4G8MA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the agonist cbg-iv at 2.05a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Pharmacological and structural characterization of conformationally restricted (S)-glutamate analogues at ionotropic glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8mA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8mA02
1MY4A 1S7YA 3RN8A 4TQUQ 1N7XA 4H65A 4HCYA 2HZKA 2ZYOA 1MDP1 4G68C 1RYXA 4IGRA 4JWYA 2RF1A 4QFKA 2YLNA 5K2XA 3S9EA 1FW0A 2F36A 1EZ9A 4KI0E 2UXAA 1GR2A 2HFBA 4X1DA 4E0XA 2AL5A 1PBPA 3QAXA 2RC8A 3LBSA 2XXPA 3PUYE 2UVHA 2O6AA 1VFDA 1R9LA 4G8MA 3TEPA 5I59B 5KCJB 2PYYA 2X7QA 1LBCA 1LSTA 2DE2A 4QFNA 1NMUA 5A5XA 5I56A 1O64A 3PGFA 4Q5TA 1M5CA 2Y7RA 3W15C 1MY2A 3SDFA 3TDJA 3T9VA 3PMWA 5DVJA 2F78A 3K6WA 2Q9TA 3MZ1A 2Q2AA 3SESA 3C34A 3MZ9A 2O7UA 3S2VA 3EHTA 4YKKA 4LA9A 4UACA 2REJA 4NF6A 3OO9A 2NUVA 2Y7PA 2E1SA 3KFMA 3HHGA 1B0LA 4OETA 4KYDA 1JVYA 3G3JA 4KYEA 3OO8A 1IITA 3TTRA 4GXSB 3OENA 4IO5A 3H03A 4XKPA 1WODA 5BUUA 1N3WA 3W9WA 4DXUA 4JDFA 3SEYA 1YPNA 2GHAA 2H9BA 4NF4B 3N6UA 1MQHA 1NKXA 1B7ZA 3FXUA 1JETA 3MW0A 1B5JA 4KYSA 5I2KA 2VD2A 3OELA 1OLAA 4OXVA 1QUJA 3TCHA 4N07A 5H8QB 4O3BA 1FTKA 1URSA 2ZMBA 1JW5A 4O3CA 2QS3A 4NF5A 1NFTA 3V8XB 3QUFA 4HTGA 4OEVA 1D4NA 4ECFA 1A55A 5ITPA 5HBCA 3TCGA 1D3KA 5I84A 3FVGA 4MLVA 1SW2A 3IOUA 4EDPA 2Q89A 2NVUB 4U4XA 4G4PA 3O9PA 3O97A 4F22A 1XT8A 2Z8FA 1N04A 3N26A 1OLCA 4JBZA 4MH5A 3K0VA 1MM6A 5EHSA 3DM0A 3PPRA 4ZE8A 2XX8A 2DXYA 3TTLA 1BP5A 3MVWA 1LB8A 1O63A 3ZS6A 4IO2A 4OTEA 5IKBA 3EF7A 2ALUA 3Q27A 3C33A 2FA7A 5DEXB 4GOTA 1QW0A 3OXNA 3E9XA 3SERA 3N94A 3K1NA 1OMPA 2DOJA 2H25A 4G8NA 4MFIA 4GLIA 3HN0A 3N5LA 2DS9A 4KFQA 5JK4A 3UK4A 5I2NB 2OJTA 1KWHA 2V25A 5H8NA 4LQ2A 1UTHA 3KBRA 1GTKA 3LSLA 4OHNA 4H8IA 4IB2A 2ONRA 2A5TA 4G8HA 2DSFA 3QXMA 4YMBA 2XXXA 5AE4A 3K1MA 5FHOA 3M3FA 1UQWA 1URDA 3U93A 3TUSA 4PFUA 2H99A 1NNKA 1P1QA 1MDQA 4ELOA 1I6BA 4R73A 3T96B 5AA4B 1Q1KA 2F34A 3G3IA 3QUJA 4RPNA 3I3VA 3K4UA 3MBPA 1B3FA 4DZ1A 2G93A 4LQ5A 4PQJA 3TTMA 4R6KA 2VHAA 5FTHA 1Y3NA 2QRYA 4JSDA 2R6GE 4P0GA 3PUWE 4H67A 3C9HA 1NH7A 4BDOA 1XOCA 3E4RA 4DCYA 3PD8A 2ZYMA 4U1ZA 5JTYB 4M4GA 3TTNA 2PBWA 4WXJA 3H4ZA 4G68B 2QSXA 3EQ1A 2DYXA 4ZZAA 1MQJA 5I57B 3QIMA 3UP9A 1B2HA 4F3PA 1XVYA 1LCFA 2XXHA 3CIJA 4QF9A 2ONKE 2I4BA 1TXFA 3H3GA 2ZNSA 2ONSA 2H98A 3ODBA 5TPAA 4ZDMA 3SEWA 2NWJA 2YJPA 2DWIA 3FD3A 3F11A 3FUZA 1SI1A 4F1UA 2PT2A 3IOVA 4POXA 4F3BA 4HS7A 5H8HA 3RNNA 2P1SA 1FQBA 5BWJA 3VVDA 4RK2A 3RT6B 3LSXA 1QKBA 2RCAA 5L9MA 1YCJA 4K3FA 2CZLA 1DOTA 1US5A 1BIYA 1B7UA 5L8DA 5FTIA 5CRYA 3H7MA 1I69A 3I6VA 4R74A 2XHDA 5FHMA 3IB2A 1LBBA 3TELA 3O2AA 5B70A 3PMVA 4PETA 1XHYA 4ZE9A 4GVOA 1JEVA 4GFRA 1B51A 1IXCA 1DMBA 1H3DA 3TYHA 2F7CA 4EXKA 4FE8A 4R72A 2DQVA 1SW4A 5H8SA 4ESXA 1PC3A 4R6HA 3RGYA 1QKAA 1D9YA 4OYVA 1A99A 4DDDA 2OZZA 1UIVA 2F7AA 1IUDA 4OWDA 1I6QA 1Y4CA 1M5DA 4I9DA 4C1UA 4NE4A 3FJGA 3RT8A 1Y1MA 5I58A 1PEBA 1SDXA 1BTJA 3CR9A 1LFHA 2XXUA 4JWOA 2QL3A 3VLUA 2QJEA 2UVIA 4ZEIA 4JXIA 4R6YA 3U1OA 4X9TA 1LFGA 4EUOA 3VE1B 2V3TA 5F1QA 4YKPA 4Q30B 1DTZA 3OO6A 3H6TA 2F8DA 1DPEA 1PB9A 1JQFA 4I62A 1MM7A 2XXYA 4F18A 1S9TA 2ZNTA 3A3CA 3TMGA 1FTJA 4QSEA 1B05A 1LCTA 2I48A 5AA2A 4FATA 1P1NA 5H8FA 2O69A 4JSOA 5A5XB 4JWXA 1JW1A 4EQBA 3S9LC 3K2DA 5I56B 1N76A 4WKMA 3B6QA 1UIUA 1N84A 3Q29A 4GL0A 1P1UA 3EHUA 4F31B 3C32A 4PP0A 4PFWA 3KN8A 1IIWA 1MQIA 3THIA 3OO7A 2OK2A 3B7DA 3T9HB 3A3UA 3WAFA 4GIZA 3D4CA 1UTBA 1GGGA 3GXAA 1SW1A 4NF6B 1ZLQA 1LAFE 1S50A 3T93B 2GRVA 4NWDA 5K2YA 3SEVA 4YKJA 3S4UA 1QJMA 1B3HA 1P1OA 3TZAA 2REGA 2G29A 1ZU0A 1GV8A 3VLWA 3MZBA 1O7TA 2A5SA 1FCKA 3MPLA 4JB7A 1SVXB 5F7VA 3MUQA 4YKIA 3K00A 2GHBA 5HM4B 1FQCA 2O7IA 5I2KB 1I6AA 3MP1A 1M5EA 2ABHA 1A7LA 2PT1A 4F29A 4F1YA 4ELRA 1P1WA 1PB8A 1EH3A 1USYE 4UA8A 3TKDA 4NF5B 5ICQA 3O6IA 2KLFA 2OWTA 4F2QA 3FZVA 1FQDA 3UGWA 4I8CA 4ND9A 1GVCA 4OESA 2DVCA 4E0WA 3Q25A 4Z0IA 5DVIA 1EZPA 2F35A 2HAUA 2WKYA 4IY5A 3O66A 1ATGA 1XS5A 1NH8A 1FTOA 3FJ7A 3B6TA 4NF8A 4GWOA 2QPQA 1MY3A 1MG1A 4P11A 3IJXB 3RPWA 3WAEA 2RINA 4BDQA 3TCFA 1DSNA 3B6WA 1US4A 2ZXTA 1OQHA 2XXTA 2DWAA 5CMKA 1N7WA 1VE4A 4OFLA 4N6PA 3SEXA 1P99A 1SYIA 4FIMA 4XKQA 2VD3A 1B9JA 1J1NA 4RPOA 3OD7A 2PMSA 3VXBA 4IO7A 4LZ8A 4X48A 3TTKA 3ONMA 2O1MA 3Q28A 5H8NB 1LGBC 2VOZA 3U72A 1UTHB 4FJPA 2XXWA 2QS1A 1IXGA 4Q8RA 2RCBA 1N0TA 2O51A 2DWHA 1B1HA 1VFEA 2X26A 3CRBA 2DP8A 2A5TB 4LUBA 3T9UA 1R1NA 3U8QA 3LC8A 4U1OA 2F6GA 4F39A 3R26A 5DTBA 5LOMA 3KSJA 4BDLA 1M5FA 4G2ZA 1MY1A 4YZZA 4ELPA 1ZMGA 1ZJLA 2ANJA 1WDNA 3SKPA 3DP4A 1Y20A 2HAVA 1H45A 1AH5A 3FASA 4EF2A 4F19A 1MQDA 3SEUA 1B5IA 2I3WA 4ONYA 1MY0A 5FHNA 1SBPA 3GLBA 1QVSA 1OVBA 3OSRA 1RKMA 3JYRA 1B52A 3CFXA 2O84X 4G77A 3IX1A 5DT6A 1QULA 1PB7A 3KZGA 4AB6A 3MC2A 3H06B 4C0RA 3IR1A 1FTLA 1N3XA 1ZTYA 2RC7A 1ANFA 2XX7A 4F2OA 1FQEA 1QUIA 3VVFA 4LATA 4OVJA 4EQ9A 4KR5A 1LLSA 4OQOA 2ESNA 4DXBA 2B65A 1JVXA 3FJMA 3HV1A 4QFLA 3VV5A 4ZEKA 5TPAB 4KQPA 3PPNA 2QS4A 4HW8A 3ILTB 5TU0A 1A54A 1B5HA 1URGA 3IJOB 1B32A 5CBSA 5H8HB 3MWBA 4U21A 2O1LA 5AA3A 2ZYKA 1MXWA 4GXAA 3KG2A 2F7BA 4KHZE 4YICA 2V3UA 2DWJA 4LP2B 4LZ7A 4WEPA 1NNFA 2V84A 3CG3A 3SETA 1Y4TA 4RXLA 4IO4A 4F3SA 4P0IA 2GH9A 3LR1A 1CE2A 5CMMA 1EU8A 1MRPA 1HSJA 3K01A 2E0SA 3K1PA 1MPDA 2W7YA 2D5WA 3TFLA 4MF3A 3C4MA 2V3QA 3IO6A 4H8JA 3DELB 1B46A 4GQOA 3PU5A 2OCUA 2B3FA 1B58A 1POY1 3FV2A 1B3LA 1OIBA 2Z8DA 1YAEA 3G3KA 3PD9A 2BJJX 1SI0A 1FQAA 3FGSA 3CSBA 1MQGA 3I5OA 4KCDA 4LZ5A 5KDTA 3TODA 3PUXE 3FATA 5M2VA 3E13X 3ZKKA 3MP8A 3ZSFA 4IO6A 4POWA 3FVNA 4AB5A 2XXVA 3K6XA 5CMBA 1A40A 4MLQA 5I58B 1Z7ME 2THIA 3MAMA 1B7HA 2PX1A 3BBRA 4QFPA 3VXCA 2P0SA 2RKMA 3IOTA 3FXRA 2I6EA 2D3IA 4NMYA 2F97A 1JEUA 2OWSA 1POTA 3QYTA 4HCWA 3V83A 4XTCQ 1MXVA 4NEDA 3RLFE 1LAGE 1USYH 1SW5A 4EQ7A 4F1VA 3PV0E 2VGQA 4WEDA 4KCCA 3HHFA 3CVGA 4TLLB 5IAIA 2P2AA 4BDMA 4ZS9A 3H6VA 4QHQA 5TP9B 2AIXA 1T0KA 5TP9A 5AA2B 5J1DA 5L9OA 4X1BA 3U92A 5H8FB 3KJTA 4RNSA 1XC1A 1TFAA 4BDRA 1B0HA 4XKNA 3VLVA 3OEMA 3O28A 3HCQA 5ITOA 3PMXA 1ELJA 4KD5A 3VFJA 3DLNA 3TAJA 1IEJA 2IEEA 5I59A 5KCJA 4YAHX 1DPPA 1MXUA 1MXZA 2OBGA 1LFIA 4LVQA 5ISUA 4DLDA 4GF8A 4EF1A 4ISUA 3Q26A 1FQFA 3JZJA 3MJNA 1UTBB 3UORA 1TT1A 2XD3A 4DE8A 1MPCA 5HPQA 3K6VA 4C1TA 4MBPA 1ZKBA 1IZ1A 2Q2CA 2HCAA 4U22A 2I4CA 1II5A 4QSDA 1Y1ZA 4KPTA 4PFTA 3VVEA 2HXWA 4GD5A 4DXCA 4XIGQ 4OZ9A 4TOZA 4BLAA 2R9JA 3GZGA 2Z8EA 1R6ZA 4ZZEA 3LUYA 4O3AA 2XX9A 1NNPA 2H5YA 2F5XA 2DVZA 1SQYA 4GL8A 1B6HA 4H5FA 3T66A 1BLFA 3VDFA 5DVFA 3KOTA 4IGTA 2XXRA 2I3VA 3RQTA 4N13A 2DXRA 2OLBA 3HPIA 1H44A 2D21A 3S9NC 3CI8A 2Y7KA 3MQ9A 4H1XA 3O29A 2XXQA 3M3LA 4YB7A 4NF4A 5CC2A 3C36A 2PVUA 2X7PA 1MS7A 4FECA 4U4SA 1QUKA 2I58A 5EHMA 4OERA 1B40A 3N6TA 3MVYA 5H8QA 4RJZA 4U23A 4FEDA 3DP6A 2AL4A 1A8EA 3BFTA 3KJ7A 2IA4A 4OFJA 1LAXA 1Y9UA 4NF8B 5JEIA 3H6WA 3ECRA 1LB9A 1MXYA 1BKAA 1LAHE 4IO3A 1JW4A 3PUZE 4RYAA 4R9FA 2VP1A 1IXIA 3IORA 5CM6A 2I0CA 3W9VA 3CSGA 3TQWA 2Y7IA 3EN3A 1PBQA 4OEUA 5L9SA 3MPKA 1EZOA 4FEBA 4EXLA 2AYSA 3G7WA 2O68A 5AA2D 3PPPA 5CBRA 1SD3A 3C35A 4RA1A 3IO4A 3IB1A 1D9VA 2HQ0A 1NL5A 4ZECA 3GBBA 5DEXA 4RK9A 3PUVE 3OOAA 3RUMA 1R9QA 3IL1B 4Z7EA 1AMFA 4QRZA 4H5GA 3ILUB 3FIRA 5CMCA 4R2BA 3CG1A 2XXIA 1A8FA 1VR5A 5I2NA 2Q8JA 4RY1A 3S9MC 4DCXA 4U2RA 3M8UA 4LONB 4ESWA 3BFUA 1HSLA 2HZLA 3V89B 4R75A 3USDA 3FVKA 3MP6A 1Q35A 4OMBA 4AQ4A 5ELVA 4YB6A 1VSOA 2Y7WA 3HO7A 2V93A 2F6PA 2QMWA 2UVJA 1TFDA 4NWCA 4TLMB 3UIFA 2QMXA 1IQ7A 2DE4A 3HSTA 3IOWA 2GFEA 1Y3QA 3OMBA 4THIA 3L6GA 3MVXA 5AA4A 1Y3PA 3P7IA 1MPBA 2M8CA 4QSCA 2HEUA 3LSWA 3O6HA 1HSEA 3ZKLA 4OENA 1MH4A 2NOOA 5B7DA 4FORA 1DTGA 1AL3A 1AIVA 2ZNUA 3T9XB 4PE5B 2UVGA 5JTYA 2R71A 1YTVA 1B4HA 2FNCA 2Q88A 5EYFA 4YB5A 4XXUA 3G3GA 1F9BA 5KZTA 3AXFA 4G68A 1IXHA 3R7XA 3C31A 2I49A 5CI5A 2FYIA 1L5TA 1B3EA 3GBAA 2LAOA 5I57A 3EPEA 1PDAA 3O6GA 4I1DA 1H76A 3U94A 4Q0CA 1OQGA 3MVZA 2CMOA 1OVTA 3KOSA 3RTFB 3OEKA 1B3GA 2I0BA 3OSQA 3IB0A 1FTMA 4R9GA 3G3HA 1MH3A 2RC9A 1AOVA 4F3GA 3T22A 4ELQA 3IK6B 4QFOA 2XD2A 1ZIUA 3KGCA 4GRKA 4ZEBA 3G3FA 1JNFA 4YMAA 3QK6A 4FAJA 1H43A 3RTWB 1CB6A 3CFZA 4DIGA 4L17A 4ZEDA 3KN3A 3UA8A 3FVOA 1NNTA 3IAZA 3K6UA 3A09A 3KEIA 1B1XA 2QS2A 1XVXA 1MXXA 3LSFB 1ZBMA 3QSLA 4YU0A 4ZEFA 3D4GA 3BKIB 3KN7A 3PPQA 2UYFA 3FV1A 4IY6A 4OFOA 5AA1A 3KSXA 2NXOA 2Z23A 1SYHA 4BDNA 5KDTB 2H4IA 2YPNA 3E3KA 4H0WA 3JV9A 4M1VA 3R6UA 5DYHA 2Z22A 3K02A 4XKRA 2DE3A 3CFLA 1B4ZA 3TQLA 3M3KA 2ZYNA 3PPOA 1WVJA 3H6UA 3EHSA 4NTLA 5ICTA 2B3BA 3L6HA 1TWYA 2UYEA 1RYOA 3DP8A 4H6DA 3UN6A 1Z7NE 3FXQA 3TPAA 3V5AA 4PFYA 3RY3A 1M5BA 4R2FA 2Y84A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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