3IOUA

Huntingtin amino-terminal region with 17 gln residues - crystal c94
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
416
structure length
402
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQPPPPPPPPPPPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Secondary structure of Huntingtin amino-terminal region.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Huntingtin
total genus 102
structure length 402
sequence length 416
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iouA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iouA02
2DS9A 3C9HA 3UIFA 3HCQA 1Q1KA 3BBRA 1P99A 3VVDA 4AB6A 3RGYA 1A54A 4F18A 3T9VA 2D3IA 1JQFA 5M2VA 1NL5A 1SW2A 2HAUA 4THIA 2FNCA 4IY6A 1MPCA 1Y3PA 2F78A 4DIGA 1Y20A 2DP8A 1USYE 3F11A 2DSFA 1BTJA 4R6KA 5FHNA 1UTHA 4FECA 3WAFA 4MH5A 1MY2A 4MF3A 4YKIA 3PU5A 4FORA 3C31A 3K6WA 4RA1A 2V3QA 5CMKA 3L6HA 5H8HA 1LAHE 2GHAA 4MFIA 4GVOA 3HPIA 1IUDA 3ZSFA 2NVUB 5LOMA 1WDNA 3FVOA 4ZS9A 4IO5A 3V89B 5BWJA 4U1ZA 4Q5TA 5I56A 4YKJA 5J1DA 4G4PA 4OQOA 1B51A 2OK2A 3C4MA 4X48A 2OJTA 3TDJA 2A5TA 2PX1A 2Z8DA 3FXQA 5JTYA 2F35A 2PYYA 3SERA 3QIMA 2ZYOA 2DWJA 2F6PA 2CMOA 4GOTA 1FTKA 3TTNA 1YTVA 1POY1 1HSLA 3TEPA 1BIYA 1FQFA 1PDAA 3FVKA 3TPAA 4RYAA 3TKDA 1SI0A 4ECFA 3EQ1A 4LZ8A 5K2XA 2F7AA 5B7DA 1ZU0A 2DVZA 1B5JA 3VVFA 4LUBA 1D9VA 3RT6B 2CZLA 2X26A 2GFEA 4R72A 3IORA 4F3SA 2H9BA 4RXLA 4G2ZA 1B3GA 2HFBA 1B7UA 1LGBC 1LCFA 4YKPA 1BP5A 3IOTA 1MH4A 1MM6A 2VOZA 2ALUA 1MPDA 1B3EA 4ZEBA 3TUSA 3H3GA 4NE4A 4EUOA 5CC2A 2OWTA 3IB1A 1OQHA 4IB2A 5I2NB 3MVXA 1MS7A 3H03A 3IB2A 1MXZA 5H8QB 1FCKA 2NUVA 3T22A 2NWJA 3SEWA 1N04A 1QUKA 3DP6A 1B0HA 4G8HA 4H1XA 4OENA 2QS1A 3DM0A 5TP9B 2QS2A 2XD2A 5DTBA 2Q2CA 4GXAA 4Q30B 3E13X 3N94A 1DPEA 3UP9A 3H7MA 3Q26A 3FVNA 1LAFE 2Z22A 3BFUA 4OESA 3IB0A 4H65A 2F36A 1FQCA 4Z0IA 4R73A 2B65A 3VXCA 1L5TA 1A8EA 4YMAA 1QKBA 3PD9A 5CBSA 3LSFB 1MH3A 3FVGA 4G68C 3MAMA 1Z7ME 4F3BA 3VLWA 2XHDA 1B7ZA 2XXHA 4LQ2A 1FTOA 2QJEA 2IA4A 3FASA 3DLNA 1H3DA 3KG2A 1IXGA 1BLFA 1M5FA 1NH7A 3TFLA 3PUZE 2W7YA 5H8NB 3LC8A 4BDLA 1XHYA 4N07A 4QFKA 3M3LA 3G3FA 4LZ5A 2UVHA 2DWAA 4JSOA 3HHFA 4EF2A 1IZ1A 1RKMA 3K1MA 3IJOB 2XXXA 3ILTB 1B7HA 1H44A 5HM4B 3O6GA 4POWA 1URSA 1FW0A 1NMUA 4LP2B 2UYEA 4R6HA 4BDQA 2ANJA 4RK2A 1Y3NA 3QYTA 1Y9UA 3I5OA 5CMBA 3OO6A 5AA2D 2HZKA 2D21A 1Y4TA 3B6QA 3QSLA 5FTIA 4ZZAA 4OERA 1S7YA 1VR5A 3KN7A 3UGWA 4PFTA 3FJMA 4NF5B 1B52A 4DCYA 3O66A 4K3FA 3TTLA 4TQUQ 2VD3A 5AA2B 3HN0A 4H67A 2R9JA 4XKRA 3H6TA 4HW8A 2F97A 2DWIA 2IEEA 3U94A 4BLAA 3FJGA 5KDTA 1IIWA 4JWYA 5I2KB 3IOWA 3ZKLA 3H6WA 2FYIA 3OELA 4TLLB 1ANFA 4GFRA 4QHQA 3LSXA 1MQJA 2PBWA 2DVCA 2YLNA 2F34A 1MXYA 1MDP1 3PGFA 4KCDA 1PEBA 3RT8A 1HSEA 3T9UA 1OVBA 1ZLQA 3W15C 1S50A 1MM7A 1Z7NE 2XX9A 1LFIA 2H4IA 1SW5A 1A55A 4M1VA 2UVIA 1I69A 1UIVA 2A5SA 2WKYA 2LAOA 1ZMGA 1EZ9A 3SEYA 3O29A 4KQPA 4H8IA 5I59A 1PC3A 3OO9A 4EQBA 4KR5A 5TU0A 2Y7RA 1B58A 4WEPA 4FAJA 3N5LA 3MZBA 4KPTA 4F22A 5ELVA 2KLFA 3OXNA 3PUXE 3DP8A 5AA3A 4C1TA 2F7BA 4U4XA 1UQWA 3PUYE 4XKNA 4C1UA 3MQ9A 2HXWA 2RKMA 1DOTA 2HAVA 4ELQA 3RUMA 3UA8A 2ZXTA 2Y7KA 2I6EA 5I56B 1XOCA 2X7QA 4OXVA 4I1DA 4NEDA 3T9XB 2XX8A 4KYDA 2OBGA 5A5XB 3ZS6A 1UTBA 1SW1A 4JWXA 4JXIA 3VVEA 3MVYA 4ELOA 1LAXA 1Q35A 2QSXA 3U1OA 4YMBA 3ECRA 4FATA 1LSTA 4GL8A 4G68B 5HPQA 3ILUB 4OFJA 2XXQA 1NH8A 2I49A 3VLVA 2V93A 3O28A 4I62A 2AL5A 1SW4A 1XS5A 3USDA 3IOUA 3V83A 1A7LA 3IOVA 1URGA 4E0WA 3TTMA 3DELB 1B2HA 1EU8A 3M3FA 5AE4A 3SEUA 1B6HA 3C36A 1MQGA 3G3KA 3PV0E 3RY3A 3SESA 4X9TA 4F3PA 2RC9A 3IL1B 2V3UA 4QSEA 1IXIA 2XD3A 3D4CA 1KWHA 4FIMA 1R1NA 5I57A 1B0LA 3CFXA 4OEUA 2RCBA 4MLVA 1HSJA 3CVGA 5I58A 3ONMA 1A8FA 4TLMB 1R9QA 1YPNA 4C0RA 3KBRA 2I48A 2I4BA 4F29A 5ISUA 2YPNA 4U22A 3G3JA 1QW0A 3K02A 2Q2AA 3G3HA 1NKXA 4ZDMA 2ONRA 5ITPA 2I0CA 1XVXA 3JV9A 4H0WA 1FTLA 1N84A 3EF7A 1QUIA 3K1NA 4GXSB 2O84X 1ZTYA 2XXUA 3IR1A 2DQVA 4NF6A 3IX1A 4M4GA 1SBPA 3OMBA 4U23A 1NNFA 2Q89A 3O97A 3MW0A 4ZE9A 3EHUA 3JZJA 1SYIA 4R74A 5DEXA 2QS3A 4YICA 4LQ5A 1MXWA 3Q28A 1JEUA 4DCXA 2Q8JA 3S9LC 3S9EA 3OSQA 2B3FA 3FUZA 4OHNA 5K2YA 4NWDA 4QFOA 1MQIA 4OFOA 4WXJA 1MQDA 4L17A 2Q9TA 4HCYA 3CFZA 3OEKA 2UVGA 1ELJA 3PMXA 4O3BA 4EF1A 1IXHA 1O63A 3FXUA 1P1OA 1VE4A 2I3VA 3G7WA 2Y84A 2QL3A 1FQEA 1AH5A 4XKQA 2XXRA 1IXCA 2XXPA 4FEDA 5L9OA 3T96B 2ESNA 1MPBA 1JEVA 2P1SA 2I3WA 3H6VA 4U1OA 1N3XA 1MG1A 1J1NA 3TCHA 3K01A 3A09A 1PB8A 4OWDA 4F19A 4F2OA 5FTHA 1B46A 2XXYA 5TPAB 1JW1A 4NTLA 2GRVA 3B6WA 3CFLA 4IO4A 2NOOA 2NXOA 4H5FA 1MXVA 3PMVA 3GBBA 3VV5A 3V5AA 4NF8B 4ZEKA 1TXFA 2QRYA 2PT1A 3LBSA 3OO8A 4Q8RA 5L8DA 2DXYA 4OVJA 4DXCA 1M5EA 4OETA 1TFAA 2OZZA 3MP8A 1LFGA 1XC1A 1MXXA 3A3CA 5IKBA 3RTWB 3UORA 4FJPA 3SETA 1LCTA 4POXA 4ELRA 1Y1MA 1WVJA 4RY1A 1II5A 3PUWE 4PFWA 1YCJA 3PMWA 3K4UA 5DYHA 3GZGA 4KYEA 1PB7A 4R75A 3HSTA 2RC7A 4P11A 3R26A 4U21A 3T93B 3VLUA 3KFMA 3CSBA 3GBAA 4NF4A 1AIVA 4JWOA 3EN3A 4KI0E 3FD3A 4Q0CA 1PBQA 3MBPA 5DVIA 3GXAA 3S2VA 4TOZA 5CM6A 5AA4A 1B1HA 1NNPA 2H5YA 5KCJB 3OSRA 4GQOA 3MVWA 4YB6A 2AL4A 3KN3A 1O64A 3QUFA 1NNKA 1SVXB 2F6GA 4LZ7A 1ZJLA 3RTFB 3E3KA 5H8FA 1P1NA 3R7XA 4Z7EA 1URDA 1MDQA 5TP9A 2V3TA 2GH9A 4H8JA 2FA7A 4FE8A 3C34A 5I84A 2PMSA 3B6TA 4HTGA 1Y4CA 2Q88A 4XXUA 2DXRA 3LSWA 1JW5A 1NNTA 4LA9A 2P0SA 1H45A 2HCAA 2XXVA 4EXKA 1DPPA 1M5DA 2HQ0A 2Y7IA 1MY4A 4ISUA 2DWHA 3M8UA 2ZNTA 2OLBA 1N0TA 2O69A 3U8QA 4EDPA 4G8NA 2V25A 1H76A 4DDDA 1XVYA 1DTZA 5H8NA 3N6TA 4O3CA 4UACA 4JDFA 1DMBA 1UTHB 3CG3A 1IQ7A 3CRBA 1N7WA 1LFHA 1JNFA 2XXTA 4IO2A 5I57B 2YJPA 5H8HB 4YKKA 3VDFA 4ESWA 1OMPA 1FTMA 3S4UA 5IAIA 1TFDA 4LVQA 4OYVA 4E0XA 3TELA 3KN8A 4ZE8A 1QVSA 1QUJA 3MPKA 1VSOA 2REJA 1N3WA 4X1BA 3UK4A 1GTKA 1SD3A 2D5WA 1JVYA 2F7CA 5AA2A 4UA8A 4NF6B 4YB5A 1EZPA 3E4RA 1M5CA 3EHSA 4KD5A 2A5TB 2P2AA 3IO4A 1ZIUA 5CRYA 5JTYB 2DE4A 4X1DA 2AIXA 2B3BA 3LUYA 1QJMA 2V84A 2Z23A 1B05A 1LBCA 3V8XB 1RYOA 1CE2A 4F1VA 4EQ7A 2ZYMA 1YAEA 3FZVA 1AL3A 3BFTA 5CI5A 5DVJA 3FJ7A 3IJXB 3TCGA 4RNSA 2R71A 5B70A 3TZAA 3KSJA 3CR9A 4LATA 5F1QA 1A99A 2G29A 1ATGA 3PPRA 3G3GA 2DYXA 3IO6A 4QFLA 5EYFA 3IK6B 3LR1A 4RJZA 5FHMA 4ZEIA 1GR2A 4IO3A 1MY1A 1FQAA 3FV1A 2UVJA 2H25A 2M8CA 3CSGA 3QXMA 4U4SA 4OZ9A 4IGRA 2VP1A 3K6VA 4G77A 1LB9A 1AMFA 2I0BA 1VFEA 3C35A 3FV2A 1TT1A 3CG1A 3DP4A 2O7IA 4QSCA 3R6UA 5ITOA 3MJNA 1GV8A 2ZYKA 5KZTA 5L9MA 2PVUA 2QS4A 1I6AA 3KOTA 3SEXA 4DE8A 3U92A 3PPNA 3O6IA 1ZKBA 1GVCA 5L9SA 3Q29A 1DTGA 5A5XA 4U2RA 1RYXA 5ICTA 4OMBA 1LB8A 1M5BA 1O7TA 4F1YA 1B1XA 4OTEA 2DE3A 2XXWA 3K2DA 4GD5A 4G68A 3PUVE 5F7VA 5H8SA 2F5XA 4F2QA 4R9GA 4DXUA 2E1SA 1CB6A 2Z8FA 4IGTA 4XIGQ 3K00A 3HHGA 4R9FA 2ZNUA 2QMXA 1SYHA 3KZGA 4ONYA 4ZZEA 3KGCA 3VFJA 2O68A 2Y7WA 5HBCA 4MLQA 4HCWA 4ELPA 3N6UA 3U72A 3K6XA 1P1UA 3CI8A 1LBBA 1ZBMA 1MQHA 1OLAA 2DE2A 3SDFA 3MUQA 3B7DA 1D9YA 1OLCA 1XT8A 3MP1A 3FGSA 2ONKE 3RN8A 1US4A 2XX7A 3RLFE 4DLDA 3JYRA 3MP6A 3TAJA 1R6ZA 3SKPA 4NF4B 2X7PA 3AXFA 2Y7PA 2HZLA 4ND9A 1S9TA 1LLSA 4GWOA 3U93A 3H4ZA 4BDMA 2H99A 4PFYA 2O51A 3W9WA 4YZZA 2RINA 3EHTA 1OIBA 1QKAA 1D3KA 5AA4B 2UYFA 1LAGE 2VHAA 3G3IA 5DVFA 4F31B 4YU0A 4JB7A 2OCUA 4OFLA 2REGA 1B9JA 4ESXA 4WKMA 1B32A 4BDRA 2GHBA 2F8DA 4GF8A 1VFDA 1MXUA 3BKIB 3I3VA 3H6UA 1B3LA 4EQ9A 1QULA 2G93A 4P0IA 3A3UA 5H8FB 3TMGA 5KDTB 3HO7A 1SDXA 1H43A 1Y3QA 2THIA 4XTCQ 5DT6A 3N26A 1EH3A 4F3GA 2RC8A 5CMCA 1MRPA 1B3HA 4PE5B 3L6GA 1FQDA 1MY3A 4G8MA 4WEDA 3EPEA 4RPNA 4YAHX 2H98A 2QPQA 3KJ7A 3TYHA 3C32A 4JSDA 4ZEDA 5CMMA 1SI1A 4R2FA 1P1WA 2UXAA 4ZECA 1SQYA 1I6BA 3LSLA 1B40A 4PFUA 4JBZA 1B4HA 3P7IA 4BDNA 1POTA 1OVTA 2O6AA 2ABHA 2AYSA 3CIJA 3S9MC 2R6GE 5CBRA 3TTRA 3TTKA 4IO6A 1WODA 5I59B 4XKPA 3ODBA 3MPLA 1A40A 4N13A 3PD8A 3QUJA 3T66A 3ZKKA 4IY5A 3SEVA 1D4NA 1UIUA 3TCFA 4F1UA 5TPAA 1USYH 1JW4A 2HEUA 4N6PA 5I2NA 4R2BA 5H8QA 4IO7A 1JETA 4GLIA 4NMYA 1B5IA 2O1LA 3FIRA 3MZ1A 2ZNSA 3T9HB 3PPPA 4NF8A 4O3AA 1IEJA 4KYSA 4OEVA 4ZEFA 3O9PA 3KEIA 3TODA 1UTBB 4R6YA 3IAZA 1PBPA 4GRKA 4BDOA 4KCCA 4QFPA 2ZMBA 2Z8EA 2PT2A 1B4ZA 5BUUA 4QRZA 2ZYNA 3E9XA 3FATA 4QFNA 5FHOA 1N7XA 2OWSA 5EHMA 3C33A 3Q27A 1NFTA 4I9DA 3S9NC 3UN6A 3RPWA 5EHSA 3MVZA 3MZ9A 1Y1ZA 1EZOA 4I8CA 4AB5A 1P1QA 2XXIA 4PP0A 2O7UA 1B3FA 3FXRA 4DXBA 1I6QA 4QSDA 4RK9A 4RPOA 4PETA 3KSXA 2BJJX 3M3KA 1R9LA 4NWCA 3H06B 4HS7A 4GL0A 1AOVA 1TWYA 1OQGA 1BKAA 4YB7A 1FQBA 1N76A 1PB9A 3KOSA 5I58B 2VD2A 2ONSA 4H5GA 4QF9A 1IITA 4H6DA 5ICQA 5JEIA 3VE1B 3PPOA 1B5HA 3I6VA 5KCJA 1MY0A 2O1MA 3RNNA 2RCAA 3Q25A 5JK4A 4NF5A 2RF1A 3D4GA 1FTJA 1F9BA 3TQLA 4LONB 3OD7A 2E0SA 4AQ4A 1JVXA 1T0KA 4P0GA 3WAEA 1US5A 3MC2A 3K0VA 4KHZE 3K6UA 3K1PA 3O6HA 3W9VA 2I58A 3HV1A 3THIA 4FEBA 4GIZA 2I4CA 5I2KA 3OO7A 3PPQA 3TQWA 3RQTA 4EXLA 1GGGA 3OENA 3QK6A 4F39A 4DZ1A 3MWBA 3GLBA 5DEXB 3OOAA 4PQJA 3OEMA 2VGQA 2QMWA 5AA1A 3KJTA 3QAXA 1DSNA 4MBPA 4KFQA 3O2AA 3VXBA 2DOJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DS9A 3C9HA 3UIFA 3HCQA 1Q1KA 5IZ3B 3BBRA 1P99A 3VVDA 4AB6A 3RGYA 1A54A 4F18A 4OANA 3T9VA 2D3IA 1JQFA 5M2VA 1NL5A 1SW2A 2HAUA 4THIA 2FNCA 4IY6A 1MPCA 1Y3PA 2F78A 4DIGA 1Y20A 2DP8A 1USYE 3F11A 1DCUA 2DSFA 1BTJA 4R6KA 5FHNA 1UTHA 4FECA 3WAFA 4MH5A 1MY2A 4MF3A 4YKIA 3PU5A 1YYZA 1RDZA 4FORA 3C31A 3K6WA 4RA1A 2V3QA 5CMKA 3L6HA 5EYHA 3BIHA 2XXKA 5H8HA 1LAHE 2Y5LA 2GHAA 4MFIA 3B50A 3HPIA 4GVOA 1IUDA 1LBYA 3ZSFA 2NVUB 5IM2A 4FBPA 2BJIA 2WX9A 3MYUA 5LOMA 1WDNA 4MIJA 4JVCA 3FVOA 4ZS9A 4IO5A 3V89B 5BWJA 4U1ZA 3BIGA 4Q5TA 5I56A 4YKJA 4NF0A 5J1DA 4G4PA 4OQOA 1FPGA 1B51A 2OK2A 3C4MA 4X48A 1FPFA 2OJTA 3TDJA 2A5TA 2XWIA 2PX1A 2Z8DA 3FXQA 5JTYA 2F35A 2PYYA 3SERA 3QIMA 2ZYOA 2DWJA 2F6PA 2CMOA 4GOTA 1FPJA 1FTKA 3TTNA 1YTVA 1POY1 1HSLA 3TEPA 1VDWA 3IFAA 1BIYA 1FQFA 1PDAA 3FVKA 3TPAA 4RYAA 3TKDA 1SI0A 4ECFA 3EQ1A 4LZ8A 5K2XA 2F7AA 5B7DA 1ZU0A 2DVZA 1B5JA 4MNIA 2KQZA 3VVFA 4LUBA 2OX3A 1NV2A 1D9VA 3RT6B 2CZLA 2X26A 2GFEA 4R72A 3IORA 4F3SA 2H9BA 4RXLA 4G2ZA 1B3GA 2HFBA 1B7UA 1LGBC 1LCFA 4YKPA 1BP5A 3IOTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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