3IJXB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, hydrochlorothiazide
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 75
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijxB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijxB02
5K2YA 4IGRA 1PBPA 1LGBC 4IO6A 3Q25A 3OXNA 2HAUA 2DWJA 2WKYA 4FORA 3LSXA 2ONKE 1QUKA 4IGTA 2Q88A 5I2KB 2F6PA 4R2FA 2F7AA 3KN8A 3TPAA 2QS2A 5A5XB 3JYRA 2QJEA 2OJTA 2OLBA 2F6GA 1MXZA 2QPQA 4DXBA 1URGA 1MQHA 5KCJB 1GV8A 1B7ZA 4GVOA 2XD3A 3K1PA 3T93B 3TTRA 1JETA 3HPIA 4H8IA 5I56A 4KD5A 4YKIA 3OO9A 3TCHA 3IORA 3WAFA 5I2NB 4F3PA 2PBWA 4ZEIA 1A40A 1Y1ZA 1IXGA 3IJOB 1S9TA 3U72A 3PMVA 4JB7A 3ZSFA 4H0WA 5FHNA 3QUFA 1NH7A 2XX7A 4ZECA 3HCQA 3QAXA 1D4NA 5I57A 2ZYNA 5H8SA 2GRVA 2A5TB 1OVTA 3QIMA 1IXCA 3MJNA 4OFJA 4F1YA 1GGGA 1RYXA 2HAVA 2PVUA 4U4SA 1M5CA 4XKNA 5DEXB 1B4ZA 1S50A 1CE2A 1WODA 4JSDA 2Y84A 3IB0A 1GTKA 4OZ9A 1YPNA 5EHMA 1PB8A 3PGFA 5BUUA 3K0VA 4QFOA 4YB7A 4R9GA 1QVSA 5IKBA 4TOZA 1I6BA 3KBRA 1B5IA 2XXWA 4YU0A 4FE8A 3ZKKA 3MC2A 2DE2A 3PPNA 1XS5A 1LB8A 4ZEBA 3U92A 5TU0A 4JDFA 2KLFA 2LAOA 3QSLA 3O97A 1OVBA 3MZBA 3VDFA 2ZMBA 5L8DA 3R7XA 1AIVA 1Y3QA 5I59A 5AA2B 2BJJX 3MPLA 1ZKBA 4R6YA 4GL0A 3PV0E 1Y3PA 4PP0A 3FVOA 3IB1A 3O6IA 3IOUA 1N7XA 4R74A 4NF6B 2PYYA 1MG1A 1B32A 4HS7A 3E3KA 3S9LC 3CG3A 2NVUB 3FJMA 2P1SA 3T66A 2PMSA 1ELJA 4ECFA 4EQ7A 4QRZA 1SD3A 3OOAA 4I1DA 4KCCA 2E0SA 4OENA 1IZ1A 4WKMA 1QJMA 1USYH 5BWJA 1B40A 2RF1A 3L6GA 2ZNTA 4H1XA 1KWHA 4ZE8A 1IQ7A 2PT2A 4G2ZA 4PFTA 4ELPA 4X1DA 3RTFB 1SBPA 1SVXB 3TCGA 4OFLA 3VLWA 4F39A 2O69A 3SDFA 4K3FA 1MXYA 3BKIB 4GQOA 3E13X 3BBRA 3QYTA 4F3SA 2I48A 3KSJA 3TZAA 2I4CA 1YTVA 4GXAA 2DSFA 4U21A 1JW5A 3N26A 1GVCA 3ILTB 4OVJA 3TQLA 4AB5A 1N04A 3ILUB 2HZLA 4BDMA 4RK9A 4X48A 1P1OA 1M5DA 2V3TA 3HHGA 3LC8A 3HV1A 4G77A 2HXWA 3P7IA 2D3IA 2H9BA 5AA1A 4PQJA 1JQFA 3M3LA 2F35A 1FTOA 2PT1A 1B3FA 4QF9A 5L9OA 4HCWA 1QW0A 2I49A 1US5A 2OCUA 1MH3A 1MPBA 4U1OA 4GIZA 2F36A 4PFUA 1IITA 1J1NA 4ZS9A 3TKDA 2UXAA 3EQ1A 1PEBA 1VFDA 3MBPA 1MS7A 2XHDA 2DWAA 3FATA 5F7VA 3N6UA 1B6HA 4OWDA 5M2VA 3RGYA 3IK6B 3CR9A 4X9TA 4DZ1A 2HZKA 4FEDA 2F8DA 3KJ7A 4QSDA 3CFZA 3K6WA 5ITPA 1CB6A 3O6GA 5FTIA 3I3VA 4ZZAA 3UN6A 3DP6A 3TTMA 3TTKA 2DE4A 3MWBA 1LSTA 1XT8A 4LATA 2ZYMA 4ZZEA 2F5XA 1MDP1 2X26A 4FECA 1B3HA 3T9XB 4U2RA 3TAJA 2A5SA 4H5FA 5I56B 3PUZE 4JWOA 2Y7WA 3MZ9A 4R6KA 1H76A 4QFPA 1UTHB 3GLBA 3O2AA 3SEUA 4O3AA 1D9VA 1NNPA 3SEYA 3K00A 4KI0E 4NWDA 4YKKA 1FW0A 5I57B 3OEKA 5KZTA 4POWA 2V84A 4P0GA 3QXMA 1VE4A 2AL5A 3OD7A 4BDRA 1JVYA 4U22A 4NF4A 2DP8A 1MXWA 3PMXA 4Q0CA 2OWTA 2GHBA 2YPNA 3G3IA 1P1WA 3MW0A 3FV1A 3K6UA 1JW4A 4N07A 2NUVA 5CRYA 4KPTA 4GOTA 2FNCA 3EPEA 2XXHA 3O29A 3CI8A 3RUMA 2D21A 1XOCA 3H06B 1IXHA 5B70A 3HHFA 4Z0IA 3GBBA 1FTLA 4I8CA 3FXRA 3OSQA 1P99A 1AL3A 3G7WA 4LQ2A 1SDXA 3TTNA 3DLNA 4BDOA 2Q9TA 2DWHA 3FGSA 3F11A 5I59B 3RN8A 1T0KA 4U23A 1MQIA 1MY1A 3VLUA 1SQYA 3H03A 1H45A 4TLMB 1MDQA 4NF8B 2XXYA 2XXIA 4QSCA 5IAIA 3QK6A 3D4CA 2W7YA 3B6WA 4F19A 1ZJLA 4YMBA 1MPCA 3KJTA 1QUJA 4IY6A 2AL4A 4L17A 2Q8JA 4AQ4A 4UACA 2DYXA 1EZ9A 3PUWE 1WDNA 1FTMA 2R9JA 4G8MA 4P0IA 1TFDA 2H25A 5ICTA 3RNNA 4RY1A 4DIGA 3V89B 1ZIUA 3DELB 3K6XA 4X1BA 3CVGA 4MH5A 4G4PA 3PPQA 1A7LA 2XXXA 1OLCA 3SEXA 1JEUA 4H65A 2VHAA 3PD9A 3VE1B 4ZEFA 1NNKA 3G3HA 4NEDA 1QUIA 5H8QA 1LLSA 4WEDA 1I69A 2VGQA 2GHAA 2XXPA 4P11A 3G3KA 1HSJA 1EH3A 2H98A 5H8FA 2FYIA 1BTJA 1AOVA 1PBQA 2REJA 1B0HA 1MM6A 2DS9A 4BLAA 3GBAA 4OMBA 3LBSA 4PFWA 2HFBA 1SW1A 1MQJA 3FVKA 2ALUA 5JTYA 3FXQA 2DXYA 1YAEA 2F7CA 5JEIA 2I58A 4GFRA 4YAHX 4ELQA 2F97A 3CG1A 3TFLA 3FXUA 3KOSA 5EHSA 2VD3A 2V93A 1F9BA 3FVGA 2DVZA 2XXTA 4ZEKA 1NMUA 4YB5A 1MXXA 3D4GA 4NTLA 2V3UA 5AA2D 2ANJA 1USYE 2O1MA 1LB9A 3CSGA 3TMGA 4OQOA 5CI5A 1Y20A 1MY0A 1UTBA 2ZNUA 4H8JA 2F34A 3TODA 3R26A 1JEVA 1FQFA 4ND9A 3UP9A 5B7DA 1MY3A 1S7YA 1BP5A 3OENA 1ATGA 4ESXA 4EDPA 4R72A 1RKMA 4IO5A 2XD2A 2DOJA 2Q89A 1SYHA 4ESWA 4XKQA 1QULA 3H3GA 1DTZA 4O3CA 4IO7A 4XXUA 3S9MC 4O3BA 1FQBA 2VOZA 4JWYA 3BFTA 1POY1 3A3CA 1II5A 2RC9A 1EU8A 3IB2A 5KDTA 5HM4B 4G8HA 1ANFA 3PU5A 5AE4A 3EHUA 1FQDA 3RQTA 1LCTA 4JBZA 2I4BA 4JSOA 3K4UA 1SW4A 4LP2B 4IO4A 3TCFA 3S9EA 1M5FA 1LFHA 4QSEA 5LOMA 2ABHA 1D9YA 2Z23A 3CRBA 4MLQA 1O64A 1Q35A 2Z8EA 3IOVA 2Q2AA 1DSNA 3MZ1A 3S2VA 1ZLQA 4GF8A 1LFIA 2XXRA 2QSXA 3IL1B 4E0XA 4E0WA 2O68A 2CZLA 4C1TA 1NKXA 3S4UA 5CMKA 1QKAA 2UVIA 3UA8A 2XXVA 2F78A 4DE8A 1A8FA 2ONRA 4H5GA 1QKBA 4JXIA 4U1ZA 2OZZA 3UORA 3CSBA 5L9MA 5KCJA 4YKPA 5CM6A 5F1QA 2REGA 4XKRA 3KG2A 3Q26A 3H4ZA 4OYVA 3K1NA 4Z7EA 2QMWA 3PPPA 3SETA 4F2QA 4EF2A 3TYHA 4OTEA 3HSTA 2G93A 4BDLA 5I2NA 1M5EA 1H3DA 1XHYA 1DPPA 2D5WA 3IOTA 3PUXE 1NH8A 4OEVA 4BDNA 4RNSA 3TUSA 2QS1A 5TP9A 3C35A 4F22A 4MF3A 1TT1A 4GLIA 5H8HA 3W9VA 1BLFA 3UGWA 1OLAA 1R9QA 2F7BA 5DEXA 3KN7A 5AA3A 4RPNA 5HPQA 4F2OA 1Z7ME 3GZGA 4WXJA 2O1LA 4NWCA 4FJPA 3EHTA 4KQPA 1OMPA 4QFKA 1PB7A 1B2HA 1LAFE 1HSEA 3SEWA 4I9DA 3N6TA 3WAEA 3KN3A 3KOTA 5H8FB 1B3GA 3FVNA 3N94A 5CBSA 2I0CA 5JTYB 4ZDMA 4QHQA 4Q30B 2I6EA 3O28A 4N13A 4OESA 3W15C 3T9UA 2O84X 3KFMA 4LONB 2THIA 3KEIA 3CFXA 3C9HA 3EHSA 1M5BA 2B3FA 2NOOA 3LSWA 1Y4CA 1XVXA 1FTKA 3OMBA 1L5TA 2V3QA 1UIVA 3E9XA 3Q29A 2HEUA 5CMCA 1SW2A 5HBCA 4YICA 2H99A 2Y7KA 3U8QA 3VVDA 3EF7A 3JV9A 1JNFA 2ZNSA 1Y3NA 2R71A 3IO6A 4IY5A 3LR1A 1I6AA 3W9WA 1MQGA 3E4RA 2FA7A 5TPAA 3KGCA 3IX1A 5FTHA 4ISUA 2PX1A 3THIA 3VVEA 2GFEA 1A55A 1EZOA 4XKPA 2R6GE 3FV2A 3MVXA 2OK2A 4DDDA 1IXIA 3MUQA 1ZTYA 3VXCA 5KDTB 1SYIA 2QRYA 1A8EA 1LAGE 3MVZA 2UYEA 3IOWA 1IUDA 4AB6A 1NL5A 1Y4TA 4C0RA 1N84A 3R6UA 1B58A 3RLFE 1XVYA 2I0BA 2O6AA 4LUBA 1SI0A 3Q28A 4ZE9A 3RTWB 1RYOA 2QL3A 1R6ZA 5CMBA 3M3KA 3PUVE 3C31A 3IAZA 3B6QA 4EQBA 2IA4A 3PUYE 3OO8A 4R9FA 3PMWA 1B52A 4HCYA 4FEBA 3ECRA 4YB6A 3A09A 3MP8A 5CBRA 3PPOA 5AA4A 4QFNA 2X7PA 4IB2A 4OEUA 2H4IA 3K02A 3EN3A 3OSRA 1MY2A 1IIWA 1OQHA 1DOTA 5I58A 4ONYA 3B7DA 4MLVA 1TXFA 5CMMA 4F29A 4Q8RA 3G3JA 1HSLA 5DVJA 1B5JA 1N3WA 2P2AA 4HTGA 4R73A 4NF5A 2DXRA 1FTJA 3VV5A 3A3UA 5CC2A 1O63A 4YKJA 3QUJA 3ZKLA 3USDA 1MXUA 3H6UA 3L6HA 1MQDA 4U4XA 3I5OA 2O7UA 3T9VA 4KHZE 3Q27A 4UA8A 1TFAA 2I3VA 1WVJA 2UYFA 3G3GA 4F31B 3C33A 1URDA 3PD8A 1LCFA 3FIRA 4OHNA 1B0LA 1SW5A 3I6VA 2P0SA 5DVFA 1Y9UA 4EXKA 1B1HA 1OQGA 1UTHA 4G68A 2OBGA 5H8NA 1B1XA 5J1DA 2AYSA 4R2BA 4FAJA 4RXLA 4THIA 4LZ8A 2RC7A 5TP9B 1AMFA 2Z8FA 1Y1MA 4NMYA 3LSLA 4MFIA 1Z7NE 3TDJA 4PE5B 3OELA 3CIJA 5H8HB 1MM7A 4F3BA 3LUYA 3M8UA 2UVHA 3PPRA 5DYHA 2DVCA 3MQ9A 4R6HA 2HCAA 2H5YA 4XIGQ 1NFTA 1PC3A 3H6WA 2ESNA 1YCJA 1FQCA 4KYDA 4DLDA 2QMXA 4GD5A 1Q1KA 3FD3A 2ONSA 4KCDA 3TTLA 3SERA 1SI1A 1VR5A 3O6HA 4GXSB 4EXLA 3ODBA 1B51A 1LBCA 4DCYA 1P1UA 4I62A 4OETA 1B5HA 4C1UA 3SKPA 4M4GA 3FZVA 4WEPA 4JWXA 4NF8A 2CMOA 1ZMGA 2O7IA 3FJ7A 2G29A 4YMAA 1DMBA 1POTA 4NF4B 2Y7IA 1URSA 2V25A 1OIBA 1FQAA 3IR1A 3K1MA 4LQ5A 2VD2A 1B3EA 3RT8A 2NWJA 1I6QA 1PB9A 1N7WA 5DT6A 4HW8A 3TQWA 5TPAB 3H6TA 5DTBA 3SEVA 4PETA 4XTCQ 4BDQA 1A54A 5I2KA 1NNTA 1H43A 4NE4A 3RT6B 4RK2A 4DXUA 5DVIA 3OEMA 1XC1A 1US4A 3MPKA 3IO4A 5A5XA 5EYFA 2RCBA 3FUZA 1R1NA 2ZYKA 3AXFA 4RJZA 1N0TA 4TQUQ 2Z8DA 2DE3A 1O7TA 2XX8A 3C34A 1BKAA 3HN0A 3U94A 3GXAA 4LA9A 2Y7PA 4MBPA 2HQ0A 3K01A 3H6VA 3KZGA 3VFJA 2DWIA 2UVJA 2QS3A 4EUOA 4G68C 1AH5A 4ELRA 3DM0A 4Q5TA 4QFLA 2AIXA 1ZU0A 4R75A 2A5TA 1UQWA 3V5AA 3MVYA 3ZS6A 1DTGA 5AA4B 3VLVA 4KFQA 4KYSA 1B46A 2RC8A 3K2DA 3O9PA 1LFGA 4KR5A 3MVWA 3C36A 1N76A 5I58B 4POXA 4GL8A 3UIFA 4ZEDA 2Z22A 5H8QB 1FCKA 1B7HA 4NF5B 4RPOA 2UVGA 3LSFB 4F18A 1MY4A 2O51A 2RINA 3S9NC 5FHMA 3OO7A 5JK4A 4OERA 4F1VA 1H44A 1JVXA 5FHOA 2YJPA 1MPDA 4GRKA 3V8XB 4FATA 4EF1A 2XXQA 2M8CA 3U93A 2VP1A 2Y7RA 3IJXB 3FASA 2XXUA 4M1VA 3M3FA 3RPWA 5AA2A 3KSXA 4TLLB 5I84A 2YLNA 3DP4A 5ELVA 1JW1A 2QS4A 2ZXTA 3VXBA 3TELA 4RA1A 4G68B 4LZ7A 1MH4A 3FJGA 1VSOA 2DQVA 4NF6A 5H8NB 3B6TA 1MRPA 4G8NA 1UTBB 3C4MA 5K2XA 3HO7A 4N6PA 4LZ5A 3H7MA 2RKMA 2I3WA 4EQ9A 4H6DA 4LVQA 3MP1A 3SESA 1BIYA 1LBBA 2RCAA 1P1QA 2E1SA 4DXCA 3C32A 5ISUA 1MXVA 1P1NA 3RY3A 3OO6A 1B3LA 4DCXA 4PFYA 4IO3A 3G3FA 1B05A 4OXVA 3U1OA 3O66A 4YZZA 1GR2A 1R9LA 1B4HA 3K6VA 4IO2A 3DP8A 4F1UA 4FIMA 3N5LA 3T9HB 1N3XA 4OFOA 2GH9A 2X7QA 1DPEA 4RYAA 3T22A 1ZBMA 3T96B 5ICQA 1EZPA 2B3BA 4H67A 2OWSA 2XX9A 1UIUA 1PDAA 1B7UA 1D3KA 1LAHE 3ONMA 2NXOA 1A99A 1LAXA 1NNFA 4GWOA 3BFUA 1FQEA 3JZJA 2IEEA 3TEPA 3CFLA 4ELOA 1TWYA 2Q2CA 1B9JA 5L9SA 4KYEA 3MP6A 3UK4A 1VFEA 3VVFA 3V83A 2B65A 4F3GA 2ZYOA 3MAMA 1IEJA 5ITOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5K2YA 2ZZWA 4IGRA 1PBPA 1LGBC 4OVRA 5EYGA 4IO6A 3SZPA 2WYPA 3Q25A 3OXNA 2HAUA 2DWJA 2WKYA 1FSAA 4FORA 3LSXA 2ONKE 1KA1A 1QUKA 4IGTA 2Q88A 5I2KB 2F6PA 4R2FA 2F7AA 3KN8A 2CZKA 3TPAA 2QS2A 5A5XB 3JYRA 2QJEA 2OJTA 2OLBA 4MNPA 2F6GA 5ET6A 1MXZA 2QPQA 4DXBA 1URGA 1MQHA 5KCJB 1GV8A 1B7ZA 4GVOA 2XD3A 3K1PA 3T93B 3CHGA 3TTRA 1JETA 3HPIA 4H8IA 3B8BA 5I56A 4KD5A 4YKIA 3OO9A 5EQAA 3TCHA 3IORA 3WAFA 5I2NB 1YYZA 4F3PA 4QXDA 2PBWA 4ZEIA 1A40A 1Y1ZA 1IXGA 1FPKA 3IJOB 1S9TA 3U72A 2WBBA 3PMVA 4JB7A 3ZSFA 4H0WA 5FHNA 3QUFA 1NH7A 2F3DA 2XX7A 4ZECA 4LN5A 4PCDA 3HCQA 3QAXA 1D4NA 5I57A 4NQ8A 2ZYNA 5H8SA 2GRVA 2A5TB 2WYKA 1OVTA 4O7IA 3QIMA 1IXCA 3MJNA 4OFJA 4F1YA 1GGGA 1RYXA 2HAVA 2PVUA 4U4SA 1M5CA 4XFEA 4XKNA 5DEXB 5LTCA 1B4ZA 1S50A 1CE2A 3D1RA 4O7MA 1WODA 4JSDA 2Y84A 3IB0A 1GTKA 4OZ9A 1YPNA 5EHMA 1PB8A 3PGFA 5BUUA 3K0VA 4QFOA 2VT5A 4YB7A 4R9GA 1QVSA 5IKBA 4TOZA 1I6BA 4PC9A 3KBRA 1B5IA 2XXWA 4YU0A 4FE8A 4MIJA 3ZKKA 3MC2A 2DE2A 3PPNA 1XS5A 1LB8A 4ZEBA 3U92A 1DCUA 5TU0A 2Q8MA 4GX3A 4JDFA 4O94A 2KLFA 2LAOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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