3VVFA

Crystal structure of ttc0807 complexed with arginine
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
GGSEFQVRSFEEIKRSGEIRIGTEGAFPPFNYFDERNQLTGFEVDLGNAIAERLGLKPRWIAQSFDTLLIQLNQGRFDFVIASHGITEERARAVDFTNPHYCTGGVIVSRKGGPRTAKDLQGKVVGVQVGTTYMEAAQKIPGIKEVRTYQRDPDALQDLLAGRIDTWITDRFVAKEAIKERKLENTLQVGELVFQERVAMAVAKGNKSLLDALNRALAELMQDGTYARISQKWFGEDVRCK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Two ATP-Binding Cassette Transporters Involved in (S)-2-Aminoethyl-Cysteine Uptake in Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Thermus thermophilus
molecule keywords Amino acid ABC transporter, binding protein
total genus 90
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vvfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vvfA02
4FECA 1II5A 4Q8RA 2XXVA 3R6UA 3TTMA 2LAOA 2ZYKA 1I6AA 2F6GA 4X48A 4RPNA 2Q2AA 4YB7A 2I4CA 3T93B 3K2DA 2AIXA 3QXMA 4WEPA 2QS4A 1POTA 3IJXB 3MBPA 3VXBA 4DCXA 2R9JA 3LR1A 3VE1B 5H8NB 1BLFA 2H98A 1B51A 4BLAA 1B3LA 1VFDA 3FGSA 5CI5A 4TLMB 1B9JA 1H44A 3TQWA 3RGYA 2QMXA 1ZU0A 5DYHA 2I4BA 4LZ7A 4EF1A 5A5XA 4XKQA 2UVJA 3K1NA 3IOUA 1CB6A 2Z8EA 4PP0A 3K1PA 4GIZA 3PUZE 3VXCA 1P1WA 3CSBA 2DVZA 2ESNA 3SEWA 2PVUA 3PGFA 2PYYA 4KYSA 2VP1A 4G68A 1TFAA 3TAJA 4ZEKA 1LCFA 2OLBA 1N3WA 4GXSB 4BDQA 4N07A 2QL3A 3LSFB 2NUVA 4ZEFA 3LSLA 3K1MA 4ZEDA 3TTLA 4RA1A 2IEEA 2X26A 2QJEA 3IOWA 4GL0A 4ZS9A 3MP1A 5HPQA 2PT2A 3V83A 5DTBA 4JXIA 4RNSA 4OERA 1DSNA 4DXBA 3UIFA 4F18A 3N6TA 1ZLQA 1H76A 3TQLA 3MVYA 2A5TB 3MPKA 2Z8FA 3G3KA 1N7XA 3RTFB 5AA4A 4YKIA 1EU8A 5AA2D 4JWYA 3HHGA 2DSFA 3IO6A 3Q27A 4H5GA 3TCGA 2XXHA 3PUYE 3VLVA 2D3IA 1B7UA 2RF1A 2Z23A 3KN8A 3M3FA 2O84X 2OWTA 1SW5A 3PPNA 2F7AA 1FTKA 1XT8A 3T22A 3MP6A 4I8CA 4EXLA 1LAGE 1A7LA 4ZECA 1DTZA 3H03A 3ZS6A 5H8QA 2Q89A 4LVQA 3RQTA 1B5JA 1LLSA 1A54A 4TQUQ 3MUQA 4R73A 5I57A 1OLCA 1URGA 4F1UA 3K01A 4IGTA 3H6UA 3VFJA 2XXQA 4BDNA 2ZNTA 1LB9A 3FIRA 4G8MA 5FHMA 3LUYA 3CR9A 2IA4A 3OSQA 3O6IA 1MG1A 4BDMA 4ZE8A 4OFOA 1GV8A 4ISUA 2DE3A 5H8FB 4PFYA 5M2VA 5I84A 4OEUA 3FATA 4ZE9A 3K02A 3TUSA 2I0CA 3S9NC 4OHNA 2RINA 1PB9A 3USDA 3MVZA 1MM7A 2DS9A 4OETA 2FNCA 1AMFA 1MQHA 1WODA 5TPAA 3BFTA 2XXYA 4KFQA 4X1BA 1LB8A 1Y9UA 4O3CA 1O63A 4QFKA 3I6VA 2I49A 1MRPA 3OENA 1KWHA 2E1SA 1J1NA 3H6WA 2OWSA 3ODBA 4MBPA 3V8XB 5ITPA 3ECRA 1MXZA 4RK9A 3D4CA 4YKPA 3KJ7A 2HZLA 1NL5A 2Z22A 1UIUA 3C35A 4OWDA 4GF8A 1EZOA 2Y7WA 3L6GA 5DVIA 3RPWA 3T66A 2XX9A 4JDFA 2DP8A 4F31B 4QSCA 2UYFA 2B3FA 2NWJA 1B46A 3PPQA 3TODA 3CFLA 2NVUB 3KSXA 3FV2A 4GRKA 1D3KA 1M5DA 3MAMA 1NNKA 4AQ4A 2QPQA 1P1UA 4OFJA 2I6EA 1LFIA 1LGBC 1MQIA 4AB6A 4XTCQ 4MH5A 3SDFA 2V84A 3RT8A 2GHAA 3MW0A 2I3VA 3Q28A 5JTYA 5I58B 4F39A 1RYXA 4I9DA 1PBPA 3MWBA 3GLBA 3OO7A 1JW5A 3UP9A 5I59B 1RYOA 4U23A 2QSXA 3PMXA 1R1NA 2F78A 2H4IA 4R6KA 2DXRA 5H8NA 5KCJB 1LFGA 2VOZA 4G68C 3ILTB 1IZ1A 1JEUA 4QFLA 2UVHA 2UXAA 1EZ9A 2Q9TA 4H5FA 2THIA 4OENA 3UN6A 3QYTA 5F7VA 2BJJX 5EYFA 3QIMA 2G93A 1LCTA 5TP9B 3FJMA 3ZKKA 3CI8A 4F3PA 3RLFE 4EF2A 1Q1KA 4LONB 4F19A 1QVSA 3G7WA 3O97A 2XD2A 1MQJA 3QUFA 4NF5A 5I2KB 3K4UA 1MXUA 4LP2B 3HHFA 1B7ZA 4YMBA 3P7IA 5CMBA 1N76A 2HXWA 1XOCA 5LOMA 4ZEBA 4KYDA 2YPNA 2M8CA 2FYIA 2R71A 5ITOA 1A40A 3DLNA 4C0RA 4EQ9A 3RNNA 3O6HA 1PBQA 2P1SA 1M5EA 1MH3A 1GTKA 3C4MA 2XXIA 3FUZA 5HM4B 4GVOA 2VD3A 4ELQA 1XC1A 2HQ0A 3HPIA 4MFIA 2B3BA 3LSXA 3OO6A 1UIVA 2AL5A 4RYAA 1DPPA 1R9QA 3SEYA 4G8NA 2DXYA 3B6QA 1MPDA 1SI1A 2UVIA 3K6UA 4X9TA 1UTHA 2P0SA 1MM6A 2A5TA 3E4RA 3DELB 1NMUA 1MDP1 3PV0E 1ZTYA 1QUJA 2DYXA 2ZNUA 5L9OA 2XXTA 3MP8A 3VV5A 2H99A 4WEDA 1L5TA 1FTLA 1JETA 4Q0CA 3SERA 4PFWA 1AL3A 3LSWA 3VLUA 4EQ7A 3PD9A 3E13X 4OMBA 1N3XA 3W15C 2RKMA 4ELOA 3IK6B 3KOSA 3C32A 1MY0A 4GFRA 2I3WA 4JWXA 1ZMGA 1MXWA 1SW4A 3R26A 5I2NB 5H8HA 1USYH 1Y1MA 3E9XA 4MLVA 4XKRA 4F2QA 1R6ZA 1SYHA 4IO6A 1T0KA 4MF3A 1XVXA 3SESA 1QKAA 2O68A 1P1QA 3C31A 3FVOA 3LC8A 3RTWB 3HCQA 1OLAA 1IITA 2DE4A 2B65A 1H3DA 2O7UA 5H8FA 4LA9A 3OXNA 3EQ1A 3G3IA 1ZIUA 3CRBA 5CMCA 3QSLA 2GFEA 2V3QA 1MH4A 4FEDA 1Y3NA 4IO4A 5FHNA 1VE4A 1WDNA 3C34A 1FQEA 4RY1A 2F35A 3HV1A 3SEXA 3MC2A 1JVXA 4R2FA 3C33A 1URDA 3PPOA 3PPPA 1NH7A 2QS1A 4POXA 1FTOA 3MZ9A 1O7TA 4ZDMA 4XIGQ 4KYEA 2O69A 4H0WA 4AB5A 3QUJA 3TYHA 4ESXA 1PB8A 2XXPA 3G3GA 2OZZA 3T9VA 4WXJA 1IXCA 1A55A 3MJNA 5IKBA 1P1NA 1Y1ZA 4GLIA 4NTLA 4QRZA 2A5SA 3SEVA 3FV1A 3H6TA 2DOJA 1LAXA 1P1OA 4WKMA 1B1HA 4NF6A 2F36A 1JVYA 2VGQA 1AH5A 1MDQA 1MXVA 3CG3A 2HAUA 3U8QA 1FQCA 1LSTA 3L6HA 4LQ5A 3VDFA 2GH9A 3MZ1A 1VFEA 5I58A 2REJA 1MXXA 2ABHA 2XHDA 2ONKE 5I59A 4GXAA 1Y3PA 5KDTB 2F7BA 3SKPA 2DVCA 4E0WA 4M1VA 2QS3A 3Q29A 2Y84A 1FQBA 1I6BA 1FTMA 5CC2A 4O3AA 2RC9A 3O2AA 5A5XB 5TP9A 4IB2A 4N6PA 1FTJA 4H67A 4ZEIA 4OYVA 3KFMA 2GHBA 1MXYA 1US4A 1HSEA 4ONYA 1SDXA 4NF8A 3K0VA 3V89B 1R9LA 3PMWA 2Y7KA 4NF4B 3FXQA 3EHSA 2O7IA 3TTNA 3WAEA 2UYEA 4Q5TA 5DVJA 4OVJA 1JNFA 4BDOA 3HN0A 1IXGA 1P99A 3O6GA 4ELPA 5K2XA 2QS2A 1N04A 5DEXA 1B3EA 3H4ZA 1YCJA 1IEJA 4U4XA 5DT6A 2ZYMA 3H06B 1B4HA 2I48A 3IORA 4XKNA 2PX1A 3BKIB 3IOVA 3H6VA 4DZ1A 4DIGA 2E0SA 3MVXA 2D5WA 3ILUB 3G3JA 5IAIA 4PFUA 3N6UA 4G2ZA 1RKMA 1UQWA 4KI0E 2ZXTA 2GRVA 1DPEA 3H3GA 1B7HA 5CMKA 1M5BA 4O3BA 1QUIA 4P0IA 3A3CA 4XKPA 3FVNA 5JEIA 1FQDA 4JSDA 5FTIA 4LZ5A 4FAJA 4HCWA 4QFNA 3TELA 3TFLA 1ZBMA 3FVGA 3W9WA 4OZ9A 1Q35A 2Y7RA 2XXXA 4LQ2A 5AA2B 3OO9A 2RCAA 2DE2A 3FD3A 2XD3A 1TXFA 4C1UA 1ZJLA 3OEMA 1S9TA 4Z7EA 4TLLB 4NEDA 1EZPA 4F1VA 4X1DA 2ALUA 3UK4A 1CE2A 1D9YA 3O29A 5BWJA 2QMWA 5B7DA 3PPRA 4G77A 5AA3A 1Z7NE 1OVTA 2YJPA 4H8JA 3KEIA 4JB7A 1N84A 5FTHA 1B3GA 1BTJA 1POY1 4HS7A 2RC7A 3PUVE 3T9UA 2V3TA 2HEUA 3MQ9A 4IO5A 4JBZA 4R6HA 1B6HA 4UA8A 1N0TA 4QFOA 4Q30B 4NWDA 1USYE 1NKXA 3TCFA 4DXCA 4PETA 3GBBA 2V25A 4JSOA 4KD5A 4NWCA 1HSLA 5J1DA 5F1QA 1YAEA 2NOOA 2ANJA 3KN7A 4OESA 3CVGA 1OQGA 4KPTA 3IOTA 3K00A 2ZYNA 1NNFA 3ONMA 3HSTA 3IB0A 2Z8DA 3IB2A 1LBBA 1PDAA 3OD7A 3DM0A 3V5AA 4G4PA 4KQPA 1SYIA 1Y4TA 1WVJA 3KJTA 4I1DA 1Y4CA 1EH3A 2F7CA 2DQVA 2P2AA 1Y3QA 1XHYA 3IJOB 3RUMA 1B4ZA 1ANFA 1OIBA 5I56B 3BFUA 2REGA 1NH8A 3S9MC 4DLDA 4NE4A 1SW1A 1OMPA 1FQAA 1SVXB 3T9HB 4YAHX 2H5YA 2PT1A 2W7YA 3FVKA 2Q8JA 2CMOA 4RK2A 1UTBB 2NXOA 2OCUA 4RPOA 4U2RA 3UGWA 1LFHA 4N13A 4MLQA 3TEPA 4RXLA 4ESWA 1JW4A 3TCHA 3KOTA 2OK2A 4FE8A 1B40A 2G29A 4P11A 3OELA 5JTYB 1IUDA 2O6AA 4HTGA 4M4GA 1Y20A 1H43A 1US5A 3EN3A 4YKJA 1B2HA 3S2VA 4F2OA 1D4NA 2X7QA 1H45A 5B70A 1SBPA 1MPBA 1SI0A 2CZLA 4U22A 5H8SA 1A8FA 3VVEA 2DWAA 1JEVA 1B5IA 4P0GA 3I3VA 5KDTA 2XXRA 3FZVA 4R72A 1BIYA 5CMMA 3K6VA 3IL1B 3QK6A 4E0XA 3IR1A 4RJZA 3GZGA 5EHSA 1M5FA 4YZZA 1LAFE 4I62A 1GVCA 4OQOA 4NF5B 1MY4A 3K6XA 4ZZAA 3PUWE 1IXHA 2RCBA 2VHAA 3KZGA 4H8IA 1XVYA 4IY6A 4KR5A 3A3UA 3A09A 4R9GA 1DOTA 4THIA 3LBSA 4F1YA 4IO7A 4R74A 4NF4A 4Z0IA 2DWJA 3MPLA 3FXRA 3M3KA 4EUOA 4PE5B 1TFDA 1TWYA 3H7MA 4LZ8A 1A99A 1IXIA 1QJMA 2X7PA 1SW2A 2KLFA 4ECFA 4KCCA 3N26A 3JV9A 4YMAA 3ZKLA 3TPAA 1DMBA 1Z7ME 4HCYA 5ICTA 2AYSA 4BDRA 1B58A 2ZNSA 1QUKA 5BUUA 1GR2A 3M8UA 1ZKBA 5ELVA 1UTHB 2DWIA 1MPCA 4G8HA 3O28A 3PU5A 4L17A 1URSA 1ATGA 4QF9A 1LAHE 4HW8A 4GQOA 4BDLA 4QHQA 2XXUA 3KSJA 2O51A 3OEKA 4TOZA 3W9VA 3CIJA 3E3KA 3KGCA 4IGRA 4POWA 2F97A 4PQJA 1B3FA 1B05A 1MQDA 1B52A 5L9SA 3GBAA 3B7DA 3I5OA 2WKYA 4F3SA 4H1XA 3U72A 3VVFA 3Q25A 4EXKA 5AA2A 3DP8A 1AIVA 2F8DA 5KCJA 3THIA 3B6TA 1BKAA 5KZTA 4YB6A 3WAFA 3QAXA 4FIMA 4IO2A 3T96B 1GGGA 4GL8A 3S9LC 2RC8A 3IAZA 4K3FA 2VD2A 1MQGA 4F3GA 5HBCA 3RN8A 4ZZEA 1NFTA 3G3FA 5H8HB 4NMYA 4F29A 2V3UA 3EPEA 4H65A 4QSEA 3PD8A 1I6QA 2ZYOA 5ISUA 2D21A 3T9XB 2F34A 5AE4A 1XS5A 5I2KA 1FW0A 4R75A 3FJ7A 4G68B 4ND9A 2HFBA 5CBSA 1O64A 1DTGA 3VVDA 3UORA 3CSGA 3KG2A 2I0BA 3FASA 4OFLA 1MY3A 3FXUA 2Y7IA 4R2BA 3PMVA 3UA8A 4GOTA 3OMBA 1NNPA 2F6PA 3DP4A 2YLNA 3O66A 3M3LA 4UACA 2HAVA 3G3HA 4FJPA 1N7WA 2PBWA 2OBGA 1S50A 4GD5A 4LUBA 4U4SA 2XX8A 1B0LA 3U94A 3K6WA 2XX7A 3TKDA 3S4UA 2R6GE 4FORA 1S7YA 4EDPA 1ELJA 4IY5A 3ZSFA 1B3HA 5JK4A 1B0HA 4KCDA 2HZKA 3CG1A 1PC3A 4FATA 3MVWA 1M5CA 5AA4B 2XXWA 4FEBA 2PMSA 1PEBA 1NNTA 4U1ZA 3SETA 4DXUA 5I56A 3EF7A 1YTVA 3IO4A 4F22A 1JW1A 3HO7A 1TT1A 3IB1A 3KBRA 1FCKA 4NF6B 3N5LA 4U21A 3N94A 3U93A 4ELRA 1QW0A 4PFTA 1A8EA 1UTBA 4DDDA 1VR5A 3OOAA 4DCYA 2OJTA 4IO3A 2O1MA 1B32A 3EHUA 1MY2A 2H25A 3RT6B 5H8QB 4JWOA 4OEVA 2O1LA 2F5XA 2Q88A 3DP6A 1I69A 3AXFA 4YKKA 3PUXE 1F9BA 5I57B 5L9MA 5CBRA 4OXVA 3U1OA 2UVGA 3B6WA 4OTEA 4QSDA 3R7XA 4QFPA 3FJGA 1MS7A 5AA1A 3CFZA 3IX1A 3EHTA 3Q26A 1MY1A 3TTKA 2Q2CA 3VLWA 1D9VA 3C9HA 5I2NA 3MZBA 5K2YA 3OSRA 4YU0A 3TMGA 4R9FA 4XXUA 2V93A 3SEUA 3TDJA 2DWHA 1BP5A 3KN3A 4NF8B 1VSOA 5CM6A 1B5HA 1JQFA 4R6YA 5FHOA 2HCAA 4EQBA 4C1TA 1HSJA 5TPAB 3RY3A 4YICA 2AL4A 3O9PA 3D4GA 4F3BA 3JYRA 1AOVA 3TZAA 2Y7PA 3CFXA 2FA7A 4KHZE 1YPNA 3S9EA 2ONRA 5DEXB 5EHMA 2ONSA 5L8DA 4H6DA 5ICQA 1B1XA 4LATA 3U92A 1QKBA 4DE8A 1SD3A 1IQ7A 3JZJA 4U1OA 1OVBA 3F11A 1FQFA 4YB5A 5CRYA 5DVFA 1IIWA 1QULA 3TTRA 3BBRA 3C36A 1PB7A 5TU0A 2QRYA 1OQHA 3OO8A 2ZMBA 1LBCA 1SQYA 2I58A 2H9BA 4GWOA 3GXAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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