4G4PA

Crystal structure of glutamine-binding protein from enterococcus faecalis at 1.5 a
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
235
structure length
235
Chain Sequence
HHGENLYFQGMEGKKYTIGTDLTFAPFEFQDSKGKYIGIDVDLLDAIAKDQDFEVDLKPLGFDSAVQAIQSKQIDGMIAGMSITDERKKSFDFSDPYFDSGLQLAVKKGNDKIKSYDDLKGKTVAAKVGTESANFLEKNKEKYDYTIKNFDDATGLYKALENGEADAIVDDYPVLGYAVKNGQKLQLVGDKETGSSYGFAVKKGQNPELIKKFNAGLKNLKDNGTYDKILNNYLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Enterococcus faecalis
publication title Functional Diversity of Tandem Substrate-Binding Domains in ABC Transporters from Pathogenic Bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Amino acid ABC transporter, amino acid-binding/permease prot
total genus 77
structure length 235
sequence length 235
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g4pA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g4pA02
2F8DA 2DXRA 2XXWA 4EXLA 2HQ0A 4EUOA 2RCAA 5JEIA 4QSCA 1B58A 3LR1A 4TOZA 2DP8A 2D21A 4DCYA 2V3QA 3OSQA 4AB6A 2O7IA 3HV1A 1B5IA 3FGSA 2I0CA 1DMBA 2P0SA 5I84A 1BTJA 3K00A 2VD3A 4NWCA 1ZMGA 1JNFA 2E1SA 2PT1A 2ZNSA 1MDP1 5H8SA 2CMOA 1FQDA 1IQ7A 1O7TA 4ECFA 3FVKA 2PX1A 4KHZE 3T9XB 1ANFA 4Q0CA 2FNCA 3MVYA 3CFZA 5H8QA 2YLNA 4O3CA 4LP2B 5CC2A 1B0LA 4LZ7A 3UIFA 5H8FB 3T9HB 4UACA 1O63A 4NF6A 3OENA 4POXA 1BIYA 2ZMBA 3GBBA 4LA9A 4F22A 4GL0A 3IO6A 3OELA 3Q26A 2QS1A 1ZBMA 4IO6A 3C9HA 4YAHX 3G3HA 3T9VA 3IB2A 3O9PA 2F34A 2F7CA 2OJTA 4IGTA 1M5EA 5TP9B 2V3UA 4QRZA 2A5TA 1Y9UA 3KBRA 3GZGA 3UK4A 1QUIA 5IKBA 1M5BA 4FORA 1N3XA 4FEBA 1TWYA 5H8HB 1R1NA 2QS2A 1LGBC 1IITA 3H6TA 3N5LA 3FASA 1DTGA 4KQPA 2NVUB 2VP1A 1A40A 4BDRA 1BP5A 1B7ZA 2IA4A 3DP8A 4KYSA 2GRVA 4IO2A 1R9QA 3MP1A 3K0VA 1SYHA 5DVIA 4HCWA 4IB2A 1RYOA 2RKMA 4YKIA 3B6WA 3U92A 3HHFA 4NF8A 1NNPA 2V84A 2GHBA 3RN8A 1P1OA 2O1LA 2Y7IA 4OHNA 3ILTB 2XXXA 1MQIA 3FZVA 2XHDA 2F7BA 3L6GA 4U21A 3W15C 1IZ1A 5KZTA 1LAFE 1CE2A 2UYFA 3N6TA 1LAXA 1D9VA 5H8NA 1SW5A 1RKMA 3U8QA 1P1NA 2HXWA 3H03A 4G68B 4YKJA 3TTRA 1MY3A 1OVBA 2X7PA 5CMBA 4F31B 5JTYA 5JK4A 1FW0A 3TTNA 1I69A 4IO5A 3EHTA 4HW8A 1LAGE 3E9XA 4OQOA 1XOCA 4RYAA 1H45A 3V83A 4RK2A 1B7HA 5ICTA 2HEUA 3HCQA 3MVXA 3GXAA 2P1SA 3U72A 2KLFA 1SW1A 4H65A 3KZGA 2Q88A 2H99A 4XIGQ 2I58A 5I59A 3LC8A 3FVNA 5M2VA 5CMKA 4AQ4A 5AA2A 4E0WA 2Y7WA 1DOTA 3RGYA 3CIJA 1A99A 3S2VA 3MW0A 3PUXE 4C1TA 4NF5A 3K1PA 1Y4CA 4C0RA 1RYXA 3FJGA 3PMVA 4FAJA 5FHOA 3FXUA 3K6UA 4ISUA 1H3DA 3S9NC 1M5DA 4DXUA 1SVXB 1OLCA 2REGA 3LSWA 2OWSA 4R6KA 5AA2D 1XVXA 3A3UA 5DTBA 5I57B 5ISUA 4KCCA 3OMBA 2XXUA 2OZZA 2QSXA 2H4IA 4R2BA 2DVCA 3UN6A 5B70A 4YMBA 2I3WA 2UVGA 3C32A 4RXLA 3TYHA 3FUZA 4EQBA 3AXFA 3OO7A 3UORA 4DCXA 3QUJA 5TP9A 1OLAA 4LVQA 4F19A 1FCKA 1URDA 4BDMA 4XKNA 5CBRA 5CBSA 1LB8A 2PBWA 2UXAA 1AOVA 2XXHA 1FTOA 4NTLA 4BDOA 1NH8A 4JSOA 3LSFB 3MPKA 4OEVA 3MVWA 5K2XA 1MXYA 3PMXA 3O97A 4OVJA 2ONSA 5H8QB 4FE8A 3G7WA 4JB7A 4OESA 3KN3A 4FEDA 1FTLA 1B3HA 3IORA 2GH9A 5CMCA 4NF6B 3QIMA 4Z7EA 1US4A 5B7DA 2I48A 1MQHA 2DOJA 2AYSA 3MQ9A 2HZLA 4K3FA 4EF1A 2I0BA 4YKKA 1JEUA 4QFLA 1B3EA 2RC9A 2A5TB 3OOAA 2F36A 4ZZEA 4GL8A 3CSGA 4DXBA 1NL5A 3G3KA 1JW1A 4GRKA 4GWOA 3OD7A 3M3KA 2OCUA 1B52A 1VFEA 4GLIA 1A54A 3IAZA 1T0KA 2QL3A 3BKIB 4JWYA 3RTWB 1IIWA 3CG1A 2X26A 1DSNA 4QFPA 2DSFA 1I6QA 4AB5A 2Z8EA 3DLNA 5CRYA 3U94A 1IXCA 3IR1A 1D3KA 2HCAA 4QFKA 4MBPA 3QXMA 3C4MA 4G77A 1WDNA 4YB5A 4R72A 1QVSA 1YAEA 4OEUA 2GFEA 4NF8B 1ZTYA 3PU5A 3TKDA 4XKPA 4XXUA 2XXRA 1XS5A 1Y3NA 4EQ7A 2QMWA 1SW4A 1P1WA 3PUWE 2RC8A 4LZ5A 1Q35A 4R75A 4GOTA 2Z23A 1HSJA 4IO4A 2I3VA 2H5YA 5H8NB 2PMSA 1F9BA 5ITOA 1B51A 2H25A 2FYIA 2XD2A 3C36A 5JTYB 3BBRA 4POWA 4N13A 3OSRA 3RLFE 2DE4A 2XX7A 2Z8DA 2F7AA 2A5SA 3OEMA 2CZLA 5DVJA 4OERA 4G68C 1LLSA 4R2FA 5HM4B 4P0IA 4OFLA 1P1UA 4JWOA 2O51A 3SKPA 1IXHA 3A09A 3SESA 3VVEA 1GR2A 4H1XA 2O84X 1SI1A 3IK6B 5I59B 2B3FA 4RJZA 1PBPA 2P2AA 4PQJA 3QYTA 1ELJA 2DS9A 5AA2B 3OO8A 1LB9A 2QJEA 4KD5A 2LAOA 2Q8JA 3BFUA 1M5FA 5I2KA 1M5CA 2O1MA 1SQYA 1MS7A 5KCJB 4NF5B 1QUKA 3TCHA 1A8EA 4DDDA 2X7QA 3FD3A 4P11A 1NNTA 5BWJA 3CFLA 2VOZA 2I49A 3E4RA 4EXKA 5EHSA 1JW5A 3FV1A 4I62A 1NNKA 4OTEA 3K02A 3THIA 4F3PA 1EU8A 4ESXA 4PE5B 4R73A 1A7LA 3TMGA 3ODBA 1VE4A 2FA7A 3TDJA 1Y20A 3KGCA 2F97A 2NWJA 2DYXA 5AA1A 3MC2A 1LFHA 1B9JA 1Y3QA 4TQUQ 1MM6A 1MG1A 1ZIUA 1VR5A 3B6QA 1N0TA 3RPWA 2HFBA 1B32A 1POY1 4EQ9A 2ONRA 1QKAA 4GXAA 1SD3A 2R9JA 2Q2AA 3D4GA 2GHAA 1B3GA 4G2ZA 4JWXA 3C31A 4GFRA 4LQ2A 2B3BA 5FTHA 3SDFA 1B3LA 3IL1B 2ZYMA 2REJA 3KN8A 1HSEA 3FVOA 4IO7A 1OQHA 5DEXA 1MPBA 4FJPA 4Q8RA 3E3KA 3W9VA 3SEXA 3MP6A 1YTVA 4KYEA 3G3IA 1S9TA 5K2YA 4G8HA 1UQWA 3CFXA 3KJ7A 3WAEA 1ZU0A 4U23A 3PD9A 5ELVA 3VXBA 2VGQA 4QSDA 1IEJA 4MF3A 1B05A 2WKYA 5KDTA 3CVGA 4JDFA 1I6AA 3TFLA 3H6WA 2W7YA 4KFQA 2XXQA 2Q89A 1BLFA 4H0WA 4QF9A 5IAIA 3ONMA 5CMMA 2XXVA 4HS7A 5I58A 3QAXA 3KN7A 4G8MA 3K6VA 2YPNA 3LSLA 1B46A 1Y1MA 2D3IA 3IJOB 2Q9TA 4PFYA 3M3FA 1PB8A 3B7DA 3ZKLA 2Z22A 2I6EA 4JXIA 2ANJA 1A8FA 3T93B 1MPCA 4I8CA 2OBGA 1EZ9A 3HN0A 1XC1A 2AL4A 1II5A 3FXQA 3W9WA 3H3GA 5KCJA 3MJNA 4X9TA 2ALUA 1MPDA 4WKMA 3K6WA 4ZEIA 3R7XA 2F5XA 4PFTA 4OETA 1MXWA 3IO4A 3TTMA 3O6GA 2O6AA 4F1UA 3IOWA 3VLUA 4L17A 3Q28A 5HPQA 1LAHE 3QSLA 1EZPA 2R6GE 1NKXA 4R6HA 3LUYA 1LFGA 4TLLB 3OO9A 1EZOA 3VVDA 1CB6A 4U4SA 3H6UA 3HO7A 3HPIA 3TAJA 4HCYA 3VDFA 1USYH 4LZ8A 3PPRA 3TCFA 4ONYA 3UGWA 1Z7NE 1NH7A 4GF8A 2D5WA 4OXVA 2V3TA 5I2KB 2ABHA 4MLVA 3CG3A 1P1QA 2XXIA 3TCGA 3OO6A 2XXPA 1LSTA 3K6XA 3RY3A 3V8XB 2DVZA 1VSOA 2H98A 4GVOA 3PPPA 3PPNA 3ILUB 2VHAA 3HHGA 5FHNA 3U1OA 4O3BA 1OIBA 4ELRA 2F78A 3FV2A 4Q5TA 1LBCA 3T66A 2DWIA 3EF7A 4E0XA 4F29A 1DPPA 1UTBA 1FQEA 4FECA 1OQGA 3IOVA 4ZDMA 4I9DA 4U1OA 2IEEA 4QFOA 1B1XA 1N7XA 3CI8A 1OMPA 4ZEBA 2O68A 4N6PA 2PVUA 4WEPA 2Y84A 3K1MA 4YICA 1PB9A 3CR9A 1PC3A 3O6IA 2UVHA 2Z8FA 2ZNUA 5I2NA 3O6HA 1URSA 3CRBA 1PB7A 4I1DA 5BUUA 3GBAA 4XKQA 3EN3A 4Z0IA 1MXXA 4H5GA 3FATA 1Z7ME 3JYRA 1Y4TA 4YB6A 3MVZA 3K01A 3Q29A 4FIMA 4RY1A 1QW0A 3PGFA 3GLBA 4DZ1A 2NXOA 4KI0E 3H06B 1Y3PA 5DYHA 3SERA 4Q30B 1KWHA 4ESWA 4ZEKA 5DEXB 2XX8A 3WAFA 1POTA 3TUSA 1FTMA 2RF1A 1IXIA 3USDA 3VVFA 3RUMA 1R9LA 4C1UA 1I6BA 4ZZAA 3OEKA 3Q25A 1B2HA 1ZJLA 4TLMB 4U4XA 1AIVA 4GIZA 3MZBA 5AA3A 2AIXA 5KDTB 1TXFA 3G3GA 4F3SA 4X1BA 4ELQA 1Q1KA 1FTJA 4QHQA 1GVCA 5I56A 3O66A 1JVXA 3PD8A 4IGRA 3I5OA 4NWDA 4OWDA 2DWHA 3T96B 2DE3A 4G8NA 3CSBA 5I58B 4IO3A 4QSEA 1USYE 3RT6B 3Q27A 2QPQA 1MY0A 3VLVA 4RA1A 1FTKA 4H8JA 3O2AA 4NF4A 3TQWA 2NOOA 1OVTA 1B4HA 5L9MA 4IY5A 3DP4A 2PT2A 3MBPA 3MWBA 3UP9A 3FJMA 3TZAA 3EHSA 3R26A 1WVJA 1DTZA 1SYIA 3PV0E 5F7VA 1B40A 1TT1A 2UVIA 2XD3A 1MQGA 3A3CA 4ZEDA 4P0GA 4LATA 4GD5A 1PEBA 3KG2A 3MAMA 4DXCA 1GV8A 2Q2CA 1QUJA 4XTCQ 3UA8A 1L5TA 2NUVA 3SEVA 2G29A 3FJ7A 4ND9A 1LBBA 4JBZA 4KR5A 1MXVA 4R9GA 1QKBA 5A5XA 4MFIA 1B7UA 3L6HA 3KOSA 1ZKBA 2OLBA 3JV9A 3H7MA 4ZS9A 3VXCA 4OZ9A 2RC7A 2QRYA 3S4UA 5CM6A 5AE4A 5TU0A 2ZYKA 1UIUA 1MXZA 3O28A 4PP0A 4KPTA 4U2RA 3RNNA 2UVJA 3FXRA 4G4PA 3LSXA 2HZKA 2UYEA 1FQCA 3K2DA 1H76A 4GQOA 1N7WA 3S9LC 3VLWA 3VFJA 3C34A 3FIRA 1S7YA 4JSDA 3N94A 2F35A 1LCFA 3N26A 1H43A 1MH4A 3M3LA 3T9UA 3V89B 4YKPA 3G3FA 3D4CA 1UTBB 1ZLQA 2XXTA 4QFNA 2ONKE 4BDNA 3SEUA 4EF2A 1MQDA 1B5HA 1JW4A 4RPNA 4ELPA 4PETA 1IUDA 1LFIA 1TFAA 4MH5A 4M4GA 1AL3A 1UTHA 5J1DA 4U1ZA 2O69A 5AA4A 4DIGA 4X48A 1N76A 3F11A 2DXYA 5I2NB 2RINA 1BKAA 1JVYA 1FQFA 3MUQA 4H6DA 5L9OA 3I6VA 3S9MC 4F1YA 1FQBA 4YMAA 3IJXB 3HSTA 3U93A 1MY4A 4FATA 1DPEA 3JZJA 3TELA 3LBSA 1UIVA 3MPLA 4GXSB 5HBCA 3O29A 1XT8A 3C35A 4U22A 1B3FA 3G3JA 3P7IA 3TODA 1QULA 2ESNA 2I4BA 3S9EA 4WEDA 3H6VA 2QS4A 3K4UA 2XX9A 4RPOA 1ATGA 2DWAA 3SEWA 3ZKKA 5TPAB 1B5JA 4ELOA 3ECRA 1LCTA 2M8CA 3KFMA 3R6UA 3ZS6A 4F39A 3IX1A 4BDLA 5F1QA 4DE8A 4H67A 4N07A 3PMWA 4YZZA 4F1VA 4ZEFA 2ZYNA 3PUYE 4F2QA 1P99A 1MY2A 5L9SA 5I56B 4BDQA 4IY6A 5EYFA 3PUVE 3VV5A 4KYDA 4DLDA 3H4ZA 4F3GA 1N84A 4M1VA 1AMFA 5ICQA 1NFTA 2Y7PA 1MM7A 3V5AA 4LONB 1MQJA 4R6YA 3IB0A 3T22A 5H8FA 3B6TA 1B6HA 1D4NA 1NNFA 3QK6A 4NF4B 3TQLA 4BLAA 2YJPA 3PPOA 3QUFA 1D9YA 5ITPA 4LQ5A 2DWJA 2F6GA 5DT6A 1R6ZA 2V25A 1PDAA 4HTGA 3M8UA 1VFDA 3RTFB 4THIA 2V93A 3EHUA 1NMUA 2OWTA 5EHMA 3MZ9A 3I3VA 3C33A 2ZYOA 1SW2A 5DVFA 1URGA 4F18A 4EDPA 4XKRA 5H8HA 1GTKA 4UA8A 4OFJA 3PPQA 3KJTA 4H8IA 4F2OA 2QS3A 2RCBA 2Y7KA 1US5A 2VD2A 1S50A 4MLQA 2B65A 4KCDA 4PFUA 2H9BA 1N3WA 5A5XB 3DELB 2HAVA 5CI5A 3N6UA 3RQTA 1TFDA 4RK9A 3DP6A 4OENA 1J1NA 1XHYA 3MP8A 4NE4A 3SETA 3TTLA 1EH3A 1JETA 3TEPA 1JEVA 1QJMA 3KOTA 2Y7RA 3ZSFA 1B0HA 1O64A 2I4CA 2O7UA 4R9FA 4OYVA 4ZE8A 3MZ1A 1YPNA 1A55A 3KEIA 3KSJA 4OFOA 1SDXA 5FHMA 2ZNTA 3FVGA 5FTIA 3SEYA 1WODA 1JQFA 4H5FA 4WXJA 3IB1A 4G68A 4OMBA 2THIA 1YCJA 2ZXTA 2F6PA 1IXGA 1N04A 4NMYA 2PYYA 3IOUA 4ZE9A 4ZECA 5LOMA 2E0SA 4F3BA 3OXNA 1SBPA 1PBQA 4R74A 3BFTA 3TTKA 3EQ1A 1MRPA 5TPAA 4LUBA 2OK2A 1XVYA 1UTHB 1MXUA 4YB7A 3VE1B 1B4ZA 1GGGA 1MDQA 5AA4B 2XXYA 4X1DA 2DE2A 4O3AA 2QMXA 2HAUA 2BJJX 3E13X 3PUZE 4PFWA 1MY1A 1H44A 1MH3A 4NEDA 1B1HA 3EPEA 3IOTA 2AL5A 1Y1ZA 1SI0A 3RT8A 2G93A 1AH5A 3KSXA 1HSLA 2R71A 4RNSA 3DM0A 3TPAA 4YU0A 5L8DA 5I57A 2DQVA 3K1NA 1FQAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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