4FIMA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with celecoxib acid at 1.80 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with celecoxib acid at 1.80 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
total genus 117
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fimA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fimA02
1CE2A 1GTKA 4QRZA 3KN8A 1LAXA 5I2NA 1PB7A 2O6AA 3OSRA 4F3SA 4DDDA 3K0VA 1Y1ZA 2UVHA 2XXRA 5HBCA 2H5YA 2F78A 4H0WA 1R6ZA 1UTHA 3QXMA 5FTIA 3G7WA 1D3KA 1N84A 3ONMA 3HN0A 3G3JA 1MXWA 2REJA 4OHNA 5KDTA 3EPEA 2P1SA 4K3FA 4Q30B 4ZE9A 1B6HA 1SI1A 4U4SA 4NWDA 4G68B 1IIWA 4N13A 1QW0A 4DXCA 2R71A 4EXLA 3G3IA 3K4UA 3K1NA 4H6DA 4LA9A 1FQEA 5JTYB 1XS5A 5L9MA 3M3KA 2ABHA 1IITA 3FJMA 3RNNA 1MQJA 4ZZEA 2I58A 1FTJA 3OO7A 3FXUA 4Z0IA 5AA2B 3O6IA 3FIRA 2B3BA 5CMCA 1ZLQA 2DE3A 4R75A 1MY0A 2I0CA 1UIVA 1YCJA 4KI0E 1I69A 2DE2A 4F19A 3H06B 3CRBA 4E0XA 1UTBB 3EQ1A 1PBPA 2QS2A 3S2VA 1Y3PA 1QUKA 3C36A 1MQDA 5F7VA 2HEUA 3K1MA 3MQ9A 3SDFA 4DXUA 3VFJA 1A8FA 3Q29A 1MXVA 3PPNA 4PP0A 1OVBA 5H8FB 3OD7A 4H8JA 4OXVA 3VE1B 1NNFA 1M5BA 3MPLA 1LFIA 5L8DA 2V84A 3H4ZA 2FA7A 2YLNA 1ZBMA 1MQHA 4XKPA 5HPQA 4POXA 4GF8A 1Y4CA 2NXOA 1A55A 3FGSA 1ZKBA 4R6KA 3IB0A 4QFKA 4MF3A 2DXYA 2ZYOA 3T9UA 3TTMA 3FVGA 4ELOA 1GV8A 3O66A 1NFTA 3HO7A 2I48A 3RY3A 1SYIA 3KN3A 5I57A 1N3WA 2M8CA 4EQ9A 2DXRA 4QSCA 3S9MC 4IO5A 3C33A 5M2VA 1MS7A 1B7HA 3C34A 4XKRA 5FHMA 1LCFA 2ZYMA 2A5SA 5LOMA 1QUJA 4ZEKA 2VP1A 3PPOA 1D4NA 4QFPA 1R1NA 3N94A 2RC7A 4RY1A 2E1SA 2I0BA 5A5XA 1A54A 1TXFA 2Y7IA 2F36A 2PX1A 1B51A 1N7XA 3RUMA 4QFOA 1OLCA 3O6GA 1VSOA 2UYEA 4ZEBA 3T93B 2YPNA 1QKAA 2ZYKA 4NWCA 3EHTA 2DQVA 2OWTA 3IOVA 3PPQA 2R9JA 4HCYA 4F39A 3IK6B 3CI8A 3MVXA 1MXUA 4GXAA 2VOZA 3QSLA 5H8QB 4GLIA 4NTLA 1YTVA 2VHAA 3IO4A 3K6WA 1USYH 3FASA 2DWHA 4R9GA 1ZIUA 1B5IA 1QULA 2RCBA 1NH7A 1M5EA 4BDQA 3M3LA 3N6TA 3EN3A 4F1UA 5ISUA 5K2YA 1SW4A 2UVGA 5F1QA 3OSQA 3KOSA 4NF8A 1B3FA 3MVWA 3S9LC 1DSNA 3PV0E 1SW2A 1MDP1 3KG2A 3QUFA 5DVFA 1A7LA 2H9BA 3KZGA 2V93A 4NF4B 1P1UA 4YKIA 2O1LA 2G93A 5JEIA 4GL0A 4PFTA 2PT2A 4U2RA 1F9BA 1OLAA 3L6HA 4U21A 1AL3A 1FQFA 2XX7A 2WKYA 3LSLA 2REGA 2QL3A 1S7YA 3OMBA 1AH5A 5I2KB 2F7CA 4RXLA 4DE8A 2OWSA 4BDOA 3LUYA 4AB6A 3SEUA 2QJEA 3TEPA 3FV1A 2DWIA 4G2ZA 3IOTA 2HFBA 3PUYE 3DELB 3GZGA 1US4A 4IY6A 1JETA 2I4BA 4XKQA 3TELA 1B3GA 1P1OA 4PETA 3HCQA 4E0WA 4IGTA 3EF7A 3WAEA 3UA8A 4G4PA 1MH3A 3IR1A 4TLMB 2HZLA 3CVGA 4MFIA 2THIA 3QUJA 4ZEDA 4TQUQ 4H67A 1SD3A 1Y4TA 4OETA 1FTLA 1EZ9A 3TQLA 2DOJA 2F7BA 3Q27A 1EZPA 3PU5A 3A09A 4H8IA 1B3HA 4RNSA 2XX9A 1Y3QA 4EQBA 4F3PA 5CC2A 3IOWA 5ITOA 1MXZA 3VVDA 4FORA 4LP2B 4RK2A 4LZ8A 2D3IA 3MP8A 3MP1A 4JSDA 3TZAA 4KYSA 1VR5A 3PPPA 1ZMGA 3SEVA 3ZSFA 1LB9A 3FD3A 3JYRA 3K00A 5I58B 1S50A 1CB6A 4G68A 4RJZA 3Q26A 4OERA 3VLUA 4BDRA 1MXYA 4F31B 1LGBC 2DE4A 5DEXB 1XC1A 2NWJA 5JTYA 4OFJA 4OFOA 1B7UA 3B7DA 3MVYA 4DIGA 4YMBA 3C31A 1XHYA 3RTFB 1QKBA 3OO9A 1QVSA 3DM0A 4WEDA 2NVUB 2DWAA 3KOTA 5AA2A 3R26A 3TTRA 2XXHA 1MY2A 2ALUA 1GVCA 4NF5B 3ILUB 4EF1A 2HAVA 4Z7EA 2NOOA 2XXWA 1L5TA 2ZXTA 1UTBA 4OENA 4IO3A 3IL1B 2Y7WA 2AL5A 4GFRA 3K02A 5ITPA 3SERA 1MM7A 3D4CA 1B1XA 1FCKA 3OO6A 2O1MA 4X1DA 1DTGA 3TAJA 4BDMA 3I5OA 4F29A 2VD2A 1Z7ME 4OEUA 5L9SA 2ESNA 1ZJLA 5H8FA 3T9HB 4JSOA 3HHFA 1AMFA 4DCXA 3IO6A 3UGWA 2RINA 1LBCA 1NMUA 4P11A 4F3GA 3TUSA 1HSEA 4I62A 3FJGA 1JW1A 1FQBA 3P7IA 3VLVA 3SEXA 3IJOB 3V8XB 5DVJA 1SQYA 4IB2A 3CR9A 3HSTA 1RYOA 3D4GA 4OWDA 3KJ7A 4JB7A 3MAMA 4HW8A 4UACA 1TFDA 2O7UA 1MY1A 1DOTA 2V3QA 1A40A 3O2AA 5AA4B 2QS4A 5B70A 1NKXA 1A8EA 2X7QA 3W15C 4MLQA 4FIMA 1URSA 1QUIA 2E0SA 2PVUA 1LSTA 3MP6A 2H25A 1SW1A 3V5AA 1O64A 1N7WA 2G29A 4U22A 3FXRA 1T0KA 5KZTA 1PBQA 1JW4A 1B5JA 3MZ1A 4X48A 4XKNA 1D9VA 4OYVA 2V3TA 2F6GA 2CZLA 4JBZA 3OENA 4WKMA 2FNCA 1IXIA 4PFUA 4X9TA 1I6BA 4F2OA 1Z7NE 2H98A 1J1NA 3FXQA 4R9FA 1O63A 2ZMBA 1WDNA 4OFLA 3TCHA 1MXXA 3ZS6A 2D5WA 3B6TA 3U8QA 1Y20A 3RN8A 4YKJA 3KGCA 4DLDA 4F2QA 1M5FA 3RLFE 5H8NA 2Z23A 4KCDA 1B58A 1B0LA 1URDA 3O6HA 1II5A 3TYHA 5TP9B 1B5HA 4QF9A 4FE8A 3S9NC 3G3HA 2Z8EA 1URGA 5CMKA 3VDFA 3N5LA 5H8QA 3DP6A 3E4RA 4QSDA 4KQPA 2Q8JA 4NE4A 3T66A 3G3KA 5CMBA 4RPNA 2OJTA 3THIA 2RC9A 1TFAA 4PQJA 5CRYA 3G3GA 1MDQA 3TKDA 2PT1A 3CFXA 2ONRA 3MUQA 3LSXA 3H03A 1ATGA 4ELRA 4H65A 1PB9A 1N76A 3OELA 4JDFA 5HM4B 3KBRA 5I56B 4EQ7A 3MZ9A 3FUZA 1BKAA 3SKPA 5H8NB 3VXBA 4BLAA 3BKIB 1POTA 2Q89A 2GFEA 2DVCA 4NF4A 1LCTA 1N0TA 2Y7KA 2DSFA 3A3CA 4YKKA 4EF2A 3EHUA 3M8UA 3T9XB 2QS1A 1H43A 4OTEA 2F34A 3SESA 1LFGA 2XXQA 4PE5B 1DPPA 3CFZA 1RYXA 5KCJA 3KSJA 5FHNA 3USDA 5I2KA 1JVYA 2OK2A 3CFLA 1Q1KA 3K1PA 3K6VA 2UVJA 1FQDA 3R6UA 3S9EA 2DWJA 1FW0A 1FQAA 2O69A 2Z22A 2Q2CA 2GH9A 4YMAA 3W9VA 2RC8A 1P1QA 3HPIA 4ND9A 4AB5A 4Q0CA 1B05A 3S4UA 2DYXA 1JVXA 4BDNA 3C32A 5TPAB 5I59B 1MRPA 2Z8FA 3BFTA 5JK4A 2XD3A 2O68A 3OEMA 3PMXA 3GBBA 2XXPA 2VD3A 1HSJA 3TTKA 4KYDA 1B3LA 4G8HA 3VVEA 4EXKA 5KCJB 4KYEA 4ESWA 4MH5A 2B3FA 3FV2A 3BFUA 4GQOA 1B1HA 3VV5A 1LAGE 4I1DA 4ONYA 3UORA 3GXAA 3MBPA 4I8CA 4GVOA 4R73A 3BBRA 3TTLA 4XIGQ 5EYFA 3IB2A 4TOZA 4ZEFA 4NF6B 4R72A 4QHQA 1PC3A 1VFEA 2HQ0A 4KFQA 2XHDA 1M5CA 4GIZA 3VXCA 1H45A 3SETA 1HSLA 1FQCA 1JQFA 3UK4A 3LR1A 1LAHE 4YICA 3PPRA 1SW5A 5I58A 4JWXA 3KFMA 3QYTA 1DTZA 3JV9A 2HZKA 3UIFA 4ELPA 1B40A 2UXAA 4LUBA 4KR5A 4TLLB 5DEXA 3RQTA 4HS7A 3FJ7A 3DLNA 4R6YA 4JWOA 5DYHA 4N6PA 4YKPA 1UIUA 4IO6A 1MQGA 5H8SA 1SBPA 3K6XA 3E9XA 4U1ZA 4GWOA 4EUOA 4F1VA 1P99A 3KN7A 4M4GA 2Y7PA 2OCUA 1NNKA 5AA2D 4ELQA 2HXWA 4NF5A 3TFLA 3N6UA 1TWYA 2AYSA 1MPBA 5CBSA 3U94A 4GD5A 1NNTA 4OVJA 2UVIA 4FATA 3PMWA 1SI0A 2IEEA 4KCCA 4KD5A 2X26A 1OVTA 1BTJA 1S9TA 5H8HB 3CG1A 4C1UA 1P1WA 1SVXB 4YB5A 4RA1A 1ELJA 3H3GA 4ZS9A 2ANJA 2I49A 1N3XA 4XTCQ 4H1XA 4RPOA 5DTBA 1M5DA 4OMBA 1YAEA 3FATA 1IXGA 3B6WA 2D21A 3MW0A 3RPWA 4NMYA 3IOUA 4F3BA 3MVZA 3ODBA 3MZBA 2QRYA 3PMVA 3LC8A 4WEPA 3MJNA 4LZ7A 1GR2A 3LBSA 2CMOA 3IB1A 1OIBA 3V83A 4IO4A 1B52A 2Q9TA 2HCAA 5L9OA 4FEBA 1LLSA 4NEDA 1FTMA 1R9LA 4XXUA 4KPTA 2ZYNA 3C4MA 1GGGA 4R2BA 1VE4A 5AA4A 3UN6A 3F11A 4C0RA 4L17A 4PFYA 2BJJX 4POWA 5DT6A 1MY4A 4ECFA 4IO2A 3VVFA 3TMGA 4HTGA 1B4ZA 1P1NA 2QMWA 2W7YA 4QFNA 2F5XA 1SDXA 2R6GE 4BDLA 2P2AA 4FJPA 1XVXA 1US5A 1DMBA 4M1VA 2Q2AA 1EZOA 3U92A 5FHOA 4QSEA 3IX1A 2A5TB 1MQIA 3RGYA 4LQ2A 1IUDA 3PD8A 1SYHA 1FTKA 3O29A 3AXFA 3FVOA 3OEKA 1PEBA 1IXHA 1H44A 3LSFB 3RTWB 4R6HA 4G8NA 1A99A 5DVIA 5I2NB 4O3BA 2FYIA 3H6VA 1DPEA 3K6UA 5CM6A 3Q28A 1BLFA 1ZU0A 3Q25A 3L6GA 1UTHB 1B4HA 3OXNA 1H3DA 2DVZA 5TP9A 4OQOA 4YZZA 5KDTB 2DP8A 3O28A 4ZDMA 2XXIA 1WVJA 2PYYA 5I84A 2XXTA 1H76A 1AIVA 3W9WA 1BP5A 3ZKKA 1D9YA 3CSGA 3TCGA 4R74A 1Y3NA 1LAFE 4G77A 4H5GA 5J1DA 4R2FA 1MPCA 4FEDA 4GRKA 1Q35A 4AQ4A 1XT8A 2I6EA 3PGFA 4FECA 4P0IA 2B65A 5I56A 1NL5A 4U23A 5CMMA 3TTNA 2UYFA 2O84X 2PBWA 2OZZA 4LONB 4IO7A 2IA4A 1VFDA 2QS3A 3OO8A 2XXVA 2ONKE 4MLVA 3DP8A 5TU0A 1TT1A 2DS9A 4LQ5A 4LVQA 3E13X 1EU8A 3KEIA 1LBBA 3DP4A 1LB8A 2F35A 1B9JA 3EHSA 3FVKA 3TODA 2Z8DA 1MM6A 1XOCA 2I4CA 1Y1MA 3TQWA 2X7PA 5EHMA 4HCWA 1PDAA 1NNPA 2RKMA 4RK9A 1N04A 4THIA 3C9HA 4ZZAA 3E3KA 4PFWA 3U93A 1I6QA 3PUXE 5AE4A 2O7IA 2QPQA 1I6AA 4KHZE 4OEVA 2PMSA 4IY5A 5CBRA 5TPAA 5I59A 5ELVA 3H6WA 5I57B 2P0SA 4I9DA 3MWBA 4ESXA 1MG1A 1B3EA 3HV1A 3PUVE 5ICTA 3QK6A 3H7MA 2OBGA 1B0HA 1USYE 4ZE8A 4ZEIA 1NH8A 5B7DA 3SEWA 3K01A 2HAUA 3VLWA 4P0GA 4GL8A 2XXYA 3LSWA 2NUVA 4IGRA 3ILTB 3O9PA 3M3FA 1WODA 4X1BA 3KSXA 1KWHA 4NF6A 1AOVA 4DCYA 2XX8A 5A5XB 1IZ1A 5IKBA 4LZ5A 3RT8A 1JEVA 4QFLA 1O7TA 4U1OA 3B6QA 1B7ZA 3H6TA 4JXIA 3JZJA 4RYAA 3T22A 3V89B 5AA1A 2OLBA 3N26A 1ANFA 4MBPA 4ZECA 1MH4A 3TDJA 3U1OA 1QJMA 1LFHA 4YB7A 4GXSB 3CSBA 2GRVA 1JW5A 2Y7RA 2I3VA 3G3FA 3PD9A 2QMXA 2RF1A 3ECRA 3SEYA 4F1YA 5EHSA 3FVNA 3A3UA 4G8MA 4O3CA 2XXXA 3KJTA 3T9VA 4YAHX 1IEJA 2QSXA 3WAFA 1IQ7A 3PUWE 1RKMA 2AL4A 4F22A 3ZKLA 5AA3A 3MPKA 5H8HA 2GHBA 3I6VA 1OQHA 2ZNUA 3QAXA 2YJPA 4NF8B 4YB6A 5CI5A 3PUZE 3K2DA 3TCFA 1B2HA 1B46A 2LAOA 3I3VA 1JNFA 2ONSA 4F18A 2AIXA 4G68C 2O51A 2I3WA 1XVYA 3UP9A 2RCAA 5IAIA 4DZ1A 2ZNTA 2V3UA 3IORA 3QIMA 1MY3A 3FZVA 3CG3A 2F97A 2V25A 1OMPA 4FAJA 2F6PA 2H4IA 5ICQA 5BUUA 4Q5TA 3C35A 3TPAA 2F7AA 1JEUA 3CIJA 4EDPA 2VGQA 3IJXB 2Q88A 3MC2A 2Y84A 3HHGA 5BWJA 2XXUA 2KLFA 2XD2A 1MPDA 4Q8RA 4C1TA 4U4XA 2GHAA 3R7XA 4DXBA 2ZNSA 4WXJA 4GOTA 2F8DA 1OQGA 4UA8A 1BIYA 4N07A 4JWYA 1FTOA 4LATA 1IXCA 4YU0A 4H5FA 5FTHA 4O3AA 1B32A 3IAZA 1Y9UA 1UQWA 3U72A 3T96B 2H99A 3GBAA 4OZ9A 2A5TA 3H6UA 1ZTYA 3O97A 5K2XA 3RT6B 1PB8A 1YPNA 3OOAA 4ISUA 4OESA 1EH3A 1R9QA 1POY1 3GLBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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