3ILTB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, trichlormethiazide
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 89
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iltB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iltB02
1YTVA 4R6KA 1MXYA 3TZAA 3MW0A 4EF2A 2O68A 2F7BA 5AE4A 4QSEA 3OEKA 2XX7A 3KGCA 3C31A 1P99A 4DIGA 1I69A 3PUZE 4PP0A 4JWXA 2Y7PA 1GVCA 5CMBA 1FTLA 2ONKE 3G3GA 3W9WA 5L9MA 1NH8A 1SW1A 3TCHA 4PFWA 1JETA 4P0IA 2XHDA 3FXRA 2HEUA 4E0WA 2I4BA 5M2VA 4LQ5A 5L9OA 4QHQA 3VXBA 3LBSA 2OK2A 5H8NB 4POXA 4OFOA 1P1NA 4U1OA 3UA8A 2H25A 2Y7KA 3G3FA 4RA1A 3HO7A 1JVXA 1I6BA 5H8QB 4P0GA 1DPEA 1B32A 5I58B 1EZPA 1XC1A 4ZZAA 4AQ4A 2DWJA 1P1WA 5I59B 4F19A 4H65A 2FYIA 4YB6A 1QVSA 2H9BA 3PGFA 4FORA 2P2AA 3PMWA 1VSOA 3N5LA 1SDXA 3N26A 1EH3A 1B05A 3TDJA 4IO7A 4DXUA 2ZYOA 5TP9A 4F22A 1MXUA 4POWA 3K02A 4GXAA 2PT1A 3IL1B 1XS5A 3MJNA 2DWAA 1RYOA 3LSFB 4Q5TA 3KOSA 3CR9A 2DOJA 1JEVA 4OESA 2V25A 2AYSA 1MY0A 1IXIA 2XD3A 5BWJA 1PC3A 3EHUA 3ILTB 4U1ZA 4XTCQ 4RPNA 1ZKBA 2I0BA 2V3QA 2RCAA 3O9PA 3TPAA 5I2KA 3IB0A 2H4IA 3VLWA 2ONRA 1GTKA 2D3IA 4YB7A 3TODA 3EF7A 3PD8A 1A40A 1MXZA 3MWBA 3TTNA 2DP8A 2ALUA 2R6GE 3KEIA 3SESA 3UGWA 4IY6A 1MRPA 3TAJA 4QFOA 2QS1A 4G4PA 2HAVA 3IJOB 3O6HA 5JK4A 3T66A 2R71A 1US4A 2H98A 3KJTA 2DXRA 1RYXA 1B0HA 3RY3A 1NNFA 5DEXA 5I2NA 5AA3A 3TYHA 4RPOA 1B3LA 3OD7A 4TOZA 5TP9B 3QUJA 1OMPA 1MQJA 2ZYMA 3BFUA 2NUVA 1B4HA 4X1DA 3OSRA 3R7XA 3V5AA 4U2RA 3FXQA 4DCYA 3WAEA 2RCBA 2I49A 3C9HA 2ZXTA 3IB2A 4DE8A 4QFPA 3QIMA 4ZE9A 3ODBA 4N13A 2O7IA 3TEPA 4L17A 4H67A 3U72A 3PUVE 2M8CA 1USYH 3MVXA 3PPNA 1SBPA 4JWOA 4ISUA 1HSJA 3MP1A 1URGA 5LOMA 5TPAA 4R74A 1M5BA 5I2KB 4HS7A 1AH5A 4LZ8A 2RC9A 3U8QA 4F18A 2DS9A 3QYTA 5HPQA 1LAFE 3RT6B 1CE2A 1OLCA 1H43A 2Q2AA 3OO9A 4RY1A 2DWIA 2CMOA 3CFLA 3QXMA 3HPIA 3UK4A 2V84A 3KSJA 4IO2A 1Z7ME 1MQHA 4BDLA 3KN3A 1I6AA 4GD5A 5FHNA 4ELOA 1ELJA 5DEXB 5I2NB 4FEBA 2ONSA 1D4NA 3H6TA 3FGSA 3K1MA 3PPOA 1VFEA 3PD9A 1RKMA 4KCCA 1LFGA 3BKIB 4GL8A 3T9HB 5JTYA 3SKPA 4OEVA 3OOAA 2RF1A 1B7HA 5CMMA 3H6WA 1DSNA 3OENA 5A5XA 3H03A 5I57A 4EQ7A 4HCYA 4BLAA 4H6DA 3RTWB 2GHBA 5TPAB 3JZJA 3PMVA 4OTEA 2ESNA 2VOZA 2P0SA 1ZJLA 5ICTA 1DPPA 4LUBA 1SYIA 2O1MA 3K01A 3LR1A 2I4CA 1OQHA 2XXWA 3MPLA 3IOTA 2F7CA 2XXVA 1JNFA 3MAMA 1N76A 1SI0A 1PB8A 2ZMBA 2I3VA 4JWYA 4ELPA 1LBCA 2UYEA 1B3EA 3OXNA 3TFLA 1IZ1A 3E9XA 3FJGA 3MC2A 1IXHA 1MM7A 3E3KA 2VD3A 2DSFA 3EQ1A 2O51A 3KN8A 3MP6A 3MZBA 4JB7A 3Q28A 1P1OA 3RNNA 1LAHE 3Q29A 2XXTA 3V8XB 4ZEFA 2QPQA 1II5A 1FQEA 4RK2A 3R6UA 1XOCA 1D3KA 4KHZE 2DE3A 3OO7A 1AOVA 5JTYB 3TCGA 1B9JA 5K2XA 1OLAA 4KCDA 1XVYA 5A5XB 5I57B 1MY1A 1NNTA 4GOTA 5TU0A 3KJ7A 4FIMA 2DVZA 3TKDA 5CC2A 4KPTA 3C33A 3S9NC 4KQPA 1FQBA 2Z8EA 3VE1B 4IO5A 2IEEA 1ZTYA 2ZYNA 2B65A 3GXAA 5ISUA 4XKNA 4YMAA 1B7ZA 3MQ9A 4BDNA 4M4GA 1B3GA 1Y3NA 2QS2A 5ITOA 1A99A 1Q1KA 1KWHA 3V89B 3O29A 2HAUA 4OVJA 3FVKA 4QFNA 3BBRA 4FJPA 4ZEIA 1FTMA 5IKBA 3SEUA 4KD5A 4MLQA 4TQUQ 4Q0CA 5CBSA 3C4MA 4FATA 1FQCA 3I5OA 4NF8A 1LLSA 4O3BA 3HV1A 3ILUB 1P1QA 4EDPA 4BDQA 1PBQA 1IITA 3K2DA 4R9FA 4G8HA 3KG2A 3K1PA 4UA8A 4R6HA 3IOVA 3SEWA 4R9GA 4F1YA 4HW8A 3TTMA 1ZBMA 3M3KA 4N07A 2ABHA 1VR5A 5F7VA 4ND9A 3G3HA 3LUYA 2PBWA 4ZE8A 3QK6A 4OERA 3CI8A 1LFIA 2DWHA 3CSGA 3EN3A 4GLIA 3RLFE 4FAJA 4G68A 1N3XA 1T0KA 1MQGA 3T9XB 1EZ9A 4GFRA 4DXBA 1MG1A 4K3FA 3CIJA 3IK6B 4ZEBA 1FTOA 3IJXB 3TUSA 2REGA 2DVCA 3K4UA 2QMXA 1XHYA 3L6HA 2F36A 1UQWA 1USYE 1DOTA 3S9MC 1QW0A 3PUXE 3THIA 2F34A 1ZIUA 3PPRA 1IQ7A 1R9LA 3FJMA 2OWSA 3A3UA 3UORA 1NKXA 2XXUA 4XIGQ 2RC7A 4NF8B 1ZU0A 1SW5A 3VLVA 1QJMA 4OZ9A 1LBBA 1TFAA 2QS3A 1WODA 1Z7NE 2UVGA 4IO3A 5CI5A 2DXYA 4NMYA 1FQAA 1UIVA 4EUOA 1PDAA 1FQFA 3DP6A 2Q9TA 2UVJA 3UIFA 1JW5A 1F9BA 2A5TA 1Y3PA 2HFBA 5KDTA 3G7WA 4Z0IA 4Q30B 1N84A 3FJ7A 4RNSA 5I56A 4X1BA 3VVFA 2Q88A 2NOOA 3FVOA 4G68B 1PBPA 1O63A 3DP8A 1POY1 3K6UA 3BFTA 2QL3A 4H5GA 4OWDA 2Y84A 3FASA 1CB6A 3K1NA 4ZEDA 3L6GA 1M5FA 3MVZA 2NWJA 4H0WA 4IB2A 1MS7A 4OQOA 3K6VA 4X48A 3VDFA 3OMBA 3RN8A 3M3LA 3RUMA 3W9VA 1BLFA 3S4UA 4IO6A 2IA4A 3F11A 5H8HA 2ANJA 3TMGA 3T22A 1R1NA 1LGBC 3GLBA 4OENA 4OHNA 3OO6A 3KBRA 1MPBA 3H3GA 1N04A 3DELB 3FV2A 5KZTA 3VLUA 4OFJA 3FUZA 5J1DA 1NMUA 1B46A 1H45A 1IEJA 1DTGA 2XXIA 4EF1A 5BUUA 1D9YA 4Q8RA 3B6TA 2Q2CA 1POTA 1SYHA 2A5TB 2F78A 4EQ9A 2THIA 3U1OA 5KDTB 3Q27A 3GZGA 3H6VA 4F3PA 1EZOA 4Z7EA 3IOUA 1B1HA 2B3FA 5HM4B 1NL5A 5I56B 1Y20A 1N3WA 4QFKA 1VE4A 1WVJA 5ITPA 3JYRA 5B7DA 4NTLA 1OQGA 4U4XA 2F6GA 3VV5A 4RXLA 1QKBA 3T96B 1A7LA 1B5HA 3OSQA 5CM6A 4QSDA 1O64A 1BKAA 3FVGA 3TQLA 4IGRA 1SQYA 3QAXA 1M5EA 4OEUA 5H8HB 3CVGA 1OVTA 1AMFA 2XX8A 2A5SA 1MH4A 1QULA 4U21A 4OMBA 3W15C 3E4RA 5AA2A 5FTIA 1S9TA 3KSXA 1B7UA 1Y1ZA 5KCJA 2X7QA 4PQJA 2KLFA 1BIYA 4OXVA 3R26A 4QF9A 3VXCA 4F3GA 2E1SA 3S9LC 1MY2A 3KN7A 1N7XA 3MPKA 4WKMA 3U94A 4KFQA 1HSLA 1XT8A 1SW4A 1NH7A 1YAEA 3U92A 4F1UA 1JVYA 1IXCA 4FECA 2Z8FA 5CRYA 4C1UA 1MXXA 4THIA 3E13X 5DVIA 3SEVA 2B3BA 1PEBA 3TQWA 3TCFA 1GR2A 4F1VA 1B51A 2QS4A 1Y1MA 5AA2B 2DE4A 3H7MA 3H4ZA 1PB9A 4U23A 1NFTA 4I9DA 5KCJB 3QSLA 3P7IA 3JV9A 3RPWA 4EQBA 2Q8JA 2O84X 1B4ZA 3B6WA 3FIRA 3SDFA 1O7TA 3Q26A 1DTZA 2ZYKA 5H8SA 4NWDA 4NF6A 2VP1A 4YKJA 4TLMB 4DXCA 3TTRA 4BDMA 3O6IA 2DYXA 3AXFA 4F3SA 5DYHA 4G8MA 4C0RA 2FNCA 3T9UA 1SVXB 4XKQA 2DE2A 2I58A 3U93A 1H44A 5DVJA 4NF4A 4BDOA 1FW0A 4ZEKA 3M8UA 5EYFA 3HSTA 4DCXA 1AIVA 3B7DA 2HCAA 5B70A 1NNKA 2ZNSA 5DVFA 1YPNA 1Y3QA 3N6TA 1MPDA 2YPNA 2AIXA 4JBZA 4PE5B 4R73A 3S9EA 2Y7IA 1JW4A 4LQ2A 3KFMA 3MZ1A 1TT1A 4GIZA 3N94A 3CFXA 1M5CA 1LCFA 2I3WA 3S2VA 4X9TA 2HZKA 3O28A 1LCTA 4JXIA 2QJEA 1WDNA 2HXWA 2F8DA 5AA4A 1MQDA 4R72A 3K0VA 4F2QA 3M3FA 3FXUA 4YB5A 4NF6B 1QUIA 1QUKA 4MH5A 5FHMA 4R2BA 2O7UA 1Y4CA 2UVIA 3C32A 4LA9A 4BDRA 4LVQA 2FA7A 4NF4B 4LATA 1MY4A 4G77A 1GGGA 2H5YA 1A8EA 2XXPA 3IX1A 4G68C 4KYEA 4PFTA 3KOTA 2F6PA 4GRKA 1B58A 2GFEA 3C34A 1LAGE 3LSXA 2D21A 1IXGA 3DLNA 1B6HA 4YKPA 4F3BA 1MPCA 2F35A 2GH9A 3SEYA 3MVYA 2XXYA 2VHAA 5I84A 3MUQA 2P1SA 3HCQA 2PMSA 3ZKKA 1FQDA 2PT2A 1ZLQA 1J1NA 5EHSA 3KZGA 4LP2B 5JEIA 2O69A 4ONYA 4KI0E 1ANFA 4LONB 1URDA 5AA4B 2NXOA 4WEDA 4E0XA 4LZ5A 3G3KA 4R6YA 4AB5A 1AL3A 1MXVA 2YJPA 2REJA 4JDFA 4KR5A 4DZ1A 3C35A 4LZ7A 3QUFA 2O1LA 2F5XA 1LFHA 1XVXA 1UTHA 3ZSFA 1GV8A 4H5FA 2D5WA 4FEDA 3ZKLA 2AL5A 3O6GA 1FCKA 4UACA 2Z23A 4QRZA 1UIUA 2F97A 3USDA 4YMBA 3SEXA 5AA1A 3SERA 3LSWA 3I3VA 3UN6A 3K6XA 3MVWA 3FD3A 4PFUA 4KYSA 3FV1A 4I1DA 4GXSB 4NEDA 2RINA 2OLBA 3TTLA 1FTKA 3LSLA 3I6VA 1B5JA 4ZDMA 4GQOA 3DM0A 4HCWA 4ESWA 4HTGA 4GVOA 4ZZEA 3PU5A 4MBPA 1VFDA 4F29A 3TELA 2F7AA 4JSOA 5DT6A 4F39A 1UTBA 2QRYA 3CRBA 4IY5A 3GBBA 3EPEA 1B3HA 4NWCA 4QFLA 3ECRA 1BP5A 3A09A 3MP8A 2WKYA 1B2HA 2V93A 1EU8A 4EXLA 4JSDA 3OEMA 3DP4A 4WEPA 1TFDA 1UTHB 3VVDA 3H6UA 3H06B 4NE4A 4OETA 2NVUB 4IGTA 3O97A 2E0SA 2XXXA 1FTJA 2PX1A 1H3DA 3CSBA 3PV0E 4DLDA 4I62A 4R75A 1D9VA 1Y9UA 3OELA 3OO8A 1LB8A 2G29A 3D4GA 5FTHA 4H8IA 1P1UA 1NNPA 2QSXA 2GRVA 3Q25A 5ELVA 1SD3A 1R6ZA 3CG1A 2W7YA 4WXJA 1MDQA 4FE8A 4ZECA 4PFYA 3MBPA 2VGQA 3O66A 4F2OA 3HN0A 3PUYE 1UTBB 3EHTA 3HHGA 1MQIA 1B3FA 2R9JA 5L8DA 4MLVA 5IAIA 4F31B 2O6AA 3IO4A 1PB7A 2ZNTA 5AA2D 1SW2A 2HZLA 1N0TA 4DDDA 5ICQA 3RT8A 1S7YA 1MDP1 3T93B 2PYYA 4O3AA 1QUJA 4YICA 2OZZA 1M5DA 1B5IA 3ONMA 3PPQA 1MXWA 1OVBA 2CZLA 5H8FA 5DTBA 3FZVA 3IOWA 3MZ9A 1LB9A 3FATA 2Q89A 2AL4A 3IO6A 1I6QA 2VD2A 1MH3A 2H99A 5F1QA 2XX9A 1L5TA 3D4CA 2RKMA 3O2AA 3RTFB 4RK9A 1US5A 1B0LA 3PUWE 3T9VA 2OWTA 4RYAA 4U22A 1Q35A 5CBRA 1ATGA 3WAFA 2V3TA 4GF8A 4ELQA 4P11A 4NF5A 2GHAA 4YKIA 3PPPA 2I6EA 4R2FA 2UYFA 5CMCA 4MFIA 4N6PA 3IORA 3HHFA 4ZS9A 2Y7RA 1A8FA 2QMWA 1ZMGA 2XXRA 2Z8DA 2Y7WA 2XXHA 1SI1A 4GWOA 3VVEA 1S50A 4MF3A 2BJJX 5K2YA 2OCUA 4YZZA 2V3UA 3RQTA 4YU0A 3V83A 4H1XA 5H8FB 3IAZA 3FVNA 2LAOA 4XKPA 4M1VA 1B1XA 4AB6A 2XXQA 5HBCA 1JW1A 3K00A 2G93A 1A55A 1HSEA 1N7WA 1MM6A 2UVHA 1QKAA 3VFJA 3TTKA 4IO4A 3ZS6A 1IIWA 2YLNA 3B6QA 4I8CA 4O3CA 2PVUA 4EXKA 1H76A 2DQVA 2HQ0A 4ELRA 4GL0A 4YKKA 2ZNUA 2Z22A 1MY3A 1A54A 4XXUA 3C36A 3G3JA 4PETA 3IR1A 4OYVA 1IUDA 4C1TA 1Y4TA 2RC8A 4G2ZA 4NF5B 2UXAA 4OFLA 3UP9A 2XD2A 5H8NA 1DMBA 2OBGA 3N6UA 2I0CA 2X7PA 1LSTA 3GBAA 1JQFA 1TXFA 1B40A 5L9SA 2I48A 4ECFA 5H8QA 5EHMA 1R9QA 3RGYA 2X26A 5I58A 4TLLB 1TWYA 1URSA 3LC8A 4QSCA 1JEUA 5FHOA 5I59A 3EHSA 4G8NA 3SETA 4RJZA 3IB1A 4ESXA 3CFZA 3K6WA 5CMKA 3G3IA 1OIBA 3CG3A 4H8JA 3A3CA 4KYDA 4U4SA 1BTJA 4YAHX 4XKRA 1B52A 2OJTA 1LAXA 3PMXA 1YCJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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