4FATA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 91

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH2 (74-80)S1 (6-10)TI2 (56-59)TVIa1 (13-16)TIV1 (14-17)EMPTYAH7 (174-183)S2 (18-19)S3 (32-33)3H1 (23-25)3H2 (28-31)S6 (71-73)AH3 (94-98)S5 (62-64)TII2 (138-141)S14 (218-225)S7 (85-86)O1 (88-90)S8 (100-109)TII3 (225-228)AH9 (230-244)AH8 (194-202)S9 (111-116)TII1 (116-119)TVIa2 (203-206)O2 (119-121)AH4 (124-129)AH6 (153-164)TVIII2 (131-134)TI'1 (184-187)S10 (134-138)S11 (170-171)TIV4 (165-168)S12 (188-193)AH10 (246-256)TI4 (256-259)S13 (208-211)AH1 (35-47)TI1 (20-23)S4 (51-55)TIV2 (65-68)AH5 (142-149)TIV5 (259-262)TI3 (66-69)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transport protein, membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Functional analysis of a novel positive allosteric modulator of AMPA receptors derived from a structure-based drug design strategy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 91
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fatA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fatA02
4U1OA 1UTHA 1N04A 4PFWA 5H8QB 4EDPA 1NL5A 2DS9A 4XTCQ 3PPOA 2WKYA 4TQUQ 3T9XB 5H8SA 1HSEA 4KCDA 2I49A 3KJTA 3I5OA 1B3HA 2D21A 4JXIA 1CE2A 5I59B 2HQ0A 3PUYE 1B52A 3QK6A 1M5EA 3RGYA 5B7DA 1P1OA 3H6UA 1XOCA 3FVGA 5AA4A 3TODA 2AL4A 2NXOA 3AXFA 1SVXB 4ZZEA 4K3FA 3CG1A 2DQVA 4AB5A 4QFKA 2OK2A 2HAUA 3ZSFA 3GLBA 4DZ1A 1PDAA 4QSEA 3JZJA 4RPOA 1LAHE 3MC2A 5I2NB 2Y84A 3MVXA 3SEYA 3KFMA 3U72A 2F5XA 3K0VA 5JK4A 4U2RA 2XXHA 2UVGA 3W9VA 1PC3A 4FORA 1KWHA 2NOOA 1XS5A 1B3FA 3W15C 1SQYA 1JQFA 1TT1A 2ZNSA 4DXUA 2O1LA 3Q29A 4R73A 3IK6B 4DIGA 5CC2A 4Q5TA 3HHGA 4EXLA 3MVWA 3PMWA 3KJ7A 1NNPA 1LFIA 3KEIA 1LBBA 1RYOA 2UVIA 1ZMGA 5I57A 4KR5A 3IJXB 3PMVA 2Y7RA 4I62A 1FQBA 5FTIA 3A09A 2F97A 2XXQA 1A8EA 5F1QA 4NEDA 2I3WA 3G3JA 3A3CA 2XD2A 5H8HB 3DP8A 1D3KA 4F3BA 2REGA 3LSLA 5H8NA 4ESWA 1FTJA 1XVYA 1Z7NE 1JW4A 3HO7A 2H5YA 3SERA 1WODA 2DP8A 2XXWA 1FQFA 1M5FA 4LQ5A 2O51A 3DLNA 3VVFA 4BDRA 3BBRA 1SW5A 3OSQA 5TP9B 4X1DA 3SKPA 2ZYKA 4NWDA 4G8MA 1WDNA 4P0IA 3B6WA 1N0TA 3EN3A 3K2DA 3TTMA 3MAMA 3T96B 1LAGE 4P11A 1MXYA 2H4IA 4ND9A 5ELVA 5AA2B 3TELA 3VVEA 3RUMA 4BDMA 2YLNA 3C33A 4RJZA 3T9HB 3MVZA 3PMXA 3TCHA 3E3KA 5H8FA 1A7LA 2R71A 5I58B 4EF2A 4U4SA 2Z8FA 4N07A 4ZDMA 5TU0A 3LR1A 4PFTA 3MPKA 1MH3A 3FZVA 2A5SA 1S50A 2DVCA 2DE4A 1MQIA 4THIA 3PPPA 4F31B 5I56B 3LSFB 4H1XA 1IUDA 1ZKBA 2GFEA 4F22A 3SEXA 1B3GA 1H3DA 1OQHA 1MS7A 1P1UA 1XVXA 4OENA 1AOVA 1GGGA 3O97A 4XKNA 3WAFA 1P1NA 3LSXA 2LAOA 1Y1ZA 5FHOA 5ISUA 4OESA 4G8HA 2F7BA 4YB6A 3SEWA 4YMAA 2Z23A 4GD5A 4G2ZA 1LFGA 4FEBA 3MPLA 4QFPA 1QJMA 3CI8A 3U8QA 3KOSA 4DDDA 2Q2AA 5I2KA 5JTYA 2DE2A 3ILTB 3ONMA 4DE8A 4M1VA 2RF1A 4MFIA 4RXLA 1I6BA 3EHUA 4U23A 2HCAA 2OZZA 4LZ8A 2XX7A 4RYAA 1MY1A 4YKIA 4ZEIA 4LUBA 5ICTA 1GV8A 3QXMA 3HN0A 4G8NA 3LBSA 3MP1A 5A5XB 1II5A 1B6HA 4EQBA 3VE1B 2HZKA 1PB8A 3QAXA 4TLLB 3O6IA 3EPEA 4DXBA 2F34A 1B3LA 5KDTA 2KLFA 1N76A 4ELQA 4HTGA 3VXCA 3T9VA 4H67A 3FIRA 4JBZA 2ALUA 2OLBA 1MPBA 2REJA 3T66A 1XHYA 2PBWA 4LP2B 3SDFA 1QVSA 1ATGA 3G3IA 1LB8A 3EHTA 3KN8A 4ZE9A 3KSXA 3TYHA 2XXTA 2PT2A 2ZNTA 4XXUA 1N7XA 2I4BA 4R6KA 2NUVA 2VOZA 3LSWA 3VVDA 3TZAA 3FXUA 1MXXA 2O69A 4HS7A 1BKAA 1B1XA 4NF4A 2A5TA 2RC7A 3IX1A 4WEPA 4BDLA 1JVXA 1IIWA 2OWTA 3FJMA 2PMSA 1B7HA 1B0LA 3O66A 4E0WA 4BDQA 4ELRA 3G3HA 2ZMBA 2ONSA 4OFLA 4OVJA 4FE8A 1XT8A 1FW0A 1IXHA 3TTNA 2HXWA 3C4MA 4GWOA 4NF5A 4XIGQ 4HCYA 2VHAA 3QYTA 2FYIA 2Q8JA 3MP6A 5DVJA 3MUQA 1B7ZA 4WKMA 5DT6A 3FGSA 3G3FA 4POWA 5TPAB 3UIFA 5AE4A 2D5WA 3W9WA 5ITPA 3M3LA 2O7IA 3O2AA 1QKAA 3IB2A 3KG2A 3BFTA 4MBPA 3DELB 1UIVA 2RC9A 1FTKA 1EH3A 2DXRA 1IQ7A 4AQ4A 4PQJA 1MDQA 1DPEA 3K6UA 4OFOA 1MXZA 1URGA 5JEIA 1AH5A 3TKDA 1IEJA 2QS4A 1MQDA 1JEUA 2H98A 3G3KA 3C34A 1AL3A 1OQGA 3OO7A 3TUSA 4IO6A 2GHAA 3TTKA 1Q35A 2V25A 1MY2A 3TCGA 4PP0A 3PV0E 1MY3A 1FQDA 3OO8A 4GRKA 1LGBC 1SW4A 3F11A 1Y4CA 2XXUA 3FXQA 1SI1A 2HZLA 1A40A 4LZ5A 3OXNA 3K1NA 3TEPA 1MQHA 1LSTA 1QULA 2I0BA 4UACA 3RNNA 3T22A 1A99A 1YPNA 3K6VA 2GRVA 4FJPA 1AMFA 2ONKE 3PPQA 4NF6B 4F1YA 4Q8RA 2XXXA 3BKIB 4G68B 3PUZE 1MDP1 1FCKA 2NVUB 1QUKA 5FHNA 1LAFE 4MLQA 3UP9A 5KCJA 2F35A 2HAVA 1R9QA 1UTBA 2VGQA 5I2KB 5JTYB 1BTJA 3C36A 3G7WA 4NMYA 4IGRA 3TMGA 1T0KA 4F39A 3KN3A 1MRPA 3VFJA 3N6UA 3MJNA 1VR5A 3U94A 4QFOA 3RT8A 2XXVA 5CMMA 3IB0A 4F29A 2F78A 1B5HA 4KYSA 2Q9TA 2O7UA 2XX9A 2M8CA 1H45A 3TDJA 1P1QA 5DTBA 3S2VA 1F9BA 1MG1A 3MZ9A 1RYXA 1ANFA 2CMOA 3RT6B 5CBSA 3CFZA 4OYVA 3G3GA 1IITA 3QIMA 4ZEBA 4N13A 3S9EA 3B7DA 3CVGA 1IXGA 1B40A 4GL0A 3SEVA 3B6TA 3H6WA 1S9TA 1TFAA 1MH4A 3SETA 4U21A 4Q0CA 4ZS9A 3C32A 4QF9A 5CM6A 4NF8B 3H7MA 2Y7PA 2Y7IA 3FATA 2F7AA 4R2FA 1LBCA 3T93B 2ABHA 3RQTA 4X9TA 1A8FA 2UYEA 1B7UA 3O6GA 3HPIA 2XXRA 4GF8A 3K1PA 3V83A 3SESA 4ZE8A 3VLUA 1ELJA 2PYYA 3PGFA 1DTZA 1MQGA 5B70A 1JW5A 1IZ1A 2AIXA 3DM0A 2R6GE 3UN6A 2A5TB 1OVTA 3MBPA 5ICQA 2ESNA 3IAZA 2DXYA 3QUFA 5DVIA 1JNFA 1B1HA 3HCQA 5HM4B 1AIVA 3M3KA 3PUVE 4IO4A 5DEXA 2F7CA 3HV1A 3C9HA 4MH5A 3IOWA 1SYHA 4JWOA 2QRYA 3TTRA 3OO6A 3N94A 1Y3PA 1H43A 2ZXTA 4GVOA 3H6VA 2QPQA 1SBPA 1B51A 3O29A 4MLVA 4IY5A 3SEUA 3ZKLA 3IB1A 1Y3QA 2CZLA 2QMWA 3R26A 1R6ZA 3ILUB 2E0SA 3BFUA 2I6EA 5CMKA 3Q27A 4P0GA 1TWYA 2Z22A 1B4HA 1N84A 1SYIA 1B2HA 1LCFA 1TFDA 1NFTA 4YICA 2FNCA 3K6XA 2Q88A 3MVYA 3FVKA 3U1OA 1OIBA 5I84A 5FTHA 1SDXA 1EU8A 4XKRA 4PE5B 2UXAA 3CFXA 3TTLA 1I69A 1O64A 4HW8A 4POXA 5H8QA 2Y7WA 1BIYA 1DSNA 3TCFA 5FHMA 2XD3A 4F3SA 2XXPA 2DVZA 3KBRA 4F19A 1D9VA 4R74A 1P1WA 5CBRA 4KPTA 5I59A 2XHDA 1LAXA 1USYH 1URDA 2XXYA 2V84A 3MW0A 3UORA 1Q1KA 1UTHB 4GLIA 3VXBA 1B58A 2DOJA 2B3BA 4BDNA 2DWAA 4FAJA 2RKMA 3VLVA 2QS1A 4G68C 4H65A 1OMPA 3Q25A 1US5A 3OELA 3LC8A 3TQWA 1FQEA 3V89B 4JSDA 3FVNA 3KGCA 2V3UA 5AA4B 3OO9A 4GIZA 1NNKA 1LLSA 5I2NA 2F6PA 4N6PA 4R9FA 2O6AA 1H44A 5KCJB 4LATA 1DTGA 3IOTA 1B5JA 4E0XA 3MZBA 5J1DA 2QS3A 5HBCA 4C0RA 1NKXA 2X7QA 3HSTA 2DSFA 4PETA 4JSOA 1SW1A 5BUUA 4G4PA 2HFBA 1UIUA 2FA7A 3FASA 2ANJA 1D4NA 1NH7A 4ELPA 4KQPA 2DWHA 1QKBA 3S9NC 3KZGA 4WXJA 1URSA 2YPNA 3MZ1A 4GQOA 5AA1A 4RK9A 4FATA 1EZOA 1MPCA 4TLMB 5H8HA 3FXRA 4C1UA 4R75A 3GZGA 3TFLA 3N6TA 5I57B 2P0SA 1EZ9A 4H8IA 3TPAA 4C1TA 1ZBMA 1NNFA 1M5CA 4EQ7A 3OOAA 3PD8A 2ZYNA 3IL1B 4IY6A 4GFRA 3TAJA 3CSBA 2AYSA 4ZEKA 4H8JA 3M8UA 5AA3A 1VFDA 1M5DA 4KYEA 4H6DA 5H8NB 3D4CA 3UGWA 3FV1A 1MQJA 4KI0E 1MY0A 4ZEDA 2GH9A 4ISUA 2P2AA 4YB7A 1LB9A 4ZZAA 2UYFA 2I4CA 5AA2A 2F8DA 3ZS6A 3K6WA 4OMBA 1SD3A 5I58A 5AA2D 1UQWA 3FJ7A 5EHSA 5L9OA 4LQ2A 3L6GA 3CR9A 4RPNA 1ZLQA 5DEXB 5CMBA 2QS2A 3UK4A 4LONB 4JDFA 3GBAA 5I56A 1QUJA 5H8FB 1B05A 4WEDA 5K2XA 3O9PA 3S9MC 3OEMA 4GXSB 2PT1A 4LZ7A 3GBBA 4U4XA 3Q28A 4JB7A 4H5GA 4JWYA 3O28A 2I3VA 1OLCA 3Q26A 3M3FA 4GXAA 2Z8EA 3FUZA 3CFLA 4Z0IA 1VE4A 3IO4A 2B3FA 5DVFA 1FQAA 2DWIA 3USDA 3IR1A 3S9LC 2I0CA 2IEEA 4I9DA 4F1UA 3H6TA 4YKKA 4LA9A 1FTOA 1ZJLA 2OJTA 1YTVA 1B46A 4F1VA 4R6YA 2VD2A 1Y9UA 2G93A 3MP8A 1H76A 1S7YA 4DLDA 3IOUA 4FEDA 4KHZE 4H0WA 2E1SA 4DXCA 1DPPA 2GHBA 2ZYMA 1NMUA 4F18A 1US4A 4Z7EA 5L9SA 2P1SA 4MF3A 2DYXA 3V5AA 1L5TA 5A5XA 3IO6A 4RY1A 2OWSA 3OD7A 2Q89A 2V3TA 1Y4TA 3RTFB 1Z7ME 1POY1 1Y3NA 4X48A 3L6HA 4R6HA 2QL3A 3U93A 2O84X 4JWXA 4OTEA 5K2YA 4F3PA 1ZU0A 4YKPA 2OCUA 4F3GA 4RNSA 2QSXA 1VSOA 4OEUA 1DMBA 3OEKA 5BWJA 3LUYA 5IAIA 4LVQA 5KDTB 2H9BA 3ECRA 3IORA 1I6AA 3H06B 4R72A 4IB2A 4OFJA 2I58A 4F2OA 2F36A 3R7XA 4U1ZA 3K02A 1O7TA 3K4UA 5F7VA 4KCCA 1N3XA 2Y7KA 1R9LA 4BLAA 1GVCA 4X1BA 3GXAA 2Z8DA 3KN7A 3D4GA 3PPNA 2I48A 4YAHX 2PX1A 2THIA 3PUWE 3U92A 1OVBA 3PU5A 3IOVA 2O68A 4RA1A 4IGTA 3N26A 1EZPA 3CSGA 4YKJA 4NF4B 2R9JA 3HHFA 1YCJA 3B6QA 3IJOB 3O6HA 4EQ9A 3OSRA 4ONYA 2QJEA 3K1MA 4QSCA 4EXKA 2NWJA 3VDFA 4DCYA 4QRZA 5DYHA 1PBPA 5TPAA 1MXUA 5CI5A 3CRBA 4NF5B 4XKPA 2RC8A 3N5LA 1VFEA 4KD5A 1O63A 4NWCA 2YJPA 1LFHA 4L17A 1B9JA 1GR2A 4F2QA 1MM7A 4OZ9A 4HCWA 1QUIA 1FQCA 2X26A 4BDOA 1HSJA 2X7PA 4M4GA 2XXIA 4U22A 1A55A 1RKMA 3A3UA 2PVUA 3H3GA 4RK2A 5LOMA 1YAEA 1J1NA 3VV5A 1PEBA 3C35A 4KYDA 1MM6A 4YZZA 2ZNUA 4EUOA 3ODBA 4ELOA 2H99A 3KOTA 1B3EA 5EYFA 3EF7A 2UVJA 3QUJA 1IXIA 1B32A 1QW0A 3OENA 4H5FA 2UVHA 4PFUA 3FJGA 4OXVA 4YMBA 4YB5A 2QMXA 4NTLA 3EHSA 2VP1A 2AL5A 1NNTA 1OLAA 1IXCA 1R1NA 3MQ9A 1PBQA 3H4ZA 2RCBA 3FD3A 1MXVA 2DWJA 1MPDA 2XX8A 4NF6A 4G68A 2VD3A 4GL8A 1CB6A 2O1MA 1D9YA 4FIMA 3V8XB 1Y20A 4Q30B 2ZYOA 3H03A 3RLFE 1JETA 1B4ZA 4KFQA 2IA4A 4R9GA 2Q2CA 4IO2A 5EHMA 4QSDA 3I3VA 4OERA 3T9UA 3JYRA 2RCAA 1UTBB 5M2VA 3CG3A 4EF1A 4XKQA 5L8DA 3DP6A 2G29A 4ESXA 1JVYA 5HPQA 2ONRA 1PB9A 2RINA 5CRYA 4R2BA 3R6UA 5IKBA 2DE3A 1B5IA 1ZIUA 3E9XA 3RY3A 4DCXA 4I1DA 4UA8A 1ZTYA 4IO7A 1N3WA 4YU0A 4NF8A 2B65A 2F6GA 3DP4A 1BP5A 4GOTA 1DOTA 3WAEA 5CMCA 3PUXE 1I6QA 4FECA 3FV2A 2D3IA 4O3BA 1M5BA 1JW1A 3RTWB 4OQOA 4G77A 1FTLA 3VLWA 5ITOA 1USYE 3E13X 3JV9A 5TP9A 1MY4A 3P7IA 3PD9A 3QSLA 1HSLA 1NH8A 1LCTA 5KZTA 1PB7A 4QFNA 3THIA 1FTMA 3MWBA 3UA8A 3I6VA 4O3CA 5L9MA 3K00A 4ECFA 3C31A 1Y1MA 1SW2A 4ZEFA 4AB6A 2V3QA 1GTKA 4OWDA 4NE4A 2BJJX 4OHNA 3KSJA 4O3AA 4TOZA 4OEVA 4PFYA 3E4RA 1JEVA 3CIJA 3ZKKA 4IO5A 1MXWA 1WVJA 1XC1A 1N7WA 1P99A 3PPRA 4OETA 2OBGA 1A54A 1SI0A 4IO3A 1BLFA 2H25A 2HEUA 3OMBA 2V93A 2W7YA 3FVOA 3EQ1A 4I8CA 3RPWA 1POTA 4QHQA 3S4UA 3TQLA 3RN8A 1B0HA 3K01A 1TXFA 4ZECA 4QFLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4U1OA 1UTHA 2XWVA 1N04A 4PFWA 4KXPA 5H8QB 4EDPA 1NL5A 2DS9A 4XTCQ 3PPOA 2WKYA 4TQUQ 3T9XB 5H8SA 1HSEA 4KCDA 2I49A 3KJTA 3I5OA 1B3HA 1NV5A 2D21A 4JXIA 1CE2A 5I59B 2HQ0A 3PUYE 1B52A 3QK6A 1M5EA 3RGYA 5B7DA 1P1OA 3H6UA 1XOCA 3FVGA 5AA4A 3TODA 2AL4A 2NXOA 3AXFA 1SVXB 4ZZEA 1FBHA 4MNCA 4K3FA 3CG1A 2DQVA 4AB5A 4QFKA 2OK2A 4OVTA 5ET5A 1IMAA 2HAUA 3ZSFA 3GLBA 4DZ1A 1PDAA 2Y5LA 4QSEA 1K9ZA 3JZJA 4RPOA 1LAHE 3MC2A 3GYYA 5I2NB 2Y84A 3MVXA 3SEYA 3KFMA 3U72A 2F5XA 3K0VA 5JK4A 4U2RA 2XXHA 2UVGA 3W9VA 1PC3A 4FORA 1KWHA 2JJKA 2NOOA 1XS5A 1B3FA 3W15C 1SQYA 1JQFA 1TT1A 2ZNSA 4PDHA 4DXUA 2O1LA 3Q29A 4R73A 3IK6B 4DIGA 5CC2A 4Q5TA 4XF5A 3HHGA 4EXLA 3MVWA 3PMWA 3KJ7A 1NNPA 1LFIA 1KZ8A 3KEIA 4GBVA 1LBBA 1RYOA 2WBBA 2UVIA 1ZMGA 3NOHA 4PBQA 5I57A 5ET6A 4KR5A 3IJXB 3PMVA 2Y7RA 4I62A 1FQBA 5FTIA 3A09A 2QVRA 4NF0A 2F97A 2XXQA 1A8EA 5F1QA 4PFRA 4NEDA 2I3WA 3G3JA 3A3CA 4QXDA 2XD2A 5H8HB 3DP8A 1D3KA 4F3BA 1FPJA 2REGA 3LSLA 5H8NA 4ESWA 1FTJA 1XVYA 1Z7NE 1JW4A 2DDKA 4MNPA 3HO7A 2H5YA 3SERA 1WODA 2DP8A 2XXWA 1FQFA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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