4FEBA

Crystal structure of htt36q3h-ex1-x1-c2(beta)
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
402
structure length
402
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQQQQQHQHQHQQQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Beta conformation of polyglutamine track revealed by a crystal structure of Huntingtin N-terminal region with insertion of three histidine residues.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Huntingtin
molecule tags Signaling protein
source organism Escherichia coli o157:h7
total genus 124
structure length 402
sequence length 402
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4febA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4febA02
1SYIA 1BKAA 1F9BA 5DYHA 5I57A 4DE8A 2HQ0A 2H9BA 1Y20A 3VLVA 5AA1A 2Q88A 4IGRA 3TKDA 2V25A 2M8CA 4ELOA 5A5XA 1MDP1 4IB2A 5I58B 3CG1A 2OBGA 1OVBA 5DEXB 2DE3A 2LAOA 2AIXA 2NWJA 1D3KA 4QSEA 4KYDA 4BDOA 3TEPA 3CSBA 2RINA 1LCFA 3K01A 5F7VA 2DWHA 3N6UA 4Q8RA 2DSFA 4YZZA 3MBPA 4C0RA 5DVFA 5B70A 3PUYE 2H98A 4G68A 4G8HA 5I59A 3SEXA 1MG1A 4N6PA 3IOVA 1UTHB 1POTA 1EH3A 4LA9A 2DWAA 1NFTA 1SW1A 2ESNA 3IOWA 3O6IA 4GFRA 1FTJA 1N76A 2HXWA 2GHBA 1JW1A 3OMBA 2Z8EA 3FZVA 3CVGA 2DQVA 2XXHA 4F22A 3QSLA 2OLBA 1B7ZA 3T96B 3OO9A 1URDA 3QXMA 3OSRA 2DWJA 3MPLA 4N07A 5HPQA 3M3FA 1MPDA 1QUJA 3KFMA 1HSLA 2UVHA 2XXUA 1A40A 4QSCA 1DTZA 4MH5A 4LZ5A 4F39A 3MAMA 1XOCA 4BDLA 3KSJA 4NF4B 1OLAA 2H4IA 2YJPA 1S7YA 3KOSA 2QPQA 3GLBA 2REGA 3FVOA 1MXXA 1FTOA 3GXAA 1KWHA 2ZYKA 4DZ1A 3RN8A 1Q35A 2A5TA 3VXCA 3OSQA 2F97A 1B51A 4YB6A 4ZEDA 2F36A 1MQDA 3H6TA 4RY1A 1B2HA 3U8QA 2Q8JA 4I1DA 1M5CA 4PFWA 4IO6A 5H8NB 1H3DA 5CMMA 3EF7A 3HV1A 4ZEFA 2QS4A 3KG2A 1B40A 3SKPA 3EHSA 3OOAA 3FXUA 3OEKA 1SW4A 4QRZA 3JYRA 3PPQA 3KGCA 1B3FA 4GXAA 3U92A 4HS7A 4RA1A 2F34A 4F29A 3FVNA 4ZZAA 5I2KA 1MXUA 1A8FA 4LP2B 3E3KA 3T66A 1IEJA 3E9XA 2H5YA 1GGGA 1M5DA 1BIYA 3ODBA 3B6TA 3ZSFA 1JETA 3TPAA 4JBZA 5TU0A 4NF8A 1AH5A 3IOUA 4OQOA 3RT6B 1J1NA 3RQTA 4POXA 3PUWE 2XXQA 5CMKA 4U22A 4F1YA 3LSFB 4Z0IA 1IUDA 5KDTB 1YAEA 1BTJA 4U4SA 3O97A 3QIMA 5JK4A 2ZNUA 4EXKA 4F3BA 4R6KA 5K2YA 3KJ7A 3EHTA 1Z7NE 3SDFA 3MP6A 1LLSA 1MQJA 4F18A 3IORA 3K0VA 5TP9B 1AMFA 2UVGA 2F78A 2QS1A 3UP9A 3PPPA 3IK6B 3UGWA 4P0GA 4O3BA 4H1XA 5H8HA 2O84X 3RLFE 3WAFA 2ZXTA 1TWYA 4HTGA 1N3XA 3U94A 3H6UA 4RJZA 2B65A 4BDNA 4PQJA 5I2NB 3K1MA 3TDJA 3FV2A 1P1WA 2AYSA 2CMOA 2F7BA 5H8QB 4MLVA 3IAZA 2GHAA 4NMYA 2Z22A 1B4ZA 3CR9A 2QS2A 3T9UA 4THIA 3B7DA 2I49A 3DELB 4EF2A 3CSGA 1NNPA 5CBRA 3OXNA 2F8DA 1H76A 4LQ5A 1Q1KA 2QJEA 3RPWA 2HFBA 3Q25A 4EQ9A 3C4MA 1M5FA 3KEIA 2PT1A 3C35A 4OXVA 1FQFA 5F1QA 5AA2D 2UVIA 1OLCA 3KBRA 2I3WA 5I56B 3K4UA 3WAEA 1ZMGA 1B32A 1TFDA 3OEMA 3PPNA 5AA4A 2HZKA 4RK9A 2O7IA 3OO8A 4NWCA 3PMXA 3IB1A 1ZIUA 5H8FB 2VD2A 4YB5A 1II5A 1FTLA 4YKKA 3CI8A 4HW8A 1IXGA 1XC1A 4OEUA 4R74A 2OCUA 1O7TA 4C1UA 1DPPA 1DSNA 5ICQA 1IXIA 5AA2B 3S9NC 3DP6A 5J1DA 1MXVA 1ZTYA 1EU8A 3I3VA 2A5SA 4TQUQ 2VD3A 2RC7A 4BDRA 4KD5A 2RF1A 4OENA 3O9PA 3E13X 3K6WA 3CG3A 5K2XA 3FIRA 4DLDA 4I8CA 1B3EA 3IJXB 2YPNA 3MJNA 5I58A 3TCHA 1FQAA 1IXCA 5LOMA 1RYOA 3S9LC 2HAUA 4KCCA 5EHMA 4H5FA 5DEXA 3C33A 2PVUA 3USDA 1R9QA 4F1VA 1R6ZA 1PC3A 5ITOA 3Q28A 1I69A 3IB0A 1A99A 3MP1A 4R2BA 3IJOB 1VR5A 4F2QA 3BKIB 1MXYA 2DE2A 4GIZA 3A3CA 4R72A 3G7WA 5CI5A 2XHDA 3TAJA 2PYYA 4G77A 2I48A 4QFOA 1NKXA 3RY3A 1EZPA 2P0SA 1B1XA 5CMBA 1PB8A 3A3UA 1MY4A 2VHAA 1WDNA 3W9WA 3H6VA 3C36A 3O28A 1TT1A 3B6QA 3TTNA 1EZOA 1ANFA 1VE4A 2DE4A 3DP8A 4NF5B 1H43A 5H8SA 1B52A 2BJJX 1SI0A 3IB2A 4C1TA 2O7UA 1R1NA 3MVZA 1SVXB 3QYTA 4ZS9A 1MQGA 2Z23A 2P2AA 3T9VA 5IAIA 1MS7A 2ANJA 3H6WA 3I6VA 4KR5A 1PEBA 3LR1A 4GOTA 3BBRA 5M2VA 4OETA 4M1VA 3VLUA 1Y3QA 1A54A 1D4NA 2XX8A 3T93B 4ESXA 1S9TA 2R71A 3GBAA 3IO4A 1ZKBA 4FEDA 1MM7A 1N7XA 2XXYA 1Y4TA 4R6YA 4F2OA 2ZYMA 1A55A 3K00A 1A8EA 1FTMA 3V83A 3O6HA 3PPRA 2DXRA 1CE2A 4UA8A 4ELPA 4EF1A 5H8NA 2D5WA 4FEBA 3IOTA 1LCTA 5EHSA 1Z7ME 3E4RA 4MBPA 4DCYA 1GVCA 4ESWA 3K1PA 4EQ7A 4GL8A 3RUMA 3W15C 2REJA 2DP8A 1POY1 4PFTA 4MFIA 2NOOA 4I62A 2DVZA 4FE8A 5FHMA 4H65A 4QF9A 2QMWA 2F7CA 3VDFA 2I0CA 1LB8A 2PX1A 3PUXE 4MLQA 4NWDA 4ZE8A 3S9MC 4ZDMA 1B0LA 3S9EA 3H3GA 3VVDA 3IO6A 4IY5A 3PMVA 4DXUA 2H25A 4XKPA 1HSEA 3QK6A 4F31B 2QRYA 4DDDA 3OD7A 5TPAB 4JB7A 4GF8A 3G3HA 4OFOA 4YMBA 4QFKA 1NNKA 2QL3A 4KQPA 2XXPA 1I6AA 1URSA 4NE4A 2DVCA 4F1UA 1LFHA 5I84A 3MZ9A 4OFLA 4UACA 5TP9A 3KJTA 4Q30B 3T22A 2XX9A 1WODA 4ELRA 2NUVA 4IO4A 4DCXA 4JWYA 5A5XB 2O6AA 4H0WA 4IGTA 3FGSA 5I2NA 3GZGA 3H4ZA 4N13A 4Q5TA 5H8QA 5FTIA 1YPNA 2XXTA 3BFTA 1MDQA 1LBCA 2QMXA 1XT8A 4KI0E 4LUBA 3PD8A 3O29A 3TMGA 1PDAA 1B3HA 4JSDA 4EQBA 4KFQA 5KCJB 2XXRA 1VFDA 4JWOA 3N26A 2IA4A 2OWSA 4PP0A 1P1UA 1XVXA 1MY1A 1UQWA 1XS5A 3ZKLA 1MXZA 4PFUA 3C32A 3MZBA 4HCWA 4ONYA 1P1OA 2W7YA 4OVJA 1SI1A 2O1LA 4XKNA 5I56A 4QFLA 2GH9A 3PPOA 3KSXA 3RTFB 1LAFE 1GV8A 3TTLA 1MH4A 2RCAA 4EUOA 3RGYA 3VXBA 2G93A 4GD5A 3TCGA 1B0HA 4ELQA 2AL4A 1AIVA 5FHNA 1TXFA 1NMUA 3KN3A 3JZJA 1JVYA 4OMBA 2V3QA 3VV5A 2QSXA 4QFNA 5AA2A 4GXSB 2CZLA 3SEUA 3MQ9A 1PBPA 4WXJA 4R9GA 1NNFA 3SERA 3FVKA 4KYSA 5JTYB 4EXLA 3G3IA 4NF6A 3VE1B 1FCKA 1WVJA 1FW0A 1Y4CA 2O51A 1NL5A 2A5TB 3LUYA 3U1OA 4G4PA 3TELA 3LBSA 5BUUA 2ZNTA 3FATA 4QHQA 2D3IA 2ALUA 1BP5A 1SW5A 3C31A 4ZEKA 1B3LA 4H67A 4LZ7A 4RPNA 4IO2A 3VLWA 5IKBA 4R9FA 3D4CA 2Q9TA 3C34A 5CMCA 1D9VA 2XX7A 4YB7A 3M3LA 4BDQA 3R7XA 1SQYA 4BDMA 1LBBA 1JNFA 1PBQA 3H7MA 4I9DA 3RNNA 2UVJA 3MVYA 2RKMA 2DOJA 3GBBA 2Y7KA 4YKIA 2Y7WA 5I2KB 2V3UA 3PUVE 4DXCA 2OJTA 3U72A 5KZTA 2OK2A 4JWXA 4IO7A 3ILTB 4WKMA 3UIFA 1SBPA 2THIA 3K2DA 4RPOA 3LSXA 2O69A 2Q89A 1MXWA 1BLFA 3FASA 3SEWA 4ZEBA 4MF3A 4AB6A 3OELA 1Y3PA 1TFAA 2NVUB 3V89B 4NF5A 1P1QA 2ZYOA 2I0BA 2F6PA 5L9OA 2OZZA 4OWDA 1VFEA 1XHYA 5HBCA 2F7AA 5DT6A 3Q29A 1DMBA 2XD3A 1MRPA 4U21A 3TTMA 1N84A 1FQCA 5CC2A 4GLIA 1H44A 1MPBA 2HEUA 4M4GA 4LATA 1FQEA 2P1SA 5CM6A 3DLNA 1QUIA 3G3GA 2X26A 2V93A 1MPCA 2XXWA 3MPKA 4G8NA 1LAGE 4ZECA 4ISUA 3ECRA 2Y84A 1XVYA 3PU5A 1EZ9A 5FHOA 4E0XA 4FORA 4GVOA 3S4UA 4Z7EA 2GRVA 2XXVA 3B6WA 4TLMB 3LSLA 1B05A 1AL3A 1UTHA 2B3FA 3UORA 4IY6A 1Y1ZA 4IO3A 4OEVA 3P7IA 1S50A 2I6EA 4AQ4A 3N6TA 4U23A 2XD2A 3FD3A 2I4CA 4P11A 4ZEIA 2V3TA 4H5GA 5L9SA 4JSOA 4Q0CA 3HSTA 1T0KA 1JW4A 2O68A 3UA8A 5HM4B 4JDFA 1M5BA 3FJ7A 1CB6A 1JVXA 1UTBB 5DVIA 3V5AA 4KYEA 4U2RA 4E0WA 1GR2A 1QKAA 5AA4B 1ZBMA 3QAXA 4U1OA 1O63A 3VFJA 1B5IA 5TPAA 1QULA 4F3GA 1MQHA 4G2ZA 4HCYA 3S2VA 2HAVA 2GFEA 4F19A 4RK2A 3FXQA 3IX1A 4NF4A 1QKBA 1LGBC 3CFLA 1LAXA 1IITA 4G68C 3T9XB 5B7DA 4YICA 1B4HA 5CRYA 3ONMA 1A7LA 2VP1A 2HCAA 5L8DA 2R9JA 4H8JA 1SYHA 4OYVA 1IIWA 2V84A 1US4A 2X7QA 2DYXA 4WEDA 2DXYA 1ZJLA 3FV1A 2WKYA 1JQFA 1ELJA 3KOTA 4OHNA 2Q2AA 4NTLA 3HHGA 4KCDA 3LC8A 3QUFA 3CRBA 2I4BA 2Y7PA 4R75A 1B1HA 2ABHA 4RNSA 3FJGA 1DOTA 1OMPA 1FQBA 2VOZA 3LSWA 3VVFA 2DWIA 5AA3A 4PETA 3SESA 1AOVA 1B46A 4LQ2A 4PE5B 1IZ1A 5KCJA 1JW5A 4O3CA 3FVGA 3KN7A 2RC8A 3TUSA 1URGA 2Z8FA 2B3BA 4X1DA 1Y3NA 1M5EA 3IL1B 2O1MA 5EYFA 2PMSA 1D9YA 1YCJA 4GWOA 1N7WA 3FUZA 3MVWA 3RTWB 5KDTA 1ZU0A 1OIBA 3A09A 1NNTA 3MVXA 3M8UA 1MY3A 3TYHA 3AXFA 3MWBA 3ZS6A 5I57B 4ZZEA 4OERA 3G3JA 3PD9A 1MY0A 2ZNSA 3T9HB 3JV9A 2DS9A 5DTBA 4L17A 2XXIA 2Q2CA 4WEPA 1MM6A 3KN8A 2OWTA 1B6HA 3VVEA 3EN3A 2PBWA 1NH8A 5JTYA 3FJMA 1JEVA 1NH7A 4X48A 4K3FA 3Q26A 3R6UA 1B7HA 3O6GA 3ZKKA 2NXOA 4DIGA 1Y9UA 3O2AA 3OENA 2ONRA 3G3FA 2XXXA 1LFIA 3V8XB 4POWA 3CIJA 1RYXA 4XIGQ 2D21A 4G68B 5I59B 2X7PA 4DXBA 4LZ8A 3I5OA 3TQWA 3SEVA 1N3WA 2AL5A 1GTKA 3HHFA 5ITPA 1B9JA 2Z8DA 4GL0A 3THIA 3O66A 5DVJA 2ZMBA 2E0SA 3HCQA 2ONSA 3K6UA 1UIUA 5BWJA 1N0TA 1JEUA 4TLLB 3MP8A 1LFGA 2Y7IA 4FIMA 4U4XA 3IR1A 4H6DA 1USYH 4GRKA 3N94A 3DM0A 5H8FA 3U93A 3Q27A 1QW0A 2I58A 1USYE 4PFYA 5ICTA 4OESA 4BLAA 4NEDA 1QJMA 3DP4A 4RYAA 1LSTA 4X1BA 4LVQA 4OFJA 3RT8A 3L6HA 2G29A 3KZGA 1PB7A 2UYEA 4XKRA 4EDPA 1Y1MA 1SW2A 3TCFA 4YMAA 3CFXA 1YTVA 1US5A 1B7UA 4R2FA 4GQOA 1QVSA 3QUJA 2E1SA 4OTEA 1B58A 1PB9A 3OO6A 4JXIA 3HO7A 2QS3A 3EQ1A 2HZLA 3G3KA 4QFPA 4R73A 3K6VA 4ND9A 1QUKA 4AB5A 4YAHX 1B5JA 1O64A 5L9MA 2YLNA 4G8MA 1HSJA 3MZ1A 1MY2A 2FYIA 3SETA 2H99A 4FATA 2F5XA 4R6HA 3ILUB 3MC2A 2FNCA 1LAHE 3TFLA 4FJPA 4ECFA 3TZAA 4XXUA 1IXHA 5FTHA 3MUQA 1P1NA 4NF8B 2FA7A 3EPEA 1RKMA 1N04A 1UTBA 3K1NA 3PGFA 4YU0A 3TQLA 4TOZA 4F3SA 2Y7RA 1R9LA 3N5LA 3L6GA 4XTCQ 4XKQA 3TTRA 1VSOA 1H45A 1ZLQA 4RXLA 2IEEA 3HPIA 4X9TA 1I6BA 4O3AA 5ELVA 1P99A 4KPTA 3EHUA 4YKPA 4U1ZA 1FQDA 1FTKA 3K02A 1LB9A 3CFZA 2UXAA 1I6QA 5H8HB 1ATGA 4NF6B 4IO5A 3HN0A 4F3PA 3K6XA 1IQ7A 3UN6A 3PUZE 2F6GA 2I3VA 2RC9A 3M3KA 3H06B 3C9HA 4FECA 1OVTA 3PV0E 4P0IA 5AE4A 3BFUA 4OZ9A 1DTGA 1SDXA 3W9VA 1L5TA 4ZE9A 4YKJA 3H03A 3SEYA 2PT2A 2F35A 3OO7A 5ISUA 5CBSA 3TODA 1SD3A 2VGQA 1MH3A 1B5HA 1B3GA 3MW0A 4LONB 3F11A 1UIVA 1MQIA 3FXRA 2R6GE 2RCBA 2UYFA 1OQHA 2ZYNA 4FAJA 3PMWA 2KLFA 3TTKA 1OQGA 5JEIA 3D4GA 4QSDA 4KHZE 4H8IA 3UK4A 2ONKE 3R26A 1DPEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SYIA 4P3LA 1BKAA 1F9BA 5DYHA 5I57A 1NV2A 4DE8A 2HQ0A 2H9BA 2MKZA 1Y20A 3VLVA 4IR8A 1KA1A 5AA1A 2Q88A 4IGRA 1FBHA 3TKDA 2FVZA 2V25A 2M8CA 4ELOA 1FBFA 5A5XA 1MDP1 2FBPA 4IB2A 5I58B 3CG1A 2OBGA 4GWXA 1OVBA 5DEXB 2DE3A 2LAOA 2AIXA 2NWJA 1D3KA 4QSEA 4KYDA 3ISPA 4BDOA 3TEPA 3CSBA 2RINA 1LCFA 3K01A 5F7VA 2DWHA 3N6UA 4Q8RA 2DSFA 4YZZA 3MBPA 4C0RA 5DVFA 5B70A 3PUYE 2H98A 4G68A 4G8HA 5I59A 3SEXA 1MG1A 4N6PA 4I3YA 3IOVA 1UTHB 1POTA 4JVIA 1EH3A 1FRPA 2DWAA 1NFTA 1SW1A 2ESNA 3IOWA 4LA9A 3O6IA 4GFRA 1FTJA 1N76A 2HXWA 2GHBA 2DDKA 1JW1A 5LTCA 4X04A 3OMBA 4NGUA 2Z8EA 3FZVA 3CVGA 2DQVA 2XXHA 4F22A 3QSLA 2OLBA 1B7ZA 3T96B 3B50A 4PCDA 3OO9A 1URDA 3QXMA 3OSRA 2DWJA 3MPLA 4N07A 2Q74A 4N8GA 5HPQA 3M3FA 1MPDA 4P1LA 1QUJA 1QGXA 2ZZWA 3KFMA 1HSLA 2UVHA 2XXUA 1A40A 4QSCA 1DTZA 4MH5A 4LZ5A 4F39A 3MAMA 1XOCA 4BDLA 3KSJA 4NF4B 5LDZA 1OLAA 2H4IA 2YJPA 1S7YA 3KOSA 4MNPA 2QPQA 3GLBA 2REGA 3FVOA 1MXXA 1FTOA 2Q8MA 3GXAA 4PBQA 4NAPA 1KWHA 2ZYKA 4MCOA 4DZ1A 3RN8A 1Q35A 2A5TA 3VXCA 3OSQA 2F97A 1B51A 4PBHA 4YB6A 4ZEDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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