3IL1B

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, idra-21
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3il1B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3il1B02
5CMMA 3UA8A 1GVCA 1IEJA 3CI8A 4YKPA 3Q26A 3MP6A 4G77A 4FEDA 4OQOA 1AOVA 4IO7A 4ZEDA 2I49A 2F8DA 2AYSA 3QAXA 1B3LA 2O68A 4BDLA 4MLQA 1DOTA 2ZYKA 3T9XB 1HSEA 4G68A 4R6KA 2F6PA 3TMGA 1Y9UA 5HM4B 1MH3A 3EHUA 2GRVA 3DELB 4KD5A 3K4UA 1OQGA 2R71A 3QXMA 4XKPA 2NUVA 2I0CA 3K0VA 1O63A 1D4NA 2XXQA 3VV5A 1PB7A 5LOMA 1MXYA 3V5AA 2VP1A 3E3KA 4EDPA 1LB8A 3FXUA 5AE4A 2O7IA 1AIVA 2G93A 1FTOA 1RYOA 3IOWA 3FJGA 4NWDA 1Y3NA 3G3KA 3LUYA 2I3WA 3S2VA 4K3FA 4RXLA 1SI1A 2A5TA 4YKIA 4EQ7A 4F3SA 4ESWA 3F11A 4G68B 1MXZA 1TFDA 2QMWA 1UQWA 2VGQA 4BDNA 3SEXA 1OLAA 3A3UA 4UA8A 1SW4A 1D9VA 3D4GA 4R9FA 5CC2A 3IR1A 4POXA 2DP8A 4GL8A 3MJNA 5IAIA 1B0HA 4GOTA 4X1DA 2V3TA 1EZ9A 2Z22A 4GFRA 1B05A 1QKAA 3CFZA 1SI0A 4ZDMA 3G3IA 2O1LA 2ONRA 4LATA 2AL4A 3PPQA 4MLVA 1QUIA 4ECFA 2A5TB 1VSOA 3IAZA 1QUJA 3KN3A 3MAMA 2ZYOA 5H8SA 3U72A 3JV9A 2XX8A 1LCFA 2RF1A 3OMBA 2AIXA 1FQFA 4C0RA 4YMBA 4JXIA 3TODA 1PC3A 4N07A 1FQBA 3O66A 3MUQA 4ZEBA 2PVUA 4TOZA 1B3GA 2A5SA 4RA1A 3FVGA 1MDQA 4H65A 3N94A 1B40A 2UYFA 1MQJA 2HZLA 5I58A 3OO9A 4FIMA 3M3FA 1UIUA 3OELA 4DDDA 4QSDA 5AA3A 1B2HA 2E0SA 5ELVA 4OFJA 4FATA 1XC1A 1EH3A 4LA9A 3E13X 1BLFA 3O9PA 1WVJA 4G4PA 1JETA 4IGTA 3TFLA 1B5HA 4O3BA 2Y84A 5EHSA 1M5DA 2F6GA 3MQ9A 2F97A 4IO2A 4GL0A 1URGA 4MH5A 2GH9A 5I56B 5JK4A 5FHNA 2X26A 5J1DA 5I58B 4H5GA 4BDOA 4F22A 3S9NC 4UACA 3DLNA 3MZBA 4XKQA 5JEIA 3PMXA 2ANJA 4NEDA 2W7YA 1MY4A 5I57A 2DE2A 3MPKA 1PB9A 3W15C 3VVFA 2VHAA 3C35A 4EXLA 1XS5A 3CRBA 4GVOA 2B3BA 3IJOB 1LFGA 1AL3A 3TAJA 1UIVA 1B5IA 1LGBC 4Q0CA 4R2FA 3RT8A 3FJ7A 4G68C 3G3HA 4MFIA 3RTWB 4OXVA 3HHFA 2AL5A 1LAGE 3M3KA 2H9BA 1Q35A 3HN0A 3K1NA 4FE8A 2V84A 2RC9A 3FVOA 3M8UA 4DE8A 3TTKA 4GXSB 5I57B 1XT8A 4Z0IA 2Z23A 3JYRA 1B58A 1LB9A 5TPAA 4EUOA 1M5CA 4NMYA 1R9LA 2Y7KA 3EHSA 3H6UA 2RCBA 1R1NA 1N76A 5CMKA 3M3LA 4M4GA 2DSFA 1WDNA 4WXJA 3DP8A 1ATGA 4EQBA 1R6ZA 3WAFA 4JWYA 3LR1A 2I3VA 3VVDA 4KQPA 1IXHA 4EF2A 4C1TA 3MZ1A 1MRPA 1PEBA 3MW0A 3OD7A 4RJZA 1LCTA 2R9JA 3VE1B 3OSQA 1OIBA 1QJMA 3GXAA 2V3UA 4P11A 3THIA 5TPAB 4QF9A 3MVXA 1B1XA 2O1MA 3V83A 4TQUQ 1PB8A 1IUDA 1LSTA 2OLBA 3JZJA 1MH4A 3T9VA 2ZYMA 4P0GA 5AA4A 4EF1A 1IITA 2PYYA 3Q29A 1AMFA 5H8QA 3TYHA 3KN8A 3SDFA 1B3EA 2QJEA 1NH8A 3MPLA 3GBBA 3TTMA 3OEMA 4LZ8A 2QSXA 4MBPA 1B1HA 4KYEA 5AA2A 3VXCA 3Q27A 5DEXA 3SKPA 4GRKA 4DCYA 2XXRA 1A8FA 1B51A 3EN3A 3TTNA 4H8JA 5AA4B 4I8CA 1Y1ZA 3MBPA 1IIWA 5IKBA 5FTIA 1IXIA 3BKIB 4XXUA 5H8QB 3FJMA 3K2DA 5EYFA 1M5BA 3DM0A 3UN6A 4KCCA 4ONYA 1Y20A 5CM6A 1LAHE 1M5FA 2V3QA 4OERA 2RC8A 2UVGA 2I48A 2PBWA 3MWBA 4QFNA 1TFAA 3C31A 3UIFA 4RPNA 3K1PA 5TP9B 3U93A 4NE4A 3O28A 2YLNA 3ODBA 5DEXB 2DWAA 1JVYA 5CMCA 1MDP1 3EF7A 3IX1A 4OMBA 4WEPA 2ZXTA 1NNTA 4DIGA 2QRYA 2B3FA 3PUYE 4YKKA 1JW5A 2FYIA 3LSLA 3TPAA 4U1ZA 1LFHA 3D4CA 5DT6A 4E0XA 2Z8FA 2CZLA 1Z7NE 2ABHA 4GWOA 4U23A 3MVZA 5B7DA 3MVYA 3V89B 4LUBA 3OSRA 4BDMA 5CRYA 5ITPA 1VE4A 3H7MA 2I6EA 5H8FA 2QS4A 4AQ4A 2REJA 2O6AA 3TZAA 5CBSA 2P0SA 2YJPA 3FGSA 4EXKA 3PMVA 4IO4A 3U94A 4DXCA 4ZZAA 3G7WA 4FAJA 1NNFA 1JQFA 1Q1KA 4N13A 3MP1A 3H6VA 3G3FA 2H98A 2QS3A 3C36A 4GD5A 2F78A 4Q8RA 4G2ZA 3ZKLA 1P1UA 1UTHA 1DPPA 2XHDA 1GTKA 1PBQA 3G3GA 1MPBA 3B7DA 1MXUA 5H8FB 4ELRA 1MY1A 4QFPA 4M1VA 1US4A 3OENA 2B65A 4F3BA 5JTYA 3LSWA 4EQ9A 4OESA 1MQDA 1CB6A 2GHBA 1DTGA 2ESNA 3I3VA 3C34A 3SEUA 4L17A 1Y3QA 2DWHA 3UK4A 2G29A 3QK6A 1H3DA 4GIZA 2VOZA 3SEVA 2CMOA 2F5XA 3IB0A 1BIYA 1DMBA 3T66A 1CE2A 1TWYA 4F1YA 1N3XA 1B3HA 2F7AA 3PUVE 1B9JA 1XOCA 2UVJA 2I0BA 1UTHB 1USYH 1B4ZA 1B4HA 4PETA 3PPOA 2QS2A 3FZVA 1B6HA 4IO6A 5JTYB 1LBBA 3K6XA 3QYTA 4ZEFA 2HAUA 4JBZA 1EZOA 3N26A 4OVJA 3O6GA 5CBRA 2KLFA 3ZSFA 1MG1A 2Q89A 2ALUA 4F29A 3EPEA 2XX7A 4YKJA 1IXCA 4LVQA 3IL1B 1NNPA 1Z7ME 1SVXB 3FATA 3DP4A 2PX1A 4ZECA 1LAFE 1ZTYA 3SETA 2HCAA 2XD3A 3HPIA 1ZBMA 3C32A 4U21A 1B3FA 1J1NA 3TTRA 3A09A 3I5OA 3A3CA 3PUXE 3IJXB 4OZ9A 1FTKA 4YU0A 1BTJA 3CFXA 2UVHA 3K1MA 3ZS6A 3G3JA 3T96B 5ITOA 1EZPA 1PDAA 1I6BA 1ZIUA 1URSA 4DCXA 4HW8A 1MM7A 1B0LA 4F1UA 2OZZA 1NH7A 5I2NA 1UTBA 4Q5TA 3RNNA 5BUUA 4R9GA 1SW2A 4DXUA 2Q2CA 1FQAA 1SYHA 5L8DA 1PBPA 4OYVA 3PPNA 4ZS9A 5EHMA 4FORA 3H6WA 3HV1A 3VFJA 3KOTA 4GQOA 3GBAA 2DS9A 3C33A 3HHGA 3TQWA 3H3GA 2DE3A 2ZMBA 1I69A 3K01A 1SW1A 4OENA 5I2NB 3ILUB 1UTBB 1HSJA 4OEUA 3U8QA 3S9LC 3RY3A 1OVTA 3FXQA 3QSLA 2DE4A 1I6QA 4RNSA 1JW1A 5KZTA 4F18A 3WAEA 4ESXA 5DVJA 3L6HA 1MPDA 4FECA 3CG3A 2QS1A 2Y7RA 4E0WA 5B70A 1I6AA 3ILTB 3PPRA 1FTLA 3IORA 2E1SA 3TKDA 3O29A 3B6WA 2I58A 4PFTA 1P1QA 3AXFA 3RTFB 1MQIA 1S50A 1N7WA 3IOUA 2RKMA 5ISUA 3B6TA 4H5FA 1US5A 4LP2B 1MXVA 2XXYA 4QFLA 2PMSA 5DYHA 1Y3PA 4TLMB 2IA4A 2DVCA 1P1OA 1SYIA 2FNCA 2NVUB 4O3CA 4U4SA 1P1NA 3S4UA 2DWIA 1FTJA 4F2QA 4PE5B 2F35A 3MZ9A 1IXGA 2GFEA 1N7XA 4H8IA 1A7LA 2RC7A 3RGYA 4G8MA 3KN7A 1QW0A 3PD9A 4RYAA 4G8NA 3CSGA 5FTHA 5KDTA 1IQ7A 5DVFA 2F36A 3MP8A 2F7BA 5K2YA 1YAEA 4PFYA 3U92A 4LONB 3N6UA 1USYE 4RY1A 3FXRA 1ZU0A 5FHOA 4YAHX 2DWJA 3QUFA 2O7UA 2RCAA 4YB7A 3O6HA 1MXXA 2XXXA 2I4CA 2VD3A 3C4MA 4JSOA 4XTCQ 4O3AA 2D3IA 5F1QA 4QFKA 3TDJA 4F3GA 2QPQA 3KSXA 4MF3A 1SDXA 1XVYA 3TQLA 4Z7EA 4R72A 4ZZEA 5I2KA 3CR9A 5KDTB 3SEWA 4YICA 4OFLA 5DVIA 4ELQA 4QSCA 4LQ2A 1YTVA 4XKNA 4KCDA 1N04A 3IB2A 3SERA 2M8CA 2NXOA 1XHYA 5I84A 2LAOA 3H03A 4YMAA 3PD8A 1II5A 2DYXA 2OBGA 2Z8EA 1OLCA 5AA2B 3T9HB 1O7TA 3T22A 1POTA 3RT6B 4Q30B 5K2XA 4IO3A 4FEBA 2XXTA 5I59A 3UORA 3C9HA 1LAXA 3N6TA 4ZEIA 3ONMA 4XIGQ 2ONKE 4BLAA 5L9SA 4ZE8A 3K00A 1NFTA 5I2KB 4HTGA 2P1SA 3PPPA 1VR5A 5F7VA 1A99A 2F34A 1HSLA 1M5EA 3IB1A 4KHZE 1GR2A 4U1OA 3SEYA 2Y7IA 3Q25A 1A8EA 1N0TA 2XXHA 1OQHA 1ANFA 2H5YA 5L9OA 5BWJA 1IZ1A 3RQTA 2XX9A 3FUZA 2HXWA 1ZLQA 4PQJA 3LC8A 2XD2A 1VFDA 2HFBA 5I59B 3Q28A 5ICTA 4KR5A 4KPTA 4OHNA 4NF6A 2YPNA 3KJ7A 1T0KA 4I1DA 3KJTA 1P1WA 2DXYA 1RKMA 5H8NA 3O97A 2OCUA 3OO6A 1JNFA 3MVWA 1ELJA 3CIJA 3VLUA 1DPEA 4QFOA 3R26A 1SW5A 4RK2A 3IOVA 4F39A 3TCFA 4LQ5A 3FIRA 4RPOA 1ZMGA 2XXPA 1JEUA 4F19A 3W9WA 1B32A 3QIMA 4IB2A 3DP6A 1XVXA 4AB6A 1NMUA 4RK9A 1SBPA 2QMXA 3W9VA 1H45A 2Y7PA 3HSTA 2XXUA 4AB5A 1P99A 3FASA 3TELA 1H43A 4NF5A 2UVIA 4NF6B 3VDFA 2OK2A 4R2BA 1AH5A 5H8NB 4R73A 5KCJA 2DOJA 4PFUA 2Y7WA 3IK6B 3SESA 3U1OA 3EHTA 2PT1A 1H76A 2IEEA 2HZKA 4JSDA 2BJJX 2HAVA 4F1VA 2DXRA 3CG1A 2VD2A 3USDA 2ZYNA 1S9TA 1FQDA 4HCYA 1A55A 4R6HA 1B7HA 3TEPA 3S9MC 2D5WA 3IO6A 5DTBA 1TT1A 3KSJA 4KYDA 3HO7A 4NF5B 4OWDA 2GHAA 1MY2A 2OJTA 2NWJA 4ISUA 5KCJB 4H1XA 3GZGA 1YCJA 4YB5A 1SQYA 3PV0E 4GF8A 4LZ7A 4ELPA 4G8HA 1A54A 2XXIA 4H0WA 3ECRA 4NTLA 5I56A 1QULA 1MPCA 4F2OA 4F31B 3HCQA 4BDQA 3T9UA 1URDA 2OWTA 3FV2A 3UGWA 1A40A 2H25A 1N84A 2O51A 3VLVA 3MC2A 1L5TA 1FCKA 3PMWA 3E9XA 1VFEA 3OO8A 4ZEKA 4JWOA 3IO4A 4FJPA 3BFTA 4HS7A 3OO7A 1R9QA 4QHQA 3CFLA 4JB7A 1DTZA 1JEVA 3H4ZA 3QUJA 4ZE9A 1H44A 3FV1A 3RUMA 4PP0A 3B6QA 3KFMA 4YZZA 1Y4TA 2UYEA 1B7UA 2H99A 3ZKKA 1NKXA 3E4RA 1JW4A 4R74A 1MY0A 3R7XA 4KFQA 1BKAA 4IY5A 1N3WA 4I9DA 4BDRA 1GGGA 1O64A 1B46A 1NNKA 5CI5A 1Y1MA 3CSBA 3OXNA 1SD3A 1D3KA 3LSFB 3O2AA 3EQ1A 3L6GA 4X9TA 1BP5A 3TCGA 4QRZA 4U2RA 3IOTA 4X48A 5FHMA 4ELOA 2ZNUA 2DQVA 2F7CA 4X1BA 4H67A 1QVSA 3O6IA 3OOAA 1JVXA 3T93B 4KI0E 1D9YA 3CVGA 4WEDA 1QUKA 1MXWA 3UP9A 1MM6A 5A5XA 1S7YA 3VXBA 4C1UA 2WKYA 4OEVA 1OMPA 4NWCA 4NF4A 2FA7A 3V8XB 3TUSA 3KZGA 4IO5A 4LZ5A 5M2VA 1FQCA 3KEIA 2X7PA 4DLDA 4JDFA 4I62A 4P0IA 1ZKBA 1LFIA 3BFUA 2V93A 2Q8JA 4OTEA 1EU8A 4PFWA 1F9BA 1KWHA 2V25A 2ONSA 3LBSA 3LSXA 1GV8A 3GLBA 1YPNA 4XKRA 4GXAA 2HQ0A 3KBRA 5A5XB 1TXFA 2OWSA 4F3PA 1MS7A 5HPQA 2D21A 5HBCA 3K02A 3KOSA 2HEUA 2UXAA 4OFOA 4NF4B 1OVBA 1MY3A 2I4BA 3OEKA 1QKBA 3VLWA 3KGCA 3K6UA 5AA2D 3RLFE 5H8HA 1LBCA 2NOOA 5CMBA 1NL5A 4NF8A 1FQEA 4POWA 4U22A 3VVEA 1B52A 4H6DA 4OETA 5TP9A 3TTLA 1MQGA 3FVNA 1B7ZA 2THIA 2O69A 3BBRA 4IGRA 4YB6A 2Q88A 5ICQA 3N5LA 4IY6A 2X7QA 1POY1 2Z8DA 3H6TA 4QSEA 2QL3A 4THIA 3K6VA 3PGFA 3FVKA 4R75A 5H8HB 3H06B 1FTMA 4GLIA 2Q9TA 3FD3A 3K6WA 4NF8B 4N6PA 3RPWA 4U4XA 2Q2AA 2ZNSA 2RINA 3I6VA 4KYSA 3PU5A 1B5JA 3KG2A 2ZNTA 2REGA 1Y4CA 5AA1A 3R6UA 2R6GE 1DSNA 2O84X 3TCHA 3PUWE 2PT2A 4WKMA 2XXVA 4ND9A 2XXWA 5L9MA 1LLSA 1WODA 1RYXA 3S9EA 4DZ1A 4R6YA 2DVZA 1ZJLA 4JWXA 3PUZE 4HCWA 4TLLB 2P2AA 3P7IA 2H4IA 4DXBA 1FW0A 5TU0A 1MQHA 3RN8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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