3TTRA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with lidocaine at 2.27 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of C-lobe of bovine lactoferrin complexed with Lidocaine at 2.27 A resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttrA02
3K0VA 3H4ZA 4F1YA 1SW1A 4YB7A 3G3KA 2DWJA 1I69A 2PT1A 4ZE8A 2F5XA 4G8NA 4EF2A 1LAGE 4JSOA 2OWSA 2ZNSA 4H67A 3MVYA 1MQGA 3PMWA 5CMMA 5IKBA 3O66A 3C31A 1QVSA 3OO9A 2F34A 2WKYA 1S50A 1WVJA 4HCYA 3GZGA 4LP2B 4QHQA 1A54A 2I0BA 5AA2B 3EHUA 4H5FA 4P0IA 4GQOA 2GFEA 3MAMA 3FV1A 3MC2A 4L17A 4OVJA 4F2QA 3QUFA 1JW5A 4OETA 2DVCA 1N7XA 5CBRA 1MY0A 5M2VA 1JEVA 1LAHE 2VD2A 3H6VA 2UVJA 4IO6A 4FE8A 1UTBB 4IGRA 1II5A 4ND9A 3D4CA 2V84A 1GGGA 1LBBA 4NEDA 1Y3QA 2D21A 3FD3A 4F19A 2I4BA 5CM6A 2V3TA 2XXXA 1JVXA 2PBWA 5EHMA 1FCKA 4JWOA 2Y7RA 1H43A 1B3LA 4XTCQ 3E3KA 1FW0A 1BP5A 5AA2D 1H45A 5I57B 1LSTA 1IQ7A 3LBSA 3MJNA 3M3LA 4I62A 4DXCA 4GWOA 1WODA 1FTKA 1MG1A 3T9XB 3KN3A 1JW4A 3R26A 3H06B 5I2KB 3LSLA 4OFOA 1MY3A 3PUZE 3CFZA 4G68C 4AQ4A 3UK4A 4JXIA 3FVGA 3HCQA 2PT2A 1N84A 1NFTA 1TFAA 3RT8A 2RC8A 2E0SA 2O7IA 1ELJA 2DP8A 3EF7A 4GXSB 3TAJA 4QRZA 4JDFA 4ZEBA 5EHSA 3KEIA 2B65A 4FEDA 3EHSA 1NNPA 4G2ZA 4YMAA 3IOTA 3PPRA 2PX1A 4ZS9A 1PB7A 3TDJA 3HSTA 4X48A 3PUYE 1MQHA 1XT8A 3PPPA 4QFOA 1M5DA 3MZ1A 3QIMA 2M8CA 4F29A 1MDQA 3JYRA 4FATA 1VFEA 4NF8A 1AOVA 3S4UA 2UYEA 4O3BA 1URGA 2ONRA 2F6PA 3H3GA 3N5LA 2V3UA 1GR2A 4X1DA 2UVIA 2G29A 1POY1 4C1UA 4NF5A 1AIVA 2A5SA 4F39A 1EH3A 1BTJA 3O2AA 5L9OA 3PV0E 1P99A 3TQLA 4H5GA 4F3GA 1B52A 3IO6A 5DEXB 2XX7A 3O9PA 1MXXA 4U22A 1LFHA 4LATA 3CG3A 2XXPA 2NVUB 4ELPA 1ZJLA 5H8FB 4IO2A 4KHZE 1N76A 4BDMA 4HS7A 5AA2A 4I1DA 3VLUA 2V25A 1B5JA 3A09A 1B3HA 3MZBA 4XKQA 3SEUA 2XHDA 4RNSA 4R9GA 4F22A 2XXYA 1M5BA 2F7CA 4QSEA 3Q29A 4GD5A 4OEVA 1I6BA 1F9BA 2XX9A 2ZYMA 4R6KA 2ONKE 2ANJA 4XKRA 4U1ZA 1NNKA 2DQVA 4RK9A 3D4GA 3OENA 4PP0A 2QS2A 1FQCA 3VVDA 2F7BA 5I84A 2R9JA 4EF1A 3IAZA 4R2BA 5H8HA 3FVOA 4BDNA 2Q2CA 1B1XA 1Z7NE 2OBGA 1EU8A 4ZEDA 3U94A 1SW4A 1OLCA 3QUJA 4HW8A 3MPLA 3PPQA 2ALUA 2Q9TA 3H03A 1B46A 5IAIA 2XXQA 4POXA 2Y84A 3FJMA 1I6AA 1PC3A 5A5XB 5I2KA 3G3IA 1DMBA 2I6EA 2Z8EA 3IJOB 2YLNA 3GXAA 3QYTA 5L9SA 1O64A 3DELB 5JEIA 4QFKA 3TCFA 1J1NA 1A99A 1LCTA 1SQYA 2E1SA 3TKDA 3T66A 1YAEA 1MY1A 3VDFA 1O7TA 4RYAA 3RT6B 2V3QA 2GRVA 3W15C 1N0TA 1SBPA 3GLBA 3V89B 2DS9A 4YU0A 4NWDA 4ZZEA 2I58A 4Q0CA 1IITA 2B3BA 1Y1MA 1Y9UA 2I3VA 4EQBA 4IGTA 1XHYA 4NE4A 4OFJA 4EQ7A 1ZTYA 3QK6A 2DVZA 3KN8A 4QF9A 1P1UA 1P1NA 1PEBA 3IOVA 5B7DA 4OFLA 1SDXA 1GTKA 3RUMA 2NWJA 3N94A 1B3EA 1LB9A 5BWJA 1OIBA 5HBCA 3TPAA 3N26A 4X1BA 1R9QA 4NWCA 3T96B 4GL0A 1B9JA 3CIJA 3TTNA 1MPBA 3IORA 4U4XA 3FJGA 3R7XA 3MZ9A 5DEXA 4H1XA 4OWDA 1TXFA 4KPTA 4JSDA 3MWBA 1Y3PA 3LSFB 4TLLB 3SKPA 4H65A 3B7DA 3PU5A 3N6TA 4LZ8A 1SI1A 5DVIA 3HPIA 5H8FA 3B6QA 5JTYB 3CFLA 4EXLA 1DPEA 4RXLA 3RGYA 2THIA 3C36A 5FHOA 1B05A 4AB5A 2UXAA 5I56A 3FZVA 4ZEKA 4G4PA 3VV5A 5I58B 2AIXA 2REGA 2O84X 3OXNA 1ZMGA 1DTGA 1N3XA 2QJEA 3G3FA 1M5CA 3UIFA 3OEKA 4LONB 1PB9A 2X7PA 3K1PA 3LSWA 2HZLA 2DWHA 4JWYA 2GH9A 4YICA 1NNTA 4EQ9A 1S9TA 2I49A 5KDTB 2CZLA 5ISUA 3KSXA 5K2XA 2VD3A 4XKNA 2Q8JA 1FTMA 4MF3A 1ANFA 1NH7A 4GVOA 2FNCA 3OELA 4H8JA 2F36A 4MLVA 3H6UA 3FIRA 1QW0A 2H99A 4PQJA 2QRYA 4OHNA 4ZDMA 5CI5A 4O3CA 2O1LA 5CMCA 1LAXA 2PYYA 3CG1A 3RN8A 1N7WA 1P1WA 1LLSA 3U1OA 2DE2A 3OMBA 4DE8A 1A8FA 1IEJA 5I2NA 1B32A 1TWYA 1MM6A 1YCJA 3LC8A 3OEMA 1XC1A 3USDA 3C33A 1IZ1A 2XD3A 4NF4B 1OQGA 2PVUA 4LQ2A 1MH3A 2HCAA 1UTHA 4MLQA 2P0SA 3IX1A 3Q25A 2CMOA 4BDOA 2F7AA 4FEBA 4R74A 3O6IA 1JEUA 5FHMA 4OENA 3G7WA 2RCAA 4OZ9A 3PUVE 4RPNA 4N6PA 1O63A 5FHNA 2DXYA 4IO5A 1SW5A 4BDRA 2ESNA 4DIGA 1LGBC 1B5HA 3EN3A 5CMKA 2H5YA 3VVFA 1US5A 1XS5A 4EUOA 2RCBA 3EPEA 4R9FA 2Y7WA 4LZ5A 2D5WA 3TODA 1QUJA 2H25A 5TP9A 3GBAA 4ESXA 2XXVA 3HHFA 3MBPA 2DYXA 3O28A 2VHAA 4U23A 1ZLQA 1IXHA 2FYIA 3IB2A 4DCYA 3FASA 5J1DA 3O97A 4THIA 4ZZAA 4TQUQ 4N07A 3RPWA 4ESWA 3H6WA 3T9UA 3THIA 3TTMA 3RY3A 5FTIA 1TT1A 3T9VA 3C4MA 4GL8A 3AXFA 2HAVA 3U92A 3VLWA 3T93B 4NTLA 4U4SA 5CC2A 4X9TA 5JTYA 3OO7A 3VLVA 4NF6A 3OSRA 3MP6A 1OVTA 4G68B 1NNFA 1MXVA 4JB7A 1H3DA 4LVQA 1ZKBA 5I58A 4JWXA 3S9LC 2QMXA 3BFTA 3SEXA 3CVGA 5AA4B 1Y1ZA 5EYFA 2GHAA 2YJPA 3T9HB 2IA4A 4F3PA 4KCCA 5HPQA 2VOZA 3FGSA 4LZ7A 1GV8A 3K2DA 5KDTA 2R6GE 2DE4A 3MVXA 4HCWA 5TPAB 4IY5A 1M5FA 3BKIB 3H7MA 1Q1KA 2H9BA 2RF1A 3C35A 3M3FA 3LSXA 1UTBA 4OEUA 1AH5A 3K6XA 1XOCA 2Q89A 3L6GA 1M5EA 1B5IA 1XVXA 4OTEA 4N13A 3DP4A 2V93A 2DOJA 1OMPA 4IO4A 3RTFB 1MPCA 3V8XB 1FQFA 3MW0A 5KCJB 3KOSA 1MQJA 1B58A 3OD7A 3L6HA 4KYDA 5HM4B 1BLFA 3G3HA 3S2VA 3GBBA 3DP8A 3ILTB 4F3BA 4PFUA 4NF4A 3IOWA 4ZEIA 1YPNA 4FIMA 5I57A 3UA8A 4F1VA 1SW2A 3MP1A 4ECFA 3FJ7A 3FATA 5ITPA 3KSJA 1USYE 3LR1A 3MPKA 4KD5A 1MXWA 2ZYNA 4WEPA 5ICQA 1B3FA 1USYH 5CMBA 2Z23A 2QSXA 2FA7A 1PDAA 4OQOA 3W9VA 1BIYA 3OO6A 4QSCA 2IEEA 2QS1A 2XXRA 4QFPA 1UIUA 3TFLA 2GHBA 2XD2A 1A8EA 3C34A 3VFJA 1B0LA 1Y3NA 4PFWA 2HFBA 1DOTA 3PUXE 4KR5A 5FTHA 2D3IA 1QKAA 2RKMA 1ZU0A 3QSLA 1B3GA 1GVCA 3FVKA 3K00A 3WAEA 1IXCA 4YKIA 4FJPA 1N3WA 2W7YA 3R6UA 1B1HA 3ODBA 4MH5A 4PETA 4R2FA 4R75A 4H6DA 3MP8A 3LUYA 2XX8A 1B6HA 3ZSFA 3MVWA 4C1TA 4BLAA 3S9NC 4DDDA 1D9YA 3TELA 2NOOA 3CRBA 1NKXA 1MS7A 2XXIA 5AA1A 3DP6A 4RY1A 3KJTA 4ZECA 5ELVA 4XKPA 2F6GA 1Y4TA 3PMXA 4YB6A 3UP9A 4R6YA 4RA1A 4DXUA 3ILUB 1R9LA 3Q28A 4HTGA 4U21A 5DT6A 1SVXB 3Q26A 4KCDA 5AA4A 1IUDA 4ELOA 1QUIA 1DPPA 3OO8A 1JNFA 4F3SA 4FAJA 4RPOA 2ZYOA 2R71A 3ZKLA 1A40A 3U8QA 1D9VA 1MY4A 2QL3A 3FXUA 3SETA 2XXHA 4PE5B 1AMFA 3IOUA 4NF8B 4P0GA 3SESA 1QULA 1FQEA 1RYXA 4WXJA 3DM0A 4LUBA 3IR1A 4OYVA 4AB6A 3ECRA 3HN0A 3HV1A 4UA8A 1YTVA 5F7VA 4YKKA 4NF5B 1MXUA 2Y7IA 4KYEA 2HXWA 3RNNA 4IB2A 1H44A 2X7QA 1PB8A 1MXZA 3SEVA 3TEPA 3RQTA 1EZOA 3KGCA 3B6WA 2KLFA 1IXIA 3SEWA 1JETA 2DWIA 3E4RA 1QKBA 1VR5A 5KCJA 1POTA 1FTLA 2RINA 4I8CA 2QMWA 1JW1A 1LFGA 2Z8DA 2AL5A 5ITOA 1Y4CA 3KG2A 3V5AA 4C0RA 4ONYA 4QFLA 3FXQA 4U1OA 1MM7A 1PBPA 2F8DA 4BDQA 1MQIA 4YAHX 2AL4A 4F18A 4Z7EA 1LBCA 3SEYA 4FORA 1P1OA 5A5XA 3CR9A 1US4A 1T0KA 1N04A 4G8HA 1LB8A 2PMSA 2Z22A 4H8IA 4R6HA 1URSA 3DLNA 1NH8A 1VE4A 2I0CA 3ZS6A 4KYSA 4ELQA 2ONSA 3WAFA 5AE4A 2H4IA 4H0WA 4OMBA 3C32A 3HO7A 4E0WA 2O7UA 2DSFA 4ZEFA 2ZYKA 2QS4A 4ISUA 2OLBA 4E0XA 3TZAA 3P7IA 2ZNTA 3U93A 5H8HB 3O6GA 3OSQA 1NL5A 1OVBA 4R72A 4M1VA 3SERA 3VXCA 5DYHA 2O51A 2DE3A 3V83A 4DCXA 2O68A 2O69A 3E13X 4JBZA 3K1MA 4F2OA 4PFTA 5H8NB 3I6VA 3PMVA 3TTLA 1JVYA 1SI0A 2A5TB 3PUWE 2ZMBA 2HQ0A 3CSBA 1RYOA 1BKAA 3TYHA 2NXOA 1MDP1 3PD9A 1B7UA 4OXVA 4F1UA 1XVYA 1FQAA 1L5TA 2Q2AA 1D4NA 1LAFE 1EZPA 2OWTA 4POWA 3SDFA 2QPQA 4TOZA 4RJZA 3KZGA 4YMBA 3QXMA 3RLFE 1DSNA 2P2AA 3VVEA 3IL1B 5L9MA 3FUZA 1ATGA 4IO7A 5DTBA 1VFDA 2F97A 3PPOA 2ZXTA 2RC9A 3C9HA 1URDA 2DWAA 4LQ5A 4RK2A 5I59B 1DTZA 2OJTA 2HEUA 1MPDA 3IB1A 1OLAA 3EHTA 2YPNA 1OQHA 3KFMA 2Z8FA 2ABHA 4GXAA 3CSGA 1MQDA 3MUQA 5F1QA 3K4UA 4YKJA 4YB5A 3VE1B 5H8QB 4ELRA 1R1NA 1LCFA 1HSEA 1D3KA 5DVFA 2X26A 4GIZA 5CBSA 3MVZA 2UYFA 3K6VA 3PPNA 4LA9A 4Q8RA 3K02A 2LAOA 3KN7A 1UIVA 3UGWA 3PD8A 2VGQA 2VP1A 3CFXA 5B70A 2XXWA 4GOTA 3TQWA 1FQDA 1R6ZA 1Z7ME 5ICTA 3MQ9A 2HZKA 4DXBA 4EDPA 4PFYA 2AYSA 3IO4A 3G3JA 5H8SA 2F78A 3IK6B 3FV2A 2XXTA 1FTJA 3M8UA 2Y7PA 3K1NA 1RKMA 1MH4A 1B40A 4MFIA 4WKMA 1MRPA 3HHGA 1KWHA 4XIGQ 3KOTA 3KBRA 5I56B 1B7ZA 4F31B 3QAXA 4Z0IA 2O1MA 3S9EA 3Q27A 3CI8A 4U2RA 3RTWB 5DVJA 5CRYA 3A3UA 3O6HA 4I9DA 4BDLA 1ZIUA 3A3CA 3FXRA 4R73A 4KQPA 3UORA 3TTRA 1EZ9A 3ZKKA 2OCUA 3O29A 4UACA 4KFQA 4Q30B 4IO3A 3IB0A 1IIWA 5JK4A 2I48A 4ZE9A 2O6AA 2ZNUA 2I4CA 1Y20A 4OESA 1TFDA 3TUSA 3KJ7A 1A55A 1CB6A 5H8NA 2XXUA 1FQBA 3IJXB 3B6TA 2A5TA 3ONMA 3M3KA 1IXGA 4KI0E 4EXKA 1I6QA 1PBQA 1SYIA 3E9XA 4G8MA 5I2NB 2I3WA 1B51A 1Q35A 2RC7A 1JQFA 3I5OA 3VXBA 1MXYA 4DZ1A 4XXUA 3W9WA 1UQWA 4M4GA 1B4HA 5BUUA 3N6UA 3G3GA 4YKPA 4FECA 1HSLA 2B3FA 1UTHB 2OZZA 2QS3A 1CE2A 1P1QA 1AL3A 4OERA 2OK2A 1A7LA 2BJJX 5I59A 3S9MC 4GRKA 5AA3A 1B4ZA 4TLMB 4P11A 2DXRA 2NUVA 4O3AA 5LOMA 2UVGA 1LFIA 4GLIA 4IY6A 2Y7KA 3JV9A 1HSJA 3I3VA 2F35A 4Q5TA 4G68A 4QSDA 3TCGA 1SD3A 5H8QA 1S7YA 5TP9B 4WEDA 3OOAA 3K6WA 3K01A 5K2YA 1B2HA 4DLDA 5KZTA 2HAUA 2UVHA 2Q88A 5L8DA 2REJA 1FTOA 4GFRA 2H98A 1B7HA 5TU0A 1VSOA 3K6UA 3U72A 1ZBMA 1MY2A 3PGFA 4QFNA 3BFUA 3EQ1A 5TPAA 4MBPA 3T22A 2P1SA 3F11A 4K3FA 3H6TA 1NMUA 1SYHA 1QUKA 4NMYA 1H76A 3UN6A 3TMGA 3TCHA 1QJMA 3BBRA 4NF6B 3JZJA 2G93A 1B0HA 3TTKA 4YZZA 3FVNA 1WDNA 4GF8A 4G77A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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