4ELRA

Ferric binding protein with iron and carbonate
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
310
structure length
310
Chain Sequence
SPTLTIYSGRGQSLVEPLVKQFEAETGIRVQVRYSTDAQILAALQEEGSRSPADLFWANTAGALGQASAKGLLRPLGETLLEKPIAFVPASRTWVPVTVRLRVLAYNPDRIKAEELPESLLDLPRFAREKGLVGRVGWTPTYSSFQDMVAGMIALYGEEKTREWLLAMKALAPKAYPSNPAMLDAIRAGEVDLGSTNHYYVVRFRRAGYRLGMHHFRDGDAGNLALVTGAGLLKTSKNLAAATRFLTYLLSPQAQQYFVGNIGEYPLVKGVALDPNLLPLEEALAKSPKLDLEKLPLDRALRLLRETGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal transport
source organism Thermus thermophilus
publication title Crystal structure of ferric binding protein A
rcsb
molecule keywords Iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein
total genus 108
structure length 310
sequence length 310
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4elrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4elrA02
2REJA 2HZLA 3MZ9A 3OELA 3S9LC 4MF3A 3CIJA 4YB6A 5CMCA 3PPPA 4FE8A 2NVUB 1B3HA 3U8QA 3SEYA 5I59A 2AL4A 3H6TA 2HFBA 3TFLA 2V84A 4DE8A 3VXCA 4G68A 4P0GA 2F97A 4MFIA 3TTKA 5TU0A 1MS7A 1UIVA 3I6VA 4GVOA 2ZNUA 1SD3A 3MBPA 4F3SA 3S9EA 3H3GA 2YJPA 4H5GA 2B3FA 2F36A 1M5CA 1MH4A 3SEWA 2RC7A 2OBGA 5FTHA 5H8NA 4G8MA 4PFUA 1BLFA 1FQEA 3RT8A 1H45A 4F1UA 4OERA 5LOMA 4L17A 4U4XA 1SW4A 2O84X 4U1OA 4KR5A 3G7WA 3V5AA 5DEXA 2G93A 3TQLA 3PPNA 3OXNA 5J1DA 1POTA 2QJEA 1VR5A 4U22A 4R2BA 4Z0IA 2Y7IA 3K1MA 4Q30B 4XKRA 3K6VA 3L6GA 2HQ0A 1EZ9A 1Y4TA 1J1NA 5BWJA 3V8XB 3ECRA 3MQ9A 3OO8A 4AB5A 3SDFA 4PQJA 3Q29A 1MM6A 3OSQA 4GXSB 2XXPA 3RTFB 3IORA 4AB6A 3IJXB 1AIVA 4POWA 2HCAA 3K4UA 1M5DA 3FXUA 1H43A 1MDP1 2ABHA 1EU8A 3CRBA 1D9YA 4OEVA 4P0IA 1HSLA 1A8EA 3K6WA 4NF8B 4TQUQ 1IXGA 3SEVA 2ONSA 2UXAA 4IB2A 3T9HB 3LSLA 4H8JA 1MPBA 3U94A 3R6UA 1URGA 3MJNA 4TLLB 4LZ5A 1TT1A 1N7XA 3E4RA 5DVFA 2I48A 4JSDA 3BFUA 5FHOA 1OVTA 1I6AA 1B3FA 2ZMBA 1PDAA 3FV1A 3OENA 1IIWA 4OYVA 1EZPA 1MH3A 3TDJA 1Y3PA 2YPNA 4NWDA 3MP8A 4BDQA 5DYHA 2O51A 3MZBA 1LCFA 2REGA 1S7YA 2ZYMA 3OEMA 2B3BA 4JWOA 1QULA 3S9MC 1DPPA 3N26A 3FJ7A 4MLVA 2QMWA 3IOWA 3DP6A 4ZDMA 1A54A 3UIFA 1MY0A 5L9MA 5CC2A 1TXFA 4IO3A 1Y1MA 3IB1A 3MP1A 4YMBA 1B1HA 1BTJA 4ELPA 3MPKA 4NF6B 3AXFA 3PPRA 1SVXB 4FEBA 3TUSA 4DCXA 1AL3A 2FA7A 2A5TA 3UN6A 2PYYA 1Y1ZA 1M5BA 4QRZA 5AA3A 1LCTA 4OFLA 3E9XA 4KPTA 4JDFA 3TQWA 1RYXA 1SI1A 2XXQA 1MQHA 1R1NA 2R9JA 3H06B 3D4GA 5TPAA 4ZECA 3C9HA 1H44A 3OD7A 2PT2A 3RN8A 1D4NA 1ZJLA 2I58A 1LFHA 3Q25A 3S2VA 3ZS6A 5ITPA 5I56B 2X7QA 2F5XA 4N6PA 3UA8A 1XVXA 4IO4A 1JETA 2OWSA 2UVGA 1MM7A 2Y7KA 1SW1A 4H5FA 3G3JA 4GL0A 3N6UA 4KYEA 3H6UA 3FJGA 4KFQA 4ELRA 4F1VA 4KCDA 1O64A 4X48A 3O2AA 4F31B 2A5SA 2PT1A 3OSRA 4BDOA 4JWYA 4YMAA 4XKQA 4F3GA 1XOCA 2I4CA 1NH8A 3VE1B 2QRYA 4IO2A 2ZXTA 2VP1A 2DE2A 4QFOA 3EN3A 4EF2A 4XKNA 1NFTA 2UVJA 1Z7NE 4WEDA 1FQDA 4GL8A 2QPQA 1WDNA 5FHMA 3WAFA 1O7TA 1PBPA 1MRPA 3KOSA 4JWXA 3RY3A 3C4MA 2NXOA 4C1TA 3PUZE 1QUJA 1IITA 1R6ZA 1PBQA 3W9VA 4I8CA 1OQHA 2ZNSA 1M5FA 4G2ZA 2Y7WA 3TTRA 2E1SA 3EHUA 1GVCA 2F7AA 1YPNA 1ZKBA 4EXLA 1H3DA 2AIXA 1JW5A 3IO6A 4BLAA 2H25A 3KFMA 2V3QA 1I6BA 2I0CA 4EQBA 2DXRA 4F2QA 1H76A 1B05A 1MG1A 3Q27A 4DZ1A 2DQVA 3BBRA 3S9NC 3PMVA 3MVXA 5H8FB 4ECFA 3CSGA 3K01A 2HXWA 3O97A 4JXIA 2X26A 3TCHA 4MLQA 1Y4CA 1ATGA 4QFLA 3H7MA 3K1PA 3KJTA 2THIA 5K2YA 2Y7RA 3W15C 3FD3A 2B65A 3KN3A 1B1XA 4ND9A 5IKBA 4EQ9A 4RA1A 3O66A 3TTNA 1YTVA 1SI0A 3QSLA 2IA4A 1Y3NA 1P1NA 4IO5A 2UYFA 3PV0E 4PE5B 4R9FA 4LATA 4E0WA 1F9BA 3LSXA 5ICQA 4HCWA 3USDA 1LFGA 3HCQA 5M2VA 2XX8A 1OQGA 3EHTA 2O7IA 1PB9A 1FTMA 5I2NB 1UTHB 3LR1A 2H98A 5CM6A 2O1MA 2OK2A 2D3IA 2IEEA 4X1BA 1PB8A 4O3AA 2OLBA 4H8IA 4KD5A 3QUJA 5FHNA 5AA1A 1VSOA 1LFIA 3PPQA 4ZEDA 1DSNA 2RF1A 3PU5A 1ZBMA 4YKPA 4YKIA 3VV5A 2ONRA 3TAJA 4YAHX 3CFLA 5I58B 3SEXA 1QUIA 4RPNA 1JW4A 3MWBA 4ZEFA 1PB7A 2XXYA 4NF6A 1US5A 5F1QA 4M1VA 1P1WA 1MDQA 5L9OA 4ZE9A 1B5HA 1OIBA 2RCAA 4IY5A 5KCJB 2ONKE 3U1OA 3M3LA 2F78A 3OEKA 3OMBA 3W9WA 2KLFA 1II5A 3IX1A 4EQ7A 4JB7A 4GOTA 3DM0A 4Q8RA 2DWAA 3R26A 4ZEIA 1S50A 3TTLA 4F3BA 3KSJA 4MBPA 2XXVA 3K1NA 1LAFE 4GQOA 5KDTB 3FXQA 3HV1A 5I56A 3SEUA 4K3FA 3TZAA 4DCYA 1I6QA 4PFYA 1B32A 3GLBA 4EDPA 5A5XA 1FCKA 1B0LA 3P7IA 3QYTA 4DIGA 2I6EA 3OO7A 2ALUA 2H9BA 2F7BA 3SERA 3HO7A 4LA9A 4OVJA 4KCCA 1BKAA 3T9XB 3MC2A 2O7UA 3HN0A 4RYAA 3A3UA 3Q28A 4DXUA 1MXUA 4XIGQ 3HPIA 3ZKLA 4GXAA 3I5OA 4ZS9A 3CSBA 3V83A 4H67A 1N04A 1MXVA 1IXHA 1CB6A 1GTKA 3EQ1A 3Q26A 2NOOA 4ISUA 2H5YA 1OMPA 5B7DA 2DWIA 5DTBA 4NMYA 5IAIA 1B51A 1NNKA 4FATA 2DP8A 3IB2A 4F2OA 4GIZA 5L9SA 4G77A 4Z7EA 1DPEA 4NEDA 2F35A 5F7VA 3RUMA 1B7ZA 4OTEA 4F3PA 3SESA 3OO6A 4U1ZA 2V93A 1B3EA 2NWJA 1FTOA 3PMXA 4GLIA 3O6IA 1MY3A 4NF5B 4F18A 4BDMA 2ZYNA 1B40A 5ELVA 4BDLA 1M5EA 1LAHE 5AA4A 3FZVA 4HCYA 3U72A 5I2KA 4HW8A 4P11A 5AE4A 3FUZA 3FASA 4G68B 2OZZA 2I3VA 3E3KA 4H6DA 4ZZAA 1D3KA 3JV9A 1B6HA 1GGGA 1B46A 3FV2A 1FQCA 3VFJA 3QAXA 1SW2A 5HM4B 2O1LA 1ANFA 2Q2AA 3GXAA 3IOUA 1MY2A 3PUXE 4IGTA 2V3TA 4YKKA 5TP9B 2ZYOA 1P1QA 1MY1A 4RK2A 3LSWA 4U2RA 5EHSA 3A3CA 2PMSA 1MXZA 1R9QA 2DWJA 1LLSA 3C35A 3QK6A 5K2XA 3MAMA 3T93B 1UTBB 4X1DA 4KYSA 4QF9A 4RK9A 5AA2B 2D5WA 4LZ8A 4PFWA 2M8CA 3PUWE 3O29A 3PPOA 4WKMA 1IZ1A 1P1UA 1MXYA 5B70A 4NF4B 3I3VA 3UORA 4AQ4A 1URDA 2P0SA 1B7UA 1MXWA 1B9JA 4EF1A 3FGSA 4ONYA 5L8DA 5H8HA 2WKYA 1FQAA 3RNNA 3FVKA 2ZNTA 3H03A 1I69A 5CMMA 4G8NA 1SW5A 1P1OA 1Z7ME 3IAZA 4QFNA 5I2NA 4PETA 4OQOA 3H4ZA 1B52A 2DSFA 3U93A 3O28A 3M8UA 3PUVE 1N76A 3TKDA 1LB9A 1HSEA 1ZLQA 3KGCA 4NE4A 2GHAA 2DOJA 1IQ7A 2DVCA 4NTLA 3IO4A 1A7LA 1N3WA 3B6TA 4HTGA 1B2HA 1SQYA 4THIA 3RTWB 2H4IA 4ZEKA 5EHMA 2I0BA 2XXUA 3K00A 4G4PA 1LAGE 3CI8A 4ZZEA 3O6GA 4QSEA 5I58A 3GZGA 1KWHA 3TCGA 3O6HA 4LONB 4OFOA 4ELQA 3MPLA 3S4UA 1AMFA 3DP8A 1N7WA 3VVFA 4R9GA 2W7YA 2QMXA 5KCJA 2RINA 1YCJA 3FVGA 3KBRA 4YICA 3D4CA 3FATA 1MXXA 4R75A 2QS2A 2R6GE 1JVYA 3TELA 3EHSA 2FYIA 2DE3A 4IGRA 3SKPA 5KDTA 4I1DA 2YLNA 3MVZA 4R74A 4YB7A 1DOTA 3MUQA 3M3KA 3BFTA 3LSFB 4F19A 1IXCA 5HBCA 5ICTA 3HHGA 4M4GA 5CMKA 2R71A 1POY1 4DLDA 3L6HA 2HAUA 3THIA 3TODA 4ZE8A 2Z8EA 4Q0CA 1PEBA 2VD2A 3C33A 3M3FA 1URSA 4OETA 3MW0A 4OENA 3QIMA 4NF8A 4YKJA 4QSDA 4JSOA 1LB8A 2QL3A 3RT6B 3N94A 5JEIA 1QKBA 4GFRA 2DXYA 1NNTA 2Z22A 3KOTA 3ONMA 2BJJX 1FTKA 2F8DA 1IUDA 3PGFA 3KZGA 2AL5A 3FXRA 1B58A 4KHZE 2F6PA 1XT8A 4RPOA 1FW0A 1OLCA 2CZLA 4R2FA 3TYHA 4F29A 3O9PA 4KQPA 4NF5A 4EXKA 4OWDA 2E0SA 1S9TA 1JNFA 3EPEA 2HZKA 2ZYKA 4TLMB 5CMBA 1T0KA 2FNCA 3QXMA 2V25A 4UACA 2Z8FA 4UA8A 4MH5A 1GV8A 2UVHA 1MQJA 1BIYA 3KJ7A 3DELB 1RYOA 4WXJA 5H8QB 3KEIA 3B6QA 1UIUA 1B4ZA 2P2AA 3T66A 1NMUA 1HSJA 1VE4A 1LGBC 2OJTA 2CMOA 1Y20A 4DXBA 5TP9A 4XTCQ 1QW0A 3R7XA 2I49A 4I62A 3A09A 2H99A 2Q9TA 1US4A 3KN8A 3U92A 3K6UA 1QKAA 4OMBA 3JZJA 4F1YA 2RCBA 4U4SA 3N6TA 1TFAA 1ZMGA 1XS5A 1WODA 5I57B 1Y9UA 4FECA 4TOZA 2VD3A 3VLUA 1UTBA 2DE4A 3PUYE 5AA2A 1USYE 2F6GA 1IXIA 3KN7A 3IL1B 4ESWA 2XXHA 3UK4A 1NNFA 2GFEA 3CVGA 2PX1A 4NWCA 1ZTYA 1JEVA 1DTZA 2XXRA 1SYHA 4NF4A 1FQBA 4QFKA 1JEUA 4OESA 4LQ5A 4POXA 4R72A 3G3KA 3RLFE 3JYRA 1B3GA 3K2DA 3ODBA 3IR1A 1ZU0A 4XXUA 5JTYB 4BDNA 4FORA 2I3WA 3ILUB 1VFEA 1MQDA 3PD9A 1SDXA 5AA2D 1N0TA 1PC3A 3KG2A 3V89B 1B3LA 2X7PA 5CBRA 3K02A 2Q89A 4HS7A 4U21A 3G3FA 1SYIA 2QS3A 3TEPA 4YZZA 2XXWA 3UGWA 3TMGA 1SBPA 3UP9A 2XXIA 2F7CA 5I84A 1GR2A 4YU0A 4PP0A 2GHBA 4QSCA 2XD2A 3BKIB 1LAXA 3B6WA 2RKMA 3CFZA 4H65A 2XXXA 4FAJA 4GWOA 4IO7A 4C1UA 4OXVA 2HAVA 4LZ7A 2DWHA 4LUBA 3T22A 2OWTA 4OHNA 1LBCA 5I59B 1EH3A 3DLNA 1B5JA 2VOZA 4KI0E 2UYEA 4OFJA 3VVDA 1A40A 3B7DA 4IO6A 3CG1A 2XXTA 2Q88A 3IK6B 4OZ9A 1YAEA 1QVSA 5H8FA 1B5IA 1VFDA 3LC8A 4QFPA 3DP4A 5DVJA 1FQFA 5CBSA 2O68A 2XHDA 4FJPA 1B0HA 5H8NB 3RQTA 3G3IA 1XC1A 3GBAA 1USYH 4N07A 4JBZA 4RNSA 3K0VA 3C34A 1LBBA 3N5LA 5DEXB 2GRVA 2ESNA 1B7HA 1BP5A 1CE2A 1XVYA 4LQ2A 2QSXA 3ZSFA 1TWYA 1MY4A 2DS9A 3IOVA 2QS4A 1ELJA 1L5TA 1MPDA 4O3BA 2QS1A 4G8HA 4E0XA 1QUKA 3TCFA 5CRYA 1RKMA 1JQFA 3G3GA 1XHYA 5A5XB 2G29A 1A99A 2P1SA 4LVQA 3PD8A 1D9VA 2F34A 3FVNA 2ANJA 1AOVA 2O6AA 4WEPA 4G68C 3VXBA 3ZKKA 1MQGA 4YB5A 3IOTA 4H1XA 1JW1A 5DVIA 4GF8A 2XX7A 1UTHA 3HHFA 5CI5A 3ILTB 5H8SA 2Y7PA 4I9DA 3MVWA 3VDFA 3VLWA 1QJMA 1UQWA 1A55A 1JVXA 2HEUA 2I4BA 1IEJA 4X9TA 2OCUA 3OOAA 1FTLA 4R6KA 1ZIUA 4C0RA 1Y3QA 5ITOA 1AH5A 1B4HA 4H0WA 4RXLA 2VHAA 1N84A 3KSXA 4QHQA 1A8FA 1MPCA 5H8QA 1LSTA 5DT6A 3K6XA 3MVYA 3F11A 3C31A 3G3HA 1FTJA 5FTIA 2RC9A 4FEDA 3WAEA 3H6VA 4DXCA 4ZEBA 4R6HA 3IB0A 4EUOA 2D21A 3TTMA 2VGQA 4BDRA 1Q1KA 2DYXA 3CR9A 3T9VA 4R6YA 3EF7A 4XKPA 5AA4B 4R73A 4IY6A 1Q35A 1MQIA 3FVOA 5I2KB 5EYFA 3VVEA 1TFDA 5KZTA 2RC8A 3C32A 3LBSA 4GD5A 5I57A 4LP2B 3T9UA 4ELOA 3E13X 1NNPA 1O63A 2GH9A 4PFTA 4OEUA 2NUVA 1DTGA 4DDDA 4KYDA 3TPAA 1NKXA 1DMBA 2A5TB 4Q5TA 1WVJA 2XX9A 1OVBA 2O69A 3VLVA 3FJMA 3QUFA 4N13A 3MP6A 3FIRA 3IJOB 3CFXA 3PMWA 2Q8JA 1NL5A 3MZ1A 4U23A 5BUUA 5TPAB 3GBBA 2Z8DA 1OLAA 3H6WA 2DVZA 2Q2CA 4RY1A 3HSTA 2PBWA 2XD3A 5HPQA 1NH7A 2AYSA 2LAOA 3C36A 3RGYA 5JTYA 4GRKA 3RPWA 5JK4A 3OO9A 1N3XA 2V3UA 3SETA 1R9LA 4F22A 3CG3A 4FIMA 3T96B 1EZOA 2Y84A 4ESXA 2Z23A 4O3CA 4F39A 5ISUA 2PVUA 3LUYA 1P99A 5H8HB 2UVIA 4RJZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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