4G77A

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with tolfenamic acid at 1.98 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with tolfenamic acid at 1.98 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
total genus 117
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g77A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g77A02
2DE3A 2XXVA 1EH3A 1CB6A 3TKDA 3O6GA 3KN7A 1B51A 1GR2A 1P1WA 5KCJB 1NH8A 3VLWA 1USYE 2QL3A 4GWOA 1M5BA 2QS1A 4POXA 1IIWA 2XXRA 4QFNA 4GL8A 3CVGA 2R6GE 4LZ7A 1PBQA 1B3FA 1FQDA 2VP1A 4ND9A 1OLAA 1QUJA 5CC2A 3N26A 3M3FA 2HFBA 5HM4B 2ZYKA 2Q9TA 3VVEA 2W7YA 1JNFA 5K2YA 1B1HA 4YAHX 1DOTA 4G8NA 3MC2A 1DMBA 3KOSA 4JB7A 4Q8RA 2I58A 3KFMA 1B2HA 1FTLA 1B32A 2I48A 3MZBA 4H6DA 3SESA 3CIJA 3K2DA 1UTBB 5I2NB 3CR9A 2QRYA 4ESXA 3V8XB 3PPRA 2P0SA 3U72A 5B70A 3O28A 3VVFA 2HCAA 2RKMA 2Z8FA 4F1VA 1MG1A 4RXLA 1S7YA 1M5FA 2E1SA 2Y7KA 4P0IA 3PGFA 1UIVA 4ESWA 4IY6A 1PB7A 1RYXA 1SQYA 4QFOA 5F7VA 3VXCA 2UYEA 3MVZA 4LZ5A 3CI8A 4DLDA 3UORA 1IXHA 4LP2B 4THIA 5EHSA 2H99A 4ONYA 4P0GA 3H6UA 1MY1A 1QULA 4NMYA 5TP9B 2XXUA 3R7XA 4ZE9A 4BDLA 1JEUA 4XKNA 1MQHA 5KZTA 4EQ7A 2HZKA 4WEPA 4PE5B 2OJTA 2UYFA 4R9GA 2HZLA 1B7HA 3T9VA 1B6HA 3H06B 5ISUA 3IL1B 4FEDA 3L6HA 3Q26A 1SW4A 1ZBMA 5A5XA 1Y3PA 1SI1A 4F22A 3HCQA 4OQOA 2NVUB 4ZEIA 5CMKA 2DSFA 3OELA 2Y7RA 4DZ1A 5I2KB 3LR1A 5DYHA 3M3KA 3DP4A 1FW0A 2AIXA 2A5TB 1WDNA 5JK4A 1MPBA 2Y7WA 3LSXA 1TFDA 3PUVE 3C4MA 3CRBA 5I57B 4JDFA 3P7IA 1OMPA 4TLLB 5FTIA 1A99A 4ELOA 4C0RA 3R6UA 1IUDA 4OXVA 2ZYNA 3LC8A 3TTLA 3FV1A 4OYVA 1N84A 5EHMA 4PFWA 3FVOA 1TT1A 5JEIA 3TFLA 4I9DA 4KQPA 2F35A 1B46A 1SBPA 2UVIA 3U8QA 4KHZE 1MQDA 4OTEA 1DTGA 3SKPA 1NNPA 2F5XA 4F1UA 4NF6B 3ODBA 3O6IA 1SDXA 4G2ZA 1OIBA 3FATA 1MY0A 4ZEDA 1MPDA 3S9NC 3FIRA 4F3SA 2FYIA 4PP0A 4RK2A 3SETA 3U94A 4E0WA 1IZ1A 2NWJA 4X48A 4ZS9A 2RCBA 4G68C 5DEXB 1IXGA 3KSXA 2RC8A 5I59A 3TZAA 4BDOA 3OOAA 3QUJA 2XX8A 5M2VA 1D3KA 5H8NB 2FA7A 2XD3A 3MBPA 2QJEA 4IO5A 4ELQA 2QMWA 3CFZA 5I84A 3MZ9A 2BJJX 2P1SA 1Y3NA 2HEUA 1N76A 3ZSFA 1AL3A 2GHBA 4U2RA 1MXWA 1BP5A 3C31A 3OMBA 3PUYE 4I8CA 2REJA 1PEBA 4U4SA 3EQ1A 5H8FA 1RKMA 4PFUA 2QSXA 4R6HA 1R9QA 2OWTA 1RYOA 4HS7A 1R6ZA 3QIMA 2ZYOA 1US4A 4NWCA 2DE2A 4ZZEA 4PQJA 5H8HA 2DYXA 2F7CA 3IO6A 3T9HB 4IGTA 1OLCA 1B3HA 2VGQA 3JZJA 1NKXA 4MLQA 1ELJA 4TOZA 2I4CA 4YB6A 1O64A 1MH3A 2O1MA 3C9HA 4KD5A 4PFTA 4JXIA 4KYDA 2GH9A 5IKBA 3CSBA 2RF1A 4DE8A 3I6VA 1BTJA 4O3CA 4F39A 2VD2A 5I58B 1ZTYA 1WODA 4IO4A 1FTJA 2ZNUA 5TU0A 3RY3A 3Q25A 4M4GA 3PD8A 3E13X 3QK6A 3UA8A 1JEVA 3IB1A 1L5TA 4NWDA 1N04A 4XXUA 3K6XA 3PMWA 3K1NA 2XX9A 3TMGA 2I6EA 1ATGA 5HPQA 5HBCA 3IR1A 4RNSA 3K0VA 3I5OA 2F7BA 3L6GA 1FQBA 2Q89A 3TCGA 3JV9A 2ZMBA 1ZU0A 3U1OA 3QAXA 2F97A 3EHTA 1UTBA 3N5LA 1B58A 3MPKA 4TQUQ 2H9BA 5FHOA 2QS3A 1Q35A 5TPAB 4OETA 5IAIA 4F3BA 2F6PA 2RC7A 4F2QA 2HAUA 4ZZAA 3TODA 2RCAA 1LBBA 3GXAA 5CBSA 1JW4A 1BIYA 1IXCA 2O69A 4IO6A 2PT2A 2NUVA 2V3TA 4NF8B 1NFTA 5AA3A 3PPPA 4R74A 3MUQA 4JWYA 5TP9A 3S9EA 3O2AA 1MQGA 3S9LC 3CFXA 3K4UA 1MXVA 4F29A 2HQ0A 3TCFA 3FVGA 1H44A 1MDQA 5H8SA 5AE4A 2DP8A 5ICTA 5L9OA 3FD3A 1SI0A 1M5DA 3KJTA 3OSRA 4YB5A 1B5JA 3IOTA 2R9JA 4DIGA 1MY3A 1XVXA 4NE4A 3M3LA 3V89B 1MY2A 3FXQA 3G3FA 4N13A 5K2XA 2VOZA 2F34A 3LSFB 1VR5A 4NTLA 4UA8A 3DM0A 3HV1A 4YZZA 3K1MA 3OEKA 2Q8JA 1LSTA 4YKIA 1PBPA 3TEPA 4OEVA 3IOWA 3ONMA 4H5FA 2ANJA 1UTHB 3G3IA 1SW2A 3B6QA 3EHSA 3UN6A 5ITOA 2A5SA 2QS4A 4H8JA 4BLAA 3KG2A 4GXAA 4LONB 1EZPA 3SEXA 3EN3A 4WKMA 1JVXA 1AH5A 4GXSB 2V3UA 3MAMA 4X1DA 1Y20A 1O63A 1BLFA 1B7ZA 2GRVA 4H65A 4L17A 5I57A 2OCUA 4QSEA 3EPEA 1LAHE 1S9TA 5L9SA 2F78A 2DS9A 3I3VA 4QFPA 1M5EA 4RPNA 2O68A 2D5WA 4G68A 5CBRA 4F2OA 2F36A 5CMCA 1NH7A 3T9XB 4GRKA 1KWHA 3H6VA 4I1DA 3H3GA 2I0BA 3FVKA 3IK6B 4DDDA 5KDTB 2I3VA 3CSGA 3MWBA 1JVYA 1Y4CA 1AOVA 1ZJLA 1MXYA 1NNFA 2VD3A 3FZVA 5AA2B 4GOTA 3PUWE 4EQ9A 2HXWA 4R6YA 4AB5A 3TQWA 4EXKA 1BKAA 3E3KA 1EZOA 3TYHA 1I6AA 4KI0E 4G8HA 4H8IA 3D4GA 4IO2A 4JSOA 5DT6A 4QRZA 2YPNA 4O3AA 1LBCA 3FJ7A 4YU0A 3DP8A 1QJMA 5DEXA 2PYYA 3TQLA 3KN3A 3GLBA 1XVYA 3PMVA 4RYAA 1FQFA 4NF5B 3EHUA 3GZGA 2H25A 3S4UA 1TWYA 4F18A 1HSEA 3PMXA 3KZGA 3DLNA 3FJMA 3OO8A 4LQ2A 5JTYB 1DPPA 3T93B 2G93A 3IORA 1M5CA 3VLVA 1QW0A 3DELB 3PU5A 2D21A 2R71A 4PETA 2FNCA 4OFLA 1ANFA 2ONRA 1DPEA 1FQCA 5B7DA 3Q28A 4NF4B 4NEDA 5I56A 1QUIA 2HAVA 1II5A 4EDPA 3SEWA 4MLVA 1Y3QA 3LUYA 3MVWA 1ZIUA 3D4CA 4Z7EA 3OO9A 3TTNA 3MW0A 4M1VA 3FV2A 4U1OA 1B40A 3HHGA 2UXAA 4EF1A 3CG1A 4GQOA 1PB9A 4LATA 2PVUA 1H76A 3FJGA 4MF3A 1MXZA 1R9LA 3QYTA 3EF7A 4OERA 1OQHA 3RNNA 1ZKBA 5CI5A 3SERA 4R2BA 5A5XB 4KYEA 1MM6A 2WKYA 2XXTA 4H5GA 2GHAA 3C35A 1MY4A 1VSOA 4U22A 2XXHA 1OVBA 1B0HA 4MBPA 5H8QB 3HHFA 4ZE8A 4QFKA 4F19A 2XHDA 3C36A 2YJPA 3PV0E 5FTHA 1D9VA 1MH4A 3OXNA 1SD3A 1A55A 4IGRA 2IEEA 2CMOA 1D4NA 3VV5A 4OFJA 1LB8A 3PPNA 1TXFA 3RTWB 4DCYA 2I4BA 2RINA 2P2AA 2XXPA 4G77A 2DOJA 1MRPA 4EUOA 3E4RA 1LFGA 3VDFA 1EZ9A 2ZNTA 3RUMA 4FECA 5ITPA 3IB2A 2OWSA 2D3IA 4N6PA 3BKIB 3MJNA 4OFOA 1P99A 2KLFA 2O51A 1R1NA 4OWDA 4QHQA 5FHNA 2XXYA 2UVGA 3O29A 3LSWA 1URGA 4GD5A 3CFLA 3V5AA 4YMAA 2NOOA 3FXUA 3MPLA 1SW1A 4JSDA 4U4XA 1A40A 2NXOA 1D9YA 3RGYA 5AA4B 5AA2D 1PDAA 1Q1KA 5TPAA 1OVTA 2XX7A 2B3BA 4P11A 2O1LA 4IY5A 4KCCA 4QF9A 3OO6A 1Y9UA 1MXXA 1A8FA 3UP9A 3HN0A 1CE2A 5DVIA 5KCJA 4GFRA 3T66A 1I69A 4NF8A 1B7UA 3G3GA 3G3KA 2F8DA 3SEUA 3Q27A 3C33A 4H1XA 3VE1B 5I59B 4XTCQ 4POWA 2XXXA 1HSLA 2UVJA 2XXWA 1US5A 1NNKA 1XHYA 4ZDMA 2AYSA 1YTVA 4JWOA 3PPQA 1LFIA 1Z7ME 3V83A 1MM7A 3G3JA 1B3EA 4GF8A 3TPAA 2XXQA 2Y84A 4ELPA 1PB8A 4YICA 5AA1A 1B4HA 3N6UA 3IJOB 3W9WA 2E0SA 4KPTA 3IB0A 4F31B 2V93A 4YKKA 1WVJA 4FEBA 5I2NA 4U1ZA 4R2FA 4UACA 1LAXA 3IAZA 5L8DA 3RLFE 3MVYA 4X9TA 3S2VA 4HW8A 5H8HB 4YMBA 3TTMA 2OLBA 2X7QA 1F9BA 1B5HA 4BDNA 4BDMA 2THIA 4KCDA 1XT8A 3TTRA 3ILUB 3AXFA 1MPCA 2DWJA 1POY1 1MQJA 1YCJA 4FE8A 4WXJA 2V84A 3C34A 2ESNA 4OESA 1YAEA 1N0TA 1B0LA 3C32A 4LZ8A 1IITA 2ABHA 2O84X 2ONKE 1GV8A 4R75A 1MDP1 1SYHA 3KBRA 4YKJA 4JBZA 4RA1A 5CM6A 2DVCA 3GBBA 1YPNA 1H43A 4RK9A 2YLNA 4C1UA 3IX1A 4ECFA 1GTKA 1B3LA 3SDFA 3IOUA 5KDTA 3TTKA 2Q88A 2Q2CA 3TUSA 4YKPA 3KN8A 2QMXA 5AA2A 1MS7A 2OBGA 4Q5TA 1N7WA 4HCWA 5ELVA 2OK2A 3TDJA 4R72A 1NMUA 4JWXA 3N94A 4KR5A 5I2KA 3RT6B 5BWJA 2Z8DA 3UGWA 3OO7A 1B3GA 2DXRA 4LUBA 2F7AA 4FIMA 2AL5A 1H3DA 3W9VA 1QVSA 2A5TA 2DWHA 3A3CA 1DSNA 3RTFB 3B7DA 4AB6A 4H67A 3H03A 4NF5A 4XIGQ 1P1OA 3G3HA 2G29A 1N3XA 4KYSA 1VE4A 1XC1A 1Y1ZA 3E9XA 4F3GA 3FVNA 4ISUA 5JTYA 2RC9A 3W15C 3O97A 4OZ9A 4OENA 4H0WA 1HSJA 4MFIA 2DXYA 1Y4TA 3PUZE 4DXCA 3VXBA 3QUFA 2PMSA 5CMMA 4NF4A 1XS5A 3IJXB 1B52A 2Z22A 2Z23A 3O9PA 5CMBA 5DVJA 3Q29A 1POTA 3T22A 1JW1A 3H6WA 3K01A 4NF6A 4Q0CA 4EXLA 1SW5A 1I6BA 2ALUA 1N3WA 4EQBA 1JQFA 3BBRA 3H7MA 1B9JA 1J1NA 1O7TA 2OZZA 3RQTA 4AQ4A 3K02A 3H4ZA 4QSDA 1P1QA 4DXUA 5F1QA 4RY1A 4R6KA 3U93A 4QSCA 4R9FA 3O6HA 3PUXE 1N7XA 3IO4A 4FORA 5H8QA 2ZNSA 1LFHA 4R73A 3MP1A 2X26A 1T0KA 2V3QA 1FTOA 4PFYA 3MP8A 2CZLA 5H8NA 5DTBA 3G7WA 5J1DA 2Q2AA 4HCYA 3ZKLA 1AMFA 1XOCA 3K6VA 1TFAA 5ICQA 1SYIA 1S50A 3KSJA 3ECRA 3K1PA 3RT8A 3FGSA 5EYFA 4G68B 5L9MA 4KFQA 1LCTA 3KJ7A 2VHAA 4XKPA 4Z0IA 3SEVA 1QUKA 2Z8EA 3VLUA 1FTKA 3T9UA 2H4IA 4IO7A 1IEJA 1PC3A 3K00A 2XXIA 3S9MC 5LOMA 3IOVA 1B5IA 4OMBA 5AA4A 3B6TA 3MVXA 1A54A 3WAFA 4LQ5A 4GIZA 3ZS6A 2I0CA 2ZXTA 1JETA 3F11A 4GL0A 4C1TA 4FAJA 2O6AA 4OVJA 5DVFA 1URSA 3K6UA 1FCKA 2V25A 3TELA 1LLSA 2O7IA 1FTMA 1H45A 4ZEKA 3HSTA 4TLMB 1OQGA 1LGBC 5I58A 1AIVA 2Y7IA 2DE4A 4X1BA 4XKRA 1FQAA 2IA4A 3KOTA 1MQIA 3GBAA 4LVQA 4LA9A 3RN8A 4F3PA 2PX1A 3N6TA 4RJZA 3OSQA 3A3UA 4G4PA 3VFJA 1NNTA 3U92A 3PD9A 3M8UA 4RPOA 4IO3A 1DTZA 2Y7PA 4U23A 3USDA 4HTGA 4DCXA 1NL5A 4F1YA 1LB9A 3VVDA 3O66A 5I56B 5FHMA 4EF2A 1Z7NE 4XKQA 3ZKKA 2F6GA 1FQEA 2QPQA 4K3FA 4Q30B 1IXIA 1LAFE 3OEMA 3A09A 2I49A 4QFLA 3FXRA 3CG3A 4E0XA 2PT1A 3TAJA 4FJPA 3FASA 3BFTA 4I62A 4N07A 1Y1MA 2B65A 1URDA 3THIA 1JW5A 1ZMGA 2PBWA 3R26A 1MXUA 4O3BA 2O7UA 2ZYMA 1A8EA 3KGCA 4BDRA 3DP6A 4ZEBA 1SVXB 2H5YA 3B6WA 1P1NA 2DQVA 4YB7A 2DWAA 4ZEFA 4WEDA 1GVCA 4BDQA 3FUZA 3TCHA 1B4ZA 1EU8A 4DXBA 4MH5A 3HO7A 3JYRA 3LSLA 4ELRA 3MZ1A 3MQ9A 3OENA 1B1XA 3RPWA 1A7LA 2H98A 4OEUA 4ZECA 2B3FA 3PPOA 2GFEA 4U21A 4OHNA 1VFEA 3HPIA 3QSLA 3MP6A 1QKBA 2AL4A 1USYH 2X7PA 3BFUA 2LAOA 4GVOA 2XD2A 1QKAA 4IB2A 1LAGE 4GLIA 3UIFA 4FATA 5H8FB 3UK4A 2REGA 3LBSA 4G8MA 1UIUA 2DVZA 1UTHA 3ILTB 1IQ7A 1LCFA 2M8CA 2I3WA 3KEIA 1GGGA 1VFDA 1P1UA 3OD7A 5BUUA 5CRYA 1B05A 3K6WA 3QXMA 2ONSA 2UVHA 2DWIA 1UQWA 2QS2A 3H6TA 1I6QA 1ZLQA 3WAEA 3SEYA 3T96B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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