3H7MA

Crystal structure of a histidine kinase sensor domain with similarity to periplasmic binding proteins
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
RDRHRTIVVGGDRDYPPYEFIDQNGKPAGYNVELTRAIAEVMGMTVEFRLGAWSEMFSALKSGRVDVLQGISWSEKRARQIDFTPPHTIVYHAIFARRDSPPAAGLEDLRGRKVALHRDGIMHEYLAERGYGKDLVLTPTPADALRLLAAGGCDYAVVAMVPGMYIIRENRLTNLVPVARSIAAQRYGYAVRQGDAELLARFSEGLAILRKTGQYEAIRAKWLGVLEP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of a histidine kinase sensor domain with similarity to periplasmic binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Geobacter sulfurreducens
molecule keywords Sensor protein
total genus 76
structure length 228
sequence length 228
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2009-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h7mA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h7mA02
3QAXA 4NF5A 1MQGA 4C0RA 4HCYA 5I2KB 3PD8A 1OQHA 3TEPA 4PP0A 4OFLA 2O7UA 3TCFA 3TZAA 3MP6A 2Q8JA 2PMSA 2HZLA 3SERA 5I56B 5FTHA 1MH4A 3QSLA 2OLBA 4NEDA 4PFUA 3T9HB 1OQGA 1HSJA 3IO6A 3UP9A 4P11A 3C36A 3SEWA 4M1VA 1LLSA 2GRVA 1GV8A 4H67A 3MP8A 2IEEA 3D4CA 5AA3A 4G8MA 1N0TA 3TUSA 4GQOA 2VGQA 1FTKA 3UIFA 1VFEA 5CBSA 3O2AA 2DXYA 3ILTB 1ZIUA 4Z7EA 1B32A 1Y20A 4FJPA 5ITPA 4R72A 3S2VA 1T0KA 3PUZE 2R71A 4NMYA 3G3JA 3LR1A 2REJA 1D9YA 3VLWA 4GD5A 4C1TA 5IKBA 5I2KA 4LATA 1A40A 4ELQA 2DYXA 2I4CA 3V5AA 3IJOB 1IXCA 2G29A 3QUJA 3O6HA 5L9SA 4U1ZA 1EZ9A 4E0XA 4BDNA 4MH5A 5I56A 2XX7A 2ONSA 3JYRA 3Q26A 5FHMA 3HSTA 3C4MA 4FECA 3VLUA 1P99A 5J1DA 2PT1A 3KBRA 2Q89A 4Q0CA 3K1MA 3E4RA 2ALUA 2XXWA 3PUWE 4QFLA 1QKBA 2HAUA 1IITA 4EUOA 2E1SA 1SBPA 1NH8A 2REGA 1LCTA 1SW5A 1VR5A 4PFTA 4NF8B 2XD3A 2XHDA 3M3LA 1BTJA 4ESWA 3TYHA 3M3FA 4KCCA 4WXJA 4LZ5A 1TXFA 5DT6A 1GGGA 4DIGA 3PPNA 3TDJA 2XXHA 4O3AA 4OEUA 1A8EA 4M4GA 4R2BA 2PBWA 2O68A 3CG1A 1XOCA 2AYSA 3PV0E 1TT1A 3TELA 1ANFA 3IK6B 4U4SA 4G77A 3HHGA 5I57A 5H8HA 2I4BA 5CMBA 2XXPA 3OEKA 4F39A 1B3HA 1NL5A 4Z0IA 4LP2B 1JVXA 3TCGA 4RK9A 5CMMA 4BDQA 1QULA 2I3WA 4FEDA 3TTRA 4F1VA 3V89B 4X1DA 3SEVA 2Z8EA 2D3IA 3G3HA 4LUBA 5IAIA 1D3KA 1SW4A 1AH5A 2Y7KA 2XXYA 3R6UA 4OVJA 4ZEDA 4NF8A 4OTEA 3RT8A 3MP1A 2OCUA 3ZS6A 5ICQA 3FV1A 3I5OA 2YLNA 2Y84A 1JW5A 4DCYA 4IO6A 3PD9A 1BIYA 1MDQA 2PX1A 3DLNA 1UIVA 1RYOA 4YB7A 1NFTA 4G8NA 4RPOA 4QSDA 2DVZA 4P0IA 5TP9A 4GL0A 3FVNA 3EHSA 1LB8A 5BUUA 3KSXA 5AA1A 3RNNA 1Y3NA 5L9OA 2NOOA 1AIVA 2F8DA 3O66A 1FQEA 2UVGA 1SI0A 3TTNA 2DP8A 3EPEA 2DSFA 3MZBA 2F5XA 3MPKA 4X48A 4ND9A 3O29A 1MY1A 1QW0A 5AA4B 2XXRA 4OMBA 4TQUQ 3KOTA 2Z23A 3K6UA 2WKYA 3OXNA 3H6VA 2F36A 3KZGA 4ZE8A 2B3BA 2HFBA 5EHSA 4XKNA 1DPPA 3PMVA 2QS4A 2AL5A 2DE3A 3OO7A 3S9MC 2H9BA 1FQFA 2YJPA 1J1NA 3PMWA 3OMBA 4L17A 3ZKLA 4F29A 1XC1A 1MY0A 3V8XB 1MXYA 3C9HA 2VD2A 4GWOA 1A7LA 3EN3A 4DZ1A 3CSGA 1QVSA 3FJGA 4H0WA 1UTHB 3ILUB 3OO6A 5TU0A 4G68C 1L5TA 2A5TA 3OD7A 1YAEA 5AA4A 1A99A 2Z22A 2Y7RA 3SKPA 3A3CA 2GH9A 3UN6A 2O84X 1Y1MA 1QUJA 2ZNTA 5CC2A 3TFLA 3FD3A 1WDNA 5FHNA 4H5GA 4R6KA 2F34A 2O6AA 5I58B 4H6DA 4F22A 2UXAA 2RC7A 2X7PA 4UACA 1B51A 1R9QA 3E13X 1EH3A 2NVUB 4PETA 4UA8A 2DWHA 2QS2A 2FA7A 4IO3A 3MPLA 5DEXB 2KLFA 3EQ1A 4F3BA 4QSCA 4ISUA 4JXIA 1MDP1 1NH7A 3T66A 1H76A 3IB1A 3KG2A 1JEVA 2F6PA 2VP1A 2HZKA 3C32A 1F9BA 4GIZA 3Q25A 2QSXA 4LZ8A 5CRYA 4YKIA 4OETA 5CMKA 3U93A 1B3EA 1B7UA 2BJJX 3BBRA 3T96B 4XXUA 1NNTA 3OEMA 4LQ5A 4F19A 3U1OA 3RTFB 3QUFA 5I58A 4GL8A 4RPNA 4BDRA 4BDLA 1ZTYA 4DXBA 1MXZA 1R1NA 4KPTA 3SETA 1ATGA 1M5EA 2YPNA 1FQAA 3U92A 3T9XB 4PQJA 1IEJA 3MW0A 5AA2A 1B1XA 4H8JA 5DEXA 3IAZA 3SEYA 4F3SA 2RINA 4DLDA 4XKQA 2ZXTA 4F3PA 3N6TA 2ZNSA 4KCDA 4OFJA 1MPDA 1NNFA 3G3IA 3T93B 3IO4A 3BFUA 2X7QA 4LA9A 3BKIB 1QJMA 3ODBA 4RK2A 2I58A 1ELJA 1USYE 1Z7ME 4OEVA 3FGSA 4F31B 5FHOA 3SEUA 4ZEFA 2I6EA 1TFAA 3FIRA 1POY1 3MC2A 2RC9A 1S50A 1RKMA 4IO5A 2HXWA 1H3DA 1B2HA 1UQWA 3K6VA 3H6TA 1P1OA 4JDFA 3KEIA 1BP5A 5DYHA 3FXUA 1B5JA 3AXFA 4ZS9A 4X9TA 1N3XA 1PBPA 2HAVA 5FTIA 1LAFE 4PE5B 3FV2A 1ZU0A 4IO2A 2UYFA 1MH3A 4F18A 1UTBB 1MXUA 1D9VA 3PGFA 3SESA 4ZEIA 5AE4A 3H06B 1IQ7A 3HPIA 3MVYA 2QPQA 3FUZA 5JK4A 3EF7A 2XXQA 1TWYA 2O1MA 3KN3A 2FYIA 2F7BA 4N07A 4I62A 3RUMA 1DPEA 1M5BA 4YB6A 2F97A 4OHNA 1SDXA 2ONRA 4JSOA 3VXCA 2FNCA 3G3KA 3KJ7A 4MLQA 4XTCQ 5I57B 2CMOA 5H8HB 3RGYA 1B7HA 3FVOA 2V93A 2ONKE 5HBCA 3N6UA 4PFWA 3CFZA 3IORA 3TAJA 5ITOA 2UVIA 2OWSA 4EQ7A 1CE2A 4EXLA 3WAEA 3GLBA 3K1PA 3QIMA 1XVXA 1VSOA 1FTLA 4U4XA 2X26A 1PDAA 3K0VA 3USDA 1UTBA 4KD5A 1MS7A 3CFLA 5LOMA 5AA2D 3EHTA 4O3BA 1P1QA 2VOZA 4YKPA 3G3GA 4F2OA 1URSA 3K00A 1FQBA 3SDFA 3OOAA 2DWIA 4R9FA 2F6GA 5TP9B 1IZ1A 4IGRA 3U8QA 1IXGA 3ONMA 3PUVE 4ZE9A 2V3TA 4YB5A 4MLVA 5ICTA 3TTKA 3TKDA 3K02A 3KJTA 2DXRA 1LFHA 3ZKKA 1O7TA 5M2VA 1SW1A 1MG1A 3PPOA 4JBZA 4QFOA 3P7IA 1YPNA 2ANJA 3VVEA 1MPBA 4F2QA 3JZJA 1B3LA 4GOTA 4GVOA 2E0SA 2XXUA 2H98A 4E0WA 4BLAA 2G93A 1B3FA 4POWA 1D4NA 2XX8A 4NF6B 3KOSA 2RF1A 3CRBA 1FTOA 1US5A 3O6GA 3GBBA 4FIMA 4HS7A 4G4PA 4YKJA 1OVTA 3S4UA 1B6HA 2HCAA 1DMBA 4ZEKA 2D5WA 4JSDA 3Q28A 1FQDA 4ONYA 1NNKA 3MUQA 3MVZA 2XX9A 2I0CA 4OENA 3LSWA 1B0HA 3FXRA 1ZBMA 5B70A 5F7VA 3S9NC 2NUVA 3VDFA 2A5TB 4GF8A 3UA8A 2Y7PA 4HCWA 4KYEA 2R9JA 1AMFA 3A3UA 3KN7A 2QRYA 3I6VA 4YU0A 3U72A 4GXSB 4OWDA 1MQIA 2PYYA 3G3FA 3OSQA 1H44A 1JVYA 4U22A 2W7YA 3E9XA 3S9LC 3IL1B 2O69A 1B0LA 4AQ4A 3KSJA 1FTJA 1CB6A 3MQ9A 4NF6A 3FJ7A 2GHAA 1GR2A 1IXIA 1DSNA 2D21A 4KI0E 1B4ZA 3IB2A 5KZTA 3RQTA 1VE4A 1N3WA 2UVJA 3VFJA 5ISUA 4YAHX 5CBRA 4ZECA 3H6WA 2ZMBA 4Q30B 1US4A 1A8FA 2ZYNA 1MXWA 3QK6A 3UORA 3ZSFA 5JEIA 3CFXA 3H6UA 1FQCA 4X1BA 2H4IA 4KYSA 1OVBA 1MQHA 4KYDA 4NE4A 5I84A 1PC3A 5H8FB 3O97A 2XXVA 3B6WA 3U94A 4PFYA 1TFDA 4YZZA 2DQVA 3I3VA 4H8IA 1PEBA 2PT2A 1JETA 4YMBA 4JWOA 1B1HA 3FZVA 2UVHA 1VFDA 3QYTA 2NXOA 4IGTA 3T22A 5AA2B 1MY3A 2M8CA 3FASA 3V83A 3L6GA 3FVGA 3CIJA 3LBSA 4ELPA 2OZZA 2DVCA 2QJEA 4F1YA 1MXVA 3RPWA 3IOWA 4YMAA 2ZYMA 4DCXA 1I6AA 3K1NA 1FTMA 1Q1KA 5H8FA 1JW1A 5I59B 2QMWA 3QXMA 1OLAA 4EF1A 3OO9A 1NNPA 3PPPA 4RNSA 4IB2A 4FORA 1S7YA 4O3CA 3TQLA 1AOVA 4RYAA 2Q9TA 3FVKA 5KCJB 1OIBA 1MM7A 2F78A 3TTMA 1QKAA 4I1DA 3H7MA 3TODA 2QS3A 4KHZE 1M5FA 3H3GA 4LONB 5HPQA 2VD3A 1SI1A 3DP6A 3IOUA 4XIGQ 4R9GA 4H5FA 5CMCA 1IUDA 4N6PA 3VVDA 1MRPA 2DE4A 3GBAA 1LBBA 2RCBA 1MM6A 4R2FA 2IA4A 3IR1A 3RTWB 3H4ZA 1B5IA 3PUYE 3R26A 2DOJA 1PBQA 2ABHA 2RC8A 2O7IA 3UK4A 2QL3A 5I59A 3GZGA 3K01A 1LFGA 2UYEA 4ZEBA 1YCJA 4NF4B 1GTKA 2V25A 4EF2A 3MBPA 4OFOA 1XS5A 4TOZA 4IY6A 5KCJA 3CR9A 1B40A 5H8NB 1S9TA 2XD2A 3O9PA 1FCKA 3MVXA 1B05A 4EQBA 3JV9A 3O6IA 4P0GA 3MZ9A 5KDTB 2P2AA 5L8DA 3B6TA 3LUYA 3T9UA 4BDOA 4R74A 1MQDA 3RT6B 2V84A 1Q35A 3WAFA 1I69A 4NWDA 2PVUA 1O63A 5BWJA 3IB0A 3LC8A 2OWTA 4JWXA 1MY4A 1URGA 4TLLB 3HN0A 2F35A 2B3FA 3M3KA 1B3GA 1LAGE 3RLFE 3TCHA 4NTLA 3TQWA 4U1OA 1Y4TA 3DM0A 5ELVA 3Q29A 1SYIA 5DVIA 1FW0A 3K2DA 1LAXA 4FEBA 1XT8A 4EDPA 3CSBA 2Z8FA 1ZKBA 1O64A 3C34A 1Y4CA 4NF4A 1HSEA 3M8UA 4G2ZA 1HSLA 2B65A 4Q8RA 3HO7A 2NWJA 1B46A 3VE1B 1PB9A 3TPAA 5H8NA 4YICA 3EHUA 1MPCA 4IY5A 1MXXA 4AB6A 3R7XA 3FJMA 3BFTA 5KDTA 3B6QA 3IX1A 1SW2A 3PPRA 3UGWA 1N7XA 2DWJA 5B7DA 2P1SA 4WKMA 1SD3A 4FAJA 4IO4A 2V3QA 1MY2A 5HM4B 4MBPA 3OENA 3LSLA 4U2RA 4THIA 3OO8A 1WVJA 2R6GE 2Q2AA 4MFIA 3CVGA 3OELA 3C33A 1B58A 1ZLQA 1GVCA 4JB7A 4RY1A 3DP4A 3MJNA 3DP8A 1I6QA 2OJTA 3FXQA 2Y7WA 2Q88A 1QUIA 1EZPA 1P1NA 3FATA 4OERA 4R6HA 5DTBA 3CI8A 3K6XA 3S9EA 2O1LA 4I9DA 2QS1A 4ESXA 1WODA 4WEPA 1DTZA 2Z8DA 1LGBC 1N7WA 5CI5A 1N04A 2XXXA 4FE8A 3HCQA 1I6BA 2ZYOA 1IIWA 1B7ZA 5A5XB 2DE2A 1DOTA 1XHYA 3GXAA 1EZOA 2AL4A 1AL3A 3T9VA 1LSTA 1H43A 4I8CA 3K6WA 4DXCA 3PPQA 4K3FA 3RN8A 4OYVA 4KR5A 2OK2A 5DVJA 3HV1A 4QHQA 3DELB 3VLVA 4N13A 4BDMA 2I48A 2I49A 1JNFA 1QUKA 2AIXA 2P0SA 3F11A 2DS9A 4G8HA 1PB8A 3IOTA 4ELRA 1P1UA 4G68B 5F1QA 4H65A 1DTGA 1SVXB 5I2NB 2CZLA 2THIA 5A5XA 4KFQA 2A5SA 2I0BA 4C1UA 5K2YA 5EHMA 3G7WA 5TPAB 4JWYA 4QFKA 4QFPA 5EYFA 3C31A 1R9LA 1USYH 3PMXA 1LFIA 4LQ2A 1A54A 3W15C 1LCFA 4OZ9A 3N94A 3VXBA 2I3VA 1PB7A 2F7AA 2OBGA 3MWBA 4H1XA 4KQPA 4GRKA 2XXTA 1N84A 4EXKA 4U23A 3RY3A 3KN8A 3N5LA 1N76A 2RCAA 5DVFA 3HHFA 3PU5A 1SYHA 4ECFA 4R75A 1MQJA 3SEXA 1XVYA 4G68A 4XKRA 1Y1ZA 1KWHA 1LAHE 1LBCA 3C35A 5I2NA 1POTA 4DXUA 2RKMA 1ZMGA 4NWCA 4WEDA 3N26A 5TPAA 3LSFB 2H5YA 4ZDMA 3KGCA 1B4HA 1P1WA 5L9MA 1B9JA 2ZNUA 4LZ7A 4OQOA 4OXVA 4YKKA 2ESNA 2V3UA 1B5HA 4AB5A 4F1UA 2DWAA 2Q2CA 3E3KA 4ZZAA 1BKAA 1B52A 3CG3A 3OSRA 2O51A 4FATA 3MZ1A 4LVQA 4XKPA 1SQYA 1JQFA 1OMPA 5JTYB 4DE8A 2ZYKA 4RA1A 3B7DA 2F7CA 1URDA 4QSEA 1YTVA 1A55A 1NMUA 1OLCA 1EU8A 5H8QB 2LAOA 1JEUA 2HEUA 1ZJLA 4EQ9A 2XXIA 2GHBA 1UTHA 4GXAA 3MAMA 1Y3QA 3Q27A 4QF9A 2H99A 3W9WA 3W9VA 4GLIA 3TMGA 4R6YA 4QRZA 4U21A 1II5A 4TLMB 5H8SA 1M5CA 3KFMA 4HW8A 4NF5B 3TTLA 4OESA 4F3GA 3PUXE 4POXA 4RJZA 3ECRA 4R73A 1R6ZA 1NKXA 3VV5A 2Y7IA 4MF3A 3A09A 4IO7A 3MVWA 1Y9UA 3VVFA 1LB9A 3D4GA 2HQ0A 5JTYA 2H25A 1JW4A 3IJXB 3H03A 1RYXA 3L6HA 3LSXA 3IOVA 1IXHA 2VHAA 5CM6A 4ELOA 5H8QA 1M5DA 2QMXA 1UIUA 1BLFA 1Z7NE 1Y3PA 2GFEA 3K4UA 4Q5TA 4HTGA 5K2XA 1H45A 4ZZEA 4QFNA 4GFRA 3THIA 4DDDA 4RXLA 3O28A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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