4F19A

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with arsenate at ph 4.5
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
molecule tags Phosphate-binding protein
source organism Pseudomonas fluorescens
total genus 115
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f19A02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f19A01
2V84A 3Q28A 3DLNA 2H9BA 1ZIUA 4F3PA 2B3FA 1F9BA 3KSXA 3SDFA 3MBPA 4YAHX 3TTRA 4DLDA 1WDNA 4JSDA 4GF8A 1JW5A 4IO7A 4LATA 1N0TA 1IITA 3S9MC 1B40A 1UTHA 3DP6A 2CMOA 4QFKA 1WODA 5I58B 2I4CA 4NF8A 5I56B 2PBWA 3R7XA 1B32A 1SBPA 4C1UA 4PFUA 3OOAA 5ITOA 5L8DA 4NF4A 3C34A 3R26A 5ELVA 1ZKBA 1URSA 1IUDA 1YAEA 1A54A 3TELA 1D9VA 3KFMA 4NTLA 2XX8A 1NFTA 1R6ZA 2XXPA 4JSOA 5IKBA 2ZNSA 2RINA 2ZYNA 2Z22A 2O68A 3JYRA 4POWA 4KCDA 3HCQA 1Q1KA 3LUYA 5ICTA 2W7YA 1MY4A 4YU0A 2I48A 1IEJA 3TPAA 5DVFA 2ANJA 3OENA 4FEBA 1EZ9A 2NOOA 3IOWA 4DXBA 1QJMA 3N6TA 4X9TA 2ONRA 4IO5A 4LUBA 4PETA 4DCXA 3ODBA 4BDOA 4DZ1A 3TZAA 2Y84A 2I6EA 3K01A 3MJNA 1FTOA 2UVJA 1B58A 1UTBA 1S9TA 3K1NA 3KN7A 3KGCA 3KN8A 3I6VA 5DVJA 1P1QA 1SQYA 4OFJA 1AOVA 1DTGA 3C33A 3OO7A 1A99A 3TEPA 2I4BA 2Q88A 1B5IA 5DEXB 1GV8A 3A09A 2ZNUA 4YB7A 4JWYA 1PBQA 1Z7ME 2HQ0A 1MY3A 3MP8A 4E0XA 4PFWA 1IXHA 4R74A 3V8XB 4XKNA 1OLAA 3K4UA 4DXCA 4FATA 5FHOA 4GIZA 3G3JA 4GD5A 3CSBA 3FJGA 4EDPA 1PB7A 4FAJA 4U23A 1PC3A 5DT6A 1B0LA 3USDA 2G93A 5B7DA 4R6YA 1RYOA 1LFIA 4EXLA 4NWDA 2GRVA 5F7VA 2XXRA 4ND9A 4TQUQ 3G3HA 3OXNA 3C35A 3O29A 2QMXA 4G8NA 2QS2A 4NE4A 4PQJA 2F8DA 4KYSA 4BDNA 1IQ7A 3VXCA 2OBGA 4ZZAA 1N7WA 1SI0A 3TQWA 5EHMA 1S7YA 2OZZA 1TFDA 1DPPA 2DXRA 3TUSA 3CFLA 4E0WA 3OO6A 1UTHB 1SI1A 1POY1 3PPRA 1SW2A 3K1MA 3QK6A 4U1ZA 5H8QA 2F7BA 4JWOA 3F11A 2B65A 3E3KA 1B1HA 5DTBA 3FV2A 2ZNTA 4YICA 4IY5A 2PMSA 4NF8B 3H4ZA 1FTJA 4Q5TA 2PVUA 1B7ZA 1T0KA 4YB6A 3C32A 4Q8RA 2HAUA 1D9YA 3EN3A 4RNSA 3C31A 1JVXA 3ZS6A 4NF4B 1MXUA 2NWJA 3S9LC 1VR5A 1NNKA 4OVJA 2ONKE 3R6UA 2DYXA 3OELA 5I84A 3G3IA 4ZDMA 4F39A 3QSLA 4JXIA 4RPNA 2Y7RA 2AL5A 1TWYA 3TCGA 4H5GA 2Z8EA 3V83A 1OMPA 4N13A 4QFPA 3S9NC 3KN3A 2H4IA 3O66A 1Y3QA 4F1UA 5ITPA 4F2QA 4RJZA 4HW8A 1UIVA 3GLBA 2Q89A 5FHNA 4MH5A 4F1YA 3HSTA 2QMWA 1MPBA 3CG3A 1XHYA 4H8IA 1MQHA 4NWCA 3VLVA 1B4ZA 1KWHA 1UTBB 1URGA 4UACA 5HBCA 1Y4TA 2HZKA 2ZXTA 4ZEFA 2O69A 3Q25A 3U94A 4NMYA 3IJXB 2ZMBA 3M3FA 3MQ9A 4U1OA 1FTKA 1GTKA 1GR2A 4XKRA 2I58A 4G8HA 2F97A 1JW1A 1QULA 2YJPA 5CMMA 3VVDA 4KCCA 3T9HB 2RCAA 3TCFA 4P0IA 4RA1A 1ATGA 3KJ7A 3PPPA 4QRZA 3QUFA 5ISUA 2HZLA 1JETA 1MG1A 3GBAA 4RK2A 3LBSA 3H6WA 1MDQA 1MH3A 4QSCA 4ECFA 4DCYA 3EHSA 1SDXA 1LB9A 3VLWA 4EUOA 1MXWA 2V3TA 1DMBA 2V3QA 4R6HA 4JDFA 1EH3A 5H8HA 4LQ5A 3OMBA 5FTHA 3PUVE 5AA4A 4PE5B 3EQ1A 1QUIA 1URDA 4I8CA 3KOTA 1WVJA 3UGWA 3U93A 2Y7KA 4EQ9A 3VV5A 3HO7A 2F7CA 4QFOA 5H8QB 3RQTA 2R71A 3C9HA 2F5XA 4XKQA 1ZTYA 3OD7A 3SEUA 3TKDA 1IXIA 1IXGA 1I6AA 4FORA 1Y3NA 4M1VA 2P0SA 5EHSA 4THIA 1TFAA 4GL8A 1PEBA 1I6QA 1AIVA 1B2HA 4XTCQ 2Y7IA 3RUMA 4OENA 3VVEA 2O6AA 2I3WA 2Z8DA 1FQAA 4H67A 2UXAA 2PYYA 4KYEA 5B70A 3MW0A 3PUYE 4EF2A 4R72A 4GQOA 4KFQA 1FQBA 3IJOB 3IB0A 5DYHA 3U1OA 1SW1A 1USYE 5CMBA 1B3HA 4YKKA 4EF1A 2UYEA 4IO2A 3WAEA 1M5DA 1ZU0A 3W9WA 4R6KA 3PMWA 4ZEKA 3OSRA 1B7HA 5AE4A 1MXVA 2F6PA 2QSXA 3LR1A 3VE1B 4GVOA 4EQ7A 4POXA 1D4NA 2D21A 2I0CA 2R9JA 1PB8A 1II5A 3ILUB 3N5LA 1LSTA 1LBBA 3GXAA 2Q2AA 5CC2A 5AA2D 2IA4A 3HV1A 1MPCA 3UP9A 2LAOA 1LFHA 3L6HA 3IOVA 3OSQA 4I9DA 1B3LA 4WXJA 5CBSA 3B7DA 1MDP1 2DQVA 1OQHA 3SERA 2HFBA 4JWXA 3KJTA 3LSLA 3PD9A 4G68A 3Q29A 2B3BA 2Z23A 3EHTA 3TDJA 3SESA 4ZE8A 1Y20A 4KPTA 2O1LA 2XXHA 1Y9UA 5FTIA 2ZYMA 4EQBA 5BUUA 1IXCA 1BKAA 4HCWA 4YB5A 3S4UA 4Z0IA 5ICQA 4L17A 4R73A 4H8JA 3M8UA 4RK9A 1P1NA 3K00A 2M8CA 4KQPA 4MLQA 2YLNA 1NL5A 3G3GA 4IY6A 5H8HB 1POTA 3O2AA 1QUKA 3MC2A 5AA4B 2VD2A 4UA8A 4GOTA 2F78A 3FVGA 2DE3A 4DDDA 1GVCA 4X1BA 1SD3A 4BDLA 1SW4A 2THIA 4YKJA 4ZECA 4YMAA 4LVQA 2RC8A 2NXOA 3HPIA 3V5AA 3KBRA 3E4RA 5JK4A 1GGGA 4M4GA 3PUZE 1RYXA 3LSXA 3FASA 1AH5A 3K6WA 3MVWA 2VOZA 4ZE9A 2DOJA 1QUJA 3UIFA 1US5A 3IX1A 4OFOA 3CR9A 1EZPA 4XXUA 1M5FA 1ZMGA 3W15C 2Z8FA 2P1SA 5IAIA 2F36A 2CZLA 4R75A 4IO3A 1H3DA 1JEUA 2DWIA 3M3KA 2NVUB 3A3CA 2AL4A 2AIXA 2O1MA 5KDTA 1MXXA 1ZBMA 1PDAA 4U22A 4FECA 1MRPA 2VGQA 3FIRA 2QS4A 3MP1A 1FQEA 1Y3PA 3S2VA 5AA3A 3D4CA 4XIGQ 2IEEA 4NF5A 1MY2A 3IAZA 1B52A 3BKIB 3H06B 3K0VA 4WKMA 1HSJA 2D3IA 1Y1ZA 4TLLB 2VP1A 3C36A 1B7UA 3PPQA 5TP9A 4R2BA 4G2ZA 3H03A 3N6UA 2Y7WA 3ILTB 3FVNA 2OK2A 4G77A 3IK6B 2REGA 1P1UA 3O6IA 3CFZA 1LAFE 2HEUA 1DPEA 1FQFA 4F22A 3T66A 5I57A 3N94A 2DWHA 2QPQA 3IOTA 5H8NA 1MY1A 3T9UA 3I3VA 4OMBA 1SVXB 4F29A 3RTFB 5J1DA 4KD5A 3PPNA 4WEPA 4G68B 1O63A 4H6DA 1VSOA 3PMVA 2NUVA 4G68C 4OYVA 4RYAA 3P7IA 4U4XA 4GXAA 4I1DA 1MQDA 3VLUA 4F3GA 5M2VA 4ONYA 1B3EA 4K3FA 3FJMA 2GH9A 1N04A 2RCBA 3G7WA 3K6XA 2DE2A 5I2NA 4F19A 3FXRA 2H5YA 1PBPA 5KCJA 1CE2A 1OQGA 4PFTA 4ZZEA 4QSDA 2XXWA 4OEUA 4FJPA 2PT1A 1SW5A 3LSWA 4GXSB 1DSNA 1MXYA 4GRKA 4YKIA 2VD3A 4MLVA 2I3VA 3CSGA 1UIUA 2GFEA 2UVHA 3LC8A 1NNFA 4KYDA 1Y4CA 3QIMA 4LQ2A 1B05A 1B5JA 1H44A 4RPOA 4KHZE 4IB2A 2HXWA 1N7XA 4OQOA 4OXVA 3H6TA 2O7UA 3RY3A 5KDTB 1LGBC 4ELPA 3O97A 4G8MA 3RPWA 1HSEA 4P11A 1I69A 4ELRA 5TPAA 4IO4A 2XXYA 5DVIA 1Z7NE 4NF5B 4YKPA 1FTMA 1OIBA 2ZYKA 4GWOA 3IB2A 4F18A 2QJEA 2DWJA 4H5FA 2A5TA 2Q8JA 4MBPA 1DOTA 3TTLA 3ZKLA 3BBRA 1UQWA 1MPDA 1PB9A 3JV9A 1MY0A 3TTMA 1YTVA 1H45A 2ONSA 5TP9B 1FTLA 3OO8A 5KZTA 2X7PA 2DE4A 1CB6A 4TOZA 5HPQA 3KOSA 3PPOA 5I2KA 3FV1A 4LZ7A 1OLCA 2FNCA 3TTKA 3RLFE 1N76A 1RKMA 4H65A 4BDRA 2H99A 1YCJA 2UVIA 4F31B 3T9XB 1MQJA 5I57B 5K2YA 2BJJX 3VFJA 5H8NB 1B9JA 3OEMA 4OERA 3TMGA 4NEDA 2I0BA 4X48A 3SETA 1IZ1A 3KSJA 4FIMA 4IO6A 1Q35A 1ELJA 1S50A 1NMUA 1JVYA 1OVTA 3K6UA 1B1XA 5H8FA 4C0RA 1Y1MA 4OWDA 3I5OA 4BDQA 3L6GA 3PUXE 4OTEA 4LA9A 4F2OA 2UVGA 3V89B 1P99A 1B3GA 4OETA 4Q30B 4GL0A 3RT8A 1XOCA 2F35A 5EYFA 2O84X 2XX7A 4AB6A 5CM6A 1ZJLA 2UYFA 4O3BA 1N3WA 1N3XA 5I2NB 4ESWA 5AA1A 2I49A 3O28A 3T9VA 5KCJB 3SEXA 5AA2A 1M5BA 1R9QA 3HHFA 3IOUA 4NF6A 3U92A 3MZ1A 3MUQA 3H6VA 2XXQA 5A5XA 3PD8A 1VFDA 4X1DA 3T22A 1LB8A 3EHUA 3K1PA 4XKPA 2V93A 4G4PA 3GBBA 2RC7A 1XT8A 1QKAA 3D4GA 3C4MA 1EU8A 2O7IA 1MXZA 3CG1A 2YPNA 3SEVA 3W9VA 4ZEIA 3JZJA 3MZBA 4H0WA 2A5SA 1MH4A 5H8SA 4ZEBA 4U4SA 3HN0A 5FHMA 5LOMA 3K02A 1A8EA 2R6GE 1US4A 1MS7A 2P2AA 3LSFB 1XC1A 1USYH 1B4HA 2PT2A 4I62A 1LLSA 1FW0A 2XX9A 2HAVA 1YPNA 2O51A 5JTYA 1O7TA 1VFEA 3MZ9A 1TT1A 3DM0A 3FD3A 5TPAB 3ZKKA 5TU0A 3T96B 3G3KA 4U21A 3MVXA 5L9MA 4O3AA 3H3GA 2A5TB 3UN6A 3FJ7A 4RY1A 2X7QA 3CI8A 4MF3A 3KG2A 2QRYA 2ZYOA 2HCAA 2E1SA 2RC9A 1EZOA 1B46A 1B51A 4JBZA 1FCKA 3A3UA 3KEIA 3IR1A 4YZZA 5I2KB 4R9GA 4ESXA 1QKBA 1HSLA 1LAXA 3TCHA 2XXVA 1D3KA 4Q0CA 2KLFA 4OFLA 1MQGA 3SEYA 3TQLA 2DVCA 2OLBA 2PX1A 2V3UA 3UORA 3HHGA 5CMCA 1ANFA 4LONB 3CFXA 4DIGA 1H76A 3TODA 2RF1A 3ONMA 3RTWB 3H6UA 1NNTA 2XXXA 2G29A 1M5EA 5H8FB 4LP2B 4OZ9A 3RT6B 4ELQA 3K6VA 1LFGA 3UA8A 4HTGA 1BTJA 3TYHA 2ABHA 4N07A 1XS5A 1QVSA 4OHNA 4F3SA 3FUZA 4QF9A 2DS9A 3B6WA 4IGTA 3CVGA 4F3BA 1I6BA 1XVXA 3IL1B 2H98A 1B0HA 3TFLA 2REJA 4JB7A 3T93B 3CRBA 4AB5A 3VXBA 3IB1A 2XXTA 4TLMB 3PU5A 2QL3A 1R9LA 2FYIA 1JW4A 4U2RA 1TXFA 2H25A 5AA2B 3TTNA 4NF6B 1MM6A 5CMKA 3BFTA 4R2FA 5HM4B 1NH8A 1LCTA 3AXFA 4BLAA 5A5XB 1B6HA 2XXIA 3O6GA 5I59A 1LCFA 3TAJA 3IO6A 4R9FA 4BDMA 3ZSFA 4KI0E 1R1NA 3SEWA 1SYHA 2ALUA 2F6GA 4H1XA 2ESNA 3B6QA 3BFUA 3CIJA 2XD2A 4WEDA 3U8QA 2Q2CA 4ZS9A 1J1NA 2Q9TA 3M3LA 1MQIA 1A55A 2DSFA 3U72A 4Z7EA 1SYIA 4AQ4A 4QHQA 4QFNA 1AL3A 1LBCA 2DP8A 5I58A 2DVZA 2OCUA 1B3FA 2DXYA 4KR5A 3MPLA 3O9PA 5I56A 4FE8A 4FEDA 4C1TA 3E9XA 3EPEA 1IIWA 5JTYB 1AMFA 3N26A 1JNFA 3QUJA 3FZVA 1JEVA 3K2DA 1BIYA 1FQCA 1B5HA 2OJTA 2XHDA 3THIA 3DELB 1QW0A 3UK4A 2FA7A 2V25A 3E13X 2VHAA 3DP8A 3IO4A 4N6PA 3WAFA 2DWAA 3QYTA 3OO9A 3FVKA 5CI5A 4RXLA 2GHAA 1L5TA 5K2XA 1FQDA 2X26A 4ELOA 2OWSA 1MM7A 4HS7A 1A8FA 3GZGA 3QAXA 1NNPA 3MVZA 1LAGE 1BLFA 3MAMA 4MFIA 3PGFA 3Q27A 2XD3A 4GFRA 4EXKA 3PV0E 3FATA 3EF7A 5F1QA 5L9OA 3MPKA 3OEKA 2F7AA 4ZEDA 4PFYA 3SKPA 1O64A 4P0GA 3RNNA 5BWJA 1M5CA 1A7LA 1A40A 3KZGA 3G3FA 4PP0A 4F1VA 1H43A 1N84A 2QS1A 3VVFA 1NKXA 2WKYA 3MVYA 4GLIA 4DE8A 3MP6A 5CBRA 3FXQA 5L9SA 3S9EA 1P1OA 4HCYA 4QSEA 5JEIA 5DEXA 2D5WA 3H7MA 4ISUA 1ZLQA 3MWBA 2QS3A 2RKMA 3DP4A 2Y7PA 3IORA 3PMXA 2XXUA 3O6HA 4IGRA 4OESA 4YMBA 1LAHE 3FXUA 3VDFA 4LZ8A 2GHBA 1VE4A 3RN8A 2F34A 4OEVA 4O3CA 1P1WA 3Q26A 1DTZA 1XVYA 5CRYA 4LZ5A 3QXMA 2OWTA 1OVBA 3FGSA 3PUWE 2E0SA 3RGYA 3ECRA 1JQFA 1BP5A 4QFLA 1NH7A 2AYSA 4DXUA 3B6TA 5I59B 3FVOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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