3SESA

Cu-mediated dimer of maltose-binding protein a216h/k220h by synthetic symmetrization
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEHAFNHGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An approach to crystallizing proteins by metal-mediated synthetic symmetrization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 124
structure length 370
sequence length 370
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3sesA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3sesA01
4NF5A 2ONKE 2PX1A 4GOTA 3VVEA 4N13A 4QFPA 3B6QA 1HSJA 1B5HA 3IR1A 5H8SA 3E4RA 3Q25A 5K2YA 4BDMA 3IB0A 4RK2A 3N94A 4ONYA 3BFUA 3W9WA 2R71A 1MXWA 1PB8A 2GHBA 3S9EA 2RKMA 1NNTA 4DXBA 4X1BA 2XXQA 3TTLA 4EF1A 1MY2A 4EXKA 3H6VA 1S7YA 3OELA 1TWYA 1B5JA 4FECA 1CE2A 3K6VA 3QK6A 3B6TA 4ZEFA 2QMXA 4OFLA 2CMOA 3UIFA 3IOVA 1IZ1A 1B2HA 3UN6A 5TP9B 1A99A 2XXPA 2I4CA 3KZGA 3Q28A 3O97A 3OO7A 1JEVA 3OO8A 4P0IA 4QHQA 1UQWA 1JNFA 1B05A 2VGQA 5AA2D 4JWOA 1MQHA 1OQHA 3TQLA 3FUZA 5HBCA 3CI8A 4PFTA 1ZLQA 3VFJA 2DWHA 4TLMB 3ZKKA 1SYIA 3MJNA 2H25A 2Q88A 1PEBA 2O1LA 5EHSA 5AA2B 3KSJA 4H8IA 2PVUA 3IK6B 1IXCA 4Q0CA 4XIGQ 2X26A 3GBBA 4KQPA 2R9JA 3CRBA 3SEVA 4MH5A 2ZNUA 2O51A 3OD7A 2I3VA 2O1MA 3FJMA 4U1OA 1LFHA 1FQAA 4IY6A 1B40A 3V89B 1TT1A 2X7QA 3ILTB 1O64A 4FORA 2V3UA 1JW4A 1DTZA 1NNFA 1PC3A 3KFMA 3MPKA 4I62A 3MZ9A 3ODBA 3DP6A 4LZ8A 4DCYA 2HAUA 4JWYA 2HFBA 5DEXA 4EQBA 1IEJA 3MZ1A 3WAFA 4H5FA 4GF8A 3FVNA 3FXUA 1ZU0A 1IXHA 4H8JA 1XVXA 4ZS9A 3SEYA 2ZYOA 2UXAA 1Z7NE 3HPIA 2YJPA 3PGFA 3KJTA 4G8HA 4ISUA 4KFQA 1II5A 1VR5A 1GV8A 1QUKA 2THIA 5KDTA 2V93A 4GQOA 1P1UA 4FJPA 1OMPA 2Y7WA 2REGA 5H8QA 2F34A 3PPPA 4MLVA 2GFEA 3PMWA 5TU0A 3C9HA 3R7XA 3S4UA 2QS3A 5LOMA 3S9MC 5H8HB 3RY3A 3O2AA 1ZMGA 3S2VA 2F8DA 4I8CA 2A5TA 4QSEA 2Z8EA 4KYSA 4L17A 2OCUA 1R1NA 3TTMA 4OQOA 2Y84A 3K1PA 2Q8JA 2VOZA 2DXRA 4R6KA 4H1XA 4RYAA 3RN8A 3TAJA 5I56A 3A09A 4RPNA 1OVTA 5CMBA 1NNKA 3OEKA 4X1DA 2Z22A 2ZYMA 2UVHA 2Q9TA 2F78A 1ZJLA 1Y4CA 4GRKA 1LAHE 1NH7A 4RA1A 5ITPA 2DE4A 2O69A 3B6WA 1CB6A 2XXXA 5AA4B 4DE8A 4JBZA 3C33A 2DSFA 5A5XA 1SW1A 3CFZA 2XHDA 3FXQA 3N26A 1OLAA 3MVXA 2H5YA 3IB2A 1WDNA 2UVJA 4YZZA 4H65A 1I6AA 1SBPA 4NF8A 2O6AA 5IAIA 4NF4A 4F3SA 3OEMA 4G8MA 3KGCA 4YU0A 5BWJA 1BIYA 5AA1A 1N7XA 3VVFA 3O29A 4OEUA 4IY5A 3T22A 4LQ2A 1A54A 2ZYKA 3G3GA 4FAJA 2G29A 1Y1ZA 1FTKA 4R75A 4NE4A 1PDAA 3RT8A 3H6WA 3KJ7A 1H43A 2E0SA 2NXOA 1ZIUA 3L6HA 4G8NA 4G68A 3T66A 3KG2A 3PUXE 5KCJB 2Y7PA 4AQ4A 4WXJA 1IIWA 3EHSA 1URSA 3N6TA 1SI0A 3DLNA 1B3FA 3MWBA 4YICA 4FEBA 2F5XA 4H5GA 5FHMA 3TKDA 4YB7A 3G3FA 3JV9A 4GL8A 1L5TA 4R6YA 3TTKA 1A40A 1MQDA 3O28A 4IGTA 5H8FB 1MPBA 4KYEA 4XKPA 5AA3A 3K0VA 1S9TA 3SESA 2ZNSA 2I0BA 3VXCA 3VXBA 2ANJA 5L9SA 5BUUA 1MY4A 4P11A 4R9FA 3W9VA 3TCGA 3P7IA 4F3PA 1JEUA 2P1SA 4OERA 2Q2AA 2YPNA 1N0TA 1SD3A 4OVJA 4OZ9A 3MQ9A 3OXNA 3D4CA 2D3IA 1M5EA 4H6DA 5ICTA 1SVXB 3IL1B 2DXYA 2NOOA 3CG1A 4EXLA 5I84A 3IOWA 3H3GA 4OYVA 1F9BA 2Y7IA 3FV1A 4ZEBA 2VHAA 4E0XA 3O6IA 1IITA 3MP6A 4F1UA 5JTYA 1Z7ME 5DVFA 4MBPA 4BLAA 3RNNA 2QS1A 4R73A 2O7IA 1ZTYA 3LR1A 1B3GA 1EU8A 1OLCA 2F97A 1POY1 3PUWE 1VFDA 2E1SA 3FV2A 2ZNTA 2Q89A 4ESXA 3PMXA 3TQWA 1OIBA 1POTA 1RKMA 4LA9A 5CBRA 4KPTA 1RYXA 1B1HA 1JETA 3KN7A 5CM6A 4ZEIA 4ELQA 4AB5A 4ZE8A 2ZMBA 1EZ9A 1JW5A 4F29A 5I2KA 4RY1A 4UACA 3N5LA 1EH3A 1B5IA 3OOAA 1GVCA 4XXUA 1AIVA 5J1DA 2P0SA 3TZAA 1B0LA 3HV1A 1DTGA 3T93B 1KWHA 3PD8A 1XS5A 3R26A 3KOSA 5ITOA 1QJMA 2DP8A 2Y7RA 3KN8A 1DMBA 4ZEKA 5H8NA 1LGBC 4G4PA 4N6PA 3K4UA 5I59A 1LAFE 1N7WA 4PETA 4TQUQ 1LBCA 4BDOA 2XXTA 4GVOA 4GXSB 3RLFE 1O63A 5TPAB 4OFJA 1P1NA 3G7WA 4Q30B 1AL3A 4YKPA 3FJGA 1VFEA 4H67A 3OO6A 3A3CA 4F3BA 5ISUA 1FQCA 2OWTA 3DP8A 4MFIA 3W15C 2H4IA 1Y4TA 3EN3A 1LFGA 2B3BA 4OFOA 1WVJA 3HHGA 1SW4A 5DEXB 4NWDA 1R9LA 3MP1A 3PMVA 5FTHA 5I2NA 1M5CA 4YB6A 5KZTA 1WODA 1FTOA 4O3BA 2F6GA 1JW1A 1PBPA 1IUDA 1SW2A 3L6GA 3MAMA 2V3QA 2W7YA 1IXIA 1FQFA 4DXUA 1MS7A 3EHUA 5KDTB 2OBGA 4MF3A 5I57A 3KEIA 1UTHB 3IAZA 4HS7A 2AYSA 4YB5A 2O7UA 5H8QB 3OMBA 3KBRA 5CC2A 3SEUA 3V83A 4GL0A 4QFKA 2DS9A 3K1MA 2UVGA 2A5TB 3U94A 5F7VA 1B3LA 3E9XA 2UYEA 4F2QA 4YKKA 1Q1KA 1XT8A 1DPEA 3EHTA 3GXAA 3BFTA 3TYHA 2B3FA 1J1NA 5CI5A 2DVZA 4U4XA 3M3FA 5B7DA 1S50A 1OVBA 2I48A 3QIMA 2ESNA 1NNPA 3FZVA 4LONB 3LUYA 1MDQA 3H03A 3LBSA 5I58A 3PU5A 1Y9UA 4OWDA 3SEWA 3M3LA 2HZLA 3TELA 4E0WA 3VLVA 2GH9A 2HEUA 4QFOA 4OEVA 4WEDA 4OTEA 3MBPA 3LSWA 3H4ZA 3TCFA 3MVZA 2Z23A 3JYRA 1N3XA 1LB9A 5A5XB 2I3WA 1LCTA 2QSXA 2OJTA 3PPQA 4R2FA 1USYE 4XKRA 3H06B 4LZ5A 1MM6A 3LC8A 4ECFA 4NF8B 2F35A 1A8FA 4R9GA 4ZE9A 4LATA 1FCKA 3KOTA 2XX7A 3M3KA 3H7MA 4X9TA 2RC7A 2RCAA 1MPDA 4Q5TA 3PUZE 4ZZEA 3HHFA 3RPWA 3VLWA 4BDNA 4IO4A 3FVOA 1Y20A 2RCBA 1MDP1 2ONSA 1XC1A 4KYDA 1A7LA 3I3VA 2R6GE 3EF7A 3MW0A 2X7PA 5HPQA 2DQVA 3CFXA 5FHOA 2H9BA 4U23A 5DYHA 3QUFA 4R2BA 2B65A 4NWCA 1A55A 1B4ZA 4PE5B 1YTVA 4U1ZA 1LCFA 1P1WA 3PD9A 3C32A 1EZOA 2PMSA 2NWJA 3OENA 1H45A 2VD3A 5H8HA 4HW8A 2WKYA 4IB2A 3GZGA 3FASA 3WAEA 1NFTA 3PPRA 4EDPA 1TFDA 5DT6A 5L8DA 1LAXA 1VSOA 2V84A 1P1OA 2PT1A 3O6GA 4RXLA 1ATGA 3TUSA 1R9QA 4I9DA 4WEPA 4ELRA 5M2VA 4BDRA 3E3KA 3CSGA 1B6HA 3UA8A 3TFLA 1QKAA 3HN0A 2UYFA 1SI1A 1ZBMA 3U92A 1M5FA 3SEXA 1EZPA 4BDLA 4XKQA 1SYHA 2ONRA 4R6HA 5JEIA 4PFUA 2IEEA 2XD3A 1FTLA 4NF6B 3HCQA 3U1OA 2AL5A 2O84X 1ZKBA 2XXYA 1FQDA 4U4SA 4LZ7A 2V25A 3UORA 4OENA 5DVIA 3QYTA 1I69A 1NL5A 5CMKA 1UTBA 4ELOA 3DP4A 4Z7EA 3IOUA 4QRZA 2KLFA 3PUYE 1QW0A 4FATA 1XHYA 5K2XA 3Q27A 2DWIA 3SKPA 1Y1MA 1LB8A 4QF9A 4JDFA 1R6ZA 1B46A 4NF5B 1TXFA 2REJA 1LSTA 3T96B 2PYYA 4QSCA 2G93A 2DVCA 1NKXA 1MQIA 2QL3A 3IO4A 1LLSA 3AXFA 3TEPA 3THIA 3IX1A 4NTLA 2FNCA 1Y3PA 4GLIA 1P99A 3HSTA 2VP1A 5KCJA 2HCAA 3K00A 3DELB 3USDA 4U22A 3K02A 3I6VA 4PFWA 1PBQA 2V3TA 4F3GA 3MPLA 3BBRA 2XXHA 2Y7KA 4K3FA 4U2RA 3K2DA 5EYFA 3O66A 2QPQA 3G3HA 3C35A 4F2OA 3OSRA 2HQ0A 4DLDA 3ILUB 3FJ7A 5EHMA 4BDQA 3MC2A 4OXVA 4NMYA 4AB6A 2AL4A 1B32A 3C34A 3ECRA 5F1QA 1DPPA 3O9PA 1SDXA 1JQFA 4FIMA 1MRPA 3FVGA 2I4BA 3SDFA 2RINA 1UIVA 1H76A 1FQEA 4P0GA 1MXYA 5I2NB 2XXWA 2XX8A 4U21A 4PP0A 1SQYA 3QSLA 2F36A 1AMFA 3U72A 3ZKLA 1MXXA 2HAVA 2OK2A 3TPAA 1QUIA 3IJXB 1IXGA 3DM0A 3R6UA 4HCWA 1NMUA 4F22A 5I57B 2LAOA 4KI0E 3MP8A 3VE1B 3IORA 3KSXA 4IO2A 3G3JA 1N84A 2XXUA 3KN3A 3GLBA 1FW0A 3VLUA 3C4MA 5ELVA 3V5AA 4DDDA 2QMWA 2Z8DA 3HO7A 4IO7A 4DXCA 4N07A 3K01A 4KCDA 2XX9A 2I49A 1BLFA 4GD5A 4RNSA 4ZECA 4RK9A 3M8UA 4PQJA 4EQ9A 4F1YA 4OETA 2I58A 3PPNA 4LP2B 2GHAA 2DE3A 4OMBA 2FYIA 3H6UA 3S9NC 4QSDA 5I58B 1MQGA 1MY1A 2D5WA 1HSLA 1B9JA 1JVYA 3T9VA 2HZKA 4QFNA 1QULA 3E13X 5DTBA 4ESWA 3ZSFA 3VVDA 3VDFA 4Q8RA 1N76A 1USYH 4POXA 1Y3QA 4RJZA 5TP9A 1VE4A 4M1VA 2DE2A 4THIA 3SETA 4FE8A 3IB1A 1P1QA 1M5BA 1MY3A 1RYOA 5TPAA 4GFRA 2F7AA 3K6WA 2OWSA 4RPOA 3Q26A 3CSBA 2RF1A 3PPOA 3TDJA 2GRVA 5I56B 2NVUB 4KHZE 3B7DA 4GXAA 1IQ7A 1YPNA 3K1NA 3MZBA 1Q35A 1NH8A 3TCHA 3EPEA 4C1UA 2ALUA 3FIRA 2XXVA 5AA2A 1B1XA 3FVKA 1JVXA 3T9XB 4F31B 1GTKA 1GR2A 4NEDA 1US4A 4IGRA 3Q29A 4YKIA 1B7HA 1A8EA 2XXRA 2ABHA 4JSDA 2ZXTA 3OO9A 4DZ1A 1B51A 4G77A 5HM4B 1UTHA 1ELJA 4ZDMA 3QAXA 1N3WA 1MH4A 5JK4A 4F18A 4NF4B 2YLNA 3V8XB 1URDA 2DOJA 1MXUA 3GBAA 2F7CA 3G3KA 3T9HB 1MG1A 4ELPA 3F11A 4OHNA 3K6XA 4ZZAA 4ND9A 5DVJA 3BKIB 5AE4A 1BP5A 2QS2A 2H98A 2NUVA 3LSFB 3MVWA 3K6UA 5CMMA 3TODA 1MXVA 5FHNA 2M8CA 4C0RA 1B7ZA 3U8QA 2QRYA 4LUBA 1AH5A 1OQGA 3RGYA 1PB7A 1D3KA 2UVIA 2XD2A 4H0WA 1LAGE 1QVSA 4UA8A 5CRYA 4G68B 1MY0A 2Z8FA 4DIGA 1LBBA 1B3EA 4O3CA 2DWJA 4M4GA 4XTCQ 1MXZA 4IO3A 1BKAA 2OZZA 2XXIA 3RT6B 3IJOB 4KR5A 1XOCA 4WKMA 4Z0IA 3FATA 1AOVA 1YCJA 3FXRA 4TLLB 3UP9A 3LSLA 4IO6A 2F7BA 4JB7A 3LSXA 4TOZA 3N6UA 3H6TA 1UTBB 1D9YA 2H99A 2VD2A 1MQJA 1D4NA 4ZEDA 4I1DA 3IOTA 3CIJA 1PB9A 4HTGA 3TTRA 2DYXA 4QFLA 1FTMA 1B0HA 1I6QA 4R74A 1URGA 1BTJA 4YKJA 4G2ZA 4XKNA 3CVGA 3CG3A 3ZS6A 4JSOA 3SERA 3CFLA 4F39A 2D21A 4G68C 5AA4A 1FTJA 1H44A 4GWOA 4FEDA 1YAEA 4MLQA 4GIZA 3C31A 2O68A 3UK4A 1DSNA 3FGSA 4X48A 2PBWA 3I5OA 4C1TA 2RC8A 1D9VA 1SW5A 4O3AA 1LFIA 2FA7A 2P2AA 4LQ5A 1GGGA 4POWA 2QJEA 1US5A 2CZLA 2I0CA 4F1VA 2DWAA 3S9LC 4DCXA 3PUVE 1QKBA 1M5DA 5CBSA 3RQTA 4OESA 2QS4A 4JWXA 4YAHX 3ONMA 3TTNA 4YMAA 1H3DA 5JTYB 1UIUA 1B7UA 3UGWA 4JXIA 3C36A 1HSEA 1ANFA 4YMBA 5B70A 5CMCA 4PFYA 1DOTA 2Q2CA 4R72A 4EQ7A 5FTIA 2A5SA 3MUQA 2BJJX 1B52A 1O7TA 3IO6A 3A3UA 3JZJA 4LVQA 1B4HA 5I2KB 3MVYA 4F19A 3T9UA 1FQBA 3QUJA 1Y3NA 1MPCA 1MH3A 3G3IA 4KCCA 3RTWB 1T0KA 1XVYA 2F6PA 5L9MA 1B3HA 2PT2A 4NF6A 4IO5A 2RC9A 3OSQA 5IKBA 3FD3A 1I6BA 2HXWA 3VV5A 3EQ1A 5H8NB 5ICQA 2OLBA 2ZYNA 2I6EA 4KD5A 5I59B 3U93A 5L9OA 4EF2A 3RUMA 3QXMA 4HCYA 5H8FA 3TMGA 1TFAA 3D4GA 3RTFB 1B58A 2AIXA 2IA4A 1N04A 4EUOA 3O6HA 1MM7A 3CR9A 1QUJA 3PV0E
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NF5A 2ONKE 2PX1A 4GOTA 3VVEA 4N13A 4QFPA 3B6QA 1HSJA 4PF6A 1B5HA 3IR1A 2WYKA 5H8SA 4HE2A 3E4RA 3Q25A 5K2YA 4BDMA 3IB0A 1DK4A 4RK2A 3N94A 4ONYA 3BFUA 4PFBA 3W9WA 2R71A 1NUZA 1MXWA 1PB8A 2GHBA 3S9EA 2RKMA 1NNTA 4DXBA 4X1BA 2XXQA 3TTLA 4EF1A 1MY2A 1FBGA 4OVTA 4EXKA 1RDYA 3H6VA 1S7YA 3OELA 1TWYA 1B5JA 4FECA 1CE2A 2KQZA 3K6VA 2WYPA 3LV0A 3QK6A 3B6TA 4ZEFA 2QMXA 4OFLA 2CMOA 3UIFA 3IOVA 1IZ1A 3SZPA 4PCDA 1B2HA 3UN6A 5TP9B 1A99A 2XXPA 2I4CA 3KZGA 3Q28A 2WX9A 2HXRA 3O97A 3OO7A 1JEVA 3OO8A 4P0IA 4QHQA 1UQWA 1JNFA 4MMPA 1B05A 2ZZWA 2VGQA 5AA2D 4JWOA 4MNPA 1MQHA 1OQHA 3TQLA 3FUZA 5HBCA 3CI8A 4PFTA 1ZLQA 3VFJA 2DWHA 2QFLA 2QVVA 4TLMB 3B8BA 3ZKKA 1SYIA 3MJNA 4PC9A 2H25A 2Q88A 1PEBA 2O1LA 5EHSA 5AA2B 3KSJA 4H8IA 2PVUA 3IK6B 1LBVA 1IXCA 4Q0CA 4XIGQ 2X26A 3GBBA 4KQPA 2R9JA 3CRBA 3SEVA 4XEQA 4MH5A 2ZNUA 4I3EA 2O51A 3OD7A 2I3VA 2O1MA 3FJMA 4U1OA 3RPLA 1LFHA 1FQAA 4IY6A 1B40A 4O7MA 3V89B 1TT1A 2X7QA 3ILTB 1O64A 4FORA 2V3UA 4I40A 1JW4A 1DTZA 1NNFA 1EYKA 1PC3A 3KFMA 3MPKA 4I62A 2XXKA 3MZ9A 3ODBA 3DP6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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