3S9NC

Complex between transferrin receptor 1 and transferrin with iron in the n-lobe, room temperature
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
674
structure length
511
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYDKSDNCEDTPEAGPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSDVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title How the binding of human transferrin primes the transferrin receptor potentiating iron release at endosomal pH.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Transferrin receptor protein 1
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 115
structure length 511
sequence length 674
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3s9nC02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3s9nC01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3s9nC03
3KN7A 4BDNA 5CC2A 4F39A 5DVFA 3GXAA 4GOTA 1P1OA 1FQAA 1VR5A 3FATA 3QSLA 1NNFA 3IX1A 4FORA 5EHMA 2XHDA 3VDFA 4PFYA 5CMMA 4H65A 5I2NB 5M2VA 3IB0A 3G3JA 3U93A 2ZXTA 4GL8A 2FNCA 3R6UA 4QFPA 1AOVA 2NWJA 1DOTA 3JZJA 5DVJA 4M4GA 4DXUA 4MF3A 4I9DA 2XXIA 5KDTB 1TWYA 2O7UA 3RNNA 1B9JA 3FUZA 1QW0A 1ZJLA 2H25A 2Z8FA 4R9GA 5KCJB 1Y1MA 1SYIA 4E0WA 4R6YA 4PFWA 3T9VA 4C1UA 3OEMA 1Q1KA 1B0HA 4OQOA 4BLAA 3KG2A 1USYH 1XVYA 4F3BA 1RYOA 1JEVA 4IY5A 4OWDA 4G68C 3HHFA 3FASA 3HPIA 1B46A 1NNKA 2Y7RA 1N0TA 4NE4A 3CFXA 3KEIA 1EH3A 3B6WA 1HSLA 2RCBA 3SEVA 2HZKA 5L8DA 5ICQA 5FTHA 1ZU0A 1Y4TA 1GVCA 2Q2CA 3QXMA 2RINA 2V84A 2O84X 1R1NA 1Q35A 2Z8DA 4R2FA 3SEWA 5BWJA 1QKBA 1Y20A 1QJMA 2GH9A 3K6WA 2X7QA 1WODA 2I4CA 1MQGA 3TTRA 2QMWA 4XKPA 2R6GE 1MM6A 1UIVA 1SD3A 4F3PA 5I56B 5I58A 4EUOA 2F34A 1D9YA 4TOZA 3ZS6A 4KD5A 4H67A 2Q9TA 2HCAA 3PPPA 3SETA 4LQ5A 4ELQA 5HPQA 3OD7A 5TP9A 2HAVA 4ZEIA 4JSOA 1ZKBA 4NWCA 3PMWA 1POTA 4XKQA 1N7WA 3FIRA 1TXFA 1LB8A 4H8JA 2I0BA 2VD2A 5HBCA 4DZ1A 3TZAA 1B7ZA 3CVGA 3SEXA 1UIUA 4F29A 4IO2A 2BJJX 5F7VA 1IEJA 1FTKA 2Y84A 1SI1A 4OXVA 1SYHA 4GXSB 3UGWA 1MDP1 2R71A 4IO4A 1B3HA 4RXLA 2XX8A 4GXAA 1H76A 4KI0E 2PVUA 1LBCA 3FXQA 4JB7A 3M3KA 3MBPA 1N04A 2DWAA 2QRYA 2ZYOA 3PUZE 2OCUA 4LUBA 3IK6B 3TTMA 5CM6A 2F7CA 3LUYA 4F3SA 1QUJA 3T96B 4POWA 2YLNA 1NNPA 4G68B 4NF5A 1N84A 2AYSA 1MG1A 1II5A 4FE8A 3WAFA 2XXVA 1J1NA 1QUIA 4G8NA 5H8QA 4NWDA 3R26A 5TPAA 3ZKLA 3VLWA 5AA4A 1UTHA 3Q28A 4ZE9A 1LB9A 4OFLA 1S9TA 2V3QA 2X7PA 2I3WA 4I8CA 4QFKA 4DCYA 1QUKA 2B3BA 4F18A 4YMAA 3MZBA 4QSDA 4NF4A 2AL4A 4NF6A 4TLLB 2RC8A 1XT8A 1MRPA 3OOAA 1B51A 3G3FA 4DXCA 2HZLA 2A5SA 2O7IA 3TKDA 2NXOA 4GRKA 4JBZA 2A5TB 4C0RA 3RN8A 1MXWA 1SVXB 1D9VA 2D3IA 1FQDA 4GWOA 2UYFA 4U21A 3VLVA 4IO3A 4PP0A 4YB5A 4LZ7A 3BBRA 3GBBA 3H6UA 4LP2B 3F11A 1HSEA 1IXHA 5DYHA 4R72A 4ZDMA 1ELJA 4DLDA 1UTBB 1OLCA 3RQTA 4EF1A 2PT2A 3O29A 3N94A 4U4XA 4FATA 3IR1A 3SESA 2YJPA 2XXXA 3RTFB 4EQ9A 2HQ0A 1OIBA 4LA9A 1M5EA 4YICA 3PPQA 4EF2A 5F1QA 2OJTA 5H8NB 3KSJA 5ICTA 1LCFA 1O63A 3PUXE 2UVGA 2P2AA 3MW0A 5JTYB 2CZLA 1LFIA 1MY0A 2UVHA 3E9XA 3OENA 1I6AA 4IO5A 5JK4A 4EXLA 5AE4A 3HV1A 1BTJA 2DXYA 5FHNA 2H98A 4LZ8A 1MXUA 1MPDA 3B7DA 4QFLA 2QPQA 2QMXA 3U92A 5KDTA 3JV9A 3SKPA 3OEKA 4U23A 3PMVA 2F5XA 1S7YA 1NMUA 4NEDA 3H4ZA 1O64A 4UACA 1A99A 3EHTA 3K6XA 4R6HA 4R75A 1SBPA 5ITPA 1ANFA 1YPNA 1JW1A 4PFTA 4QFNA 1FQFA 1FQEA 1JVYA 2DE2A 1WVJA 4HS7A 3MPKA 4OHNA 1P1NA 3OO6A 1B1XA 3TCFA 4Q5TA 3K6UA 5I59B 4AB6A 5A5XA 1A8FA 3FD3A 3I3VA 3MZ1A 4LATA 1PC3A 4DE8A 2V3UA 3T22A 3SDFA 3TCHA 1B5IA 3KBRA 3LR1A 1MXVA 4YKJA 5FHOA 3IOTA 3KSXA 4OEVA 5AA2D 3O6IA 3EHSA 4AB5A 5DT6A 3U72A 4UA8A 4BDLA 3VXCA 1DTZA 3K01A 3L6HA 5I57B 5I56A 2R9JA 1TFAA 1AH5A 3RT8A 3TYHA 4HCWA 2GHBA 2I0CA 4AQ4A 5DEXA 3OSQA 2I48A 2RF1A 2DXRA 2Q88A 3RUMA 2IA4A 3S9EA 1DTGA 1POY1 2ONSA 3PMXA 2REJA 5FTIA 4Z7EA 3LBSA 1MY4A 3SEUA 4JDFA 4YZZA 3LSXA 4DXBA 3GZGA 4F22A 1VE4A 3W15C 4H0WA 5LOMA 2OLBA 1JVXA 3MVXA 2UVJA 5I84A 3N5LA 1DMBA 1DSNA 4O3AA 3HHGA 3H6TA 3FXRA 3QIMA 3G3IA 3OO7A 2Y7PA 3FGSA 3RTWB 3ODBA 3L6GA 3A3UA 5TU0A 4ELOA 2ESNA 4QF9A 4L17A 4OFOA 3VE1B 1A55A 3T9XB 2ONKE 1B5JA 3ECRA 3OXNA 1A54A 1GR2A 2ZMBA 3H06B 2GFEA 5JEIA 1IITA 2QS1A 4TLMB 3T9HB 4KYEA 3G3HA 4O3CA 4X1BA 1LAGE 4I1DA 3USDA 3W9VA 1PB7A 4JWXA 2Z8EA 5AA3A 3ONMA 3OO8A 4RNSA 2O6AA 4G68A 4YKIA 1XC1A 1FW0A 3CIJA 4DDDA 4RJZA 1JETA 1DPEA 5H8FB 4POXA 1YCJA 1PB8A 2IEEA 2VD3A 4G77A 3UN6A 4IGRA 4U4SA 2GHAA 1US5A 2OWTA 4PE5B 3K6VA 3PPOA 1YTVA 2X26A 3GLBA 4RK2A 1IXIA 2XXWA 5K2YA 2DQVA 4DCXA 5L9OA 1MY3A 4NF8A 4QSCA 4BDRA 4G8HA 4ZECA 3N6UA 4N6PA 1H44A 4QHQA 3LSWA 2A5TA 4F1UA 1F9BA 4NTLA 4RYAA 1OQGA 3C9HA 4KCDA 1B40A 2G93A 2CMOA 2I6EA 2Z23A 3FV2A 3K02A 3K2DA 3FJMA 5J1DA 4E0XA 1B7HA 3OELA 4FEDA 1FQBA 1ZLQA 3S9LC 4RK9A 3EPEA 3DELB 4ESXA 4MH5A 1UTBA 4ONYA 5EYFA 4O3BA 1OVBA 4ZZAA 2XXTA 5H8HB 1Z7ME 1IQ7A 3A09A 4IY6A 4MLQA 2RC9A 1A7LA 3TTNA 3Q27A 1XOCA 1Z7NE 3M3FA 3PPNA 3IL1B 4JWOA 4FIMA 1MPBA 3B6QA 1QVSA 3E3KA 1JQFA 5JTYA 1ZBMA 4F3GA 1QULA 1M5DA 2DP8A 3KN8A 2QS3A 1AIVA 4XTCQ 2O1LA 4ZEKA 1FCKA 4OERA 4U2RA 1B32A 1T0KA 3FVGA 4X48A 2ALUA 1Y9UA 2M8CA 5IKBA 2PYYA 3Q29A 2XX7A 3MQ9A 3T66A 3G3GA 1OLAA 2W7YA 1URGA 4KR5A 1RYXA 3H6WA 5KZTA 4YAHX 3FZVA 3W9WA 1NFTA 3H3GA 5BUUA 1EZ9A 4KHZE 4RPOA 3UORA 3BFTA 4IO6A 3TTLA 1B3EA 1URSA 3VFJA 2OWSA 3TMGA 2E1SA 3K1NA 3V8XB 1D4NA 3FJ7A 4TQUQ 3UP9A 2OZZA 3S9MC 1VSOA 4ZEFA 1ZTYA 2F97A 4WXJA 4P0GA 2O51A 2RCAA 3FVKA 4MFIA 3SEYA 3KJ7A 3TPAA 1R9LA 3UA8A 1FQCA 1MY2A 4RA1A 3G3KA 1VFEA 1B2HA 1LGBC 3H03A 1H45A 4WEPA 1B05A 4XIGQ 2ZYKA 3M3LA 4GQOA 4BDMA 1R9QA 4DIGA 2GRVA 2REGA 4M1VA 3LSFB 3LC8A 4Q30B 2P0SA 3MVWA 1N3XA 3RGYA 1TFDA 2H99A 3CSBA 1LCTA 2DS9A 3DM0A 1QKAA 1PBQA 4Q8RA 3MWBA 4JWYA 2B3FA 4KYSA 4KYDA 5I2NA 3LSLA 1MQDA 3H7MA 3D4CA 1UQWA 2VHAA 1RKMA 3KOTA 2G29A 1NH7A 3O66A 3THIA 1Y1ZA 1M5FA 5IAIA 5ITOA 4R6KA 1HSJA 3IAZA 3RY3A 3IB1A 1KWHA 1LLSA 3K00A 1BLFA 4G2ZA 2XXHA 1FTJA 2I3VA 3JYRA 4NF5B 1FTMA 5KCJA 4X9TA 3IB2A 3B6TA 1CB6A 4FECA 2ZNUA 2KLFA 1NH8A 5H8QB 3CG1A 3FJGA 3DP6A 3FVNA 1B3FA 5TPAB 1UTHB 2D21A 4G4PA 4PFUA 3MJNA 2VGQA 4NF4B 2HFBA 4ZE8A 4RPNA 1B0LA 3HSTA 4PETA 3C34A 4N13A 3EQ1A 4IB2A 5FHMA 4H8IA 1I6QA 1MS7A 4MBPA 1D3KA 2RKMA 3T93B 1H43A 3MP6A 3T9UA 4BDOA 4P11A 4KFQA 1WDNA 1A40A 3QYTA 5CBRA 3TODA 1MH3A 3CRBA 1MXXA 2F8DA 4K3FA 1I69A 4G8MA 5HM4B 3HCQA 2Y7KA 3MAMA 4H5FA 1Y3NA 3O2AA 5H8FA 3EN3A 3GBAA 3OO9A 3BFUA 4LVQA 2H5YA 1IXCA 1LBBA 3M8UA 1IZ1A 1DPPA 3ILUB 1SW4A 4Q0CA 4OENA 5AA2B 3MUQA 4OVJA 3QUFA 4NMYA 2DOJA 1P1QA 1ZIUA 2AL5A 4PQJA 2HEUA 2XXYA 4F2OA 3BKIB 4GLIA 1A8EA 4GL0A 3KJTA 3K1PA 1LFGA 4Z0IA 2FA7A 3PGFA 5CBSA 2O1MA 4ZEDA 2B65A 2ZYNA 4YKPA 1SW1A 4OEUA 5ELVA 4THIA 2Y7IA 3TQWA 1B7UA 1Y3PA 5AA1A 2F7BA 2ONRA 3IJOB 3VVDA 1IXGA 1PBPA 3CR9A 3KN3A 4LZ5A 1SQYA 1MXYA 3K4UA 4YKKA 2P1SA 2ANJA 3C33A 5H8HA 1VFDA 1URDA 4IO7A 4P0IA 3KGCA 2NUVA 1FTLA 4ISUA 3IJXB 5I2KB 1PDAA 1PB9A 1P99A 2THIA 3PUYE 3G7WA 3AXFA 1MM7A 3DLNA 1AL3A 2NOOA 2PX1A 4RY1A 2LAOA 5DVIA 1B3LA 4GFRA 1BP5A 5A5XB 2E0SA 1O7TA 2V25A 3Q26A 4ZEBA 1B5HA 3RT6B 3HO7A 1NL5A 2PMSA 4F31B 3PD9A 3K0VA 3UIFA 4XKRA 2V93A 1B6HA 1P1WA 3U94A 3RLFE 1LAXA 4C1TA 1XS5A 4QSEA 4GIZA 1MH4A 1M5CA 4LQ2A 4YB7A 3IOUA 4JXIA 1EZOA 4ZZEA 4OTEA 1BIYA 3Q25A 2VP1A 5DEXB 4BDQA 4FAJA 1N76A 4GVOA 3PPRA 1B4HA 5K2XA 4EDPA 1N7XA 3CFZA 5CMCA 3H6VA 2XXPA 3SERA 2DYXA 1MQIA 3TCGA 4U1OA 5B70A 3MZ9A 2I4BA 1SW2A 1PEBA 5CRYA 2O68A 3MC2A 2QSXA 3OSRA 1CE2A 2UVIA 5EHSA 3V83A 2DE4A 2XX9A 4R2BA 1IIWA 4R9FA 4ECFA 1P1UA 2QS2A 3E13X 3QK6A 4JSDA 2DWJA 3PV0E 5CI5A 1SW5A 3WAEA 4U22A 3MPLA 3CG3A 2OBGA 4YU0A 2UYEA 3P7IA 3QAXA 4OYVA 5H8NA 2F7AA 4KCCA 3V89B 4EXKA 3D4GA 3O97A 3CFLA 3MP1A 3C31A 3OMBA 4HCYA 4MLVA 3I5OA 1EZPA 4KQPA 1OVTA 4H5GA 5B7DA 1SI0A 2ABHA 2VOZA 2WKYA 3KZGA 3ZKKA 1MDQA 1MY1A 2I49A 3O6GA 1B58A 1USYE 1LAHE 1XHYA 2HXWA 3S4UA 1S50A 4WKMA 1IUDA 2RC7A 4ZS9A 2UXAA 2ZYMA 1BKAA 2XXQA 3C4MA 3DP4A 1FTOA 3E4RA 1M5BA 1L5TA 3TQLA 5L9SA 3ILTB 2I58A 4OZ9A 2AIXA 1US4A 1LSTA 2D5WA 4OESA 1EU8A 3O6HA 5I58B 1B3GA 3IO6A 3PUWE 4OETA 5CMKA 4HTGA 1MXZA 3HN0A 2H9BA 3TEPA 4NF8B 2XXRA 5H8SA 1JEUA 1NNTA 4OFJA 4XKNA 3TAJA 5I59A 3MP8A 2DVZA 4ESWA 5TP9B 1OQHA 1MQJA 4IGTA 3IORA 3FXUA 2Q8JA 3PU5A 2PBWA 2XXUA 3FVOA 1YAEA 2V3TA 1LFHA 4U1ZA 2DVCA 1JNFA 4ELRA 2QJEA 2DWIA 2DWHA 3KOSA 3U8QA 3ZSFA 3CSGA 4R73A 3IOWA 3TDJA 4F19A 1GGGA 3KFMA 3VLUA 3MVZA 4H1XA 5I57A 4FJPA 3PD8A 3QUJA 1B1HA 2F35A 5AA2A 1AMFA 3O9PA 3VV5A 1GV8A 1H3DA 2XD3A 3FV1A 4HW8A 2Q2AA 2Y7WA 3N6TA 4ND9A 4LONB 3PUVE 3RPWA 3DP8A 1I6BA 4OMBA 2F6GA 4H6DA 4GD5A 2FYIA 3V5AA 4XXUA 2O69A 4R74A 5DTBA 2NVUB 1ZMGA 3TUSA 2DE3A 2ZNTA 4F1VA 1B4ZA 1Y3QA 1GTKA 4KPTA 4WEDA 1MPCA 2PT1A 4I62A 5ISUA 5AA4B 1JW5A 4F2QA 1XVXA 4X1DA 2DSFA 1N3WA 5CMBA 2Z22A 3S2VA 3O28A 1ATGA 4N07A 3IO4A 3VVFA 4YB6A 2YPNA 3TFLA 2OK2A 4F1YA 2QL3A 3K1MA 4NF6B 3VXBA 3EF7A 3S9NC 1OMPA 4GF8A 5I2KA 3A3CA 3IOVA 2F36A 4QRZA 3C36A 3N26A 1MQHA 3TELA 1R6ZA 4EQ7A 1SDXA 4QFOA 3TTKA 3MVYA 1Y4CA 3EHUA 1B52A 3I6VA 2F6PA 3R7XA 4FEBA 4EQBA 3C32A 1LAFE 3C35A 2HAUA 1TT1A 2H4IA 5L9MA 3VVEA 2XD2A 2ZNSA 3UK4A 1NKXA 3U1OA 2F78A 2Q89A 4ELPA 2QS4A 3CI8A 4YMBA 1JW4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KN7A 4BDNA 5CC2A 4AS5A 4XF5A 4F39A 5DVFA 3GXAA 1FTAA 4GOTA 1P1OA 1FQAA 1VR5A 3FATA 3QSLA 1NNFA 3IX1A 4FORA 5EHMA 2XHDA 3VDFA 4PFYA 1NUYA 1K9ZA 5CMMA 4H65A 5I2NB 3CHGA 5M2VA 4NF0A 3IB0A 3G3JA 3U93A 2ZXTA 3KC1A 4GX6A 4GL8A 4PDHA 2FNCA 3R6UA 4QFPA 4XFEA 1AOVA 2NWJA 1DOTA 3JZJA 1NV7A 5DVJA 4M4GA 4DXUA 4MF3A 1CNQA 4I9DA 2XXIA 5KDTB 1TWYA 2O7UA 3RNNA 1B9JA 3FUZA 1QW0A 1ZJLA 2H25A 2Z8FA 4R9GA 5KCJB 1Y1MA 1SYIA 4E0WA 4R6YA 4PFWA 1FBPA 3T9VA 4C1UA 3OEMA 3U65A 1Q1KA 1B0HA 4OQOA 4BLAA 3KG2A 1USYH 1XVYA 4F3BA 1RYOA 3FBPA 4HE2A 1JEVA 5F24A 4IY5A 4OWDA 4G68C 5J16A 3HHFA 3FASA 3HPIA 1B46A 1NNKA 2Y7RA 1N0TA 1LBVA 4NE4A 3CFXA 3KEIA 4MAGA 1EH3A 3B6WA 1HSLA 4N15A 2RCBA 3SEVA 2HZKA 5L8DA 5ICQA 5FTHA 3ISPA 1ZU0A 1Y4TA 1GVCA 2Q2CA 3QXMA 2RINA 2V84A 2O84X 1R1NA 1Q35A 4DI3D 2Z8DA 4R2FA 3SEWA 2FBPA 5BWJA 1QKBA 1Y20A 1QJMA 2PFZA 5IZ3A 2GH9A 3K6WA 3SZPA 2QFLA 2X7QA 4I3EA 1WODA 2I4CA 1MQGA 3TTRA 2QMWA 4XKPA 2R6GE 1MM6A 1UIVA 1SD3A 4F3PA 5I56B 5I58A 4EUOA 2F34A 1D9YA 4TOZA 3ZS6A 4KD5A 4H67A 2Q9TA 2HCAA 1NUXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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