3G3HA

Crystal structure of the glur6 ligand binding domain dimer k665r i749l q753k mutant with glutamate and nacl at 1.5 angstrom resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
256
structure length
252
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKRSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITLAILKLQEEGKLHMMKEKWWCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Stability of ligand-binding domain dimer assembly controls kainate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
total genus 85
structure length 252
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3hA02
1JETA 4LUBA 2F7BA 1LBCA 4F19A 5JTYB 1WDNA 2DS9A 2ZYKA 3PUWE 4OFLA 4MLQA 2QJEA 5I57B 3CR9A 4C1UA 5DT6A 3FJMA 1LAXA 3ZKLA 5TPAB 1A54A 2NXOA 3RUMA 1DTZA 1AMFA 3K00A 4JXIA 3BBRA 3IK6B 5EHSA 4G68A 4R72A 1MQIA 4JDFA 2AL4A 3HPIA 1B5HA 4H65A 4YICA 3T9XB 1Y3QA 1ZJLA 3L6GA 2XXWA 1M5BA 3M8UA 2XX8A 4LONB 1IXHA 4L17A 2G29A 3Q29A 4R74A 1DOTA 4GF8A 5AE4A 1A8FA 2O84X 1SW1A 2ZYNA 4G2ZA 1NFTA 3M3KA 4JWXA 1FQDA 1H45A 2HXWA 4NF4B 5B7DA 4DXUA 4YMBA 2H98A 3T96B 3V8XB 1A40A 3QUJA 1NNPA 5EYFA 4EDPA 4OVJA 4FE8A 1PB7A 3PMXA 3N94A 1JVXA 5H8NB 3IOWA 4R6HA 5M2VA 1MXZA 4NF5B 4IO2A 1B51A 2DXRA 4ESWA 1M5CA 3MC2A 5IAIA 3MVYA 1I6AA 2PMSA 2RKMA 4GVOA 4KYEA 5HPQA 4JB7A 5DTBA 3PUXE 2RF1A 3OD7A 4F1YA 1A99A 3RGYA 4FATA 1VSOA 2I4BA 5KCJB 4BDLA 3U72A 1WODA 4QFNA 4NF8B 2XXPA 3LC8A 4KR5A 2YJPA 1FQAA 4G8MA 3U92A 2XXRA 4YKJA 1P1UA 4U4SA 3B6QA 1IXGA 3MP6A 4X48A 1MY0A 2O68A 3R6UA 2Z8FA 1N7XA 1O64A 3HCQA 3RT8A 1FTMA 2R71A 3ECRA 3S4UA 5ITOA 1MH3A 4Q0CA 4O3BA 3QSLA 4YKPA 3H6VA 5I56A 4NWCA 2QL3A 4OXVA 2XHDA 2HZLA 4X1BA 4ZEBA 3PUVE 4ZE8A 4LQ5A 1SVXB 4PQJA 4OETA 3LUYA 3K1PA 1PBPA 1AIVA 3C36A 4RXLA 1EZ9A 2Q2CA 4NF6B 3OO6A 5TP9B 2I58A 5HBCA 3EHUA 3AXFA 4KCCA 1FCKA 1QUJA 3H3GA 3PPPA 4QSCA 3O6GA 2ESNA 1SI0A 1VE4A 2G93A 4PETA 1FQEA 3C31A 2UVIA 3FVNA 3EQ1A 5B70A 4P0IA 1HSJA 4IY5A 2M8CA 1ATGA 1B4ZA 4NWDA 1MY3A 3RTFB 1Z7NE 2O6AA 1B40A 3G3KA 1B6HA 5AA2D 4ECFA 3I5OA 3V5AA 2XXQA 4G68B 1FTJA 3IO4A 2XXHA 1DMBA 4R9FA 3TEPA 3FASA 1IITA 1MPDA 1MXWA 3Q25A 5KDTA 1MY2A 3G3HA 2PYYA 1URSA 4WKMA 4BLAA 2I4CA 4FJPA 2AYSA 5A5XA 4G4PA 2O7UA 4X9TA 3SEUA 4DIGA 4LATA 4NEDA 4MH5A 3SEWA 2V3TA 3P7IA 3KFMA 4QHQA 5AA4B 5JK4A 1CE2A 2A5SA 4QFOA 3W9VA 3OO9A 3QYTA 5AA2A 3RTWB 1BLFA 3T22A 2DP8A 4IO5A 2DE4A 3MPKA 3TELA 2UXAA 4F3PA 2P0SA 5DYHA 3Q27A 4ELQA 3VVDA 1ELJA 3A09A 3FD3A 4GLIA 5L9SA 4YB5A 1F9BA 1Y1ZA 2I0BA 5FTHA 3MUQA 2Q9TA 4BDQA 3H4ZA 4JSDA 2X26A 5TU0A 3CFZA 4ELOA 1MPCA 3FZVA 1USYH 1RYOA 2UVGA 2V93A 2FNCA 3O97A 3IAZA 5FHMA 4NMYA 1SYIA 4EQ9A 2Y84A 3O2AA 1WVJA 2F34A 3Q26A 4H67A 3MZ1A 2R6GE 1POY1 1VFDA 1B2HA 4YU0A 1QVSA 2F6GA 2PX1A 4KFQA 3VXBA 2DSFA 4XKRA 1VFEA 1CB6A 1B52A 1O7TA 4TLMB 3FVGA 2NWJA 3GLBA 1MG1A 1NNKA 4DCXA 4UA8A 3OO7A 3LSLA 4RK2A 4ND9A 5I56B 5DVFA 1Y3NA 2Y7RA 1LFGA 4MF3A 1BP5A 3CSGA 5H8FA 2V84A 2OLBA 3RNNA 3PU5A 1FQCA 3KN7A 1LCFA 2QMXA 3GBBA 3E9XA 3CIJA 4R2BA 2DWIA 2VD3A 3DP4A 3D4CA 1NKXA 1EZOA 4G77A 4IGTA 4U23A 3H7MA 4BDMA 3K6WA 4OMBA 2KLFA 3VXCA 1HSLA 4IO4A 4X1DA 1B3HA 1MQJA 1A55A 5DEXA 2RINA 1QKAA 4HCWA 3UK4A 3OEKA 1JEVA 3FUZA 2GRVA 1B46A 1N76A 3MBPA 1XVXA 1GV8A 4DZ1A 3SKPA 4O3AA 3GZGA 3USDA 2PT1A 3RY3A 1GGGA 1XOCA 1S7YA 1B3GA 4AB5A 4H5GA 4FEDA 4I1DA 5I2KB 2F8DA 5CBSA 4KPTA 2Z8DA 2XD3A 4ZDMA 3G7WA 5KDTB 2F5XA 1JNFA 5A5XB 3RT6B 4OEUA 5CM6A 4OQOA 1FQBA 2OK2A 1AH5A 1LB9A 4XKPA 4PFYA 3C32A 2F7CA 2UVJA 1MQHA 1KWHA 3I6VA 5CMBA 1PDAA 4ZE9A 1Y1MA 5AA2B 4FIMA 3K01A 3H6WA 2O1LA 4MLVA 2ZNUA 1ZTYA 4WXJA 2XXUA 3H6TA 4OEVA 1ZKBA 3C34A 1LSTA 2DE3A 4DXCA 4THIA 5H8HA 3IX1A 3B6WA 3PPNA 5AA4A 4ZECA 1OQGA 3KJTA 1IUDA 5ISUA 1B4HA 4KYSA 1URGA 1B7HA 2RC9A 1IQ7A 1NNTA 3TFLA 4ZZEA 1MH4A 4IO6A 4EQBA 1H3DA 1XHYA 1US4A 4YAHX 1HSEA 3UP9A 4ESXA 1MS7A 4JSOA 3FATA 1B0HA 5J1DA 4R2FA 3OOAA 1MXYA 3S9MC 4JWOA 4GL0A 3EHTA 2ANJA 1JW4A 3A3CA 2H5YA 2P1SA 2GHBA 1Q35A 4GFRA 1S9TA 3O9PA 1BKAA 3OENA 3S2VA 3EF7A 1M5DA 5KZTA 4RY1A 4WEPA 3PPRA 3TPAA 3QUFA 1O63A 4PP0A 3DP6A 5L9OA 1B5IA 4RPOA 2DVCA 3R7XA 1LCTA 2O51A 2V3QA 5ICTA 2ONKE 4LQ2A 3BFUA 4N13A 3OXNA 1OLCA 5H8FB 1UIUA 1USYE 3K4UA 2I0CA 3GBAA 4BDOA 3FGSA 2REJA 2D5WA 4GWOA 2XX9A 1OVBA 4QSEA 3FXQA 4RA1A 3MJNA 4ISUA 1P1NA 2VGQA 4F1VA 2I3VA 3RLFE 2QMWA 1LFIA 4YB7A 2XXXA 4QFLA 2WKYA 2PT2A 2ZNSA 3PUZE 4F2QA 3VVEA 4G8HA 5DEXB 3TCGA 1D9YA 3FJGA 2DYXA 3FV2A 4R73A 4G68C 4P11A 3O6HA 3S9LC 3HO7A 3VLUA 4U4XA 1ZLQA 4RYAA 2LAOA 2V3UA 1LB8A 1SW2A 3FIRA 3O6IA 3O66A 5JEIA 1B3LA 4DXBA 5ITPA 3HSTA 2NUVA 4OERA 4R6YA 3F11A 4M4GA 3IJXB 1OQHA 5LOMA 3TODA 1B9JA 4RPNA 3ZKKA 1A8EA 1PEBA 2QSXA 1MDQA 2ONRA 5I2KA 3KJ7A 1DPPA 2E1SA 4HW8A 2XXIA 2GH9A 4UACA 3DM0A 3TUSA 3PV0E 2FA7A 1J1NA 3N5LA 1JW1A 2ONSA 2DWAA 1I6BA 2I49A 1MY4A 1P1OA 3T9VA 2F78A 5H8HB 1TXFA 1XVYA 3SEVA 2HEUA 1LGBC 3TQLA 4IGRA 5K2YA 1L5TA 1DSNA 3IB2A 1TFDA 1P1WA 5F1QA 3CRBA 2X7PA 3PPQA 3FVKA 3JZJA 3U1OA 4QFPA 3E3KA 3K1NA 3K2DA 4IO3A 1FTOA 3TTRA 3KBRA 1NH7A 3LR1A 1I69A 1GVCA 2CZLA 3IB0A 3MPLA 2Z23A 4LVQA 3A3UA 2OJTA 3EHSA 4OESA 4OHNA 4RK9A 4KHZE 3VE1B 2DWHA 4R6KA 2BJJX 4H1XA 3MAMA 4F2OA 2DVZA 1JVYA 3MP8A 3CVGA 4YKKA 3EPEA 4OENA 2E0SA 3IR1A 3IOTA 2ZXTA 1JEUA 2X7QA 1LBBA 2YLNA 1OIBA 3ZS6A 3ZSFA 3S9EA 3MZ9A 2OBGA 3CFLA 3LSWA 3ILTB 2F97A 1TT1A 3CSBA 3V89B 2OWSA 1B5JA 2RC7A 1MXXA 1B7UA 1SW4A 1TWYA 3MP1A 5FHNA 1RYXA 1H76A 3G3FA 4XKNA 3W9WA 1PB8A 1Z7ME 3GXAA 2V25A 3QIMA 1FTLA 3JYRA 4TOZA 3H6UA 3TMGA 4NE4A 3PMVA 2FYIA 3TTLA 1B1XA 4MBPA 4H8JA 3G3JA 3MVZA 3TAJA 5I59B 5CRYA 2RCAA 4GIZA 4F18A 3U94A 2DOJA 3FXUA 2O7IA 1MQGA 4GL8A 3IL1B 4LZ7A 3T93B 2RC8A 3OEMA 1H43A 3V83A 2D21A 3K6XA 3THIA 2I3WA 3MVXA 1FW0A 3UA8A 2H9BA 4OZ9A 4PFUA 1S50A 1YCJA 4Z0IA 5L8DA 4GXAA 3VFJA 4U21A 1IXCA 4Q8RA 4TQUQ 1QUKA 1PB9A 3KEIA 1R6ZA 4H8IA 1B32A 2O69A 2XXTA 3WAFA 2ABHA 3U8QA 3OMBA 2H25A 3H06B 1MXVA 1R9QA 5BUUA 2HAUA 3KN3A 1PBQA 2GFEA 3R26A 2REGA 4GQOA 3PMWA 1QUIA 2NOOA 3PD9A 1I6QA 5H8QA 1NMUA 2H4IA 1Y4TA 1DPEA 4ELRA 4U2RA 4ZS9A 4Q30B 3LSXA 4FORA 4KYDA 4PFWA 4K3FA 4DCYA 1QKBA 1SI1A 1AOVA 3Q28A 3QAXA 1B0LA 3KGCA 3TZAA 3JV9A 4IB2A 4POXA 1B3EA 3K02A 2AL5A 4DE8A 3FJ7A 4AQ4A 3I3VA 3TQWA 1ZIUA 4U1OA 2UYEA 2XX7A 4EF2A 1IEJA 4G8NA 3IORA 1D4NA 3T9HB 1N0TA 3S9NC 4E0XA 2AIXA 5ELVA 3UIFA 4LZ5A 2VHAA 3SERA 1MPBA 4GRKA 2CMOA 2THIA 2XXVA 3EN3A 4N6PA 1D3KA 2Q8JA 3B7DA 1GTKA 5I2NA 3VLWA 3ONMA 1Y20A 4RNSA 4ZEDA 3MQ9A 3C35A 2QS4A 2UYFA 2A5TA 4H6DA 2IA4A 2Z8EA 1XC1A 2B65A 3FV1A 4GD5A 4I62A 4EQ7A 2F7AA 4EF1A 2F6PA 5CI5A 4NTLA 5HM4B 1UIVA 1UQWA 3M3FA 5ICQA 4RJZA 5FTIA 4BDRA 3LBSA 2QRYA 5CBRA 5CMCA 1RKMA 3T66A 3OSRA 3TCFA 1UTHB 3FXRA 3KSXA 4OFJA 2ZYMA 5I58A 1B7ZA 1VR5A 3VVFA 3SESA 5I84A 3O28A 1YTVA 4IY6A 1IIWA 1MXUA 3SETA 4F29A 2I6EA 2IEEA 1R9LA 2OZZA 3MWBA 1N3WA 1PC3A 3LSFB 4U22A 1H44A 2B3BA 2QS3A 2OCUA 5AA1A 2GHAA 4GXSB 4AB6A 3FVOA 4ZEKA 1NL5A 2DE2A 2XD2A 2R9JA 2OWTA 3G3IA 3OSQA 3TTMA 3DLNA 3TDJA 1N04A 5I59A 2Y7PA 3K0VA 3IO6A 1LAFE 1XT8A 4E0WA 1FTKA 1N84A 5L9MA 1JQFA 1YAEA 3BFTA 4PE5B 2Y7WA 3KOTA 3TTNA 3PD8A 2VOZA 3RPWA 1SYHA 5BWJA 1POTA 4DDDA 3PGFA 4LP2B 1XS5A 1IZ1A 4FECA 4XKQA 4QRZA 3PUYE 1UTBA 2O1MA 2ZYOA 1SD3A 2B3FA 2NVUB 1EZPA 1D9VA 2Y7IA 2PVUA 3SEYA 3KSJA 4F39A 3E13X 2YPNA 1LLSA 5H8QB 3TTKA 3IOUA 1LAGE 3DELB 3T9UA 4FEBA 3HN0A 1ZBMA 4KI0E 3ODBA 3HHGA 1US5A 3VLVA 2Q88A 4U1ZA 2QPQA 3OO8A 3CI8A 5H8NA 5IKBA 1Y4CA 1EH3A 5JTYA 2VP1A 3N26A 1ZU0A 4Z7EA 5I57A 1URDA 3WAEA 4QFKA 3BKIB 1R1NA 2F35A 5CMMA 3MW0A 5TPAA 1LFHA 2ZNTA 1M5EA 3E4RA 3IJOB 3UN6A 3TYHA 4FAJA 4LZ8A 2DQVA 1A7LA 4LA9A 1QJMA 3CG1A 1B58A 4MFIA 3HHFA 3CFXA 4BDNA 3U93A 4OTEA 5I2NB 1BIYA 1ZMGA 1MDP1 2HAVA 3C9HA 5CC2A 3RQTA 2DXYA 3C4MA 3DP8A 4M1VA 2A5TB 2I48A 4N07A 1M5FA 3K1MA 4JBZA 2RCBA 1N7WA 2H99A 1B05A 1MM6A 1OMPA 5FHOA 4PFTA 4C0RA 4F22A 4R75A 1MY1A 4XXUA 1P1QA 4XTCQ 4NF4A 1TFAA 4YZZA 4IO7A 4H5FA 1EU8A 2F36A 4EXKA 4P0GA 5H8SA 1YPNA 3SEXA 1FQFA 4H0WA 3UGWA 4HCYA 2W7YA 2HZKA 4HTGA 4ONYA 3RN8A 1NNFA 3KOSA 4I9DA 1II5A 1N3XA 1QULA 1JW5A 4NF5A 3QK6A 2ALUA 5I58B 5F7VA 1B1HA 2PBWA 1MM7A 3KN8A 1LAHE 4QF9A 3TKDA 2Z22A 5AA3A 5EHMA 3KG2A 3HV1A 2XXYA 3KZGA 4F3GA 4DLDA 2DWJA 4EUOA 1UTHA 4HS7A 2Q89A 3W15C 4ZEIA 4KD5A 1MQDA 4Q5TA 5KCJA 3IOVA 4ZZAA 4ZEFA 3H03A 4NF8A 4OYVA 3C33A 4EXLA 1Y3PA 4F1UA 4F31B 2QS2A 2Q2AA 5CMKA 3B6TA 4ELPA 4OFOA 1NH8A 1Q1KA 4POWA 4WEDA 2UVHA 3M3LA 2VD2A 1SBPA 3D4GA 1SW5A 3MVWA 4QSDA 2ZMBA 3VDFA 3PPOA 1ANFA 1OVTA 3K6VA 4KCDA 2HCAA 2HQ0A 2QS1A 3QXMA 3OELA 1T0KA 4YKIA 4R9GA 4KQPA 4YB6A 4OWDA 1QW0A 5DVJA 4TLLB 3UORA 1P99A 3N6UA 4O3CA 3G3GA 1B3FA 3ILUB 2HFBA 3SDFA 4C1TA 3L6HA 1UTBB 1MRPA 3VV5A 4F3BA 2Y7KA 3MZBA 1SQYA 2D3IA 3TCHA 5K2XA 1DTGA 4JWYA 1GR2A 3K6UA 3N6TA 3IB1A 3CG3A 1SDXA 1AL3A 4NF6A 5TP9A 4YMAA 1OLAA 1BTJA 4GOTA 4XIGQ 5DVIA 2P2AA 3O29A 1Y9UA 4F3SA 4I8CA 1IXIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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2PBWA 1MM7A 3KN8A 1LAHE 4QF9A 3TKDA 2Z22A 5AA3A 5EHMA 3KG2A 3HV1A 2XXYA 3KZGA 4F3GA 4DLDA 2DWJA 4EUOA 1UTHA 4HS7A 2Q89A 3W15C 4ZEIA 4KD5A 1MQDA 4Q5TA 5KCJA 3IOVA 4ZZAA 4ZEFA 3H03A 4NF8A 4OYVA 3C33A 4EXLA 1Y3PA 4F1UA 4F31B 2QS2A 2Q2AA 5CMKA 3B6TA 4ELPA 4OFOA 1NH8A 1Q1KA 4POWA 4WEDA 2UVHA 3M3LA 2VD2A 1SBPA 3D4GA 1SW5A 3MVWA 4QSDA 2ZMBA 3VDFA 3PPOA 1ANFA 1OVTA 3K6VA 4KCDA 2HCAA 2HQ0A 2QS1A 3QXMA 3OELA 1T0KA 4YKIA 4R9GA 4KQPA 4YB6A 4OWDA 1QW0A 5DVJA 4TLLB 3UORA 1P99A 3N6UA 4O3CA 3G3GA 1B3FA 3ILUB 2HFBA 3SDFA 4C1TA 3L6HA 1UTBB 1MRPA 3VV5A 4F3BA 2Y7KA 3MZBA 1SQYA 2D3IA 3TCHA 5K2XA 1DTGA 4JWYA 1GR2A 3K6UA 3N6TA 3IB1A 3CG3A 1SDXA 1AL3A 4NF6A 5TP9A 4YMAA 1OLAA 1BTJA 4GOTA 4XIGQ 5DVIA 2P2AA 3O29A 1Y9UA 4F3SA 4I8CA 1IXIA
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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