4DXUA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with aminocaproic acid at 1.46 a resolution
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Metal binding protein
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with aminocaproic acid at 1.46 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 118
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxuA02
4MF3A 4XKRA 3QUJA 1B05A 3CFZA 3O97A 1R6ZA 1WVJA 4GF8A 2RC9A 5DTBA 1O7TA 2VD3A 4F3PA 4H65A 1P1OA 3MAMA 1SW5A 1XT8A 4C1UA 3AXFA 4R9FA 5CBSA 3H6WA 1I6BA 1MQDA 4YKPA 3MVZA 3OO8A 1MM6A 3UIFA 4G8MA 4GRKA 4MFIA 1P99A 4LZ8A 2DXYA 1Y1MA 3HO7A 1B32A 3IOTA 1B0LA 3E9XA 2DOJA 1Z7NE 3TCFA 2KLFA 4QSCA 1YPNA 3OXNA 5HBCA 4JB7A 5LOMA 3FVKA 1VFDA 4E0XA 4U23A 1LFIA 4KR5A 1DOTA 3PUWE 5I58A 2O7IA 1OVTA 5H8QB 3H3GA 4K3FA 5I59A 5H8SA 3TPAA 1OMPA 3K6WA 2DS9A 2ESNA 4OYVA 3FXUA 1BKAA 3A3CA 1S9TA 3PUYE 5DEXB 5FHMA 2OLBA 1MQGA 4FEDA 2HAUA 4HCWA 1UTBB 2OZZA 1USYH 4FJPA 3H4ZA 1IUDA 3HSTA 4F19A 5I2NA 4G8NA 2ANJA 2I4BA 2DVCA 4LA9A 1GV8A 3EHUA 4X1BA 3KBRA 4U4SA 4KYSA 5ICTA 2A5SA 1RYOA 4YB7A 3TQWA 4EQBA 5I2KA 4DCYA 2F5XA 1WDNA 4JXIA 3C35A 3VXCA 2BJJX 1QVSA 5F7VA 1UQWA 1SI0A 3BFTA 3H03A 2G93A 3SKPA 4LUBA 2UVIA 2REGA 3VE1B 5CMKA 2I6EA 3MVXA 3GXAA 3S9MC 2OCUA 3IOUA 4ZEDA 2HEUA 4QSDA 3OD7A 4H5FA 2RC7A 3RTWB 3FV2A 4F31B 3T9UA 2O6AA 3RQTA 2D5WA 2Q88A 1NFTA 3KN3A 3TAJA 3TQLA 2NWJA 4Z0IA 2Y7KA 5ITOA 1SW4A 3GLBA 4NE4A 4HTGA 4R6HA 3OSRA 2I0CA 5AA4A 1A7LA 3O66A 3RUMA 2H99A 4TQUQ 4GXAA 3BBRA 2F7CA 4PP0A 4QHQA 5KCJA 1L5TA 1BP5A 1A40A 3N94A 4KQPA 3M3LA 1FTOA 1RKMA 4LVQA 3RNNA 5CBRA 1MXUA 1R9LA 3IJXB 4H0WA 3IL1B 4JWYA 4NF5B 4RA1A 2XXPA 3RLFE 3W15C 3KGCA 3PPRA 2RKMA 5HM4B 1URDA 1EZ9A 1JW4A 2DQVA 4DZ1A 4F1YA 4ZEBA 5AA2B 1RYXA 3ZS6A 1JVXA 3LBSA 4PFUA 1JEUA 4ONYA 3OELA 3MVWA 1ZLQA 4OENA 3RY3A 2B65A 4AQ4A 1PDAA 3OO9A 3D4CA 5BUUA 1FQCA 2B3FA 1PB9A 4R6YA 2F36A 3K4UA 3UGWA 5F1QA 1LB8A 1M5CA 4UACA 5J1DA 2ZNUA 4BLAA 4BDOA 3VFJA 5I56A 4DXCA 5M2VA 4Z7EA 3MQ9A 3EQ1A 2XXXA 4C1TA 1MY0A 3U93A 3FD3A 4O3AA 4AB5A 1VE4A 4L17A 1B46A 3TTKA 3LR1A 3DELB 2UXAA 1N04A 4U22A 3V89B 4PFTA 2DYXA 4F29A 1P1WA 3RN8A 2UVJA 1NNFA 3VLWA 1QW0A 2V3QA 4EQ9A 2HZLA 1QULA 2Y7IA 4H8IA 1ZU0A 2DWHA 3C32A 4NF6A 4RY1A 1FQEA 3WAFA 1B3FA 2DSFA 4GL0A 1LFHA 2VD2A 4G8HA 1Y4CA 3CFLA 5H8HA 1Y1ZA 1IXCA 5TP9A 4IO5A 3OENA 1B51A 4FE8A 3ODBA 4G77A 4OFLA 1SW2A 1WODA 2UVGA 3E13X 3KJ7A 3VLVA 3P7IA 3PPPA 1USYE 2F78A 3TEPA 3UN6A 2GRVA 2XXQA 3FJGA 1ATGA 3QYTA 1GGGA 3FVOA 3C36A 4IGTA 4F1UA 4DXBA 3U72A 5H8QA 1JW1A 2P1SA 2UVHA 3FZVA 5IKBA 2ZYOA 1CB6A 4POWA 5KDTB 1URSA 1B3LA 3O6HA 1XS5A 4N6PA 3I3VA 3T66A 3S9LC 4ZE9A 3K1NA 3TELA 3SERA 4IGRA 1SW1A 2R71A 3TCHA 5K2XA 1B3EA 1HSJA 1AL3A 1VR5A 2O68A 1IQ7A 3K2DA 2QMWA 2XXIA 1IXHA 2XXRA 3IX1A 1LBBA 3CI8A 3EPEA 1P1NA 1OQHA 4WEPA 4RK9A 2RCBA 1R1NA 3VVEA 1ZKBA 2Q89A 2Z23A 2FYIA 5H8NB 3PGFA 3WAEA 3ILTB 1H3DA 2XHDA 2I3WA 4BDMA 1UIVA 4KD5A 1JEVA 4MBPA 4ZS9A 3OMBA 1IITA 4AB6A 1MQHA 4KCCA 2DP8A 5DVJA 2PBWA 4NF8A 3SEVA 2NUVA 3JV9A 4BDNA 1A8FA 3TTMA 1LGBC 3BFUA 1T0KA 3VXBA 1PB8A 3K02A 3MP6A 1Y3PA 3O9PA 3TZAA 4NF4B 1LBCA 1FQAA 5A5XB 3MPLA 4OESA 1QUIA 4I62A 2PMSA 3LSXA 3R7XA 4PE5B 5EHMA 1TFAA 1B1XA 3SEUA 3N6UA 5H8FB 1MPCA 3S2VA 4Q0CA 2UYEA 3U94A 2VOZA 2O51A 4PFYA 3B7DA 3ECRA 1QUKA 2XD3A 4EUOA 4OHNA 2V3UA 4WKMA 1ZBMA 3SEWA 1MRPA 3G3HA 3KOSA 4H6DA 2QS1A 4YZZA 1LAFE 3S9EA 2QS4A 3CSBA 1HSEA 4GL8A 2HAVA 1Y9UA 3LSWA 1S7YA 3VVFA 4P0IA 3TMGA 3SDFA 3C33A 1ZMGA 4RJZA 2RCAA 1B40A 2VHAA 2ALUA 5I84A 3Q26A 5K2YA 3T9VA 4OXVA 1O63A 2ZMBA 1UTHB 3HHGA 5AA2A 3O6GA 4U21A 3DP8A 3KJTA 3PMXA 1POY1 3FVGA 1OQGA 4OETA 3TCGA 3KZGA 1B4HA 3RT8A 3PV0E 2W7YA 1LLSA 2I0BA 4EF1A 3FIRA 2HXWA 4THIA 3T96B 3UK4A 4NTLA 1US4A 1XVYA 3GBAA 4F2QA 3HV1A 4BDRA 2AIXA 2I49A 2Z8DA 4X1DA 4GFRA 4EQ7A 1OLAA 3PPOA 2ONRA 3MZ9A 2CMOA 3Q27A 3MVYA 5ITPA 5L9OA 1JETA 4YICA 1I6AA 4OQOA 1NNTA 4KPTA 1Y3QA 1O64A 3QAXA 3VLUA 1NL5A 4ELOA 1A55A 3S9NC 2THIA 4IY6A 3LSFB 1M5BA 3IORA 1MDP1 1Q35A 1N7WA 2DVZA 4HS7A 3V8XB 2XXYA 3ZSFA 2O1MA 3UORA 4F3SA 2Z8FA 5EYFA 3MZBA 2V3TA 3PUXE 4FATA 2O69A 3USDA 5EHSA 1TFDA 3K6XA 1MH3A 5JEIA 1TXFA 4QRZA 3KG2A 1ELJA 3ZKKA 3SEYA 4LQ5A 3O28A 3DM0A 3TYHA 1MY4A 5BWJA 2NOOA 2Y84A 5DVIA 4F2OA 2OBGA 2DE3A 3SEXA 1II5A 1N3XA 4ZEKA 5TU0A 2F6GA 2Y7RA 3QK6A 4X48A 4OMBA 1ZJLA 3M8UA 2I3VA 3IB1A 3DLNA 4YKKA 2XX7A 4H8JA 5AA3A 3IOVA 3C31A 4F39A 4DLDA 3EN3A 5I59B 3TTLA 4OEUA 4JSOA 3EHTA 3A09A 3IB0A 2XXVA 4F1VA 4LONB 1EH3A 5KDTA 3KSJA 2NVUB 4F18A 3OEMA 1D9VA 4ELPA 1JVYA 5I57A 3HN0A 3TUSA 4FORA 3RT6B 1B52A 1B7ZA 2DE4A 5DVFA 2Q8JA 5FTHA 5FHNA 3GZGA 3DP4A 3IAZA 2AL4A 3V83A 1B3GA 2RINA 3MC2A 4YMBA 4ESWA 2WKYA 3KSXA 3BKIB 4GXSB 3C34A 4EDPA 3K01A 4DXUA 2DWIA 2HFBA 1YTVA 2I58A 1Z7ME 4DE8A 2A5TA 4KHZE 2XX8A 3OEKA 3C9HA 3JZJA 3KOTA 4EXKA 5L9MA 4G68A 4R74A 3FGSA 1P1UA 3FATA 1LAHE 2QSXA 1BTJA 5JTYA 4XIGQ 3RTFB 3TODA 2Q2CA 3OSQA 4YU0A 4JBZA 4NF4A 1EZOA 1Y3NA 3G7WA 2OJTA 4QF9A 1JW5A 5TPAB 1SVXB 2F7BA 4JSDA 1B3HA 2OWTA 2E1SA 3LC8A 2DWJA 3V5AA 1N3WA 3L6GA 1M5DA 4H67A 3I6VA 2H25A 2QJEA 3VDFA 3MPKA 3R6UA 4GQOA 1MQJA 2ZYMA 1B7HA 5AA1A 1N84A 5KCJB 3PUVE 3SETA 4TLLB 4R2BA 4QFOA 4F3BA 1IIWA 1YCJA 1SQYA 4WXJA 3VVDA 2REJA 4NWCA 3IK6B 5KZTA 2VGQA 4TOZA 1PBQA 3KN7A 3CSGA 4OTEA 2QPQA 4Q30B 1LAGE 3U1OA 4Q5TA 4RPNA 5L9SA 4ZE8A 4O3CA 4PFWA 4GIZA 4JWXA 3VV5A 2AYSA 3HPIA 1UTHA 4UA8A 4ESXA 3LUYA 5DEXA 1QKAA 3TTRA 3TDJA 4R75A 4HCYA 1UTBA 1Y4TA 3E4RA 1QJMA 2ZYNA 5FHOA 5B7DA 1JQFA 4OFOA 1FQDA 1Y20A 5CMBA 1B4ZA 2Y7PA 3CIJA 4LQ2A 3PPNA 4ZEIA 2FNCA 3TFLA 4MH5A 1OLCA 4ND9A 5IAIA 4R2FA 4G2ZA 1QUJA 5HPQA 1XC1A 1EZPA 1H44A 2QMXA 3F11A 1B58A 5I56B 3B6WA 2Z8EA 4X9TA 5B70A 3HCQA 1IZ1A 3CG1A 2UYFA 3PD9A 1FTJA 3FJ7A 3QUFA 1MXZA 1FTKA 2LAOA 3CFXA 1DSNA 1IXGA 1A99A 4OEVA 4OFJA 4ISUA 4XKPA 1TT1A 4IB2A 3PPQA 2XX9A 1S50A 4LATA 3PD8A 4GOTA 1GTKA 2HCAA 2O7UA 2H5YA 3H7MA 3CVGA 4NF6B 5ICQA 2GHAA 3SESA 2OK2A 1URGA 2HQ0A 2I4CA 5DYHA 3M3FA 1LCFA 3K6VA 3Q25A 4TLMB 2DWAA 4G4PA 5H8HB 4KCDA 3THIA 5TP9B 4YB5A 3K0VA 3MJNA 3RPWA 4DDDA 1MXWA 3E3KA 1BIYA 2X26A 2PVUA 1MXXA 2XXWA 3LSLA 1N0TA 3PMVA 1DTZA 3GBBA 4MLVA 4NF5A 4YAHX 4NMYA 2NXOA 1CE2A 1GVCA 3C4MA 2V93A 1QKBA 3T22A 5JK4A 1VFEA 2R6GE 1FTLA 3PUZE 1IEJA 2DE2A 1J1NA 1PEBA 4RXLA 2F7AA 2R9JA 1N76A 4XXUA 5CM6A 2H4IA 4RK2A 1DPPA 2ZNSA 4NEDA 4I8CA 4LZ5A 3CR9A 2AL5A 1MQIA 1I6QA 4GLIA 1FTMA 2O1LA 3IB2A 4M1VA 3S4UA 2QS2A 2ZNTA 4RYAA 5CI5A 2V25A 4FIMA 1A8EA 2F34A 2ZXTA 3N26A 3PMWA 4R9GA 2ONKE 2X7PA 2XXTA 1FQBA 3W9VA 3RGYA 4N07A 1LCTA 2XXUA 4OZ9A 4GVOA 4P0GA 1NNPA 1SI1A 1VSOA 2H98A 3Q28A 3ZKLA 1MDQA 4JWOA 4GWOA 2E0SA 4ELQA 4YKIA 4U1ZA 2ZYKA 4ZECA 4NF8B 3K6UA 2GHBA 4NWDA 3M3KA 3DP6A 2IEEA 4QSEA 5L8DA 1ANFA 3H6UA 4BDLA 1I69A 3T9HB 4LP2B 3TKDA 1F9BA 3KN8A 3QSLA 4YB6A 1MY1A 3FUZA 3H6VA 1A54A 4IO2A 5TPAA 1SDXA 3FVNA 3IR1A 4OERA 1R9QA 1HSLA 4ZZEA 1NH7A 2F35A 3PU5A 1SD3A 3MP1A 2FA7A 2Y7WA 4DCXA 1POTA 4IO3A 1IXIA 1B1HA 5AA2D 2YPNA 4DIGA 1ZTYA 1US5A 3KFMA 4R72A 2PYYA 3G3JA 1Q1KA 1TWYA 4H5GA 3K1PA 4QFLA 4H1XA 1KWHA 1NKXA 5ELVA 5I58B 3L6HA 2RC8A 3O2AA 4WEDA 1MS7A 3H06B 2V84A 2IA4A 4XKQA 1LSTA 3FXRA 2G29A 5DT6A 4RNSA 5FTIA 5CC2A 4I1DA 4U2RA 4KFQA 2HZKA 2D3IA 1N7XA 1LB9A 1H76A 3QXMA 1NMUA 3N6TA 2P0SA 4EXLA 5I2NB 4ZDMA 4PETA 4QFKA 1AH5A 2GH9A 3T93B 2DXRA 2VP1A 1P1QA 1BLFA 2B3BA 3MBPA 4R73A 3B6QA 5I2KB 2ABHA 2QL3A 3IOWA 3FXQA 3T9XB 2CZLA 3U92A 4OVJA 5H8NA 3IO6A 1DTGA 4LZ7A 1B5HA 4YKJA 2QS3A 3ILUB 4FAJA 1D3KA 1SYIA 2H9BA 3U8QA 2D21A 1MXYA 2O84X 4IO7A 1UIUA 5A5XA 4N13A 3QIMA 3K1MA 1D9YA 4QFNA 4U4XA 4OWDA 3I5OA 3MW0A 4ELRA 2I48A 4KYDA 1DMBA 5H8FA 2XD2A 3FV1A 4Q8RA 3MUQA 4IO4A 3TTNA 1NNKA 2XXHA 3D4GA 2Q2AA 1EU8A 3B6TA 1ZIUA 2YLNA 1PBPA 1B6HA 1OIBA 3EHSA 5AA4B 3IJOB 1B7UA 3O6IA 4POXA 1MPBA 4FECA 4M4GA 1MG1A 4ZEFA 2RF1A 2X7QA 1OVBA 4F22A 4RPOA 3G3GA 4G68C 5CRYA 3OO6A 3Q29A 3A3UA 1MM7A 4I9DA 3MP8A 5ISUA 1NH8A 2F6PA 5CMCA 1M5EA 3CRBA 2F8DA 3O29A 4ECFA 1YAEA 4XTCQ 1PC3A 4FEBA 2PX1A 1AIVA 5CMMA 4IO6A 4U1OA 4KYEA 3G3FA 2Q9TA 4QFPA 1DPEA 4JDFA 1B0HA 4IY5A 1H43A 1JNFA 1XOCA 1H45A 2P2AA 3OOAA 2QRYA 4HW8A 1MY2A 3N5LA 3MWBA 4XKNA 1MY3A 5I57B 2GFEA 3H6TA 3JYRA 2Z22A 2M8CA 1MXVA 1MPDA 1MH4A 1B9JA 4C0RA 1FW0A 1FCKA 1B5IA 4YMAA 3UA8A 1LFGA 3OO7A 3R26A 4P11A 3MZ1A 1D4NA 1SYHA 1M5FA 2F97A 2OWSA 3CG3A 1GR2A 4E0WA 2ONSA 1FQFA 3IO4A 4ZZAA 2A5TB 3K00A 3W9WA 4MLQA 3KEIA 4PQJA 3HHFA 1SBPA 1AOVA 4R6KA 3ONMA 1B5JA 2PT1A 4G68B 3FASA 4EF2A 2PT2A 5JTYB 3EF7A 4BDQA 1XHYA 1LAXA 1B2HA 5AE4A 1PB7A 1AMFA 4O3BA 3G3KA 4F3GA 4KI0E 2YJPA 1XVXA 3FJMA 3G3IA 4GD5A 3UP9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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