4FEBA

Crystal structure of htt36q3h-ex1-x1-c2(beta)
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
402
structure length
402
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQQQQQHQHQHQQQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Beta conformation of polyglutamine track revealed by a crystal structure of Huntingtin N-terminal region with insertion of three histidine residues.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Huntingtin
molecule tags Signaling protein
source organism Escherichia coli o157:h7
total genus 124
structure length 402
sequence length 402
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4febA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4febA02
2I48A 4R9FA 3EQ1A 1PDAA 3MW0A 2F6GA 1NH8A 3T22A 3C34A 5I56A 3MVZA 1B40A 3H6WA 1GTKA 2Y7WA 1BP5A 4EXKA 3IO4A 3LBSA 4BLAA 3OO7A 1XT8A 4LP2B 1ZBMA 4GIZA 2OZZA 2NOOA 3OSRA 3KOSA 4ELOA 2ZXTA 3H6UA 1OQGA 4U2RA 1LBCA 1MXXA 3N5LA 1FQBA 3H6VA 3I5OA 2Z23A 3V8XB 1QKAA 1L5TA 3K6XA 1HSJA 3KBRA 4YB6A 2QS3A 3FGSA 4WEPA 3R26A 3V5AA 5KDTA 2F8DA 3EN3A 1IXIA 4KI0E 1S7YA 1GGGA 3SEXA 2Z8FA 3RUMA 4YB5A 3TTRA 1SD3A 1XC1A 4DCXA 4XIGQ 3ONMA 3IOUA 1Y3PA 3C36A 3USDA 3IK6B 2B3BA 4GFRA 4O3BA 4ELQA 3G3IA 2PBWA 1PB7A 3FXUA 2QMWA 2ZYKA 4KCCA 2UVHA 4OHNA 2KLFA 3GBAA 3U1OA 1NNFA 4H8IA 1EZPA 1VE4A 1N76A 2LAOA 3TUSA 1OLAA 3OSQA 5CI5A 5DEXA 3LUYA 4ZE8A 5DVJA 2DE3A 3KZGA 2Q9TA 4H5FA 3TZAA 1SDXA 1JVYA 1PB9A 5H8QA 1I6BA 4OWDA 4HS7A 2A5TB 1M5FA 5I2NA 3DP6A 1RYXA 3UK4A 3MPKA 3EF7A 3TODA 1URSA 4EQBA 3FV1A 2HXWA 1UTHB 1JEUA 4HCWA 3U8QA 3KOTA 1R6ZA 1MY1A 4GWOA 4I1DA 1Z7NE 3ILUB 2V3UA 4R72A 2HQ0A 4Q0CA 2F7AA 1SBPA 3MZ1A 1D4NA 4F31B 2YPNA 4KYEA 4P0IA 1Y4TA 3DLNA 3T9UA 5L9SA 3UN6A 1ZIUA 4GQOA 4P11A 1MY2A 1DMBA 4U23A 5ELVA 4QSEA 5KZTA 3VV5A 1NNPA 1VFDA 3B7DA 3SEVA 3OO6A 1POTA 3D4GA 1FQEA 3G3KA 3RNNA 4GOTA 1MQJA 3CFLA 5TPAB 2V25A 3QXMA 4NF8B 4UACA 5M2VA 3UGWA 4YICA 3K4UA 2E1SA 3BBRA 3T66A 1QJMA 2UVGA 1M5BA 1D9YA 4FORA 3RT6B 4F1YA 1N7WA 4XKPA 4ZDMA 3U93A 2DWJA 1B32A 1O64A 2XD3A 1NH7A 1SI0A 2XXUA 2H5YA 1DTZA 4G68C 1B9JA 4JB7A 3T93B 1B46A 1DPEA 1J1NA 1URGA 2HAUA 1USYE 2QMXA 1MPBA 1R9LA 1TXFA 5LOMA 3UIFA 4RYAA 5ISUA 2PMSA 3JZJA 4JSOA 2UVIA 4OXVA 1LSTA 3K1NA 3UA8A 1B1XA 3Q26A 1MM6A 4MLVA 3SKPA 4H67A 1UTBA 1QKBA 2I4CA 3LSFB 3VDFA 2Y7IA 1P1NA 2VD3A 1IUDA 5I59B 4E0XA 3T96B 2O51A 3FIRA 4UA8A 4TLLB 4QFLA 4HCYA 4H1XA 2OBGA 5L9OA 4GL8A 4U4XA 4IGTA 2Q2CA 1WODA 2O6AA 1NFTA 3B6WA 3M3FA 4F1UA 1XVXA 1Y9UA 1MPCA 4ZS9A 1GVCA 3VVFA 4FECA 2D21A 4G68B 4G77A 4Q8RA 2Z22A 1USYH 3CI8A 4IB2A 5JTYB 3IOWA 2Y7PA 1XOCA 4AB5A 2R71A 3IB2A 4LZ8A 1MM7A 4F2QA 3TELA 1O7TA 1JW5A 3G3GA 2REJA 5CBRA 1PB8A 1QW0A 4H0WA 1QUKA 4P0GA 2OLBA 4FATA 5CC2A 4MLQA 2DXYA 1MQHA 4OZ9A 3Q27A 4NMYA 4WEDA 3GLBA 3H6TA 4YB7A 2ZYNA 2NVUB 1ANFA 4U1OA 3WAEA 3GBBA 1DPPA 4LZ7A 4X1DA 1LAHE 3ZSFA 3OEMA 3FD3A 3B6TA 2I6EA 3CRBA 3O6GA 2ZMBA 3G7WA 2F6PA 4EXLA 4XKQA 2XX8A 2VGQA 4MF3A 5I2KA 1P1QA 3AXFA 3QK6A 4LATA 1B6HA 1LFIA 1ATGA 3IB1A 5KDTB 4HTGA 4IO6A 4WXJA 1B0HA 4IY5A 4JSDA 3TTNA 3W9VA 4IO5A 4FEBA 3OMBA 4FIMA 3FJGA 4DCYA 4U4SA 1LFGA 3CR9A 3FVKA 3R7XA 4GL0A 1FW0A 3F11A 3HPIA 3IJOB 4NF5B 4G8HA 4KQPA 1SW1A 1CE2A 2ZNUA 1XVYA 3HN0A 4IO3A 2QL3A 3Q28A 3V83A 3W15C 1AMFA 1MS7A 4OFLA 5ICQA 1I6AA 1H76A 1B5HA 4OERA 3OXNA 2ZYMA 1S9TA 5I2NB 3I6VA 3ILTB 3K2DA 1OVTA 1POY1 4JWXA 1B52A 3GXAA 3Q25A 4NF6A 3RGYA 3TQWA 4IO2A 4YKJA 5I84A 3THIA 1A7LA 4RK2A 2XXRA 4E0WA 4QF9A 4ESWA 3FJ7A 2QS1A 5I58A 1M5CA 1MPDA 4ELRA 3OELA 3U94A 3RN8A 4NWDA 4H6DA 4F18A 1B51A 3OO9A 2GFEA 5EYFA 3I3VA 1IQ7A 1A55A 3PPQA 2AL4A 4BDMA 3FVGA 3PPPA 5CMCA 3RTWB 1B4HA 2AL5A 4DLDA 1PC3A 2XXXA 1KWHA 3H06B 4EDPA 4YMBA 4GF8A 1NMUA 4G2ZA 4F3PA 4GD5A 4QFKA 3LSLA 4YMAA 1IXHA 3T9VA 3N26A 1Y4CA 1SW5A 3RTFB 1UIVA 2D3IA 3VE1B 5BWJA 3EHSA 3PPOA 3G3FA 2FYIA 4RA1A 4C1UA 2GRVA 4RY1A 1TWYA 4H5GA 3CIJA 3E3KA 3ZS6A 5F1QA 3IOVA 4ZZEA 3SERA 1P1UA 4F3BA 2PX1A 5B70A 2PT2A 4NF5A 4PETA 1JEVA 2DVCA 2XXHA 4PFWA 1SYHA 4IO7A 3K00A 4KPTA 4BDQA 2ZYOA 3OEKA 2HZLA 3KN3A 3QIMA 4GRKA 3IX1A 2UXAA 5TU0A 1US5A 2DWHA 5DVIA 3E9XA 1NKXA 1UTBB 2ZNTA 1MXYA 4U1ZA 4JXIA 3ZKKA 1LCFA 5TP9A 4DXBA 1I69A 3IO6A 4DDDA 1ZMGA 4YAHX 4ZEFA 3VVEA 1BIYA 4NE4A 4QHQA 3MWBA 2I3VA 3EHUA 3CSBA 4OEVA 2Y7KA 3PGFA 4YZZA 4R6YA 1ZTYA 1MXWA 4ZEBA 3MP6A 4QFNA 3CFXA 2DE2A 3DP8A 4THIA 2B65A 1PBPA 3CG1A 1FQAA 4OFOA 1MY0A 3HO7A 2RCBA 1XS5A 3JV9A 1YCJA 4DE8A 4RPNA 3MP8A 1M5EA 2YJPA 2Z8DA 1FTJA 2HCAA 1B7HA 3KN7A 2ONSA 3D4CA 1A8EA 5CMBA 1B58A 5H8HA 1R9QA 4DIGA 4AQ4A 1OVBA 2H9BA 3M3LA 4F3SA 2RC9A 1FQDA 5IKBA 2NWJA 4TLMB 2HEUA 1Y3QA 2XHDA 2ONKE 3C9HA 4OTEA 1UQWA 2XX9A 5HPQA 2GH9A 4EF2A 2F34A 4OETA 2P0SA 4F1VA 4RJZA 3SEYA 4ZEIA 3KEIA 4X1BA 2F78A 3FXQA 3PUXE 4R73A 5AA3A 4BDNA 2M8CA 3MBPA 1OLCA 4OFJA 4KHZE 1RKMA 5FTHA 4EQ7A 4QRZA 2O1LA 2H4IA 1LAFE 5I2KB 2DWAA 2OCUA 3KJTA 3HHGA 1IXCA 1B5IA 2YLNA 5H8FB 2RCAA 1DOTA 4NF4B 3R6UA 3MUQA 2Q2AA 3RLFE 2CZLA 4R75A 2Y7RA 4DZ1A 3LR1A 5KCJB 4ECFA 3RPWA 3N94A 2HAVA 3OENA 1LB9A 3CVGA 4X9TA 1URDA 2GHBA 3PUVE 3VLVA 2XXTA 5F7VA 2OK2A 1LB8A 5CMMA 4EQ9A 3PV0E 3H3GA 3QAXA 2I58A 1LCTA 1YPNA 3SEWA 4KCDA 1OQHA 3QSLA 2AYSA 3CG3A 2Z8EA 4ZEDA 3ZKLA 1F9BA 4O3AA 1GV8A 2AIXA 3A09A 1MDP1 1ZJLA 4XTCQ 4R6HA 2VP1A 3C4MA 5AA4A 1LGBC 2FA7A 4PQJA 3RT8A 4C1TA 4NF6B 4OEUA 1FTMA 4KYDA 3LC8A 4POWA 5H8NA 4Z7EA 1A8FA 4G4PA 3UORA 1WDNA 2WKYA 3K6VA 3PPNA 5I58B 4OQOA 4RK9A 3G3JA 4QFOA 4L17A 5A5XB 1EU8A 3IL1B 2I3WA 3IR1A 1NNKA 5DT6A 2THIA 4WKMA 1JETA 4OVJA 4N6PA 1XHYA 5IAIA 1LAGE 1IZ1A 3IORA 1JW1A 2OJTA 1T0KA 4LUBA 2VHAA 4IO4A 1PEBA 3L6GA 4Q30B 2DP8A 1R1NA 1JQFA 3VFJA 2V84A 3PUYE 1AOVA 3MPLA 3K02A 5L8DA 2P1SA 1MG1A 1B3EA 4C0RA 3MVWA 4I9DA 4QSCA 2Q8JA 5H8FA 2I0CA 4FEDA 4NF4A 2XD2A 2G93A 2XXYA 3N6UA 2QSXA 1P1OA 5KCJA 4R74A 2RC8A 4HW8A 2F36A 5FTIA 1A99A 4KYSA 1N84A 1B2HA 5EHMA 3U72A 3UP9A 2DWIA 4PE5B 3K1PA 5I57A 4NEDA 4EF1A 3M8UA 3E4RA 3QUJA 4RPOA 1MXUA 3KGCA 1CB6A 4I8CA 1N04A 4JWYA 4IY6A 2V3TA 2RF1A 3L6HA 1N7XA 5ITPA 3BKIB 1NNTA 3H7MA 1Z7ME 5TP9B 4G8MA 3N6TA 3TEPA 2RKMA 1IXGA 1MXZA 3BFTA 1A54A 3U92A 5L9MA 2A5SA 3C33A 5CMKA 1LBBA 3LSWA 1IITA 3E13X 3MJNA 2V3QA 4O3CA 3IOTA 3MVXA 4ESXA 3QYTA 4M1VA 3S9MC 1BLFA 2HFBA 1A40A 5A5XA 4M4GA 3TAJA 3FUZA 3O6HA 4GVOA 3T9XB 1RYOA 3SDFA 3S9LC 1AH5A 1N0TA 3B6QA 1B0LA 3JYRA 1EZ9A 2VD2A 2DQVA 1FCKA 1MY4A 1YTVA 5H8HB 4RXLA 3SESA 4MBPA 1ELJA 3TFLA 3K0VA 3KSXA 4XKNA 2O7UA 1US4A 1HSLA 4ISUA 2RINA 1Q35A 4OESA 1S50A 3OD7A 3CFZA 1TFAA 3QUFA 1NL5A 3TKDA 4R9GA 3VXBA 3S9NC 1LFHA 1O63A 3TTLA 4F39A 2UVJA 2DSFA 3LSXA 3TTKA 3FATA 2XX7A 2XXQA 3MC2A 3RY3A 4LQ5A 5AA2A 4ONYA 3TDJA 4IGRA 2ALUA 3FJMA 4AB6A 1WVJA 3CSGA 2DS9A 1B7UA 3EHTA 3GZGA 5FHMA 4BDLA 2E0SA 2QS2A 1LLSA 2PT1A 1MDQA 4PFTA 2IEEA 3FXRA 1IIWA 2O1MA 3PD9A 2CMOA 3H4ZA 2X26A 3H03A 1QUJA 3PMXA 4YKKA 3S2VA 4LA9A 2Q88A 1FTLA 3K6UA 3PUZE 1BKAA 4OENA 1MXVA 2I4BA 4MFIA 4F19A 4TOZA 1II5A 4N07A 2XXWA 1FQFA 1UIUA 1P99A 1DSNA 2F35A 3TTMA 4ZECA 3A3CA 1MQDA 4PFUA 3OO8A 1B05A 5CM6A 4XKRA 2DYXA 1D3KA 2QS4A 5JK4A 3MVYA 2NXOA 2O7IA 3SETA 1OIBA 1AL3A 4LVQA 5DVFA 2O68A 4ZE9A 2QJEA 3TCGA 2DOJA 4R2BA 4U22A 2REGA 3FV2A 5AA4B 1B3FA 4X48A 2BJJX 2R6GE 5AA2D 1B3LA 4GLIA 3VVDA 5FHOA 1Y1MA 4YU0A 4FAJA 5H8NB 5HM4B 3P7IA 4LQ2A 4NWCA 3O2AA 4KR5A 1Y1ZA 3Q29A 1JNFA 1Q1KA 3MP1A 4KD5A 2PVUA 1YAEA 1H44A 5ICTA 4K3FA 3O97A 4RNSA 5CBSA 5BUUA 3IJXB 3O6IA 4F29A 4FE8A 4ZEKA 1Y20A 1JW4A 2H99A 3TCFA 1OMPA 3BFUA 4F3GA 4FJPA 2F7BA 4QSDA 3DP4A 1FTKA 3TCHA 2GHAA 4PP0A 3K1MA 2Y84A 1B4ZA 1MH4A 5EHSA 3PPRA 4QFPA 3O66A 4OMBA 4I62A 1EZOA 2ZNSA 2XXVA 4PFYA 4F2OA 1SYIA 1MY3A 1SW2A 2NUVA 1MH3A 2H25A 4JWOA 3HSTA 3OOAA 3IAZA 2H98A 1ZLQA 5CRYA 2I0BA 4R2FA 4GXSB 5H8SA 3PUWE 5HBCA 1Y3NA 4DXCA 1MQIA 3FZVA 3W9WA 1D9VA 1B3GA 2V93A 4N13A 1ZU0A 2UYEA 5ITOA 5I57B 2PYYA 3O28A 3HV1A 3MAMA 2QRYA 2X7QA 2RC7A 1QUIA 2W7YA 2B3FA 1FTOA 4LZ5A 2A5TA 2D5WA 3O9PA 3TMGA 2G29A 5JEIA 3C32A 1SI1A 2P2AA 1P1WA 1MRPA 3O29A 5FHNA 4KFQA 1UTHA 2UYFA 4POXA 5DYHA 3PD8A 3KG2A 4YKIA 3T9HB 3HHFA 1B1HA 1B7ZA 1B3HA 1PBQA 3K6WA 4U21A 4NTLA 5K2XA 1VSOA 2QPQA 3VLWA 3FVNA 3MZ9A 3FASA 1SVXB 3WAFA 1SW4A 3PU5A 3IB0A 3RQTA 1H43A 4DXUA 5I56B 5DTBA 5TPAA 2F97A 2Q89A 4JBZA 3TPAA 4NF8A 1LAXA 1QULA 2OWSA 4Q5TA 2VOZA 3EPEA 1VFEA 3PMVA 4XXUA 2HZKA 4ELPA 3C31A 3C35A 3M3KA 1HSEA 4LONB 2XXPA 3KSJA 3KFMA 1M5DA 3G3HA 1MQGA 2FNCA 1GR2A 3KN8A 3K01A 3VLUA 5B7DA 1AIVA 1TT1A 3SEUA 4BDOA 3HCQA 5AA2B 2DE4A 2X7PA 3V89B 2DXRA 4Z0IA 1I6QA 3A3UA 1DTGA 5K2YA 4GXAA 3ECRA 3ODBA 2F5XA 1B5JA 1VR5A 2ONRA 4BDRA 4H65A 2OWTA 4ZZAA 1N3WA 4JDFA 4G8NA 4YKPA 5I59A 5J1DA 2ABHA 1EH3A 4ND9A 4TQUQ 4MH5A 5AA1A 1H3DA 2IA4A 1IEJA 1N3XA 3S4UA 1SQYA 3TQLA 4OYVA 4H8JA 2R9JA 1JVXA 2ANJA 2ESNA 1ZKBA 1TFDA 5DEXB 2XXIA 3DM0A 1BTJA 5H8QB 2F7CA 3FVOA 4EUOA 1FQCA 2I49A 4G68A 2O69A 3KJ7A 1QVSA 3MQ9A 3S9EA 2O84X 4R6KA 5JTYA 3TYHA 3DELB 4F22A 5AE4A 3VXCA 3MZBA 3PMWA 1H45A 2DVZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2I48A 4R9FA 3EQ1A 4DI4B 1PDAA 3MW0A 2F6GA 1NH8A 3T22A 3C34A 3T1BA 4MEVA 4PDDA 5I56A 3MVZA 1B40A 3H6WA 1GTKA 2Y7WA 1BP5A 4EXKA 3IO4A 3LBSA 4MIJA 1FBFA 4BLAA 3OO7A 1XT8A 4LP2B 1ZBMA 4GIZA 2OZZA 2NOOA 3OSRA 3KOSA 3QMFA 4ELOA 2ZXTA 3H6UA 1OQGA 4U2RA 1LBCA 2OX3A 1MXXA 3N5LA 1FQBA 3H6VA 3I5OA 2Z23A 3V8XB 4PGPA 1QKAA 1L5TA 3K6XA 1HSJA 3KBRA 5IZ1A 4PCDA 4YB6A 2QS3A 3FGSA 4WEPA 4QBAA 3R26A 3KC0A 3V5AA 5KDTA 2F8DA 3EN3A 4OVTA 1IXIA 4KI0E 4XFEA 1S7YA 1GGGA 3SEXA 2Z8FA 1G0HA 2ZZXA 3RUMA 4YB5A 3TTRA 1SD3A 1XC1A 4DCXA 4XIGQ 3ONMA 3IOUA 1Y3PA 3C36A 3USDA 3IK6B 2B3BA 4GFRA 4O3BA 4ELQA 3G3IA 2PBWA 1PB7A 3FXUA 2QMWA 2ZYKA 4KCCA 1EYIA 2UVHA 4P56A 4N15A 4OHNA 2L5VA 2KLFA 3GBAA 3U1OA 1NNFA 1NV6A 4H8IA 1EZPA 1VE4A 1N76A 2LAOA 3TUSA 1OLAA 4HE1A 3OSQA 5CI5A 1LBVA 5DEXA 3LUYA 4ZE8A 5DVJA 2DE3A 3KZGA 2Q9TA 4H5FA 3TZAA 1SDXA 1JVYA 1PB9A 5H8QA 1I6BA 4OWDA 4HS7A 2A5TB 1M5FA 5I2NA 3DP6A 1RYXA 3UK4A 3MPKA 3EF7A 5J16A 3TODA 1URSA 4EQBA 2XWIA 3FV1A 2MKZA 2HXWA 1UTHB 1JEUA 4GX3A 4HCWA 3U8QA 3KOTA 1R6ZA 2B4MA 1MY1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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