3ZSFA

Crystal structure of the l-cystine solute receptor of neisseria gonorrhoeae in the unliganded open conformation
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
GSLIERINNKGTVTVGTEGTYAPFTYHDKDGKLTGYDVEVTRAVAEKLGVKVEFKETQWDSMMAGLKAGRFDVVANQVGLTSPERQATFDKSEPYSWSGAVLVAHNDSNIKSIADIKGVKTAQSLTSNYGEKAKAAGAQLVPVDGLAQSLTLIEQKRADATLNDELAVLDYLKKNPNAGVKIVWSAPADEKVGSGLIVNKGNDEAVAKFSTAINELKADGTLKKLGEQFFGKDISVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Two Solute Receptors for L-Cystine and L-Cysteine, Respectively, of the Human Pathogen Neisseria Gonorrhoeae.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Neisseria gonorrhoeae
molecule keywords ABC TRANSPORTER, PERIPLASMIC BINDING PROTEIN, AMINO ACID
total genus 76
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3zsfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3zsfA02
2ANJA 2DSFA 3PGFA 2Y7KA 5KDTA 1LAHE 3K1NA 4POXA 3KFMA 1MQDA 4Q30B 4IO2A 1LSTA 4DXCA 3OO7A 1DTGA 1N0TA 1QKAA 4POWA 3TMGA 3L6HA 4AB5A 4KYDA 3KSJA 1MXUA 5I56A 1B0LA 2O1LA 2ZNSA 3PUZE 4TQUQ 3TTRA 4LZ5A 4JSOA 4GD5A 4ESXA 2HFBA 4OFOA 3U72A 4N6PA 5CC2A 1VFEA 2RINA 1EZOA 1GVCA 2OWSA 4LUBA 3GLBA 3G3GA 2V84A 2H4IA 3DP8A 3M3FA 3KN7A 4OFLA 2CMOA 4IO5A 3IORA 1B1XA 1QKBA 4Z7EA 3ZSFA 1B7ZA 1M5DA 2H99A 2VOZA 3B6TA 2HXWA 1NNTA 2DYXA 3RN8A 1R1NA 2PBWA 2I48A 4HW8A 4ZS9A 2UXAA 4FECA 4NF5A 4U21A 1EU8A 4H5GA 1Y1MA 3F11A 4O3BA 1B51A 3ZKLA 3QYTA 2R9JA 5I59B 2NWJA 2REJA 5KDTB 4JBZA 4M1VA 4HS7A 1LBBA 2ZNUA 2O1MA 4JDFA 2XXRA 1ATGA 3SEWA 4R72A 5ITPA 3I5OA 3G7WA 3K6UA 4H8IA 5I56B 5EYFA 3IL1B 1SW1A 4G2ZA 1I69A 3QSLA 3BFTA 4TLMB 3FXQA 3EQ1A 2DXYA 1FTLA 3E9XA 1Y4TA 3VLVA 4Z0IA 2AYSA 1JVXA 3S4UA 4RYAA 4KR5A 5H8QA 2V25A 2E1SA 4XKQA 1QUJA 1N84A 4EXKA 3DP6A 3TQLA 2FNCA 1GTKA 1A40A 2DWIA 3TQWA 2DE3A 2HEUA 4QSEA 2CZLA 3G3FA 4OHNA 4HCYA 2UYFA 1XHYA 2P2AA 2ALUA 1JETA 2H5YA 4F1VA 4F39A 1UQWA 4R9FA 3FVKA 1B6HA 4R73A 1JQFA 5H8FB 1GGGA 1HSEA 4OWDA 3MVZA 3B6WA 2XXXA 3SDFA 5DTBA 5CBRA 3AXFA 1IITA 2OWTA 2DWJA 2VD3A 3U92A 3T22A 1SBPA 2DVZA 3DELB 2ZMBA 1NFTA 1LFHA 4FEBA 4YMBA 4AB6A 3HPIA 5I57A 4EUOA 1VSOA 3LBSA 1CE2A 5I2KA 1Q35A 2Y7IA 4U4SA 1KWHA 3FV1A 3HO7A 4JWXA 1SW4A 3GBAA 1B4HA 4ZZAA 3CVGA 1USYH 2Q9TA 3MW0A 3CI8A 1B1HA 2DQVA 3E4RA 3OXNA 2O6AA 3MWBA 1B46A 4JXIA 2FA7A 1SYIA 4K3FA 4MH5A 5H8QB 1B3FA 3OEKA 1Q1KA 1WDNA 3VV5A 5LOMA 4YU0A 3O28A 1R9LA 1RYXA 3EHUA 1MXXA 5J1DA 5I84A 1B7HA 2ONKE 4C1TA 3HHFA 5EHSA 4WEPA 4UACA 4F18A 4G4PA 3RLFE 4RJZA 2I3VA 4OFJA 4C1UA 4KI0E 1D3KA 4MLQA 3PPNA 3C36A 1M5FA 3IAZA 5I2NB 1RKMA 3RY3A 2DE4A 1PB9A 3OO8A 4FE8A 3UP9A 3I6VA 3CFLA 4RK9A 2Y7PA 4ISUA 2XXQA 1H43A 2HZKA 1B52A 4I9DA 3KZGA 3H4ZA 3FGSA 5CMBA 2XX8A 1VR5A 1N76A 5I57B 1XS5A 1FQCA 4E0XA 4PFWA 3O6HA 5DVIA 3ECRA 3IJXB 2O7IA 5AA1A 2I6EA 5L9OA 2F8DA 3RNNA 3S9MC 2F7AA 1QUKA 1N3WA 5HPQA 3TDJA 3TTNA 3TELA 4XKNA 1IIWA 2H25A 3L6GA 1JW1A 5JTYB 4FAJA 2X7PA 1B9JA 2Z23A 3T96B 4X9TA 4QFLA 2DWAA 2DXRA 3ONMA 5A5XA 3RUMA 4F29A 4DDDA 1MY2A 1B4ZA 1N04A 1DOTA 2Z8DA 3HV1A 1OMPA 3G3JA 2ZYOA 2I3WA 2ONRA 2XXVA 1L5TA 5TU0A 3TYHA 1H3DA 4ECFA 3LC8A 4KYEA 3LR1A 1P99A 4DE8A 1MDP1 2V3TA 4U22A 2PMSA 3RGYA 2RC8A 1NNKA 4R2FA 3IK6B 4IB2A 4OESA 4G8MA 1VFDA 2XD3A 4GIZA 3W15C 2HCAA 4EQ7A 4NWCA 2OBGA 1MPDA 1POY1 3C31A 1FTOA 4THIA 3MUQA 4YICA 3H6TA 4UA8A 1NL5A 1F9BA 4YMAA 2PVUA 3MVXA 1MXYA 4L17A 1FTMA 3M3KA 1IQ7A 1M5EA 1JW5A 3OEMA 1WODA 4ONYA 5H8NA 3TAJA 1AL3A 3BKIB 5DVFA 3MZ1A 2O69A 3IB2A 1IXCA 1Y1ZA 2UVIA 3KEIA 3R26A 1Y4CA 3SEXA 3FXRA 3D4CA 3VVDA 2AIXA 3EHSA 1B3LA 1PDAA 4R75A 1O7TA 2I4BA 3MQ9A 4N13A 4EF1A 3VLUA 1YAEA 3O97A 3O29A 1LGBC 4LZ7A 2IEEA 1OLCA 3PPOA 1HSLA 3PUXE 4ND9A 1M5BA 1SI0A 5A5XB 2VHAA 2O51A 1LB8A 4X48A 2Y7WA 5TPAA 1FTJA 4U23A 1P1NA 1ZIUA 2OZZA 4H67A 2DE2A 1JW4A 2XD2A 1XC1A 3V83A 1JEVA 3PUVE 1QULA 2HAVA 4NE4A 3SERA 4DLDA 3CRBA 4FORA 5M2VA 4WEDA 1JVYA 1LAXA 5AA2A 2UVJA 3PU5A 4F22A 3THIA 4G68C 3EN3A 1FQFA 3MZBA 4G8HA 3TCHA 5BUUA 3PMWA 4IO7A 3E3KA 1LAGE 4M4GA 1ELJA 3MPKA 1DPEA 4IY5A 2Z8EA 2XX7A 3MP1A 4F1YA 1PC3A 4P0IA 1VE4A 2DVCA 4E0WA 2X7QA 4DZ1A 3MAMA 2I0CA 3MPLA 3N94A 1PB7A 3I3VA 4IGTA 1H76A 3FD3A 3K2DA 2B3BA 4BDMA 5DEXA 3CSGA 1GR2A 4PETA 1B05A 1PEBA 4LQ5A 1MPCA 1ZMGA 1OVTA 3QIMA 3IO6A 3V8XB 3TEPA 2WKYA 4G77A 4F2OA 4OVJA 1A54A 3TODA 1M5CA 1URSA 4U1ZA 3C32A 4EDPA 2NVUB 1MXZA 5FTHA 4FJPA 1MY0A 3EPEA 4KHZE 2RF1A 5ICTA 1AOVA 1UTBA 4R6YA 3R7XA 1MS7A 2PX1A 2F97A 4LQ2A 3IOUA 3C4MA 5AA2B 1BIYA 3UA8A 1N7WA 3TCGA 4GXSB 2GH9A 4H65A 4ZE8A 3IX1A 3VXCA 5L9SA 1XT8A 1MH3A 3FJMA 4XKPA 3O6IA 3PPRA 1R9QA 4NF5B 1P1QA 2QL3A 1WVJA 3USDA 3GXAA 2F6GA 4ZZEA 3M3LA 4O3AA 4KQPA 3IOVA 1IUDA 3UGWA 3DLNA 4QSDA 3GBBA 4X1BA 3PMXA 2AL4A 5AA4A 2PT2A 2V93A 3DP4A 5TP9A 2NUVA 1TT1A 4DXBA 1IEJA 1Y20A 2Q2CA 5DEXB 1NMUA 1RYOA 1B3HA 3KN8A 1Z7ME 3IJOB 1QUIA 1US4A 2FYIA 1UTHA 4XIGQ 4OZ9A 5FHMA 3K1PA 3LUYA 4ELQA 5K2YA 2BJJX 3T9HB 3OELA 4R2BA 3B7DA 1SVXB 4H8JA 3O2AA 1UIUA 4GLIA 3VXBA 3CG3A 2I49A 2F7BA 2D21A 4F1UA 4Q0CA 5CRYA 1UTBB 4OYVA 1B5IA 1LFGA 2V3QA 5BWJA 4WKMA 1QW0A 4YKPA 3PUYE 3TUSA 1B5JA 3FJ7A 5AA2D 3KOSA 1MDQA 3Q28A 2I58A 2RC7A 5H8HA 1P1OA 4NWDA 3FUZA 1B5HA 1FW0A 2M8CA 3CFZA 4DIGA 3Q26A 3UN6A 2QPQA 3H6VA 4NEDA 1ZLQA 4QHQA 2YLNA 3SEUA 2D3IA 1OVBA 2LAOA 4JB7A 5CI5A 3MZ9A 3RPWA 4KCCA 3OSRA 3M8UA 3LSLA 3PV0E 1PB8A 5AA4B 3K02A 2GHAA 3H03A 3KSXA 3IB1A 2F36A 4NF8A 5F1QA 2YPNA 4I62A 2Z8FA 4BDLA 4OEVA 2Y7RA 2HQ0A 2NXOA 4HTGA 4OENA 3JYRA 4OEUA 5I2KB 3SETA 4ZECA 3C34A 1A99A 3RQTA 3FJGA 1UTHB 2REGA 1N3XA 2AL5A 4R6KA 2F5XA 4KPTA 4G68A 1MQGA 2KLFA 4KCDA 3U94A 4ESWA 4AQ4A 5FHNA 4KFQA 3WAEA 4GL0A 4FIMA 5CBSA 1BTJA 1A8EA 4GOTA 2OCUA 3Q27A 3A09A 4OQOA 5KCJA 3VVEA 4TOZA 4H5FA 3PPQA 4I1DA 1FTKA 3MVWA 4RXLA 5I58A 4U2RA 4IY6A 2XX9A 1D9YA 3HSTA 1FQBA 4ZEIA 1PBPA 1D9VA 3CFXA 4NF4A 5DT6A 4QF9A 1ZJLA 1ZU0A 4ZDMA 5ICQA 3HCQA 3A3UA 1B32A 4GRKA 2HZLA 1MRPA 1MH4A 3QUJA 1XVYA 4R6HA 2GRVA 3RTWB 1B40A 2UVGA 1IXIA 1YPNA 3VVFA 3VLWA 3PD8A 2PYYA 1AMFA 1R6ZA 5FTIA 1JEUA 2B3FA 2RKMA 2O7UA 4NF8B 2ESNA 2XXPA 4DCXA 4LVQA 2VGQA 3N6TA 1LBCA 4R74A 5ISUA 3N26A 5JEIA 1ANFA 1FCKA 4LONB 1EZPA 1B0HA 1LB9A 4JWOA 1II5A 1DPPA 1LFIA 3TKDA 4F3PA 1H45A 4G68B 4XTCQ 1B3EA 3TTKA 1I6BA 1A8FA 1FQDA 2A5TA 2B65A 3OMBA 2QJEA 1DMBA 3KOTA 1MQJA 3BFUA 1P1WA 5EHMA 3FVGA 4GFRA 4FATA 1IXHA 5ITOA 5KCJB 1D4NA 2R71A 2YJPA 1YCJA 1MM6A 3QAXA 4PQJA 4GF8A 4RNSA 1AH5A 5I58B 3KGCA 4QFOA 4YKKA 1TFDA 3IR1A 4OERA 4X1DA 2VP1A 5F7VA 2XXUA 3ILUB 4NF4B 3EHTA 3R6UA 3K6WA 3KBRA 4GVOA 3O9PA 3JV9A 2XXTA 1BKAA 3ZKKA 3CIJA 2F34A 1NH7A 1MY3A 3QXMA 1URDA 1NNFA 1IZ1A 4EXLA 1TXFA 3ZS6A 1OIBA 3P7IA 4RA1A 3T93B 3S9NC 3H6WA 1H44A 1LCTA 2QS2A 2XXWA 3H3GA 4EQBA 1TFAA 3TZAA 1BP5A 2I4CA 1I6QA 1URGA 1Z7NE 3PMVA 4HCWA 4IO6A 5B7DA 4PFYA 4JWYA 2F35A 3G3HA 3PD9A 2RC9A 1OQGA 4PE5B 1YTVA 3OD7A 2G93A 1CB6A 2Y84A 1S7YA 3VDFA 4QFKA 4QFPA 1US5A 4RPOA 5H8NB 2O84X 2A5TB 3W9VA 4ZEKA 5H8FA 3K6VA 5FHOA 2GHBA 5H8SA 1EH3A 4LA9A 3O66A 3FVNA 3K4UA 3GZGA 2P0SA 3IO4A 3PUWE 2XXYA 3IOWA 3BBRA 1S9TA 1MPBA 3TTLA 1NH8A 3KN3A 2QS3A 4LZ8A 5HM4B 3H6UA 2Q88A 3KG2A 4P11A 4YKIA 5TPAB 4Q5TA 4PFTA 2THIA 2QS1A 2IA4A 4BDRA 1QJMA 3U8QA 1POTA 2I0BA 1T0KA 3T9XB 4QSCA 1AIVA 1XOCA 2E0SA 2QSXA 4H1XA 4LATA 5KZTA 4ELPA 3FVOA 4I8CA 3S2VA 3N5LA 3RT6B 3OO6A 3TFLA 5K2XA 2Q89A 4YAHX 3ILTB 1Y3QA 3OO9A 3QK6A 3VE1B 3W9WA 2OLBA 4FEDA 4GL8A 3ODBA 2RCAA 4U4XA 3FATA 4C0RA 4F2QA 5IKBA 3OSQA 3RT8A 5IAIA 3MP8A 4PP0A 2F7CA 4OETA 4F3GA 4OXVA 1A55A 3Q29A 4N07A 2R6GE 3CSBA 4ZE9A 3UK4A 3N6UA 4IO3A 1ZBMA 5L8DA 1LAFE 5CMCA 1USYE 4BDNA 4MBPA 2D5WA 3S9EA 1SYHA 3LSFB 5I2NA 3QUFA 5DYHA 4YKJA 3V5AA 3UORA 2O68A 3KJTA 3G3IA 2ZYNA 4MLVA 3K1MA 4H6DA 2X26A 4YB7A 3SEYA 2ZYKA 1LCFA 2OJTA 1MY1A 4ELOA 1LLSA 1Y9UA 2XXHA 5AA3A 1B3GA 1QVSA 1A7LA 3TTMA 2ONSA 3IB0A 3T9UA 1ZKBA 5ELVA 3FASA 4NTLA 3CG1A 1MY4A 1DTZA 3EF7A 3U1OA 1J1NA 1TWYA 5B70A 4XKRA 4F31B 1SW5A 4YB5A 3HHGA 3OENA 5HBCA 1FQEA 2V3UA 3TCFA 5JTYA 2Q8JA 4WXJA 1BLFA 2XXIA 2PT1A 1FQAA 4MF3A 2GFEA 3C35A 1MM7A 1SQYA 1O63A 4YB6A 4PFUA 4IGRA 2QMXA 4XXUA 3S9LC 4R9GA 4F3BA 1ZTYA 2H9BA 4NMYA 1Y3PA 4BLAA 1S50A 4U1OA 2ABHA 4NF6A 4RK2A 2Z22A 4H0WA 2HAUA 4GXAA 3E13X 3FV2A 1PBQA 3A3CA 5TP9B 3D4GA 2ZYMA 3UIFA 5CMKA 4RY1A 1I6AA 4DXUA 1B7UA 4EF2A 1B2HA 4ZEFA 3FZVA 4QRZA 3H06B 1O64A 1XVXA 3HN0A 3SKPA 2QS4A 3LSXA 3MBPA 2QRYA 1OLAA 4GQOA 2F78A 3Q25A 3VFJA 1SDXA 1MQIA 4KYSA 3B6QA 4O3CA 3O6GA 3K00A 4LP2B 3K0VA 3MP6A 3PPPA 1NNPA 4BDQA 3MJNA 1P1UA 2ZXTA 3C9HA 4YZZA 3DM0A 4OMBA 3C33A 4MFIA 4P0GA 5H8HB 1JNFA 3RTFB 2VD2A 3U93A 1HSJA 3T66A 3WAFA 3K6XA 1SW2A 2Q2AA 2DS9A 1IXGA 2A5SA 1OQHA 4DCYA 1SI1A 1MXVA 3MVYA 1B58A 3SEVA 2DWHA 4EQ9A 1GV8A 3K01A 2P1SA 2DP8A 2ZNTA 5JK4A 5CMMA 2DOJA 1DSNA 4NF6B 2QMWA 4G8NA 4QFNA 2RCBA 5CM6A 1UIVA 2UVHA 2F6PA 3MC2A 4ELRA 4ZEBA 3JZJA 2UYEA 4Q8RA 1N7XA 3H7MA 4TLLB 5L9MA 4GWOA 3FIRA 4IO4A 4JSDA 1NKXA 1SD3A 3LSWA 1MG1A 2XHDA 5AE4A 3IOTA 1Y3NA 2H98A 3G3KA 1EZ9A 3SESA 4BDOA 1MXWA 2NOOA 3CR9A 4KD5A 4RPNA 3TPAA 4F19A 2W7YA 2G29A 3FXUA 4OTEA 2OK2A 4ZEDA 3T9VA 3V89B 3KJ7A 5I59A 5DVJA 1MQHA 4F3SA 3OOAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ANJA 2DSFA 3PGFA 2PCRA 2Y7KA 5KDTA 1LAHE 3K1NA 4POXA 3KFMA 1MQDA 4Q30B 4IO2A 1LSTA 4DXCA 3OO7A 1DTGA 1N0TA 1NV4A 4H46A 1QKAA 4POWA 3TMGA 3L6HA 1RDXA 4AB5A 4KYDA 3KSJA 1MXUA 4O7IA 5I56A 2HPGA 1B0LA 2O1LA 2ZNSA 3PUZE 4TQUQ 3TTRA 4LZ5A 4JSOA 4GD5A 4ESXA 2HFBA 4OFOA 3U72A 2F3BA 4N6PA 5CC2A 1VFEA 2RINA 1EZOA 2XWKA 1GVCA 2OWSA 4LUBA 3GLBA 3G3GA 2V84A 2H4IA 3DP8A 3M3FA 3KN7A 4OFLA 2CMOA 4IO5A 1LBWA 3IORA 1B1XA 1QKBA 4Z7EA 3ZSFA 1B7ZA 5J16A 1M5DA 2H99A 2VOZA 3B6TA 2HXWA 2V4CA 1NNTA 4N8YA 2DYXA 3RN8A 1R1NA 2PBWA 4KXPA 2I48A 4HW8A 4ZS9A 3GYYA 2UXAA 4FECA 4NF5A 4U21A 1EU8A 4H5GA 1JP4A 4N15A 1Y1MA 3F11A 4O3BA 1B51A 3ZKLA 3QYTA 2R9JA 5I59B 2NWJA 2REJA 5KDTB 4JBZA 2B4MA 4M1VA 4HS7A 1LBBA 2ZNUA 2O1MA 4JDFA 4PGPA 2WYKA 3EKIA 2XXRA 1ATGA 2XWIA 3SEWA 4R72A 3B50A 5ITPA 4JVDA 3I5OA 3G7WA 3K6UA 4NQ8A 4H8IA 2WBDA 4N4UA 5I56B 4UABA 1DCUA 5EYFA 3IFCA 3IL1B 1SW1A 4G2ZA 1I69A 3QSLA 2FIEA 3BFTA 4TLMB 3FXQA 3EQ1A 2DXYA 1FTLA 3E9XA 1Y4TA 3VLVA 4PCDA 4Z0IA 2AYSA 1JVXA 3S4UA 4RYAA 4KR5A 5H8QA 2V25A 2E1SA 4XKQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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