3U8QA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with phenyl-propanolamine at 1.97 a resolution
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Phenyl-Propanolamine at 1.97 A Resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 116
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u8qA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u8qA02
4LZ5A 4EQBA 2P2AA 5CI5A 4WEDA 3FATA 1M5DA 1YPNA 2XX8A 1B5HA 3K1PA 2X7QA 4BLAA 1B58A 2ZYMA 3CR9A 3MVZA 5M2VA 3K0VA 3TDJA 3O6GA 1PB8A 1LFGA 4L17A 3JZJA 3USDA 3FZVA 3VDFA 4POXA 3VXCA 4OEVA 2PVUA 1JNFA 1OVTA 4MLVA 3QAXA 1SVXB 2HQ0A 1SW5A 1A55A 2RC9A 5L9SA 1NNTA 2XXWA 4X1DA 5K2YA 2I4CA 1B3EA 1M5CA 3O66A 1Y1ZA 2I48A 2E1SA 4TLMB 4GRKA 2OZZA 3C34A 3KOSA 3MVXA 1MH3A 1ANFA 3IOWA 3BKIB 1NNFA 3HCQA 2Y7KA 2OK2A 2DXRA 3UIFA 4IO4A 5I56A 1USYH 2QRYA 4I8CA 1I69A 5H8NA 1JEUA 4ZE9A 5AA1A 3TQLA 5I2KA 4F39A 1QW0A 4PE5B 2ZYOA 1VFEA 2RF1A 2XXUA 5J1DA 3DM0A 1ZJLA 3FJGA 3CFLA 4UA8A 1R1NA 2FA7A 4JWYA 3H7MA 2V25A 3SERA 3TKDA 5CC2A 5CMBA 2QS2A 2Y84A 1USYE 2PMSA 4JSDA 4NTLA 4XKRA 1IZ1A 3EN3A 3UGWA 1P99A 3T66A 3O28A 1N3WA 1PDAA 3IAZA 3CI8A 4ECFA 1HSLA 1ZLQA 1BKAA 4ZEKA 4I1DA 4R2FA 4F3SA 1GTKA 3OO8A 3U72A 5H8NB 3K02A 4NF8A 5I2KB 3RNNA 2KLFA 2DWIA 2BJJX 2FYIA 2RCBA 1LLSA 4NF5A 1R9QA 2ZYNA 2F7AA 4OZ9A 4FEBA 3RT8A 3N94A 3PMWA 1KWHA 5EHSA 1XVXA 1LB8A 3G3KA 5H8QA 3FVNA 1Y3NA 2D3IA 5JK4A 3U93A 4KCCA 3KG2A 1B0LA 1BTJA 2GHBA 5CRYA 3VFJA 1YTVA 4EF2A 4TOZA 1YAEA 3ECRA 2O51A 3ZSFA 1O7TA 2THIA 4IO7A 3WAEA 4LVQA 4OTEA 1FQEA 5EHMA 3TMGA 4BDLA 3SEUA 1A54A 2ZMBA 2VHAA 4GWOA 2O68A 5ITOA 4NF5B 3SESA 4H6DA 3H4ZA 4DXBA 2PYYA 4GF8A 4ZEBA 3MBPA 3K6UA 3IOUA 2XD3A 4N07A 5H8QB 5AA4B 4QF9A 2NOOA 1R6ZA 1Y9UA 4JWXA 3GBAA 4P0IA 1LFHA 2RINA 1A7LA 1TXFA 4IO2A 5I58A 5ITPA 4OERA 1AMFA 3O2AA 5AA2A 1AH5A 2RCAA 4KPTA 4R9GA 3TTMA 1FCKA 1AL3A 2GFEA 5CM6A 1NL5A 1B40A 1B05A 4ZEFA 2G29A 1LAHE 3IO6A 2DSFA 4NMYA 1SI0A 2V84A 4GQOA 2PBWA 2YJPA 1A99A 2A5SA 1JQFA 2HAVA 4YKKA 2QPQA 3FGSA 3G3HA 3G3FA 3QIMA 4F19A 3GLBA 3K6XA 1R9LA 2V3TA 1QUJA 3E4RA 5FHOA 4HS7A 4XIGQ 3FV2A 1JW5A 2F7BA 3IL1B 3IK6B 3ZKLA 1SI1A 2I49A 2OWTA 4DCXA 3K2DA 4HW8A 2A5TA 1FQFA 1Y1MA 5I58B 5I2NA 3PUWE 3SDFA 3HN0A 3MQ9A 2Z8EA 2ZYKA 1VFDA 3UORA 2B65A 4KI0E 3E3KA 3SEWA 5JTYA 4RYAA 1B1XA 2HXWA 1B4ZA 2HZLA 3T22A 4ZZAA 2Q8JA 4H5FA 3FXRA 3FV1A 4DLDA 4N13A 1UIVA 3S9LC 1MXWA 1IQ7A 1IXGA 3HHGA 3PUYE 1MXVA 3CSBA 1POTA 5BWJA 3Q25A 1FQAA 3LUYA 3MP1A 1BIYA 2RC8A 1A8EA 1XS5A 4QFOA 3M8UA 5ICTA 3TUSA 5KCJA 3CVGA 5DEXA 3VLWA 4ESXA 3O6IA 2AYSA 2QS4A 2PT2A 1LBCA 4FATA 1FTOA 1WVJA 4FECA 4OHNA 5I2NB 1H43A 3E9XA 3MP6A 1DSNA 4F2OA 4KYSA 3W9VA 3SEYA 3TCGA 2F78A 5JTYB 3PPPA 3U8QA 5HBCA 5H8FA 3IX1A 3JV9A 3IR1A 3GBBA 5I59A 4PFWA 3B6TA 4LONB 4F29A 3KBRA 4U2RA 2XX9A 1JETA 1MQDA 2HEUA 3DLNA 3K1MA 3VLVA 1MY0A 3S4UA 3FXQA 3VLUA 1H44A 3OEKA 1B3HA 2Y7PA 1Q35A 5DEXB 1NH8A 2AIXA 3ILTB 4EXKA 1FTMA 3FASA 3MP8A 1EH3A 1B2HA 4ONYA 4F3PA 2HFBA 2DE2A 3IJOB 4F1VA 1LBBA 5H8FB 4OETA 4KHZE 4MH5A 5H8SA 2DS9A 2NWJA 3MVYA 2OJTA 1GVCA 3ILUB 2ALUA 4NF4A 2ANJA 2UYEA 3LSLA 4FJPA 3N26A 2DQVA 4KCDA 1DTGA 3N6UA 4DXCA 4AQ4A 4EDPA 1B4HA 2O84X 3UP9A 2I3WA 1MS7A 1T0KA 3FVGA 3R6UA 1MDP1 4R2BA 1H76A 2NUVA 2XXTA 4M1VA 3T9VA 5FTHA 1B5IA 3PUXE 1HSEA 3MW0A 3EHTA 5ICQA 1YCJA 1MY1A 4ZZEA 2HCAA 1EU8A 5CMCA 4DCYA 4O3AA 4H65A 3H6VA 4YB7A 1SBPA 4JWOA 4IO3A 4F2QA 3RY3A 4ZE8A 1LAFE 1RYOA 4MF3A 1XVYA 3DP8A 3OSRA 3TCHA 3MZ1A 4OESA 2B3FA 1B52A 2F36A 3QUFA 4IB2A 5A5XB 4IGRA 1FTKA 1IXIA 3B6QA 2UYFA 3BFTA 4Q30B 1D9VA 2F5XA 1NH7A 2ONRA 1N0TA 4QSDA 5HPQA 4OFJA 3H3GA 3H6WA 1VE4A 3PPNA 1QJMA 1B7UA 4YKPA 3RTFB 4YB6A 4TQUQ 2HZKA 2IEEA 2V93A 4KYEA 2XXXA 2O1MA 2REJA 2H98A 3O29A 4HCWA 3QSLA 4PFYA 2XXVA 3A09A 1SW2A 4YAHX 3PUVE 3KN7A 1FQDA 3B6WA 2VOZA 1Y4CA 1MM7A 2XD2A 4NWDA 3IB2A 3S9EA 1MY3A 1O63A 4OFLA 2VGQA 3TTRA 3RLFE 4GL8A 3M3KA 1MPBA 4FAJA 4DXUA 1MQJA 4YB5A 1SW1A 1ATGA 4NWCA 1MM6A 4UACA 5L9OA 2YPNA 5K2XA 4QFPA 1B32A 1URDA 5FHNA 3G3GA 5I56B 4R74A 4O3CA 3OMBA 4YU0A 1OQHA 2Q2AA 5DYHA 1QULA 4X1BA 3TAJA 5CMKA 1F9BA 3OO9A 3QK6A 3OELA 2H99A 2Q89A 4Z7EA 3H6TA 3IJXB 2XHDA 2DXYA 3EQ1A 2F34A 3CIJA 4LA9A 1US5A 3UK4A 5KZTA 3I6VA 4RK2A 3HSTA 3CFXA 1S9TA 2O69A 4GIZA 3O97A 1JW1A 1B3LA 3SEVA 4KQPA 4RNSA 4OQOA 4OYVA 3TZAA 1PB9A 4BDNA 3T9UA 1EZOA 1MRPA 3FIRA 1QUKA 3FJMA 3U94A 2O7IA 3MVWA 4MFIA 1MY4A 4NF8B 2GH9A 1UQWA 4YZZA 1URGA 2LAOA 2PT1A 2UVJA 3M3FA 1WDNA 4Q8RA 5L9MA 3PD9A 4I62A 4P0GA 3RGYA 3VV5A 1MXUA 2ONKE 3CG1A 2OCUA 1WODA 4LQ5A 4XKQA 4OMBA 1D3KA 1N7XA 4DDDA 4HCYA 2I0BA 1M5BA 3OEMA 4YKJA 3V5AA 2XXYA 4U4XA 4U22A 5DVIA 1J1NA 1GGGA 3I3VA 1Y4TA 2ZNUA 2V3UA 4XKPA 3FXUA 4HTGA 2B3BA 4DZ1A 1I6BA 4QHQA 3L6HA 3SETA 3BBRA 1MXYA 4E0XA 4MLQA 3PV0E 1PEBA 5TPAA 4F3GA 1AOVA 2AL4A 3IB0A 5IAIA 3TODA 2DYXA 3MAMA 1FTLA 3N6TA 2CZLA 3TEPA 1OVBA 3T9XB 1LB9A 4LZ8A 3I5OA 4XTCQ 2OBGA 1Q1KA 2RKMA 3MZ9A 1LAXA 2P1SA 1MXXA 4ELQA 1ZMGA 2OLBA 1GV8A 2R71A 2UVGA 3PUZE 4FE8A 1LSTA 2DWAA 3C9HA 3H6UA 1PBPA 4YKIA 1OQGA 5LOMA 2DP8A 1N04A 1JVYA 1TT1A 5AA2B 4I9DA 3MWBA 1BP5A 4ZS9A 4H67A 1MG1A 3DELB 3ZKKA 3T96B 1RYXA 3C31A 5TPAB 3AXFA 1SD3A 2Y7WA 3P7IA 2O7UA 2H9BA 1TFAA 1RKMA 1PC3A 1TFDA 3MPLA 3TPAA 4GL0A 1B3FA 1N7WA 1MXZA 3B7DA 4KYDA 3LSWA 3KEIA 3RUMA 2X7PA 3G3IA 4G4PA 1UTHA 5KDTA 3OSQA 2A5TB 2QSXA 3EHUA 3WAFA 4G77A 4THIA 4ELOA 5ELVA 4PFTA 4P11A 3CFZA 2O6AA 3IOTA 2W7YA 1A40A 2FNCA 1DPEA 1ZKBA 2DVCA 4X48A 3GXAA 2YLNA 2XXRA 5DVFA 1P1QA 3D4GA 3QXMA 5HM4B 2XXHA 4H8JA 1H3DA 1MY2A 2F6PA 1SW4A 4OEUA 4GXAA 4X9TA 4R6HA 2H4IA 2ZXTA 4RA1A 1QUIA 3CRBA 3G7WA 3LC8A 3L6GA 3IO4A 4H1XA 5KCJB 2I0CA 2XXPA 1DMBA 3RN8A 3IOVA 1UTHB 4ZEDA 5KDTB 1FQCA 3DP4A 2OWSA 3KSJA 5FTIA 1DTZA 1B51A 3MUQA 2F35A 3K6VA 1AIVA 1B5JA 1I6QA 2D5WA 1EZ9A 1XT8A 1CE2A 1B46A 4R6YA 3PMVA 2V3QA 5B7DA 3VVDA 1SQYA 5CBRA 1II5A 3UA8A 4ELRA 3TELA 4R72A 1NFTA 1NMUA 5CBSA 4C0RA 4EQ9A 5I59B 4LZ7A 3QUJA 4IGTA 4GD5A 3E13X 3FUZA 3S9NC 2Q88A 3DP6A 2NXOA 3OD7A 3VVFA 4N6PA 3BFUA 4FEDA 4U1OA 1IXHA 1ELJA 3D4CA 4OWDA 4JSOA 2XX7A 3H03A 3MJNA 1Z7NE 5IKBA 1VR5A 5TP9A 4POWA 4JBZA 1N3XA 4C1UA 2X26A 2DWHA 4YMBA 3OENA 4WKMA 1MH4A 1DOTA 5DTBA 3PMXA 1UTBA 4AB6A 2QS3A 4MBPA 4BDMA 4TLLB 4JXIA 4O3BA 3KSXA 5EYFA 4G8HA 1MQGA 1URSA 3S9MC 4NF4B 4XKNA 1H45A 3QYTA 3UN6A 3THIA 4FORA 4WXJA 4KD5A 2F6GA 2QMWA 1B0HA 1NNKA 5DT6A 4QFKA 3K4UA 3FVOA 3FD3A 1VSOA 2CMOA 3PPOA 2F97A 3FJ7A 1QKBA 5TP9B 1Y3PA 3HPIA 3OO7A 4LATA 4OVJA 1LGBC 1S50A 3V8XB 1DPPA 1UTBB 1MPDA 3FVKA 1XOCA 1Y3QA 3TQWA 4F1UA 4QSEA 1A8FA 2ZNTA 1NNPA 3SKPA 1JEVA 2UVIA 2VP1A 4BDOA 1D4NA 4C1TA 4RPNA 4U23A 1PBQA 3KFMA 3R7XA 2I3VA 4U21A 4R73A 3U1OA 1LCFA 3HHFA 2H5YA 3A3UA 4QSCA 2R6GE 4ZECA 5H8HA 3KZGA 3KN8A 5I57A 2Z8FA 3KOTA 3CSGA 1SDXA 3OOAA 4GFRA 4EQ7A 2ONSA 4GXSB 3TFLA 3VE1B 4K3FA 2UVHA 3MPKA 2I58A 4F18A 4NF6A 4YMAA 4QRZA 5B70A 1GR2A 4RXLA 4G68A 3F11A 2GRVA 2XXQA 1MQHA 3W15C 1JW4A 3OO6A 4H8IA 4OFOA 4XXUA 3KJTA 1I6AA 3ZS6A 3K1NA 3LBSA 4Q5TA 1OLAA 5H8HB 1LAGE 4RY1A 1IUDA 4PQJA 5I84A 3V83A 5AA4A 3MC2A 3PD8A 5I57B 1XC1A 1QKAA 3PPRA 4F22A 1B6HA 2DVZA 2Z8DA 3ODBA 2QS1A 3KN3A 2GHAA 4RJZA 4U4SA 1P1UA 1BLFA 3TCFA 1MPCA 4NF6B 1JVXA 2RC7A 3RTWB 4G68B 2F8DA 1OMPA 3PPQA 1P1NA 1PB7A 4IO6A 4R75A 1ZBMA 2UXAA 4JB7A 4G2ZA 2Z23A 4EXLA 3OXNA 2I4BA 2DWJA 4IY6A 2QL3A 3ONMA 4H5GA 2Y7RA 1OIBA 2NVUB 1ZTYA 3T93B 3Q26A 3GZGA 4GLIA 4GVOA 1CB6A 2XXIA 3PGFA 3EPEA 2Z22A 2F7CA 1P1OA 3CG3A 4ISUA 1NKXA 4R6KA 3TYHA 1MQIA 1HSJA 4G68C 4ZEIA 4LP2B 3K6WA 3MZBA 2O1LA 3C36A 4Z0IA 1LFIA 1QVSA 1B9JA 3RQTA 3TTNA 1UIUA 1M5FA 4NEDA 2Q9TA 4BDRA 1L5TA 1IEJA 3C35A 4BDQA 2DOJA 5FHMA 4GOTA 4KR5A 3KJ7A 1B3GA 2VD3A 2P0SA 2M8CA 4F3BA 3Q27A 4PETA 4Q0CA 2Q2CA 1US4A 4OXVA 2WKYA 2I6EA 4F31B 5F1QA 3EHSA 4RK9A 2E0SA 4EF1A 1B1HA 4AB5A 4OENA 4R9FA 3RT6B 4NE4A 1OLCA 3JYRA 4FIMA 5AE4A 3HO7A 3VVEA 3TTKA 4G8NA 1POY1 4IY5A 2ESNA 3H06B 3Q29A 4H0WA 1XHYA 1O64A 4ESWA 1FQBA 5AA2D 2ABHA 3EF7A 3K01A 4PP0A 1IIWA 1M5EA 4KFQA 3W9WA 2PX1A 3U92A 3O6HA 3G3JA 5ISUA 2DE3A 5CMMA 4F1YA 3HV1A 3S2VA 2QMXA 1ZU0A 1B7ZA 4WEPA 3IB1A 1D9YA 3M3LA 2G93A 1FTJA 2Y7IA 4YICA 1MDQA 1N84A 1SYIA 2DE4A 3LR1A 4ND9A 1B7HA 1SYHA 2HAUA 2D21A 4LUBA 4ZDMA 2VD2A 4ELPA 5JEIA 1ZIUA 4JDFA 1TWYA 5AA3A 1IXCA 3PU5A 4QFLA 4M4GA 3C32A 1EZPA 3VXBA 1Y20A 1IITA 1N76A 5F7VA 1LCTA 4EUOA 4IO5A 4DIGA 3SEXA 1P1WA 3R26A 4G8MA 4LQ2A 3K00A 4E0WA 4QFNA 3LSXA 4RPOA 5BUUA 3A3CA 3LSFB 3O9PA 1FW0A 3Q28A 2AL5A 3C33A 3T9HB 1S7YA 5DVJA 2REGA 3N5LA 2ZNSA 4DE8A 3KGCA 3IORA 5TU0A 2IA4A 3C4MA 3TTLA 1Z7ME 3RPWA 3V89B 5A5XA 2R9JA 5L8DA 2H25A 2QJEA 4PFUA 4U1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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