3V83A

The 2.1 angstrom crystal structure of diferric human transferrin
Total Genus 216
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
216
sequence length
674
structure length
674
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis for iron piracy by pathogenic Neisseria.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
molecule keywords Serotransferrin
total genus 216
structure length 674
sequence length 674
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A03
3SDFA 2XX7A 1P1WA 3FXRA 2DXRA 3IB2A 4H5FA 3KJTA 3LSXA 3QUJA 3F11A 2O1MA 2QMXA 1FQFA 3GLBA 4QFLA 4H5GA 4QHQA 4OEUA 2HAVA 3C36A 1LB9A 3C32A 4ZEFA 2RKMA 3SEYA 3H3GA 3M3FA 2ALUA 1R9QA 3QUFA 1UTHA 4OYVA 3CSGA 1VFDA 5CBRA 2Z8FA 1IXHA 1MQIA 1FTMA 4KYEA 1MY2A 2B3BA 4NF5B 2GRVA 1B3EA 2CZLA 1B3GA 4GFRA 1PB8A 3OD7A 3OEMA 5AA3A 1DSNA 1XOCA 4ZE8A 1RYOA 1NNKA 4JBZA 4L17A 1H76A 2H5YA 3FVGA 1I6BA 5CC2A 4DXUA 4NF4B 4C0RA 4KD5A 3TTRA 1A40A 4IO7A 1OVBA 2DVCA 3KEIA 4QF9A 3PPPA 4RXLA 3RPWA 4IGTA 3D4GA 3T9HB 4U22A 1MM6A 3MZ9A 4KYSA 3OSRA 4DZ1A 3GZGA 1P1UA 3TZAA 3ILUB 5I56B 4O3BA 2Y84A 2BJJX 1VE4A 2RC9A 1QUKA 1NH7A 1Q1KA 1FW0A 5TP9B 5I58B 4G68B 1MXVA 4GXAA 3R7XA 3GBAA 2H99A 3CVGA 3VVEA 3BFTA 3A09A 3C34A 3MZ1A 1CB6A 4BDLA 4ONYA 2PVUA 2PMSA 3K0VA 4MLQA 3RNNA 5DTBA 3K6WA 1OVTA 5HM4B 3VDFA 3KJ7A 4GL8A 5I56A 5IKBA 1SYIA 2VHAA 2XXPA 4EF2A 3MPLA 5JTYB 5H8FA 1MXZA 3VLWA 4ZECA 5I58A 4H65A 4KHZE 4NF6B 1ZTYA 4U21A 1UIVA 4HW8A 3K01A 4XKQA 3IOWA 4Z0IA 3TTMA 3PUYE 4MLVA 2NUVA 1EH3A 1B3HA 1I6AA 1O7TA 4RY1A 3MUQA 2I0CA 4LVQA 3IB1A 2Y7PA 3H03A 3JZJA 4PFUA 3OXNA 4IY6A 3UA8A 3SETA 4NF6A 4UACA 5JK4A 5AE4A 4YKPA 3KN7A 1ZBMA 3DP6A 4U1ZA 2CMOA 2Q9TA 5B70A 1B05A 1R9LA 1SBPA 3MW0A 1T0KA 2XD3A 1B0HA 3O29A 4EXKA 2DE3A 3MAMA 3ONMA 1ZMGA 5DEXB 1S7YA 2GH9A 3N6UA 4QSCA 4C1TA 5LOMA 1LAHE 3PUZE 4ESWA 4GWOA 3FV1A 2O1LA 2B3FA 3MC2A 1TFAA 1Y1MA 4QSDA 4EUOA 4WEDA 1YPNA 4WKMA 1IXCA 3ZKLA 3UIFA 4FE8A 2XXTA 2NWJA 2AL5A 3OSQA 1DOTA 1SI1A 4YU0A 1CE2A 1SD3A 4WEPA 4H8IA 3FGSA 2X7PA 1O64A 1SVXB 3MPKA 3CSBA 1LAXA 3ZKKA 3MVWA 3IR1A 1PEBA 3O97A 4YMBA 5CRYA 2XXRA 4DXCA 1GV8A 2R6GE 4F18A 1MH3A 2E0SA 3DP8A 5JEIA 2Y7KA 4RNSA 5CMCA 2B65A 1O63A 1B3FA 4PQJA 5AA2D 5KCJB 4I62A 4F39A 3MVYA 4ZEKA 1MRPA 3T66A 3QSLA 1A7LA 3MP1A 1VR5A 4DLDA 4EQ9A 1J1NA 4GF8A 4N6PA 1N0TA 1Z7NE 4G8MA 3ZSFA 3DLNA 2ZNUA 1MPCA 2XX9A 3OO8A 2G93A 3OOAA 1UTBA 2Y7IA 3KN8A 4O3AA 1MXYA 2P1SA 2O7IA 2PBWA 3KBRA 4G77A 2QSXA 2I4CA 4I1DA 1B2HA 3TDJA 5AA2A 2F7AA 3A3CA 3W9VA 1M5FA 2A5TB 4Q0CA 4P0IA 1R6ZA 1LAGE 3TELA 3O9PA 2Z8EA 1HSLA 3SERA 2DYXA 4GLIA 1NKXA 4PFWA 3PUVE 4ZZEA 2DXYA 4LP2B 5CMMA 3S4UA 3AXFA 5FTHA 1Y1ZA 1US4A 1HSEA 2R71A 4G8HA 1A8FA 4OFOA 3PMVA 3RGYA 4Q5TA 3B6TA 3CFLA 4U1OA 4FECA 3H6UA 3RTFB 2DVZA 4I8CA 4JWOA 2V3TA 1ZIUA 1Q35A 1SI0A 3B6QA 3SEWA 1LSTA 4OTEA 2M8CA 4GVOA 3K00A 4YAHX 3EHTA 5ISUA 1B58A 1POY1 1B40A 2XXHA 4AB6A 1XS5A 4FAJA 4N13A 1MXXA 3I3VA 1LBBA 1LGBC 1EZOA 5K2YA 1USYH 4R6HA 2OZZA 3LBSA 4R6KA 4AB5A 4OVJA 4LONB 4NE4A 3T9VA 2OK2A 1N3WA 4MF3A 3Q25A 5FHMA 1B7HA 3K1PA 4F3BA 2H9BA 4ESXA 2DS9A 2O84X 1JNFA 1GTKA 3SKPA 2LAOA 3K1NA 1IUDA 2F34A 3FVKA 1NNPA 3MVXA 4IGRA 3OMBA 1BIYA 1B1XA 1KWHA 3I6VA 4XIGQ 4POXA 5F7VA 2V84A 4XKPA 3GXAA 1M5BA 1MPBA 1IXIA 1BKAA 4ZS9A 3IOUA 2D21A 3TTKA 3O2AA 5L9OA 2QPQA 2ONSA 4DDDA 1MDP1 4AQ4A 3N26A 3PUWE 4C1UA 3CR9A 3T9XB 2F36A 4EDPA 1QVSA 4JWXA 4ELPA 4XXUA 2ANJA 3U94A 3PD8A 4HS7A 4M4GA 1AL3A 1QKAA 3H6WA 3C31A 3O6HA 3MWBA 1I6QA 4HTGA 4YMAA 4EQBA 3LC8A 1GR2A 4X1BA 1Y3PA 4KI0E 1IQ7A 1M5CA 3KOTA 3MP8A 1H45A 2GHAA 2OJTA 3VXCA 4PETA 3PPQA 1UQWA 2X26A 4ELOA 3SEVA 4NF5A 5J1DA 4DCYA 4TOZA 1B9JA 3CI8A 2O69A 4BDQA 1BP5A 4YB5A 3H6VA 4XKNA 4ZEIA 3HO7A 1ANFA 1IZ1A 4K3FA 1B5JA 3CRBA 1XVYA 3PPOA 1B52A 4NF4A 3G3GA 2A5SA 2VGQA 1URSA 4N07A 5ICQA 3FATA 3EN3A 2Z22A 3FXQA 1P99A 2DWIA 4POWA 3TEPA 4NEDA 3E3KA 5K2XA 1PDAA 5A5XB 2F6GA 4R73A 2HAUA 2I6EA 4XKRA 2HFBA 3K6UA 3SESA 4F2QA 3IK6B 2OWSA 1EZ9A 1QKBA 4H8JA 3PPRA 1A54A 3M8UA 2YPNA 3TYHA 2F78A 5HBCA 4UA8A 1Y3QA 4OETA 4BDOA 4QFPA 4EXLA 2ZNSA 4R9GA 3TCHA 3EPEA 1P1NA 2XXIA 5TP9A 4G68A 1XC1A 1MQDA 5CMBA 3H06B 4U2RA 2I3VA 2ZYMA 2PT2A 1XT8A 1AIVA 1DPPA 4MFIA 2NOOA 4JWYA 3G3FA 1WODA 4LZ7A 4XTCQ 4G2ZA 1Y20A 4JXIA 3CG1A 1FTLA 5TPAB 3CFXA 3ZS6A 3CG3A 1SW1A 4ELRA 2V3UA 5JTYA 3TPAA 4FATA 4LA9A 3BFUA 4HCYA 2UYFA 1LCTA 4LZ5A 1QJMA 3I5OA 4Q8RA 3O6GA 2Q2AA 2F7BA 3R6UA 4F3PA 4KCCA 4Q30B 3PV0E 4TQUQ 4LATA 3BKIB 3U93A 2I3WA 1DTGA 4LQ5A 1MY0A 3FVOA 3KG2A 2I58A 2O7UA 4WXJA 4YB7A 2W7YA 3TFLA 1ATGA 3KN3A 3RT8A 4LQ2A 1LBCA 2OLBA 4H1XA 4R2FA 3BBRA 2XXUA 3U92A 3S2VA 3V89B 5KDTB 2HZKA 1B0LA 2O6AA 1B32A 3KSJA 4RYAA 1POTA 2OCUA 2ONRA 4YKJA 1S50A 2Z23A 5CMKA 2FYIA 1GGGA 5L8DA 4F19A 1OQGA 4FEDA 2F35A 5DEXA 3OEKA 5DVJA 1URDA 2ZMBA 2P0SA 3T9UA 1ZJLA 5KDTA 3LSLA 4R2BA 4OXVA 1B3LA 5CM6A 3P7IA 3H6TA 3TAJA 4RA1A 4THIA 2NVUB 2PT1A 1XVXA 1LCFA 1SQYA 2DE2A 4DE8A 2NXOA 2AL4A 3B6WA 3FJMA 4LZ8A 2QJEA 3W9WA 1Y4TA 3VLVA 4F22A 3O28A 3RN8A 1MG1A 5H8QB 3PGFA 5ELVA 4NMYA 3D4CA 4GL0A 3K02A 4ZEDA 4X1DA 1DTZA 5DVFA 1YTVA 3K4UA 3L6HA 4IY5A 2XD2A 1H3DA 4M1VA 2F8DA 1LAFE 2O68A 3Q26A 3LSFB 4LUBA 5KCJA 3HPIA 3JYRA 2YLNA 1SW4A 4ECFA 1D9YA 4GQOA 5H8QA 1JW5A 1FQCA 3T96B 3E9XA 1Y9UA 2D3IA 3W15C 1P1OA 5B7DA 2HQ0A 3VFJA 1TWYA 3EQ1A 4QFOA 1EZPA 4RK2A 4QSEA 1SW5A 3K1MA 5DVIA 1D3KA 5KZTA 3KZGA 3TTLA 1ELJA 4E0WA 3KFMA 1FTJA 2IA4A 3IO4A 5I57B 3QXMA 3S9LC 3Q27A 3Q29A 3L6GA 1MH4A 2V93A 2V25A 1TFDA 4QFKA 4BLAA 2HCAA 1ZU0A 5H8HB 4ZDMA 3VLUA 3EF7A 1B5HA 2A5TA 1D9VA 3OO7A 4PE5B 1WVJA 4F2OA 2UXAA 3QK6A 1ZKBA 4QRZA 1Y3NA 3HHGA 5CBSA 1S9TA 4NTLA 3IOVA 1MY4A 1FQAA 4NWDA 4GOTA 1QULA 4H0WA 2XXYA 3G3JA 3E13X 4NWCA 1VFEA 2IEEA 1PB7A 2UVHA 3C35A 2UVIA 4BDNA 4F3SA 1NNTA 4OMBA 3OO9A 4BDMA 2ESNA 2XXWA 3PPNA 4OQOA 2RCAA 3VVFA 2QL3A 2UVGA 3FJGA 1H44A 1URGA 1B6HA 3IAZA 5I2NB 3QIMA 3R26A 4OFJA 1FCKA 1L5TA 2VP1A 1BTJA 2Q89A 4ZEBA 4Z7EA 4ZE9A 2DE4A 4OEVA 4O3CA 4F29A 3C4MA 1OQHA 3UK4A 1SW2A 4TLLB 2F7CA 5ITPA 3OELA 3S9EA 2QMWA 3CIJA 5I2NA 2PYYA 2E1SA 4FEBA 1VSOA 1Y4CA 2Z8DA 4F1YA 2GHBA 3IJXB 3ODBA 3C9HA 1UTHB 3MQ9A 4YZZA 3T93B 1R1NA 4IO2A 2I0BA 2QS1A 1LLSA 3O66A 3HSTA 4KCDA 1MXWA 4X9TA 5TU0A 4BDRA 1RKMA 4P11A 4RK9A 5M2VA 3MZBA 1NNFA 2I4BA 1DMBA 5F1QA 3CFZA 2KLFA 3UORA 4PFTA 4GXSB 3TCGA 1B51A 1MY3A 1H43A 1JW4A 5AA4B 1IIWA 3MP6A 3HN0A 1JEUA 1AOVA 2D5WA 1Z7ME 3E4RA 3UP9A 1LFHA 2H25A 2FA7A 4DXBA 3HV1A 3B7DA 4GRKA 3PU5A 1QUJA 3O6IA 3IB0A 3V5AA 4ISUA 5BWJA 1PC3A 3VV5A 5AA4A 4KFQA 5IAIA 3UN6A 3RLFE 1YAEA 3PMXA 2RCBA 1WDNA 1IEJA 2HZLA 4OESA 2GFEA 3V8XB 4U4XA 5ITOA 2DOJA 4R9FA 3RQTA 4FIMA 2Q88A 1OLCA 3PD9A 4GD5A 1DPEA 2XX8A 5H8FB 4TLMB 5I84A 4F31B 3TCFA 1OLAA 4NF8B 4IB2A 3DM0A 5H8SA 1FTOA 3HCQA 4OWDA 3K6VA 3MVZA 4EQ7A 4IO6A 1FQDA 2ZXTA 4YKIA 3H4ZA 1US5A 1AH5A 4F3GA 3DELB 3SEXA 5BUUA 5A5XA 1MQJA 4G68C 5H8NB 3FIRA 5DT6A 2DWHA 1LB8A 2ZYOA 1LFGA 4NF8A 2UYEA 3FASA 3H7MA 2H98A 1SDXA 2DSFA 1A55A 1NFTA 3MBPA 1MPDA 1AMFA 4R75A 5FHNA 4ND9A 1LFIA 1UIUA 2REJA 5DYHA 2AYSA 2UVJA 5H8NA 3KSXA 1NL5A 3EHSA 3IJOB 4PFYA 1N76A 2XHDA 1B5IA 4OHNA 3FVNA 2RINA 4PP0A 2O51A 4KPTA 3TQLA 5TPAA 3ILTB 4I9DA 1RYXA 1PBQA 2AIXA 1B4HA 5ICTA 3WAEA 4YB6A 3KGCA 2DWAA 2FNCA 2RF1A 3IOTA 2RC8A 1I69A 2WKYA 3MJNA 4E0XA 3K6XA 1D4NA 4IO4A 3DP4A 3G3HA 3S9NC 5EYFA 2P2AA 1OMPA 4F1VA 2DQVA 4JSOA 3M3KA 1MS7A 4R6YA 4H6DA 1HSJA 1M5DA 4RJZA 4RPNA 3ECRA 1NMUA 4MH5A 2R9JA 2ZNTA 5I2KB 4OENA 1IXGA 1B46A 4JSDA 3TMGA 3FXUA 2G29A 4JB7A 4G4PA 3FD3A 4KQPA 3G3KA 3JV9A 3RT6B 1B7UA 3M3LA 3PUXE 2ABHA 2QRYA 2THIA 3VE1B 1F9BA 1QUIA 2XXQA 1MXUA 4RPOA 1B7ZA 3N5LA 5L9MA 1UTBB 1FTKA 3USDA 2DWJA 3THIA 2V3QA 3S9MC 5I2KA 3K2DA 1P1QA 3VXBA 4YKKA 5AA1A 1N3XA 5EHMA 5AA2B 1JEVA 3TQWA 3TTNA 4MBPA 3KOSA 2XXVA 1GVCA 4H67A 3UGWA 1N04A 2QS2A 4U23A 2YJPA 4QFNA 5EHSA 4KR5A 2Y7RA 1JETA 5HPQA 3TKDA 1JVYA 2RC7A 4HCWA 3TODA 3VVDA 1FQEA 3GBBA 1B4ZA 1A8EA 1EU8A 2PX1A 4F1UA 4U4SA 5FHOA 4ELQA 1JVXA 4DIGA 3HHFA 4FORA 3PMWA 4R74A 1QW0A 1BLFA 3C33A 4EF1A 2Y7WA 1ZLQA 3QYTA 3U1OA 4GIZA 5I59B 3IORA 3RTWB 5FTIA 2REGA 1USYE 4OERA 2ZYKA 1MQGA 4DCXA 3Q28A 2I49A 4OZ9A 1TXFA 3A3UA 4P0GA 1PB9A 5I57A 3TUSA 4OFLA 1MQHA 4KYDA 3N6TA 1OIBA 3EHUA 1MY1A 5L9SA 3FJ7A 3OENA 2QS4A 4YICA 1TT1A 5H8HA 5I59A 1JQFA 2VD2A 3V83A 2HXWA 4X48A 1II5A 1JW1A 3WAFA 1IITA 1M5EA 3RY3A 3IX1A 3LSWA 3FUZA 2ONKE 2F5XA 2VOZA 1MDQA 3LUYA 1PBPA 3T22A 3LR1A 2Q2CA 2XXXA 2DP8A 4FJPA 3SEUA 2ZYNA 4R72A 2F6PA 2I48A 3IL1B 4G8NA 1MM7A 1NH8A 1FQBA 2OWTA 1N84A 1A99A 3G3IA 2HEUA 3U8QA 1N7XA 2Q8JA 2VD3A 4JDFA 3FZVA 1SYHA 1B1HA 2OBGA 3U72A 3RUMA 3OO6A 4IO3A 2X7QA 1XHYA 1N7WA 2QS3A 3G7WA 5CI5A 4ZZAA 3N94A 4IO5A 3FV2A 2F97A 2H4IA 3IO6A 3QAXA 1YCJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DK4A 3SDFA 2XX7A 3SZPA 1P1WA 3FXRA 2DXRA 3IB2A 4H5FA 3KJTA 3LSXA 3QUJA 3F11A 2O1MA 1FPDA 1KZ8A 2QMXA 1FQFA 3GLBA 4PFRA 4QFLA 4H5GA 3KC0A 4QHQA 4OEUA 2HAVA 3C36A 1LB9A 3C32A 4ZEFA 2RKMA 3SEYA 2PFZA 3EKIA 3H3GA 3M3FA 2ALUA 1R9QA 3QUFA 1UTHA 4OYVA 3CSGA 1VFDA 5CBRA 2Z8FA 1IXHA 1MQIA 1FTMA 4KYEA 1MY2A 2B3BA 4NF5B 2GRVA 1B3EA 2CZLA 1B3GA 2Y5KA 4GFRA 1PB8A 3OD7A 3OEMA 5AA3A 1DSNA 1XOCA 4ZE8A 1RYOA 1NNKA 4JBZA 4L17A 1H76A 2H5YA 3FVGA 1I6BA 5CC2A 2F3BA 4DXUA 4NF4B 4C0RA 4KD5A 3TTRA 1A40A 4P9KA 4IO7A 1OVBA 2DVCA 3KEIA 4QF9A 3PPPA 4RXLA 4KXPA 3RPWA 5T3JA 4IGTA 3D4GA 3T9HB 4AS4A 4U22A 1MM6A 3MZ9A 4KYSA 3OSRA 4DZ1A 3GZGA 1P1UA 3TZAA 3ILUB 5I56B 2XXKA 4JVDA 4O3BA 2Y84A 2BJJX 1VE4A 4NQ8A 2RC9A 1QUKA 5LTCA 2HPGA 2KR0A 1NH7A 1Q1KA 1FW0A 5TP9B 5I58B 4G68B 1MXVA 4GXAA 3R7XA 3GBAA 2H99A 4GBVA 3CVGA 3VVEA 4OVQA 3BFTA 3A09A 3C34A 3MZ1A 1CB6A 4BDLA 4ONYA 4PBQA 2PVUA 2PMSA 3K0VA 4MLQA 3RNNA 5DTBA 3K6WA 1OVTA 5HM4B 4GX6A 1FBPA 3VDFA 2R8TA 3KJ7A 4GL8A 5I56A 5IKBA 1SYIA 1EYKA 1LBZA 2VHAA 2XXPA 4EF2A 4OVTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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