4F2OA

Quisqualate bound to the d655a mutant of the ligand binding domain of glua3
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLASGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The loss of an electrostatic contact unique to AMPA receptor ligand binding domain 2 slows channel activation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 3
molecule tags Transport protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2oA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2oA02
1RKMA 2H9BA 4DZ1A 3RTWB 1DTZA 2Q2CA 5CRYA 3S9NC 3K6XA 4OTEA 4GWOA 4G4PA 3C9HA 2DWJA 3IJXB 4FE8A 3KEIA 1MPCA 3IB1A 4G8MA 2Z22A 4G8HA 1GR2A 4OZ9A 3MVYA 4PFUA 1UTHB 1BIYA 4JB7A 1B2HA 2UVGA 5FHMA 1R9LA 1I69A 3FIRA 1P1QA 3IK6B 2D5WA 1JEUA 3H06B 3LSLA 1B7HA 3RPWA 3VFJA 1MM7A 1EH3A 2E0SA 5HBCA 1MQHA 1JW1A 3D4CA 4OQOA 4F3PA 1USYE 1LB9A 3MZBA 4Q5TA 3BFUA 3G3IA 3OEKA 3TTRA 2QPQA 1AMFA 3CR9A 5AA2A 3IO4A 2YLNA 4R72A 1UIUA 4OEVA 3T9VA 2I3VA 1RYXA 2QS3A 5L8DA 1NNKA 2GHAA 2PYYA 3N26A 3CVGA 2ZYMA 1MY4A 5L9MA 2I58A 2W7YA 3KZGA 1B4ZA 1LLSA 2PT2A 3HN0A 3T22A 2OCUA 4H5FA 5JTYA 5FHOA 1N3WA 3FGSA 1O64A 4U1ZA 3MPLA 4X1DA 3VXCA 3DM0A 4YU0A 5HPQA 2Y7PA 1SI1A 1QKBA 2QMXA 2HFBA 3PPNA 3KSXA 3T93B 3HV1A 4U23A 2O51A 3K6UA 3RGYA 3QSLA 4OFOA 3JYRA 1FQDA 2I0BA 1N76A 3FJ7A 3R26A 1R6ZA 4BDLA 4ZZEA 4TQUQ 1Q1KA 5I2NA 2F35A 5A5XB 2Z23A 3FUZA 5JEIA 4OENA 1OVTA 5FHNA 1GGGA 3MC2A 4IO6A 4R74A 2ESNA 4MBPA 4NF8A 4YMBA 4QSDA 3I6VA 4R6YA 1VR5A 5CI5A 2DSFA 3VVFA 4DCXA 4LA9A 1JVXA 2RCBA 4H5GA 2REGA 1Y3NA 2F6PA 1SBPA 2OLBA 3DP8A 2UVHA 3GLBA 4R2BA 3RT6B 2AYSA 3A3UA 1MY3A 2V93A 4IGRA 3SEYA 3O6IA 2UVIA 4FJPA 4AB6A 3PPRA 5EYFA 5H8FA 3QIMA 4EF2A 5AE4A 4O3BA 4YB5A 3USDA 3E13X 2ALUA 4JSDA 1IQ7A 5K2XA 3H03A 5CBSA 3Q29A 2DXRA 1MRPA 3O28A 1P1OA 2IA4A 4OXVA 3PU5A 4TLMB 3ODBA 4Q8RA 3KOSA 1D4NA 2ZYOA 2AL5A 1IZ1A 2Q88A 2O1LA 4ZEDA 4DXCA 4U21A 4Q0CA 4K3FA 3PUWE 2FNCA 2H25A 2X7PA 2OWSA 4KFQA 5KCJA 2LAOA 1NH8A 3Q25A 1ZTYA 5KDTB 3K02A 2DQVA 3EF7A 4GD5A 1B3FA 3IOTA 4X48A 4R9GA 1OQGA 2H99A 3FASA 3FJGA 1QUKA 1B0HA 4HCWA 4PETA 2Y7RA 4PFTA 4GQOA 2DXYA 1LGBC 4F3GA 2VOZA 4H1XA 4RPNA 1MXWA 3O2AA 3M3FA 2WKYA 2F78A 1IITA 1UIVA 2I49A 4QF9A 1H76A 4FATA 3ILTB 4NF5A 1MDP1 1MQIA 1NH7A 4F2QA 4QHQA 4G68C 4X1BA 3ZS6A 3MP1A 3H6UA 1TWYA 1TFAA 1MPBA 1SW5A 1NMUA 3SEWA 1PEBA 2Z8EA 4I62A 1QVSA 1MY0A 4NF6A 4MLQA 1FQBA 1M5DA 3RUMA 2O69A 1BTJA 3GXAA 3S9EA 3R6UA 1MPDA 4KHZE 3UORA 1US4A 4U4XA 2I4BA 1P1NA 2PMSA 5CM6A 1XC1A 1URDA 1LBBA 1UTBA 2R9JA 3FV2A 1PB9A 3OMBA 2I0CA 4DIGA 3A3CA 5I59A 2HQ0A 2HCAA 3CFZA 3U8QA 2PT1A 2VP1A 3MBPA 4XKRA 3WAFA 1QJMA 2UXAA 4EUOA 3OENA 4PQJA 4ELOA 3CFXA 3GZGA 3PD9A 5H8QA 5BWJA 3K01A 1O63A 2QS2A 4E0XA 1II5A 3UP9A 3H4ZA 2DVZA 4MFIA 1MXVA 3VLWA 3DP6A 2ZMBA 5CMCA 4ZEKA 3EPEA 1OVBA 2XXUA 5I58A 1NKXA 2I4CA 3TYHA 5KZTA 2E1SA 4WEDA 3T9HB 2XX9A 4BDOA 3UK4A 3FXUA 4YKKA 3UGWA 3PUXE 1TT1A 3CG3A 1VFEA 2RINA 4H8IA 4P0GA 1MS7A 1M5FA 2DVCA 3HCQA 2HZKA 3B6WA 3MZ9A 3K1NA 3OSQA 2NVUB 3BKIB 3C35A 3SETA 4I1DA 4N13A 2RC8A 1LAXA 4THIA 1URGA 5JTYB 2P2AA 5EHMA 1KWHA 2ZXTA 3QXMA 5K2YA 3IO6A 3DLNA 2ZYNA 1WDNA 5I57A 5H8NA 3T66A 2NUVA 2V84A 1B52A 1SYHA 3U92A 3ZKKA 3T9XB 5I56A 2GFEA 5I2KA 4OYVA 4KYEA 1H43A 4HTGA 3PMWA 3H6TA 2V3QA 1XVYA 1A8FA 4DXUA 2B65A 3KGCA 4RA1A 4MLVA 4PFYA 1LAHE 3HHGA 3SESA 4G68B 3PPQA 2X7QA 3OD7A 1AH5A 4C1UA 1BP5A 2RF1A 2F8DA 4M4GA 3I5OA 5AA3A 4GF8A 2PBWA 1LAFE 1I6QA 3TEPA 1SDXA 4LQ2A 4NF8B 4JDFA 4H0WA 3MAMA 1B5HA 4JBZA 3AXFA 3KBRA 3LBSA 3N94A 4LZ5A 3CG1A 4ZE9A 3FZVA 1MY2A 4OETA 1N84A 3K2DA 4IO7A 4LP2B 3TODA 4ELRA 4NTLA 1XS5A 4WKMA 4IGTA 4RY1A 1WVJA 2R6GE 3QUFA 1S9TA 2Y7IA 2OZZA 4LQ5A 3O9PA 2DOJA 3KN3A 3C32A 3CSGA 2V3UA 3QUJA 3I3VA 3TELA 4YB7A 5TPAA 2B3BA 3V83A 1EZPA 2ONKE 2XX7A 3MUQA 4YKJA 1B32A 4LATA 1UQWA 1MXYA 4FEBA 2XXPA 3KN7A 1FQFA 2HEUA 3O29A 1H45A 5CC2A 3MP8A 4ZE8A 1YPNA 1JETA 2OK2A 2XXRA 4C0RA 4YMAA 2F7BA 3QK6A 4ZZAA 1MG1A 3PUYE 4ZECA 1EU8A 1POTA 4ISUA 3VE1B 4FEDA 4L17A 2XX8A 3LUYA 4AQ4A 4EXLA 4NMYA 4LONB 3W9VA 5TP9A 3E3KA 1B7ZA 4IO3A 2D3IA 1P99A 2PX1A 3KOTA 4NF5B 1DMBA 1IXGA 1LFGA 1N7WA 3IL1B 5FTHA 3UN6A 4IY5A 1A54A 3W15C 4F1VA 4F31B 2I48A 1MY1A 5J1DA 5AA4B 4FORA 5DVJA 4FIMA 1A99A 4QRZA 4OFJA 1P1WA 4P0IA 5L9SA 3B6QA 3U1OA 1UTHA 3SEVA 1XVXA 4FECA 2XXQA 1LSTA 1IUDA 4PP0A 3KSJA 3CIJA 3UA8A 2Z8FA 1ZBMA 2OWTA 5CBRA 5BUUA 3IOUA 1JW4A 1BLFA 2DS9A 2B3FA 3IR1A 3IB0A 2RC7A 4ZEFA 2Z8DA 3EQ1A 5H8QB 1LCTA 2H5YA 4ELQA 3K1MA 3ILUB 3LSWA 3W9WA 2Q8JA 3S9LC 2VHAA 4F29A 1ELJA 1S50A 2OBGA 3G3GA 2BJJX 4AB5A 2I6EA 2THIA 5H8SA 5I58B 3TTNA 3TQWA 1FTOA 1NNPA 2O1MA 3MJNA 1FTJA 1A8EA 4I9DA 1PBPA 3E4RA 4HW8A 1DSNA 4YKIA 3TDJA 2RC9A 3T9UA 1SW2A 4GXSB 3QAXA 4NWCA 2YPNA 2HZLA 1PB7A 1B4HA 1QUJA 3OOAA 4OHNA 3E9XA 3K1PA 1EZOA 1Y3PA 3SERA 3PUVE 3N6TA 2XXVA 2HAVA 1XHYA 3GBAA 3C33A 3K6VA 4JWOA 2F34A 4N6PA 5I57B 1SW1A 3PGFA 5LOMA 4GOTA 1Y3QA 2XHDA 5I2KB 1H3DA 3QYTA 1N0TA 4UACA 4F2OA 2H4IA 1A40A 1PB8A 1R9QA 3MVWA 4E0WA 5L9OA 5A5XA 1NL5A 1AIVA 3PD8A 5H8HA 1YTVA 3RTFB 4IO5A 1Y9UA 2XXXA 2ZNSA 2VGQA 4Z7EA 1FCKA 2DP8A 3MWBA 5CMMA 2VD2A 4H6DA 4R9FA 1FTKA 1JQFA 1JVYA 3FV1A 5AA2D 1PDAA 3O97A 4LZ7A 3V5AA 4NF4A 3LSFB 1L5TA 1B3LA 2V3TA 3RNNA 1TFDA 4I8CA 3PPPA 2AL4A 3PMXA 4BLAA 1M5BA 4OEUA 5DVIA 2Q2AA 2QMWA 4QFKA 4NWDA 5EHSA 4LVQA 4P11A 1SVXB 1HSJA 1LFHA 1MM6A 1MXZA 4OWDA 4DE8A 1GVCA 4NEDA 3EHTA 3ZKLA 2XXHA 3OSRA 2ONRA 4H65A 4DXBA 4ND9A 2O68A 4QSEA 3Q28A 2XXYA 5B70A 4XIGQ 3FXQA 4PFWA 5AA2B 4G77A 5DT6A 4XXUA 4ONYA 2PVUA 4FAJA 2G93A 1H44A 3G3JA 1SW4A 4IO4A 2QRYA 4MF3A 1EZ9A 4OVJA 5TU0A 1B58A 2VD3A 1OMPA 5DYHA 1JNFA 4C1TA 1Y1MA 1B1XA 1R1NA 3TKDA 1URSA 3O6HA 1NNFA 1YAEA 2R71A 3SKPA 3HHFA 2KLFA 1TXFA 4JSOA 3B7DA 1LFIA 4OERA 1N3XA 2XXWA 3VV5A 1ZLQA 2REJA 1IXCA 3IORA 3S4UA 4H8JA 2NOOA 4Z0IA 2Y7WA 2AIXA 3IOVA 3H6VA 5I84A 4F18A 4X9TA 2RKMA 1ATGA 5TP9B 2G29A 1B7UA 4F1UA 4KPTA 5AA1A 4G8NA 4IO2A 5F1QA 2Y84A 3IX1A 1IXIA 3PUZE 2F36A 1JW5A 1YCJA 4BDNA 1OQHA 3L6HA 3EHUA 5I2NB 1ZKBA 1M5CA 4ESWA 1O7TA 1ZU0A 3HO7A 3SEUA 5M2VA 4ZEBA 4U1OA 1M5EA 3HSTA 5ITPA 4KCCA 2QL3A 1BKAA 3JV9A 4EXKA 3K4UA 1RYOA 4U22A 1PC3A 4ESXA 1B6HA 4R2FA 3LSXA 3VLUA 1OIBA 1T0KA 1MDQA 2QS1A 1DPEA 5B7DA 3PPOA 3ECRA 2OJTA 1POY1 2ZNTA 4EQ9A 2ZNUA 1B0LA 1IEJA 5H8FB 1Y4TA 5HM4B 1B05A 1A7LA 1MQJA 3MPKA 3C34A 1GV8A 4EQBA 2F5XA 4BDMA 4DDDA 3KG2A 1Z7ME 2UVJA 3TCGA 3C4MA 3ONMA 3VDFA 5IAIA 4F19A 5ISUA 4MH5A 4HCYA 2F7AA 1GTKA 1SQYA 1B9JA 3BBRA 3V8XB 2CMOA 1A55A 2FYIA 2UYEA 4OFLA 1JEVA 4KQPA 4QFNA 5KCJB 4RNSA 4F3BA 1LBCA 4ZEIA 3B6TA 2O6AA 1IIWA 1OLAA 3FATA 4JWXA 2Q9TA 1MXUA 3VXBA 2XD3A 4XTCQ 3SEXA 4KR5A 4ZS9A 4KYDA 2XD2A 2A5TA 1VE4A 4QFPA 4KD5A 2H98A 5CMBA 3G7WA 5JK4A 2GRVA 3O6GA 2NWJA 1B40A 5DEXA 1XT8A 1S7YA 1FQEA 1N04A 4GL8A 4YAHX 3GBBA 4GXAA 2ZYKA 2O84X 5ELVA 3CRBA 3FVGA 1B3HA 4O3AA 1D3KA 4NF6B 3TCHA 4N07A 1LB8A 4OMBA 4U4SA 4KI0E 4G68A 2GHBA 1NFTA 3MVXA 1Y20A 4YB6A 4TOZA 1CE2A 5ICTA 1ANFA 5H8HB 2IEEA 4R73A 4LZ8A 3R7XA 1QUIA 2DWIA 2RCAA 5DTBA 3P7IA 4HS7A 4JXIA 1MXXA 4ZDMA 1B51A 3WAEA 1UTBB 2ABHA 1DPPA 3HPIA 1SYIA 3KJTA 3KN8A 5I59B 1AOVA 2CZLA 4R75A 3S9MC 3L6GA 4Q30B 1B3EA 1IXHA 1XOCA 3OELA 2Q89A 4YZZA 4GL0A 4NF4B 3H6WA 4XKQA 1ZJLA 2DE3A 3PMVA 3CFLA 5FTIA 1B5JA 4IB2A 2HXWA 3RN8A 1D9YA 4BDRA 3OO7A 4XKNA 3OO9A 5F7VA 3MP6A 1I6BA 1MQDA 3UIFA 1VSOA 2DYXA 4O3CA 1F9BA 3JZJA 4ELPA 3MW0A 3C31A 3FVOA 3ZSFA 4NE4A 2A5SA 3F11A 3FVKA 1D9VA 3FD3A 3OO6A 3FXRA 1B46A 3EHSA 2V25A 3FVNA 3RY3A 5CMKA 3TQLA 1HSLA 4GFRA 2M8CA 4R6HA 4GIZA 3G3KA 1FTMA 3CI8A 3OEMA 3TZAA 2QSXA 2D21A 4KCDA 1MH4A 2XXTA 3H3GA 1Z7NE 4YICA 1QULA 3IOWA 3VLVA 3TTKA 2F6GA 3M8UA 3K6WA 2F97A 4QFLA 1I6AA 4EDPA 4BDQA 4M1VA 2ONSA 1OLCA 1B1HA 3OXNA 2DE4A 3M3KA 3N6UA 1LAGE 4DLDA 5H8NB 4XKPA 5I56B 2UYFA 2QS4A 4QSCA 1MQGA 1SI0A 2QJEA 4OESA 4EQ7A 2ANJA 2FA7A 1N7XA 3A09A 1MH3A 3DELB 2F7CA 1B3GA 4RK2A 4F22A 4JWYA 2YJPA 4RPOA 3O66A 4POWA 3TCFA 2HAUA 3TMGA 1CB6A 3LR1A 1LCFA 3V89B 5AA4A 1US5A 3IJOB 4G2ZA 4DCYA 3T96B 3U94A 4H67A 1Y1ZA 2Y7KA 3THIA 3EN3A 3VVEA 4IY6A 4RK9A 4UA8A 4EF1A 1SD3A 1PBQA 2O7UA 4GRKA 3TTMA 3CSBA 1VFDA 4F39A 3TPAA 3TFLA 2I3WA 3VVDA 1P1UA 3S2VA 4RJZA 3PV0E 3TUSA 3K00A 4F1YA 2DWHA 2XXIA 4RXLA 4R6KA 3G3HA 1QW0A 1USYH 3MZ1A 2P0SA 4WEPA 3IB2A 2X26A 5ITOA 2P1SA 3C36A 1NNTA 3TTLA 3KFMA 3M3LA 4POXA 2DWAA 2O7IA 3SDFA 3MVZA 3U93A 4RYAA 1ZMGA 3RQTA 1J1NA 4KYSA 5KDTA 3G3FA 3Q26A 1QKAA 5TPAB 3MQ9A 3DP4A 1WODA 5IKBA 4U2RA 3BFTA 2DE2A 1Y4CA 3U72A 3OO8A 1FW0A 1B5IA 1DTGA 3KJ7A 3FJMA 4GVOA 1DOTA 2GH9A 2A5TB 3N5LA 1HSEA 4PE5B 4LUBA 2NXOA 5ICQA 3H7MA 4YKPA 1AL3A 4ECFA 1FQCA 4QFOA 3K0VA 5DVFA 1ZIUA 3TAJA 3IAZA 3RT8A 3D4GA 4F3SA 5DEXB 4GLIA 1FQAA 1Q35A 4WXJA 3Q27A 4TLLB 3LC8A 3RLFE 1FTLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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