4G8NA

Crystal structure of the kainate receptor gluk3 ligand-binding domain in complex with the agonist g8m
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
TNRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Pharmacological and structural characterization of conformationally restricted (S)-glutamate analogues at ionotropic glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
molecule tags Membrane protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8nA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8nA02
1H76A 5AE4A 4OWDA 3CR9A 2ABHA 4P11A 3I6VA 3L6HA 1SW2A 1LAGE 4LZ8A 2DE3A 3GXAA 3T96B 1QUIA 4PFTA 1URGA 1B58A 1WVJA 4EQ7A 1MXZA 3VE1B 5KDTA 2O1LA 2Q9TA 2UVGA 3T9UA 1N7XA 4DDDA 3FIRA 4NF8A 2P2AA 3VFJA 4F2QA 3B6WA 3HCQA 4GD5A 4ND9A 3V5AA 4IY6A 3PMVA 1WDNA 4GF8A 4NE4A 1VFDA 5ITOA 2RINA 2I49A 3UORA 2O1MA 2OJTA 1XVYA 4HCYA 4G2ZA 1ZKBA 1LAHE 3PPNA 4RXLA 1UIVA 4Q5TA 4U4XA 1VR5A 3C9HA 4YU0A 3U72A 3FATA 3TODA 4PFUA 1MQJA 1PDAA 1LAFE 1IIWA 4KFQA 4XXUA 2D21A 4LQ5A 4WXJA 2NVUB 4DXUA 3TTNA 3G3GA 3HV1A 2ONSA 4YZZA 4C1UA 1QW0A 1B0HA 2F35A 4ZEDA 3IX1A 1B3LA 3PMXA 2G29A 4U22A 4FJPA 1DSNA 3FV1A 2QSXA 3MPKA 4FECA 3W15C 4O3AA 3FVGA 4F19A 4N07A 1JEVA 4YMBA 1IITA 3KFMA 3KG2A 3KBRA 1NNKA 2O69A 4ZZAA 3CSBA 4U23A 1IXHA 2R71A 4MLQA 2XXRA 3MC2A 2F36A 2RKMA 3MJNA 4OYVA 2V25A 2NWJA 2VD2A 2B3BA 1UTHB 3CFZA 4UA8A 3UP9A 5EHSA 1I6BA 3E13X 2Y7KA 1AMFA 3SKPA 3RUMA 3U93A 4RK2A 4X48A 1P1NA 1QVSA 3N5LA 3A09A 2DP8A 5DVJA 4R72A 4GXSB 4L17A 1R1NA 1GV8A 3O28A 3A3UA 1ZIUA 4ZEFA 3K6UA 2H25A 4F1UA 5KZTA 2DXRA 4QFOA 3CI8A 4R74A 2YJPA 1MQGA 4X1DA 1XC1A 1B5JA 3EHTA 2RC7A 3FXQA 1M5BA 4GIZA 3MVZA 3RLFE 1M5CA 1FQEA 3HSTA 3IJXB 4TOZA 1Z7ME 4EQ9A 3V89B 3PUYE 3JZJA 2ZXTA 4G68A 3K1MA 4ZEKA 3FZVA 4QSEA 4Z7EA 3OXNA 2I3VA 5K2XA 4ECFA 3DP8A 2DYXA 2XXQA 3G7WA 3MP6A 1USYE 1T0KA 3SDFA 3TCHA 4Z0IA 3ZKKA 4FAJA 2P1SA 1PB8A 1A7LA 2ALUA 1A8FA 4LP2B 3VVDA 3MAMA 3TFLA 1B7ZA 3MW0A 4GWOA 1SI0A 1B5HA 2Z22A 4R6KA 3TTLA 1A55A 1MDQA 5FTHA 2ONRA 2RF1A 1MY0A 1MXVA 1N0TA 3CG1A 1I69A 1LLSA 4H5GA 1LGBC 2DS9A 2QS4A 5CBRA 3E3KA 2I58A 1US4A 2QRYA 4MH5A 1JNFA 2D3IA 2PVUA 4JXIA 4NEDA 3PPRA 3FVKA 4QF9A 1B1XA 3KSXA 3IAZA 1OIBA 1A99A 2X26A 2ZYMA 2M8CA 3JYRA 1LFHA 1RKMA 2O51A 3BKIB 4H6DA 1BKAA 2PT1A 2Z23A 3MZ1A 3RTFB 4ONYA 4ISUA 4ELOA 4R9FA 1B52A 3EN3A 4OVJA 1XOCA 1N76A 3R26A 4NF6A 1MQHA 3VLVA 5TP9B 1H3DA 2F78A 5DT6A 3MP1A 1BP5A 4OFOA 5H8HA 1DTZA 3Q28A 4QFNA 5TPAA 2F34A 2UVJA 2I4BA 4ELQA 2Q2AA 3TDJA 3LSXA 2OCUA 1OMPA 3HN0A 4JBZA 3MP8A 2RC9A 3R7XA 4H65A 4KCDA 3VDFA 3FV2A 4DZ1A 4G8NA 1AH5A 4MLVA 2AL4A 4ZEBA 2OWSA 3T93B 3R6UA 1XVXA 1D9VA 4NF4B 3TTKA 1S50A 4MBPA 4OQOA 4FATA 2IEEA 3TELA 4BDOA 3TTRA 1MDP1 1HSLA 4BDRA 4LONB 4ZE9A 4YKKA 1N04A 3IOWA 3KSJA 2FA7A 3C34A 4X1BA 3O2AA 2FNCA 2ZYKA 4LQ2A 4LATA 4JSDA 4RY1A 1FQAA 3RT6B 3LSWA 4OERA 3MPLA 3LSLA 4F18A 1M5FA 1IXIA 1FQCA 4F3GA 3O6GA 4EUOA 3K02A 1EZPA 4H1XA 3Q25A 2HZKA 4IO4A 5B70A 5H8NA 4F3SA 1IQ7A 4G8HA 3S9MC 2DE4A 2OWTA 5I84A 1NH8A 4OENA 4PE5B 3O66A 5AA1A 3ZSFA 4OETA 4G68B 1FTKA 2PYYA 4IO5A 4DXCA 4OFJA 3OSRA 4H8JA 2R6GE 4LVQA 2X7PA 4ZDMA 1FCKA 1B46A 2ZMBA 1SD3A 2VOZA 1ZTYA 4JWXA 4YMAA 3S4UA 1SYHA 3QK6A 4MF3A 2ANJA 1XT8A 3K4UA 2XX9A 3QSLA 2GRVA 1Y20A 4DCXA 3T66A 4PFYA 3KN3A 2F97A 3VLUA 2RCBA 4POXA 2REJA 2AL5A 1OQHA 2G93A 3K00A 4HCWA 1R6ZA 2DWAA 3OEMA 2A5SA 3VXCA 4XKQA 3QXMA 1RYXA 2Z8DA 3IOTA 4FEBA 2XXYA 3S9EA 2V3TA 5ICTA 2XXHA 3FGSA 3U92A 1ZLQA 3W9VA 2DVCA 2DOJA 3T9XB 4ELRA 3SEUA 4EXKA 4M4GA 4RNSA 3PPOA 1A54A 2CZLA 4KCCA 3THIA 3CIJA 4OMBA 5CMCA 3U8QA 3H3GA 4O3CA 5H8FA 4R9GA 1ELJA 3KN7A 3Q29A 3RPWA 5H8HB 1D3KA 3OO9A 4AB5A 5HM4B 2F6PA 4U1OA 3QYTA 5BWJA 1B3HA 5DVFA 3CG3A 4POWA 2F5XA 2OZZA 1GGGA 3G3KA 4YB5A 2UVHA 1M5EA 4XIGQ 3QAXA 3H6VA 3BBRA 2O84X 4THIA 4U21A 4EF1A 2Q88A 3M3KA 1MY1A 3K6WA 3MVWA 5AA2A 4RPNA 1Y1ZA 4OZ9A 3HHFA 5EHMA 1Z7NE 2PBWA 1NNTA 4G8MA 3H4ZA 4GLIA 1DPPA 4AB6A 1B6HA 4GL0A 1UTBA 2HAVA 2AYSA 1CE2A 2Y7IA 3PGFA 3TAJA 3PUZE 2P0SA 5I57B 4H5FA 3HPIA 3KEIA 4Q0CA 2XXUA 2LAOA 2HEUA 2W7YA 3LSFB 3K1PA 1ZJLA 3B6QA 3CSGA 1ATGA 3IOVA 3KOTA 3ONMA 1IUDA 4QFLA 3N94A 4PP0A 1EZOA 1FTOA 4NWDA 1P1QA 4QSDA 1P99A 3B7DA 2PX1A 3KJTA 5H8SA 5H8NB 5JTYA 3TCFA 1ZMGA 3AXFA 4F22A 3KJ7A 1B4HA 1URSA 5L9MA 3KZGA 3OD7A 2ZNTA 1PB9A 5CMKA 5B7DA 3C32A 3O29A 4EXLA 3WAFA 1QJMA 1SW5A 4P0GA 4WEDA 1QUJA 4XTCQ 2H99A 4BDQA 1R9QA 3B6TA 1ZBMA 1YAEA 3DP6A 3I5OA 3H6TA 3D4GA 3SERA 3RNNA 1O63A 1UIUA 4KI0E 2REGA 1DMBA 1TT1A 4KHZE 1NNFA 1FTLA 1KWHA 3RN8A 1LB8A 4F3BA 2V84A 1Y3PA 3ILTB 4QSCA 5EYFA 3GZGA 3K6XA 5A5XA 4P0IA 3TQWA 5IAIA 2QS1A 4ZECA 1A40A 1MPCA 4PFWA 3T9VA 2ONKE 1L5TA 5DEXA 1B0LA 4YKPA 5JK4A 1XS5A 4BLAA 4GRKA 5I2KA 4OEVA 3RGYA 2ZYNA 5AA4A 4RYAA 1O64A 3BFUA 1S9TA 1LFIA 3IL1B 1H44A 5I2NA 5KDTB 4LZ5A 1VFEA 1B3EA 3TPAA 3OEKA 2VGQA 4NF8B 3SEWA 3WAEA 3K01A 1SI1A 1GR2A 5ELVA 1B40A 3OO6A 3M3LA 1EH3A 1B51A 1Y4TA 1Q35A 4JWYA 4ZS9A 3E4RA 3H06B 1MY3A 4LZ7A 4I1DA 3SESA 5AA2D 4R75A 3ODBA 2O7IA 4OEUA 4ESWA 3ZS6A 3H6WA 1JEUA 3MZBA 4FORA 1TFDA 4RA1A 4YAHX 5FHNA 4ZE8A 3K0VA 1IXCA 1LCTA 2RCAA 3CVGA 2B3FA 2F8DA 2GHBA 3MVXA 4IGTA 4OTEA 1ZU0A 2ZNUA 3F11A 2Q89A 2H9BA 2THIA 3T22A 3PUVE 4JWOA 4ZEIA 4F39A 3O6IA 4G77A 1MM6A 1JVXA 2I3WA 1B32A 4RPOA 1UTBB 3OMBA 3RQTA 1BLFA 1N3WA 2I0CA 4RJZA 3FJ7A 4KQPA 4GVOA 3PU5A 3MWBA 3C33A 4YB7A 2I6EA 2O7UA 1EZ9A 1JW1A 1Y1MA 3EF7A 4QFKA 4DXBA 2H98A 4MFIA 2OK2A 1B05A 3UK4A 4LUBA 2O68A 3H03A 3C31A 2XXWA 1TFAA 3CFXA 3V83A 5JEIA 2I0BA 3OOAA 4U4SA 1I6AA 4KYSA 1QKAA 2BJJX 3LBSA 2HAUA 3OELA 1JETA 4WEPA 1JVYA 1Y3NA 3H6UA 1FTJA 1LBCA 1NH7A 3QUJA 4GXAA 2Z8EA 3L6GA 3DELB 1IEJA 3IO6A 4FE8A 3IB1A 1Y9UA 3HO7A 1A8EA 4R6HA 2HCAA 3T9HB 1II5A 2XXIA 3MVYA 3K1NA 1OQGA 3G3FA 3ECRA 5HPQA 3P7IA 1Y4CA 1YTVA 4IB2A 3H7MA 3FJGA 2ESNA 4N13A 4U1ZA 4XKPA 5KCJA 4YKIA 1AL3A 4KPTA 1OVBA 1LCFA 1P1UA 2NXOA 4OFLA 5I59A 1QULA 2F7BA 1P1OA 3RY3A 1Q1KA 2XXXA 2QPQA 2XXTA 4BDLA 4EQBA 3PMWA 5I2NB 4GL8A 3U94A 3OO8A 4QRZA 1MH4A 1OVTA 3G3HA 5ISUA 4ZZEA 2V3QA 3PD8A 1IZ1A 5BUUA 4YICA 3IJOB 4XKRA 5CC2A 1HSEA 1LSTA 4UACA 5J1DA 2DWJA 3MBPA 1OLAA 4NWCA 1M5DA 3S2VA 4E0XA 1H43A 1BIYA 3TMGA 3QUFA 5CRYA 3VVEA 1PBPA 2H5YA 2GH9A 1DTGA 4K3FA 4TQUQ 1NFTA 2X7QA 1LB9A 4C0RA 2QS3A 3SEYA 2D5WA 3MZ9A 1SW1A 4N6PA 3TZAA 1VE4A 1POY1 3K6VA 1SDXA 2QS2A 1GVCA 1MQDA 4KR5A 3UN6A 4IGRA 3RT8A 4NMYA 4I62A 2I4CA 4NF6B 4DIGA 3KGCA 3D4CA 1B3GA 1B7HA 4JDFA 4DE8A 1AOVA 4YKJA 2HZLA 1FTMA 5TPAB 3OO7A 5CMBA 2O6AA 2Y7PA 3FVOA 2IA4A 1NKXA 2F7AA 5I58A 1TWYA 4G68C 1XHYA 4OHNA 1FW0A 2F7CA 3GBBA 4IY5A 3EPEA 3IB0A 4OESA 3I3VA 3USDA 5DTBA 1R9LA 1H45A 1YCJA 1B7UA 2A5TA 1B5IA 2V93A 5CI5A 2YPNA 5TP9A 4LA9A 3V8XB 2KLFA 1SQYA 3TKDA 4F1YA 4F29A 1N84A 3UA8A 1N7WA 3S9NC 3S9LC 1NNPA 3TUSA 5M2VA 1I6QA 5F1QA 3OSQA 4RK9A 4GOTA 1MY4A 3N6UA 3N6TA 4I8CA 1UQWA 1FQBA 2PT2A 1SW4A 4IO6A 4NF5A 1SBPA 5DYHA 4NF4A 4F31B 2Q8JA 1MG1A 3TCGA 3IO4A 3IOUA 4IO7A 4XKNA 2QMXA 3DLNA 5H8QA 3GBAA 3FXUA 5ICQA 1MM7A 4YB6A 2F6GA 2OLBA 2VD3A 1LAXA 2UXAA 5F7VA 2Y7WA 2XD3A 5KCJB 1B2HA 3OENA 1J1NA 4R2FA 5IKBA 1FQFA 1MY2A 2XXPA 3TTMA 5I59B 2RC8A 3O9PA 2UYFA 2AIXA 3Q27A 4I9DA 4JSOA 2DWHA 1URDA 5L8DA 4OXVA 2QL3A 4PETA 1PB7A 2XX7A 4WKMA 1EU8A 4FIMA 2GFEA 1B3FA 1TXFA 3PD9A 4GFRA 3O6HA 4C1TA 1SYIA 1WODA 4NTLA 3EQ1A 1IXGA 2QMWA 3DM0A 3FUZA 1Y3QA 4ESXA 2CMOA 2ZNSA 5I56A 5TU0A 4HW8A 3KN8A 3TQLA 1D9YA 4JB7A 3A3CA 3ZKLA 4O3BA 3KOSA 1BTJA 1MXWA 4AQ4A 4QHQA 5AA3A 3LC8A 4E0WA 2Y7RA 3RTWB 1B9JA 3VVFA 4FEDA 4M1VA 3IB2A 3K2DA 4F1VA 2XXVA 1MPBA 5H8FB 4TLLB 2QJEA 4Q30B 2FYIA 4QFPA 5K2YA 2XHDA 3PPQA 4X9TA 3PPPA 1QUKA 1N3XA 5I58B 3FJMA 1MXXA 5L9SA 4H0WA 3ILUB 3VV5A 1AIVA 3M3FA 5FHOA 3CFLA 1PBQA 4BDMA 1DPEA 5AA2B 5L9OA 3MQ9A 1CB6A 2HXWA 1DOTA 2Q2CA 2A5TB 3W9WA 1MPDA 2NOOA 3BFTA 3SEXA 2GHAA 3UGWA 2B65A 2XX8A 3M8UA 2PMSA 1O7TA 1MXUA 1YPNA 1JW4A 3HHGA 2XD2A 1OLCA 2UVIA 4BDNA 5DVIA 3LUYA 4U2RA 2R9JA 1US5A 4ELPA 4R2BA 4PQJA 2H4IA 2HFBA 1MRPA 5JTYB 2DSFA 1SVXB 5FTIA 2E1SA 1D4NA 3FD3A 4F2OA 1B4ZA 4NF5B 3VLWA 1PC3A 1F9BA 2DWIA 1B1HA 5ITPA 5LOMA 4DCYA 3Q26A 4EDPA 1QKBA 3IK6B 1MQIA 1VSOA 5H8QB 3PUXE 5CBSA 1JQFA 2V3UA 4TLMB 3VXBA 3TYHA 3TEPA 1POTA 2WKYA 4R6YA 1HSJA 4IO2A 5HBCA 5I57A 3PV0E 4Q8RA 1JW5A 2YLNA 2Z8FA 2NUVA 3GLBA 1FQDA 3C36A 3MUQA 1ANFA 5CMMA 3LR1A 4EF2A 1GTKA 1NL5A 4DLDA 3U1OA 4F3PA 1UTHA 3IR1A 4KYDA 4R73A 4H67A 3FVNA 4HTGA 3SETA 2UYEA 3O97A 5A5XB 3IORA 3DP4A 5CM6A 4KYEA 3QIMA 2OBGA 2DXYA 3PUWE 3G3IA 3N26A 1USYH 2ZYOA 5DEXB 2HQ0A 4G4PA 1P1WA 5I2KB 4HS7A 5AA4B 3JV9A 3C35A 3C4MA 1MH3A 3E9XA 3FXRA 3UIFA 1LFGA 2DQVA 2I48A 5I56B 2DE2A 2VP1A 1RYOA 3G3JA 4IO3A 2DVZA 4KD5A 2VHAA 2E0SA 5FHMA 4H8IA 1PEBA 3CRBA 3SEVA 4GQOA 3EHUA 2Y84A 1MS7A 3EHSA 1NMUA 1LBBA 1S7YA 3FASA 1MXYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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