4G8MA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the agonist cbg-iv at 2.05a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Pharmacological and structural characterization of conformationally restricted (S)-glutamate analogues at ionotropic glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8mA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8mA02
4MF3A 4R75A 5CMKA 3TELA 4KHZE 1P99A 2V3UA 4Z7EA 5ITPA 4FEDA 4BDQA 4R6YA 3M3KA 4X1BA 1KWHA 1BIYA 1H76A 2W7YA 4ZZAA 3TYHA 3B6TA 5L9SA 1B7HA 4RK9A 3VV5A 3JV9A 3UK4A 3KJ7A 2NVUB 3PUVE 2D21A 3O2AA 1R9LA 3H03A 1P1UA 1SBPA 2UVGA 4H0WA 3A3CA 2DQVA 2OZZA 2HEUA 3CSBA 1EZOA 3O6GA 3MVYA 4G77A 3SEVA 1UIUA 2QSXA 4N13A 3IB2A 4FORA 4YB5A 5JK4A 1HSEA 1AOVA 2NWJA 3UN6A 4I8CA 4F2QA 4OERA 1XS5A 4XIGQ 3OO8A 2BJJX 5DT6A 3U93A 1URDA 4DXCA 1BTJA 1RKMA 2Q88A 4IO5A 4OYVA 3G3FA 1H43A 3TTRA 4YICA 4U21A 4YMBA 3IOTA 4E0WA 1IUDA 3SETA 1B3EA 4R72A 3I3VA 3MPLA 1PDAA 3EQ1A 1B52A 3Q27A 3MC2A 2B3BA 1GGGA 1FTKA 3TPAA 4ZEIA 2REGA 1OVBA 2VP1A 3MVZA 3HHGA 4XXUA 1YTVA 5CMMA 4POWA 1SW4A 3OO9A 1ANFA 2QMWA 2F34A 2GH9A 3W9WA 2FYIA 2REJA 1LLSA 1QUIA 4GD5A 3MUQA 1XHYA 4ZZEA 2O69A 5M2VA 4LUBA 1FQCA 4XKNA 1MXXA 1SI0A 2DWJA 3IJXB 4BDMA 4G2ZA 1PBPA 1LCFA 3PMVA 4ZDMA 5A5XA 1MH4A 2P2AA 1VE4A 3S9EA 4ZEKA 4F3PA 3TQLA 4FECA 3VE1B 4WEDA 1MQHA 4GL8A 2F7AA 3FUZA 4R9GA 4GLIA 1MRPA 3SEXA 2RC9A 4MFIA 5CC2A 1PC3A 3H6UA 2RF1A 2H99A 2H5YA 3SEUA 2X26A 1JEVA 4NF4B 2DS9A 4G4PA 2ONKE 4FE8A 3E3KA 4PFYA 4HCWA 3BFUA 1D3KA 1AH5A 3S2VA 2ZYOA 3PPNA 2DVCA 1UIVA 4ELOA 1OMPA 5I2NA 4TQUQ 3WAFA 3M3FA 4H67A 4G8HA 1Y1MA 1Z7NE 4NTLA 3U72A 5KDTA 1N3WA 1NH7A 2ZYNA 4ISUA 2A5TA 1B7UA 5I84A 3QSLA 3ODBA 3UORA 4G8NA 4PFUA 3ZKLA 1N7XA 4C1UA 3O97A 2O7IA 4R2BA 4ZEDA 3RT8A 5KCJA 3KGCA 4GWOA 1N84A 4JSOA 4RY1A 1IIWA 2LAOA 4G68C 4H5FA 5A5XB 3TCHA 4ECFA 3P7IA 2VHAA 4ELRA 3TKDA 3K01A 3RTWB 3TODA 4KYSA 4OWDA 1NFTA 5CBRA 4ESWA 3PPQA 1S9TA 1LBBA 3U1OA 3MW0A 3OO7A 3RNNA 4ZEBA 5AA2A 2B3FA 1JEUA 1M5FA 4H1XA 2PYYA 3MAMA 2HAUA 1IEJA 4U4XA 2UVJA 5JTYA 2F6PA 3MZ9A 1JW5A 2YLNA 1A7LA 1B3GA 4XKPA 4Q30B 3S4UA 3OSRA 3U92A 4OEVA 2I49A 3ONMA 3TCGA 2F7CA 3MBPA 5H8QA 4NMYA 2P1SA 4QFKA 2ZMBA 4GFRA 3K00A 5I2NB 4BDOA 3VXBA 3D4CA 4ZE8A 1YPNA 4GXSB 5KDTB 4ND9A 3UA8A 3CG3A 2A5TB 1T0KA 2XXPA 4P0GA 5DVJA 2I58A 4G68A 5KCJB 2Z23A 4TOZA 1R6ZA 4EXKA 2DWIA 1N7WA 3C33A 2Q89A 2DWAA 3K6VA 3I6VA 5ICTA 3T9UA 5I56A 1VSOA 3FXUA 1Y4CA 4RJZA 3UIFA 5HPQA 4QRZA 3V8XB 4R2FA 4F31B 2XXTA 1O63A 4KYDA 1B46A 2OK2A 3N5LA 1NNFA 4QSEA 1I6QA 5AA2B 4MLVA 3MVWA 4C0RA 1MY1A 4LVQA 5JTYB 1B2HA 4Q8RA 4NF5A 4ESXA 1WVJA 3QXMA 1FQAA 1B3HA 4UA8A 1OLCA 2DP8A 2QMXA 4JWXA 3HSTA 3RQTA 5B70A 3N26A 2Y7WA 3RN8A 4G8MA 3L6HA 4Q5TA 1SVXB 3LBSA 3RPWA 2Z8EA 1Y3PA 5H8QB 2HFBA 4ZECA 3VLWA 4QF9A 2O68A 4BDNA 1QULA 1IZ1A 1RYXA 3H3GA 5H8NA 4PE5B 3S9MC 1ZIUA 5TP9A 2XX8A 1PBQA 3FV2A 4YMAA 1M5DA 2KLFA 2F6GA 2FA7A 4EUOA 5I58A 4I1DA 1MM7A 4G68B 1H44A 3TTKA 3TDJA 4QFPA 3USDA 3OEKA 1TFAA 1US5A 2Z8FA 4HTGA 1EH3A 3ECRA 5DEXA 1QKAA 5I56B 3C34A 2O84X 3PV0E 3PU5A 3VVFA 4KYEA 1A8EA 2VGQA 4H8JA 4FATA 4LQ2A 4GL0A 3T9HB 4NE4A 2V84A 3RGYA 1R9QA 1A54A 1A40A 3CVGA 4KPTA 5I57A 1S50A 5CMBA 4DCXA 1MDQA 4DE8A 4ZS9A 4NF5B 2CZLA 1LAHE 2OJTA 4PETA 1MXYA 4X9TA 1B5IA 3WAEA 2V3QA 3K1MA 1RYOA 3S9NC 3MP8A 4U2RA 4OVJA 5HBCA 5ELVA 3SERA 3K4UA 4IO4A 5IAIA 4EF2A 2RCBA 3QK6A 2Z22A 3TTLA 1MXVA 4NWDA 3K1NA 2XXYA 5H8NB 1XVYA 1I69A 1GVCA 4IGTA 2AL4A 4EQBA 1FQFA 1B0HA 1GR2A 3AXFA 5TP9B 1NMUA 1SYHA 4QHQA 4U1ZA 2YPNA 2ONSA 4Z0IA 1NH8A 5I58B 5TPAA 2F97A 3PPOA 5EHMA 1GV8A 4DXBA 3QYTA 1QVSA 4X48A 4NF6A 3PGFA 3B6QA 4M4GA 2PX1A 5CI5A 2QS2A 3IAZA 4OFOA 4TLLB 2UYFA 5DEXB 4BLAA 3O6IA 3MVXA 2UXAA 1UTBA 3Q25A 1B4ZA 2XHDA 1LGBC 1MY2A 1Q35A 2ZYKA 3T9XB 1MS7A 5FHNA 5H8HA 3TCFA 2V93A 5I57B 2OWSA 1US4A 1N76A 3KOSA 3O9PA 3T93B 4OXVA 2ONRA 3C31A 1FQBA 1H45A 1JVXA 4KR5A 4F3SA 2QPQA 1B3LA 3OO6A 4H8IA 3JYRA 3QAXA 1A99A 2Q2AA 4U4SA 4FIMA 1B5JA 1EZPA 1L5TA 3PPRA 3VXCA 1DSNA 1LFHA 3OD7A 1QW0A 5HM4B 2H98A 1LBCA 4DLDA 1OLAA 2YJPA 1SW2A 3E4RA 2QJEA 4OESA 4F29A 3ILTB 4RNSA 3ZSFA 4H6DA 4KFQA 1CB6A 1D9VA 2HZKA 2RINA 5DTBA 5TPAB 4LZ8A 3H7MA 3FVNA 1LSTA 2ZYMA 2VD2A 4QSDA 4NF6B 5FHMA 2NOOA 5F1QA 3SKPA 2AIXA 3N6TA 1IQ7A 1XC1A 1J1NA 4C1TA 1VFEA 3U8QA 3EN3A 4AQ4A 1MQDA 1ZMGA 2NXOA 1UTBB 3SEYA 2I6EA 3DP8A 3RLFE 5J1DA 4FEBA 1SDXA 2OLBA 3FV1A 1BKAA 4RPNA 4X1DA 4LONB 3K0VA 3KSXA 1EZ9A 3MZ1A 5H8HB 2WKYA 3PUWE 4JBZA 1PB8A 1NNPA 2ABHA 1YAEA 5L8DA 4F3GA 1N04A 1B7ZA 3IB0A 3HO7A 3RUMA 1PB7A 1Y1ZA 3KG2A 3EF7A 3TEPA 1YCJA 4TLMB 3T9VA 3KBRA 4RYAA 2E1SA 1QUJA 3S9LC 1Y20A 2PMSA 2RCAA 3H4ZA 3CFXA 3CIJA 5FTIA 1XVXA 4YKJA 3R26A 5DVFA 2DE2A 2HAVA 3BFTA 4YKPA 1B1HA 4FAJA 2OBGA 4IB2A 4XKRA 3SESA 2HQ0A 2PT1A 3IORA 4F39A 1IXCA 3MJNA 4OFJA 1D9YA 3K6UA 5CRYA 3K1PA 1MQGA 4IO6A 1P1WA 4KI0E 1MM6A 2O7UA 3TTNA 1FTJA 4U23A 3G3KA 3K6XA 3LUYA 3OMBA 3VVDA 3EHUA 2GHAA 1P1NA 4R74A 1ZJLA 3VVEA 3V83A 2UYEA 4R6KA 2Z8DA 2Y7KA 4OENA 3VLVA 4F18A 1AL3A 3O29A 2DE3A 3LSWA 1QUKA 2UVIA 3K02A 4IO7A 4OTEA 3LSLA 3KEIA 2PBWA 2XXRA 3OELA 2Y7RA 4ZE9A 5DVIA 1B4HA 4Q0CA 4GF8A 3OSQA 4RXLA 1A55A 1I6AA 1B40A 1TT1A 1D4NA 3FVKA 4IGRA 4YKIA 4L17A 1MPCA 1NNKA 1ATGA 2DYXA 3A09A 2Y7IA 3FJMA 2X7PA 1LFGA 3DM0A 2XXWA 4YB6A 3KN7A 2Q2CA 5AA3A 3FXRA 1ZLQA 2HZLA 3IX1A 4QFNA 2XXVA 3GBAA 3FATA 3E13X 1TXFA 1DTZA 1SI1A 3PD9A 3U94A 1UTHA 1I6BA 5EHSA 1MPDA 4OETA 2A5SA 3IOWA 1QKBA 1ZKBA 2HCAA 1TWYA 3TAJA 2AYSA 4O3AA 1MXWA 2F8DA 4DIGA 1USYE 3HN0A 4LQ5A 3B7DA 2NUVA 1JVYA 1URGA 3K6WA 4I62A 2OCUA 5TU0A 2P0SA 2F36A 1OQGA 2DSFA 3KFMA 3D4GA 4P11A 2UVHA 4QSCA 1AIVA 3HPIA 5ITOA 4F3BA 1LAXA 4YU0A 2Y7PA 1FTOA 2ZNTA 1MY4A 5K2YA 3BKIB 4ZEFA 2D3IA 3W9VA 2M8CA 4H5GA 1DTGA 2XXIA 1B9JA 4I9DA 4BDLA 1SW5A 2HXWA 4E0XA 4F22A 2GFEA 2G29A 2Q9TA 1MH3A 1H3DA 4PQJA 1B5HA 1AMFA 3CSGA 4FJPA 2F78A 5I2KA 4JSDA 2H25A 1BP5A 4EQ7A 3Q28A 3C32A 1FTMA 3IR1A 3IO6A 1JW4A 1OVTA 4NF8A 1LB9A 3CR9A 1R1NA 3V5AA 1Y9UA 4OZ9A 1IXHA 2QS1A 1B1XA 1LAFE 4R6HA 3OEMA 1UTHB 2RC7A 2XD2A 3GZGA 3Q26A 4MLQA 3DLNA 4HCYA 4QFOA 3FIRA 3LSFB 5I59A 1MXZA 2H4IA 3H6VA 3OENA 4JWOA 1POY1 2Y84A 3E9XA 1JETA 3W15C 5BUUA 4KCDA 1JQFA 4U1OA 1OQHA 2RKMA 4LP2B 2XXHA 3TUSA 5IKBA 3PD8A 2DXYA 4NF4A 2IEEA 3KJTA 3IB1A 1PB9A 1GTKA 3HCQA 1MG1A 4F19A 3G3JA 3OXNA 1ZU0A 1LCTA 3KN3A 2F7BA 4DCYA 3IO4A 1NKXA 3V89B 3SEWA 4F1VA 3T96B 5BWJA 4THIA 1HSJA 5FTHA 3TFLA 5K2XA 2QS3A 1DPPA 4QFLA 4GVOA 1CE2A 3RTFB 5L9MA 1MXUA 2ZNSA 4U22A 1JNFA 4OQOA 5DYHA 2CMOA 4ONYA 3I5OA 5JEIA 1LAGE 4GXAA 3LC8A 5I2KB 1M5EA 3GXAA 3MPKA 1LB8A 1SD3A 4NF8B 2VD3A 1QJMA 3PMXA 3GLBA 3G3GA 5AA4A 4RPOA 4IY6A 3VFJA 4LZ5A 3PPPA 1B0LA 3TQWA 1XT8A 2DOJA 3C4MA 1VR5A 4R73A 3IOUA 5ISUA 2DE4A 3T66A 3CRBA 2IA4A 3SDFA 3M3LA 3R7XA 5I59B 5ICQA 1XOCA 3MWBA 3R6UA 2ALUA 2O1MA 4UACA 1VFDA 4ELQA 1USYH 2AL5A 2XXUA 1MY3A 3PUYE 3DP4A 3FJGA 4PP0A 1LFIA 3PUXE 1EU8A 4KQPA 4JDFA 4NEDA 3FD3A 4IO2A 3C36A 2XX7A 3G3HA 4GRKA 3N6UA 3RY3A 3TTMA 3UGWA 2RC8A 2ZNUA 3EHTA 1S7YA 3PUZE 4OHNA 1MPBA 2O6AA 3M8UA 4N6PA 2DXRA 2F35A 3ZKKA 3C9HA 3CFLA 1NL5A 4DDDA 3ILUB 1O7TA 2VOZA 4O3CA 3Q29A 3IJOB 4K3FA 4R9FA 3MP1A 2I0CA 1DMBA 3T22A 1UQWA 4M1VA 2QS4A 4JB7A 4HS7A 1IXGA 3VDFA 3PMWA 1B51A 5LOMA 3HV1A 4JWYA 2I4BA 4OFLA 2E0SA 3H06B 1FTLA 5AA4B 4KCCA 3KZGA 4YB7A 3C35A 4DXUA 1MQIA 5CM6A 1F9BA 3N94A 3RT6B 3DP6A 1PEBA 4MBPA 4BDRA 1P1QA 4DZ1A 5H8SA 2O1LA 3A3UA 4XTCQ 4F1UA 3CG1A 5FHOA 4EF1A 3O66A 2I3WA 3UP9A 5F7VA 2QRYA 4YKKA 1FQEA 5H8FA 1B3FA 1FQDA 3JZJA 1N0TA 2H9BA 2V25A 1IITA 3FVOA 3G3IA 4RA1A 4AB5A 3KOTA 3KN8A 2V3TA 3O6HA 1FW0A 2R9JA 4LZ7A 2XXXA 4WKMA 3TMGA 1DOTA 1FCKA 2XD3A 1Q1KA 3HHFA 2F5XA 2FNCA 1B6HA 1Y3NA 3THIA 3QUFA 1BLFA 2OWTA 1M5BA 3G7WA 1B05A 3FXQA 1DPEA 5AE4A 2QL3A 4ELPA 1TFDA 5KZTA 1SW1A 3CI8A 3IOVA 3QUJA 2G93A 4N07A 2D5WA 3FGSA 4YZZA 4GOTA 1B58A 1SQYA 4P0IA 5EYFA 2X7QA 4NWCA 3BBRA 4JXIA 4RK2A 2XXQA 3F11A 3MQ9A 3GBBA 2B65A 1URSA 4O3BA 2R71A 1WDNA 4PFWA 3EPEA 4KD5A 4OMBA 1ZBMA 1POTA 3TZAA 1A8FA 2DVZA 3H6TA 1B32A 2ZXTA 1P1OA 2XX9A 4WXJA 1MDP1 3FJ7A 5AA2D 2ESNA 2PVUA 4XKQA 5CMCA 4IY5A 4H65A 4WEPA 1MQJA 4F2OA 1Z7ME 3IK6B 3B6WA 5H8FB 2THIA 1O64A 2PT2A 1Y4TA 3LR1A 1II5A 1ELJA 4YAHX 5L9OA 3H6WA 1MY0A 3EHSA 3FASA 1NNTA 3FVGA 2I0BA 2DWHA 4GQOA 3OOAA 4IO3A 2GHBA 2I48A 4EXLA 1M5CA 3IL1B 3CFZA 2Q8JA 4AB6A 4EQ9A 4PFTA 3K2DA 4LATA 5AA1A 3O28A 4GIZA 3MZBA 4LA9A 1HSLA 1N3XA 3MP6A 1JW1A 2O51A 3QIMA 5B7DA 3KSJA 1IXIA 1WODA 4F1YA 2R6GE 3ZS6A 2I4CA 1SYIA 3DELB 2GRVA 1Y3QA 1ZTYA 4MH5A 3LSXA 4OEUA 2ANJA 3L6GA 4HW8A 2I3VA 5CBSA 3FZVA 1OIBA 4POXA 3VLUA 4EDPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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