3TQWA

Structure of a abc transporter, periplasmic substrate-binding protein from coxiella burnetii
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
237
structure length
235
Chain Sequence
MVRVGTIAGPETQLMEVAKQVALNRYGLHVNIITFSDYNTPNEALADGSVDANMFQHLPYLKAQIEMRGYKIVSIGKTFVYPMGLYSKKITALTQLKTGAKIAVPSDPSNEARALLLLEKAQLIQLKTHINATPMDIASNPKKLKIVELDAAQLSRSLGDVDLAAINTNYAIPAGLSPSRDALLTEGPNSPYANVVAVREDDKNDPRLKQLVSALHSPAVLSAAKKIFGDGAIPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural genomics for drug design against the pathogen Coxiella burnetii.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Coxiella burnetii
molecule keywords Methionine-binding protein
total genus 69
structure length 235
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tqwA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tqwA02
5ITOA 2OK2A 3QK6A 4POWA 1LFIA 2AYSA 2XXWA 4TLLB 3R26A 4R9GA 1XOCA 2DOJA 3FVKA 1JEUA 5AA3A 3AXFA 2WKYA 1MH3A 4H65A 3FVOA 3RQTA 4FIMA 1IEJA 3N26A 1LAHE 4LONB 3ILUB 4DXBA 1J1NA 4C1UA 3K1PA 4G8NA 1ZJLA 5L9MA 3O6GA 1B5JA 3DP6A 4DE8A 5FHOA 1RKMA 1T0KA 1B1XA 3BFUA 3HPIA 1JW5A 1VSOA 4PETA 4FORA 3OELA 4JSOA 1P1WA 3G3HA 3F11A 2OCUA 1VE4A 2QMXA 4NF6A 2O7UA 2XX9A 2E0SA 3H7MA 4RK2A 4TQUQ 2O68A 1BP5A 4DDDA 1A8FA 3IL1B 5H8NB 2HZLA 5H8HA 4LA9A 1FW0A 2IEEA 4BDNA 3MP6A 3BKIB 3LSXA 3OENA 3SERA 3IR1A 2H5YA 1B7ZA 2QMWA 2Q2CA 2DE4A 2VGQA 3PUXE 2Y7RA 3FJ7A 1WVJA 2XXPA 4LUBA 3UK4A 3RPWA 3D4GA 4M4GA 1USYH 4DLDA 5FHMA 3KSJA 3LSWA 4KQPA 3IB0A 4U4XA 4F3BA 1H43A 2PVUA 2OBGA 2ALUA 1IITA 3EHSA 1NNPA 2ZMBA 1Y3QA 2V3UA 4AB5A 3OOAA 2DWHA 4QRZA 3S9LC 4X48A 4EF2A 1LAXA 4GL0A 5ICTA 5KDTA 2PBWA 2XD3A 3G3KA 4QSCA 2H25A 3FVNA 3B7DA 3VFJA 4PQJA 2Z8EA 1DSNA 4YB6A 2M8CA 4ELPA 3A3UA 3FGSA 3VE1B 3L6HA 1MM7A 3GBAA 5EYFA 4WKMA 2VOZA 4O3CA 1H45A 3TTMA 2VD2A 3KOTA 1EZ9A 3HV1A 2XXHA 1LBBA 5AA2A 3FASA 1LLSA 3VVDA 1URSA 1OQHA 3PPNA 3LSFB 1GTKA 1M5EA 3KBRA 1NH7A 1Q35A 3CG3A 3H6UA 4F3GA 4JWXA 3RTWB 1LAGE 4ELOA 1FTMA 1I6AA 3V5AA 1SYHA 3ODBA 5HM4B 4HW8A 4OETA 3RN8A 1PEBA 2A5TA 3EPEA 4YKKA 5FTHA 2NWJA 3KFMA 3CG1A 1O63A 1FTKA 4R75A 3KN8A 3OEKA 2XXQA 2V3TA 4OTEA 3VVEA 4I1DA 3QUFA 3SEUA 3UN6A 3UP9A 1GGGA 2BJJX 2HAUA 4F1YA 4F29A 4N6PA 4RJZA 4NEDA 3CFZA 1MG1A 3EHUA 4MF3A 4PFTA 1Z7NE 4H5FA 3QYTA 1Y9UA 3MVWA 4IO2A 3MZ9A 3PD9A 3T9XB 3LBSA 3D4CA 1FTLA 3SEWA 4FECA 3K6XA 5I57A 5I2NA 1ZKBA 4FE8A 1USYE 4JWYA 1ZMGA 4GFRA 4NF6B 4IO3A 3OMBA 4ZS9A 1VR5A 3CIJA 3MP1A 3U94A 1A8EA 3MVXA 2REJA 5H8HB 1LB9A 2GFEA 2RC8A 1B4ZA 2ABHA 1B7HA 4GL8A 4NWCA 4JDFA 3IX1A 1TFAA 3KN7A 4YZZA 4U2RA 1Y3PA 2F7BA 1JW1A 1FQAA 1N84A 1Y20A 2DE3A 4XKRA 1A7LA 3V83A 4TOZA 2RINA 4ND9A 1POY1 4LZ8A 4RXLA 1LAFE 4R72A 4EUOA 2Z22A 3FD3A 3HN0A 2I3VA 3JYRA 4RYAA 1QUKA 1MH4A 2F5XA 2VP1A 1O64A 1AH5A 2HZKA 4IGTA 2HEUA 3CVGA 3ZKKA 4G8HA 3PUVE 2P0SA 4QHQA 4POXA 2V84A 2XXTA 4WEDA 1IXIA 1MQJA 4R6KA 1OVBA 1I6BA 4HTGA 4U4SA 4EXKA 5B7DA 5BUUA 1SVXB 5ITPA 1ZU0A 2X7PA 2AL5A 4BDMA 3O97A 5AA2B 1DPPA 3CI8A 1SW1A 2VHAA 3SEXA 3MUQA 1MQGA 4EQ9A 4IO7A 5K2XA 4IY5A 3TKDA 3IB1A 5TPAA 4H67A 2X7QA 1A54A 1FQCA 3DP8A 3M3FA 3MVZA 5K2YA 4ZEFA 4KHZE 3B6TA 2UYEA 4H1XA 2THIA 4GOTA 3MZBA 4OQOA 4KFQA 1ZLQA 3DELB 4OWDA 1M5FA 2F6GA 4JBZA 2UYFA 4L17A 2A5TB 3THIA 1MXYA 4GVOA 2NOOA 1NNTA 1MDQA 1LB8A 3TODA 1Y1ZA 5AA1A 3GLBA 3V8XB 3C9HA 5DTBA 1N7XA 1RYOA 4BDOA 3ZKLA 4P11A 4OMBA 4G77A 3UORA 1OLCA 1TXFA 3UIFA 2GH9A 1MPCA 4QFNA 3TAJA 4GXAA 3LUYA 4KCDA 1B3LA 4OEUA 4U1ZA 1P1QA 3U92A 4G2ZA 4QSDA 5DEXA 1O7TA 4KPTA 4THIA 2AL4A 4WXJA 3K6UA 2R71A 2Y7KA 1Y4TA 3MJNA 4OESA 4KYDA 3K6VA 5AA2D 5I57B 2QS3A 5I2NB 1SI1A 5BWJA 4E0XA 4DXUA 2XX8A 1MY0A 4KI0E 3S4UA 4GD5A 3T9VA 1IUDA 4YICA 1OQGA 5IKBA 3EF7A 4QFPA 3FVGA 4TLMB 4G68C 4FAJA 2RKMA 3RNNA 1NMUA 1JEVA 3CSGA 2XD2A 1P99A 2QSXA 1MQDA 3M8UA 4R6YA 4ZE8A 3U1OA 3A09A 4C0RA 3HSTA 3DP4A 3GBBA 4R2BA 4LZ5A 4MBPA 3O29A 1B3EA 4DZ1A 3G3FA 1YTVA 2DWAA 3SKPA 5I58A 1TFDA 4U21A 2XXXA 4RA1A 1A40A 3TQLA 1XHYA 1Z7ME 4G68B 2LAOA 2I49A 4Z7EA 2OWTA 4R2FA 1HSJA 2XXRA 4ELRA 4U23A 4BDRA 2HCAA 3TFLA 1AMFA 2YPNA 4DIGA 1VFDA 4ELQA 3C35A 4LP2B 3VXBA 1JQFA 1MPDA 2F6PA 1B4HA 3MQ9A 4MH5A 2DWIA 3RGYA 1FQDA 3KJ7A 3KN3A 1QUJA 1QULA 4I62A 3KG2A 3PUZE 4OEVA 3PPOA 2QJEA 3RT8A 1N0TA 1Q1KA 4ZEKA 1PB9A 5L9SA 2H98A 3IOTA 4I9DA 4OERA 2RCBA 2PT1A 3H03A 4YKIA 4GLIA 3SEYA 1B6HA 1NL5A 2B3BA 1BIYA 2I4CA 4YB5A 4BLAA 3PD8A 3IO4A 4OVJA 1ELJA 2ZNUA 2A5SA 3KOSA 4U22A 1CE2A 1MXUA 3PU5A 1N3XA 2UVGA 3FJMA 4LVQA 2FA7A 2DXRA 3H6VA 2PT2A 1QUIA 2P2AA 1A55A 5TPAB 5JTYA 2DQVA 2UXAA 4NMYA 3T22A 3TEPA 1LCFA 2P1SA 4KYSA 3ZSFA 4OYVA 3CFXA 4ZEBA 1GR2A 3G3GA 1Y1MA 4DCYA 4E0WA 3JV9A 4EF1A 4OHNA 3MC2A 2ONSA 4QSEA 4X1BA 3TCHA 3SEVA 1DTGA 4GF8A 4JWOA 5H8QB 4ESXA 3Q25A 5TU0A 1D4NA 3FXUA 1IIWA 1DTZA 3PPRA 5DT6A 5H8SA 5HBCA 1LFHA 1US4A 3IOWA 2VD3A 3H4ZA 3QAXA 3TCGA 1NH8A 5EHSA 4JXIA 3TUSA 1QKAA 4OFOA 1FQBA 4G4PA 3T9HB 3C4MA 5DEXB 4U1OA 4YU0A 4BDLA 1H3DA 2I0BA 1N76A 1B0HA 1R1NA 2RF1A 1R9LA 3TCFA 2ZNTA 4R9FA 3OXNA 2ZNSA 1LGBC 2I0CA 4IO4A 5TP9A 1XS5A 4O3BA 1LSTA 4XXUA 4IO6A 2I48A 1QKBA 4X1DA 1UIUA 2Z23A 3I5OA 4ONYA 3QXMA 1XT8A 2UVHA 5JEIA 2ESNA 2NVUB 3QIMA 2Q88A 4KD5A 3PGFA 4I8CA 4ZZEA 2OLBA 5I58B 3RUMA 5JK4A 3UA8A 4F3PA 1UTBA 2ZYKA 2F8DA 4IB2A 4JSDA 2UVJA 3B6WA 4EQ7A 2DSFA 1JVYA 4RK9A 1YPNA 4R74A 1M5DA 1SD3A 2RC7A 3Q26A 1MQHA 1MDP1 3KEIA 2UVIA 4Q0CA 3K2DA 1POTA 1DMBA 4GRKA 4G68A 3IO6A 2OJTA 4YMBA 2ANJA 3O28A 1JETA 5KCJA 2O51A 3RY3A 1WDNA 2QPQA 4F22A 5CRYA 3IK6B 1MXVA 2GHAA 3G3IA 2F34A 1FQFA 2OZZA 1UIVA 1MY1A 3BBRA 1XVXA 1F9BA 1B5HA 2O1MA 4Z0IA 2CZLA 3IOVA 1SYIA 4RNSA 4XKPA 3PMWA 3E13X 3FIRA 3OD7A 5I2KA 2Q89A 2Y7PA 5CMCA 3B6QA 4KR5A 5JTYB 3W15C 2REGA 5L9OA 4H8JA 1NNFA 1OLAA 3KSXA 5AA4A 1NNKA 3OO8A 1IZ1A 4KYEA 3WAEA 4LATA 3TTLA 3PMXA 4HCYA 4JB7A 1SQYA 1A99A 1P1OA 1SI0A 1IXGA 4R6HA 4EDPA 1QJMA 3H6WA 3JZJA 1D9YA 1OMPA 4ZEDA 3PV0E 3G7WA 4ZEIA 2QS2A 3MAMA 3T96B 1TT1A 3R7XA 1XVYA 1HSLA 5I56A 2H99A 2RCAA 2ZYOA 1II5A 1PBPA 1QW0A 1BKAA 5ICQA 3O66A 2V3QA 5LOMA 4XKQA 1H76A 4LZ7A 2DS9A 3S9NC 3M3KA 4YKJA 2NXOA 2GHBA 5H8QA 3IOUA 4P0IA 2Y84A 2F78A 4OENA 4ISUA 3K6WA 3W9VA 5KZTA 4RPOA 2V25A 3TZAA 5CM6A 3C31A 1FQEA 2O1LA 3S2VA 1WODA 2F36A 2XXUA 1B3GA 3HHGA 3IB2A 4UACA 3SESA 4GWOA 3PMVA 1R6ZA 1MM6A 2IA4A 3U8QA 1H44A 1AOVA 3E4RA 3K02A 5TP9B 1MXZA 3O9PA 2OWSA 4ESWA 1B46A 1N3WA 3K00A 5IAIA 1JW4A 3RLFE 3P7IA 3HHFA 2DXYA 3VDFA 4ZZAA 4OZ9A 1IQ7A 3RT6B 1MY3A 1EZOA 4YMAA 5FHNA 2O69A 2QS1A 5L8DA 4OFLA 4EQBA 1B3FA 4GQOA 1KWHA 3VLVA 3Q27A 4GXSB 1MRPA 4NF8A 5DVJA 4H0WA 1UTBB 4H8IA 2H4IA 1PB8A 4N07A 4F1VA 2O84X 3FZVA 1MPBA 5I59A 1N7WA 3EHTA 5A5XA 1MS7A 5CMMA 1LFGA 1MXXA 3PPQA 4YAHX 4F3SA 5FTIA 1PDAA 2E1SA 4N13A 4RPNA 4MLVA 5CBSA 1SBPA 3ECRA 1S50A 3L6GA 3CRBA 4Q30B 5KCJB 4QFOA 3TTKA 4G8MA 2V93A 1DOTA 4OFJA 2HXWA 1P1UA 2Z8FA 1UTHA 5B70A 4HCWA 1QVSA 1YAEA 3PPPA 4WEPA 2DYXA 1OIBA 4ZE9A 3CSBA 2DE2A 3KGCA 3VLWA 3PUWE 3SDFA 1P1NA 4PP0A 3EN3A 1URGA 1SW5A 3BFTA 1ATGA 4NE4A 1PBQA 3OO9A 3VLUA 1DPEA 5I2KB 2D3IA 2XX7A 3N94A 3USDA 3IJXB 3N6UA 1M5CA 3U93A 2I6EA 5AA4B 1FCKA 4IGRA 2Q8JA 2QRYA 1ZBMA 1GV8A 3V89B 3K1MA 3FV2A 4F39A 4H5GA 4F19A 3ONMA 4NTLA 3IAZA 1FTOA 1ZTYA 3H06B 1IXCA 3IORA 2DVCA 4FEDA 5DVIA 3VV5A 2Y7WA 3KZGA 1D3KA 4EXLA 2CMOA 4FJPA 4NF5A 1ZIUA 5I56B 3M3LA 2B3FA 1B32A 1PB7A 4K3FA 3OSRA 5HPQA 4FATA 3FJGA 5ELVA 1PC3A 4KCCA 4F18A 3HCQA 3FV1A 2XXYA 2Q9TA 3H6TA 3MWBA 3UGWA 1YCJA 1B58A 4NF4A 3N6TA 5AE4A 1SDXA 3HO7A 1MQIA 3FATA 1LBCA 5DYHA 1M5BA 1AL3A 2DWJA 2ONKE 3K01A 4YKPA 4PFYA 5I84A 3A3CA 2O7IA 1B05A 1NKXA 2YJPA 1S7YA 2Y7IA 1OVTA 3SETA 1LCTA 3KJTA 3QSLA 3R6UA 2O6AA 3K1NA 1IXHA 2QL3A 3K0VA 1SW2A 3TELA 2Q2AA 3MP8A 3TTRA 3T9UA 5H8FA 2HFBA 2R9JA 4OXVA 1B9JA 2Z8DA 1BTJA 3U72A 2I58A 1URDA 3E3KA 2ZXTA 4ZECA 1EU8A 3MW0A 2DP8A 2PYYA 3QUJA 5CMBA 3MZ1A 4P0GA 5M2VA 1BLFA 3C34A 4NF8B 1B1HA 4PFUA 4MLQA 4F2OA 3DLNA 2PMSA 3GZGA 4RY1A 3ILTB 5I59B 4DXCA 3CFLA 2B65A 2G29A 4IY6A 5ISUA 5A5XB 3LR1A 4AQ4A 3EQ1A 3FXQA 1MXWA 1EZPA 3O6IA 3IJOB 3O2AA 3DM0A 4M1VA 3O6HA 2I4BA 1B52A 3ZS6A 3T93B 4X9TA 3G3JA 1VFEA 3RTFB 1Y3NA 3C32A 5CBRA 1N04A 3MBPA 3C33A 1UTHB 3TMGA 3I3VA 4GIZA 1B40A 5DVFA 1B7UA 1JVXA 3TDJA 1CB6A 3VXCA 3E9XA 3GXAA 3C36A 2XXVA 2F97A 1B51A 4IO5A 3VVFA 2F35A 3OEMA 1US5A 3CR9A 1ANFA 2D5WA 5H8NA 3S9MC 1B5IA 3TQWA 2F7AA 1B2HA 1Y4CA 3TPAA 1NFTA 4XKNA 1AIVA 3T66A 1S9TA 3OSQA 4YB7A 4AB6A 3TYHA 4XTCQ 2XXIA 2X26A 2R6GE 2W7YA 3FUZA 5CI5A 3H3GA 1D9VA 1R9QA 2ZYMA 4HS7A 2FYIA 5KDTB 1JNFA 3N5LA 2ONRA 2RC9A 2XHDA 1HSEA 4FEBA 3I6VA 1I6QA 4NF5B 5EHMA 1B0LA 1MY4A 4XIGQ 4PFWA 4H6DA 4UA8A 2FNCA 3K4UA 3Q28A 5CMKA 3FXRA 4C1TA 3PUYE 2F7CA 1RYXA 3TTNA 1XC1A 3LC8A 3Q29A 4F1UA 4NF4B 2ZYNA 2GRVA 1UQWA 2HAVA 4NWDA 2NUVA 2PX1A 4Q8RA 3MVYA 4LQ2A 2YLNA 2QS4A 4QFKA 3WAFA 4LQ5A 1FTJA 5F1QA 4O3AA 1MY2A 1GVCA 3W9WA 3OO7A 4BDQA 5CC2A 4ECFA 4R73A 4MFIA 1SW4A 4QFLA 1L5TA 2H9BA 2DVZA 4F31B 4QF9A 2G93A 1EH3A 4Q5TA 5J1DA 5H8FB 3OO6A 3S9EA 4DCXA 1I69A 1B3HA 2HQ0A 3MPKA 4F2QA 5F7VA 3LSLA 4PE5B 2KLFA 1TWYA 3MPLA 2D21A 2I3WA 4ZDMA 2AIXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ITOA 2OK2A 3QK6A 4POWA 1LFIA 2AYSA 2XXWA 4TLLB 3R26A 4R9GA 1XOCA 2DOJA 3D1RA 2XA5A 3FVKA 1JEUA 4PAKA 4XEQA 5AA3A 3AXFA 2WKYA 1MH3A 4H65A 3FVOA 3RQTA 4FIMA 1IEJA 4O8MA 3N26A 1LAHE 4LONB 3ILUB 4DXBA 1J1NA 4C1UA 3K1PA 4G8NA 2WYPA 1ZJLA 5IZ3B 5L9MA 3O6GA 1B5JA 3LV0A 1SPIA 3DP6A 4DE8A 5FHOA 1RKMA 4IR8A 1T0KA 1B1XA 3BFUA 3HPIA 1JW5A 1VSOA 4PETA 4FORA 3OELA 4JSOA 1P1WA 3G3HA 2PFYA 3F11A 2OCUA 1VE4A 2QMXA 4NF6A 2O7UA 4XF5A 2KR0A 2XWIA 2XX9A 2E0SA 3H7MA 4RK2A 4TQUQ 2F3BA 2OX3A 2O68A 1FBFA 1BP5A 4DDDA 1A8FA 3IL1B 5H8NB 2HZLA 5H8HA 4LA9A 1FW0A 2IEEA 4BDNA 3MP6A 3BKIB 3LSXA 3OENA 3SERA 3IR1A 2H5YA 1B7ZA 2QMWA 2Q2CA 2DE4A 2VGQA 3PUXE 4JVIA 2Y7RA 4DI3D 3FJ7A 1WVJA 2XXPA 4I3EA 4LUBA 3UK4A 3RPWA 3D4GA 4M4GA 1USYH 5ESYA 4DLDA 5FHMA 3KSJA 3LSWA 4O7IA 4KQPA 3IB0A 4U4XA 4F3BA 1H43A 2PVUA 2OBGA 5EQ9A 2ALUA 1IITA 3EHSA 1NNPA 2ZMBA 1Y3QA 2V3UA 4AB5A 3OOAA 2DWHA 4QRZA 3S9LC 4X48A 4EF2A 1LAXA 4GL0A 5ICTA 5KDTA 3IFAA 2PBWA 2XD3A 3G3KA 4QSCA 1NUYA 2H25A 1EYIA 3FVNA 1RDYA 3B7DA 4P1EA 1NUXA 2F3DA 3KC0A 3VFJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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