4ELRA

Ferric binding protein with iron and carbonate
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
310
structure length
310
Chain Sequence
SPTLTIYSGRGQSLVEPLVKQFEAETGIRVQVRYSTDAQILAALQEEGSRSPADLFWANTAGALGQASAKGLLRPLGETLLEKPIAFVPASRTWVPVTVRLRVLAYNPDRIKAEELPESLLDLPRFAREKGLVGRVGWTPTYSSFQDMVAGMIALYGEEKTREWLLAMKALAPKAYPSNPAMLDAIRAGEVDLGSTNHYYVVRFRRAGYRLGMHHFRDGDAGNLALVTGAGLLKTSKNLAAATRFLTYLLSPQAQQYFVGNIGEYPLVKGVALDPNLLPLEEALAKSPKLDLEKLPLDRALRLLRETGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of ferric binding protein A
rcsb
molecule keywords Iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein
molecule tags Metal transport
source organism Thermus thermophilus
total genus 108
structure length 310
sequence length 310
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4elrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4elrA02
3UIFA 5KZTA 2D5WA 1JW1A 3P7IA 1H44A 2F7BA 1DPEA 5HM4B 4YICA 1ZMGA 1P1QA 3TCFA 5H8HA 2O1LA 3T96B 4WEPA 1IIWA 4ISUA 1N04A 4ELOA 2V84A 4X48A 4KHZE 5KCJA 1VR5A 3OEMA 4EXKA 1B51A 3KJTA 1PC3A 5ISUA 3RTFB 2XXWA 4OFOA 4C1TA 1MXYA 5I57B 1LFIA 5ELVA 2NWJA 3MVWA 2E1SA 4ZZEA 4H8JA 4U21A 5CC2A 4BDRA 4NF4A 2OCUA 5L9SA 4KPTA 3BFTA 3ZSFA 4ESWA 3CSGA 2ONSA 2W7YA 3PMXA 2DVCA 3K2DA 1SI1A 4OFLA 1M5FA 4ELPA 2VOZA 3U1OA 1M5BA 3T9HB 3IAZA 5B7DA 2UVJA 3OEKA 2F8DA 2R9JA 1PB8A 4WKMA 1I69A 3SEYA 4EQ9A 3KGCA 1KWHA 1JVYA 2KLFA 2Q8JA 4OENA 4U23A 3H6UA 1MY3A 1MXUA 5H8SA 2F6GA 1ELJA 1Y4CA 1FQEA 4QSDA 3E9XA 1A54A 1LLSA 2I3VA 3H03A 1JVXA 4LQ2A 3IOTA 4GIZA 1SW5A 3HSTA 3U72A 3KOSA 4LA9A 3EF7A 3UK4A 3D4CA 5AA2A 2DE3A 3FVOA 2HZLA 2ZMBA 4OXVA 4GD5A 4XTCQ 5ICQA 2Q2CA 4ZEBA 2RF1A 1A8EA 4PFWA 1SYIA 1OQGA 4F3BA 3DELB 4F1VA 3QUFA 3OO8A 2OBGA 3Q27A 2V93A 3FJMA 4NMYA 3TCGA 3GLBA 2X7PA 3RQTA 4ZS9A 4DZ1A 3ZKKA 3DM0A 1IXIA 2NUVA 2I48A 3I5OA 1B32A 4XKQA 1DOTA 4LVQA 4PFYA 3USDA 2R6GE 4Q0CA 4O3CA 5K2XA 3SETA 4F3PA 4EXLA 1B46A 4YKKA 4MBPA 5I84A 3MQ9A 4M1VA 4BDNA 2ANJA 1SI0A 3RNNA 4EF1A 3N6UA 4LZ7A 4I8CA 3O66A 5JTYA 1AOVA 4KD5A 4JWYA 2X7QA 4QF9A 5FTIA 1H45A 3JYRA 1CB6A 3HO7A 3O6HA 1O63A 1B3HA 4FAJA 1UTBB 3VVDA 3TQWA 4XIGQ 4BDLA 5I58B 1VFDA 5CBRA 5A5XB 1RYXA 4FECA 3ODBA 4MF3A 3SEWA 2HEUA 2XX7A 5ICTA 2IEEA 1FCKA 1LFGA 2LAOA 4DCXA 4ZEFA 4NF5B 4ZZAA 3LC8A 1NL5A 4TOZA 4PP0A 4G68A 2Z8FA 1MDQA 5LOMA 1I6QA 4H67A 1UIUA 3K6VA 4LATA 3HPIA 1Y3QA 4WXJA 1GGGA 1QVSA 4QHQA 5H8NB 4QSCA 5DEXA 1LAFE 2Q9TA 1LAGE 3V5AA 1NNTA 5J1DA 2XD2A 4E0XA 3OSRA 2QJEA 5TPAB 1MQDA 3SESA 1FQBA 2XHDA 3IOWA 4DIGA 2HFBA 1NH7A 1WODA 2V3TA 3FD3A 2G29A 5I56A 1MRPA 1B58A 2NOOA 4JSDA 1QJMA 3U92A 1T0KA 5I2KB 4RPOA 2A5TA 4ND9A 3N5LA 1XT8A 3CG1A 4H0WA 4IGRA 1TWYA 1MY1A 3CFZA 1R9QA 3IB2A 3E3KA 3IO4A 4MLQA 4RJZA 1FQCA 2F7CA 3KSXA 1MQJA 4ZDMA 4AB6A 4IO7A 4NE4A 1LSTA 1B1XA 4YB5A 3OO6A 1EH3A 2DS9A 1Z7NE 4KYDA 4R9FA 1JEVA 2B3BA 3C36A 3MP1A 1B4ZA 4G8NA 4OFJA 4O3AA 4DE8A 4G68C 1B1HA 2I3WA 3TKDA 3KSJA 2YLNA 3O9PA 4E0WA 1B4HA 2QS1A 2O7IA 3PPPA 5EHMA 1F9BA 5JEIA 4RYAA 4X1DA 5AA4A 1B5IA 4F19A 4OEUA 1A40A 3TPAA 4R6YA 3H06B 1S9TA 1NMUA 4P11A 1SW2A 5H8HB 1ZTYA 4M4GA 1ZLQA 4TLLB 5HBCA 2Y7PA 1NKXA 1R1NA 1Y1ZA 3U93A 4IGTA 4RK2A 1GTKA 1USYH 2VD3A 3KN3A 1B52A 1P1NA 4ZEIA 3EHTA 3O28A 2ONRA 2REJA 3IJOB 3FVGA 3CG3A 3PPRA 3T22A 1ANFA 5H8QA 5EYFA 4P0IA 3OSQA 1LCFA 5I2NB 3OD7A 2F6PA 2ZYMA 1MS7A 1PDAA 2XXIA 4K3FA 4LONB 4G4PA 1LBBA 5HPQA 2AIXA 2R71A 4QRZA 4NWDA 3KG2A 4X1BA 3H4ZA 4F31B 1B0HA 3KBRA 1US4A 4OWDA 3CR9A 1VFEA 3KN8A 4PQJA 4LZ8A 2D3IA 3H7MA 2UVGA 4OVJA 1MPCA 2H4IA 2Z8EA 4ELQA 2RC9A 2I4CA 4LZ5A 4PETA 3FXQA 4HCYA 4GXAA 1XVXA 3R7XA 2Q88A 1MQHA 2P0SA 2DE4A 3PD8A 2DVZA 3PUYE 3M8UA 1TXFA 4ZE8A 2VD2A 2XXVA 3MP8A 4QFKA 2P1SA 3FJ7A 3PPQA 3Q25A 4OTEA 3C31A 4PFTA 5ITOA 2ZNSA 2E0SA 1NNPA 1AMFA 3CVGA 1I6AA 1B05A 5DT6A 4H5GA 1POTA 3IR1A 3A09A 4POWA 1BKAA 4O3BA 4JXIA 3C32A 4GOTA 1MH4A 1N7XA 1ATGA 4I1DA 1FTKA 4JDFA 3SEVA 3TMGA 3M3KA 4JSOA 2ALUA 2XXRA 5TP9A 3UA8A 4I62A 4U4SA 3VXBA 4Z0IA 1PEBA 1FTJA 1LCTA 4F39A 4QFNA 3TYHA 5BUUA 2NXOA 1EZOA 2OJTA 5K2YA 3ILUB 2XXPA 3V89B 2ONKE 1PB9A 4OEVA 2RINA 4YZZA 3K6UA 4YB6A 2QPQA 4HCWA 1OVTA 3KN7A 1B3GA 4TQUQ 4ONYA 3TTLA 3RT8A 3A3CA 1EZPA 5I57A 1A7LA 1YTVA 2XXTA 3G3JA 2ZXTA 1S50A 4GL0A 4U1OA 4JWOA 4I9DA 4F3SA 5L9OA 5KDTB 3M3LA 4N13A 2WKYA 1LB9A 3K02A 1IITA 1NFTA 1ZBMA 1B7ZA 1N76A 1XVYA 3QYTA 2OWTA 3OOAA 4DCYA 3MVXA 3FASA 4YMBA 4DXBA 3RLFE 1FTOA 4KCCA 4EDPA 3O6IA 2DWJA 4MH5A 3PMWA 3CRBA 3F11A 1IEJA 1IUDA 3PMVA 1BLFA 4BDQA 1N7WA 1MXZA 2ESNA 3BBRA 5L8DA 3H6TA 5I59B 3JZJA 3UGWA 4FORA 2QS3A 4G8HA 1XOCA 1B6HA 1D4NA 1FQFA 3TCHA 2G93A 4YKJA 1NNFA 5FHOA 1N0TA 1B9JA 1D9VA 2PT2A 4LP2B 3TTRA 4F1UA 3KJ7A 4KI0E 3PUVE 2GHBA 1OLCA 1Y3PA 2Z8DA 4FATA 3TFLA 4N07A 4PFUA 3TTMA 2QS2A 2I0CA 4Z7EA 3GBAA 4H1XA 2XXYA 3B6TA 3SDFA 2OK2A 2PX1A 4R73A 3E13X 2HXWA 2VHAA 1BTJA 2QMWA 3IB0A 2PT1A 4QFOA 4ZE9A 4GVOA 1Y4TA 4RK9A 4ESXA 4DXCA 5AA2D 4NF6B 4GL8A 4R75A 4R6HA 3FUZA 2DSFA 1MXXA 4IB2A 2GRVA 3VLWA 3S4UA 1M5EA 2YPNA 1B0LA 2O7UA 4F18A 2O68A 5B70A 5CRYA 3LR1A 1IXCA 3MZ9A 4Q5TA 3IO6A 5JK4A 1USYE 2VGQA 3W15C 1SW4A 1US5A 2Y7KA 1TFAA 1POY1 1OVBA 1Q35A 4XKPA 4Q8RA 3C9HA 3PUXE 2ZYNA 3OXNA 5CM6A 3K00A 1MY0A 4F2OA 3EHUA 1FW0A 1TFDA 2FNCA 2Y7RA 1M5CA 4H8IA 3O2AA 1VSOA 2FA7A 4BDOA 4UA8A 1QUKA 3G3GA 4GXSB 3QAXA 1PBQA 1P1UA 3CI8A 1UTBA 5H8FB 2HZKA 4F2QA 4C1UA 4C0RA 3IK6B 4YMAA 2Y7WA 3TTNA 2F97A 1UTHB 3MZ1A 3OO7A 3LSLA 2DOJA 3MZBA 5A5XA 5BWJA 1AL3A 3T9VA 3VV5A 1Q1KA 2RCBA 4NF8B 3KZGA 4RY1A 4NF5A 3MPLA 2XXUA 3IB1A 1VE4A 4L17A 5ITPA 2HQ0A 3FXRA 3VVFA 1MQIA 1II5A 1QUIA 2XD3A 1QULA 2V25A 3PUZE 3V8XB 2PVUA 4THIA 4ZEDA 5H8NA 1B5HA 3V83A 5TPAA 2H9BA 1SQYA 4R72A 3EN3A 4U1ZA 3G3KA 4LUBA 3L6HA 4F3GA 3FV2A 1I6BA 4GQOA 1DPPA 2O51A 2RC8A 2OWSA 3DLNA 3HCQA 4OESA 1URSA 3MUQA 2Q2AA 1LAXA 3R6UA 4JBZA 4FE8A 3SKPA 3FIRA 2F5XA 5I2KA 4F29A 1XHYA 3H6WA 3VFJA 3CFLA 3DP4A 1BIYA 5DVJA 4DXUA 5KCJB 4P0GA 4N6PA 2DXRA 1A55A 3O6GA 5AA3A 3FVNA 3O97A 2H98A 4X9TA 1HSEA 2THIA 3UN6A 2DQVA 4R2BA 3FV1A 2DXYA 1IQ7A 1B2HA 3N94A 1MH3A 1L5TA 4NF4B 4QFPA 5CBSA 4ELRA 1P1WA 3ZKLA 2PMSA 1LB8A 1XS5A 3U94A 4BLAA 2GHAA 3N6TA 3W9VA 1Y9UA 5AE4A 2P2AA 1DSNA 2RCAA 5TU0A 5FHNA 3MAMA 5FHMA 2QL3A 3TQLA 3AXFA 1IXGA 1IZ1A 1S7YA 3RTWB 3BFUA 4NWCA 1FTMA 4RNSA 4AQ4A 4IO5A 3CSBA 3A3UA 3H3GA 4OERA 3DP8A 2UYEA 5DYHA 2XXXA 1M5DA 2I6EA 1MG1A 1SYHA 4KFQA 2O69A 1ZU0A 2REGA 2UVIA 2QSXA 3IJXB 4EQ7A 3ECRA 4XKRA 1EZ9A 1QW0A 3MVZA 3IOVA 1GVCA 4KR5A 3B6WA 2V3UA 1B7UA 2OZZA 1TT1A 3L6GA 4MFIA 3VLVA 5AA2B 2CMOA 3RUMA 3D4GA 4AB5A 4POXA 1D9YA 3C33A 2ZYKA 1MXVA 3VLUA 1QKAA 3SEXA 2YJPA 2XX9A 4WEDA 2I0BA 5I2NA 1Y20A 4F22A 2F36A 3K1MA 4OYVA 4OHNA 2F35A 4EF2A 4IO4A 3M3FA 3SEUA 4RXLA 4LQ5A 3ZS6A 1SD3A 3OMBA 3MC2A 5FTHA 3MP6A 5CMMA 2DWIA 3T9XB 1SVXB 2F34A 1H3DA 4KYEA 4ECFA 3FXUA 3EHSA 2DP8A 3FJGA 3PUWE 1AH5A 3K6XA 4OMBA 1YPNA 1YAEA 3PD9A 3PGFA 4YB7A 5IAIA 3MW0A 3WAEA 3WAFA 1QUJA 3FGSA 1A99A 3PPOA 3T93B 4YU0A 2QS4A 1JW5A 1R9LA 3S9NC 4XXUA 3VDFA 1YCJA 1B3LA 3FATA 2ABHA 4RPNA 1JW4A 1ZKBA 4DLDA 4JWXA 2ZNTA 5JTYB 5L9MA 3QK6A 4RA1A 3MBPA 2XX8A 3EPEA 3S9MC 2B3FA 3S9EA 5CI5A 3LUYA 4U22A 1O64A 1Y3NA 1IXHA 1AIVA 1MM6A 3H6VA 2GFEA 4FEBA 5F7VA 1JQFA 1Z7ME 4IO6A 4F1YA 1SW1A 1EU8A 3N26A 1N3WA 3OO9A 3HHFA 1H43A 2H25A 2VP1A 3G3HA 2RC7A 1OLAA 1MQGA 4GRKA 4PE5B 2Q89A 3TELA 4G8MA 3G3FA 1URGA 3QXMA 4OETA 1OQHA 3BKIB 3RN8A 3K0VA 1MY2A 4HS7A 4YAHX 1OIBA 1O7TA 2I49A 1R6ZA 4YKIA 2XXQA 4QSEA 3MPKA 2XXHA 3PU5A 4HW8A 4ZEKA 4G68B 2I4BA 4FEDA 3KOTA 3MVYA 2D21A 4H6DA 2RKMA 3UP9A 1GV8A 5DEXB 4R6KA 2ZNUA 3OENA 1B40A 2DWAA 4EUOA 2GH9A 1CE2A 4HTGA 1B7HA 1HSLA 2UVHA 1MY4A 3IOUA 3W9WA 4R2FA 3IL1B 5KDTA 5I56B 3S9LC 3I6VA 4H65A 3C35A 3DP6A 5CMCA 3IX1A 3MJNA 1UQWA 3G3IA 3LSXA 3ONMA 2A5TB 3TAJA 2F78A 5DTBA 1RYOA 4TLMB 3I3VA 1OMPA 4FJPA 3TDJA 3B6QA 4DDDA 3GXAA 3T66A 3THIA 3TZAA 2UXAA 5I59A 3VXCA 2DE2A 4GLIA 4GFRA 4KQPA 3RT6B 2FYIA 3G7WA 2H5YA 1H76A 2O6AA 3CIJA 3C4MA 3K01A 2ZYOA 3HN0A 1JETA 4XKNA 2NVUB 1P1OA 2F7AA 3Q26A 3VE1B 3ILTB 3HV1A 2PYYA 5IKBA 4QFLA 4GF8A 4UACA 3TODA 4MLVA 3QUJA 3VVEA 1DMBA 4IY6A 2O84X 3PPNA 2UYFA 2AL5A 1MXWA 5AA4B 1LAHE 3LBSA 4IO3A 3RGYA 1BP5A 3E4RA 1PB7A 3U8QA 4NEDA 1D3KA 5M2VA 2A5SA 1SBPA 3LSWA 3UORA 4BDMA 1P99A 3OELA 2B65A 3KEIA 2HAUA 1DTGA 3IORA 3KFMA 1SDXA 1JNFA 3TTKA 1JEUA 2DYXA 4IO2A 3PV0E 5I58A 4GWOA 4JB7A 4NF6A 2OLBA 1UIVA 1PBPA 2M8CA 3TEPA 3RPWA 3O29A 3JV9A 2QMXA 2Y84A 1MDP1 4KYSA 3K1NA 3FVKA 1NNKA 1WDNA 2I58A 4H5FA 2HAVA 2Z22A 3GZGA 2CZLA 1MPBA 1FQDA 5H8QB 4YKPA 1MM7A 4G77A 2X26A 5DVIA 1J1NA 3RY3A 2AL4A 2H99A 3S2VA 3Q29A 5F1QA 1MPDA 4U2RA 3K1PA 1WVJA 4U4XA 2V3QA 1RKMA 4OZ9A 3T9UA 2IA4A 2QRYA 4EQBA 5EHSA 5AA1A 3CFXA 1B5JA 3K4UA 4ZECA 3K6WA 4Q30B 1LFHA 3FZVA 4NTLA 1FQAA 3GBBA 5H8FA 4KCDA 3EQ1A 1LBCA 4FIMA 1FTLA 1UTHA 1B3EA 3HHGA 1HSJA 5CMKA 3TUSA 2Y7IA 1B3FA 2Z23A 3B7DA 1NH8A 1ZJLA 3MWBA 4G2ZA 4NF8A 3SERA 2DWHA 4OQOA 1LGBC 3Q28A 1XC1A 2BJJX 2O1MA 1N84A 4R9GA 4R74A 3R26A 3LSFB 1QKBA 2HCAA 3QIMA 1URDA 1Y1MA 3QSLA 2AYSA 1GR2A 3C34A 4IY5A 1DTZA 1N3XA 2PBWA 1ZIUA 5DVFA 5TP9B 1A8FA 5CMBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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