3U94A

Crystal structure of the gluk3 ligand binding domain complex with glutamate and zinc: p21212 form
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
publication title Zinc Potentiates GluK3 Glutamate Receptor Function by Stabilizing the Ligand Binding Domain Dimer Interface.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 74
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u94A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u94A02
4OQOA 1RKMA 4BDMA 1MQGA 1LAXA 1MH3A 2QPQA 4IO7A 4I62A 1SD3A 1JW4A 3MUQA 1B1XA 1B7HA 5FHNA 2ZXTA 1DMBA 2Q2CA 1MXVA 5CBSA 4I1DA 1XS5A 3DLNA 2XXVA 3DP6A 3VLVA 3QSLA 1AIVA 3M8UA 3C33A 1B5IA 4RK2A 5KZTA 3RGYA 3KJTA 5HM4B 2ZYMA 4F2QA 5FHOA 3T93B 2X7QA 4KI0E 5I84A 4ZE8A 5I57A 3RN8A 4ZDMA 3ECRA 1N3WA 5AA2B 4QFNA 3TKDA 3FXQA 4G8HA 1MXYA 2F5XA 2DVCA 1URDA 4NF8A 4QSEA 1YCJA 2V84A 3QYTA 1B51A 1NNKA 1URGA 2Y7PA 1Y1MA 3VXBA 3K0VA 4LUBA 3H06B 2DWHA 4YB5A 3O97A 2QS3A 2DXYA 2D5WA 1B4HA 5AA1A 3CG1A 3W9VA 4G77A 3Q28A 4R2BA 1EZ9A 1ZLQA 3MVXA 3S9MC 4PP0A 3FVGA 2F7AA 1ZTYA 3LSWA 2OK2A 5I2KA 2NUVA 3RT6B 4HW8A 4GL0A 4FATA 5F7VA 4NE4A 3V89B 3TTLA 3G3FA 4P0IA 2RCAA 3SEXA 1FQFA 1HSEA 4JDFA 2I49A 3P7IA 1FQBA 2ZYOA 4DIGA 2UYEA 1WODA 2ZNSA 5L9MA 3T9VA 3BBRA 1B5JA 5H8HA 2HCAA 2XXUA 4H0WA 4DXUA 4F2OA 1B52A 2LAOA 3EHTA 1TXFA 3HHGA 1Y3NA 2E0SA 3OSQA 3KG2A 1S50A 3IB2A 3RY3A 2F6GA 4KYEA 5I57B 3VV5A 3ZS6A 1VFDA 1TFAA 3TAJA 1VR5A 3L6GA 1H3DA 2QSXA 5I56A 1NNPA 3T9UA 4OHNA 3DP4A 5KDTA 4YB7A 4PQJA 1H44A 4NF8B 3RUMA 1B1HA 3D4GA 3CSGA 4FORA 4HTGA 1LSTA 2R6GE 3C36A 3MZ9A 3PMXA 2DYXA 3HO7A 4GLIA 3LBSA 2PT2A 4ECFA 5IAIA 3TQLA 2I3VA 2M8CA 1YPNA 2XX7A 3PPOA 1NMUA 1ZU0A 2XXWA 3U1OA 4YKJA 5JTYA 1SYIA 3HN0A 3C9HA 2Y7IA 1FTKA 3PMVA 4OEVA 1R1NA 4AQ4A 1MXWA 4NEDA 3MAMA 2UVHA 4IO2A 3CR9A 5DT6A 5I2KB 4G8MA 2P1SA 4U1OA 3TODA 2O6AA 3PUVE 3BKIB 2I0BA 4ELQA 4LVQA 1B4ZA 1MY1A 3VVFA 1IXGA 3V8XB 1ATGA 3MVYA 3FVNA 3CG3A 4MF3A 3I3VA 1A40A 2FNCA 3UK4A 2XXXA 1R9LA 3TDJA 1O7TA 1OQHA 2F7CA 3S4UA 4LONB 3KEIA 3LUYA 3A3UA 4F18A 1OVBA 5H8HB 4F3BA 1M5FA 4QRZA 2F34A 3DP8A 4R74A 3UIFA 3UORA 5CC2A 2OWSA 3THIA 1H45A 3V83A 3GZGA 3TQWA 1MXUA 3GBAA 1CB6A 3RQTA 5I56B 4H6DA 2XD2A 5KDTB 2X7PA 4ZEDA 3I6VA 1D3KA 1Y4TA 3KOSA 5ISUA 2Y7KA 1D4NA 4PETA 4JWOA 1A55A 3CSBA 4R6KA 3FVOA 1SVXB 4GFRA 2O51A 1DOTA 5I58A 3IAZA 5M2VA 3VXCA 3IOUA 2A5SA 4E0WA 3QUFA 3T9XB 4KR5A 1Y20A 4POXA 5JTYB 4GL8A 3USDA 1USYH 2WKYA 3Q26A 4DCXA 4LP2B 3FUZA 4MFIA 2PMSA 1MY3A 1ANFA 4UACA 1IZ1A 4O3BA 3IOWA 2NWJA 5HPQA 2F78A 4ZEFA 2F35A 2Q8JA 3TTRA 1CE2A 3CVGA 3HV1A 3MPKA 5AA2D 2RKMA 3PUZE 3OELA 3SEYA 3SKPA 4NWCA 1JETA 1GVCA 1LCTA 1R6ZA 3TFLA 2ONKE 4X9TA 1OMPA 4MLVA 3FXRA 2F36A 4X1DA 4QF9A 4Q30B 1EZOA 4WXJA 2QRYA 4ZS9A 4LQ2A 5BUUA 1Y9UA 1NNFA 3O66A 4P11A 2Y7RA 5H8QA 1FTLA 1IITA 4N13A 1ZIUA 1POY1 3H7MA 1B9JA 3W9WA 3KOTA 3IORA 3F11A 1IIWA 5ITOA 2H5YA 3W15C 2O7UA 1SW4A 2BJJX 4EQ9A 5EYFA 3T9HB 3PMWA 2DWAA 2UVGA 2IA4A 5I58B 3OSRA 2Y84A 4G68A 5AE4A 4EQBA 3R7XA 5TU0A 2ALUA 2R9JA 3C31A 3D4CA 3U94A 4I9DA 3L6HA 4FJPA 4U21A 1PDAA 1ELJA 3R26A 3N5LA 1B05A 2ZNTA 1M5BA 1UTHA 4IO5A 2HAVA 3MW0A 3CFXA 4LA9A 4Q0CA 2REGA 5EHSA 3HCQA 1M5CA 1OLAA 1N84A 1QKAA 4XIGQ 5HBCA 1AOVA 5EHMA 1EH3A 1MPCA 2VD3A 3CRBA 3IL1B 1P1OA 4GXAA 3T96B 2PBWA 4R6YA 2HFBA 1SYHA 1YAEA 1UIUA 3IOTA 3FATA 3PD9A 3MP8A 3SEUA 1SBPA 2XXPA 2CZLA 2PX1A 3FJ7A 3IOVA 4HCYA 3B6TA 3G3KA 4LQ5A 1MQIA 1B3HA 5H8QB 4U23A 5K2XA 1P1NA 5TPAA 1L5TA 4ZZAA 4EF1A 2E1SA 5CMBA 5L9OA 2QMXA 4IO3A 3K2DA 2I0CA 3UN6A 2ZMBA 3B6QA 4PFYA 2ANJA 2DE3A 4H5GA 4NF5A 2GH9A 3HHFA 3KJ7A 1B0LA 3N6TA 5ICQA 2V3TA 1FQEA 1MY2A 2I3WA 4L17A 1LB9A 1Y3PA 4G68B 1US5A 1UIVA 5ELVA 2Z8DA 4LATA 3KN8A 4OWDA 2VHAA 4WEDA 1B7UA 1N04A 2QL3A 4G8NA 4KYSA 4TOZA 3SEVA 1I6BA 2ZNUA 5KCJA 2W7YA 1NKXA 4QFKA 1UTHB 5B70A 1RYOA 3PGFA 3C34A 4KYDA 4OMBA 2RC8A 1OIBA 2Z8FA 1S7YA 2DWJA 1Q1KA 3KBRA 1B0HA 1B7ZA 3FV1A 1MS7A 4C1TA 2F7BA 3TTKA 3PPNA 4JXIA 4OXVA 4M1VA 3B6WA 3TTMA 4EXLA 1PB7A 1JNFA 3I5OA 3LSFB 1QJMA 4JWYA 1B40A 5TPAB 5CMCA 5IKBA 1B3LA 4OFOA 1WDNA 3FVKA 4IO4A 2B3BA 1WVJA 4K3FA 2P0SA 4PFWA 2A5TA 1P1WA 4IGRA 4OERA 1MH4A 2I4CA 3FV2A 4FEBA 4F1YA 4PFTA 3MJNA 2Y7WA 3JZJA 1SW1A 2DQVA 4C0RA 4NF5B 3FIRA 1SI0A 5DTBA 4F1VA 3RPWA 4H8JA 3PV0E 2AIXA 3M3FA 2ESNA 4R9FA 4XXUA 5CI5A 1MM6A 2OJTA 5TP9A 4Z7EA 2QMWA 4NF6A 3RTWB 2H99A 3K4UA 2Z23A 4KD5A 3Q27A 4OVJA 2HZKA 4GIZA 5DEXA 3H6UA 5F1QA 3IB0A 2FA7A 2O69A 1SW2A 2O68A 3U8QA 3VLWA 5KCJB 3TZAA 4OYVA 1M5DA 3UGWA 3LR1A 1QUKA 3K1NA 4OTEA 2G93A 4KPTA 5CBRA 4GD5A 1FW0A 1AH5A 1EU8A 2RC9A 3FZVA 2XHDA 1I69A 1LB8A 5DVFA 3WAEA 1I6QA 3KSXA 4X1BA 2G29A 1FTMA 3M3LA 5JEIA 4X48A 4YKKA 4QHQA 3MZ1A 4H67A 5FTIA 4F31B 1GGGA 3O6IA 4R72A 3TYHA 1NFTA 3MP6A 3LSXA 4OENA 2Q9TA 3IB1A 4R75A 3K6XA 1IUDA 3K00A 4EUOA 3ZKLA 2GHBA 4NTLA 5CMKA 4F39A 3A09A 4ZE9A 1Z7ME 4O3CA 2A5TB 4XKPA 1A99A 1IXIA 2I6EA 4H1XA 1QKBA 2H25A 2P2AA 3G3HA 2DXRA 3RNNA 3PPRA 1BP5A 4MBPA 1AMFA 1XC1A 1BIYA 4N6PA 4FAJA 2RF1A 3IK6B 1LFHA 1NH8A 1MDQA 3IO6A 1LAFE 3TTNA 5TP9B 3E4RA 1O64A 4H5FA 4NF6B 3C32A 2AL5A 1GR2A 1PB8A 1QULA 2KLFA 1PC3A 5DEXB 3PPQA 4TLLB 2UXAA 2YLNA 1A8FA 5CM6A 1M5EA 3EN3A 1IXCA 4AB5A 4QFOA 1SI1A 2XXRA 2I48A 2V3UA 3U93A 4QFPA 5B7DA 3PUWE 3FJGA 4RJZA 1I6AA 3H3GA 1O63A 4NMYA 2XXTA 2NOOA 4IY6A 3SESA 4P0GA 1SQYA 3IJOB 4C1UA 2XX9A 3TCGA 3BFUA 3VE1B 2I4BA 3MBPA 4DDDA 1OQGA 2PYYA 1BLFA 2V93A 3MZBA 1BTJA 4POWA 3QUJA 1NL5A 4DCYA 1TT1A 4OFLA 4MH5A 1D9YA 2HAUA 1FTJA 1XVYA 3O6GA 2O1LA 5CRYA 4PE5B 3DELB 1USYE 5AA4A 4ZEIA 3CIJA 3S9NC 3KN3A 3TELA 3C4MA 1MXZA 4OFJA 1SDXA 3G3JA 4ESWA 1IXHA 4HCWA 1LAHE 5I2NA 4GRKA 3ILUB 4RK9A 4GVOA 4G68C 2V25A 3VDFA 3MWBA 5DYHA 3N94A 3DM0A 3E9XA 1A8EA 3O2AA 4ZECA 4I8CA 2VP1A 1Y4CA 1N7WA 4RY1A 2F97A 3HPIA 3U72A 2HXWA 3EPEA 4BDNA 5DVIA 1BKAA 2OZZA 1MQHA 4FIMA 3FXUA 2OLBA 4ZEBA 1OVTA 5H8NA 4WEPA 3VVEA 4XKNA 3OEMA 3OOAA 3MC2A 3Q25A 4BDRA 4JB7A 1PB9A 1MDP1 4RPNA 3MVZA 2R71A 1IQ7A 3OENA 3PUXE 2O1MA 2DE2A 3V5AA 1N7XA 3K1PA 4GWOA 2HEUA 2H9BA 3S9LC 4YMBA 1JQFA 2Q2AA 3C35A 3WAFA 4ELRA 3OO6A 3OO8A 1VE4A 2QS4A 1JVYA 1RYXA 4M4GA 1YTVA 1VSOA 2ZYKA 5L8DA 5A5XA 1MG1A 4XTCQ 5AA4B 2ZYNA 5ICTA 3E3KA 3ZSFA 4ELPA 4OZ9A 3UP9A 4YU0A 3O9PA 2O84X 1MQJA 1FQDA 2DP8A 2YPNA 4IB2A 2IEEA 4IY5A 3E13X 5I2NB 4GF8A 1AL3A 2DSFA 2UVJA 3ONMA 3FD3A 1ZBMA 4AB6A 2XXYA 3IO4A 4F3SA 1B3GA 1B6HA 2DVZA 4GQOA 3IX1A 2GRVA 4H65A 3ODBA 1QUJA 3GLBA 4EXKA 4FE8A 1B3EA 4U4XA 1QW0A 1TWYA 2VOZA 2GHAA 4F3PA 5I59A 5H8NB 3LC8A 1ZKBA 5AA3A 4E0XA 1HSJA 1A54A 4FECA 1QUIA 3OO9A 3K01A 3MP1A 3MVWA 1N3XA 3QAXA 4OETA 4OESA 2PVUA 4YAHX 2I58A 4H8IA 2XXHA 4YKIA 3O29A 4FEDA 2REJA 3TMGA 4GXSB 1LGBC 3KZGA 2B65A 2VGQA 3QK6A 2RINA 4NF4A 1H76A 1PBQA 3JYRA 4RYAA 4U1ZA 2OCUA 4PFUA 3CI8A 1FTOA 4QSCA 4F3GA 4F1UA 4RPOA 3G3IA 3O6HA 4U22A 3CFLA 3ZKKA 5A5XB 3KFMA 2YJPA 3M3KA 1F9BA 1N76A 2QJEA 1B58A 1FQCA 4RXLA 4IGTA 5FHMA 2NVUB 3EQ1A 2HQ0A 3OD7A 1SW5A 3KGCA 3H6WA 4JSOA 2RC7A 3GXAA 4G4PA 3OO7A 3QIMA 3QXMA 2OWTA 3S9EA 2Z22A 3RTFB 1HSLA 4OEUA 3IJXB 3T66A 5ITPA 3OMBA 4KCCA 1B2HA 1MXXA 1TFDA 3BFTA 3IR1A 3CFZA 4Z0IA 2Z8EA 1S9TA 3PUYE 1N0TA 3JV9A 3N26A 1T0KA 1DTGA 1B3FA 1OLCA 4BLAA 1UTBA 5I59B 4RNSA 5JK4A 3EF7A 4RA1A 5K2YA 4NWDA 4Q8RA 1LFGA 2H4IA 4ND9A 4DZ1A 3EHSA 1UQWA 3EHUA 1KWHA 3VVDA 4F29A 5DVJA 4JWXA 4ISUA 2H98A 3G7WA 4EDPA 1MM7A 4YB6A 4TLMB 3K6VA 2GFEA 3OEKA 3R6UA 3TCFA 4NF4B 3RT8A 1JVXA 4DLDA 4HS7A 2UVIA 3H4ZA 1D9VA 3PPPA 4EQ7A 4TQUQ 5LOMA 1ZJLA 3N6UA 1Z7NE 3S2VA 3A3CA 4BDOA 1NH7A 4KFQA 4KHZE 3H6TA 4JSDA 4JBZA 1MQDA 4G2ZA 4XKQA 1POTA 1NNTA 4IO6A 1EZPA 2DOJA 2Q88A 4R9GA 5H8FA 1PEBA 3U92A 2V3QA 2D21A 4ONYA 4DE8A 1B46A 2RCBA 1GV8A 3VLUA 3AXFA 1B5HA 2XXIA 5J1DA 4MLQA 4LZ8A 4R2FA 3SDFA 4DXBA 2FYIA 2XD3A 3TPAA 1GTKA 4ELOA 4YMAA 4ESXA 1LCFA 2VD2A 4YZZA 4F19A 4ZEKA 2DE4A 1B32A 2QS2A 1JW1A 1IEJA 4KCDA 4KQPA 1UTBB 2Q89A 4U4SA 1MY4A 4LZ7A 4WKMA 4GOTA 2B3FA 3GBBA 2OBGA 3K02A 3PD8A 2F8DA 1FCKA 4UA8A 1DTZA 4THIA 4BDQA 1LAGE 3SETA 4XKRA 2ABHA 2DWIA 5L9SA 4EF2A 3MQ9A 5CMMA 3RLFE 4DXCA 1DPEA 1XOCA 1JEVA 4QFLA 2XXQA 4N07A 3T22A 1JEUA 4R73A 3TEPA 3TUSA 2XX8A 1R9QA 4YICA 1MPBA 1Y1ZA 1Y3QA 3K6UA 3HSTA 2X26A 3MPLA 2NXOA 1JW5A 3SEWA 1LBBA 3ILTB 5BWJA 4QSDA 2AYSA 1QVSA 4ZZEA 4R6HA 3VFJA 5H8FB 2PT1A 4U2RA 3TCHA 1XVXA 1LLSA 1URSA 1J1NA 3G3GA 3KSJA 3K6WA 5AA2A 4LZ5A 1XHYA 4BDLA 1PBPA 1Q35A 1XT8A 3O28A 2ONRA 4Q5TA 2CMOA 4F22A 2DS9A 2QS1A 4YKPA 2D3IA 1MY0A 3UA8A 3PU5A 1ZMGA 3SERA 3FGSA 1P99A 1II5A 3H6VA 1FQAA 3H03A 2THIA 4O3AA 1DPPA 3KN7A 1US4A 2ONSA 3K1MA 1MRPA 1A7LA 3LSLA 5FTHA 3Q29A 1DSNA 1MPDA 5H8SA 2AL4A 3FASA 2HZLA 1P1UA 1LFIA 3B7DA 2F6PA 2UYFA 1H43A 3OXNA 3FJMA 1LBCA 2O7IA 1VFEA 1P1QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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