4G4PA

Crystal structure of glutamine-binding protein from enterococcus faecalis at 1.5 a
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
235
structure length
235
Chain Sequence
HHGENLYFQGMEGKKYTIGTDLTFAPFEFQDSKGKYIGIDVDLLDAIAKDQDFEVDLKPLGFDSAVQAIQSKQIDGMIAGMSITDERKKSFDFSDPYFDSGLQLAVKKGNDKIKSYDDLKGKTVAAKVGTESANFLEKNKEKYDYTIKNFDDATGLYKALENGEADAIVDDYPVLGYAVKNGQKLQLVGDKETGSSYGFAVKKGQNPELIKKFNAGLKNLKDNGTYDKILNNYLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Functional Diversity of Tandem Substrate-Binding Domains in ABC Transporters from Pathogenic Bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Amino acid ABC transporter, amino acid-binding/permease prot
molecule tags Transport protein
source organism Enterococcus faecalis
total genus 77
structure length 235
sequence length 235
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g4pA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g4pA02
4WEPA 4DCXA 4ZECA 3W9VA 1EZ9A 1XT8A 4ESWA 3MPLA 1OIBA 1MM7A 2D21A 5KDTA 5TPAB 4U22A 2DE3A 3JZJA 1B51A 3CVGA 5FTIA 1ZU0A 1P1QA 3TAJA 2DVZA 1JEUA 3DLNA 4JB7A 1SW4A 3PD9A 1QKAA 3B6WA 4YZZA 2UXAA 1LFGA 5H8HB 5I56A 3OOAA 4H67A 2F36A 4TOZA 2WKYA 1UIVA 4WKMA 4JDFA 5ICQA 4YB6A 3HCQA 3JV9A 3Q28A 1QUKA 3TFLA 3KBRA 2I58A 3O66A 1MXUA 4U23A 4EQ7A 3RN8A 1RYXA 1EU8A 4MF3A 4LZ8A 2F97A 3ZS6A 4BDMA 1PC3A 1P1OA 1O63A 4AQ4A 2XD3A 5H8NB 1SD3A 4KHZE 3WAFA 1JNFA 4EQBA 4F2OA 4PFWA 2Y7IA 3PPQA 2ZNSA 4NMYA 4IGTA 2Y7PA 2Q89A 1CE2A 1Q35A 3T96B 4ZEDA 1TXFA 2DS9A 4E0XA 3OEKA 5ITPA 3MZ1A 1SDXA 4DCYA 4I9DA 3VLVA 3LBSA 4C0RA 1H43A 1PB9A 1B4ZA 4LZ5A 3KG2A 1B3LA 2XXUA 2VGQA 3PUVE 2QS1A 4IO5A 3CFLA 2XXYA 1BKAA 2D3IA 4GL8A 2QMXA 4YKPA 5CI5A 3U93A 5ELVA 3ONMA 4ZE8A 3EN3A 1D3KA 4GRKA 1VFEA 1MY2A 3PUZE 3G3IA 4ZEFA 4PQJA 1R9LA 2GHAA 3G7WA 1VFDA 1B2HA 2REGA 3H4ZA 2ALUA 3C4MA 3DELB 2RC8A 4X1DA 1OLCA 3ZKKA 3VE1B 1D9YA 1MPDA 3MVYA 1MPBA 1GR2A 3UGWA 3LSWA 4DXUA 1NH7A 1UTHA 4H6DA 3B6TA 4XXUA 3R7XA 2Y7WA 1B0LA 1R1NA 4YKKA 2I4BA 3VLWA 2DYXA 2ONRA 2UVJA 3PMVA 1LAFE 1P1NA 1HSJA 1I6AA 1M5CA 3PMWA 3MBPA 2IEEA 2KLFA 2XX7A 2GFEA 1B46A 3PV0E 3DP4A 4IO6A 4ZZAA 5JTYB 2F6PA 1BIYA 4XKPA 1A54A 1VR5A 3BFTA 1FQDA 1O64A 4DZ1A 4ZEBA 3ODBA 1DOTA 4R6YA 3RNNA 1UTBA 3EHSA 3IK6B 1H76A 3HPIA 1PEBA 2VOZA 4OENA 1WDNA 2DWHA 3PD8A 1D4NA 5AA2B 4U4SA 3FGSA 1GVCA 3MVXA 4KYDA 2OK2A 5I57A 2XXIA 1XC1A 4OEVA 2QRYA 2R6GE 3PMXA 5B70A 1SYIA 4OTEA 4RA1A 1YTVA 1N3XA 1TWYA 5ISUA 2F7CA 4I1DA 1PDAA 3K1PA 2DWJA 1LB9A 3G3KA 5I58B 2RKMA 2HZKA 2ONSA 4YU0A 1LAGE 4EXLA 2QL3A 1SYHA 3MVWA 2QS3A 3LSLA 2DE4A 3R26A 1UQWA 2ZYOA 4EF2A 5BUUA 4OYVA 3C35A 4MLQA 3VVDA 3EHTA 5EYFA 4YMBA 1B5HA 4JWOA 3IX1A 3KN7A 5I2NA 3BBRA 3Q26A 5I59B 4MLVA 4X1BA 3PUYE 2I6EA 1LAXA 3KN3A 3Q25A 2FA7A 1ZMGA 1DPEA 2LAOA 3OENA 3LC8A 2ZYMA 1LBBA 2NOOA 4FIMA 2V3UA 3C33A 2RCAA 2X26A 4G8MA 2DQVA 4BDQA 1MXZA 3H6TA 1VE4A 5FHMA 4TQUQ 3TKDA 1YAEA 1A8EA 3SETA 2XD2A 5H8QA 4JSDA 3T9UA 2Y7RA 3IO6A 5TP9A 2PYYA 2V93A 2P0SA 5H8HA 3A3UA 2O7IA 2YPNA 2XXHA 1N7XA 4DIGA 1B9JA 3OO9A 2ZYKA 4ELOA 4F19A 3SEYA 4ZEKA 1H44A 4LVQA 3MP1A 1MQDA 1N3WA 2UVGA 2I0CA 3M3KA 2PT2A 1I6QA 4XTCQ 5CBSA 4QFNA 5DVFA 4KCCA 4OMBA 2P1SA 1MS7A 1FCKA 4NF4B 3SEVA 3PPPA 4POXA 4QSCA 1XOCA 2OWTA 4DXCA 4G8HA 3HHFA 4YB5A 5CMCA 3F11A 4L17A 1NFTA 3KEIA 1TFAA 3TYHA 5I2KB 3N5LA 4OERA 4GXAA 4N13A 5H8FB 3IO4A 2G29A 3I5OA 1IEJA 5BWJA 1IQ7A 4IGRA 1M5EA 2RCBA 3TTNA 1M5FA 4LONB 3RTWB 1N04A 3TELA 1DTGA 3HN0A 1ELJA 1USYH 4NF5B 4P11A 1PBQA 3IL1B 3K6VA 3IR1A 4RK9A 3T9VA 1B58A 4FEDA 2B3FA 1NNFA 3QUFA 4K3FA 1I69A 1MH3A 1LBCA 3K2DA 3QUJA 1BTJA 4YICA 4RYAA 3FVGA 2DXRA 5DVJA 5AE4A 3B6QA 3CIJA 1SW1A 1Y3PA 1B3HA 3KN8A 2Z8EA 5L9MA 2UYFA 2PX1A 4R75A 4QSDA 1NKXA 4IO3A 3IAZA 4IO7A 3S9NC 1Y20A 1Y3NA 2Q2CA 3ZKLA 3TZAA 2F78A 4JXIA 4GWOA 1N0TA 4KD5A 1ZLQA 2H9BA 1MH4A 1L5TA 4KCDA 1USYE 4NF6B 1B1XA 1B5JA 1NNTA 4HCWA 4DLDA 4G68B 4PP0A 2UVIA 3CG1A 3MZBA 4EF1A 1B7UA 4OETA 3H6WA 5TU0A 4G77A 4NTLA 2HFBA 4QRZA 5J1DA 3SEXA 1UIUA 3PPNA 2ONKE 2X7QA 3IOUA 2F35A 1Z7ME 3V89B 4QFPA 3G3HA 1B3EA 4F2QA 5IKBA 1B32A 3O6IA 2H25A 3HSTA 4KR5A 1QVSA 4F1YA 4KFQA 1HSLA 4POWA 4JBZA 4QFLA 1HSEA 3H6VA 4M4GA 1IITA 5AA1A 2HQ0A 4PE5B 4DE8A 3KFMA 1MXYA 3N6TA 1MY3A 2XX9A 1MXXA 1FQBA 4F3BA 2OZZA 1AH5A 1ANFA 3IB0A 1S50A 4KQPA 3I3VA 3U8QA 3VVFA 4GFRA 3TCGA 2R71A 1US5A 1QKBA 4JSOA 4NF8A 1XS5A 3OSQA 5ICTA 4FECA 2O69A 2DOJA 4ONYA 2PBWA 4AB6A 5M2VA 2RC9A 2OCUA 3K6XA 1B05A 1IXIA 5AA4A 2QJEA 2OLBA 4ESXA 4YB7A 3AXFA 4OZ9A 2A5TB 1B52A 5DEXA 1OVTA 2AYSA 2P2AA 4PFTA 2A5SA 4QFKA 3UORA 4OQOA 2Q8JA 4KI0E 1QUJA 2I48A 2QS4A 5FHOA 5KDTB 3U92A 2GRVA 5A5XA 3OSRA 4FJPA 2VP1A 4ZZEA 3O6GA 2B3BA 1LSTA 1MQIA 3OELA 1XVYA 3S9MC 3FXUA 4IO2A 4I62A 1S9TA 5IAIA 4FORA 3H3GA 1EH3A 1FTKA 3T9XB 3OO7A 3SERA 2ANJA 3RY3A 1IXGA 5KCJA 2ZNUA 3UP9A 5I56B 1ZBMA 1B3GA 3O28A 4Z0IA 3MP8A 3DP8A 4H5FA 5HBCA 3EHUA 3OO8A 4F29A 3CSBA 2OBGA 1MY1A 4NWCA 3EPEA 1BLFA 5JEIA 3FVOA 3K0VA 4P0GA 2FNCA 3LSXA 1MQGA 3C31A 1JW5A 3FD3A 3PUXE 2HEUA 3VLUA 3SESA 3N94A 3UA8A 1R6ZA 1AOVA 1URDA 4NF5A 2H98A 4EQ9A 1QUIA 4NWDA 3EQ1A 2V84A 4GF8A 2YLNA 1DSNA 4AB5A 3TDJA 3FATA 3HV1A 1MDQA 3IJXB 2ZMBA 3VV5A 4HTGA 3E3KA 4YAHX 2Z22A 3G3FA 3S9EA 1OLAA 4R73A 3FXRA 4KYEA 1POY1 5TPAA 1Y1ZA 2VHAA 3TMGA 1MXWA 4M1VA 1RKMA 1JVYA 3TTRA 4HW8A 3IORA 4GXSB 1IXCA 4RPNA 4BDOA 4F3SA 4IB2A 2O6AA 2RF1A 4RY1A 3VVEA 2B65A 4Z7EA 1B6HA 4F31B 3TODA 3TTKA 3N26A 5CC2A 3CFXA 3THIA 3UK4A 4UA8A 4QFOA 3FXQA 2NUVA 4LATA 1S7YA 1JW4A 3EF7A 3K00A 4R9GA 2H5YA 3TTMA 2Q88A 2XXWA 3RUMA 4BDLA 2QSXA 1DTZA 1ZTYA 3GZGA 1ZKBA 4ND9A 3ZSFA 3OD7A 2XHDA 4BDNA 1B1HA 4YKIA 4TLMB 4PFUA 5H8NA 4G68A 1GTKA 1LFIA 1H3DA 1UTHB 5CBRA 5B7DA 2UYEA 1Q1KA 1Y4CA 3OEMA 2VD3A 2V3QA 2Q9TA 1IUDA 3K6UA 1B0HA 3Q27A 5DVIA 1QJMA 2X7PA 2Y7KA 4O3AA 4U1ZA 4IY5A 1Y1MA 1NNKA 4X48A 3IB2A 3U72A 3KSJA 1RYOA 4IO4A 1US4A 3K6WA 3LUYA 1DPPA 1Z7NE 4H65A 3M3LA 3FJGA 3RTFB 3QK6A 1ZJLA 3S4UA 3MPKA 3MQ9A 3FVNA 4GOTA 3O9PA 4GLIA 4R74A 5FHNA 1AIVA 2ZXTA 4LQ5A 3FJMA 1UTBB 1D9VA 4EDPA 1H45A 3RGYA 3FV1A 4X9TA 1SW5A 3FUZA 1GGGA 3MC2A 4QHQA 3H6UA 2NWJA 5I57B 1JW1A 1YCJA 1FQFA 4H8IA 3V8XB 3T66A 2FYIA 3IJOB 1A40A 3RQTA 4F39A 2QS2A 5CMBA 4R6HA 2F34A 1FQAA 3TQWA 1LCFA 1A99A 4OFJA 2CMOA 1M5BA 4XIGQ 3KGCA 3ILUB 5DYHA 1A7LA 1FW0A 1AL3A 4UACA 3MUQA 4BDRA 3DM0A 3VFJA 5DTBA 3TUSA 1WODA 1B40A 3O97A 4ISUA 4F3GA 3M8UA 1PBPA 5I2NB 3E4RA 4F1VA 4H8JA 3N6UA 1MQJA 4HS7A 4O3BA 3T22A 3MVZA 4H1XA 2XXPA 3OO6A 4ZEIA 1LGBC 1NMUA 1Y9UA 5F1QA 3O29A 2PT1A 4DDDA 2RINA 2DWAA 4ECFA 1O7TA 4R2FA 3UN6A 3V5AA 2DXYA 3RPWA 4OFLA 5EHMA 4C1TA 1OQHA 4NEDA 2VD2A 4RJZA 3PPOA 2W7YA 3GBBA 5H8QB 5JTYA 3I6VA 4LP2B 2AL4A 4G4PA 5TP9B 2NVUB 3RLFE 2ZYNA 3P7IA 5L9SA 2I3VA 1SQYA 4G68C 4Q8RA 2RC7A 5L8DA 1B3FA 5AA2A 1T0KA 2XX8A 2PMSA 3WAEA 5CM6A 3E9XA 3TQLA 4Q0CA 2F6GA 4EXKA 2I3WA 4ELPA 3GBAA 3CRBA 3IB1A 3SEUA 4Q5TA 5I58A 3QAXA 3B7DA 3H06B 1IXHA 4GIZA 1POTA 1MM6A 1P99A 3FZVA 1VSOA 4FEBA 5I84A 5AA2D 3W15C 2D5WA 1QW0A 5I59A 4JWYA 4LZ7A 3RT6B 2E0SA 5CRYA 3TEPA 1PB7A 1TT1A 2Z8DA 2BJJX 1FTLA 3V83A 3DP6A 1YPNA 3BFUA 4XKNA 4GQOA 1PB8A 3Q29A 4HCYA 3KOSA 3KSXA 3U1OA 4ZS9A 2O1LA 2I0BA 3FJ7A 1GV8A 4ZDMA 4GD5A 1BP5A 4RNSA 2QMWA 3T9HB 4F22A 3VXCA 2HAVA 3FVKA 3VDFA 3S9LC 3S2VA 4R6KA 1B4HA 4G2ZA 2O68A 3OMBA 1P1UA 3MZ9A 4EUOA 2OWSA 3ECRA 4QSEA 4MBPA 3KOTA 3QXMA 3USDA 1B5IA 4O3CA 2XXRA 1EZPA 4OWDA 4ELRA 1B7ZA 1CB6A 5FTHA 5HM4B 4U2RA 4BLAA 4OEUA 3M3FA 1I6BA 1JEVA 3W9WA 1OVBA 3TPAA 2IA4A 3KJTA 4YKJA 4RPOA 1MXVA 4NF4A 4R72A 1JETA 2OJTA 5CMMA 4RXLA 1A55A 4P0IA 2NXOA 3G3GA 4U21A 2I4CA 4NE4A 2AL5A 5CMKA 3H7MA 1URGA 1P1WA 4WXJA 1MDP1 5DT6A 2R9JA 5I2KA 5AA3A 3MWBA 1SI1A 2O84X 3BKIB 3L6GA 1NH8A 3CG3A 1WVJA 4KYSA 4U1OA 2DVCA 5H8FA 1DMBA 1FTMA 1MPCA 2XXVA 3K1NA 3QSLA 3K4UA 1IIWA 3K02A 1IZ1A 3IOVA 3GXAA 2F5XA 2O1MA 2DE2A 3IOWA 2AIXA 2O7UA 4FATA 1MQHA 3K01A 2HZLA 3JYRA 2DSFA 3PGFA 5H8SA 3ILTB 3LR1A 4ZE9A 4H0WA 1LAHE 3UIFA 1URSA 1N7WA 3C36A 3A09A 4U4XA 3D4CA 1OQGA 4C1UA 1B7HA 2UVHA 1AMFA 4RK2A 2CZLA 3MJNA 1QULA 4GL0A 4LQ2A 1SW2A 2HXWA 4FE8A 4H5GA 3MW0A 1NNPA 4N6PA 5EHSA 5L9OA 3O2AA 2REJA 2F8DA 1MRPA 4G8NA 1NL5A 3TCHA 4F1UA 2Z8FA 3T93B 1JQFA 3GLBA 4LA9A 1FTOA 3OXNA 1FQEA 2HCAA 4MH5A 2H4IA 1SVXB 3LSFB 1LLSA 4YMAA 4NF8B 4ELQA 1FQCA 1XVXA 2QPQA 4JWXA 5KZTA 1LCTA 4DXBA 1II5A 3C34A 3D4GA 2F7BA 5AA4B 1N84A 1LFHA 2XXTA 3VXBA 2YJPA 1A8FA 4NF6A 2E1SA 5DEXB 3L6HA 1ZIUA 2XXXA 2M8CA 4THIA 2PVUA 5HPQA 3MAMA 1N76A 3FASA 3QYTA 3R6UA 2THIA 2ESNA 3SDFA 4OFOA 4OXVA 3C9HA 4FAJA 2DP8A 3CI8A 5A5XB 2GHBA 3SEWA 4PFYA 4WEDA 2F7AA 4XKQA 3HO7A 1MG1A 4IY6A 1J1NA 1MY0A 4MFIA 3PUWE 3IOTA 3A3CA 1XHYA 4F18A 1JVXA 3C32A 3MP6A 3QIMA 2Z23A 4I8CA 3SKPA 4OHNA 3TCFA 1TFDA 1M5DA 3HHGA 3KJ7A 3FIRA 4KPTA 3U94A 4R2BA 4OVJA 3G3JA 2HAUA 5KCJB 4E0WA 3CFZA 3O6HA 4TLLB 2V25A 2I49A 2O51A 5ITOA 4F3PA 1Y3QA 1LB8A 3PPRA 2XXQA 3K1MA 5K2YA 2DWIA 5LOMA 4GVOA 2H99A 5F7VA 3TTLA 1MY4A 4XKRA 2ZNTA 1EZOA 2V3TA 3CSGA 4OESA 3E13X 1FTJA 3FV2A 4LUBA 5K2XA 4PETA 4QF9A 2Q2AA 2G93A 4Q30B 1KWHA 3RT8A 3CR9A 2Y84A 4R9FA 2ABHA 2A5TA 1SBPA 5JK4A 1F9BA 1OMPA 1R9QA 3PU5A 1ATGA 3KZGA 3H03A 2GH9A 1Y4TA 4N07A 1SI0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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