3U1OA

Three dimensional structure of de novo designed cysteine esterase ech19, northeast structural genomics consortium target or49
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
411
structure length
411
Chain Sequence
GSHMEVNLRMSWWGGNGRHQVTLKALEEFHKQHPNINVKAEYTGWDGHLSRLTTQIAGGTEPDVMQTNWNWLPIFSKDGTGFYNLFSVKEQLDLAQFDPKELQQTTVNGKLNGIPISVTAMIFYFNDATWAKAGLEYPKTWDELLAAGKVFKEKLGDQYYPVVLCAGQTLVLIRSYMTQKYNIPTIDEANKKFAYSPEQWVEFFTMYKTMVDNHVMPSTKYYASFGKSNHYEMKPWINGEWAGTYMWNSTITKYSDNLTKPAKLVLGPYPMLPGAKDAGLFFLPAQMLSIGKSTKHPQESAMLINFLLNSKEGVEALGLERGVPLSATAVTQLRASGVIKDEDPSVAGLNMALELPHKMTTSPYFLDWQIWSLFLDAIQYIDYGQKTVQETAEYFNKQGDRILKRAMRGSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Computational design of catalytic dyads and oxyanion holes for ester hydrolysis.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Synthetic construct
molecule keywords De Novo design cysteine esterase ECH19
total genus 127
structure length 411
sequence length 411
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u1oA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u1oA02
4ZZEA 4Q8RA 3IK6B 1BIYA 4P0GA 1LB9A 2V25A 2PYYA 4F31B 1FQAA 1JEUA 5K2XA 3TQWA 3V8XB 3FVNA 1A7LA 3BBRA 1N3XA 3LSLA 1MY1A 2D21A 3FJ7A 2V3UA 3FZVA 2XXPA 1EH3A 3E9XA 2ZXTA 1OIBA 4OTEA 3ILUB 2V3QA 1LAGE 3VVEA 2PT2A 4POWA 3HV1A 2OZZA 1MQGA 3LC8A 2H5YA 1B4ZA 1URSA 3PMVA 1ZBMA 3I5OA 1XHYA 5CBRA 4GD5A 3K6WA 5KZTA 3OEKA 1LAXA 3ILTB 1HSEA 2DQVA 2CZLA 3IL1B 3MQ9A 1B0LA 3TCGA 2YPNA 1F9BA 3DP8A 3QIMA 3VFJA 1SDXA 2ZYOA 1JW1A 3VDFA 3VVDA 1P1NA 3SEYA 4RPNA 2GRVA 3OENA 4GWOA 2R71A 1NNTA 4KYSA 4JWXA 2DS9A 3LSWA 4F2OA 3P7IA 2NWJA 1ANFA 1IUDA 4XIGQ 1DPEA 2HZKA 1Y9UA 2F7AA 4QFPA 5DVIA 1A8FA 1XVYA 4DE8A 1Z7ME 1LB8A 2H98A 1A8EA 1II5A 4PP0A 3S9LC 4ZE8A 3OEMA 4H0WA 3O6HA 3ZKLA 3T22A 2ZYKA 4UACA 3S9NC 1AOVA 5H8SA 2VD3A 3H03A 3H4ZA 4R73A 1DPPA 4HTGA 1MH4A 1FTJA 2ZNUA 3FVGA 3O97A 2Q2AA 5I56A 1MM6A 3U72A 1TXFA 3TTRA 4Q0CA 3THIA 1ZKBA 2H99A 3H6WA 1N7WA 3HPIA 4RY1A 4IY6A 3MWBA 3OSQA 3IOVA 1ATGA 4BDMA 2Z22A 2YLNA 4NF4A 4IO7A 4N07A 3W9WA 1SYIA 1A99A 3UN6A 2XX9A 1VR5A 4HCWA 2YJPA 1O64A 2DWIA 5I57A 1PB7A 1ZLQA 3K1NA 3VVFA 1N76A 4O3BA 2DE4A 3KJ7A 2HZLA 3PD8A 3RLFE 3ZSFA 3IJOB 4GFRA 4G2ZA 2QL3A 2DE2A 1L5TA 3I6VA 5B7DA 4FECA 5L9MA 2B3FA 4F3PA 1P1OA 5FTIA 1MY0A 4WEDA 5I84A 2I58A 1OVBA 2QS3A 4H1XA 4QSEA 2DVCA 3GBAA 1MY4A 5I56B 3TYHA 2G93A 3V5AA 1B3GA 1B40A 4H65A 1MXXA 3OMBA 5CM6A 3SEVA 5F7VA 5EHSA 1QKBA 3MC2A 3IB0A 5EYFA 4F1VA 1LAFE 3M8UA 3PGFA 1B5IA 4OVJA 2D5WA 3CFLA 1M5BA 2Y7KA 3PUZE 4F1UA 3CFZA 1UIVA 4LQ2A 3CR9A 2PBWA 2W7YA 3B6QA 2G29A 1D4NA 3KG2A 4GLIA 4Z7EA 4ONYA 4C1TA 2UVIA 5ISUA 3T96B 1IXCA 2UVGA 3T93B 5TU0A 1B4HA 4THIA 4R2FA 4ELPA 5FHMA 4KYEA 2I0CA 4PETA 3Q25A 4XTCQ 3H6UA 4ZEIA 2HAUA 3LSFB 3O6IA 1MG1A 1EU8A 5DYHA 2PMSA 1N04A 1DSNA 1US4A 2XXQA 3T9HB 1LBCA 1H43A 4OQOA 2I3VA 2OJTA 4JSOA 2QSXA 4NE4A 1IXHA 1O7TA 4KI0E 4LZ5A 2NXOA 1P1QA 4JDFA 5H8QA 4R9FA 2XXHA 5CC2A 4TOZA 1D3KA 2O7IA 3SEXA 2I6EA 1B52A 4OFOA 4IY5A 2O69A 3TTKA 4KYDA 1FQFA 2LAOA 4X48A 4U23A 4EDPA 4RNSA 3VE1B 5EHMA 1I69A 4H67A 3A09A 1R9QA 4OWDA 2DXYA 4N6PA 1MQDA 1MXYA 4LZ7A 1OQHA 3CRBA 1LCTA 3G3FA 2XX8A 1YCJA 3PUXE 1MXWA 3RT6B 4Z0IA 3SESA 1FW0A 1WDNA 3HHFA 4XXUA 3KN8A 4OHNA 4R74A 4NTLA 3M3KA 1YAEA 3GXAA 2AL4A 2QRYA 5IAIA 3PPQA 5CMCA 2HFBA 4PFUA 4EXKA 3FASA 3KN3A 3K1PA 2GFEA 1XOCA 4X9TA 2A5TA 3JV9A 1MXZA 1NNPA 2A5SA 2E0SA 2P2AA 4IGTA 4YB7A 3QSLA 4LVQA 1IXGA 1TWYA 2HXWA 3FJGA 4JB7A 3MAMA 4YKPA 1JW5A 4GXAA 1LFGA 3PU5A 4ND9A 1N0TA 3IB1A 3QUJA 2DSFA 3PPNA 4U4XA 1JEVA 4DXUA 3HO7A 3TMGA 1DMBA 4G68A 3R6UA 4U1OA 3PUWE 2Y7IA 1ZIUA 2DWJA 1POTA 2GH9A 1YTVA 2R9JA 1N84A 4GF8A 3B7DA 3O6GA 2OLBA 4M4GA 2PT1A 4JWOA 4GIZA 4NWDA 1DTZA 1Y3PA 3U92A 1PDAA 1QULA 3K6VA 2F5XA 3OD7A 1MXUA 1MM7A 5DVFA 1BKAA 3EPEA 2A5TB 2H4IA 3SETA 3C31A 3O2AA 1NKXA 2QMXA 3U1OA 1RYOA 4MLVA 1Q1KA 3HSTA 2F36A 4R2BA 3UA8A 2ZNSA 4OENA 1A54A 2P0SA 1AH5A 2ZNTA 1GR2A 3IAZA 2UYEA 1Y3QA 4X1DA 1SD3A 3S2VA 3PV0E 1HSJA 2ANJA 4GQOA 4JBZA 3T9XB 2F7CA 1UTHB 3MVWA 4NF5A 3FUZA 4NF8A 5KDTA 3CVGA 2Q2CA 2Z23A 4AB5A 5IKBA 1OQGA 5A5XA 4G68B 1SI0A 1B0HA 2RC9A 3Q26A 1TFDA 1US5A 3PPOA 3TCFA 2QS2A 1GGGA 4YB5A 1DTGA 1MH3A 1IEJA 4G8NA 4YKJA 1YPNA 1JVXA 4YMBA 1QUJA 3M3LA 2XXTA 2Z8DA 1OVTA 3FIRA 2GHBA 3G3IA 2O51A 3FVOA 4DXBA 3JYRA 4ZEFA 4FJPA 1B7ZA 5I58A 3MPLA 2ESNA 4QSDA 4QRZA 2HCAA 5ELVA 4MBPA 4LA9A 3RN8A 2IEEA 3N26A 2VD2A 2RCBA 2ALUA 3HCQA 4BDOA 3DLNA 2UVJA 4YKKA 4ZE9A 1B05A 3LSXA 4F39A 3E4RA 4OETA 3H6VA 1B7HA 1OLAA 2OWTA 4ELOA 1N3WA 4F29A 4NF5B 1IITA 1JVYA 3S4UA 4NF8B 5DVJA 5KDTB 2ABHA 4EQBA 1USYE 4NWCA 1PEBA 3OELA 4YZZA 1TT1A 4ZDMA 1MDQA 4LUBA 3SEWA 4OMBA 3UK4A 1VFDA 3JZJA 5FTHA 2OK2A 1P1UA 3KN7A 4L17A 4YAHX 3TDJA 3T9VA 5BWJA 5H8FA 3MP6A 3U94A 5AA4A 1B58A 3MUQA 5H8HA 4EF2A 3USDA 3EN3A 4ZECA 3G7WA 4EQ9A 1B5JA 5ITOA 4R6KA 4OYVA 1OMPA 3QXMA 1UIUA 1M5CA 3CI8A 1Q35A 4O3CA 3N6TA 3K02A 3C9HA 2F35A 3MPKA 1J1NA 4YB6A 2DXRA 1ZJLA 4GRKA 4F18A 3IB2A 1LCFA 4NF6A 5L9SA 2O1LA 3SEUA 3K4UA 4YU0A 3H06B 3A3CA 4FEBA 1S7YA 4XKRA 1HSLA 1B3LA 4RK9A 3H7MA 4NF4B 4E0WA 3SERA 4EQ7A 2RKMA 3L6HA 5JK4A 3EHTA 3S9MC 2F6GA 4X1BA 3T9UA 5I57B 3QK6A 2XHDA 4H5FA 5H8FB 3K00A 3E13X 5AA4B 4IO2A 3PUVE 4WEPA 4PQJA 1SI1A 4QFNA 5H8HB 1QUKA 1Y3NA 3OO9A 5ICTA 3KFMA 1B2HA 4RXLA 3HHGA 4IO6A 4KCDA 1B6HA 1URGA 4JSDA 3WAFA 4LP2B 2FYIA 5I59A 4QFKA 4I1DA 1SW5A 1XVXA 4DDDA 4KD5A 4U2RA 2ONSA 2H9BA 1PB8A 2XD3A 3KBRA 4KHZE 3DP6A 4F19A 4FATA 4DIGA 3C33A 4R9GA 1SBPA 1NMUA 2XXRA 2F6PA 2X7PA 3VXBA 4YICA 4BDRA 4MFIA 3OXNA 2VGQA 3PMWA 4F22A 4G8HA 4DCYA 2VHAA 4JWYA 2I0BA 2FA7A 4QFOA 2O1MA 2RCAA 1EZPA 2Q89A 3CG1A 3KGCA 4F3GA 3V89B 3TKDA 3DELB 3VLVA 1B51A 4XKPA 3MP8A 3TUSA 4LATA 4RJZA 2QMWA 3RTFB 1A40A 3GLBA 3BFTA 1SYHA 1B1XA 2ONKE 4R6HA 1VSOA 3EHSA 1GV8A 1PBQA 4P0IA 4QHQA 3L6GA 5I59B 3ONMA 5FHNA 4C0RA 5I2NA 1Z7NE 3O9PA 4PFTA 3O28A 3C36A 2DVZA 3QAXA 3PPRA 5H8QB 1MQHA 1NH8A 4G77A 5DT6A 3IR1A 1AIVA 3FXQA 1NNKA 1SVXB 1MY3A 4MF3A 4UA8A 1I6QA 1KWHA 2E1SA 1S50A 5LOMA 4NMYA 4BDQA 3Q27A 1BP5A 2PVUA 5H8NA 4TLMB 3VV5A 1JETA 3K1MA 1Y4TA 3UP9A 1QW0A 3IOTA 2M8CA 1PBPA 1MS7A 4F2QA 3OO6A 3CSBA 3PPPA 2UXAA 3E3KA 4OEVA 3EQ1A 1UQWA 4AQ4A 3DM0A 3W15C 4H5GA 1LLSA 2Y7RA 3TZAA 1MPBA 2Q88A 4GOTA 4JXIA 4ZEBA 1SW4A 4FIMA 3FXUA 3B6WA 1IIWA 5AA3A 1IQ7A 1URDA 3K0VA 3FVKA 3G3JA 3FD3A 3TCHA 3HN0A 5L8DA 4H6DA 2NOOA 2OCUA 2REJA 4U1ZA 4AB6A 5I2NB 4FAJA 1B9JA 1EZOA 2DWAA 1SW1A 1GTKA 3F11A 5CRYA 2THIA 3S9EA 4U4SA 1B3FA 4LONB 2V84A 1Y1MA 1VE4A 1XS5A 2ZYNA 1ZTYA 3B6TA 3MVXA 4U22A 4R75A 3TTLA 4OFLA 1B3EA 3MZ1A 4OESA 1CE2A 1M5EA 1H44A 4YMAA 4WXJA 4DCXA 1LFIA 1TFAA 5I2KA 1B3HA 2QS4A 5F1QA 1RYXA 5DTBA 1QKAA 3EHUA 5H8NB 2F34A 3PD9A 2QJEA 2Z8FA 4LZ8A 2DOJA 2I4BA 3R7XA 1NNFA 4IO5A 1N7XA 2I3WA 2X7QA 4PE5B 1GVCA 4FE8A 1NH7A 4H8IA 4KR5A 2V93A 4ESWA 2XXUA 3Q28A 3IJXB 1R1NA 3G3GA 4EUOA 1MRPA 5CMBA 1AMFA 1WVJA 4ZS9A 5HPQA 3FV1A 1R6ZA 3IOUA 3OOAA 1LSTA 1H76A 1PB9A 4HS7A 1SQYA 2F97A 1FQCA 2VOZA 5AE4A 4R6YA 2P1SA 3KOTA 2O84X 2HAVA 1LAHE 1MXVA 1S9TA 1I6AA 3TEPA 1BLFA 3GBBA 1Y4CA 1XT8A 3KOSA 3QUFA 2ZMBA 2I4CA 1FTOA 2XXWA 4R72A 4OEUA 1H3DA 3N5LA 4KQPA 5JTYA 3UGWA 4ESXA 4HW8A 4I62A 1FTMA 4IO3A 1USYH 3LBSA 1Y1ZA 5I2KB 2Y7WA 1JW4A 1D9VA 3LUYA 2HQ0A 4IB2A 5KCJA 4U21A 1MY2A 4ELQA 4QFLA 3M3FA 1R9LA 4RYAA 4DZ1A 4EXLA 4IGRA 2O6AA 2H25A 1MPDA 4F1YA 5A5XB 3DP4A 4FORA 5HBCA 5AA1A 1FTKA 4GXSB 2ONRA 4TQUQ 4O3AA 1ELJA 5CBSA 2KLFA 3RTWB 4ZEKA 2OBGA 3N6UA 1CB6A 2XD2A 2RF1A 4ZZAA 3VLUA 5AA2D 1T0KA 3MW0A 4N13A 2V3TA 2OWSA 4P11A 2B65A 2AIXA 3U93A 4BDLA 3MZ9A 1POY1 3SKPA 1MPCA 1LBBA 5I58B 5L9OA 1FTLA 4EF1A 2I48A 2F7BA 3RY3A 3KZGA 1M5DA 4DLDA 1JNFA 3BFUA 4I9DA 4RK2A 2FNCA 1IXIA 4RPOA 2NVUB 2Q9TA 3TQLA 5JTYB 3FJMA 1D9YA 3Q29A 2WKYA 4G68C 4ECFA 3MZBA 5HM4B 4Q5TA 5KCJB 1MQIA 1DOTA 1QVSA 2O68A 4QSCA 3C4MA 1M5FA 3MBPA 4M1VA 4XKNA 4MH5A 1BTJA 3IORA 3O66A 4Q30B 3FXRA 5FHOA 2F8DA 2XXYA 3TODA 2O7UA 2X26A 3MVYA 5TPAA 3TTNA 4RA1A 5J1DA 1QUIA 1OLCA 3U8QA 3RQTA 4MLQA 3IO4A 3O29A 2XXIA 5M2VA 3TPAA 5CI5A 1FQBA 3CG3A 1ZMGA 2REGA 5AA2A 2DP8A 3IO6A 3H6TA 4ZEDA 4GL0A 2PX1A 3CFXA 3T66A 3CIJA 2VP1A 3RUMA 3UIFA 2B3BA 4H8JA 3C35A 4KCCA 2RC8A 2BJJX 3TAJA 3C32A 3OSRA 1QJMA 4F3SA 4NF6B 5JEIA 1SW2A 3K6UA 2Y84A 3PUYE 4G8MA 2D3IA 3FGSA 3CSGA 4K3FA 5TP9A 3MVZA 5DEXA 1NL5A 2GHAA 3R26A 4PFWA 2R6GE 2DWHA 3TTMA 3C34A 1MDP1 3H3GA 3UORA 4GL8A 4ELRA 5K2YA 3ECRA 2ZYMA 1FQEA 3V83A 5CMKA 3D4CA 3VLWA 4IO4A 2XXXA 5TPAB 4XKQA 1MQJA 3WAEA 3RNNA 1EZ9A 2Q8JA 3ZS6A 4BLAA 1JQFA 2RINA 2CMOA 1UTBA 5ICQA 1VFEA 4LQ5A 3MP1A 4POXA 3VXCA 5AA2B 3KSJA 3RGYA 3ODBA 3OO7A 1Y20A 2UYFA 4HCYA 3PMXA 1AL3A 3FV2A 3G3HA 3K6XA 3IOWA 1LFHA 4TLLB 1P1WA 4YKIA 3EF7A 2NUVA 3SDFA 1FCKA 3IX1A 2AYSA 4NEDA 3W9VA 5ITPA 1ZU0A 4I8CA 1B32A 3OO8A 2DYXA 2F78A 3LR1A 4DXCA 4KFQA 2UVHA 4E0XA 1NFTA 2XX7A 3QYTA 3KEIA 5TP9B 1RKMA 4GVOA 1FQDA 5DEXB 1B7UA 4FEDA 3G3KA 3D4GA 2QS1A 2I49A 4C1UA 1I6BA 1PC3A 4OXVA 4BDNA 4PFYA 1IZ1A 1H45A 3N94A 3RPWA 1B5HA 2DE3A 2AL5A 2HEUA 1WODA 3A3UA 3K2DA 2QPQA 4F3BA 1P99A 3MJNA 1LGBC 1UTHA 1A55A 4OERA 4OFJA 2Z8EA 5CMMA 3KJTA 2Y7PA 1UTBB 3K01A 1B46A 2XXVA 4WKMA 5B70A 4KPTA 3TELA 3I3VA 1O63A 3AXFA 3GZGA 2RC7A 4ISUA 3RT8A 4G4PA 2IA4A 1XC1A 3KSXA 3ZKKA 4OZ9A 1B1HA 3TFLA 5BUUA 3FATA 4QF9A 3BKIB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZZEA 5ET5A 4Q8RA 2B4LA 3IK6B 1BIYA 4P0GA 1LB9A 2V25A 2PYYA 4F31B 1FQAA 4PTKA 1JEUA 5K2XA 4I40A 3TQWA 3V8XB 3FBPA 3FVNA 1A7LA 3BBRA 1N3XA 3LSLA 1MY1A 2D21A 1NV6A 3FJ7A 2V3UA 4X8RA 3FZVA 2XXPA 1EH3A 2FBPA 3E9XA 2ZXTA 1OIBA 4OTEA 3ILUB 2V3QA 1LAGE 3VVEA 2PT2A 4POWA 3HV1A 2OZZA 1MQGA 3LC8A 2H5YA 1B4ZA 1URSA 3PMVA 1ZBMA 4PF6A 1QGXA 3FXBA 3I5OA 2VT5A 4O8MA 1XHYA 5CBRA 5IZ1A 4GD5A 3K6WA 5KZTA 4G61A 3OEKA 1LAXA 3ILTB 1HSEA 2DQVA 2CZLA 3IL1B 3MQ9A 1B0LA 2F3BA 3TCGA 4IR8A 2B4MA 2XWOA 2YPNA 1F9BA 3DP8A 3QIMA 3VFJA 1SDXA 2ZYOA 1JW1A 1JP4A 3VDFA 1P1NA 2PFYA 3SEYA 3VVDA 4RPNA 2GRVA 3OENA 4GWOA 2R71A 5EQ9A 1NNTA 4KYSA 4JWXA 2DS9A 3LSWA 1FTAA 4F2OA 3GYYA 3P7IA 2NWJA 3MSTA 1ANFA 1IUDA 5IZZA 4XIGQ 1DPEA 2HZKA 1Y9UA 2F7AA 4QFPA 4OVPA 5DVIA 1A8FA 1XVYA 5I3SA 4DE8A 1Z7ME 1LB8A 2H98A 1A8EA 1II5A 4PP0A 1LBVA 3B50A 3S9LC 4ZE8A 3OEMA 4H0WA 3O6HA 3T22A 3ZKLA 2ZYKA 4UACA 3S9NC 1AOVA 5H8SA 2VD3A 3H03A 3H4ZA 4R73A 4I3EA 1FJ6A 1DPPA 4HTGA 1MH4A 1FTJA 2ZNUA 4MMPA 3FVGA 3O97A 2Q2AA 5I56A 1MM6A 4OVTA 3U72A 3U65A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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