3G3GA

Crystal structure of the glur6 ligand binding domain dimer k665r mutant with glutamate and nacl at 1.3 angstrom resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
256
structure length
253
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKRSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Stability of ligand-binding domain dimer assembly controls kainate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
total genus 84
structure length 253
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3gA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3gA02
4OESA 3QUFA 1DSNA 3FXQA 4OENA 2HEUA 4EUOA 2F36A 1XVYA 3VE1B 4Q30B 2XXHA 3ECRA 3USDA 3EHUA 3PPQA 4NF8B 1B5HA 3O2AA 1MY1A 1ZTYA 2D3IA 4MLQA 1DPEA 1FTLA 5DVIA 4NF4B 1Y4CA 2WKYA 2A5TA 4ZEBA 4KYSA 5CMMA 2AIXA 1MXWA 2O6AA 1H45A 1NH8A 5H8NB 1P1WA 4U1OA 3G3HA 4DCYA 4G68C 1QUKA 3IOVA 3HSTA 2X7QA 2PT1A 5H8HA 4H0WA 3S9NC 4YB7A 4M1VA 4LZ8A 4GOTA 4DLDA 3E4RA 4ZEIA 2G29A 3H06B 3IR1A 1Q35A 3O9PA 1B0LA 2RC8A 1JW1A 1M5DA 1SI1A 1FTJA 4OFOA 2DXYA 3MJNA 4GWOA 2F7BA 1AMFA 4XIGQ 1R9QA 2ANJA 2DVZA 3C34A 1MXYA 3O97A 1LAFE 3VVFA 2E0SA 1IXCA 3K02A 1XT8A 3OO8A 4DXCA 1HSEA 1FTMA 2RC9A 4RY1A 4HW8A 2XXYA 1MY4A 1MQHA 4F39A 1B5IA 3PUXE 2Y84A 3IO6A 2P2AA 3G3GA 1PBPA 3TMGA 3OEKA 4F2OA 2IEEA 4OERA 3W15C 5JK4A 1IXIA 3MVWA 4F2QA 1B3LA 4JB7A 3TTLA 4YAHX 2HZKA 1LCTA 3PUYE 3Q29A 3EHTA 1FQBA 5A5XB 3VVEA 1P1QA 1ZIUA 4YMBA 2V3TA 5AE4A 3VXCA 4Z7EA 2VGQA 4NE4A 1AIVA 2DP8A 3VFJA 1J1NA 4KYEA 3B6QA 3N5LA 1BKAA 3SKPA 3MPLA 2B3FA 1PC3A 5L9OA 3T9HB 3HV1A 1CE2A 1LLSA 3MC2A 5TP9B 4F3SA 3OD7A 1IZ1A 2B3BA 3CI8A 3GZGA 4R74A 3TQWA 4JWXA 2DS9A 1MPBA 4NWCA 3G7WA 5EHMA 2F34A 3IK6B 2ZYKA 3EQ1A 4RNSA 3PMWA 3MP6A 4BDMA 1ZLQA 4U2RA 1TT1A 1QW0A 1OVBA 2R9JA 4Q8RA 4KCCA 1N76A 3MVZA 1UTBA 4RXLA 4R6YA 1MXUA 1II5A 1EZOA 2DQVA 4PFUA 5DEXA 3IB0A 1IITA 1JETA 2GHBA 4KI0E 4GVOA 5I2NB 4X9TA 3KBRA 4FAJA 3FVKA 1SW5A 1WODA 3BKIB 3MBPA 1TXFA 3TTNA 4DCXA 1CB6A 4OFJA 2H4IA 1SD3A 4GQOA 1WDNA 4FEBA 3OSQA 1HSLA 2DWAA 3T9VA 2G93A 1M5BA 5ITOA 4F18A 4MFIA 4ZEDA 1B1XA 1MRPA 4G8HA 2QS2A 4YMAA 5BWJA 2XXXA 5I57A 5KCJA 4TLMB 1B6HA 4F1UA 2VP1A 4I1DA 3UP9A 2DE3A 4E0WA 1A55A 2I49A 3OSRA 1MY3A 2DE4A 1N3WA 3TKDA 4HCWA 5I2KA 4WXJA 4YZZA 3GBAA 4G2ZA 2Z22A 4G8MA 1JQFA 4GL0A 2I6EA 4XKRA 4Z0IA 4EQ9A 2Y7PA 5B7DA 3DELB 4ECFA 1GVCA 1Y1ZA 2F6GA 3TZAA 2ZYMA 1QVSA 1LBBA 4X1DA 1YTVA 3TYHA 4JWOA 3MVYA 2NWJA 1B7UA 2X7PA 1LAHE 4U4SA 3MUQA 4LZ7A 1Y1MA 5CMBA 1MPDA 1O7TA 3K0VA 1BTJA 1H44A 3UA8A 2ALUA 1FTOA 3PUVE 4YB6A 2CZLA 3FD3A 2DYXA 4HTGA 1B5JA 2PVUA 1MY0A 4EF1A 3U94A 3FGSA 4OYVA 1FQCA 5CBSA 3H03A 1GR2A 4YB5A 4KCDA 4ESWA 4O3CA 2UYFA 3FZVA 2O69A 2XXWA 3I3VA 4TQUQ 4BDOA 1I6QA 3PMVA 1S50A 2O51A 2YPNA 3N94A 5L9MA 3MZBA 3UN6A 3KN8A 3PUZE 2UVIA 3KGCA 5F1QA 2RCBA 3A09A 2CMOA 1NFTA 5DVFA 3QXMA 2Y7RA 3QUJA 1IIWA 1D3KA 2Q2CA 1H76A 1OMPA 3O66A 3TTKA 3VLWA 2HCAA 3W9VA 1S7YA 1PDAA 2BJJX 3LSLA 3IL1B 4FEDA 4GFRA 4OVJA 3FV2A 3LSFB 4JSDA 2DXRA 3ILUB 3MW0A 4OEVA 4ZZAA 1Y3NA 4IO3A 3EN3A 4C0RA 4KQPA 4R6KA 4NF6B 2PX1A 2I4BA 1B3FA 2ONSA 3V5AA 3OELA 2DSFA 3EPEA 4ND9A 3H6UA 2V3QA 3K1MA 3KSJA 4Q0CA 5B70A 4ZDMA 4FECA 1N7WA 1USYH 2HAUA 2XHDA 3KJ7A 1MPCA 3U92A 3GBBA 1M5FA 3H6VA 3MWBA 1D4NA 3S9LC 5I58B 5IKBA 1RYOA 1B3GA 3PPOA 4PFYA 4I8CA 1B7ZA 4H6DA 5FHNA 1SDXA 5I56B 2OBGA 3WAFA 3V8XB 4QFLA 4TLLB 4KD5A 3P7IA 3PPPA 4ELPA 1NNTA 5CC2A 1SW1A 4LA9A 3ILTB 1L5TA 5FTIA 4N13A 4HS7A 3JYRA 4QSDA 4MBPA 3LUYA 1YPNA 3OO7A 4I62A 5EYFA 1LAGE 3M3KA 3MQ9A 3AXFA 2F35A 3CSGA 1XS5A 5L9SA 2REJA 2I0BA 1URDA 2QS4A 1EH3A 1QKBA 1URGA 1B52A 3JZJA 3D4CA 1YCJA 1FW0A 4ELRA 2F7AA 1JW4A 3WAEA 1LFIA 4QF9A 4QRZA 5JEIA 4F31B 2I48A 1MH4A 2AL4A 3OOAA 1UIVA 4EQ7A 5I59A 2A5SA 4POWA 1MQGA 5LOMA 4E0XA 3H4ZA 3QYTA 5CM6A 2XD2A 1A40A 3C33A 1MG1A 4DXUA 4PFWA 2O84X 2DVCA 1XC1A 5AA3A 3PV0E 1AOVA 1B3EA 4C1UA 3H6WA 3CFLA 1B0HA 3FVNA 1MDP1 1M5CA 5AA2D 4C1TA 4NEDA 1SVXB 4H65A 1B2HA 2DWIA 3SDFA 3VXBA 1B4ZA 1DOTA 3HCQA 4GXAA 4OHNA 4H8JA 2XD3A 4FIMA 4OQOA 4H5GA 3O6GA 3TELA 3DP6A 3RGYA 3KFMA 2H98A 2ZNSA 3ZSFA 4NF4A 1MXXA 2UVHA 5H8NA 4ELOA 4GLIA 2RCAA 5CI5A 2UVGA 1US5A 1AL3A 2DWHA 4PE5B 2E1SA 2KLFA 3K6XA 2GRVA 3CSBA 3TAJA 1P99A 3RT8A 2LAOA 1FQAA 2NXOA 2V3UA 3RUMA 1MM6A 2ESNA 1DMBA 4IGTA 4ZEKA 5JTYA 2GFEA 1NNPA 3E9XA 5ITPA 2OWSA 1SW4A 3RQTA 3B6WA 2ZMBA 3KOTA 2R71A 4U4XA 3K6UA 1FQEA 3S2VA 2QJEA 4ZECA 4RJZA 2Q89A 3K6VA 2Z23A 3FVGA 3T22A 3T96B 5AA4B 1OLCA 1MQJA 1IXGA 1SBPA 1UTHB 2P0SA 3TUSA 1HSJA 2H25A 1IEJA 3GXAA 2XXUA 1SI0A 4PFTA 3W9WA 2REGA 3MAMA 5TPAB 1R6ZA 3IJXB 4ZZEA 3THIA 1O64A 2HAVA 3IJOB 2O7UA 2Y7KA 2RINA 3M8UA 4R72A 3F11A 3QIMA 2NVUB 2OJTA 1SQYA 2RF1A 3CG1A 3FJGA 5A5XA 2FNCA 2XX8A 2QL3A 1I6BA 3DP4A 3K4UA 3PD9A 3T9XB 4ESXA 1ZMGA 1N84A 5IAIA 4DXBA 3OMBA 3UIFA 4N6PA 4DIGA 2DWJA 1DPPA 2NOOA 3MVXA 4YU0A 3FJMA 1OLAA 1N7XA 3DP8A 4JBZA 4OFLA 1FQFA 2UVJA 4GL8A 4IB2A 2IA4A 5TP9A 3TEPA 4P11A 1Y20A 1WVJA 3A3CA 4R9GA 1A99A 3TFLA 4QFNA 4IY5A 4ZEFA 4LQ2A 5AA1A 4GXSB 2UYEA 5DVJA 4F3GA 4ZS9A 4EXLA 3RNNA 5H8FA 3BFTA 5BUUA 3IO4A 3TCFA 4G68B 4WEPA 1BIYA 4RK2A 4XKNA 1VR5A 2VOZA 1GV8A 3KSXA 3G3KA 5FHOA 5I2NA 5KDTA 3JV9A 1MH3A 3IAZA 3RTWB 4RYAA 1P1NA 4NF5B 5HPQA 3LBSA 4LATA 1Z7ME 4OZ9A 1H3DA 5KZTA 3PGFA 4RPOA 1QJMA 4DE8A 1P1UA 3BBRA 2Q9TA 1IQ7A 2H5YA 5HBCA 1LFHA 4AB6A 3OO6A 1FCKA 4RK9A 3CFXA 1Q1KA 4H8IA 3Q28A 1A8EA 3IOTA 3PPRA 4F19A 2AL5A 4POXA 1PBQA 3QK6A 4U22A 2RKMA 1GTKA 3M3LA 2I3VA 1VFDA 2A5TB 3VVDA 1JW5A 1B58A 1N0TA 3N6UA 3OENA 3U8QA 3C36A 4X1BA 3KN7A 3SEXA 5K2YA 1NMUA 2H9BA 3KEIA 3UK4A 4F3BA 2FA7A 5H8HB 1POTA 4WKMA 3C31A 3TPAA 2ZNTA 4I9DA 4GF8A 3O6IA 1XVXA 1OQGA 2O1LA 2QSXA 4OEUA 2QS1A 3DM0A 1B51A 2OLBA 3FXUA 3L6GA 3HPIA 1TFDA 2RC7A 3FJ7A 4P0GA 2Q8JA 3CR9A 3EHSA 2XX7A 5I59B 1MY2A 2OCUA 3O6HA 1ZBMA 1I69A 1DTGA 4AB5A 4Q5TA 3C9HA 4QSCA 1F9BA 3IOWA 4F3PA 3KN3A 3U93A 3BFUA 1B1HA 4R6HA 4L17A 1FTKA 3TODA 5EHSA 5AA2A 2ZXTA 3ZS6A 2HXWA 3SEVA 3CFZA 1SYHA 3RPWA 1ANFA 2I0CA 4YKIA 2XXTA 1NL5A 1B05A 2I58A 3A3UA 4H1XA 1YAEA 1B7HA 1N04A 5FHMA 1EZ9A 1BLFA 1MXVA 2OK2A 3MP8A 1H43A 3KZGA 3Q25A 1A7LA 3FXRA 2VD2A 4JSOA 4MH5A 1OQHA 3L6HA 3LC8A 4RA1A 3LSXA 4JWYA 1B46A 3ODBA 4QFOA 3CRBA 2Z8EA 1URSA 3SESA 1BP5A 1A8FA 2XXQA 3FATA 2F5XA 2PT2A 2F78A 3VV5A 1QULA 4PQJA 3TDJA 4YICA 2V25A 4F22A 2XX9A 4O3AA 5CMCA 1R1NA 5L8DA 2QRYA 1LFGA 3T66A 1TWYA 1US4A 2I4CA 1ZU0A 2HQ0A 2VHAA 4BLAA 4BDQA 3MZ9A 4NF6A 5JTYB 3R7XA 1MQDA 2PBWA 4LZ5A 1Y4TA 4F29A 4DZ1A 1I6AA 1XHYA 3I5OA 3LR1A 1OVTA 3OEMA 1JEVA 4QFPA 3FV1A 1ELJA 5H8QA 4H5FA 1UTBB 2YLNA 1Y9UA 3PMXA 5DEXB 4LP2B 5I58A 2XXVA 2F8DA 1ZJLA 3K00A 4XKQA 4BDNA 3KG2A 2PYYA 2F7CA 5I56A 2GHAA 4UA8A 1SYIA 1KWHA 2QMWA 3IB2A 1LBCA 1Y3QA 3H7MA 1RYXA 4U21A 1POY1 4BDRA 1B9JA 1N3XA 3T93B 4NF8A 3FIRA 3TCGA 4KFQA 1QUIA 2QS3A 4OETA 4P0IA 1AH5A 4ZE8A 2R6GE 3T9UA 3IB1A 3V89B 4ONYA 4R73A 3G3IA 4ISUA 2FYIA 3RLFE 3LSWA 1IXHA 4FJPA 4X48A 4NMYA 5I57B 1QUJA 1PB7A 4IO7A 1NNKA 5KCJB 5M2VA 4FORA 5CMKA 4IO5A 5DYHA 3C32A 2V84A 2ONKE 5ISUA 1FQDA 1LAXA 4EXKA 2QPQA 5DT6A 4LONB 4QSEA 4R9FA 5I2KB 2Z8DA 4XTCQ 1O63A 5TU0A 3M3FA 2NUVA 1MM7A 4QFKA 2ZYOA 2Y7WA 5K2XA 3H3GA 1NH7A 2O7IA 4OXVA 2Y7IA 4DDDA 3OO9A 3G3JA 1D9YA 3O29A 4YKKA 3MP1A 1NNFA 2O68A 3V83A 2THIA 4OTEA 4LUBA 1XOCA 2ZNUA 1VE4A 3CIJA 5H8FB 3FVOA 3B7DA 4IO6A 4XKPA 3K2DA 3PPNA 4IY6A 3TQLA 4KPTA 3G3FA 3R26A 1VFEA 4OWDA 3K6WA 5CRYA 4WEDA 1DTZA 1EU8A 3EF7A 3TCHA 4JDFA 3SERA 5KDTB 3ZKKA 5ICTA 2V93A 3C4MA 2GH9A 3Q26A 2XXIA 2HFBA 5DTBA 4UACA 1USYE 3MPKA 2Q2AA 4G77A 2X26A 1SW2A 1UQWA 3ONMA 2O1MA 4U23A 3IOUA 2PMSA 3E13X 4EDPA 4NWDA 1JVYA 3SEWA 1Y3PA 4U1ZA 2XXRA 4KHZE 4JXIA 1D9VA 3U1OA 3RTFB 3SETA 2DE2A 5J1DA 3FUZA 5FTHA 4LVQA 3D4GA 4F1YA 3S4UA 1S9TA 4LQ5A 4KYDA 3QAXA 4EQBA 1PEBA 4YKJA 2QMXA 3I6VA 4G4PA 4R75A 2F6PA 1GGGA 4R2FA 2B65A 5F7VA 4RPNA 1IUDA 3K1PA 4ELQA 1LB8A 1Z7NE 5AA4A 1NKXA 4O3BA 3GLBA 5I84A 1R9LA 3Q27A 1UTHA 3S9EA 3CG3A 2ONRA 2P1SA 1UIUA 3O28A 3CVGA 1B32A 3SEYA 1B40A 1LB9A 1PB9A 2Z8FA 3HHFA 3S9MC 2VD3A 5TPAA 3VLUA 1P1OA 1LGBC 3PD8A 2DOJA 2H99A 4H67A 4M4GA 5H8SA 4FE8A 2XXPA 1QKAA 3QSLA 4BDLA 1LCFA 3HHGA 2OZZA 3VLVA 4THIA 1M5EA 4IGRA 4EF2A 3ZKLA 2I3WA 1MDQA 3UGWA 4ZE9A 4OMBA 1ZKBA 1JNFA 5AA2B 2YJPA 4NTLA 1B3HA 4GIZA 3N26A 3U72A 2D5WA 1MS7A 3PU5A 3KOSA 4PETA 3TTMA 3HN0A 3OXNA 1JEUA 1MXZA 3TTRA 2ABHA 2F97A 3UORA 3KJTA 2Q88A 1OIBA 2ZYNA 2AYSA 1EZPA 4K3FA 4YKPA 4KR5A 5HM4B 2UXAA 5CBRA 3E3KA 3H6TA 1VSOA 1RKMA 3IX1A 5ICQA 3IORA 1JVXA 3VDFA 2D21A 1B4HA 3K01A 1T0KA 1A54A 3SEUA 3DLNA 4N07A 4G68A 2HZLA 3B6TA 3K1NA 3RN8A 4AQ4A 1LSTA 2W7YA 4FATA 4XXUA 4G8NA 1PB8A 4PP0A 1MQIA 3HO7A 4F1VA 4IO2A 4MLVA 5H8QB 3FASA 4QHQA 4NF5A 3PUWE 3R6UA 3C35A 3RT6B 4TOZA 4GRKA 3MZ1A 4MF3A 4GD5A 4IO4A 3N6TA 1ATGA 5ELVA 4HCYA 2M8CA 2OWTA 4R2BA 1TFAA 3RY3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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