4DZ1A

Crystal structure of dals, an atp binding cassette transporter for d-alanine from salmonella enterica
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
IVEGRTLNVAVSPASPPMLFKSADGKLQGIDLELFSSYCQSRHCKLNITEYAWDGMLGAVASGQADVAFSGISITDKRKKVIDFSEPYYINSFYLVSMANHKITLNNLNELNKYSIGYPRGMAYSDLIKNDLEPKGYYSLSKVKLYPTYNETMADLKNGNLDLAFIEEPVYFTFKNKKKMPIESRYVFKNVDQLGIAFKKGSPVRDDFNLWLKEQGPQKISGIVDSWMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Characterization of DalS, an ATP-binding Cassette Transporter for D-Alanine, and Its Role in Pathogenesis in Salmonella enterica.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DalS D-Alanine transporter
molecule tags Transport protein
source organism Salmonella enterica
total genus 75
structure length 229
sequence length 229
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dz1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dz1A02
1D9VA 3IOWA 1A55A 1LB9A 2XX8A 4KQPA 4RY1A 3PPQA 3FIRA 3N6UA 4KD5A 1ZU0A 2B3FA 1LAHE 5H8SA 5FHOA 3FJ7A 5I58B 4PETA 5IKBA 2VHAA 5AA3A 2HAVA 4ESWA 5H8HA 2O68A 2Z8FA 3IJXB 5IAIA 4FEBA 2PVUA 1QULA 2ZNUA 3CSGA 3MPKA 1RYOA 3TCGA 4ZECA 3TTLA 1VSOA 5CRYA 1AL3A 4G68C 5H8QA 1SW2A 3DELB 2O7UA 4IO2A 4ISUA 4RYAA 1LLSA 4BDNA 1AH5A 3MW0A 4U23A 3M3KA 3EPEA 3IO6A 1B2HA 2F34A 4I1DA 2XXVA 2GHAA 2UVHA 2VP1A 4YKJA 4OZ9A 3T66A 2GHBA 3KZGA 3VE1B 2Q89A 2ANJA 2Q9TA 2Z23A 4YB6A 3G3HA 4ZEKA 2OZZA 1SD3A 1QUKA 1KWHA 2ONSA 2XX9A 4F3GA 3KBRA 2HCAA 4OFJA 2ZYOA 1LBBA 5CMCA 4P11A 4ZS9A 4NF6A 5I2KB 1OVTA 3M3LA 3TODA 4G8MA 4QSCA 1IIWA 1M5CA 2RC8A 4OTEA 2G93A 1ATGA 4NTLA 4G8NA 2UYEA 3EHSA 1ZIUA 4U4SA 5L9SA 4R6YA 3MP1A 4XIGQ 5DTBA 1MPCA 2OWSA 3T9VA 3ZKKA 3GBAA 5AA4A 2H9BA 3PGFA 1B40A 3MVZA 3CG1A 1I6AA 1POY1 2I48A 3G3KA 1IXCA 1URGA 4H5GA 1MS7A 4OFOA 2O84X 4ZZEA 4DDDA 4Q0CA 4GF8A 3PUYE 3TQWA 1S9TA 3CVGA 5DYHA 3UN6A 3GLBA 2XXHA 5ITOA 5B70A 3BFUA 3RT8A 2ALUA 1EZ9A 1USYH 3LSLA 1SW4A 4AB6A 2QMWA 3O28A 3V83A 4G77A 4LP2B 1NNPA 5I84A 1UTBA 4R2FA 5KZTA 2OBGA 2Y7KA 3E4RA 5HBCA 5ISUA 4GD5A 1O7TA 3ILUB 3FV1A 3MZ9A 1US4A 4NF5B 3CRBA 4DXCA 2R71A 4Z7EA 3FVNA 3QYTA 5A5XB 2ESNA 3B6TA 1FQDA 4G68B 4DZ1A 3JYRA 4E0WA 2H4IA 1DPEA 3PD9A 3ZKLA 4O3CA 1WODA 2P1SA 1A7LA 3KN7A 1B7UA 1H45A 4Q30B 4I8CA 1P1WA 1FQEA 1B5IA 3KOSA 4RXLA 5FTHA 2BJJX 3UK4A 3IB0A 1NNTA 1VFDA 3CIJA 4PFUA 1BTJA 1N7WA 4OHNA 4JWXA 5KCJB 3N94A 3EQ1A 3FVGA 4KYSA 1I6QA 3T22A 5KDTB 2PBWA 5CBRA 2DWHA 5AA2D 1JW5A 2ONRA 1Y3NA 1MPBA 3VLVA 4JSDA 3RUMA 1M5BA 3TCFA 3OELA 3KFMA 1LSTA 3E3KA 4XKQA 4GXSB 2DXYA 4EF2A 1L5TA 3DP8A 3LBSA 2FA7A 1B1HA 1ZJLA 3MWBA 1QW0A 3PUZE 2DS9A 3MAMA 4HS7A 1O63A 2Q88A 3QSLA 4FJPA 1A8EA 3U72A 3N6TA 4ELOA 4OVJA 2WKYA 3VVEA 1FW0A 4H8JA 3SDFA 2F8DA 1B0HA 1XHYA 2UYFA 3C9HA 3DP6A 4IB2A 4GFRA 4QFPA 2O1MA 2PT2A 2V3UA 1IQ7A 2RC7A 3IOTA 2XXUA 3C4MA 3JV9A 4P0GA 1LGBC 3K4UA 1B3FA 4MFIA 2HZLA 2FYIA 2QJEA 3K1PA 1H76A 3QIMA 5DT6A 3K0VA 3A09A 1GR2A 5H8FA 3UP9A 1VFEA 3UORA 3FASA 3RY3A 3H6WA 1P99A 3E13X 4M4GA 4N6PA 3RNNA 2AL5A 1Y1ZA 4EXKA 3GZGA 2F6PA 4XKNA 2OJTA 2Y7PA 5JEIA 1LAFE 3OEKA 1NKXA 1N0TA 2F7AA 5DEXB 4DE8A 5I2NB 5F7VA 1GGGA 1R1NA 1JQFA 5L8DA 3LSXA 2D5WA 1Y9UA 3C33A 3PU5A 3IORA 3OO6A 3TEPA 3KJ7A 1N3XA 3K1NA 3R26A 4X1BA 3I6VA 1N04A 1SQYA 2I0BA 2V3TA 2GH9A 4R6HA 1MM6A 1B46A 2P0SA 2HFBA 1JNFA 3UIFA 1O64A 2DE2A 3ECRA 1II5A 2RCAA 4R9FA 4HTGA 2Z8EA 5AA1A 3IB2A 1CE2A 1I6BA 3BBRA 2DQVA 4KPTA 4BDRA 3BKIB 4EXLA 3JZJA 2XHDA 5JTYB 1MXUA 3RGYA 1JETA 2VGQA 3RN8A 4ELPA 3FXQA 4YMAA 3KEIA 3DLNA 4NF4B 4QRZA 1SW5A 4R72A 5I57B 3QK6A 4O3BA 1N3WA 2DWAA 2ONKE 5I58A 2XX7A 3VLUA 3F11A 3BFTA 2I6EA 2IA4A 3PMWA 2ZYMA 3VDFA 5EHMA 1TXFA 1T0KA 5K2YA 3C34A 1MPDA 4F19A 5EHSA 3W9WA 5DVFA 4ZE9A 3U1OA 1B52A 3CFLA 1XS5A 1SW1A 3E9XA 2QS1A 4XTCQ 4PFTA 2V25A 2YLNA 1MY1A 3PMVA 1QVSA 4FE8A 1NMUA 2DYXA 1IEJA 2O7IA 3TELA 4QHQA 2YJPA 4PFWA 3TQLA 3B7DA 4PFYA 1B58A 4P0IA 1R9LA 3UGWA 3OSQA 1PEBA 4N13A 1SVXB 1TFDA 4GRKA 1D3KA 4LQ5A 3FD3A 4NWCA 3OO8A 4OESA 4KHZE 4X48A 1M5FA 3CI8A 5FTIA 1DOTA 4QSEA 3LSWA 1PBPA 3KOTA 1SYIA 1LB8A 4Q5TA 3RLFE 2F5XA 4YMBA 1P1QA 3OMBA 5I2KA 2FNCA 4ZDMA 1IUDA 3QUJA 4MLVA 3T93B 4ZEIA 3ZS6A 1Y3PA 2UVJA 2NVUB 2XXPA 3OO7A 3HN0A 3QXMA 2HXWA 4LUBA 1DSNA 1QKBA 1Y20A 2KLFA 1MG1A 4MLQA 1BP5A 1DPPA 4JDFA 4C0RA 3WAEA 1ZLQA 4DXUA 1GVCA 2NXOA 1B3GA 5AE4A 4BDLA 4I62A 3KSJA 3LSFB 5K2XA 2D21A 1UTHA 1FCKA 4R6KA 4ESXA 2HEUA 5DVJA 2XXQA 3OXNA 1BIYA 3O2AA 4QF9A 1Z7ME 2DVCA 3A3UA 1MQIA 4RK9A 3TTMA 4U22A 3O9PA 3A3CA 2A5SA 4HCYA 1JVYA 4NF5A 4FECA 4LVQA 4G68A 3CFXA 2H25A 3Q26A 3W9VA 2O6AA 2UVIA 4YZZA 5JK4A 3MQ9A 4E0XA 4R9GA 2O51A 1PDAA 1N76A 2VD2A 3QAXA 2XXIA 3D4GA 1PC3A 3HHFA 1P1UA 1MXXA 3CSBA 3RPWA 4GLIA 2DSFA 1YTVA 2RINA 1B4ZA 2H98A 1PB8A 5KCJA 1DTGA 4NF6B 2ZNSA 3ZSFA 1B5HA 3O6GA 4GL0A 2OWTA 5KDTA 3PUWE 5AA2B 4O3AA 5H8NB 4XKRA 1OQGA 3S4UA 2VD3A 4C1TA 1XVXA 2NWJA 3FVKA 2M8CA 1ANFA 2F97A 1IXGA 4NF8B 2B3BA 4RA1A 3TFLA 5CMBA 1MM7A 1H43A 4YU0A 5TP9B 1URSA 3SKPA 1MXYA 5FHMA 3H6UA 2QRYA 4QFOA 5CMKA 4HCWA 2V93A 1YCJA 3TDJA 4OERA 3O29A 1B32A 4U2RA 2CMOA 4ZZAA 3OEMA 4UACA 3SERA 4BDQA 3O6HA 3I3VA 1B4HA 3D4CA 1HSJA 3CFZA 5B7DA 1OLAA 2I49A 4GXAA 4ECFA 1IXIA 4FORA 3K6WA 4OEUA 1XC1A 3MVWA 4U1ZA 3UA8A 4F39A 4KR5A 4RK2A 3FJMA 3M8UA 1YAEA 4F1YA 4YB7A 4ZEFA 4H0WA 4TLMB 4PP0A 3MVYA 4RNSA 4F31B 3IOUA 4ZEDA 4ZE8A 5F1QA 4LZ5A 2DXRA 3IR1A 1B3EA 3MZ1A 4H8IA 1JW1A 2HQ0A 2Y7IA 2PYYA 3PMXA 1H44A 4AQ4A 3U94A 4YB5A 2V3QA 4KYEA 3LR1A 3TTRA 5DEXA 1Q35A 3M3FA 3K6VA 4JWOA 5I2NA 3SEVA 4XKPA 3IX1A 2Q2AA 1SBPA 4F1VA 2ZMBA 5TPAB 1BKAA 4JWYA 3FXRA 4Q8RA 4F3PA 1RKMA 4R2BA 4QSDA 1AMFA 2V84A 1MQJA 4OETA 2A5TA 3B6WA 2QL3A 2RCBA 3OSRA 5L9OA 3P7IA 1PB9A 1DMBA 4IO6A 1Y3QA 4LATA 3GXAA 3USDA 3FATA 4F3SA 2AIXA 3Q28A 4GQOA 3VV5A 4LA9A 5ELVA 4BLAA 1IXHA 4G2ZA 1FQCA 1IZ1A 3G3IA 5I56B 3I5OA 3C32A 1JW4A 4FEDA 4WEDA 4DCXA 5JTYA 1FTMA 1MY3A 2F35A 4EQBA 3V89B 1EZOA 3O6IA 3N26A 3K1MA 3MP8A 4NF4A 1LCTA 3MJNA 4LZ8A 2VOZA 1Q1KA 1CB6A 2QS3A 1OVBA 3MC2A 3MZBA 2DWIA 3PUVE 1NNKA 2AL4A 1LFGA 3SEXA 4WEPA 2I3VA 5DVIA 2I58A 5EYFA 4DCYA 1FTKA 1B9JA 3HV1A 5I59B 1D4NA 4DXBA 4IY5A 3Q29A 1GTKA 3G3JA 1SI1A 3IO4A 3S9NC 1FTOA 1JVXA 2I4BA 1WDNA 4WXJA 4QFNA 4OFLA 4F2QA 3SEWA 4JXIA 3T9HB 4IO3A 2UXAA 1B6HA 1TFAA 1R9QA 4GIZA 1P1NA 3DM0A 3PPNA 3Q27A 1DTZA 3FGSA 1ZTYA 1Y4CA 1MH3A 3U93A 1MXZA 4EUOA 3FXUA 4RPNA 2I3WA 1XOCA 1AIVA 1A99A 2THIA 4WKMA 2IEEA 3DP4A 2Z22A 5M2VA 3TUSA 3S2VA 2W7YA 3LUYA 4M1VA 3OO9A 1A40A 1UQWA 4NE4A 4FIMA 2Y7RA 4H1XA 4OENA 1VR5A 3HPIA 3MPLA 1MH4A 1ZMGA 2X26A 5CC2A 1H3DA 3SETA 1MDQA 1MQGA 1OIBA 1GV8A 1I69A 4H65A 4IO7A 4U21A 3PV0E 2Q8JA 1US5A 1MY0A 3R7XA 4POXA 3K6UA 4IGTA 3S9LC 3HCQA 1AOVA 2GFEA 5ITPA 1NL5A 4PQJA 3OOAA 3VLWA 1MRPA 5CM6A 4OXVA 4RPOA 2Y7WA 2RF1A 3PUXE 1SI0A 3H06B 4OEVA 3VVDA 4JSOA 5CMMA 2QS2A 2ZNTA 1M5EA 2QMXA 1OMPA 3TAJA 2HAUA 2QSXA 2XXRA 4R75A 4GVOA 3ILTB 3H6VA 5H8HB 3FVOA 1HSEA 5ICQA 3WAFA 2ZYKA 4G4PA 1D9YA 2NOOA 1MY2A 5H8QB 2ZXTA 1LCFA 1QJMA 3Q25A 4NWDA 4GOTA 2XD3A 2OLBA 1B05A 5A5XA 5AA2A 3U92A 3H03A 1LAXA 5H8NA 4GWOA 4KYDA 1LFHA 2XD2A 3C36A 3SEUA 1FQAA 4NMYA 2H99A 3EHTA 1MXVA 4NF8A 3H6TA 1R6ZA 1B0LA 2OK2A 5TP9A 4THIA 2XXXA 4MF3A 4UA8A 1IITA 4LONB 5HPQA 2Z8DA 1NH7A 5BWJA 4R73A 2GRVA 5ICTA 1URDA 1J1NA 4QFKA 2X7QA 1FTLA 1UTHB 4NEDA 1MY4A 3TKDA 2R9JA 3TTKA 1TT1A 4IO4A 1Y4TA 4IGRA 1EZPA 1EH3A 1ZBMA 4OWDA 3IK6B 4TLLB 5AA4B 1ELJA 2E1SA 2NUVA 3EHUA 2REJA 5FHNA 4U4XA 1LAGE 3VXBA 4JBZA 5CI5A 2DVZA 1QUIA 1XVYA 2PMSA 2G29A 4X1DA 3VFJA 1B5JA 1SYHA 4Z0IA 3TCHA 3K00A 1XT8A 1JEVA 3QUFA 3TMGA 4H67A 2DP8A 3VVFA 5LOMA 4EQ9A 4IY6A 2REGA 3K2DA 2B65A 1B3LA 2R6GE 1UTBB 3IJOB 2AYSA 3PPRA 3PPOA 3H7MA 4HW8A 3G7WA 4YKPA 3W15C 1HSLA 1MXWA 3CR9A 2RKMA 1NNFA 2E0SA 2O1LA 3K02A 4KFQA 4ONYA 5L9MA 5TPAA 1N7XA 1B51A 3OENA 4F1UA 1UIUA 4K3FA 3VXCA 3K6XA 4YICA 1B7HA 1F9BA 2H5YA 1S7YA 2LAOA 2Y84A 1USYE 1UIVA 2F7CA 1A8FA 3H3GA 4H5FA 5BUUA 3S9EA 5TU0A 4OQOA 3MVXA 4MH5A 4XXUA 2PT1A 2DOJA 1BLFA 3L6HA 4POWA 4TQUQ 3FZVA 1ZKBA 4F3BA 3CG3A 1PBQA 2QPQA 3TTNA 4BDMA 3K01A 1OLCA 3G3GA 2UVGA 5I56A 1WVJA 2CZLA 2ABHA 5CBSA 2I0CA 4AB5A 1SDXA 2YPNA 4YKIA 3IL1B 1LBCA 3S9MC 3ONMA 3RTFB 2XXTA 3FUZA 2P2AA 4ELRA 3FV2A 4C1UA 2PX1A 3C35A 4I9DA 3L6GA 3C31A 1MQHA 1PB7A 3RT6B 4X9TA 3PD8A 4ELQA 4LQ2A 2F7BA 4ND9A 4FATA 1QUJA 2F36A 5I59A 3T96B 2HZKA 3LC8A 1N84A 1FQFA 3KSXA 4RJZA 3O97A 4YKKA 3T9UA 2OCUA 1JEUA 3V5AA 1POTA 4H6DA 1OQHA 4ZEBA 1S50A 4PE5B 4F29A 3IB1A 3U8QA 3T9XB 3H4ZA 3G3FA 1Z7NE 4IO5A 3MBPA 4KI0E 4FAJA 3KG2A 4EDPA 3EF7A 5H8FB 3O66A 5I57A 3KN3A 1FTJA 3TPAA 2O69A 3R6UA 3HO7A 4OMBA 4EQ7A 3V8XB 2A5TB 3KN8A 2XXYA 1EU8A 3MP6A 1A54A 2DE4A 2Q2CA 4JB7A 4DLDA 4G8HA 4R74A 3KGCA 3GBBA 2F78A 1LFIA 1VE4A 4QFLA 1B1XA 3KJTA 3AXFA 2DE3A 4N07A 3TZAA 2QS4A 4F18A 4YAHX 1YPNA 4LZ7A 1M5DA 1B3HA 3IAZA 1RYXA 3MUQA 5J1DA 3PPPA 2D3IA 3IOVA 2DWJA 4BDOA 2X7PA 4GL8A 3THIA 3HHGA 1TWYA 1B7ZA 2XXWA 3EN3A 3FJGA 3OD7A 3RQTA 3B6QA 2ZYNA 4KCDA 3TYHA 2RC9A 3ODBA 2F6GA 4OYVA 4U1OA 4TOZA 1P1OA 1NH8A 2I4CA 3RTWB 4EF1A 5HM4B 4F2OA 1MDP1 3SESA 4DIGA 1FQBA 3N5LA 4MBPA 4L17A 4F22A 1NFTA 1MQDA 1QKAA 3SEYA 4KCCA 1Y1MA 3HSTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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