3RN8A

Crystal structure of iglur2 ligand binding domain and symmetrical carboxyl containing potentiator
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural and functional analysis of two new positive allosteric modulators of GluA2 desensitization and deactivation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rn8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rn8A02
3S9NC 2Q88A 5I59A 1AIVA 3KN7A 1DTGA 3C4MA 2UXAA 1B52A 5IAIA 1UTBA 3VDFA 3G3FA 3LSFB 1MM6A 3MWBA 3PPPA 2ZYKA 4GFRA 4F3BA 1PB8A 4QFOA 1IXIA 3JYRA 1MQGA 3MC2A 2QJEA 1QUJA 4DDDA 2V84A 2O69A 2ONSA 1FTJA 2Z8EA 1LAGE 4ISUA 3IJOB 1I6BA 3FZVA 3PMXA 3KN8A 4G68B 3ECRA 1BLFA 4G68C 3QK6A 1RYXA 1NNPA 1A99A 4IY5A 4PETA 1Y3QA 1M5EA 3S2VA 4BDQA 3T96B 3UORA 3LUYA 3O6GA 4FEDA 4DLDA 4ESWA 2PT1A 3PD8A 3UN6A 2HQ0A 3FJ7A 5KDTB 4L17A 2Y84A 3K1NA 3KGCA 3L6GA 4KD5A 2HEUA 2RKMA 4FJPA 4EF2A 1D4NA 1PB7A 1B51A 1UTHA 2IEEA 4HCYA 2Z22A 1JETA 2X7QA 1LSTA 4GIZA 1LFHA 3K6XA 2R9JA 3TKDA 1ZLQA 1DPPA 1B40A 4G2ZA 4QF9A 3P7IA 1OIBA 1RKMA 2OWSA 1MQDA 4MLQA 1MH4A 4ESXA 2A5SA 3MVZA 2WKYA 4KCCA 5I2NA 1OMPA 4P0IA 2O1MA 1GV8A 2V25A 3R26A 4E0WA 1SYHA 1H44A 4OERA 2REGA 4QFLA 3O97A 4YICA 2I3VA 3QAXA 3T66A 3FD3A 4U4SA 3KG2A 1POY1 1B6HA 3N6UA 1ZBMA 4H8IA 4H1XA 3MVYA 4DIGA 1AL3A 4YKJA 3QYTA 1P1NA 2CMOA 2GHAA 3LC8A 4OEUA 3W9WA 4X1DA 3V89B 1MXZA 3WAEA 3K02A 3B6TA 2Z8DA 3PUZE 1O7TA 1B32A 4OETA 4JDFA 5CMMA 2X7PA 1LAHE 3IL1B 3C32A 4Q5TA 1S9TA 5KCJB 1Y4CA 3PMVA 1MDP1 2B3FA 5DT6A 1BIYA 2YLNA 1I69A 3SEXA 4R6KA 4O3AA 4XKNA 4OZ9A 5DVIA 3IR1A 2E0SA 1URDA 1IXCA 2DS9A 5H8FB 2UYFA 3OELA 3RLFE 3DP8A 4OEVA 2XXTA 4WEDA 3MZBA 3U93A 3TCFA 3MP6A 2XXQA 1R1NA 5JTYB 3QUFA 1Y9UA 4P11A 3TTNA 1B3FA 4H6DA 2E1SA 3D4CA 5DYHA 2Q2AA 2AIXA 1PC3A 2Y7RA 5I57A 1B9JA 3N5LA 3TCGA 1TT1A 3CG3A 3FVOA 2XXVA 3KFMA 2DWAA 4R6HA 2CZLA 2HZKA 1B4ZA 5I58A 3K01A 1JQFA 1SD3A 4O3CA 3V8XB 2HZLA 3DP6A 2V3TA 3TAJA 4H5GA 1PBPA 3U94A 1IIWA 1LLSA 4JWOA 3Q28A 5H8NB 3JV9A 2DWHA 3T9UA 4ZEIA 3EPEA 1JEUA 3CFLA 1URGA 3E9XA 4P0GA 3TTLA 3VLUA 3HSTA 4X48A 1TFAA 4M4GA 3PD9A 4EQBA 2XX7A 4JXIA 3MJNA 3UK4A 3TZAA 1Y1MA 5I56B 2FYIA 2DE2A 1VE4A 3SEYA 4K3FA 4GVOA 3W9VA 1PEBA 3QXMA 1P1QA 2F6PA 2ALUA 1B46A 2ONKE 2I3WA 1QULA 3OO9A 1B1HA 3PUVE 3UP9A 3EN3A 1LFGA 2DE4A 4NF6A 4H5FA 3O6IA 3DELB 2OJTA 1R9QA 2XX9A 4ELQA 4OFOA 1H43A 5I84A 2O6AA 4YKPA 1NH8A 5I2KA 1S7YA 2VD2A 3FVGA 1F9BA 1JW4A 1XOCA 1N0TA 2XXWA 1USYE 4JBZA 4GOTA 1B3HA 5FTIA 1YAEA 4R74A 1LGBC 3RTFB 1AOVA 4OHNA 3FUZA 5A5XB 5BUUA 4KHZE 3S9MC 2B3BA 3K1PA 5IKBA 1SI0A 3ZKKA 1MXYA 2Z8FA 4U2RA 3RN8A 4C1UA 3H6VA 1O63A 2Z23A 1XVYA 2XXYA 4KI0E 3U1OA 2DE3A 2BJJX 1R6ZA 4G77A 4KYEA 1A8FA 4IY6A 1HSEA 4X9TA 3Q27A 3M3LA 1EZPA 1XVXA 3OEKA 4F3PA 3BFTA 4ZZEA 2NWJA 1NKXA 1B7UA 4DXBA 4UACA 3USDA 1VFDA 4ECFA 4LA9A 3SERA 4R72A 4EQ9A 4G4PA 3OENA 1B2HA 3TMGA 5I59B 3PPQA 2XX8A 5CC2A 1UTBB 1HSLA 2FA7A 1QJMA 2RC8A 4PFTA 5DVFA 5ITPA 3UA8A 4Q30B 4OMBA 4ZEFA 3ILTB 4LATA 2R6GE 2G29A 3PU5A 4ONYA 5ISUA 4F29A 4N13A 4EF1A 2QS2A 1IZ1A 2XXUA 1IQ7A 2XHDA 3B7DA 4GWOA 3IX1A 4Q0CA 4TQUQ 5AA2D 2V3QA 2ANJA 4IO5A 3K2DA 4KFQA 4UA8A 1O64A 4XKRA 3G3IA 3MAMA 3W15C 3PUWE 2D21A 5FTHA 5K2YA 1EZOA 4QSCA 3HO7A 3FVNA 5CBSA 3H4ZA 4F31B 1B4HA 1SQYA 2THIA 1A55A 3UIFA 3QIMA 1B7ZA 3VXBA 3LSWA 3SETA 5AE4A 1UTHB 4QSDA 2G93A 3IO6A 1LFIA 4OYVA 2RCBA 4R9GA 1YTVA 4LQ5A 4MBPA 4ND9A 1MY2A 1NNKA 4NMYA 2RINA 5EHSA 3CFXA 2F5XA 5I2NB 4Z7EA 3THIA 4EXKA 1FQFA 1I6AA 3OO8A 5H8HA 2NOOA 3CR9A 4I1DA 4LUBA 5CMCA 4DCYA 4GXSB 2D5WA 3VV5A 1LAXA 2ZYOA 3MW0A 3KOSA 1UIVA 1OLAA 3R7XA 3BFUA 3ZSFA 2Q8JA 5EHMA 1FQAA 4I8CA 5DTBA 1IEJA 3FASA 1TXFA 2KLFA 4PQJA 3AXFA 3TTMA 4PE5B 4KQPA 3TELA 2H5YA 4U4XA 3FJGA 4R2BA 1MM7A 4NF8B 4QFKA 4QSEA 1QKBA 4RK2A 3U8QA 3O66A 1SW5A 4ZEDA 5H8QA 5J1DA 1UIUA 4XKQA 3FXUA 2B65A 3A3UA 3SDFA 2PT2A 1MH3A 3G3JA 5TPAA 4ELPA 3OEMA 3LSLA 4OENA 1FTKA 3MP8A 4MLVA 5F7VA 3R6UA 4YMBA 1B58A 3TQWA 1II5A 2RF1A 2ZXTA 2OCUA 1BP5A 3K4UA 4LVQA 1RYOA 5I57B 4DXUA 1CB6A 3S9LC 4YB5A 2DYXA 4NF5A 5I58B 3M3KA 4N07A 2UVHA 4IB2A 4NF8A 4RNSA 3WAFA 1SVXB 4POWA 2QS1A 2ZYNA 3LR1A 1Y3PA 1CE2A 3TUSA 2DWIA 3SESA 1IUDA 1P99A 2Q2CA 4NE4A 3PGFA 4F1UA 4EUOA 2DP8A 4LZ8A 3VFJA 4BDMA 1OVTA 2R71A 1YCJA 3V5AA 2OK2A 3E4RA 2XXIA 5L8DA 3IJXB 1LCFA 3VXCA 2OBGA 4XKPA 2RC9A 1D9YA 4OFLA 4ZEKA 5AA1A 4JWYA 3JZJA 4QRZA 1EZ9A 2XXHA 4GF8A 3G7WA 1B5HA 2I58A 3HPIA 5B7DA 4DZ1A 3IB1A 2F36A 4EQ7A 3TYHA 3T9VA 3MP1A 3FXQA 4NF4A 2GH9A 4OXVA 1FQDA 3B6WA 3EHUA 4OVJA 4NF6B 2UVJA 5CMKA 1J1NA 3O9PA 5CRYA 2AL5A 3OSRA 3KZGA 5BWJA 1US4A 1MY0A 2Q9TA 1OLCA 1MQJA 4IO3A 3K6UA 5FHOA 2QMXA 3C33A 5I2KB 5HBCA 1GGGA 2DQVA 4QHQA 3MVWA 1MS7A 3OSQA 4GLIA 4OQOA 2QS4A 4U22A 5FHNA 2DXRA 3CFZA 1NH7A 3H03A 2PBWA 1ZTYA 1B3EA 2Q89A 3MZ1A 4KR5A 3S9EA 2HFBA 1Y3NA 1A7LA 3H6TA 3C36A 1A8EA 1SYIA 3PPOA 4IO2A 4F18A 1QW0A 3SKPA 4GXAA 3GZGA 4F39A 3IORA 4ZEBA 1VFEA 3QUJA 1SDXA 1JNFA 5CM6A 1XC1A 5AA4A 4M1VA 5B70A 4C1TA 3TPAA 1POTA 1MPDA 4GRKA 2I4CA 5EYFA 1QUIA 5CBRA 1D3KA 3BKIB 5DEXA 3T93B 3MVXA 3SEWA 1XT8A 2OLBA 2QL3A 2YJPA 4DE8A 3OMBA 4R73A 2HCAA 1LCTA 4LZ5A 2NUVA 2I4BA 4RY1A 4U21A 2ZYMA 1Y1ZA 4Z0IA 1SW2A 4QFPA 3KJTA 4RK9A 3TEPA 1B5JA 4H0WA 1A54A 5L9MA 4RJZA 4ELRA 1FTMA 3VE1B 1URSA 1ZIUA 1FQCA 3IOTA 2RC7A 3LBSA 3C31A 3I6VA 3K00A 4F2QA 3C35A 1PDAA 1ATGA 2QMWA 4NTLA 1TFDA 5H8SA 3Q26A 2PVUA 3N26A 3DM0A 3L6HA 3RT6B 1NFTA 5TP9A 4ZS9A 3H7MA 1MQHA 4R75A 2HXWA 3GLBA 3MBPA 4YMAA 1EH3A 4I62A 3FVKA 1D9VA 2NXOA 3EF7A 4R6YA 2O51A 2ESNA 1L5TA 4BDOA 3LSXA 4NWCA 1FQBA 1N3XA 2UVGA 1B3GA 2I48A 4NWDA 4BDNA 5AA2A 3KSJA 5KZTA 4BDLA 2F7AA 4IO6A 1ANFA 2O1LA 5CI5A 2VHAA 1QKAA 2QPQA 1N84A 3HN0A 3IK6B 1N04A 1I6QA 2OWTA 4E0XA 1MXUA 5FHMA 3TDJA 3PPNA 1S50A 3I5OA 4THIA 3G3KA 5CMBA 4RA1A 3TCHA 5ICTA 2ONRA 3S4UA 1PB9A 3MPLA 3Q25A 3RUMA 1JVXA 4R9FA 2A5TB 1Q1KA 1MG1A 1MXWA 2HAUA 4KYSA 4OWDA 4F1VA 3V83A 1OQGA 5H8HB 1OQHA 2O68A 1M5DA 4AB5A 5HPQA 2DVZA 4H67A 4LZ7A 1XS5A 2I49A 2O7UA 4XIGQ 1MY4A 2M8CA 2HAVA 3QSLA 1MXXA 1OVBA 1DOTA 1N7XA 4FORA 3N94A 5ELVA 1T0KA 3U72A 4RPOA 4G8MA 4IGRA 3K6WA 4YKIA 2A5TA 1MQIA 3GBAA 1P1OA 1FTLA 2H4IA 1IITA 3ODBA 1SI1A 3RQTA 4YKKA 5JK4A 1N76A 2F35A 3K6VA 3A09A 3PUYE 3FGSA 5H8QB 2ZNSA 2GFEA 2F78A 1B0LA 2OZZA 5TU0A 4GD5A 1AH5A 1MXVA 1Z7ME 1GVCA 1H76A 3B6QA 3H6UA 5TPAB 2F6GA 1B0HA 3ONMA 3GXAA 4GL0A 2XXPA 2FNCA 4ZECA 2UVIA 3KSXA 3FV2A 2H99A 1LBBA 1DTZA 3CIJA 4F3GA 2F97A 2QSXA 4G68A 1LB8A 4NF5B 4GQOA 3DP4A 2F8DA 4IGTA 4XTCQ 2W7YA 2QRYA 2QS3A 5M2VA 2RCAA 2D3IA 2V3UA 4BDRA 1JVYA 3RGYA 1FW0A 3IB0A 3PUXE 5KDTA 1HSJA 3EQ1A 3IOVA 4HCWA 5ICQA 1FQEA 4X1BA 3U92A 3EHSA 3T22A 3GBBA 4RXLA 4ZE9A 2H25A 3VVFA 4QFNA 2I6EA 4OTEA 4ZE8A 1WVJA 3TTKA 3RY3A 1LAFE 3D4GA 3OD7A 2Y7PA 1B05A 2AL4A 1DSNA 3CVGA 3M8UA 4G8HA 4JWXA 4XXUA 3O2AA 3O29A 1VSOA 1VR5A 2F7BA 1Y4TA 2Y7KA 1WDNA 2PX1A 3KBRA 3SEVA 1ZKBA 1NNTA 4BLAA 2DXYA 1M5FA 3G3HA 3KEIA 3T9XB 1UQWA 4NF4B 2H98A 1B3LA 1N7WA 2I0BA 4R2FA 2AYSA 1IXHA 1ELJA 3E13X 1AMFA 2GRVA 3DLNA 3CRBA 1P1UA 3IO4A 3G3GA 3ILUB 4FEBA 3CSBA 2X26A 1MRPA 2NVUB 3TTRA 2XXRA 2LAOA 1MY1A 3TODA 1SW4A 4Q8RA 3H6WA 4O3BA 1P1WA 3VVDA 1B5IA 1MY3A 3UGWA 2Y7IA 2Y7WA 4DXCA 1GR2A 4U1ZA 3C9HA 1B1XA 1JW5A 5KCJA 4TLLB 3FV1A 4IO7A 4HW8A 1USYH 3MPKA 3FATA 1FCKA 5JEIA 3N6TA 1FTOA 3VLVA 3OO6A 4U1OA 4JSOA 5H8FA 1EU8A 3M3FA 4PFUA 4DCXA 5JTYA 2VOZA 4OESA 1B7HA 2ZMBA 1M5BA 3O28A 4F19A 2DVCA 1LBCA 4RYAA 3FJMA 1YPNA 5AA4B 1NL5A 3RPWA 3OO7A 2I0CA 2YPNA 3F11A 3O6HA 2DSFA 2H9BA 2V93A 3FXRA 1Y20A 1ZMGA 3RTWB 3I3VA 4AB6A 3H3GA 4AQ4A 1MPBA 3RT8A 3ZKLA 5DEXB 4IO4A 1MPCA 3OXNA 4TLMB 2XD3A 4C0RA 4MF3A 3SEUA 4MFIA 4KCDA 1DMBA 4OFJA 4N6PA 5H8NA 4MH5A 2ZNTA 2ABHA 2F7CA 3VVEA 1QVSA 1PBQA 4I9DA 4JB7A 1Q35A 2VGQA 3K1MA 3KOTA 3IB2A 1BKAA 3VLWA 4FIMA 1GTKA 4YU0A 5L9OA 4YZZA 5HM4B 3MQ9A 4ZDMA 3CI8A 3TQLA 4ZZAA 3OOAA 3PPRA 2PMSA 3Q29A 3TFLA 2PYYA 1BTJA 4PP0A 5TP9B 4EDPA 3HHFA 5I56A 3E3KA 4GL8A 1NNFA 3T9HB 4NEDA 4FECA 1Z7NE 3RNNA 3EHTA 5DVJA 3C34A 2P0SA 3KN3A 1NMUA 3CSGA 5K2XA 4KPTA 3KJ7A 3PMWA 4HTGA 4EXLA 5AA2B 4FAJA 1H3DA 4F3SA 4YAHX 3HCQA 4YB6A 4U23A 2XXXA 1JW1A 4G8NA 1ZJLA 3CG1A 3IAZA 2DOJA 2P1SA 3IOUA 1MDQA 5F1QA 3H06B 3ZS6A 3HHGA 4FATA 4KYDA 2XD2A 2ZNUA 3FIRA 3PV0E 4F2OA 5L9SA 4YB7A 1A40A 1R9LA 1XHYA 4WXJA 5A5XA 2DWJA 4PFYA 1TWYA 4RPNA 1WODA 1IXGA 4LP2B 1DPEA 3MUQA 2GHBA 1SW1A 1SBPA 4WEPA 2REJA 4F1YA 4F22A 2P2AA 1H45A 1ZU0A 1M5CA 1JEVA 4FE8A 2O7IA 4ELOA 2IA4A 1KWHA 4HS7A 4LONB 4H8JA 2VP1A 5AA3A 4POXA 1LB9A 1US5A 3K0VA 4LQ2A 2UYEA 3A3CA 5ITOA 4JSDA 4WKMA 5LOMA 3MZ9A 2O84X 4TOZA 2VD3A 2F34A 3IOWA 4PFWA 1N3WA 1QUKA 4H65A 3BBRA 3HV1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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