4F19A

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with arsenate at ph 4.5
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
molecule tags Phosphate-binding protein
source organism Pseudomonas fluorescens
total genus 115
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f19A02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f19A01
4DXCA 3IOUA 3G3HA 4GVOA 1UIVA 5H8NA 2R9JA 4EF1A 3R7XA 1A99A 2DS9A 3Q27A 4F3GA 3TELA 3D4CA 4RXLA 3THIA 3K6XA 2F7CA 1LAFE 3OO9A 4M4GA 2PBWA 1DPEA 1SYHA 3MW0A 4ZZAA 4DZ1A 2O7IA 2XX9A 4F1UA 1MS7A 4IO6A 1VE4A 2XX8A 1LFHA 5ITOA 3E9XA 1ZTYA 4NMYA 2H99A 2M8CA 3E3KA 4F22A 2HQ0A 3DP4A 3D4GA 2NVUB 3KSXA 1OVBA 3PPPA 1EH3A 4KCDA 1US5A 2O1MA 4IY6A 4DCXA 4QHQA 3Q28A 4ELQA 5CMBA 1QKBA 5ITPA 1ZMGA 5AE4A 3OSRA 2RC8A 1ZIUA 3SETA 4NWCA 2I3VA 1LCTA 3KJTA 1UTHA 3TEPA 3I5OA 3QUFA 4FECA 4FE8A 3B6TA 2D5WA 3S9NC 3Q25A 4XXUA 4ND9A 3T9XB 2Y7RA 1B1XA 4MH5A 4L17A 1B3HA 2PVUA 3K1MA 1VFDA 1D9YA 1D3KA 3ONMA 3RTWB 1Z7NE 1PDAA 1P1UA 3VXBA 1QW0A 3H6TA 4KPTA 3IB2A 3TDJA 3VLUA 2F36A 4NE4A 4FAJA 2A5TB 3IO4A 3K1NA 4N07A 5I2NB 1XS5A 3OO8A 4R9GA 1NKXA 1XT8A 1D4NA 3PV0E 3M3FA 4QFNA 3KG2A 3OO6A 4MF3A 3T96B 4X48A 3TPAA 3T9VA 1MXZA 3CG1A 1PB9A 3MZBA 5CC2A 5B70A 3VVEA 2UVIA 1EU8A 1A8FA 3SEWA 4F2QA 4GL8A 5CRYA 3RGYA 5ELVA 3V89B 1WODA 3OXNA 4F1VA 3TODA 4IO4A 4G4PA 5ISUA 1ZKBA 4H1XA 3K6VA 2ABHA 2F7BA 1FQAA 4PFUA 4DE8A 4G68B 2OBGA 2X26A 4LZ7A 2Q89A 4ZS9A 3K1PA 3CVGA 2I3WA 2WKYA 1T0KA 4QF9A 1SQYA 3TKDA 5L9OA 3FGSA 1OLCA 2DSFA 3K00A 1B0LA 3MC2A 3JYRA 1LAXA 3PPQA 3C32A 3U8QA 4PFTA 1WVJA 4G8HA 4OTEA 1MY0A 4LVQA 4KHZE 3MZ1A 3IORA 1DTGA 1B7UA 3G3IA 3FATA 1Y4CA 1IXCA 3KN8A 3M8UA 2F7AA 1XVYA 1ZJLA 1ZBMA 2REJA 3EHUA 1AIVA 3K01A 1NL5A 5I56A 3MWBA 1DPPA 3LBSA 1B9JA 4R72A 3O66A 5F1QA 4I9DA 2F78A 1DTZA 4U22A 1RYOA 4LZ8A 2VD3A 4OFLA 4H8IA 4PQJA 2Z8DA 5H8QB 1FTMA 1IXIA 1H43A 2RKMA 1BKAA 5CBSA 1OQHA 3KSJA 4H67A 3PMXA 2XD2A 5I2KB 2CMOA 1N3XA 1FW0A 2A5SA 1MQHA 2ZXTA 1QUKA 3CFZA 4GFRA 1DMBA 1Z7ME 3CSGA 3EN3A 4OWDA 2ONRA 4NF4A 3RT8A 2F5XA 2W7YA 4N6PA 4KD5A 3C36A 2NUVA 1UQWA 4GL0A 1S9TA 3WAEA 1Y3PA 4ESXA 2QL3A 3M3LA 4DIGA 3G3JA 4NF6B 4U1ZA 1JVYA 4P11A 2D3IA 1MG1A 2P0SA 2ZMBA 4QFLA 1TXFA 2XXUA 2H5YA 3EHTA 5BUUA 5KDTB 3C4MA 2D21A 2ESNA 2I4CA 5DEXB 2V3UA 2DWIA 2P1SA 4OENA 5CM6A 1O7TA 1B5HA 4ZEBA 3K4UA 1FQCA 1MDQA 3C31A 2HAVA 2BJJX 2QPQA 3N6TA 3IO6A 2GH9A 2B3BA 3TTRA 5JEIA 5DVJA 2GHBA 4G8MA 4POWA 4RA1A 1CB6A 1WDNA 4QFKA 4GRKA 4U4XA 4F1YA 1SD3A 3QUJA 5DT6A 1R9QA 4IO5A 1MM6A 1A55A 1Y3NA 4I8CA 2HFBA 1JETA 4KFQA 1NMUA 1MXYA 2DWJA 2VD2A 3KZGA 5I58B 5TPAB 4DDDA 3IB1A 2DWHA 3MBPA 3MP8A 4K3FA 1MXXA 1B7HA 5HM4B 4O3CA 1USYH 4XKQA 1B5IA 4O3AA 2RF1A 3EQ1A 3W9VA 5HBCA 2RCAA 2HZLA 4DXUA 4YKJA 3O6IA 4PFYA 1Y1MA 3GZGA 3PPNA 1PBQA 5DVFA 3WAFA 1Y20A 3ILUB 1SW5A 2R6GE 1TWYA 3AXFA 2O68A 1P99A 2P2AA 2AL5A 5CI5A 3JZJA 2Z23A 2LAOA 4YMAA 1IQ7A 3C35A 1BLFA 2E1SA 4QFOA 3V8XB 2XXXA 3MZ9A 4EDPA 2Z8EA 1B2HA 2V3TA 4BDMA 1N7XA 4KCCA 3RY3A 1BP5A 4YKPA 2HZKA 3BFTA 1UTHB 5TP9B 3MP1A 2I49A 2XXIA 3UA8A 3LSFB 3FASA 3UGWA 1FTKA 1LGBC 1NNPA 3Q29A 1B3LA 1QUJA 5I57A 5BWJA 5H8FA 2QS4A 1QVSA 1AOVA 1B3GA 4JSOA 1L5TA 3B6WA 3UN6A 1S7YA 2Y7PA 5EHMA 1LB8A 4OQOA 4OESA 1B1HA 2AYSA 1XOCA 2XX7A 3OD7A 2UYFA 3A3UA 1OVTA 5IKBA 4XIGQ 1PEBA 3E13X 2OJTA 2H25A 1J1NA 3G7WA 4XTCQ 4WEDA 5L9SA 3P7IA 4AQ4A 1LAGE 3HPIA 4R75A 4RNSA 1SW1A 3C9HA 3LUYA 3MP6A 2FYIA 4X1DA 1Y9UA 3PUWE 4GXAA 4IY5A 1GGGA 3U1OA 3E4RA 3VXCA 1B7ZA 4IO2A 3UK4A 5I59B 3FJMA 2ONSA 2OCUA 4P0IA 1B58A 3SESA 2OZZA 1R1NA 3K02A 5IAIA 3PMWA 4H5FA 1LAHE 1UTBA 3IX1A 3TZAA 1LBCA 2XD3A 1SI1A 2ZNTA 5FTIA 3TUSA 3KBRA 4NWDA 2X7QA 3USDA 5H8SA 4OETA 3R6UA 1R6ZA 1I69A 1P1OA 3O6GA 2FA7A 3TTKA 1B5JA 3MVXA 2XXWA 1SW4A 5A5XB 3M3KA 3ZKKA 4LP2B 1POY1 1BIYA 1TFAA 3IK6B 1N7WA 1A54A 1KWHA 2ALUA 5JK4A 4QSDA 2I4BA 1JEVA 4ISUA 4C0RA 4I62A 5H8HB 5B7DA 4R2BA 5KZTA 1SVXB 1FCKA 2VHAA 4ESWA 1N3WA 1LFIA 4R6KA 1O63A 2IEEA 1JW5A 4PE5B 4R73A 3G3KA 5J1DA 5FTHA 3HCQA 4KR5A 3N6UA 3IJOB 3CFLA 2F97A 2RC7A 1QUIA 2E0SA 2YLNA 2I58A 2DQVA 3PUZE 3LC8A 4POXA 1B46A 2XXVA 4JWOA 1B52A 2QJEA 4LA9A 3FZVA 3TTLA 4NF4B 1OLAA 1PB7A 1MPBA 2HCAA 2DXRA 2YPNA 3HSTA 1B40A 3TFLA 3H3GA 5K2XA 3RNNA 1JEUA 4ZEKA 4ECFA 3FXRA 3LR1A 4NF8B 1GTKA 1JW4A 1QJMA 4XKRA 4QSCA 3CIJA 3ECRA 3S9EA 4MFIA 2NOOA 4WKMA 3HV1A 1MH3A 1NNKA 5FHNA 4BLAA 3OO7A 2QMWA 2Q8JA 1R9LA 1FQDA 4JBZA 3QK6A 4UACA 3TQWA 1N04A 3VE1B 3MUQA 3RLFE 4BDLA 3DP6A 1FTOA 3H6UA 1FQFA 3KFMA 4LZ5A 2XHDA 2VP1A 4NF5B 1YAEA 5AA4A 5TU0A 1B32A 1PB8A 4H6DA 2UXAA 3EF7A 1MQGA 3DLNA 1LSTA 2A5TA 1B4ZA 5I2NA 5JTYB 1Y1ZA 2NXOA 3RT6B 2XXRA 4X9TA 2UVHA 4DXBA 1CE2A 3FJ7A 2DP8A 2FNCA 3BFUA 1XVXA 2ZYKA 4DCYA 4R6YA 4E0XA 4BDOA 1MXVA 3FVOA 1URSA 1MXWA 1SI0A 2KLFA 3KJ7A 4NEDA 4HS7A 4ZEFA 5AA2B 4ONYA 3CR9A 1MQDA 4U1OA 3VDFA 4F3SA 4ZEDA 1H44A 4FEBA 3O28A 4OVJA 4YAHX 3FVNA 3HHGA 3QSLA 4G68A 1VFEA 4C1UA 1B05A 1P1WA 2O84X 4EF2A 4R74A 3F11A 2DVCA 3SEYA 2ONKE 1MY3A 1MQIA 2Y7KA 2YJPA 2R71A 1B3EA 5AA2D 2V84A 4R2FA 3N5LA 3I3VA 1SDXA 2DOJA 3FXQA 1B0HA 3IOTA 1SYIA 3KN3A 4F39A 3V5AA 3FVGA 3PD9A 3TTNA 4EXLA 1AL3A 3LSXA 1MPCA 4LQ5A 4JXIA 3PPOA 4QSEA 1LBBA 1LLSA 4TOZA 3S2VA 5H8NB 4HTGA 3IAZA 4DLDA 4OYVA 3VFJA 4BDRA 1II5A 1A7LA 4EQ7A 2O69A 3V83A 2QS3A 5AA1A 4G77A 3VLVA 1OQGA 5H8QA 4IO3A 3SKPA 1POTA 3L6HA 3PGFA 4JB7A 3GLBA 3KOSA 4Z7EA 4EUOA 3K6WA 1QKAA 5I2KA 4RJZA 1TFDA 3O29A 2DXYA 3IL1B 3RTFB 1IUDA 1IZ1A 3SDFA 3FV1A 2ZYNA 4F19A 3ZSFA 4JWXA 3IOWA 4MBPA 2OK2A 4BDNA 1LCFA 1GV8A 1MRPA 1SBPA 2UYEA 1MY2A 1M5BA 5AA3A 1NH7A 4YICA 1AH5A 1IIWA 4JSDA 4U2RA 3OEMA 3KEIA 2OWTA 2ZNUA 4F31B 3JV9A 4R6HA 3KGCA 3FJGA 2DE3A 4GLIA 1Y3QA 4G68C 1JVXA 3ZS6A 3RN8A 3L6GA 4NF6A 4M1VA 2Y7IA 3QYTA 3CSBA 4U23A 1UTBB 2VOZA 2REGA 2DWAA 1M5EA 5KDTA 2Q2CA 1GVCA 5DEXA 4OHNA 2Y84A 1FTLA 1D9VA 5ICQA 4THIA 1JQFA 2VGQA 1JW1A 1NH8A 1H45A 4GIZA 3QIMA 5K2YA 2XXYA 4KYEA 1I6BA 5L9MA 3SERA 4FIMA 2DE4A 4KI0E 1FTJA 5M2VA 3TMGA 3Q26A 1ELJA 2X7PA 1NFTA 4F3BA 4FJPA 4PP0A 1MY4A 2XXTA 1LFGA 2I48A 4TLMB 5DTBA 3FXUA 1XHYA 1B51A 1URGA 1HSJA 3T93B 1Q35A 1FQEA 3N94A 4YZZA 2PT1A 3A3CA 3PUVE 5I58A 3MQ9A 4RYAA 4ZZEA 5TPAA 3T9UA 1VR5A 1Q1KA 3VV5A 1ZU0A 2F8DA 3LSLA 3IB0A 3MVWA 3I6VA 2UVGA 4NTLA 2I6EA 3O97A 2IA4A 1PC3A 3U72A 4Q8RA 1RKMA 5KCJA 4IGTA 4IGRA 1N0TA 3MJNA 4RY1A 4RPNA 3ZKLA 4OXVA 4LONB 2ZYMA 2PYYA 3DP8A 3A09A 3H06B 4HCWA 3TTMA 4LATA 5CMKA 1EZOA 3VVDA 3BKIB 3FUZA 4JDFA 3K0VA 2UVJA 4U4SA 3DELB 3U94A 1LB9A 3IJXB 1US4A 4P0GA 3BBRA 5TP9A 2HEUA 1B3FA 1URDA 3S9LC 3IR1A 3OEKA 3U93A 2HXWA 3PMVA 3H6VA 3MVZA 4ZEIA 2THIA 3O6HA 5I56B 2NWJA 1M5DA 4EQ9A 3TYHA 1OIBA 3GXAA 1EZ9A 3H03A 1MDP1 4F18A 3LSWA 1AMFA 5AA4B 3OMBA 4FATA 4N13A 4WEPA 1IEJA 2F6GA 1M5FA 3CFXA 2GRVA 3C34A 4LQ2A 2O1LA 3EHSA 2RCBA 4MLVA 3OSQA 3ODBA 4PFWA 3UP9A 2XXQA 4F3PA 1A8EA 2XXPA 3PUXE 4FEDA 4FORA 4UA8A 1TT1A 2G93A 3G3FA 2Q88A 3B6QA 3TQLA 1MY1A 1JNFA 1N76A 3MVYA 2ZYOA 1S50A 2I0BA 4OEVA 4C1TA 4ZE9A 3MPKA 5I84A 4TQUQ 5I59A 4ELOA 3CG3A 2V3QA 3R26A 4EXKA 5CMCA 3OELA 1ATGA 4IO7A 1MQJA 1OMPA 4KYSA 1IXGA 3RQTA 1A40A 3HHFA 2PMSA 3K2DA 1YPNA 2OWSA 2H98A 4TLLB 5L8DA 4RK9A 4GD5A 5LOMA 2O6AA 3QAXA 4XKNA 1I6QA 4R9FA 4JWYA 3GBBA 3IOVA 5A5XA 4F2OA 4RPOA 1B6HA 1PBPA 1IXHA 4G2ZA 1MM7A 1MH4A 3SEVA 4ZDMA 4Q5TA 3PPRA 3VLWA 4IB2A 3PD8A 1YTVA 5H8HA 2O7UA 3PU5A 1ZLQA 4ZE8A 3UORA 3KN7A 4HW8A 5F7VA 4OERA 2PT2A 1ANFA 4H65A 4XKPA 2HAUA 2F35A 2GFEA 5CMMA 3PUYE 2QS2A 3N26A 1B4HA 4PETA 1H3DA 4G8NA 1GR2A 2CZLA 2V93A 5HPQA 4ELPA 3TCFA 2H4IA 3H6WA 4YKKA 3RUMA 5CBRA 4OFJA 4H5GA 1M5CA 3TAJA 4ELRA 4I1DA 4YB6A 1XC1A 4YB7A 3VVFA 3EPEA 3MPLA 4GF8A 2O51A 3S4UA 2B65A 4NF8A 3CRBA 4YMBA 3B7DA 3CI8A 2QSXA 5DYHA 4AB6A 2QMXA 4Q30B 4KQPA 2ANJA 4WXJA 1Y4TA 3FIRA 4GQOA 5DVIA 2B3FA 3H7MA 1SW2A 3KOTA 3QXMA 2V25A 2H9BA 3T9HB 1F9BA 2I0CA 4O3BA 3UIFA 4H0WA 2Q9TA 1HSEA 5ICTA 4OFOA 2Y7WA 5FHOA 5I57B 4NF5A 3DM0A 3MAMA 4BDQA 5H8FB 3SEUA 4LUBA 2AIXA 4GWOA 3T66A 2DYXA 4YKIA 1H76A 2QRYA 4GXSB 4OZ9A 3W15C 4MLQA 4AB5A 3T22A 2XXHA 1USYE 1EZPA 2PX1A 5JTYA 5EHSA 2RINA 3TCHA 3RPWA 1VSOA 4QFPA 4QRZA 1FQBA 2GHAA 1NNFA 2F6PA 2Q2AA 3FD3A 4X1BA 2F34A 1QULA 4HCYA 5FHMA 1P1QA 1UIUA 3W9WA 2Z8FA 1I6AA 2OLBA 1O64A 2Z22A 1MPDA 1NNTA 2RC9A 2QS1A 4E0WA 3ILTB 3GBAA 4RK2A 1IITA 1HSLA 5AA2A 2DVZA 4U21A 4OEUA 4H8JA 4ZECA 2ZNSA 3C33A 3H4ZA 3FV2A 4EQBA 5KCJB 1BTJA 2AL4A 3FVKA 1P1NA 1YCJA 4GOTA 1DSNA 4YU0A 1N84A 3SEXA 3S9MC 4F29A 3HO7A 3G3GA 5EYFA 1RYXA 3K6UA 4Z0IA 3HN0A 4OMBA 2G29A 3OENA 3OOAA 4KYDA 3O9PA 3U92A 1DOTA 2DE2A 1MXUA 4Q0CA 4YB5A 3O2AA 3TCGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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