3H7MA

Crystal structure of a histidine kinase sensor domain with similarity to periplasmic binding proteins
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
RDRHRTIVVGGDRDYPPYEFIDQNGKPAGYNVELTRAIAEVMGMTVEFRLGAWSEMFSALKSGRVDVLQGISWSEKRARQIDFTPPHTIVYHAIFARRDSPPAAGLEDLRGRKVALHRDGIMHEYLAERGYGKDLVLTPTPADALRLLAAGGCDYAVVAMVPGMYIIRENRLTNLVPVARSIAAQRYGYAVRQGDAELLARFSEGLAILRKTGQYEAIRAKWLGVLEP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of a histidine kinase sensor domain with similarity to periplasmic binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Sensor protein
molecule tags Transferase
source organism Geobacter sulfurreducens
total genus 76
structure length 228
sequence length 228
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2009-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h7mA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h7mA02
3KJ7A 2B3FA 3SERA 2RKMA 4GOTA 2QSXA 1PBQA 1SD3A 4K3FA 2O68A 3FJGA 4U1ZA 1AMFA 4GF8A 1S50A 4BDLA 4M1VA 3KG2A 5CI5A 1DPPA 2I6EA 3ZKKA 3L6HA 5EHMA 3SKPA 2G93A 1OVTA 2F35A 3T93B 2DWJA 1A7LA 5I2NB 1B3EA 3RUMA 4ZEIA 2O84X 5CRYA 1PEBA 2R9JA 5F7VA 1A8FA 4PFTA 4HCYA 3MUQA 3N5LA 3BFUA 3M8UA 3VLVA 1XS5A 1IUDA 3EPEA 2F36A 3K01A 5CM6A 4I9DA 2I4BA 1A40A 2I48A 5I57A 2Y7KA 2P1SA 1XC1A 4F22A 4Q5TA 4FATA 2XX9A 1B9JA 3T22A 1VSOA 5H8FB 1JW4A 3EHSA 5H8QA 4U2RA 2ZMBA 3USDA 1GR2A 2F7CA 3QAXA 3TQWA 5L9MA 4I8CA 4BDNA 3SEXA 3BKIB 4NF8B 3M3LA 4I1DA 1MY3A 3O97A 5DYHA 3GBBA 3C36A 3O66A 4YMBA 1FTKA 1FTOA 1MXVA 2VD3A 3KOSA 3SEVA 3Q27A 2UVHA 4C1UA 4OTEA 3HHGA 4R73A 5JK4A 3TTLA 2V93A 2F8DA 4ZEKA 4QFNA 2VOZA 4R6KA 1FQCA 1I6BA 5I2NA 1GTKA 3LC8A 4JDFA 1A99A 1WDNA 4IY6A 1EH3A 3CR9A 1UIVA 4E0WA 5TP9B 2O7UA 1B7UA 1O7TA 5JEIA 3ZKLA 2XXHA 2I0BA 3TODA 3MVXA 2UYEA 4KYEA 3DLNA 2A5TB 1LB9A 3KJTA 1MXYA 1JW1A 1VR5A 4I62A 3LSWA 4YICA 3T96B 2YPNA 3ZS6A 2XXPA 3GLBA 2P2AA 1QUKA 2H5YA 4DXCA 1SI1A 4QSEA 2OK2A 2D5WA 2IA4A 3C33A 3C31A 4U21A 2O69A 1SW4A 1QUIA 3PUXE 4ONYA 1H45A 3DP8A 4FJPA 4NF6A 1SYHA 1NH8A 3THIA 4YKJA 2AL5A 3TUSA 5BWJA 3C4MA 5I56B 5EHSA 1BKAA 2DXYA 1D4NA 4XKRA 3W9WA 2Z22A 1XVXA 4QHQA 1N84A 5FHOA 3DELB 4ZS9A 3EQ1A 2AL4A 4YMAA 4R9GA 1P1NA 4H0WA 1D9YA 3WAFA 2GH9A 3TTKA 3FVNA 3VVFA 2XXXA 5KCJB 3W15C 4KI0E 4FAJA 4LUBA 4YZZA 1MH4A 3IR1A 4HW8A 3DP6A 1JETA 3RN8A 4RY1A 1M5FA 2DWHA 2PYYA 2O51A 3OENA 3KBRA 3H6WA 3PMVA 1P1QA 5FTHA 4H1XA 3C9HA 5AA2D 4R74A 1UQWA 4OZ9A 4WKMA 2HZLA 3KN7A 2ZYOA 1MS7A 2DVZA 2QMWA 4ZECA 3PPNA 3K02A 1RYOA 3UK4A 2QPQA 1LFGA 3IB1A 3CVGA 2D21A 5B7DA 1Y9UA 4NMYA 4F18A 5FHMA 1FQBA 3FXRA 3CI8A 2VP1A 3SEUA 3OO6A 4F29A 3RY3A 5I56A 3U8QA 5HM4B 3KZGA 1F9BA 3W9VA 3TYHA 5H8SA 2Z8DA 4NF4A 3EHUA 3S9LC 1Y1MA 4DIGA 4Z7EA 1IQ7A 3TAJA 1IZ1A 3G3IA 5BUUA 3BBRA 4KHZE 2E1SA 3CFLA 1MXZA 1B5JA 1N3WA 2PMSA 4EUOA 5JTYB 3FV2A 4MH5A 2PT1A 4ZE9A 2QL3A 3CG1A 3TMGA 3H3GA 1SQYA 4MF3A 1Q35A 4F1UA 4DCYA 1NL5A 5H8HB 4U1OA 4IGRA 3MP8A 4Z0IA 2V3UA 3HHFA 3FIRA 2XXIA 1R1NA 2HCAA 1B3GA 2GFEA 1I6QA 2DSFA 3IO4A 4E0XA 4H5FA 3DP4A 3MVYA 3LSFB 3PPRA 1ELJA 1XOCA 3OEMA 3OO8A 1B1HA 4Q0CA 5IKBA 1B3LA 1MY1A 4JBZA 4O3AA 4ELQA 3MPKA 3KSXA 2V84A 4G8MA 1MM7A 3H6TA 4KYDA 3O9PA 3IK6B 1R9LA 2ABHA 2UYFA 4G77A 4IY5A 3HO7A 5DVFA 1SW5A 3R7XA 1TXFA 4X1BA 3H7MA 1M5DA 4FEDA 4JSDA 4F2OA 4LONB 3IO6A 3O29A 1NFTA 1UTHB 3TEPA 1URGA 3TTNA 1AOVA 1IEJA 1IXIA 4PE5B 1Y4CA 1FTMA 4YKPA 2Q9TA 4EXKA 1R9QA 4FECA 5I2KB 3FASA 2R6GE 3QXMA 1B7HA 3VLWA 5AA2A 5AA4B 1B5IA 1LBCA 4OFOA 4H8IA 4WEPA 5DVJA 5JTYA 1MH3A 1Q1KA 2LAOA 2R71A 4PQJA 2ESNA 2Y84A 3S2VA 4EF1A 1UTBB 4G8NA 3I5OA 4PETA 3EN3A 1MQIA 4LQ2A 1QULA 3FXUA 2G29A 2RCAA 1POY1 5HBCA 3MVZA 4DDDA 2I4CA 4F3BA 5FTIA 4BDQA 2DE2A 3UIFA 5KDTB 1LLSA 3VVEA 2H9BA 1QJMA 4RXLA 3MWBA 5I59A 3T66A 1S7YA 4P11A 4JB7A 4G68B 4EQBA 1M5EA 3RTFB 1DMBA 3A3CA 3IL1B 1WODA 1H44A 3H4ZA 2ZYMA 3LUYA 1MXXA 1EU8A 1SDXA 1LCTA 5CMCA 1D3KA 4F2QA 4ZZEA 5HPQA 3EHTA 3LBSA 3VLUA 4LQ5A 1JVXA 1H3DA 4R75A 2I58A 3KOTA 3ONMA 1LAHE 4OERA 2DE4A 2XXQA 2ZYNA 4DCXA 1QVSA 4POWA 1B46A 5F1QA 4Q30B 2X26A 4GFRA 4TQUQ 1YCJA 1P1UA 2I3VA 2OLBA 4R6YA 2VHAA 5AE4A 3TCFA 3K2DA 2PX1A 1ZIUA 3D4GA 4OQOA 1EZ9A 3LSXA 3T9HB 2FYIA 2ALUA 2Q2AA 2P0SA 1N7WA 4FORA 4MLVA 3ODBA 3TZAA 1LGBC 2GRVA 4ZZAA 3K0VA 3V83A 3VXBA 4QFOA 1LAGE 2UXAA 1UTBA 3D4CA 4YKIA 1XHYA 1M5BA 2Z8FA 2F34A 3FXQA 1JW5A 2XXYA 4HS7A 4XIGQ 4O3BA 1CE2A 4PFWA 1IXHA 1Y1ZA 1PB8A 4F19A 3AXFA 3HSTA 1TWYA 3O6IA 3IOTA 4MFIA 3UP9A 3Q29A 2DWIA 1LBBA 2V3QA 4BLAA 1A54A 3OMBA 1R6ZA 3TCHA 1QUJA 3B6TA 1OQGA 2IEEA 2M8CA 1MDQA 2FNCA 1Y20A 4X1DA 2XX7A 4X48A 1LAXA 1AL3A 1BIYA 5H8FA 2XX8A 2DS9A 1AH5A 5H8NB 3PUZE 1P99A 1ZU0A 1QW0A 4GRKA 3PU5A 3VE1B 5A5XB 1Y3PA 5LOMA 2Y7RA 4BDOA 1PBPA 3MZ9A 5DEXB 2GHBA 2HFBA 3A09A 2UVJA 1A8EA 3TQLA 3PMWA 1TFDA 1MQJA 3VV5A 3U92A 5I58B 4NF8A 3IOWA 5CMKA 2D3IA 3N94A 4F31B 4AQ4A 1Y4TA 2NUVA 4ELPA 3MZ1A 3OSQA 4RA1A 4QF9A 1B4ZA 4X9TA 2ANJA 3RNNA 1O63A 1NNTA 3IORA 4RNSA 4LZ5A 4XXUA 2F78A 3FGSA 4MBPA 3C32A 4F1VA 4NWDA 1SYIA 1L5TA 4DZ1A 2NOOA 4NF5B 4GL8A 2REGA 4NEDA 3ILTB 1II5A 1FTJA 1GV8A 3Q25A 3TDJA 2FA7A 1ZMGA 3H03A 2W7YA 5TP9A 2XXWA 3RT6B 4WEDA 2QS2A 2QRYA 3K6WA 4OESA 1OQHA 1GVCA 1J1NA 2QS1A 2A5TA 4F39A 5I84A 3IX1A 5TPAB 1ZJLA 4JWXA 4H67A 3UN6A 2XD2A 5H8NA 5ELVA 2ZXTA 2WKYA 3GXAA 1B05A 1USYE 1RYXA 2DP8A 3FATA 1NNKA 5DEXA 3SDFA 3FUZA 1HSJA 3PPOA 3A3UA 3K6UA 2ZNUA 3QK6A 2F97A 3RT8A 5I58A 4RPNA 1SW2A 4YKKA 1N3XA 4AB5A 2E0SA 3FJ7A 1LFHA 4OWDA 1SI0A 2UVIA 3FVOA 4EQ9A 2OCUA 2XD3A 1XT8A 1GGGA 2ONRA 1FQAA 5J1DA 1P1WA 4G4PA 2AIXA 1DTGA 3K1NA 1SW1A 2X7QA 1DPEA 4NF5A 5DVIA 1Y3QA 2OZZA 1M5CA 3OD7A 4ZE8A 1MY4A 1MPDA 3PMXA 2OBGA 3EF7A 3MAMA 2Q8JA 1IITA 1B0LA 1HSEA 1MRPA 4FIMA 2H25A 1US5A 1EZOA 2DVCA 3U94A 4G2ZA 4GXSB 2QMXA 4PP0A 3ZSFA 1QKAA 3IOVA 3PUYE 5AA1A 5KCJA 1IXGA 1MQDA 4ESWA 3CFZA 3I6VA 1B32A 1WVJA 3PD8A 4GLIA 4H5GA 4GQOA 3PD9A 3Q28A 1JEUA 3H6UA 2Q2CA 1VFEA 3MP6A 3SEYA 3QUJA 4DXUA 1DTZA 3G3GA 3C35A 5TPAA 4QFLA 2OWTA 1OVBA 4DE8A 3KEIA 3N6TA 3FJMA 4XTCQ 4OENA 4P0GA 1FQEA 2CZLA 1H43A 2AYSA 4IGTA 3TCGA 3LR1A 2DOJA 3ECRA 3CG3A 4LATA 5L9SA 3S4UA 3VFJA 4LP2B 5CMBA 3K4UA 3JZJA 1Z7NE 4WXJA 5I57B 1URSA 2HAUA 3GZGA 3G7WA 3HCQA 5AA3A 1ATGA 1MPCA 1B0HA 1FQFA 4KYSA 4YAHX 1VFDA 3T9VA 5H8QB 5L8DA 3K6XA 3E9XA 4U23A 3ILUB 3T9UA 3K6VA 3IJXB 4YB6A 2QS4A 4OMBA 4QSCA 3TELA 3MJNA 3SEWA 1N76A 3Q26A 2HQ0A 5K2XA 4GWOA 4OFLA 1OMPA 2Z23A 4ZEFA 1B1XA 1N04A 3B6QA 5H8HA 2ONSA 1S9TA 3U72A 1MY0A 2ONKE 4F1YA 4IO3A 1LSTA 3MW0A 1MQGA 5CC2A 2HXWA 1FCKA 2H98A 1JQFA 4G8HA 4QRZA 2OJTA 2RC7A 1ZBMA 1B5HA 4MLQA 4BDRA 4JWYA 4NE4A 5B70A 4QSDA 3TTRA 4EF2A 1SVXB 3PUVE 4YB7A 1PB9A 5FHNA 3HV1A 2H99A 3QUFA 3HN0A 3E13X 3N6UA 4ND9A 3V89B 3GBAA 2B65A 4KR5A 2V3TA 1ZLQA 4DLDA 4P0IA 2I49A 4G68C 1YPNA 2I3WA 1XVYA 3PPPA 4ZEDA 1NKXA 2DYXA 1FW0A 4XKNA 2HEUA 4IO4A 1UTHA 2B3BA 1HSLA 1FTLA 2ZNSA 2O1MA 3K1MA 3G3FA 3TKDA 3H6VA 4UA8A 4F3GA 2H4IA 3L6GA 2X7PA 3B7DA 2Y7IA 5I2KA 4IB2A 1SBPA 4ELRA 3KSJA 2GHAA 4ISUA 1QKBA 3HPIA 5AA4A 4O3CA 5TU0A 1B58A 3K00A 1URDA 4KFQA 2YLNA 3MQ9A 3TPAA 3S9NC 1B7ZA 1LAFE 4NF6B 1KWHA 1NNPA 4M4GA 4KCCA 2NXOA 2XXVA 1YAEA 2CMOA 2VD2A 3CFXA 3IOUA 4RK2A 1MG1A 1PDAA 1LB8A 3KGCA 3E3KA 1NNFA 3H06B 5KDTA 1N0TA 2NVUB 4OETA 2F6PA 4LZ7A 4IO6A 4ECFA 3U1OA 3G3HA 2DWAA 3M3KA 4G68A 3RTWB 2KLFA 4KPTA 3RGYA 4NTLA 3E4RA 1I6AA 1NH7A 3UGWA 1DOTA 1Y3NA 3OXNA 1B3FA 4OXVA 3RPWA 2QS3A 1MQHA 3O28A 3O6HA 5CBSA 1POTA 5KZTA 5ICQA 2XXTA 3RQTA 3S9EA 2OWSA 4R72A 5DT6A 3QSLA 4RPOA 2RC9A 1JVYA 2PT2A 3TFLA 4U22A 1B4HA 2Y7PA 3MZBA 1MY2A 1N7XA 4KD5A 4U4XA 1JNFA 2UVGA 3M3FA 4POXA 1D9VA 4UACA 3O2AA 4ELOA 3OELA 3CSBA 5CMMA 3KN3A 1H76A 1PB7A 1OLAA 3OOAA 3VVDA 3VXCA 1NMUA 1B3HA 4KCDA 3SESA 2DQVA 2HZKA 4N6PA 2RF1A 3KN8A 2F6GA 2RC8A 1B2HA 3QIMA 4GL0A 3G3KA 3IAZA 3S9MC 4R9FA 3DM0A 2O6AA 4EXLA 3CSGA 3WAEA 1PC3A 2F7AA 4PFUA 1A55A 4N13A 4THIA 3CRBA 4FE8A 4NF4B 4R2FA 2RCBA 4QFKA 1BTJA 3KFMA 5M2VA 4OYVA 4RJZA 1B6HA 2PBWA 3UORA 3TTMA 3OSRA 2XXRA 4LVQA 1P1OA 1USYH 2XHDA 3IB0A 2BJJX 3FZVA 4LZ8A 4Q8RA 5ISUA 3IB2A 3OO7A 1LFIA 3P7IA 1OLCA 4GXAA 4H65A 3LSLA 4JXIA 1MXWA 5ITPA 3UA8A 1TT1A 3G3JA 4EDPA 5A5XA 4OFJA 4FEBA 2ZNTA 3PV0E 2Q89A 2REJA 3R26A 3MC2A 4TLMB 4C0RA 3I3VA 1RKMA 3OEKA 1I69A 5CBRA 2PVUA 3SETA 3R6UA 2HAVA 4N07A 3CIJA 3U93A 1MXUA 4DXBA 2O7IA 4KQPA 2YJPA 3MVWA 2NWJA 1MM6A 1B40A 3MBPA 5L9OA 1B52A 3V5AA 3B6WA 1O64A 3MPLA 1ANFA 1B51A 3PUWE 1MDP1 5ITOA 1YTVA 2F7BA 4YU0A 5IAIA 4GD5A 1LCFA 2QJEA 4TOZA 4GVOA 1BLFA 3FVKA 4JSOA 2RINA 1MPBA 4ZDMA 2Y7WA 3FD3A 3QYTA 1JEVA 4RYAA 4HCWA 3T9XB 4IO7A 5AA2B 4QFPA 4OEUA 5EYFA 3O6GA 3RLFE 4EQ7A 3PPQA 1DSNA 4TLLB 1ZKBA 4R6HA 3FV1A 2F5XA 4XKPA 4JWOA 4OEVA 1EZPA 4H6DA 3C34A 4PFYA 1FQDA 3JV9A 4AB6A 4LA9A 2ZYKA 3MP1A 2I0CA 1ZTYA 4GIZA 2O1LA 2Z8EA 4IO5A 3PGFA 4OVJA 5I59B 1BP5A 3V8XB 3VDFA 3N26A 3K1PA 4H8JA 2Q88A 1CB6A 2DXRA 1IIWA 4F3PA 2DE3A 3JYRA 3BFTA 2V25A 4RK9A 4C1TA 1Z7ME 2A5SA 4OHNA 4R2BA 4IO2A 4HTGA 1VE4A 4F3SA 2THIA 3OO9A 2XXUA 1IXCA 1OIBA 3FVGA 5ICTA 4L17A 5K2YA 4BDMA 1TFAA 4XKQA 4NWCA 1UIUA 1T0KA 4ESXA 4ZEBA 4YB5A 2VGQA 1US4A 3IJOB 1AIVA 3F11A 5DTBA 4U4SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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