3T9UA

Cnqx bound to an oxidized double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9uA02
3C35A 1JW5A 4ZDMA 1ZMGA 2FNCA 4POXA 4FORA 1LAGE 4R9FA 3FD3A 4NF4B 4OEVA 4GIZA 1B7ZA 1H44A 5A5XA 4KD5A 4YZZA 4EXKA 1I6QA 4FATA 3N6TA 3PMXA 3TELA 2PBWA 3EHUA 1QVSA 1I6AA 3QIMA 2GHBA 1HSEA 1N0TA 4OFJA 4DDDA 3MVZA 1UTHB 2XX8A 1SD3A 3ZKLA 3MPKA 3MAMA 1MPCA 1MPBA 4EQ9A 4ZEBA 2I0BA 1AMFA 3MWBA 4EXLA 4N13A 1PB8A 1R9QA 2XX9A 3FVOA 3PD9A 3SEXA 3B6TA 4X1BA 4DCYA 4ZEFA 3QSLA 4MLVA 1B1XA 3TODA 3OOAA 3MP8A 3F11A 4BDNA 1SW1A 3D4CA 3K0VA 2P1SA 2V3UA 4N6PA 4OEUA 2DYXA 5I2NA 3OELA 1F9BA 4LVQA 4AB6A 3IOWA 1JETA 3MUQA 1B3FA 1Y3NA 2R71A 2VD3A 1XC1A 4OYVA 5I56A 3TDJA 2OJTA 3RN8A 4E0WA 3H6VA 2PT1A 3VE1B 1Y20A 5K2YA 1R6ZA 4PFTA 4H8JA 2H98A 4RPNA 4IO7A 3LC8A 4PFWA 3C31A 3CSGA 4FEDA 2R6GE 3K00A 3VLUA 4F31B 4GLIA 2XXRA 5CBSA 1EU8A 1OQGA 4ISUA 3KN7A 1OVTA 2YLNA 1GVCA 1US4A 1DPPA 1P1OA 4RK2A 3I6VA 5I2KB 3EHSA 4ECFA 2O7UA 2G29A 4TOZA 3K6UA 3OD7A 1MQGA 3O6GA 3HHFA 1RYOA 1XHYA 4BDLA 3VVEA 3ECRA 2UVHA 3N26A 1FQCA 2H4IA 4YAHX 3IOTA 3PUYE 3QXMA 4LP2B 3LR1A 4MFIA 4F2QA 2ONSA 1TT1A 2WKYA 4JWYA 1MY1A 1VR5A 1B4ZA 4GL8A 1DTGA 4XKPA 3ILTB 4H6DA 4OETA 3DM0A 1NFTA 2F6PA 2I58A 3W15C 3IAZA 1XVYA 4WEDA 3FVGA 4NF5A 2O68A 3TPAA 2HZLA 2QMXA 3VLVA 5ELVA 5H8NB 3IOVA 1NH7A 3OENA 2OZZA 5I58B 2XXYA 1N84A 1M5CA 3O9PA 1PBPA 3PV0E 2PX1A 1BKAA 1S7YA 3C34A 3KOSA 1UTBB 1Q1KA 1QJMA 4BDMA 4EQ7A 1KWHA 1QUJA 3CFXA 3TEPA 1NNTA 3VLWA 3PGFA 4OMBA 5H8QB 4WEPA 4C1TA 3K6XA 3FXQA 4WKMA 4DIGA 2PT2A 2Q8JA 1JEUA 1B7UA 4L17A 2I4BA 4O3CA 1N04A 1OVBA 3IJOB 2UYFA 4MF3A 1B4HA 4TQUQ 5CMBA 3TTRA 3GXAA 1A7LA 2E1SA 2P0SA 4NF6B 1B9JA 5L9SA 2QMWA 5AA3A 3IO6A 4F3PA 5CI5A 5H8FB 4E0XA 5BUUA 3KFMA 1LBBA 5J1DA 2XX7A 1Y3PA 4IO6A 4R2FA 4F3SA 1SVXB 3A3UA 3TUSA 1DTZA 1N7XA 2HXWA 1BP5A 3C4MA 4TLLB 4U1OA 2DWIA 5TP9B 3U92A 3PUXE 4NEDA 1SBPA 1USYH 4KCCA 3PU5A 2A5TA 4G68B 1WVJA 2W7YA 2CZLA 4KYDA 3CIJA 2YPNA 4O3BA 2QJEA 1FQDA 2Z8DA 2REGA 2D3IA 4H8IA 2LAOA 2XXVA 1FQBA 1MDP1 1JW4A 2THIA 4K3FA 1B40A 2HAUA 1NNFA 5EHMA 1LSTA 4LQ2A 3N5LA 1MQJA 3K6VA 5CC2A 4DZ1A 3PMWA 2AIXA 1B52A 3IK6B 1NKXA 2QS1A 1D9YA 3LSWA 4GXAA 4C0RA 4G2ZA 2DE4A 1MQDA 3S9NC 1AIVA 4PETA 1SYIA 1VSOA 1H45A 1BIYA 2OBGA 5AA2D 3RY3A 2HZKA 3IL1B 4IGRA 3H6UA 4OESA 1MY4A 3GBAA 2HFBA 1T0KA 4EUOA 1VFEA 2VGQA 4O3AA 4FE8A 3TMGA 4ZZAA 1D4NA 1LAFE 2ZNUA 4F22A 4R9GA 4XIGQ 3TZAA 3TKDA 4GWOA 4JSDA 4ZEKA 2Z8EA 2DVCA 3UIFA 4ELQA 1M5EA 4NWCA 5TPAB 2XD3A 1I6BA 4FJPA 3N94A 1MQHA 4F19A 4FECA 2F97A 4P0GA 2F8DA 4GRKA 3MP1A 4ELPA 1YTVA 1LFHA 4PQJA 3IB2A 1SYHA 4EDPA 1OMPA 3FJMA 3W9WA 3V8XB 3K02A 4OWDA 2XD2A 2I49A 1MXXA 4R2BA 4GQOA 4QFKA 2D21A 1CE2A 1SW4A 4FIMA 2OK2A 5DVJA 3MPLA 2KLFA 1OQHA 2DP8A 3HV1A 4OFOA 1JVYA 1PBQA 2QS2A 1GGGA 5AE4A 4ZEDA 2O1MA 1AOVA 1IXIA 2AL5A 4YICA 1B5HA 4M1VA 4Z7EA 5JK4A 1FTJA 1B32A 4KR5A 4Q0CA 3M8UA 4AQ4A 3TTNA 5H8HB 4QFLA 1OIBA 3T96B 4G4PA 5I59B 4H67A 2GFEA 2X7QA 3QK6A 2Y7KA 1Y1MA 1QW0A 2XXWA 3BKIB 2ALUA 1D9VA 3LSFB 2Y84A 3MVYA 3RTWB 4GOTA 3V83A 5ICTA 1MXZA 3K1NA 4JWXA 2Z22A 1UTHA 1WODA 4F18A 1S50A 3N6UA 4BDOA 4I62A 4FEBA 1RKMA 4IY5A 1SI1A 3U72A 4R6HA 1TFAA 3TCHA 5A5XB 1ZBMA 1O64A 1MY0A 1FTKA 2E0SA 4X48A 3G7WA 1B2HA 5DVFA 4PFUA 2B65A 4HW8A 1MXUA 1Z7NE 3S4UA 2OLBA 1B46A 5AA1A 4GFRA 2ZNSA 1CB6A 3EHTA 1BTJA 2M8CA 5ISUA 3ILUB 3T9HB 3PUVE 3R6UA 4OENA 3KEIA 2Y7PA 2UVGA 4UA8A 3FZVA 3H06B 3T9UA 1ANFA 1XOCA 2CMOA 3RQTA 4QF9A 2F78A 3KZGA 2XXUA 3OSRA 3MVWA 2UYEA 1A54A 3WAFA 4RNSA 2Z8FA 2V3TA 3L6HA 3GLBA 4X9TA 2ZNTA 3O28A 5ICQA 3UORA 2RINA 2NXOA 3KG2A 1LFIA 1FW0A 1Q35A 2PVUA 3UA8A 3O6IA 2F36A 2I3VA 1TWYA 3CG3A 3I3VA 1R1NA 3BFTA 1IZ1A 4RPOA 1M5BA 4MH5A 3S9MC 1MQIA 3VFJA 3FJGA 4F29A 4LZ8A 4F3BA 3H6TA 3TAJA 3K4UA 3DP6A 4IB2A 4ESWA 3FATA 5KDTA 3IORA 3CR9A 4YB7A 3CFZA 1DPEA 3G3HA 1FQAA 4NF8A 4MLQA 4P11A 3H3GA 2F6GA 2X7PA 3KGCA 4H0WA 5DEXA 3CI8A 2ZYKA 3EPEA 1EZOA 4H1XA 3LUYA 1IIWA 1JVXA 1QKBA 3R26A 5I58A 2HAVA 3TTKA 2O51A 3KN3A 2QS4A 4KYEA 3RPWA 4IO5A 4F1YA 1LLSA 1NNPA 4R75A 4XKNA 4RYAA 1UTBA 3E13X 2RC8A 1II5A 3U94A 3K1PA 5DTBA 2HEUA 1IXGA 1IUDA 3HO7A 4R6KA 4FAJA 2DVZA 3THIA 1A8EA 2NVUB 2D5WA 3QYTA 4NF5B 4Q30B 5H8SA 3TCFA 5L9MA 1XT8A 5K2XA 1MG1A 3OO6A 5DVIA 2IA4A 3VXBA 3TCGA 3MJNA 1IQ7A 4IGTA 1H3DA 5FHMA 3DP8A 1FTMA 3QUFA 3T93B 4LZ5A 1AL3A 4GD5A 1LB8A 3PPQA 1JQFA 1L5TA 4HS7A 1SI0A 1A40A 4KCDA 2DWJA 3K2DA 2VHAA 1QUIA 3UP9A 3O6HA 3E9XA 5I84A 1B3LA 2QS3A 5L9OA 3VVDA 3BFUA 5TP9A 3MZ1A 1SDXA 4DXCA 3GBBA 4G68A 3TFLA 4YKPA 1UQWA 3VV5A 5FHOA 3GZGA 3O66A 1TXFA 4YMBA 1B51A 5F1QA 2B3BA 3S9EA 1EZ9A 2Q9TA 1A55A 3ONMA 3FXRA 1B5JA 1QKAA 2ESNA 3HHGA 4OVJA 1HSLA 1DMBA 2RC7A 1GTKA 2O1LA 4C1UA 3A3CA 3KSXA 5HM4B 4ND9A 3PPOA 3RGYA 5TU0A 1URSA 5HPQA 4R6YA 2A5TB 5JTYA 4EQBA 1DOTA 1MXWA 3IOUA 4DE8A 3C9HA 5KZTA 5IKBA 3G3FA 3T9VA 4BLAA 1HSJA 3TTMA 3AXFA 5EYFA 4PE5B 4OTEA 1OLAA 2XXHA 2NWJA 4RY1A 3SDFA 4DXBA 2O7IA 1P1NA 4XTCQ 2RKMA 3SERA 4ZZEA 1AH5A 2I3WA 1Z7ME 5I57A 5BWJA 1R9LA 1M5FA 5HBCA 4QHQA 4F2OA 3RT8A 4NWDA 2V84A 4ZECA 5IAIA 4GL0A 5AA4B 2UVIA 4N07A 1LGBC 1MM7A 4ZEIA 2XHDA 2A5SA 1B6HA 3LBSA 1Y4CA 2ONKE 4F3GA 1H76A 4F1UA 5JEIA 1B7HA 1JNFA 3FIRA 2NUVA 3C33A 3M3FA 2Y7RA 2O69A 3ZKKA 3UGWA 4UACA 5B70A 5KCJA 2DXYA 1QUKA 3DP4A 2Z23A 4POWA 3MZ9A 2Q89A 4QSCA 4U4XA 3OXNA 2B3FA 4NF4A 4LQ5A 3P7IA 2H9BA 3E4RA 1IEJA 4F39A 4IO4A 3CFLA 3PPRA 1N7WA 1ZTYA 1POY1 3PUZE 1B3GA 3EN3A 5ITOA 3B7DA 4G77A 4ONYA 5B7DA 3EQ1A 1DSNA 2RC9A 1P99A 1ZLQA 2AL4A 1IXHA 4P0IA 5AA2B 1QULA 1SW2A 3IB1A 5DYHA 5CMMA 3SEWA 3FV2A 2BJJX 3KJ7A 4ESXA 2QSXA 2DOJA 3FJ7A 3G3JA 3RTFB 3FXUA 3OEKA 4QFPA 4U2RA 3CVGA 2VOZA 1MH4A 3MC2A 4Q8RA 2V93A 3IJXB 4X1DA 4DLDA 3I5OA 4YU0A 4NTLA 4JSOA 3KJTA 4XKQA 2HCAA 3PUWE 1I69A 3H6WA 1XVXA 4HTGA 2RCBA 2DS9A 1VFDA 1FQEA 3M3KA 3QAXA 4QFOA 1N3XA 1LBCA 2XXPA 3TTLA 3HN0A 2DQVA 5FTIA 3LSLA 4LUBA 3PMVA 3EF7A 4OERA 4I1DA 1SQYA 1MS7A 1LAXA 1PEBA 4EF1A 3O29A 3S2VA 2ANJA 3Q29A 4RA1A 3TQWA 3B6QA 4RJZA 1NMUA 1S9TA 2ZYMA 4H5GA 4OZ9A 1UIVA 3UK4A 4Q5TA 1WDNA 4DCXA 1IXCA 4R73A 4U4SA 2Q88A 1LB9A 1URDA 2HQ0A 1FQFA 3C32A 1GR2A 1Y3QA 1B05A 4ZS9A 1FCKA 5CBRA 3T9XB 4ELRA 1PB9A 2V3QA 3OMBA 2DWHA 3DLNA 3ODBA 5F7VA 1YCJA 5I2KA 5I2NB 1D3KA 1ZU0A 2GH9A 3MVXA 1B5IA 3RLFE 1P1UA 4H65A 3Q26A 4LA9A 2PMSA 2ZYOA 1JEVA 4KI0E 3SESA 2H25A 3RNNA 3SETA 5I56B 2IEEA 1GV8A 4H5FA 4KYSA 2RCAA 5CMKA 3G3IA 4MBPA 1UIUA 1MDQA 2VD2A 3Q25A 5DT6A 3SEUA 2Q2AA 1LCFA 1Y1ZA 2G93A 4JBZA 1NNKA 2V25A 3FVNA 3G3KA 2DXRA 2FYIA 1PC3A 2Y7IA 1N76A 3K01A 5H8NA 1TFDA 3Q27A 4QSDA 2XXQA 5FTHA 4YMAA 2VP1A 3LSXA 4NE4A 3USDA 3DELB 2ZXTA 2GHAA 1MY2A 2DWAA 4G8HA 3MW0A 1B58A 4YB6A 4U21A 5KDTB 4NF8B 1FTOA 1MH3A 2Y7WA 2I0CA 3K1MA 4G8NA 1N3WA 4GXSB 4JWOA 5DEXB 4I8CA 2UXAA 3HSTA 3HCQA 1A8FA 4KQPA 1MM6A 1B3EA 1B1HA 1ZJLA 5H8QA 4OFLA 4EF2A 3JV9A 1SW5A 3FV1A 5LOMA 4WXJA 5L8DA 2O84X 4LONB 1P1WA 2QRYA 3VVFA 4QRZA 3H4ZA 4LZ7A 4DXUA 2XXTA 2X26A 3A09A 4KPTA 3O2AA 2H5YA 3T66A 2F35A 4NF6A 3H03A 5CMCA 2DSFA 2F34A 4JB7A 2Q2CA 1MXVA 4LATA 3ZS6A 1P1QA 1EZPA 4YKIA 3K6WA 3MBPA 3QUJA 4IY6A 3IO4A 1EH3A 5H8FA 4F1VA 1POTA 2O6AA 4PP0A 2QL3A 4AB5A 1MXYA 4KFQA 4KHZE 4QSEA 2FA7A 3UN6A 1ATGA 3O97A 4OXVA 1M5DA 4XKRA 2ABHA 3OO8A 1ELJA 2RF1A 2F5XA 2H99A 3PD8A 3C36A 3TQLA 2F7BA 4G8MA 1B0LA 2OCUA 2ZYNA 1Y9UA 1USYE 2XXIA 5CRYA 3CSBA 3W9VA 2I48A 3SEVA 1NL5A 3KOTA 4ELOA 1BLFA 4OQOA 4OHNA 1LCTA 3Q28A 2NOOA 3G3GA 3FVKA 3V5AA 3TYHA 2DE3A 1J1NA 2P2AA 4U23A 4BDQA 4I9DA 1ZIUA 2I6EA 4ZE8A 3VDFA 1B0HA 4RXLA 1XS5A 4YKKA 3SEYA 1RYXA 2QPQA 2YJPA 3E3KA 3L6GA 4R74A 1MRPA 2UVJA 3FGSA 5FHNA 3JZJA 3R7XA 3BBRA 4PFYA 4G68C 3U8QA 1ZKBA 2ONRA 1MPDA 1A99A 4HCWA 3PPPA 1Y4TA 3B6WA 3OO7A 5JTYB 3OEMA 1YPNA 3OO9A 1NH8A 3D4GA 3VXCA 2OWSA 3H7MA 3WAEA 4GF8A 1US5A 2XXXA 1PDAA 4QFNA 1URGA 5AA4A 3V89B 3U1OA 2F7CA 5TPAA 1H43A 3M3LA 3IB0A 3MQ9A 1B3HA 4TLMB 3PPNA 4ZE9A 1YAEA 1JW1A 4NMYA 3SKPA 1LFGA 2R9JA 3MP6A 4XXUA 2AYSA 4GVOA 1O63A 1FTLA 1VE4A 3MZBA 1MY3A 3KSJA 5M2VA 3FUZA 2PYYA 5I57B 3U93A 2OWTA 1PB7A 1OLCA 3S9LC 3CRBA 1IITA 3KN8A 4BDRA 3CG1A 2ZMBA 2REJA 3RT6B 4R72A 3ZSFA 4YKJA 5EHSA 2F7AA 3KBRA 5ITPA 4JXIA 3IX1A 4Z0IA 3IR1A 1O7TA 3OSQA 3HPIA 2I4CA 3RUMA 4YB5A 4IO2A 4IO3A 2GRVA 4RK9A 4M4GA 3T22A 5H8HA 2DE2A 4THIA 4U1ZA 5I59A 4HCYA 5CM6A 3JYRA 4JDFA 1LAHE 5AA2A 4U22A 5KCJB 3FASA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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