3THIA

Thiaminase i from bacillus thiaminolyticus
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
ITLKVAIYPYVPDPARFQAAVLDQWQRQEPGVKLEFTDWDSYSADPPDDLDVFVLDSIFLSHFVDAGYLLPFGSQDIDQAEDVLPFALQGAKRNGEVYGLPQILCTNLLFYRKGDLKIGQVDNIYELYKKIGTSHSEQIPPPQNKGLLINMAGGTTKASMYLEALIDVTGQYTEYDLLPPLDPLNDKVIRGLRLLINMAGEKPSQYVPEDGDAYVRASWFAQGSGRAFIGYSESMMRMGDYAEQVRFKPISSSAGQDIPLFYSDVVSVNSKTAHPELAKKLANVMASADTVEQALRPQADGQYPQYLLPARHQVYEALMQDYPIYSELAQIVNKPSNRVFRLGPEVRTWLKDAKQVLPEALG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thiaminase-I from Bacillus thiaminolyticus at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
molecule keywords PROTEIN (THIAMINASE I)
total genus 116
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 2.5.1.2: Thiamine pyridinylase.
pdb deposition date 1998-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3thiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3thiA02
1D3KA 3K02A 1MXWA 3RUMA 4ESWA 4Q5TA 4F2OA 1TFAA 3FJ7A 5IKBA 3ECRA 1JW4A 1N3XA 1ZLQA 2QS4A 4BDMA 4FEDA 2OK2A 2QS2A 4OMBA 3G3KA 1T0KA 4DIGA 3BFUA 2ZYNA 4FAJA 4LZ5A 1NH7A 3MAMA 1LLSA 1I6BA 1RKMA 1B3FA 3H6UA 3KEIA 1O63A 1MDQA 4E0WA 3O28A 1B32A 2XXUA 2UVHA 3TAJA 4N13A 4ELPA 4Q30B 1US5A 1JW5A 5I57A 1B2HA 2DE3A 1AMFA 3E13X 1JEVA 3T93B 5AE4A 1US4A 4WEPA 3M3LA 2RC9A 4ELRA 3PUZE 5L9SA 4ND9A 4H0WA 5TPAB 1D4NA 5DYHA 2VOZA 2H25A 1PC3A 4KYSA 4TLLB 1YPNA 1ZTYA 1SD3A 1IQ7A 1SW2A 3H7MA 4LONB 1DPEA 1SVXB 4QRZA 4H5GA 1A8FA 4R6KA 3QXMA 3FZVA 1B52A 1IIWA 1HSJA 5HM4B 3OEMA 2X7PA 1UTBB 3K4UA 4H5FA 2HQ0A 2HCAA 1SQYA 2XXRA 1Y3QA 3BBRA 3R7XA 3G3IA 1H44A 2F35A 3KJ7A 4XKRA 4NF4A 5DVFA 5K2YA 4Z7EA 3PUXE 3O6GA 2I58A 3E9XA 3C9HA 2NXOA 1AIVA 2GH9A 4X48A 2QRYA 2F97A 1N7XA 5CM6A 3B6QA 3QAXA 3LSXA 3IB1A 2XX7A 3PU5A 4GWOA 5IAIA 5I56A 2F8DA 4R6HA 4K3FA 3FIRA 3RY3A 4RY1A 4KPTA 4F29A 4L17A 5TP9A 4HW8A 4QSCA 2DWJA 2ZXTA 3PMWA 3Q26A 2VD2A 1MQHA 3LUYA 2REJA 3K6VA 4ZE8A 4LQ5A 3A09A 3V5AA 4WXJA 1ZU0A 2I0CA 2WKYA 3KFMA 1N84A 5F7VA 4U1OA 4I1DA 1F9BA 2M8CA 3IOUA 3IOWA 4H8IA 1P1OA 5FTIA 2OWSA 3A3UA 3K0VA 1POY1 4F2QA 1Z7ME 1FTKA 4R9FA 2F6PA 4FECA 4G4PA 5K2XA 3S2VA 3SEUA 1ELJA 1XC1A 1MY2A 4R6YA 2Y7KA 3FXRA 5AA4A 1II5A 1JETA 3KN8A 4PFTA 1B46A 1KWHA 4ONYA 5JEIA 2VP1A 4YB7A 4NF6B 5DEXA 3JZJA 1DSNA 1MXYA 3SEVA 4KYEA 4G8NA 2ALUA 4O3BA 3CFZA 3QUJA 1FQEA 4KYDA 3KSXA 1R6ZA 4M4GA 4QSDA 4ZZEA 2Y7RA 3TTMA 1Y20A 4H8JA 4F3GA 2RKMA 4OXVA 1DTGA 4C1TA 3RGYA 4G68A 1LAXA 4DCXA 2AL5A 3O6IA 1B58A 3FVNA 3TKDA 5L9MA 5HPQA 3S4UA 3FJGA 5A5XB 3TCHA 3SEWA 2QS3A 1FTJA 1POTA 2PBWA 2LAOA 1ANFA 3H4ZA 3WAEA 3FGSA 4OQOA 5I2NB 3OD7A 3KOTA 2DVZA 3OSQA 1Q35A 4X1BA 3L6GA 2R6GE 4QFOA 1NNFA 4FJPA 1QUIA 1A99A 1FTLA 4E0XA 1SYIA 1Y4TA 2XXHA 4EQBA 1OVTA 1MXZA 3KG2A 1GV8A 3ZS6A 1FQAA 3N6UA 2I48A 3T66A 3FD3A 3OMBA 2HFBA 1USYE 4THIA 1O7TA 4PFYA 2F7BA 1MRPA 3EPEA 5FTHA 4F1YA 1AOVA 1IXHA 3KN7A 4MLQA 3ONMA 2QL3A 1JEUA 3OO9A 3SEYA 2F7AA 5CMMA 3MQ9A 3DM0A 1UTBA 4BDRA 2FA7A 3IL1B 2YLNA 1N3WA 3MZBA 4IY6A 4PP0A 2DSFA 1PB8A 4U1ZA 1MPBA 4OEUA 4C0RA 4XKNA 4DLDA 4RK9A 2PX1A 1H43A 2DWIA 2O7UA 4XKPA 4R2FA 3U8QA 3TCFA 3C4MA 3CIJA 3FXUA 2O1MA 2B3BA 3N26A 1SI1A 2UYEA 4OWDA 1EU8A 1A55A 3C35A 2QMWA 2X26A 3TMGA 1M5EA 3UIFA 4QFPA 3EHUA 2V84A 1B4ZA 1N04A 2QJEA 3TODA 3OSRA 3FV2A 1IEJA 2O68A 2X7QA 4NF4B 1OQGA 4U22A 3MVZA 1SYHA 3CI8A 1URSA 3IK6B 4BDNA 5CBRA 3KZGA 4IO6A 5LOMA 1BIYA 4HTGA 2I49A 2Z22A 3IJXB 4R2BA 4U2RA 1SW5A 1PDAA 2RC7A 2B3FA 2DS9A 2NWJA 2CZLA 3PPQA 1B0LA 4QFLA 1NKXA 3DP6A 2O84X 4NF5B 4OVJA 2RC8A 2OZZA 2ANJA 2GHAA 3VDFA 2UVIA 3W15C 4XXUA 1S7YA 5M2VA 4NF6A 3RT6B 3RT8A 4G8MA 1Y3PA 4NEDA 3V83A 2I6EA 2ZYKA 5B70A 5I2KA 1B51A 2VHAA 1LAGE 4ISUA 2XXYA 3TTLA 1S9TA 1PB9A 4JWXA 4GVOA 4WKMA 2O51A 2RCAA 4N6PA 4AB6A 5A5XA 3BFTA 4FIMA 5I84A 2CMOA 3H6VA 1VSOA 4ZEKA 3P7IA 2H98A 2I4BA 4YB5A 4F3BA 5I2NA 4RNSA 4AQ4A 4JB7A 4G68B 4R73A 3G3GA 3EHSA 1VFEA 3KN3A 1Y4CA 3K01A 4UA8A 1BKAA 3MJNA 5CBSA 4F1VA 3E3KA 4DE8A 1MQGA 2R71A 3VV5A 4IY5A 4HS7A 5JTYB 4ZEFA 2GHBA 1GGGA 3UGWA 2O6AA 5I59B 3VVDA 4MBPA 1ZJLA 2HAUA 1O64A 4H1XA 1NMUA 3CVGA 4KCCA 4IO4A 3OENA 2XXWA 4M1VA 5JK4A 3RPWA 1IXGA 4NE4A 2QPQA 2QSXA 2NOOA 1R1NA 1XVYA 2DP8A 2V25A 2V3QA 3IAZA 1B4HA 4GLIA 3S9NC 3THIA 3RQTA 3G3JA 1USYH 4P0IA 1P1WA 3UP9A 1VR5A 4C1UA 1XT8A 3IB2A 2DVCA 1YCJA 5DTBA 3IR1A 2DQVA 3EF7A 4IB2A 1B5IA 4PFUA 3FXQA 2UYFA 3KOSA 3TTRA 4YMBA 4AB5A 5CMBA 2GRVA 2DYXA 4FE8A 2PYYA 4UACA 3SESA 4JXIA 1P1QA 2RINA 1B1XA 3IO4A 1B3LA 5HBCA 2AYSA 1OLCA 1JNFA 3UN6A 3T9VA 2D21A 1NNPA 3C36A 3TCGA 2DWHA 2ABHA 4LATA 2YPNA 1TWYA 3USDA 1MXUA 3U93A 4NF5A 2HXWA 3LC8A 5B7DA 3VFJA 3FASA 1N7WA 4IGRA 1URGA 3HHFA 1DOTA 3QUFA 2PVUA 4G68C 3N94A 2DXRA 1ZKBA 3MP1A 1MG1A 3QYTA 3H6TA 4RXLA 2NUVA 4R9GA 3CG3A 4ZS9A 1LB8A 4U23A 5CC2A 1H45A 3H03A 3VVEA 1B3HA 1B5HA 1UIVA 1P1NA 2QMXA 3TQLA 4F31B 2ZNSA 4OFLA 1QUJA 1LB9A 3VLVA 4HCYA 3ILTB 5AA2A 1MY3A 2D5WA 4LUBA 5I2KB 3PGFA 4FEBA 3CFXA 5CMKA 4FATA 1IITA 2Z8FA 3LSWA 4Z0IA 1GR2A 2V3UA 1MS7A 3S9EA 3UA8A 4EXLA 3MC2A 5L8DA 1CB6A 1A40A 4GFRA 2Z23A 3MVWA 2F36A 1HSLA 2A5SA 2Q2CA 2W7YA 3K2DA 4PQJA 5ISUA 3PMVA 4ZEDA 3V8XB 5JTYA 4KCDA 4ZDMA 4POXA 3C33A 1JVXA 4JBZA 5I59A 2OWTA 1MPCA 1URDA 3F11A 3OOAA 4NF8B 1LFGA 3G7WA 3V89B 4P0GA 4GXSB 2FNCA 3TDJA 2Y7IA 5BWJA 1OIBA 4TLMB 2THIA 1WVJA 4GOTA 3M8UA 1A8EA 1B7UA 1MQIA 2R9JA 3TYHA 3WAFA 4G2ZA 4LZ7A 3DP4A 3ZKKA 2P2AA 3U94A 3U72A 3VXCA 4I8CA 1N0TA 4F19A 3N6TA 5CMCA 3KSJA 4YKPA 3DLNA 3R6UA 3TPAA 2Y84A 4IO3A 1OMPA 3FVGA 4G8HA 4OEVA 2E1SA 1FQBA 3B6TA 4ESXA 1VFDA 4EF2A 1IUDA 5CRYA 4R74A 4TOZA 4OENA 4OFOA 1VE4A 4JWOA 3AXFA 3HN0A 5H8QA 1TFDA 4LQ2A 2ZYMA 3GLBA 3SEXA 1A54A 1AH5A 3ZKLA 1RYOA 3OXNA 1S50A 2XHDA 3VXBA 1ATGA 1Q1KA 2P1SA 2QS1A 1LGBC 3C32A 1M5BA 3E4RA 3N5LA 1TT1A 5ITOA 1LAHE 4YKKA 4JSDA 1LSTA 4EQ7A 3PPNA 4GD5A 2V93A 2IEEA 3IOTA 2ONRA 1JVYA 1FTOA 3VE1B 2IA4A 4G77A 5AA3A 3KJTA 4ZZAA 1PEBA 2G29A 1OLAA 4PETA 1B7ZA 3H06B 3TTNA 3R26A 4ZEBA 2V3TA 5H8NB 3O29A 3Q25A 3OO6A 2A5TA 1NH8A 3D4CA 1CE2A 1XVXA 4GXAA 1UTHB 1Y3NA 3IJOB 4F3PA 3C31A 3KGCA 3TELA 1FW0A 3T9HB 1MXXA 1FQDA 4U4XA 4TQUQ 4NWCA 2XXXA 4OERA 3RTFB 1MXVA 3S9MC 4PE5B 3MW0A 1Z7NE 4H6DA 1QKBA 5ICQA 2F5XA 4RYAA 3I5OA 3RTWB 3FVOA 3RNNA 5EYFA 4H65A 1MDP1 2XXIA 2UXAA 3MP8A 4GF8A 3MZ9A 1M5DA 4EUOA 1EZOA 3DELB 1DTZA 5AA2B 1BP5A 2ONKE 1B7HA 4NMYA 3HCQA 4QSEA 3B6WA 1XHYA 1A7LA 4BLAA 2I3VA 4NWDA 1SDXA 4DCYA 1M5CA 1LBBA 1LCTA 4NF8A 3L6HA 4OZ9A 2PMSA 1B1HA 3PD8A 4P11A 4H67A 2O69A 1EZPA 2XD3A 4ELOA 1H76A 4F1UA 4KI0E 4JDFA 3T9XB 1WDNA 3PUWE 2XX8A 3FUZA 3UORA 3D4GA 1NNTA 3FV1A 3KBRA 4YKJA 3IB0A 4EXKA 3TFLA 3C34A 5EHMA 5FHNA 4WEDA 1FCKA 5F1QA 4GIZA 1MY0A 5H8FB 1IXIA 1ZMGA 1OQHA 3ZSFA 1B3EA 1UQWA 3HHGA 2REGA 3PV0E 2GFEA 2DE2A 3CG1A 1MM7A 1B5JA 3CFLA 1BLFA 1ZIUA 3JV9A 4Q8RA 4F39A 1MH3A 3I6VA 4POWA 1D9VA 4XKQA 4DXBA 3K1MA 3OEKA 4JWYA 1MY1A 1PBQA 1Y1ZA 4XTCQ 5AA2D 5KDTA 1L5TA 1QJMA 5I58A 1LFHA 4N07A 4DXUA 2DWAA 3PD9A 1AL3A 1H3DA 3QSLA 3M3KA 4MF3A 5H8QB 1N76A 3A3CA 4FORA 2ESNA 3PUYE 4IO2A 2ZMBA 3G3HA 1B6HA 5H8HA 1MY4A 2F34A 1P99A 2ZNUA 3MBPA 3TUSA 1MH4A 3MPKA 4ZE9A 5BUUA 2XX9A 4ECFA 4EF1A 3QIMA 3OO8A 3K6UA 4R75A 5DVIA 4OFJA 1GVCA 2D3IA 5H8NA 3SKPA 1LBCA 4F3SA 3Q28A 4LVQA 3LSLA 2XXPA 3IO6A 1MQJA 1UTHA 3IOVA 4NTLA 2F7CA 4KD5A 4QFNA 3TTKA 4BDQA 1GTKA 1BTJA 1QULA 4RA1A 2Y7PA 5AA1A 2DXYA 3PUVE 2F6GA 3HO7A 4RK2A 4MLVA 4RPOA 3MVYA 1IZ1A 4QFKA 2RCBA 2A5TB 3LR1A 4QF9A 4ELQA 4ZECA 1FTMA 2HZLA 1DMBA 3GXAA 4XIGQ 3O66A 2ZNTA 1PB7A 3CR9A 4Q0CA 1SI0A 3G3FA 4IO5A 2AL4A 1ZBMA 4BDLA 2Y7WA 3U1OA 3CRBA 4O3AA 1QKAA 1JQFA 1YTVA 3DP8A 2RF1A 4KHZE 1YAEA 4X1DA 2Q89A 3GZGA 3EN3A 1B05A 2HEUA 3O6HA 2KLFA 2HAVA 2OBGA 3MPLA 4IO7A 3CSGA 2VGQA 5EHSA 5ELVA 5KCJB 3O2AA 3JYRA 1TXFA 1B40A 3TQWA 5DVJA 4DXCA 3MUQA 3TZAA 2Q88A 2P0SA 4LA9A 1Y1MA 4F22A 3CSBA 3M3FA 2O1LA 1DPPA 4YZZA 1M5FA 1HSEA 3H3GA 2I4CA 3B7DA 1EH3A 2H4IA 4ZEIA 1R9QA 4KQPA 1SW4A 1NFTA 3LSFB 4EDPA 5H8FA 2PT1A 4GL8A 3S9LC 3MZ1A 2ZYOA 2XXTA 2DE4A 1MPDA 4YKIA 2UVJA 3MWBA 1QW0A 4DDDA 4OTEA 5TPAA 3K6XA 3ODBA 2E0SA 1PBPA 3VLWA 3ILUB 3EQ1A 1Y9UA 3VLUA 1JW1A 1LFIA 4IGTA 1OVBA 4YB6A 3VVFA 4F18A 5I57B 2ONSA 2OLBA 3PPPA 4QHQA 3HV1A 2I3WA 3K1NA 2F78A 2Q9TA 1R9LA 4YICA 3IX1A 4LP2B 2O7IA 3HSTA 1LCFA 2Q8JA 4DZ1A 4U21A 2OJTA 2OCUA 1LAFE 3HPIA 3GBBA 1FQCA 2AIXA 1WODA 1XOCA 5FHOA 3FJMA 4X9TA 5ICTA 3W9WA 1P1UA 2BJJX 4KR5A 4GL0A 5L9OA 4YU0A 3I3VA 5CI5A 1MQDA 3O9PA 4JSOA 2XXQA 1B9JA 3SDFA 5KDTB 5I58B 2UVGA 4R72A 3K6WA 3SERA 1I69A 2XD2A 4MH5A 4I9DA 1B0HA 5DT6A 3T9UA 3PPRA 3BKIB 4O3CA 2NVUB 3H6WA 1J1NA 1XS5A 2H99A 3W9VA 3PMXA 1QUKA 1EZ9A 5H8HB 1SBPA 2YJPA 4GQOA 4YAHX 1SW1A 2H5YA 4LZ8A 5I56B 1NNKA 3MP6A 3RN8A 3LBSA 2HZKA 5TP9B 4YMAA 3GBAA 4BDOA 5J1DA 2XXVA 3QK6A 5ITPA 2Z8EA 3UK4A 5KZTA 2VD3A 2Z8DA 3FVKA 4RPNA 4OETA 4HCWA 2Q2AA 2FYIA 3RLFE 4EQ9A 1IXCA 3K00A 4OYVA 2DOJA 1NL5A 1RYXA 3U92A 2B65A 4GRKA 2G93A 3OO7A 1MM6A 3T22A 1I6AA 4KFQA 3IORA 4OESA 3O97A 3Q29A 1QVSA 1UIUA 5TU0A 4OHNA 4RJZA 1D9YA 3Q27A 5FHMA 3OELA 1B3GA 2H9BA 5AA4B 3MVXA 4MFIA 2PT2A 3T96B 5KCJA 4U4SA 3EHTA 4I62A 3SETA 1FQFA 2I0BA 3TEPA 5H8SA 3FATA 5DEXB 3K1PA 1I6QA 4PFWA 3PPOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D3KA 3K02A 3U65A 1MXWA 3E79A 3RUMA 4ESWA 4Q5TA 4F2OA 1TFAA 3FJ7A 5IKBA 3ECRA 1JW4A 4HE0A 1N3XA 1ZLQA 2QS4A 1NV1A 4PBHA 4BDMA 4FEDA 2OK2A 2QS2A 4OMBA 3G3KA 1T0KA 4DIGA 3BFUA 2ZYNA 1EYJA 4GWZA 4FAJA 4LZ5A 1NH7A 3MAMA 3MYUA 1LLSA 1I6BA 1RKMA 1B3FA 3H6UA 3KEIA 1O63A 1MDQA 4E0WA 3O28A 2VPOA 1B32A 2XXUA 2UVHA 4PTKA 3TAJA 4N13A 2L5VA 4ELPA 4Q30B 1US5A 1JW5A 5I57A 1B2HA 2DE3A 1AMFA 3E13X 1JEVA 3T93B 5AE4A 1US4A 4WEPA 3M3LA 2RC9A 4ELRA 3PUZE 5L9SA 4ND9A 4H0WA 5TPAB 1D4NA 5DYHA 2VOZA 2H25A 1PC3A 4KYSA 5A5LA 4TLLB 1YPNA 1ZTYA 1SD3A 1IQ7A 1SW2A 3H7MA 4LONB 1DPEA 1SVXB 4QRZA 4H5GA 1A8FA 4R6KA 3QXMA 3FZVA 4O94A 1B52A 1IIWA 1HSJA 5HM4B 3OEMA 2X7PA 1UTBB 3K4UA 4H5FA 2HQ0A 1IMCA 2HCAA 1SQYA 3T0JA 2XXRA 1Y3QA 3BBRA 4N81A 3G3IA 3R7XA 4GX4A 1H44A 1Q9DA 2F35A 3KJ7A 4XKRA 4OVTA 4NF4A 5DVFA 5K2YA 4Z7EA 3PUXE 3O6GA 2I58A 3E9XA 3C9HA 2NXOA 1AIVA 2GH9A 4X48A 2QRYA 2F97A 1N7XA 5CM6A 1K9YA 3B6QA 3QAXA 3LSXA 3IB1A 2XX7A 1FBPA 2ZZXA 2QFLA 3PU5A 4GWOA 1XI6A 5IAIA 5I56A 4HE1A 2F8DA 4P9KA 4R6HA 4K3FA 3FIRA 4NGUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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