4FORA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with flurbiprofen at 1.58 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Flurbiprofen at 1.58 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
total genus 117
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4forA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4forA02
5CMCA 4NEDA 4ZEKA 2ESNA 3PMWA 4H5GA 5JTYB 3N94A 2RKMA 3IO6A 1IZ1A 4JSOA 1OQGA 3O66A 4LQ2A 1PEBA 2V3QA 4NTLA 4HTGA 4JWXA 3PD8A 4H1XA 1YCJA 4IY6A 3FZVA 4LP2B 4KQPA 4RY1A 4R9GA 1GGGA 2VD3A 1US4A 4U4XA 1VFDA 3PV0E 5I56A 5KDTA 4ZEDA 4F2OA 4IO6A 4R74A 3U93A 5KDTB 2H5YA 4NE4A 4LZ7A 5DYHA 3FJMA 3FV2A 4PFUA 3R7XA 1LFHA 2E1SA 3MP1A 1SW2A 2Q88A 3IJXB 1P1WA 1SQYA 1B7UA 5FTIA 2Q2CA 2DVCA 3IJOB 2DWHA 5EYFA 4N13A 3K4UA 4XKRA 3VVEA 4OWDA 1NFTA 1SD3A 2M8CA 3SERA 3T9HB 4F29A 3HPIA 1B3FA 1JEUA 2H4IA 5H8FA 3MQ9A 4JDFA 4F19A 3QXMA 3LC8A 1HSJA 3GXAA 3W15C 3TCGA 4QSDA 4IO2A 1H76A 2DXYA 4KCCA 1I6BA 1ZTYA 2HZKA 3TCHA 3FASA 1MPDA 4RNSA 1AIVA 5FHNA 3U8QA 3K2DA 1SYIA 4OHNA 1GV8A 3H7MA 3EPEA 4DXBA 5B7DA 1P1UA 1Y1MA 4U23A 1BKAA 3KBRA 4RYAA 3DM0A 4H6DA 4DCXA 4BDLA 3TFLA 3ZSFA 3BKIB 2O69A 3VFJA 1B0HA 4I8CA 5AA4B 4WEDA 1BLFA 1SVXB 4NWCA 2PT1A 1CE2A 3KN3A 1SI0A 3RY3A 1L5TA 1JW1A 4QFKA 4GWOA 3H6UA 3MPKA 2GH9A 2XX8A 4XXUA 1B3GA 4Q30B 4OEVA 2DXRA 3OO9A 1ATGA 3H4ZA 4JB7A 3RGYA 1S9TA 1O7TA 1OMPA 2O6AA 3JZJA 2FA7A 4EDPA 4LUBA 1EH3A 3K1NA 3TELA 1MQHA 4ECFA 1AMFA 1QULA 4F22A 5CI5A 1MY4A 5FHOA 4RK2A 1LAGE 5DT6A 5HBCA 3M8UA 2V3TA 2DWAA 2NVUB 3R26A 4FORA 1B7ZA 3UIFA 3T93B 2THIA 3CG1A 4IY5A 1RKMA 1TXFA 2HAVA 3OSQA 2RINA 3LSFB 5H8SA 3IB0A 3ZS6A 3Q29A 4RPNA 3IR1A 1MXYA 1ZIUA 2HZLA 3N5LA 5CBRA 1ZMGA 2Y7RA 1DMBA 1LAFE 4KPTA 3S9EA 2O84X 1WODA 4FAJA 2HQ0A 1MXWA 2QJEA 1M5EA 4G77A 4U4SA 3CG3A 2FNCA 3OSRA 4TOZA 4FECA 2AYSA 4OVJA 1A8FA 3PPNA 4NF6B 4R72A 1B7HA 2DS9A 2DP8A 2I0BA 3OELA 3CSBA 4BDMA 2Z8FA 2HEUA 1IXCA 1I6QA 4M1VA 2ZNTA 1B3EA 4DDDA 2CMOA 1LFGA 3VDFA 4P0GA 5CMBA 4R2FA 1B9JA 2Q89A 3D4GA 1XC1A 1MS7A 3OXNA 4QF9A 5TP9A 4HW8A 5F1QA 2I3WA 3USDA 4DE8A 4F1VA 1MY1A 1DTGA 3QSLA 5K2XA 5DVIA 3G3IA 2B3FA 3P7IA 2XXYA 4LQ5A 2VP1A 1PB7A 1B2HA 3FXRA 2V3UA 4UACA 4OESA 5HPQA 2I4BA 1Q1KA 2H99A 3MJNA 1QKAA 1CB6A 2PT2A 4E0WA 2KLFA 1UTBA 2DE3A 4WEPA 3BFTA 5L9SA 3OOAA 4KYEA 3PD9A 4G68C 1UQWA 3N26A 1FTMA 3IOWA 3B6TA 3VLVA 4KYDA 1YTVA 1PDAA 1FQEA 3BFUA 4H5FA 3U92A 1SW1A 3T9UA 3HHFA 4QRZA 2AIXA 3S9NC 3V83A 4X1DA 1DTZA 3K1PA 3IK6B 4F1YA 3BBRA 1DPEA 4NWDA 4ZE8A 1QUIA 1NMUA 3I6VA 3PPQA 3MZBA 1OVBA 1N04A 3H06B 2UYEA 5KCJA 4O3BA 4R9FA 4XKNA 2D3IA 1LAXA 2OCUA 2F36A 3RTWB 2YPNA 1ZU0A 4QSCA 3TTMA 5I58B 3T22A 4LA9A 4YZZA 3C34A 3VVFA 2Y7PA 4MF3A 2V93A 2RCAA 3TTKA 2F7CA 3O6HA 3C36A 4ZEBA 1GTKA 4MBPA 1D9VA 3TQWA 4POXA 1NKXA 4NF4A 3IOVA 1YAEA 3K00A 3IORA 3THIA 2I48A 1LB8A 3ODBA 5FHMA 3RN8A 4GFRA 2XX7A 2HFBA 1VSOA 1B4ZA 5I2KB 3FATA 1MM7A 3ECRA 1NNTA 1VR5A 4EQ9A 4H65A 4FEDA 3UP9A 1XOCA 1EZPA 3C32A 5JTYA 4LVQA 3VVDA 3B6WA 2ABHA 3TEPA 5JK4A 3CIJA 1FTKA 3K02A 3V89B 1ZLQA 2IA4A 4ELQA 1H43A 4G8NA 1D3KA 1QW0A 2G93A 3W9WA 1KWHA 3MP8A 1WDNA 4U22A 1DOTA 4DLDA 4QFLA 5L8DA 3VLUA 3VXCA 5I2NA 3SKPA 2O7UA 4ND9A 1LSTA 3RPWA 3C33A 3PPOA 2UVHA 2Y84A 1LCTA 1SYHA 2I6EA 1D9YA 5I2NB 3U1OA 1BTJA 4EUOA 3G7WA 5I84A 4R6HA 3FD3A 4OMBA 4QFOA 1N84A 3E9XA 3A3CA 4KI0E 2AL4A 1ANFA 3L6HA 2A5TA 1TFAA 2R9JA 3CRBA 2A5TB 3IB2A 3VE1B 1MY0A 3UA8A 1QJMA 3MBPA 3TODA 1OLAA 3WAEA 1M5FA 4YB5A 4KYSA 2I49A 3S4UA 1N76A 4GD5A 3D4CA 4I62A 2XXQA 1PB9A 2PYYA 1B1XA 1S7YA 2UXAA 3TAJA 1P1NA 1MRPA 1JNFA 1JETA 2OK2A 3HV1A 5L9MA 4G4PA 5B70A 3SEYA 1MPBA 1AOVA 1USYE 1N7WA 4OEUA 1N3WA 5H8HB 4GL0A 1LLSA 4Z7EA 4LATA 2Q2AA 3KFMA 4H8JA 1USYH 2P1SA 3SETA 4JWYA 3C35A 3IX1A 4X1BA 1POY1 3KGCA 4PETA 3KJTA 3SEVA 4MLQA 5AA4A 1NNFA 4ZEIA 1P1QA 4R6YA 5ITPA 4KHZE 2H98A 1B32A 1MQIA 1B1HA 4GRKA 1N3XA 2PMSA 5IAIA 2HCAA 1H45A 1JQFA 2WKYA 3TQLA 1IQ7A 2RF1A 4EQ7A 3GZGA 3EHSA 1NL5A 4ONYA 1EU8A 4YKKA 2QL3A 1OVTA 4Q5TA 1B0LA 3HO7A 3PPPA 5A5XB 1JVXA 4P0IA 4WXJA 1QKBA 3B6QA 2NUVA 4QSEA 1OQHA 1IXIA 3FVOA 3MP6A 4G68B 4GL8A 3C31A 1FQFA 4Z0IA 1JEVA 3VXBA 3R6UA 3T66A 2ZNSA 5EHMA 1LBCA 3I5OA 3H6VA 4M4GA 4P11A 3H3GA 2O51A 2UVIA 4FEBA 4BDNA 4ZS9A 4HCYA 3QIMA 3PUVE 4KR5A 3KSJA 3G3KA 3OEMA 4IO7A 1N0TA 5H8NB 2ZYMA 2ZYOA 1BP5A 3RT6B 3PUWE 3B7DA 4DXUA 1R9QA 5AE4A 2DWIA 3Q27A 1EZ9A 3GLBA 4UA8A 4QHQA 5ICQA 2GFEA 4IGTA 3OMBA 5CMKA 2IEEA 3FVKA 2XXTA 3IB1A 4ZZEA 4F3GA 3TMGA 1MXXA 3I3VA 3UK4A 1A99A 3MUQA 4GQOA 1YPNA 4G2ZA 1MQJA 4NF6A 1Z7NE 3W9VA 3O6IA 3RTFB 1FQCA 3A09A 4IO5A 3CVGA 1US5A 4KCDA 5H8QB 2OLBA 4ELPA 2F5XA 2Y7KA 2F7BA 4EF2A 4OERA 2O1LA 2R6GE 4EF1A 4TQUQ 3SEWA 4OETA 2D21A 3K6UA 2QS1A 1J1NA 5I57B 4YMAA 4RA1A 3G3JA 2P0SA 4XTCQ 4IO3A 5I59B 4MFIA 4N07A 4N6PA 5CC2A 3IO4A 2GHAA 3T9XB 4K3FA 3MVWA 3RT8A 1Y3NA 1B5HA 4YB6A 1JW5A 1VE4A 3OENA 1MQGA 3O28A 2O68A 1DPPA 3TCFA 4E0XA 3KN8A 1P1OA 1HSLA 1FQDA 4ESXA 4FE8A 5DVJA 1B5JA 3GBBA 4F3SA 1IXHA 2QMXA 2OBGA 3FXUA 3U72A 1N7XA 3JV9A 3O9PA 1S50A 4ELOA 4Q8RA 1Y9UA 3EHTA 3MWBA 3EQ1A 2DE2A 1FQAA 1Y4CA 4R75A 2DOJA 3MVZA 2OZZA 3OO8A 2ZNUA 3E4RA 2XHDA 3IOTA 3K0VA 4TLMB 4ELRA 1I69A 3DLNA 5DTBA 3UN6A 4OFLA 4OTEA 1XT8A 4FJPA 1JVYA 1NNPA 4C1TA 4YKJA 2LAOA 1IITA 3DP8A 4FATA 2QMWA 3HN0A 4ISUA 3FV1A 3KSXA 5LOMA 4R73A 3RUMA 4THIA 3TTRA 1FQBA 5I58A 1MXZA 2QS4A 3LBSA 2DVZA 2F8DA 3CFXA 1LGBC 2AL5A 2DYXA 1O63A 3FUZA 1B51A 1URGA 5AA1A 3CSGA 2ONKE 2B65A 1MXUA 1H3DA 2F35A 1PBPA 1BIYA 1QUJA 4BDRA 3PUZE 4YAHX 1T0KA 2ONSA 3LSLA 1MH4A 1IUDA 4LZ8A 3M3LA 5I2KA 2H9BA 1XHYA 1IEJA 2O7IA 2GRVA 2XXIA 3H6TA 4IO4A 4JBZA 2NOOA 4DIGA 3Q28A 5CBSA 1MY2A 2ONRA 3TPAA 1B5IA 4F18A 5DEXB 3K01A 3IL1B 3HHGA 1XVXA 1B52A 2QSXA 3K6VA 3PGFA 5TPAB 3EN3A 1TFDA 1B3LA 4U2RA 2DQVA 3M3KA 3OO6A 3ILUB 2NXOA 4MLVA 1O64A 1GVCA 5AA2D 3CFZA 5CM6A 3TYHA 1P99A 1F9BA 3K6XA 1ZJLA 1B6HA 4GXAA 3DP4A 3RNNA 4QFNA 2BJJX 4PQJA 1SDXA 1M5BA 2ANJA 2ALUA 2G29A 1UTHB 3FVGA 4ZZAA 4F1UA 3SESA 3PMVA 2ZXTA 1MM6A 3LUYA 3K6WA 3EF7A 1TT1A 3QUFA 1UIVA 1OLCA 3FIRA 3H6WA 4PFYA 2F6PA 2UVJA 2Q9TA 5IKBA 4ZEFA 1PC3A 1FTJA 4BLAA 4RJZA 3VV5A 3L6GA 2PVUA 4EQBA 1ZKBA 4ZECA 2PBWA 4PP0A 5K2YA 2I58A 1FW0A 3TKDA 2XXXA 3LSWA 4YU0A 2YLNA 1LB9A 2PX1A 1IIWA 3MVXA 4RXLA 5I56B 3V8XB 4YMBA 1D4NA 1DSNA 2XXHA 4R2BA 1R9LA 1MY3A 2ZYNA 3KEIA 3A3UA 4G8HA 3RLFE 2F34A 1PB8A 3PUXE 2A5SA 4JWOA 1ZBMA 4JSDA 2XXUA 4EXKA 3PMXA 4F2QA 2I4CA 3SDFA 3E13X 2DWJA 3FJ7A 4XKQA 2OWTA 3TDJA 3KOSA 4OENA 5FTHA 5TU0A 4KFQA 1QUKA 2QS2A 5H8HA 1RYXA 3LSXA 4YICA 1NH7A 4LONB 5AA2A 4L17A 4F39A 4X48A 3SEXA 2UVGA 5ITOA 5CRYA 1XVYA 5AA2B 4GVOA 3C9HA 2XXWA 5H8FB 2REJA 2HAUA 4GXSB 1NH8A 3QYTA 2GHBA 4OXVA 1AH5A 4RK9A 3UGWA 3MVYA 3OO7A 3N6UA 1JW4A 4KD5A 5ICTA 3F11A 5A5XA 4XKPA 1B4HA 3TTLA 3HSTA 2Z23A 1LAHE 1NNKA 3FJGA 3EHUA 1SW5A 2F6GA 4G68A 3N6TA 1A8EA 5BUUA 3S9LC 4H67A 2QRYA 4Q0CA 2VD2A 3IOUA 2B3BA 1Y1ZA 2D5WA 4BDQA 2X7PA 3G3HA 2XX9A 3ILTB 3TZAA 1MG1A 1Z7ME 1XS5A 3O2AA 3PU5A 3OD7A 2R71A 2F7AA 3MZ9A 4OYVA 4H8IA 5H8NA 3PUYE 1B46A 1Y4TA 4GOTA 1GR2A 3U94A 1MXVA 1FCKA 1TWYA 2OWSA 2X7QA 3M3FA 2Z8DA 4F31B 2F78A 2OJTA 3O97A 4PFTA 4U1OA 4FIMA 1UIUA 1Y20A 2RC7A 1SBPA 2RC8A 1PBQA 1AL3A 1B05A 4YKIA 4ZDMA 5BWJA 3ZKKA 2H25A 2E0SA 2QS3A 4NF5A 3Q25A 1B3HA 2I3VA 5HM4B 1I6AA 4HS7A 3GBAA 4NF5B 5KZTA 4RPOA 1LCFA 1URSA 2VHAA 5H8QA 5F7VA 3PPRA 2Z22A 3S9MC 4NF8A 3CFLA 4DXCA 2O1MA 4C1UA 3S2VA 2UYFA 4F3BA 1RYOA 5I57A 1HSEA 4QFPA 1A55A 4NF8B 3QAXA 2X26A 2XD3A 1MH3A 5I59A 3TUSA 1QVSA 4G8MA 4DCYA 4C0RA 3MZ1A 4OFJA 4PE5B 2Q8JA 3G3FA 3K1MA 4DZ1A 2REGA 1SI1A 1R1NA 4U21A 5ELVA 2VGQA 4O3AA 4AB5A 2XXVA 3KOTA 1ELJA 4OFOA 3C4MA 3TTNA 3UORA 4WKMA 3HCQA 4EXLA 2XXRA 5TP9B 3MPLA 3E3KA 5J1DA 4OZ9A 4F3PA 5EHSA 1MDQA 3IAZA 4YKPA 4GF8A 3CR9A 1A7LA 1OIBA 3V5AA 1LFIA 5AA3A 1Q35A 2RC9A 5JEIA 2Y7IA 4XIGQ 2QPQA 4TLLB 1EZOA 4IGRA 3FGSA 1UTBB 3O6GA 1FTOA 3QK6A 4OQOA 4MH5A 2P2AA 3AXFA 2NWJA 5DVFA 2HXWA 5M2VA 1FTLA 1II5A 4ESWA 2W7YA 2ZYKA 3MW0A 1MQDA 3JYRA 4HCWA 4U1ZA 1B40A 1MDP1 1M5CA 1VFEA 4R6KA 4JXIA 3KG2A 4POWA 3H03A 1R6ZA 3O29A 1LBBA 3LR1A 4ZE9A 2CZLA 4I1DA 2RCBA 2F97A 3FVNA 3T9VA 3ZKLA 4X9TA 1URDA 3CI8A 3OEKA 5KCJB 4LZ5A 1SW4A 1POTA 1M5DA 2V25A 1MPCA 3FXQA 3SEUA 4I9DA 3VLWA 4H0WA 5ISUA 4BDOA 2VOZA 3KZGA 3G3GA 3DELB 3KN7A 2XXPA 3T96B 4IB2A 5DEXA 4YB7A 3ONMA 3KJ7A 1IXGA 5TPAA 1A40A 2V84A 1Y3PA 2DE4A 2XD2A 2Y7WA 2ZMBA 4AQ4A 4NF4B 4GLIA 3WAFA 1WVJA 3MAMA 3MC2A 2DSFA 1B58A 3QUJA 3RQTA 4GIZA 4NMYA 4O3CA 3DP6A 5L9OA 3Q26A 5CMMA 2YJPA 1Y3QA 2I0CA 1A54A 1H44A 4PFWA 1UTHA 2Z8EA 4AB6A 2FYIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1SVXB 4NWCA 5T3JA 2PT1A 3SZPA 1CE2A 4MX6A 1AWBA 1FPEA 3KN3A 1SI0A 3RY3A 1L5TA 1JW1A 4QFKA 4GWOA 3H6UA 3MPKA 3PTYA 2GH9A 2XX8A 4XXUA 5EYHA 1B3GA 4Q30B 1SPIA 4OEVA 2DXRA 3OO9A 1ATGA 3E79A 3H4ZA 4JVCA 4JB7A 3RGYA 2WEFA 1S9TA 1O7TA 1OMPA 2O6AA 3JZJA 2FA7A 4EDPA 1RDYA 4LUBA 1FPKA 1EH3A 3K1NA 3TELA 1MQHA 4ECFA 1AMFA 1QULA 4F22A 5CI5A 1MY4A 2Q74A 4GBWA 5FHOA 2WBDA 4RK2A 4NX1A 1FBEA 1LAGE 5DT6A 5HBCA 3E78A 3M8UA 2V3TA 4KXPA 2DWAA 1FPDA 2ZZVA 2NVUB 3R26A 4FORA 1B7ZA 3UIFA 4N15A 3T93B 1Q9DA 2THIA 5EQAA 3CG1A 4IY5A 1RKMA 1TXFA 2HAVA 3OSQA 2RINA 3LSFB 5H8SA 1D9QA 3LUZA 3IB0A 3ZS6A 3Q29A 4RPNA 1FPJA 3IR1A 1MXYA 1ZIUA 4GWUA 2HZLA 3N5LA 5CBRA 1XI6A 1ZMGA 2Y7RA 1DMBA 2MKZA 1LAFE 4GX4A 4KPTA 3S9EA 2O84X 1WODA 4FAJA 2HQ0A 1MXWA 2QJEA 1M5EA 4G77A 4U4SA 3CG3A 2FNCA 3OSRA 4TOZA 4FECA 2AYSA 4OVJA 1A8FA 3PPNA 4NF6B 1IMBA 4R72A 1B7HA 5ET7A 2DS9A 2DP8A 2I0BA 3OELA 3CSBA 4BDMA 2Z8FA 2HEUA 1IXCA 1I6QA 2FIXA 4M1VA 2ZNTA 1B3EA 4DDDA 2CMOA 1LFGA 3VDFA 4P0GA 5CMBA 1EYIA 4R2FA 1B9JA 2Q89A 3D4GA 1XC1A 5ET5A 4HE1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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