3ILUB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, hydroflumethiazide
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iluB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iluB02
4P0IA 3M8UA 3Q25A 3IAZA 1H43A 3UIFA 3FXQA 5H8FB 3TUSA 3S9MC 1LSTA 3HO7A 5ELVA 1Y3NA 2F97A 3RT6B 4OERA 2D3IA 4ELQA 5EHSA 2ANJA 1IXHA 3THIA 1UIVA 3T93B 4U22A 1B05A 5KDTA 3KOSA 1IITA 4OFOA 3K6WA 4F3BA 2DE3A 3RN8A 3IO6A 1NL5A 2VGQA 4LQ2A 1B4ZA 1GTKA 2REJA 3FASA 4KYSA 4QHQA 5ITOA 3DP4A 1UTHB 5AA2D 1LBCA 5TPAA 1VR5A 4IO3A 3MAMA 4OENA 1MPBA 2O68A 4ZEBA 3PD8A 5I58B 4DLDA 2W7YA 4QF9A 3SEWA 3CG1A 4H5GA 3U92A 3PUYE 3K1MA 3TTKA 2I4CA 3MVZA 2Y7RA 2E0SA 3MVYA 3FVGA 4O3CA 1WVJA 2F7AA 1PC3A 4F2QA 1I6AA 4NF5B 3G7WA 1H3DA 3H6UA 5ICQA 3PD9A 3DP6A 4OHNA 3RY3A 3TTRA 4H65A 4RA1A 2VHAA 1OVBA 3O6GA 3MW0A 3ECRA 2Z8EA 1MM6A 1POY1 3CI8A 3TFLA 5A5XB 2R6GE 3LUYA 1FQDA 2VP1A 3CFZA 4FE8A 1SYIA 2PT1A 3P7IA 3HHGA 4DCYA 4Q0CA 4QFOA 1D9YA 4IO6A 3WAFA 4BDLA 2F5XA 3CSGA 1NMUA 1M5DA 4NMYA 3T9VA 2HFBA 2QMWA 5FHNA 3FXRA 1I6BA 3MBPA 3O29A 3VFJA 4MH5A 3MZ1A 3IR1A 1ZLQA 4KQPA 1LAXA 1B5HA 3MWBA 3TYHA 5ITPA 1MH3A 3IOWA 2ZXTA 3ILUB 4OXVA 2OWTA 1MXYA 5H8NA 3PPNA 3BFTA 4NF4A 5KZTA 4R75A 3B6WA 3TCFA 4H67A 3EN3A 5L9MA 5L9SA 3KN8A 3T66A 2Y84A 1MY2A 5CMBA 5DVJA 4BDNA 2F8DA 2ZYKA 1MXVA 4KCCA 3PV0E 3VLWA 4IY5A 5K2YA 4KCDA 2X7PA 3PGFA 4C1TA 2GRVA 3K01A 1ELJA 1N7WA 4M4GA 1FQBA 2ESNA 3V89B 1II5A 2YPNA 4OYVA 3OSRA 4KPTA 4YU0A 4F19A 1FTKA 4F3PA 3PUXE 2PMSA 3HCQA 3KEIA 1A8FA 1N84A 5B7DA 5KCJB 1JEVA 2XXYA 3CFXA 1A7LA 4FJPA 4JWYA 4BLAA 3TCHA 3O6IA 4EQ9A 3L6HA 5CMMA 3HPIA 2OCUA 4RK2A 3KZGA 4R2FA 1MXWA 1SW4A 3IX1A 1FCKA 2FA7A 4YMAA 2PX1A 1FTJA 4ZDMA 3MP6A 2UVGA 1NH7A 4RPOA 4PP0A 2R71A 1Y9UA 2X26A 3GBAA 3DP8A 5JTYB 4Q5TA 2YJPA 5B70A 1H76A 2DE4A 4OZ9A 1BKAA 2QRYA 3HN0A 2I48A 3UK4A 3H4ZA 2NVUB 2Q8JA 3F11A 1TXFA 1DMBA 1H44A 2DWIA 2B65A 4KD5A 3LBSA 3B6QA 1QJMA 1A40A 3SEVA 1SW5A 1HSJA 3IOUA 2XXXA 3HHFA 4U4SA 1AMFA 2V93A 1YCJA 1BTJA 4BDQA 3VVEA 3MVWA 3S9NC 4GD5A 1P1UA 3SERA 2HXWA 1Q1KA 1NKXA 3M3FA 3QK6A 4QSDA 1ZU0A 3FVNA 3K2DA 3RLFE 3E3KA 4KHZE 3V5AA 1MY4A 3KSJA 4H8JA 3QUFA 1MRPA 3KFMA 4IO5A 4F22A 1RYOA 2REGA 4YKPA 2QPQA 4FIMA 4H5FA 3U8QA 1ATGA 1B1XA 3U94A 1US5A 5A5XA 1TWYA 3MZ9A 1LB9A 4XIGQ 3FD3A 3OO7A 4F29A 2O84X 1MY0A 4ZEKA 4X48A 4EDPA 2DVZA 3LSXA 1N3XA 3OO6A 1Y4TA 3TCGA 1NH8A 2RC9A 3H6WA 4G77A 3TTMA 5DEXB 4DXCA 1B1HA 2P2AA 3TODA 1B9JA 1DTZA 4JWXA 4KI0E 1IUDA 2DWAA 5IKBA 1IQ7A 1B32A 3MJNA 2DOJA 3ZS6A 3UN6A 1XVXA 1B52A 2I4BA 4GXSB 2UVIA 3Q28A 3TAJA 4FATA 1AIVA 4M1VA 3CR9A 3FATA 4YB6A 4LQ5A 3OSQA 5BWJA 3IOTA 1XS5A 1YTVA 1R1NA 3EF7A 1IXCA 3E4RA 1SD3A 1H45A 1N0TA 4R6HA 3W9WA 4L17A 1BLFA 2RKMA 1CE2A 1HSEA 3T96B 4NWCA 2QS2A 1O64A 3K0VA 2ZNUA 2XXPA 3SESA 3FV2A 1PDAA 5DT6A 1N3WA 5H8HA 4Q8RA 3EQ1A 2F7BA 3O2AA 3KSXA 3K1NA 3OMBA 3N26A 1MDQA 1R9QA 4R9FA 3K6UA 1ANFA 5FTHA 2LAOA 3RT8A 2P0SA 2Q2AA 3N6TA 2O1MA 2E1SA 4OEVA 1MY1A 4RXLA 4GRKA 4EF2A 4LATA 1ZIUA 1A8EA 3TMGA 1QW0A 3VVDA 3FZVA 3VLVA 1M5BA 4F1YA 4E0XA 4H0WA 4G8NA 5I59A 3LSLA 4AQ4A 4U1OA 1FTLA 4PETA 4N6PA 5HPQA 2F34A 1Y1MA 3USDA 4QFKA 3LSWA 4YKJA 2H98A 4MFIA 2DP8A 3FVKA 4HW8A 5F7VA 3QAXA 4FEBA 1Z7ME 1OIBA 4G8HA 1LAHE 1BP5A 5L8DA 1KWHA 1MXXA 5FHMA 4O3AA 2F35A 1JW1A 1LFGA 4OQOA 1EZ9A 3FIRA 3Q26A 3T9UA 4PFTA 1JVXA 1UIUA 1MQGA 4YMBA 1GV8A 1MQHA 2O6AA 3MP8A 4G2ZA 3E13X 3QUJA 5BUUA 3D4GA 5CBSA 2DVCA 4JB7A 5CI5A 1PB9A 5TP9B 3LC8A 2H9BA 3OD7A 4C0RA 5CRYA 3S4UA 2F36A 1DPEA 1XOCA 4IB2A 1DSNA 2GHAA 5K2XA 3R26A 1NNFA 3OENA 2V3TA 3FJMA 5CMCA 1MY3A 1URDA 3IB0A 2ZYNA 3GXAA 1B40A 5JK4A 4ZEDA 4ZE8A 4DE8A 2QJEA 3OEMA 1P1WA 4X1BA 5AA4B 3ZKLA 4R6YA 3JV9A 4H8IA 4POXA 2XXWA 1LLSA 4ND9A 1MXZA 2UVHA 3Q29A 4I8CA 1B0LA 4OWDA 4NEDA 1QUJA 1FQCA 1O63A 4QFLA 3PPPA 5FTIA 1GR2A 4JWOA 2R9JA 3G3FA 4GQOA 1GGGA 1MDP1 1P1QA 4FORA 2QS4A 4NF6A 4DXBA 4NF8A 5I57B 3FV1A 3DELB 3H6VA 5I56B 1LCFA 5I2NB 4I9DA 3ONMA 3GLBA 3TZAA 3W9VA 2HEUA 4ELRA 5H8QA 2UXAA 4JBZA 1UTBA 2Y7IA 3IB2A 1VSOA 5I2KB 4RJZA 1YAEA 1JETA 2RC8A 2PBWA 4PFWA 1EU8A 4OVJA 1JQFA 1B3FA 4ELPA 2P1SA 4RK9A 2V3QA 1B3HA 2V25A 3OO9A 4KFQA 2H5YA 3T22A 4ISUA 4DXUA 2UYEA 4QRZA 4TLLB 1D3KA 4I1DA 3U72A 3C34A 4F39A 4X9TA 4XKNA 2B3BA 3MUQA 4KYEA 4IGTA 3VLUA 1EZPA 4ZECA 4GVOA 1NNPA 4G4PA 1FQFA 3AXFA 2XD3A 2O51A 3RQTA 1Y4CA 4G68A 3KBRA 5AA2A 1IZ1A 1J1NA 3JYRA 4HCYA 1B0HA 4OMBA 5H8FA 2PVUA 3TELA 1PEBA 4IY6A 2ZNSA 1RYXA 3VVFA 3M3KA 1SVXB 1NNKA 4EUOA 1B5IA 1XHYA 3G3HA 2HQ0A 4LA9A 3ILTB 1VFEA 2RINA 3PMXA 4HCWA 4EQBA 1Y1ZA 1JVYA 3D4CA 3TKDA 2GH9A 4UACA 4JXIA 2GHBA 4RY1A 3SEXA 4AB6A 2XX9A 1UTHA 3IO4A 1NFTA 3PUZE 1PBPA 4G8MA 3PU5A 1R9LA 4Q30B 2F6GA 3U93A 5LOMA 5KDTB 1SQYA 4ELOA 3A09A 4KR5A 5I58A 2BJJX 2F6PA 1AH5A 3L6GA 5DYHA 3G3JA 3PMVA 2Z22A 3TPAA 4NE4A 4XTCQ 1TFAA 1URGA 2OWSA 2UYFA 2PT2A 1I69A 1JW5A 2Q89A 1XVYA 4NF5A 4QFNA 1B3LA 4FEDA 1MG1A 3MC2A 2OLBA 4YICA 5TPAB 1PB7A 1FQEA 2KLFA 1B7UA 4LVQA 4BDMA 1LBBA 5I84A 1IEJA 2ONKE 3DLNA 3OXNA 2XHDA 3OEKA 3GZGA 5HM4B 3RUMA 1S50A 2V84A 3V83A 3QXMA 3MVXA 3PPOA 5AA4A 1P99A 2I3WA 1B6HA 3H03A 1FW0A 1SYHA 3SEUA 4KYDA 4DIGA 1MPDA 3JZJA 2NOOA 3KN7A 5H8SA 3H6TA 4ZE9A 3WAEA 2Q88A 3IJXB 3HV1A 2O7IA 3EHTA 1IIWA 4OFJA 4YB7A 3O66A 5DVFA 4GWOA 3KG2A 4NTLA 3T9XB 4ESWA 2DXYA 3OELA 4ZEFA 3MPLA 5AA1A 4DDDA 4MBPA 4OESA 1Z7NE 2ONSA 2HZKA 3IOVA 1P1OA 3PUVE 1AOVA 3VV5A 4ZZAA 3S9EA 3ZSFA 1US4A 1M5EA 2XXTA 4WKMA 1XT8A 3N5LA 1BIYA 1MH4A 3KN3A 2DS9A 1AL3A 3TTLA 4OFLA 4U23A 2OZZA 2CMOA 4TOZA 2H4IA 3FJGA 4ECFA 3RGYA 1LGBC 2F78A 4F3SA 1OMPA 2WKYA 4YKKA 5H8NB 4NF4B 3C32A 2CZLA 1QKAA 3E9XA 4HS7A 3O97A 2Y7KA 5KCJA 1ZBMA 1LAGE 3ZKKA 2IA4A 3TQWA 1ZJLA 3H3GA 5CM6A 4LZ8A 1PBQA 1JEUA 2OK2A 1RKMA 4OTEA 2QSXA 3K4UA 1FTOA 4TLMB 1LB8A 2QS1A 3CIJA 2DWJA 2FYIA 1LCTA 3CSBA 5JTYA 1SW2A 1P1NA 1LAFE 5AE4A 2HAVA 1NNTA 1SBPA 3T9HB 2ONRA 4JSOA 2Z8DA 4E0WA 3FVOA 5JEIA 3U1OA 3IORA 4DCXA 1D4NA 3K6XA 2ALUA 3IK6B 5J1DA 4MLQA 1MS7A 2AL5A 1N7XA 4PE5B 1UQWA 4RPNA 3LSFB 1N76A 3QIMA 2NXOA 4UA8A 1DTGA 4F2OA 5L9OA 4YKIA 4N13A 4R74A 1USYE 3A3UA 5EYFA 1PB8A 2OJTA 2B3FA 3H7MA 4GLIA 3BBRA 3DM0A 2ZMBA 4F3GA 3BFUA 5M2VA 5CMKA 2DXRA 4U21A 2I6EA 4R2BA 3FUZA 2F7CA 4GF8A 1WDNA 1I6QA 2DSFA 2YLNA 2H99A 1POTA 1QULA 1XC1A 3MP1A 3FJ7A 4THIA 3EHSA 1T0KA 4GFRA 2IEEA 2PYYA 2AYSA 1F9BA 4DZ1A 5ICTA 1SW1A 3K1PA 3EPEA 1B3EA 1URSA 2AIXA 1FTMA 2VD2A 2O7UA 5EHMA 1MPCA 4FECA 4YB5A 2THIA 3QYTA 3C31A 3VXBA 2VOZA 3BKIB 5DEXA 1SI0A 3PMWA 3MQ9A 5FHOA 4BDOA 2RF1A 1D9VA 4IGRA 2DYXA 3V8XB 3C33A 1O7TA 4GOTA 4RNSA 1DOTA 1Y3PA 1IXGA 4MF3A 1LFIA 1MXUA 3K02A 2ZYMA 2O69A 2ZNTA 4U1ZA 2G29A 3B6TA 1LFHA 2ABHA 3O28A 3FXUA 1S7YA 3CVGA 3R7XA 4LZ5A 2RC7A 3CRBA 3VDFA 3S9LC 4FAJA 2Z8FA 2NUVA 4GIZA 1MQJA 4AB5A 2QL3A 4ESXA 1B7ZA 4R9GA 3I3VA 1VFDA 3IJOB 2H25A 1B51A 3FGSA 4OETA 5TU0A 1B7HA 4F31B 3C35A 4GL8A 4R6KA 1SDXA 1OVTA 1IXIA 4ZS9A 1DPPA 2D21A 3RTFB 4U4XA 1MQDA 4IO4A 2HAUA 4H6DA 2VD3A 4LP2B 4P11A 1QKBA 1VE4A 2A5TB 4POWA 3PUWE 5H8HB 4GL0A 2D5WA 5DVIA 4N07A 3W15C 3HSTA 2Y7PA 1CB6A 2NWJA 1N04A 4EXKA 2XD2A 4QSEA 1MQIA 1JNFA 2Q2CA 5DTBA 4XKPA 2XXVA 3G3GA 1HSLA 3C36A 3R6UA 2XXUA 3I6VA 2UVJA 4I62A 2I0BA 3KJ7A 2OBGA 2QMXA 3TTNA 4F1UA 5I59B 3N6UA 1QUIA 3B7DA 4LZ7A 2HZLA 3A3CA 1SI1A 1OQHA 1M5CA 2DE2A 4R73A 3K6VA 5F1QA 1YPNA 3G3KA 2XXQA 4JSDA 4RYAA 2RCAA 3I5OA 4G68C 5ISUA 4LONB 4WXJA 1A99A 5TP9A 4NWDA 4U2RA 1ZKBA 1B2HA 3SETA 1Y3QA 3C4MA 3CFLA 2M8CA 2Y7WA 2G93A 4O3BA 1EZOA 2XX7A 4LUBA 1EH3A 4IO2A 1L5TA 4TQUQ 2HCAA 3UORA 1OLCA 3UP9A 4PQJA 3TQLA 1QVSA 2DQVA 3RNNA 4ZZEA 4PFUA 3C9HA 3EHUA 4P0GA 4GXAA 4EF1A 3RTWB 2GFEA 1MM7A 4QSCA 3CG3A 1M5FA 4BDRA 3OOAA 1TT1A 4XKQA 3TEPA 2I49A 1A54A 2XXHA 1B3GA 5CC2A 1FQAA 2V3UA 4OEUA 2AL4A 4ZEIA 3KJTA 3IB1A 4Z7EA 5I57A 4R72A 3QSLA 2A5SA 4QFPA 5I56A 2DWHA 3KOTA 4WEDA 5I2NA 4MLVA 1OQGA 3Q27A 4EQ7A 1OLAA 3UGWA 2XXIA 2I3VA 1Q35A 1A55A 3N94A 2FNCA 5I2KA 1ZMGA 4HTGA 3UA8A 1JW4A 4NF6B 4NF8B 3RPWA 3IL1B 4K3FA 4F18A 5CBRA 3MPKA 3SEYA 4XXUA 4IO7A 3M3LA 2I58A 2XXRA 5IAIA 2X7QA 2Z23A 5H8QB 2XX8A 3S2VA 1UTBB 1B5JA 1B58A 2I0CA 5AA3A 1R6ZA 3G3IA 5HBCA 1GVCA 3GBBA 3KGCA 3SKPA 2A5TA 3PPQA 1ZTYA 4WEPA 2RCBA 4F1VA 3H06B 4H1XA 4C1UA 3TDJA 4PFYA 4Z0IA 3MZBA 4YAHX 1B4HA 3ODBA 4EXLA 1B46A 3K00A 4JDFA 4ONYA 2QS3A 3VXCA 3SDFA 3OO8A 2Q9TA 1S9TA 2ZYOA 4XKRA 2O1LA 3O6HA 1TFDA 1Y20A 3O9PA 4X1DA 4G68B 3VE1B 3LR1A 4YZZA 1USYH 5AA2B 1QUKA 3PPRA 1WODA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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