3FJMA

Crystal structure of phosphate bound peb3
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
DVNLYGPGGPHTALKDIANKYSEKTGVKVNVNFGPQATWFEKAKKDADILFGASDQSALAIASDFGKDFNVSKIKPLYFREAIILTQKGNPLKIKGLKDLANKKVRIVVPEGAGKSNTSGTGVWEDMIGRTQDIKTIQNFRNNIVAFVPNSGSARKLFAQDQADAWITWIDWSKSNPDIGTAVAIEKDLVVYRTFNVIAKEGASKETQDFIAYLSSKEAKEIFKKYGWREH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Specificity of Campylobacter jejuni adhesin PEB3 for phosphates and structural differences among its ligand complexes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Campylobacter jejuni
molecule keywords Major antigenic peptide PEB3
total genus 83
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fjmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fjmA02
5H8NA 2H4IA 2GRVA 2HZKA 4KCCA 3PUZE 1NFTA 1R6ZA 3IR1A 3LSWA 3ONMA 5CI5A 1J1NA 3DLNA 3C36A 2FYIA 5DYHA 4LATA 2O7IA 4DXUA 2QL3A 5AA1A 3TYHA 4LUBA 3LSFB 1ZIUA 2ZNSA 3VDFA 5KZTA 4DCXA 1LB9A 3VXBA 4H1XA 3TTMA 2NVUB 2XXUA 3H6UA 3W15C 1JW4A 3IOTA 1OIBA 2G93A 1LGBC 5A5XB 4OYVA 1XT8A 2F78A 5JTYA 1B7UA 1CE2A 3GXAA 4TQUQ 5F1QA 3U72A 2PT1A 3EHTA 5K2XA 1D9VA 2H9BA 3FVOA 5I59A 2I3WA 2Y84A 3E9XA 4PFWA 4F18A 1B4HA 5L8DA 3G3FA 4QF9A 4F1UA 4LQ5A 4EQ9A 3RT8A 4RA1A 2A5TB 1B2HA 2DQVA 2KLFA 5CM6A 3H6WA 4NWDA 4NWCA 3G3GA 1OQHA 1B1XA 4GVOA 3WAFA 1F9BA 5L9SA 2PBWA 3S9EA 1P1WA 3KGCA 1ZLQA 2H98A 3CI8A 4IO3A 4AQ4A 3K6WA 5EHSA 2Z8DA 4IB2A 2P0SA 3KN3A 4ONYA 3JZJA 1MH4A 4GXAA 1N76A 3IO4A 4P0IA 3CVGA 3IOUA 1B40A 3KN8A 3FASA 3UA8A 1SD3A 3IB1A 3PD9A 1LCTA 2DSFA 2F35A 1BTJA 1LLSA 1ATGA 4KFQA 4C0RA 3LSXA 2AIXA 3UN6A 1TFDA 2XXYA 2A5SA 3VE1B 4KCDA 3FXQA 1P1OA 1LFHA 3S2VA 4PFUA 4E0WA 1DPEA 2XXHA 1MQHA 5I84A 3MUQA 2I6EA 3ZKKA 1HSLA 4UA8A 1MXUA 2D5WA 3MZBA 4G8MA 3KSXA 1MY3A 1JQFA 1SW4A 1A54A 4BDOA 3IAZA 1I69A 3U8QA 4BLAA 1MQJA 4LQ2A 1B3EA 4F2QA 2ZYMA 2RCAA 1MXVA 4H0WA 4GRKA 3P7IA 1XVYA 2ONKE 2I58A 4JWYA 2ZYOA 4YKJA 5A5XA 5FHNA 1P1QA 4YAHX 1MXZA 2XXWA 3FXUA 2F36A 2V3QA 1MDP1 1HSEA 4U23A 1DTGA 4GOTA 1YPNA 2V3UA 1XC1A 4G68C 2I4CA 3TODA 4KHZE 2QSXA 4ZEIA 2Q89A 1IZ1A 1Y3NA 5TP9B 2R9JA 3CSBA 3RT6B 4P11A 2ZYKA 4R2BA 1SI0A 1OLAA 2I49A 3MWBA 4GWOA 1FTOA 2H5YA 3MVWA 1O7TA 1AL3A 4ISUA 2B3BA 3F11A 3DP8A 2DVCA 4M4GA 5I58B 1EZ9A 4KQPA 2ZNUA 3I6VA 4H5GA 3O28A 1AIVA 3PPRA 3FVGA 2ZNTA 3KBRA 4ZE8A 3T9XB 3U93A 4X48A 1AH5A 5FTIA 5KDTB 2HEUA 2O84X 2V93A 3R26A 2HAUA 2F8DA 4YKIA 4XKNA 2NOOA 1A8FA 1B51A 3PUVE 4MBPA 4WEPA 3ZKLA 4QSDA 3OENA 3HHGA 1FTLA 1IXCA 1DSNA 2VD3A 1GV8A 4F2OA 4KD5A 3HO7A 2IEEA 5HPQA 3RLFE 2WKYA 4FEDA 1SBPA 3RNNA 3SEWA 3U92A 4EXKA 1EZOA 3OSQA 1JW5A 1SVXB 1T0KA 3JV9A 4F39A 3UIFA 4F1VA 4OMBA 2P2AA 2R6GE 3GBBA 3IORA 4BDLA 5F7VA 2I4BA 1ELJA 4LZ5A 3SEXA 1MY1A 3IJOB 3OSRA 3EF7A 5I56B 4G68B 2ANJA 1NH7A 5CBSA 1S50A 3OO8A 1JVYA 3MW0A 5DVFA 1Y4CA 4F19A 1VFDA 2XD3A 1USYH 3C34A 1VSOA 3I3VA 1MPDA 2XXPA 2QS4A 3O29A 3RTFB 3T66A 2Z22A 1DOTA 1Y9UA 3EQ1A 4DDDA 1QUIA 5LOMA 5IKBA 3PV0E 3IB2A 1A99A 1MQDA 3LBSA 4OETA 5I57B 1MPBA 4I9DA 4MFIA 3AXFA 3PMXA 3TTNA 4R6KA 1PBQA 3QYTA 1A55A 4IY5A 2Z8FA 1B0HA 3TELA 2OWSA 4DCYA 1N3WA 4YMAA 2ONRA 5TP9A 3T96B 4XTCQ 2F97A 2E0SA 4XKPA 4BDRA 1JEUA 3FGSA 5HM4B 1MG1A 2Z8EA 3OD7A 1USYE 4OEUA 5I58A 3CSGA 3K0VA 4C1UA 2Q8JA 2PYYA 2X26A 4POXA 2AL4A 3O2AA 1PB8A 1BLFA 1WODA 1EU8A 2G29A 4R73A 2H25A 3LC8A 1R9LA 5KDTA 4JWXA 4IO6A 3N5LA 1Q1KA 3OO9A 1YAEA 4F3SA 2DS9A 1BIYA 1P99A 1LAGE 5EHMA 5CBRA 3OEMA 1MXXA 3K6VA 3DM0A 4TLLB 3H06B 4PP0A 3TCFA 3MQ9A 4QSEA 1SW1A 1YCJA 5ICQA 3M8UA 1B32A 1IIWA 1H43A 5TU0A 2F6PA 3PUYE 3EHSA 2Y7KA 4NF8B 5H8FB 3CR9A 2XD2A 3K1NA 2RCBA 3VVFA 3DP6A 2VHAA 2REJA 4ZEFA 3CRBA 3MBPA 3TTLA 1M5CA 3KEIA 2YPNA 4QRZA 1QUKA 3U1OA 4OFLA 3QSLA 1FQEA 4I62A 2THIA 3SEYA 2V3TA 5ISUA 4Z0IA 3SDFA 1OVBA 3O6HA 2O51A 3V89B 4U2RA 4QFPA 1CB6A 1TXFA 4G68A 5I56A 1D4NA 1Y20A 5M2VA 5FHOA 4PFTA 3PMWA 3PD8A 2GHBA 1MXWA 4YKPA 5L9MA 4F3GA 4RK2A 3KG2A 4ESXA 2HXWA 3M3LA 4Q0CA 4GFRA 3FATA 1FQAA 1N7XA 2PMSA 3W9VA 4DXBA 4QHQA 4H8IA 3TCGA 1JNFA 4U1OA 3UGWA 4IO2A 4EDPA 3PGFA 4ELQA 1B9JA 5I57A 1I6AA 5HBCA 2DP8A 4X9TA 1MY4A 4PE5B 2F7BA 3SETA 3V83A 2HAVA 3KJ7A 5CMCA 3TZAA 2GFEA 4H5FA 2Q88A 1N7WA 1MDQA 3B6WA 4ZEKA 4EXLA 4NF5B 1O63A 1IUDA 1SW2A 5I2NB 4IO5A 3T9VA 4JSOA 4LVQA 3PUXE 2DOJA 1R1NA 4F29A 1QVSA 2OLBA 3V8XB 3TCHA 3TTRA 2CZLA 1MY2A 4OERA 3N26A 3C32A 3ODBA 2D21A 2XXIA 3MZ1A 3WAEA 1UTHB 3PPPA 4MLVA 1LAFE 4HCYA 1PB7A 2DWAA 3CIJA 3K6UA 4U22A 4WEDA 3G3KA 2F6GA 3RUMA 3H03A 1Y4TA 2HFBA 2UXAA 3VVEA 1FQFA 4KPTA 4DIGA 1VE4A 1XOCA 1ZJLA 4FECA 1DTZA 4TOZA 5H8HB 5KCJB 4BDMA 4R72A 2OCUA 4H65A 1URGA 3KFMA 2GHAA 1MM6A 3SEVA 3IB0A 3T22A 4NF8A 5H8FA 5JEIA 3Q28A 4BDQA 4YB5A 1GTKA 5ICTA 2VP1A 2F5XA 4ZS9A 1Y3QA 4YMBA 3KN7A 3FV1A 5CMKA 4NF4B 4DE8A 2ZMBA 4H67A 1LCFA 1IXHA 1B58A 2ABHA 1MXYA 3O97A 4KYDA 1Q35A 3N6TA 2UVJA 2AL5A 1FTJA 2Q9TA 3OMBA 2CMOA 1TWYA 3IL1B 2B3FA 2DWHA 4JSDA 1LSTA 2Y7RA 1ZTYA 1QW0A 3BBRA 3B6QA 3QK6A 1QKAA 2LAOA 2HZLA 1QKBA 2V25A 4R74A 4FJPA 1S9TA 2Z23A 4JBZA 4I1DA 2W7YA 2B65A 4IGRA 3JYRA 5CMMA 1JETA 1MY0A 2O6AA 5CC2A 1JW1A 1WDNA 4GLIA 4X1BA 1NH8A 4G8NA 1LAXA 1N04A 4NMYA 1EZPA 2O68A 4U4SA 1KWHA 2ESNA 3O6GA 1FCKA 3R7XA 4L17A 2Y7WA 4NEDA 3TQLA 3IOWA 4F31B 4NF5A 3PMVA 1N3XA 1ZBMA 1QULA 2GH9A 5I2NA 3BFTA 3SKPA 3SESA 3RTWB 1I6QA 1MRPA 4KYSA 2PT2A 4C1TA 5L9OA 1QJMA 3M3KA 1NNPA 2UVHA 3O66A 4U21A 4XIGQ 3TPAA 1UTHA 4OVJA 5H8SA 1NKXA 3K6XA 4ZEDA 3S9MC 3G7WA 3DP4A 1MS7A 3RN8A 1B3HA 1B3FA 1LAHE 1B3GA 3PPQA 2E1SA 2ALUA 5H8HA 5KCJA 1IQ7A 2QJEA 4RNSA 3HSTA 4O3BA 1NNFA 1FQCA 2DE2A 3K01A 4OHNA 3EN3A 2PVUA 4GQOA 3Q26A 2DWJA 5H8QB 1OMPA 3V5AA 1SYIA 3FJGA 2QRYA 1LFGA 2XXTA 4NE4A 3N94A 4ELPA 3S4UA 3E13X 1N0TA 1B05A 4FAJA 5CMBA 4G77A 2DWIA 5EYFA 4NF4A 1H44A 3VFJA 4G2ZA 4N13A 1M5BA 3E4RA 3FV2A 2R71A 2HQ0A 3KOTA 1B3LA 2OK2A 5K2YA 2ZXTA 3D4GA 5AA4B 3UK4A 2RC7A 4OFJA 1SW5A 4MH5A 1UIUA 2RINA 4UACA 1NNKA 3LR1A 1B5IA 2X7QA 1ZMGA 3H4ZA 1B0LA 3K4UA 1M5FA 1VFEA 3IX1A 3H6TA 4ESWA 5I2KB 3MVYA 1B1HA 4PETA 4QFNA 1FTMA 1RYXA 2P1SA 3KJTA 4OESA 3K1PA 4RPOA 1OQGA 1IXIA 4ZEBA 3MPLA 3SERA 3MP1A 4U1ZA 1FQBA 4OTEA 3RQTA 3ECRA 4KI0E 3M3FA 2QS3A 1POY1 1B4ZA 3C33A 2HCAA 4XXUA 3I5OA 2X7PA 3OOAA 1HSJA 4F3BA 4OENA 3H6VA 3A3UA 5DT6A 4R75A 3KZGA 1PEBA 4FE8A 2QS2A 2RKMA 4R9FA 3RGYA 3TKDA 1II5A 1LBBA 4POWA 4E0XA 4RY1A 1XVXA 3OO7A 2OBGA 4MLQA 4IO7A 3G3HA 1XHYA 4DXCA 5BWJA 4IGTA 1I6BA 1JEVA 3TTKA 4JXIA 4Q5TA 3IO6A 3Q27A 4AB5A 4FEBA 1FW0A 1UTBB 3UP9A 4R2FA 4BDNA 4ECFA 4ZZAA 4EUOA 1NMUA 4THIA 4F1YA 2UYEA 2REGA 2VD2A 3KSJA 1PB9A 3MZ9A 2QS1A 1H76A 5H8QA 1H45A 5AA3A 4H6DA 4QFOA 5CRYA 3OO6A 3CFLA 1Z7ME 2QMWA 1GVCA 4RK9A 3MP8A 2FA7A 3QIMA 1Y1MA 1OLCA 3QXMA 2XX8A 1US5A 1TFAA 4OFOA 3QAXA 4R6HA 1Y1ZA 4TLMB 2I48A 1EH3A 2OJTA 2XX9A 3U94A 5ITOA 4R6YA 4RPNA 3UORA 1IEJA 1ZKBA 4RXLA 4GXSB 4Q8RA 5BUUA 4JB7A 1B6HA 3G3IA 4GL8A 1L5TA 4JWOA 3HPIA 4FORA 4YU0A 3K00A 5AA4A 3TFLA 2H99A 4R9GA 3ILUB 4HTGA 4GF8A 1MQGA 1B46A 2RC8A 3H3GA 1SQYA 2XX7A 4RJZA 1LFIA 4IO4A 4LONB 5ITPA 5FTHA 4Q30B 2UVGA 4I8CA 4QFKA 4U4XA 4O3CA 3VLUA 5I2KA 4H8JA 1P1UA 4ELRA 1LB8A 2OWTA 4XKRA 4YZZA 4RYAA 3FVNA 3MAMA 3HN0A 2VGQA 1B52A 2XXRA 2NUVA 1MPCA 3C35A 1YTVA 3OXNA 3A3CA 1URSA 4HCWA 4ZZEA 2I0BA 3Q25A 3CG3A 3H7MA 1N84A 5DEXB 2F7CA 3VLVA 3CG1A 3T9HB 2DXYA 3A09A 5JK4A 2NWJA 3VVDA 4OZ9A 1S7YA 2XXVA 5B7DA 5AA2D 3PUWE 3CFZA 4LZ8A 3W9WA 1OVTA 3QUJA 4DLDA 3G3JA 2DXRA 2XXXA 3TQWA 4OXVA 5J1DA 4EQ7A 1UIVA 1IXGA 1SI1A 4GIZA 4OWDA 2XHDA 4PQJA 5AA2B 1AOVA 1A8EA 2VOZA 3EPEA 3TDJA 3PPOA 3MVXA 3OEKA 2YJPA 4OEVA 2ONSA 3ZS6A 1MH3A 1UTBA 3MJNA 2DVZA 4G4PA 4FATA 2XXQA 3TAJA 4ELOA 5DTBA 3LUYA 3N6UA 2YLNA 3GBAA 1ANFA 3O6IA 5FHMA 1LBCA 3K2DA 4GL0A 2Y7PA 3FD3A 4NF6B 2NXOA 4YKKA 2QPQA 4WKMA 3L6GA 3ILTB 3KOSA 1SDXA 3FVKA 1PDAA 3BKIB 2QMXA 3VLWA 3O9PA 1WVJA 2O1LA 4F3PA 5AE4A 4FIMA 4YB6A 4OQOA 4YB7A 4KYEA 1Z7NE 5TPAB 1MQIA 2DYXA 3VXCA 3BFUA 1B5HA 2A5TA 1A7LA 1H3DA 1SYHA 3IOVA 4AB6A 3OELA 3GLBA 2FNCA 2BJJX 1B7HA 1D3KA 4KR5A 4O3AA 2D3IA 5H8NB 4M1VA 4ZDMA 4IY6A 3MP6A 4NTLA 3LSLA 3IJXB 4N6PA 3MVZA 2I3VA 4QFLA 1B7ZA 1DPPA 1XS5A 3C31A 1FQDA 2DE4A 3ZSFA 4LP2B 1GGGA 2AYSA 2RC9A 3T93B 4ZE9A 1M5EA 1NL5A 4DZ1A 1RKMA 4XKQA 4EF1A 5DEXA 3DELB 2UYFA 3FUZA 3TMGA 4GD5A 4EF2A 3TEPA 2Y7IA 4Z7EA 3C4MA 2RF1A 1Y3PA 4LZ7A 3USDA 1NNTA 3B7DA 3B6TA 1VR5A 4HS7A 3EHUA 1AMFA 4ZECA 1BKAA 3S9NC 1GR2A 3E3KA 1PBPA 3FJ7A 1TT1A 5JTYB 1B5JA 3K02A 2OZZA 5AA2A 1MM7A 2F34A 3VV5A 1JVXA 1M5DA 2I0CA 3THIA 3HCQA 3MPKA 3RY3A 5I59B 2V84A 5DVJA 3HV1A 3IK6B 4HW8A 3S9LC 1IITA 3FIRA 4F22A 2PX1A 2ZYNA 4MF3A 4QSCA 3MC2A 5DVIA 1P1NA 1BP5A 1RYOA 2DE3A 3FJMA 4ND9A 4NF6A 3RPWA 4K3FA 3CFXA 3FXRA 3T9UA 3D4CA 4YICA 4LA9A 3TUSA 4PFYA 2Q2CA 2Q2AA 3PU5A 1POTA 1D9YA 1US4A 3C9HA 3R6UA 3FZVA 2F7AA 3GZGA 1DMBA 5IAIA 2O7UA 4N07A 4G8HA 3L6HA 2O69A 1FTKA 5B70A 3K1MA 1URDA 4P0GA 5TPAA 2UVIA 3Q29A 4X1DA 2IA4A 3SEUA 1ZU0A 3HHFA 1O64A 1R9QA 4JDFA 5ELVA 1PC3A 3PPNA 4EQBA 2M8CA 1A40A 1QUJA 2O1MA 3QUFA 1UQWA 4WXJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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