4DXUA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with aminocaproic acid at 1.46 a resolution
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with aminocaproic acid at 1.46 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 118
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxuA02
3PMXA 2B3BA 3C31A 5DT6A 3RUMA 2HAUA 3GBBA 2ANJA 4OETA 4ELQA 2G93A 2DVCA 1FTOA 4G8MA 4L17A 2FYIA 4FE8A 2DWHA 4POWA 4U22A 3FXQA 4F29A 1NMUA 3QIMA 3S4UA 1PDAA 1B7UA 3V5AA 4ECFA 2PT2A 3O9PA 1B9JA 1FCKA 3HSTA 3SESA 1OQGA 1PC3A 5DVIA 2G29A 4EXLA 3CVGA 2NXOA 1P1QA 1H43A 4GF8A 2UVGA 3G3IA 3IB2A 3Q27A 4EF1A 3U92A 3TQLA 4HCYA 4RNSA 2ALUA 4Q30B 1JEUA 3H6UA 3FJGA 1FQBA 2XXUA 1ZU0A 3PPQA 3CRBA 3O28A 5KDTB 3FASA 4TLMB 1T0KA 2OLBA 3Q25A 4OESA 1B40A 1MQDA 1SD3A 2I49A 3UK4A 1SW4A 4XXUA 1FTLA 1MY2A 4WEPA 1ELJA 4ZZAA 3B6TA 5DEXA 2PT1A 3KZGA 4N13A 1XS5A 2QS3A 3G3JA 5CC2A 3KFMA 1UTHB 2I4BA 3T9UA 1P99A 4DXCA 3G3FA 2PVUA 1VFDA 2OK2A 2F7BA 4ZEBA 1N3XA 3O29A 4NMYA 2H9BA 3M3KA 1RKMA 5F7VA 3RPWA 1QJMA 4I9DA 1I6BA 1EZ9A 5KCJA 1QUKA 4JBZA 1FQCA 4NWDA 1H3DA 3EHSA 3D4GA 4Z0IA 3TQWA 5CMBA 5I2NA 1HSEA 3E13X 1NNPA 4Q0CA 2QS4A 1IEJA 2QMWA 3FVOA 5F1QA 3IL1B 4JSDA 1F9BA 2O6AA 1M5CA 3FUZA 3TTKA 3CFZA 4R74A 1SW5A 2OZZA 4GIZA 3BFUA 2I3WA 4FEDA 4NF8A 5I57B 1PEBA 5EYFA 4OQOA 1JW4A 3UP9A 2I0CA 1B51A 4U2RA 3K1MA 3MW0A 2AIXA 4MBPA 1A40A 3Q28A 2AYSA 4R6HA 4ZECA 3T66A 3TMGA 1ZIUA 3PUXE 1VSOA 3L6HA 3W9VA 3M3FA 1MQIA 4O3BA 4ZS9A 1D9VA 1MDP1 4KQPA 1B0LA 3VE1B 3R7XA 4H5FA 4NF4A 1Q35A 1AH5A 2DQVA 1EU8A 2DE4A 1MY0A 1FTMA 4QFOA 3OEMA 3TODA 3U94A 3EF7A 1NL5A 2F36A 4YB7A 3T93B 2ONRA 4KCDA 4QSCA 5DTBA 4F1VA 4YB6A 3OO8A 2QS1A 2HXWA 2ZYMA 4KHZE 2XXHA 3VXBA 2GHAA 1D9YA 4FEBA 3MJNA 1R9LA 4NF5A 5I2KA 1JW5A 1OVTA 2Z8DA 2UVJA 2QL3A 4FJPA 5ITOA 2DE2A 3MC2A 2OJTA 3SKPA 4R72A 3K4UA 4IGTA 3U1OA 3FXUA 2GH9A 1N04A 2QSXA 2CZLA 4IB2A 4JB7A 4BDOA 4QF9A 2ZNTA 4BDNA 3H6WA 4U23A 3MZBA 2PMSA 3TEPA 2VGQA 3MP8A 4BDRA 2R71A 5FTHA 2PYYA 1B4ZA 4KYDA 3IB0A 4LP2B 3TYHA 2F6GA 4N07A 4Q8RA 4EXKA 2RCAA 4RK2A 4GLIA 2YLNA 1USYE 3KSXA 4WEDA 1DOTA 4M1VA 1FQDA 5KDTA 3QUJA 5AA1A 2VOZA 1KWHA 2REGA 3T96B 3C35A 4ZEDA 2B3FA 3PUZE 3ONMA 5ICTA 4YAHX 4P11A 3CG1A 3OSRA 1IITA 3IOTA 4LA9A 3PV0E 3MPLA 1UQWA 4FECA 3VVFA 4OENA 3UORA 4GOTA 3N94A 5I84A 3JZJA 2O1LA 2Z8EA 4YICA 5H8NA 1B6HA 3N6TA 2Q2CA 4ZZEA 1LAHE 3IJXB 2DE3A 3O6IA 3KOSA 1D4NA 3SEUA 5TP9B 3K6WA 2Y84A 4MLVA 4Z7EA 3GBAA 2XXWA 4H67A 5DVJA 4K3FA 4KFQA 1P1UA 3T9XB 3TTLA 1M5DA 4OVJA 2O7UA 5I57A 2XXVA 5L9OA 3RQTA 4C1UA 5IAIA 4YKIA 2V3TA 3N26A 3VVDA 5H8FB 1URGA 3HV1A 3ZKKA 4G2ZA 4WXJA 4EQ9A 1H76A 3B7DA 4KR5A 5CMMA 5BWJA 1QKBA 2R6GE 3TKDA 1B5JA 4TLLB 5B70A 1BKAA 5TPAB 3KBRA 3S9LC 1B7ZA 3C33A 5CBRA 4YKPA 1B3LA 1XVYA 3V8XB 3KN3A 1VR5A 3O97A 3MAMA 2XXTA 1FQFA 1NNKA 1PB9A 4PE5B 2V25A 4G68A 3V89B 4JWYA 1ZKBA 4LQ5A 3TCGA 1IXGA 2GFEA 4OMBA 3PUWE 4H8JA 1ZLQA 3C36A 3IOWA 2O7IA 1URDA 2DVZA 3BBRA 4PFUA 2F8DA 1GGGA 3IOUA 5CBSA 4DXUA 1O63A 1MXWA 1SW2A 4RPNA 4XKPA 1B05A 2UYFA 3N5LA 5FHNA 3RLFE 3K2DA 3S9NC 4NEDA 2DSFA 1R1NA 4IO7A 1SYIA 1MQJA 2REJA 1MY1A 3PUYE 4E0XA 3O6GA 2X26A 4G8NA 4HS7A 1MM6A 1POY1 2I4CA 1SI0A 4LZ8A 2D3IA 1SI1A 3IAZA 3E9XA 3K1NA 3VXCA 3IJOB 5JEIA 4GFRA 4JWOA 2WKYA 3LSWA 4RYAA 3TCFA 4JWXA 3ILTB 5L9MA 1Y3NA 3KGCA 4OFLA 2XX9A 1RYOA 4ZE8A 4LATA 1B3EA 4OZ9A 1RYXA 1AL3A 1BIYA 2R9JA 3FVKA 1LFGA 4LONB 1B2HA 2P2AA 3DP4A 4MLQA 2KLFA 3UN6A 5LOMA 1Y1MA 4P0GA 5M2VA 1B0HA 3V83A 2O84X 3GLBA 3QAXA 5HBCA 1YCJA 3K0VA 1B1HA 3SEVA 3TTMA 1MXVA 3SEWA 2ONSA 3L6GA 2O68A 3ECRA 3MVXA 4E0WA 1UIUA 3CIJA 5CI5A 3PMVA 1N3WA 1ZTYA 1NH8A 3K6VA 5A5XB 2XX7A 2ZNUA 3TTNA 1PB8A 4BDQA 4H65A 3DM0A 2DYXA 3LC8A 2YJPA 1Y4CA 4F1YA 2M8CA 3C34A 3CSGA 1MXXA 1WODA 4WKMA 3HPIA 1CB6A 1MRPA 1UTBB 4GL0A 5I56B 3Q26A 4G68C 2ZYKA 1M5EA 1MXYA 1JQFA 5ITPA 3U93A 1USYH 2O1MA 5H8FA 1ZMGA 3MUQA 1OLCA 2HAVA 1DPEA 1NFTA 4H6DA 1MS7A 1ATGA 3PUVE 1VE4A 4IGRA 1LSTA 5TPAA 1MY4A 2CMOA 3USDA 1Q1KA 5JTYA 2HQ0A 3T9VA 3I3VA 3THIA 4JXIA 1MM7A 3M3LA 4XTCQ 1SVXB 4IO2A 3PU5A 1FW0A 4TOZA 1B7HA 1LAFE 4GRKA 4ZEFA 2IEEA 3QSLA 4ZEIA 1JETA 4KYSA 4OHNA 4FATA 3K6XA 4HTGA 5HM4B 3FZVA 2GHBA 1MXZA 4EQ7A 2XD3A 4F1UA 3DELB 4MFIA 5TU0A 2XXYA 2DXRA 1B3HA 4KD5A 4F39A 3OOAA 3SETA 2Y7WA 3LSLA 4YMAA 4YMBA 1B3GA 3FJMA 3FV2A 2RC9A 4RXLA 2H99A 3RGYA 1QW0A 2QRYA 4ND9A 4C1TA 1ZBMA 2XXRA 1NKXA 3GXAA 4X1BA 2NUVA 4EUOA 3RN8A 1B3FA 5FHMA 1I6AA 3SEXA 1DSNA 3GZGA 1Y3PA 2V93A 4F3GA 1IXHA 3LR1A 2XXIA 2B65A 1LLSA 3MPKA 1N0TA 2RINA 3N6UA 5DYHA 3PPRA 5H8HB 2DWJA 1A99A 4OYVA 1H44A 3KJTA 4R2FA 3O6HA 2VP1A 3EPEA 1AOVA 4QRZA 3KJ7A 1SBPA 1XC1A 3RT6B 1S9TA 2ZXTA 1B58A 3OO7A 4RY1A 3K01A 3PPOA 4X9TA 1MPCA 1LB8A 2I6EA 3OELA 4U1ZA 4TQUQ 4QFNA 3FD3A 4AB6A 3EHTA 3EQ1A 4U21A 4RPOA 1JVXA 4HW8A 3UA8A 3IO4A 1PBQA 2UYEA 4F3BA 2OWTA 1MQGA 5AA3A 2P0SA 2ESNA 3VLUA 5JK4A 4NWCA 3ZSFA 3MVZA 2H4IA 3T22A 4Q5TA 4GL8A 2OWSA 3EHUA 3B6WA 5A5XA 4QFLA 1UTHA 1LCTA 3HN0A 4R2BA 4GXAA 1EH3A 3IR1A 1A8FA 3TFLA 4POXA 4FIMA 3H03A 2F78A 1Y3QA 5I56A 1M5FA 4IY6A 5B7DA 4AB5A 1FQEA 3I6VA 1WDNA 2Q8JA 3A09A 1POTA 2X7QA 4R9FA 3UIFA 2RC8A 3W9WA 2HCAA 4ELRA 3FGSA 1QVSA 3H6VA 4H1XA 3CG3A 1SYHA 3MP1A 5L8DA 3KG2A 1N76A 4IY5A 4U4SA 3PPPA 3MZ9A 3I5OA 3FATA 1TFDA 2Z8FA 4LZ7A 3S9EA 1QUJA 4OEVA 1A8EA 1YTVA 3DLNA 1O64A 1IUDA 4R9GA 2HZKA 3MBPA 2D21A 3TAJA 4OEUA 3VVEA 5KCJB 5AA2B 3SERA 4OERA 4H5GA 4M4GA 4MH5A 1LB9A 5J1DA 4ONYA 3MZ1A 1B5IA 2Y7IA 1Y9UA 2Y7PA 5CM6A 3LBSA 3TZAA 1Z7NE 1GR2A 3KOTA 4QSEA 1A54A 4G77A 4ESXA 4YB5A 1IIWA 3SDFA 3C32A 3BFTA 5FHOA 4NF8B 2I48A 3QYTA 3O66A 1DTZA 4GD5A 3EN3A 4OTEA 2XD2A 4YU0A 1DPPA 1MH4A 2QJEA 4U1OA 3ODBA 1P1NA 1L5TA 3TCHA 3O2AA 4H8IA 4ZDMA 1JEVA 4GVOA 4IO5A 4UA8A 4ESWA 3CSBA 4F22A 3G3GA 2A5SA 3W15C 1B52A 3VV5A 4ZEKA 3LUYA 2NVUB 5FTIA 4UACA 4ZE9A 5H8HA 1UIVA 1O7TA 3PPNA 2I58A 3FVGA 4DCXA 1IZ1A 4NF4B 1HSJA 3Q29A 2V3UA 1PBPA 3KN7A 4XKRA 3QK6A 3OENA 2HFBA 1OIBA 3UGWA 3C9HA 3ZKLA 2DWAA 5CMKA 3LSFB 4PQJA 3PD8A 3IB1A 5EHMA 3IORA 3OO6A 3K02A 4QFPA 3MQ9A 1PB7A 2DXYA 1N7XA 3M8UA 4NF5B 5I2KB 2Z23A 4R6KA 2HEUA 3RT8A 2ONKE 3CFXA 1GV8A 2XXPA 1OMPA 3D4CA 5AA4B 4DE8A 2QMXA 1OQHA 3H06B 2UXAA 1MH3A 3FJ7A 2P1SA 1MQHA 4F3SA 3JYRA 1MDQA 5KZTA 1IXIA 1ZJLA 3HO7A 4THIA 3OEKA 3MVYA 3U8QA 3F11A 1IXCA 1US5A 3VFJA 3R6UA 2V84A 2AL5A 2E0SA 4XKNA 3TELA 2ZNSA 1VFEA 1B1XA 5EHSA 2VD2A 4NTLA 1NNFA 3PGFA 3MVWA 3FV1A 1SQYA 3S9MC 1US4A 4KCCA 4U4XA 2F7CA 5TP9A 2E1SA 1FTKA 4DXBA 4KPTA 2AL4A 4NF6B 1LCFA 3H3GA 3H4ZA 1SDXA 4ELPA 1S7YA 4GQOA 4KYEA 2I0BA 3LSXA 3TUSA 5ICQA 1DTGA 3IO6A 3OXNA 2H5YA 4LQ2A 1YAEA 4HCWA 5L9SA 5H8NB 3FVNA 5AA2A 4BLAA 2GRVA 5H8SA 2FA7A 4F2QA 4X1DA 1II5A 2ABHA 4F3PA 3VDFA 4DLDA 4PFYA 1Y1ZA 1LAXA 1N84A 1A7LA 4BDLA 3E3KA 1HSLA 4DDDA 3ZS6A 5CMCA 5CRYA 2O69A 4F31B 1DMBA 3TTRA 3MWBA 2ZMBA 1I6QA 4I62A 4BDMA 4XIGQ 4OWDA 2VD3A 1D3KA 2YPNA 1XT8A 4YKJA 1R6ZA 2ZYNA 2FNCA 4F19A 2RC7A 3E4RA 4QSDA 4I1DA 4PFWA 4C0RA 1NNTA 2UVIA 2F97A 3AXFA 5IKBA 1GVCA 5BUUA 3VLWA 1MPDA 2RCBA 3RTFB 2QS2A 1XOCA 1TXFA 3R26A 2O51A 3RY3A 3U72A 3H6TA 3P7IA 4DCYA 1JW1A 5H8QB 1BP5A 5K2XA 4JSOA 2XXQA 4FORA 3CR9A 3OO9A 4G68B 4LVQA 3K1PA 1N7WA 4JDFA 5I59B 4X48A 4EQBA 1NH7A 2F35A 3FIRA 1Y20A 2DOJA 3A3CA 4OFOA 1H45A 5AA4A 3G7WA 5K2YA 3QUFA 3CFLA 2A5TB 2UVHA 2BJJX 4IO3A 1IQ7A 4ELOA 1MPBA 4PETA 3HHFA 4AQ4A 2XX8A 4RK9A 1QUIA 3A3UA 2XXXA 4H0WA 5I58B 2ZYOA 2Q2AA 1A55A 2V3QA 5ISUA 4ISUA 4IO6A 4G8HA 1LFIA 2OBGA 2DWIA 1P1OA 2DP8A 3HHGA 2I3VA 3BKIB 1WVJA 3OMBA 1SW1A 5AE4A 2NOOA 3PD9A 1J1NA 3IOVA 2Q9TA 1TWYA 2Y7RA 2XHDA 3G3KA 4KI0E 2THIA 1OLAA 4DZ1A 4DIGA 3ILUB 4R73A 2D5WA 4NF6A 1TT1A 3DP8A 2QPQA 4O3CA 1B5HA 4LZ5A 3TPAA 1UTBA 4N6PA 2H25A 5DVFA 1B46A 4YKKA 3KEIA 1LBCA 2DS9A 1LGBC 1LAGE 3RTWB 1BLFA 4PP0A 3OSQA 1XHYA 2RF1A 2H98A 1LBBA 4F2OA 2VHAA 1AIVA 1GTKA 4NE4A 3K00A 1R9QA 3QXMA 5DEXB 1P1WA 1JVYA 2PBWA 4QHQA 2HZLA 4XKQA 4PFTA 3IX1A 1S50A 3JV9A 4R6YA 3SEYA 3VLVA 3CI8A 2Q88A 2F7AA 2Q89A 4O3AA 1CE2A 3G3HA 5I2NB 4OFJA 1QULA 4IO4A 1MG1A 4QFKA 1M5BA 1BTJA 1EZPA 4RA1A 1YPNA 2NWJA 1QKAA 3IK6B 4EF2A 1XVXA 4F18A 3DP6A 3H7MA 3KN8A 4I8CA 3S2VA 3K6UA 3MP6A 4YZZA 5JTYB 5H8QA 2Z22A 1JNFA 2F6PA 2IA4A 1URSA 4LUBA 2W7YA 3KSJA 2OCUA 1LFHA 4G4PA 4FAJA 1FQAA 1FTJA 1Y4TA 2F5XA 3HCQA 4RJZA 3RNNA 1B4HA 2X7PA 4P0IA 3WAFA 5AA2D 1MXUA 5I59A 3T9HB 4GWOA 1Z7ME 3OD7A 4EDPA 4GXSB 1AMFA 4OXVA 2A5TA 1EZOA 1TFAA 5ELVA 2PX1A 1I69A 2F34A 3C4MA 1MY3A 4MF3A 3TDJA 1B32A 4R75A 5HPQA 2LAOA 1OVBA 2RKMA 3FXRA 1ANFA 5I58A 3PMWA 2Y7KA 3WAEA 3B6QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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