4F1UA

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with phosphate at ph 4.5
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
molecule tags Phosphate-binding protein
source organism Pseudomonas fluorescens
total genus 114
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f1uA02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f1uA01
4Z0IA 3QAXA 1A55A 3IX1A 1T0KA 4BDNA 2DE3A 4IO4A 1GR2A 2XD3A 1LBCA 4ECFA 2DXRA 2OLBA 2F36A 3V8XB 3EN3A 4R6KA 2F7CA 5KCJA 5AA2B 4GIZA 2ZNTA 1OVTA 1B05A 4MFIA 1XVYA 1QVSA 2ZYNA 4POWA 1UTHB 5CC2A 4N13A 2NVUB 4JWOA 5EHMA 4HTGA 2AL5A 1QULA 4FATA 4OEUA 1S50A 4DLDA 2F5XA 4EXKA 1EH3A 1PB8A 4PETA 3UP9A 4ZE9A 3G3GA 1CE2A 2F97A 3B6QA 1FQFA 3MAMA 1UTBA 5BWJA 3OD7A 2DE2A 4NE4A 4R73A 2X7PA 3VVEA 2O7UA 3IR1A 3T9XB 1VFEA 4THIA 3TDJA 1IITA 3IK6B 3R26A 3FXQA 4RPOA 1URGA 3IOVA 3LSWA 3TFLA 4ZEBA 1B3FA 3IB0A 1LB8A 4OQOA 2F35A 4LZ7A 2VD3A 4KR5A 1MQIA 4YMBA 2GH9A 2NOOA 3TEPA 1JQFA 1R9LA 2O1MA 1HSEA 2F7BA 3RGYA 1POTA 3H6WA 5EYFA 2REGA 1LFIA 1SVXB 1MY2A 2R6GE 4FIMA 4DXCA 5BUUA 3V89B 3MP6A 3KOTA 1IXHA 1JW1A 3PMVA 2BJJX 2QPQA 3KSJA 2ESNA 2VP1A 2YLNA 1B5JA 1MXWA 4DIGA 3LR1A 4MLQA 1ZBMA 4QSDA 1XT8A 4LVQA 1GVCA 4O3AA 3PPRA 3TZAA 1PB7A 1SI0A 3F11A 3U72A 3VXBA 1DOTA 3O2AA 3TTRA 1DTGA 2XXRA 4ELRA 3MW0A 1Y20A 2B3FA 1ZJLA 3O29A 2G93A 2GHAA 1NL5A 4OZ9A 3GBBA 4P0IA 3RPWA 2V25A 3G3KA 4HS7A 5ITPA 1H45A 5J1DA 3VLVA 1SI1A 2F34A 5CMCA 2P1SA 1MDQA 1UTBB 1B0LA 3C33A 1B3HA 4GD5A 1FQBA 2D3IA 4OERA 2DWAA 1PBPA 5F1QA 4Z7EA 1VFDA 1MQJA 2DXYA 3FZVA 3O6HA 3FVNA 1KWHA 1GV8A 3JYRA 5CMKA 3VVFA 1A99A 2ALUA 2PT2A 3GZGA 4YB7A 2XX7A 4U4SA 1XOCA 1FTLA 1HSJA 2V3TA 4RPNA 2O7IA 4HCWA 1RYOA 1WVJA 3SEYA 3CR9A 1TWYA 4WEDA 2ZNSA 4YB6A 3S9NC 3UGWA 2XXIA 4BDMA 3UA8A 2Z23A 3MZ9A 3IOWA 3DP6A 2AIXA 1EZPA 3PD9A 3JZJA 3OEKA 3TCFA 1S7YA 5CM6A 3BFTA 3IB1A 5I57A 1B6HA 3DP8A 1NNPA 3CFXA 4R9GA 4EQ9A 1A40A 5K2XA 3HV1A 1SW1A 4F1UA 4LA9A 4M4GA 3VVDA 3LC8A 4JB7A 3I6VA 1UQWA 2VGQA 4U22A 5B7DA 3N6TA 4KQPA 3SEWA 3IO4A 3TMGA 3Q25A 2V3UA 3CG1A 5DEXA 4BDOA 1URDA 4N6PA 3K1NA 3T66A 5I56A 4F3GA 1FCKA 3Q28A 3FGSA 3Q27A 4TLLB 4DDDA 2XXYA 3BKIB 3CIJA 1AL3A 4OMBA 4EXLA 4ELPA 1NH7A 1YPNA 4KD5A 4QFOA 2H4IA 4H6DA 2OK2A 4POXA 1LAFE 1VR5A 5JTYA 4FEDA 3LSLA 5EHSA 2RCAA 1JETA 1FTJA 2QS4A 1QKAA 1XHYA 5TU0A 2RF1A 2XXUA 1EZOA 1RKMA 3G3FA 1FQDA 1Y3QA 4YKIA 3OO7A 4KCCA 3M3FA 1SQYA 3IO6A 3ZSFA 1XVXA 4R2FA 1AOVA 3OOAA 4C1TA 5I57B 1IQ7A 4GVOA 1QJMA 4RNSA 1N76A 1M5FA 3D4CA 4KYSA 3C36A 5I58A 4NMYA 3U1OA 4U21A 3FD3A 3M8UA 3LSXA 2HFBA 5ITOA 1Z7ME 5I2NB 1Y9UA 3N6UA 4NF8A 4ZDMA 1B0HA 5AA3A 3O9PA 3PUVE 2HXWA 4ZEKA 3LSFB 4GL8A 3OO6A 1JW5A 1B1XA 1JEVA 1IXIA 4KI0E 2XXWA 2RCBA 4ESXA 5L9SA 3LBSA 3FV1A 2XXVA 4QFNA 4ELOA 4XKRA 3OMBA 3IOUA 5DEXB 2F6PA 3CSGA 3CVGA 4ZECA 1N3WA 2XXPA 3U8QA 5I56B 2XX8A 4BDLA 4RA1A 1B2HA 1SYIA 2I0BA 1O63A 1DPEA 3HN0A 3USDA 3SERA 1FQAA 1ZKBA 1A8FA 1UIVA 1SW2A 3K02A 2DE4A 3OENA 4R9FA 1MXXA 3BFUA 1US5A 4L17A 2AYSA 3AXFA 1SYHA 1Y3NA 2P2AA 4OHNA 1LCTA 3E13X 2PVUA 3RLFE 1AH5A 3DM0A 1PB9A 2R71A 4ZS9A 4ZZAA 4AB5A 1OVBA 4OFJA 3SEVA 4H8JA 2Z8EA 1NMUA 3H4ZA 5K2YA 4ESWA 4ZEIA 3HPIA 4I1DA 3T96B 2B3BA 4NWDA 1ZTYA 1MPCA 3RUMA 4JWYA 3B6WA 3PPOA 4QSCA 4EUOA 3KBRA 3UK4A 4OFLA 1AMFA 4QHQA 1JNFA 4NF8B 1Q35A 3PMWA 2X26A 4F3PA 1Y1ZA 4MF3A 2DWJA 1RYXA 1MXYA 4NWCA 4WEPA 1L5TA 1LCFA 1D3KA 3IOTA 3OO8A 4F3BA 4GQOA 5ICQA 2Z8FA 3FXRA 2F8DA 2E0SA 2W7YA 3MZBA 4Q30B 4EDPA 3MWBA 2H5YA 1TFDA 2Q8JA 5H8FA 1B46A 2UVJA 5A5XA 3MJNA 4F2OA 4H0WA 4YKJA 1IXCA 2ZYKA 1TXFA 4LQ5A 4ELQA 4PE5B 3K6WA 1N7XA 3S9LC 4EF1A 4YU0A 5H8QB 4KCDA 4IO6A 1MY3A 2DVZA 4G4PA 5FHNA 1OQGA 1I69A 5AA4B 4NF5A 3B7DA 4TQUQ 2DVCA 4EQ7A 1H44A 5HBCA 3PUXE 2V93A 3SEUA 3SETA 4OYVA 3K1MA 3U93A 4IGTA 4ND9A 3U94A 2V3QA 2H9BA 5CRYA 3H7MA 4I8CA 4JWXA 3UORA 3K4UA 4H1XA 3PUZE 4OVJA 4E0XA 2Q9TA 2Z8DA 4QSEA 1I6QA 1GTKA 2IA4A 1TT1A 3HHFA 3B6TA 3EHTA 1B3LA 4QFLA 5L8DA 3QIMA 1ZU0A 4P0GA 3RY3A 3LUYA 4PFWA 3S2VA 3FVGA 1SBPA 3RNNA 5ELVA 3TTMA 1FTOA 3FASA 3IL1B 2XXXA 1WODA 3TTKA 2ANJA 1FW0A 3ECRA 1P1NA 1ATGA 3TCGA 3RQTA 1Y1MA 3S9MC 1MY1A 3MVWA 5H8FB 3T9VA 2CZLA 3H6TA 3C9HA 5A5XB 3MP8A 1ANFA 4GLIA 2ONSA 1DMBA 4K3FA 3QUFA 3HO7A 1NKXA 2O84X 2G29A 1ZMGA 2Y84A 4PFYA 1O7TA 4GFRA 3MBPA 4WXJA 5FHMA 4R74A 1MQGA 3W15C 4G68A 5I59B 3CI8A 5M2VA 3M3KA 4RK2A 1GGGA 4F29A 4NF5B 1FTMA 1B4HA 1P1UA 3T93B 3UN6A 1ZLQA 2PX1A 3IORA 5JEIA 4PP0A 3TQLA 1IEJA 1BKAA 2H25A 1XC1A 2O69A 4P11A 2I3VA 1MXVA 1Y4CA 5L9MA 1B40A 5FTHA 2I48A 1B3EA 3SKPA 3OO9A 2FNCA 1LFGA 3K6UA 4I9DA 2I4CA 4F1VA 3QUJA 3K6XA 4MLVA 1BTJA 3O97A 4PFUA 4G2ZA 1BP5A 1B5HA 2OCUA 1MPBA 4G77A 1SW4A 3FJ7A 1R1NA 2I4BA 1N7WA 4YKPA 5IKBA 2WKYA 3D4GA 4DXBA 1MG1A 1QW0A 1MM6A 1R6ZA 4G68C 1M5BA 1VE4A 3M3LA 1YAEA 4KHZE 1B7HA 3HHGA 2D5WA 2X7QA 1FQCA 4IO3A 3TKDA 1EU8A 1SD3A 1LAXA 4O3CA 5I2NA 1NNKA 5F7VA 3WAFA 2UXAA 3C34A 4Q8RA 4YZZA 3QXMA 1JVXA 2F78A 4EF2A 4MH5A 4DCXA 2OWSA 4G68B 2XXQA 4XTCQ 3IJOB 3OSRA 2IEEA 4XKPA 1J1NA 4GXSB 1Z7NE 2P0SA 2OZZA 2ONKE 4X9TA 4IY5A 3THIA 3S9EA 1DSNA 5HPQA 3T9HB 2V84A 5HM4B 2PBWA 3KJTA 4IO5A 3KN8A 3RTFB 2Y7WA 2ONRA 3CFZA 1LBBA 3VDFA 3VXCA 1US4A 2DOJA 3O6GA 1USYE 2DWIA 4GXAA 4QFKA 2ZXTA 3HCQA 3KZGA 4IB2A 4G8HA 4UA8A 2ABHA 3Q26A 4AB6A 3K00A 2E1SA 1LFHA 1ELJA 1XS5A 4WKMA 2XXHA 3C32A 2NWJA 3K1PA 3ODBA 3UIFA 3KOSA 2DYXA 4UACA 2ZYMA 4M1VA 2A5SA 4F39A 3VV5A 3T9UA 3IJXB 3VLUA 1USYH 3TTNA 2NXOA 4QRZA 4YAHX 3FVOA 3MC2A 1FTKA 2GRVA 3EQ1A 3FJGA 2OJTA 3WAEA 3ZS6A 4GRKA 4U1OA 3GBAA 3QK6A 2QMWA 2PYYA 1MY0A 1H3DA 4ONYA 4G8NA 1P1QA 1QUJA 3P7IA 1NFTA 3PUWE 3DP4A 2I6EA 4ZZEA 3IAZA 5H8QA 3FV2A 3V5AA 2ZNUA 4R72A 4XIGQ 1CB6A 4DZ1A 1YCJA 3KN3A 1I6AA 1LSTA 3KEIA 5AA4A 3QSLA 4H5FA 5DVJA 2QS2A 2Q89A 1Y3PA 4YKKA 4DCYA 2DSFA 1MH4A 3MUQA 2I58A 2Y7IA 3TYHA 4JDFA 4KYEA 4ZEFA 3VFJA 1DPPA 1EZ9A 3VE1B 4C1UA 2I49A 4O3BA 4PQJA 3G3HA 2A5TA 1B3GA 1N04A 2VHAA 5L9OA 1Y4TA 3C35A 3MP1A 3K2DA 1FQEA 3IB2A 4QF9A 4XKNA 2Y7KA 4HW8A 5IAIA 3H03A 3PPQA 2H98A 3GXAA 3CRBA 4ZE8A 2GFEA 4LQ2A 4LUBA 4ISUA 4FEBA 4X48A 3SESA 2YPNA 1YTVA 1I6BA 3G3IA 3MPLA 3Q29A 3E3KA 4U23A 2D21A 1MQHA 2O6AA 2I3WA 3H3GA 5H8SA 2Q88A 3CG3A 1MS7A 3ZKLA 4IO2A 1OLCA 5I59A 3TPAA 2HCAA 2I0CA 1D4NA 3K01A 3MZ1A 1NNFA 4KPTA 3PD8A 2RINA 4F19A 1M5CA 1BIYA 4OENA 2DP8A 5H8HB 1MPDA 1Q1KA 4H67A 2DWHA 2R9JA 3DLNA 5B70A 4I62A 4RK9A 5H8NA 3O66A 2XHDA 3MPKA 1PEBA 3TCHA 4XXUA 3KG2A 1R9QA 2QRYA 2A5TB 5JK4A 4H5GA 1OIBA 1A7LA 2HZKA 4X1DA 3U92A 1II5A 2FA7A 3N94A 4OWDA 3FXUA 1PBQA 4NEDA 4U4XA 3K6VA 3PUYE 1D9VA 1NH8A 3DELB 4DE8A 1B7ZA 1LGBC 1MXUA 1LLSA 4FJPA 2HZLA 4R75A 1OQHA 3FUZA 4FORA 4QFPA 5KCJB 5ICTA 1B9JA 4YMAA 1B52A 2AL4A 3PU5A 2CMOA 4KFQA 1N84A 2RC9A 4IGRA 1IUDA 3N26A 3ILUB 5FTIA 4PFTA 2QJEA 3QYTA 2Q2CA 4NF6A 2REJA 2FYIA 1MQDA 3TQWA 1PDAA 3PMXA 4F22A 4F1YA 1LAHE 1O64A 4LP2B 1OMPA 1H43A 1NNTA 4RXLA 1LAGE 5DVFA 3TUSA 3L6HA 3KN7A 3TELA 2UVHA 4BDRA 4GWOA 3EHUA 5AE4A 1IXGA 2RC8A 3VLWA 3A3CA 4JSDA 4LZ8A 1S9TA 2THIA 4F3SA 5CBSA 4DXUA 1OLAA 3MQ9A 1SW5A 5H8NB 5KZTA 2QMXA 3OXNA 2H99A 2QL3A 3C4MA 2HQ0A 4Q5TA 2YJPA 3RN8A 4EQBA 3OELA 5TP9A 1IIWA 3G7WA 1N0TA 1BLFA 4OFOA 1F9BA 2VD2A 2Y7PA 4FE8A 5DT6A 1N3XA 4R2BA 4RY1A 1M5DA 3MVZA 4MBPA 3W9VA 3A09A 3RTWB 4H65A 3OEMA 3G3JA 3T22A 3R7XA 3V83A 3CSBA 4ZEDA 3EF7A 1MRPA 3EHSA 3H06B 3KSXA 5DYHA 2XD2A 4JBZA 1B58A 3CFLA 3S4UA 3R6UA 3PPNA 1B4ZA 2ZYOA 3C31A 4NF6B 4U1ZA 3K0VA 2PMSA 4AQ4A 5I2KA 2DS9A 3O6IA 5CMMA 2LAOA 2O68A 4LZ5A 1TFAA 3BBRA 4HCYA 1URSA 3SEXA 3I5OA 4IO7A 2Q2AA 5I84A 3RT8A 3ZKKA 4YICA 4OEVA 2HEUA 1DTZA 2M8CA 3OSQA 5LOMA 3W9WA 4JXIA 4KYDA 5AA1A 4F18A 1AIVA 3E4RA 4BDQA 4LATA 5AA2D 2HAVA 5KDTA 3KFMA 3FATA 1MH3A 5TP9B 1A54A 2ZMBA 1B32A 1H76A 3O28A 4OXVA 2HAUA 4OTEA 2UYFA 3H6VA 4FECA 4JSOA 4F2QA 4FAJA 3TODA 3KGCA 4GF8A 3PV0E 1PC3A 1JVYA 1SDXA 2GHBA 4E0WA 2NUVA 3MVXA 1MY4A 4NTLA 1QKBA 3TAJA 1IZ1A 4NF4A 5CI5A 4RYAA 5TPAA 3H6UA 1WDNA 1MXZA 4C0RA 2Z22A 2QSXA 3FVKA 1MM7A 2Y7RA 3JV9A 3ONMA 2PT1A 2QS3A 5I2KB 1B1HA 3EPEA 2VOZA 2O51A 1D9YA 1LB9A 4XKQA 5DVIA 1VSOA 2O1LA 3A3UA 4R6HA 2B65A 2F6GA 4TOZA 4OETA 4LONB 3TTLA 1UIUA 4TLMB 2UVGA 5CBRA 1POY1 4U2RA 4YB5A 1ZIUA 5AA2A 1P1OA 2RC7A 4R6YA 3GLBA 2OWTA 3HSTA 3RT6B 1B7UA 3N5LA 5ISUA 2OBGA 4N07A 1UTHA 4RJZA 4H8IA 4BLAA 4IY6A 1HSLA 3E9XA 2QS1A 5KDTB 5DTBA 2KLFA 5CMBA 3L6GA 1MDP1 2XXTA 4Q0CA 3FJMA 3KJ7A 1JEUA 4GOTA 3ILTB 2UYEA 5FHOA 2UVIA 5JTYB 3SDFA 3PGFA 2RKMA 3PPPA 2DQVA 3MVYA 2XX9A 1QUIA 5H8HA 4G8MA 4OESA 2F7AA 1M5EA 1JW4A 4NF4B 1B5IA 3FIRA 4F31B 5TPAB 3I3VA 1B51A 1P99A 4X1BA 1A8EA 4GL0A 1P1WA 5I58B 1QUKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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