4EQ9A

1.4 angstrom crystal structure of abc transporter glutathione-binding protein gsht from streptococcus pneumoniae strain canada mdr_19a in complex with glutathione
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
240
structure length
240
Chain Sequence
KKEIIVATNGSPRPFIYEENGELTGYEIEVVRAIFKDSDKYDVKFEKTEWSGVFAGLDADRYNMAVNNLSYTKERAEKYLYAAPIAQNPNVLVVKKDDSSIKSLDDIGGKSTEVVQATTSAKQLEAYNAEHTDNPTILNYTKADFQQIMVRLSDGQFDYKIFDKIGVETVIKNQGLDNLKVIELPSDQQPYVYPLLAQGQDELKSFVDKRIKELYKDGTLEKLSKQFFGDTYLPAEADIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Streptococcus pneumoniae
publication title 1.4 Angstrom Crystal Structure of Putative ABC Transporter Substrate-Binding Protein from Streptococcus pneumoniae strain Canada MDR_19A in Complex with Glutathione.
rcsb
molecule keywords ABC transporter substrate-binding protein-amino acid transpo
total genus 84
structure length 240
sequence length 240
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4eq9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4eq9A02
2XXPA 3KJTA 2PBWA 4G2ZA 3U1OA 5CRYA 4G4PA 3CSBA 3WAEA 4NF4B 1B5HA 1MXVA 4GFRA 3TTMA 2YLNA 3QIMA 1IIWA 2HEUA 4NF5B 3PPOA 5K2YA 1JVYA 1MXWA 4IO4A 3QXMA 3TTKA 3K6WA 3PPRA 4YKKA 4G68C 1FQCA 4ESXA 4ECFA 3UN6A 3HPIA 2O68A 5L8DA 3C4MA 4H65A 2A5SA 1MRPA 4OZ9A 4OMBA 4ELRA 5AA3A 4YMAA 1P1WA 1MXXA 2ABHA 3H3GA 3IJXB 3RN8A 2Q2CA 2GH9A 2NOOA 1OMPA 1HSEA 1N84A 4R2BA 5L9MA 3IOUA 4QFNA 1D9VA 2DXRA 5DVIA 4EXLA 3E13X 1NNTA 2O6AA 4YKJA 1Y4TA 1B1HA 3VE1B 4BDRA 3U72A 3CFZA 1SYHA 2Z8DA 4F1YA 4FECA 4R75A 3A3CA 4YU0A 2O1LA 2NXOA 2XXWA 3PPPA 3K6XA 4RPOA 2V93A 4LQ5A 4H67A 1B9JA 4MH5A 1CE2A 3PUZE 1VE4A 1P99A 1NL5A 4RA1A 3KEIA 2REJA 2UXAA 4GD5A 2XXYA 4NWCA 5CMBA 3M3FA 4WEPA 3E4RA 2R71A 3N26A 4OEUA 4OFJA 2DVZA 3UP9A 3TELA 2I49A 2UYEA 4X1DA 3TFLA 4FJPA 3A3UA 3V5AA 3KBRA 4F3SA 3C31A 1BIYA 1LSTA 4KI0E 1MQJA 2H4IA 2WKYA 4PFTA 5M2VA 3RQTA 1SBPA 3JYRA 2DE2A 3Q28A 2Y7RA 4HS7A 5CI5A 2Y7KA 4GVOA 3UIFA 4BDLA 1R9LA 1AOVA 3FIRA 4XKRA 5I2NB 2X7PA 4OVJA 1JQFA 2HZLA 2P0SA 5BUUA 4G8NA 2HQ0A 1MPDA 1OLAA 1B32A 3K1NA 5HPQA 4C1UA 1WODA 2D21A 4G8MA 5KDTB 4ND9A 1AL3A 3T9VA 4LATA 4TLMB 3TQLA 3R26A 2Z8EA 1SW2A 1USYE 3GBBA 2O51A 4ELOA 1IITA 2XXHA 3VDFA 5CBRA 4LZ8A 1LGBC 3OO6A 3TUSA 1OQGA 1Y1ZA 1A55A 2PYYA 1B5JA 4JB7A 4MF3A 1Y1MA 5DT6A 3SDFA 1SYIA 1R9QA 4U1OA 1J1NA 1JW1A 3G7WA 2F7BA 4POXA 4NWDA 3EQ1A 1IUDA 3O6IA 1US5A 5EHMA 2HXWA 1DMBA 2XXIA 1LAGE 4GIZA 2REGA 1B5IA 1Y3QA 5ITOA 1OVTA 3TYHA 1QUJA 3CG3A 4QF9A 2DYXA 5AA2D 5FTHA 3B6TA 2VP1A 3UORA 1MG1A 4TOZA 5DEXA 4LZ7A 3KSJA 4RY1A 3FVKA 1H44A 1A8EA 3M3LA 1Y3PA 3RT8A 1ATGA 4DXBA 4OYVA 4Z0IA 1N0TA 3IB2A 2X7QA 1RYOA 4YAHX 4RPNA 3R6UA 3ZS6A 2THIA 5ELVA 4U22A 1USYH 4FAJA 4YMBA 1OQHA 3SEWA 2H9BA 4IB2A 3QYTA 2XX8A 1B6HA 4LONB 3FJMA 5I59A 1MQIA 4X9TA 3TKDA 1S50A 3PPNA 3OENA 4N07A 2FNCA 3EHUA 1LFIA 2F78A 4FATA 3IO6A 4YKIA 1FW0A 1N76A 3C9HA 1URGA 1QUIA 1B7UA 3KJ7A 5EHSA 3CI8A 5H8FA 1GVCA 2OWTA 2QMWA 2VD2A 3MZ1A 3S9LC 2OCUA 3SESA 3GBAA 1B1XA 2DSFA 5KCJA 2P1SA 3PD9A 1NMUA 5I2KA 4FORA 2UVGA 2XXTA 3H7MA 1B7ZA 3CR9A 1CB6A 1PBQA 2O69A 2QSXA 4QFKA 4IY6A 2I4BA 1DTZA 1P1QA 3CRBA 4GL8A 4U2RA 4YB6A 1EH3A 3H6UA 2DWAA 3OELA 4G77A 4KYSA 3C32A 2VHAA 4WEDA 3I5OA 5I57A 5JEIA 3V89B 3IJOB 3N6UA 3B6WA 3Q29A 3DP6A 3FXRA 2GHAA 4DXUA 1PC3A 2GFEA 4F19A 4PE5B 4IGRA 4F1UA 5AA2A 3H4ZA 2AL4A 3I6VA 3RTWB 2HAVA 4IY5A 1MPCA 1MS7A 4RXLA 3ILUB 3L6HA 5J1DA 1DTGA 5DEXB 4BDQA 4GQOA 1RYXA 4LVQA 4PETA 4R9GA 2HCAA 1LBCA 4EQ9A 2I0BA 4YICA 4YZZA 3BBRA 4MFIA 2QS2A 5ICQA 4JDFA 4OFOA 1IXCA 3IL1B 3IOVA 3K01A 1OIBA 3VVEA 4Q0CA 2UVHA 3IR1A 1EU8A 4LZ5A 1FTOA 3K2DA 3G3JA 4TQUQ 3K6UA 3ONMA 4F29A 2QS4A 1QKBA 1ZIUA 5TU0A 4AQ4A 5F1QA 3GZGA 3RGYA 5I59B 1LCTA 3H03A 3MJNA 1I6BA 4IO2A 1BTJA 1A8FA 1JW5A 1POTA 4PFWA 1LCFA 4ZEBA 3SEVA 2V3UA 1ZKBA 2F97A 4X48A 4RNSA 2V3QA 5H8QA 1LAFE 3O6HA 5FHNA 5TPAA 2QS1A 4KFQA 1WDNA 5H8FB 2W7YA 5TP9A 4L17A 3PMWA 2D5WA 3K00A 4JSDA 1TT1A 3TCHA 1IXGA 2IEEA 1YCJA 4I8CA 1IZ1A 4MLQA 3SERA 5KCJB 5I2KB 3MP1A 3O9PA 1P1UA 2E0SA 1NH7A 3C36A 3MC2A 5FHMA 4F31B 5A5XA 2G29A 1HSLA 4BLAA 1LAXA 3QK6A 4DLDA 3TMGA 3O6GA 5I57B 5AE4A 2ANJA 3M3KA 3TCGA 3QAXA 4OFLA 1ANFA 1B05A 1FQDA 1MY2A 3THIA 3ZSFA 1Y9UA 1JVXA 3T93B 3ZKKA 3H6VA 3G3KA 4GXSB 1FTLA 5CC2A 1ZMGA 1D3KA 2I48A 4AB6A 5AA2B 1H43A 4F3GA 1Y4CA 3FUZA 4THIA 1MXYA 4F22A 1D4NA 2Y7WA 1SVXB 2GRVA 3TEPA 4F18A 1IXIA 2UYFA 3S9MC 2B65A 4TLLB 3N5LA 3LSWA 3RT6B 3Q25A 2BJJX 1LB8A 3MBPA 1BLFA 1ZJLA 4ZS9A 2Y7PA 3DELB 1EZ9A 4QFLA 2F34A 3MZ9A 3W9VA 2O7IA 3RTFB 2F6GA 1DOTA 1LAHE 3KFMA 3H6TA 1US4A 3S9EA 4EUOA 3PUVE 3MW0A 5ITPA 4XIGQ 3VXBA 3BFTA 1LFHA 4FEDA 3IORA 1JW4A 1HSJA 2H25A 4OQOA 4ZZEA 1FCKA 3FD3A 1MPBA 4I9DA 1MY3A 2QRYA 1YAEA 1GV8A 4F2OA 2DVCA 2DWIA 4R6HA 2ALUA 5AA1A 3MVXA 5B70A 2DQVA 3R7XA 1DPEA 3HHGA 1D9YA 1PBPA 3FV2A 4NF8A 1QULA 4ELPA 5H8QB 3IOWA 4OEVA 5TPAB 4XKPA 3EPEA 3OMBA 5TP9B 2FYIA 3SETA 5HM4B 3VLUA 3O28A 4GRKA 1UIUA 1XVXA 3T22A 3KGCA 3C33A 4H1XA 2Y7IA 4DDDA 4K3FA 4H0WA 2RC8A 1PEBA 1YPNA 4R2FA 5A5XB 4F2QA 3SEUA 2RCAA 1O64A 4KR5A 4WKMA 4ZECA 2I6EA 3LBSA 1VFEA 3EHTA 2AYSA 3PU5A 4N6PA 4Z7EA 1P1NA 2P2AA 1R6ZA 4R73A 1N3XA 3LUYA 3MWBA 5FHOA 1PB8A 3VXCA 3D4CA 1Z7NE 5H8HA 4ZE8A 3MVZA 3SEYA 1OVBA 1B3HA 1OLCA 5DVFA 2ZNSA 4GF8A 3DP8A 4E0XA 4NF6A 4EF2A 1ZBMA 3H6WA 3LSFB 3ZKLA 3FJGA 4M4GA 3FVGA 2V3TA 4O3CA 1GR2A 1FTJA 4GL0A 4C1TA 4R74A 2DWJA 4ZEFA 4XKQA 5DYHA 4ZEKA 2OBGA 1JNFA 1MXZA 1S7YA 4Q8RA 2PX1A 4IO6A 3MVWA 1LBBA 4H8IA 3V83A 1TFAA 4LA9A 1VFDA 4IO7A 2PT2A 3K6VA 3TQWA 2Q9TA 4ONYA 4H6DA 3E9XA 3RLFE 4RJZA 3TAJA 4KD5A 4RK2A 3V8XB 3TDJA 1FQAA 3OOAA 4ZEIA 3IK6B 3O97A 1ZU0A 3K0VA 4KCCA 3PUYE 4EF1A 2F6PA 2D3IA 2VD3A 3IB0A 2Q8JA 2QJEA 2Y84A 1FQBA 1AMFA 5H8NA 1JEVA 2UVIA 3CG1A 3RY3A 2RC9A 1KWHA 1ELJA 3LR1A 4DIGA 3D4GA 3MQ9A 3Q26A 1BKAA 4NF8B 1B3EA 4Q5TA 3FXQA 3DP4A 4MBPA 3OXNA 3N6TA 4HW8A 4R6YA 1UTHA 4KYDA 3T9HB 3BKIB 4OETA 3CFXA 1NKXA 3HHFA 3HSTA 3ODBA 3RPWA 1Q1KA 2DWHA 3CSGA 3VV5A 2A5TA 1FTMA 2ESNA 4U4SA 4DCXA 3IX1A 2ONKE 3PUXE 1IXHA 3PUWE 5ICTA 2KLFA 4U23A 4U1ZA 4XXUA 3OO7A 2I58A 5KZTA 1SD3A 2ZMBA 3M8UA 4EQ7A 3TPAA 2AIXA 3U93A 5ISUA 4F1VA 5H8HB 1FTKA 3K02A 4OXVA 1QW0A 2PVUA 1URSA 4MLVA 3FV1A 4QSDA 3C34A 4NF6B 4G8HA 1NFTA 5I58A 2Z8FA 4GWOA 3F11A 4KPTA 4IO5A 4F3BA 2XXUA 1XHYA 3BFUA 4OERA 3HV1A 3FJ7A 2DOJA 2X26A 1PDAA 3GXAA 1R1NA 1M5BA 4H8JA 2DE4A 4IGTA 4GOTA 2XXXA 1M5DA 2Z23A 1NH8A 1IQ7A 3RUMA 2R6GE 3KSXA 4E0WA 3RNNA 4XKNA 1MDP1 3TTNA 2QL3A 4QHQA 4F3PA 1MM6A 5I56A 1MY0A 4O3AA 4LUBA 4U21A 4EQBA 3KN7A 2G93A 5L9OA 1A99A 1IEJA 2ZYKA 2XX9A 4NEDA 1GGGA 4X1BA 4C0RA 5CM6A 3KN3A 4OESA 3DLNA 5CMCA 2QS3A 4R9FA 1B51A 3PD8A 5FTIA 4ZEDA 3VVFA 4JBZA 1A54A 2F35A 5H8NB 2ZXTA 3KOSA 4JWOA 3EHSA 1B58A 5JK4A 2XHDA 2H99A 1GTKA 2OK2A 4G68A 4OWDA 2H5YA 5IAIA 3OO9A 1Y20A 4ZE9A 3B7DA 1II5A 4I1DA 3FATA 3KN8A 2RINA 4GLIA 1ZTYA 2GHBA 3UK4A 1B2HA 2B3BA 5HBCA 2XX7A 3K4UA 1PB7A 3I3VA 4GXAA 4R72A 3Q27A 1PB9A 1NNFA 3EF7A 5I84A 1UTHB 3TTRA 1URDA 3K1PA 4POWA 2XD2A 1MH3A 5CMKA 1B0HA 2E1SA 3T66A 4DXCA 1QUKA 2V25A 4PFYA 3FASA 4HCYA 2DE3A 2A5TB 2QPQA 1SDXA 4P11A 3MPLA 4IO3A 3UGWA 3H06B 1FQEA 1JEUA 3FXUA 3G3IA 3TZAA 2F7CA 3IAZA 1NNKA 5L9SA 1SQYA 3MAMA 2NVUB 4JWXA 1UIVA 3B6QA 1AH5A 3FGSA 2YJPA 4BDNA 2HZKA 3N94A 2OZZA 4QSCA 3JZJA 3PPQA 3OO8A 2NWJA 1A40A 3SKPA 5I58B 5CBSA 5IKBA 4ESWA 2B3FA 4JWYA 3IB1A 2I3WA 3G3HA 3G3GA 3A09A 3CVGA 1POY1 3HN0A 4BDOA 1MDQA 4P0GA 3KZGA 2LAOA 1LLSA 2CZLA 2VGQA 4NTLA 5AA4A 4O3BA 3O29A 2AL5A 3HO7A 3W9WA 1MY4A 3SEXA 1DPPA 4OTEA 4PFUA 3MUQA 2ONSA 5I56B 1XT8A 1B4HA 1NNPA 1BP5A 1I6AA 4JSOA 2ZYMA 3GLBA 1LFGA 3VVDA 3TODA 1MQGA 4YB7A 3QUJA 1Z7ME 3EN3A 2ONRA 3PMVA 1EZPA 2HAUA 4KCDA 1B0LA 4YB5A 4BDMA 4U4XA 3OSQA 1Y3NA 1TFDA 3OSRA 2RKMA 2O1MA 2HFBA 1L5TA 3OEMA 2ZNUA 3PMXA 4PP0A 4G68B 3W15C 4LQ2A 2M8CA 1P1OA 2DS9A 2PMSA 2DXYA 3CIJA 1B4ZA 3LSXA 1UTBA 5JTYA 3IO4A 2NUVA 3OEKA 4WXJA 1A7LA 4F39A 2XD3A 3K1MA 2RC7A 2Q89A 3CFLA 3U8QA 1N7WA 2R9JA 1XOCA 2FA7A 2I4CA 3E3KA 1VR5A 3AXFA 2XXQA 3FVOA 3P7IA 2F8DA 1M5FA 3IOTA 2XXVA 1WVJA 2Q88A 4AB5A 1LB9A 1H45A 5B7DA 3S2VA 3O2AA 2O84X 2ZNTA 3ILTB 2F7AA 1TWYA 2O7UA 2F5XA 4KHZE 3T9UA 1N04A 4NF4A 5DTBA 1B3FA 4EDPA 3MZBA 4NMYA 4ZZAA 3UA8A 4NF5A 4M1VA 5H8SA 1SI0A 4HCWA 3G3FA 4QFPA 1M5EA 1F9BA 1H3DA 3O66A 1O63A 2ZYOA 3LC8A 3QSLA 1B7HA 1SW4A 4ISUA 4JXIA 2H98A 1B46A 1VSOA 5LOMA 4KQPA 4YKPA 2ZYNA 1SW1A 2Z22A 3T9XB 3MPKA 1XC1A 3PV0E 5EYFA 5DVJA 3OD7A 1XS5A 1UQWA 4QRZA 1DSNA 2F36A 3VLWA 4FIMA 1MY1A 1RKMA 4PQJA 4QSEA 3MVYA 5AA4B 1H76A 1EZOA 1S9TA 4DCYA 1T0KA 3KOTA 1N3WA 1Q35A 1B40A 4UA8A 3JV9A 1JETA 2PT1A 2OJTA 1AIVA 4N13A 3FVNA 3MP8A 5K2XA 3S9NC 2Q2AA 3VLVA 4UACA 4ZDMA 1ZLQA 2XXRA 2RCBA 3L6GA 5CMMA 4RYAA 4KYEA 3FZVA 4OENA 3U94A 3ECRA 3MP6A 2RF1A 2V84A 2QMXA 4QFOA 3USDA 3TTLA 4EXKA 2IA4A 1SI1A 4ELQA 1QVSA 4XTCQ 4P0IA 1QKAA 2I3VA 2OWSA 3S4UA 4DE8A 1B3LA 3U92A 3C35A 1M5CA 3KG2A 4I62A 1SW5A 4H5FA 2OLBA 4OHNA 3DM0A 3QUFA 4R6KA 1MM7A 1UTBB 5JTYB 4DZ1A 3WAFA 3PGFA 4H5GA 1MH4A 2I0CA 1B52A 4LP2B 4Q30B 5F7VA 3HCQA 1MQDA 3VFJA 1B3GA 1QJMA 1MQHA 1MXUA 5I2NA 2VOZA 2CMOA 1FQFA 3LSLA 4FEBA 3TCFA 1YTVA 4FE8A 1XVYA 2DP8A 4HTGA 2YPNA 1TXFA 1N7XA 3T96B 1O7TA 1I6QA 4RK9A 5KDTA 2UVJA 1I69A 4NE4A 5BWJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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