4GRKA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with ketorolac at 1.68 a resolution
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with ketorolac at 1.68 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
total genus 113
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-08-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4grkA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4grkA02
1Y20A 3QAXA 3RY3A 1N7XA 1S50A 2Y84A 3KBRA 4JSOA 1M5DA 3QUJA 3VVDA 2XX9A 3KN3A 2RC7A 1GTKA 4OWDA 5BUUA 2I0CA 3B6WA 1TXFA 4G68A 1B05A 1MXZA 4U22A 2Q9TA 2D21A 4QHQA 1XVYA 4G68C 1Y1ZA 2ZYMA 1IXGA 4THIA 3TTKA 3O29A 4LZ8A 4KFQA 1LAGE 1N3WA 4FEBA 5DVIA 3MP6A 3IR1A 4NMYA 1DOTA 5I2NA 4I62A 1OVTA 2FA7A 4QFKA 2DQVA 3MWBA 4KYDA 4GXSB 2HEUA 1ZJLA 1MXYA 4NF6B 2F7BA 2Z8FA 3E3KA 4GVOA 1R1NA 4N13A 3QYTA 1N04A 2O51A 3H6VA 1PB8A 4MF3A 5KDTB 3SEVA 1CB6A 3PUVE 3SETA 4NF8A 3OO9A 3MC2A 5B7DA 1SD3A 2Y7PA 4OFOA 4GL0A 4YKJA 4OTEA 3TFLA 2O6AA 4M1VA 5H8QA 3MVYA 4KD5A 3OD7A 4DZ1A 3TEPA 3HHFA 4LZ7A 3VFJA 2G93A 4U4XA 2F97A 4EQ9A 4H8JA 4F18A 1VR5A 5IKBA 1NNKA 2NWJA 5CC2A 2DXYA 3C35A 2RINA 2RC9A 4QFPA 3FJGA 4ELQA 1P99A 3HCQA 2CZLA 4BDMA 3T22A 1D4NA 2VGQA 4WEPA 1EU8A 4AB6A 3EPEA 1SVXB 1M5BA 3G7WA 5TP9A 3CSGA 3MP8A 3GBBA 4NF4A 5AA4A 4NE4A 4JWOA 1PB7A 1P1UA 4MFIA 3K6UA 1B4HA 1YCJA 4ELPA 4YMAA 1QKBA 2H99A 1MY2A 2F5XA 4FE8A 2THIA 3IB0A 4RK2A 4X9TA 3EHUA 2Z22A 2R9JA 1B5JA 3OOAA 4QFOA 4NEDA 2X7PA 4RPOA 3ILTB 3HO7A 1B4ZA 3PPOA 4EXLA 5H8HA 1RKMA 2DVZA 5AA2B 2PBWA 4PFUA 3GLBA 3USDA 3CR9A 1VE4A 3V8XB 3PUYE 3TMGA 3DLNA 3SEWA 4C0RA 1O7TA 4E0WA 1Q1KA 2A5TA 2YLNA 4FAJA 3S9NC 1BP5A 4H1XA 2DVCA 1US5A 4POXA 1FTKA 3KN7A 2F36A 1FQFA 3G3IA 5CI5A 4RK9A 5AE4A 1Y3PA 4LVQA 4H5FA 2E1SA 4M4GA 2F6GA 1LSTA 4PP0A 4R72A 4MBPA 1IXIA 1NL5A 4RA1A 1MY3A 2ESNA 5KZTA 4F39A 1YPNA 1QJMA 3JYRA 1ZLQA 3PMWA 1MG1A 1US4A 4P0IA 5H8SA 4RPNA 3S9EA 2UVHA 2DS9A 4Z7EA 2UVGA 4HCWA 3H6WA 1MPCA 3TCFA 2X26A 3ZS6A 1TWYA 1WVJA 3EHSA 3RT6B 2O1LA 4H0WA 3FJMA 3OSQA 2XHDA 5DT6A 2Q2AA 4OEUA 2HFBA 4FORA 2ZYKA 2LAOA 5FHNA 5CRYA 2PYYA 1OIBA 4PFYA 3FVGA 2V25A 4HTGA 2QL3A 3HPIA 2BJJX 4I8CA 4P0GA 2G29A 2XXIA 4NF6A 5I84A 4TOZA 3O9PA 3CG3A 4TLLB 4IO4A 2Y7RA 4LZ5A 1B58A 2F78A 1EH3A 3TDJA 2GH9A 4NF8B 3RTWB 4ESXA 3W9WA 5IAIA 1D9YA 5EYFA 2A5SA 3H7MA 4ZS9A 1A7LA 3C31A 2H4IA 2RCAA 4ZZEA 3FATA 5H8QB 1MM7A 4O3BA 1OQGA 5CMMA 4WEDA 3B6TA 2R71A 4F3PA 1B5HA 1LGBC 4QFNA 1SBPA 2IA4A 1AOVA 3FXQA 1B46A 3MUQA 3CRBA 4JDFA 5HPQA 2RCBA 3H06B 4F1UA 4MLVA 3HV1A 3S2VA 1EZOA 3SEXA 1OLCA 3PUXE 5BWJA 4U21A 4ZE8A 1DPPA 1PEBA 1KWHA 1LBCA 3TCGA 1B7UA 5JK4A 2P0SA 3RN8A 3TELA 1TT1A 3T9VA 5AA4B 1BLFA 3PMVA 3FXUA 3U72A 1B6HA 3D4CA 4TQUQ 1MY4A 3PD9A 2O69A 2NVUB 1ELJA 3IB2A 3V83A 2HAUA 3K01A 2XXVA 5ELVA 5CBSA 1A8EA 3VE1B 4XKRA 5K2XA 1HSEA 3M8UA 1BIYA 2PT2A 2FYIA 4PE5B 2DSFA 1EZPA 4ZEBA 3B7DA 1NH7A 3Q26A 3ECRA 4IY6A 5H8HB 1S9TA 5FHOA 5CMCA 2B3FA 4FECA 3MVWA 3TUSA 4OHNA 3RGYA 1RYXA 2A5TB 2X7QA 4G8NA 1P1NA 1MPBA 1VFDA 4OQOA 2PX1A 1AH5A 1ZIUA 2RF1A 1LFHA 2ZNUA 1MDP1 4DIGA 4R9FA 4GD5A 5ICQA 1Y4CA 3W15C 2O7UA 4PETA 2REJA 2AYSA 3TQWA 4EQ7A 3RLFE 4R73A 1MXVA 4R9GA 1AL3A 5JEIA 1S7YA 3S9LC 4F2QA 4IGTA 3T9UA 2B65A 4NF5A 3SEUA 4NWDA 1I6BA 1IXCA 4IY5A 2OZZA 3H3GA 3O28A 1B51A 1GV8A 4AB5A 3M3KA 1Y3NA 1JW4A 1POY1 5TPAA 3N6UA 1B2HA 2FNCA 2GHBA 1I6AA 1P1OA 2NUVA 3N5LA 4X48A 3IORA 2QMXA 3IOTA 3SKPA 2DOJA 3KGCA 4ZE9A 5EHMA 1PBPA 4IO3A 3DM0A 3IJOB 3O6GA 3VDFA 2R6GE 3UIFA 2H25A 3VLWA 3SESA 1B32A 1M5FA 4LP2B 3QSLA 5JTYA 3CVGA 5A5XB 3U92A 3GZGA 3I5OA 2OBGA 3FIRA 3MZ1A 4N6PA 1Y3QA 1LFGA 3ZSFA 1B3FA 2YPNA 1MQIA 2DWAA 5I2KB 3CFXA 3FVKA 2OWSA 1LLSA 3ZKLA 2QPQA 4ECFA 1ZBMA 3MPLA 1T0KA 1XS5A 4H67A 4YB7A 4OVJA 5I57A 2VD2A 3TCHA 1N7WA 4BDRA 3E9XA 2ANJA 3FGSA 2ZYNA 4G8HA 2DP8A 4R2FA 4RXLA 4TLMB 3MZ9A 3V89B 2Y7KA 2DWIA 2DXRA 2B3BA 1P1QA 4DDDA 1JEUA 4OEVA 3FV2A 3T66A 2DE2A 2ABHA 3Q25A 3E4RA 4OERA 3RNNA 4XKNA 4Q0CA 4OFLA 2P2AA 2DYXA 3A09A 3JV9A 3N94A 4EF2A 1POTA 4O3AA 3BKIB 3EHTA 2XXYA 4DXBA 4YMBA 1MQHA 1Z7ME 3QIMA 2Y7IA 1MQGA 3OXNA 2UYEA 4GLIA 2DWHA 3U8QA 3QK6A 1ZMGA 2V3UA 4DLDA 2I0BA 1DMBA 5DTBA 2XD3A 4XXUA 5ITPA 4DE8A 4OFJA 3W9VA 3LR1A 4FATA 2ONRA 3G3GA 4GWOA 1NKXA 3U93A 3DP6A 1MXUA 2WKYA 2F35A 2UVIA 3OO7A 3WAEA 2E0SA 3T9XB 3CIJA 3G3JA 1II5A 2OK2A 3IB1A 1USYH 4KCDA 1H45A 2OCUA 4ZEKA 1LFIA 4L17A 1SDXA 3T9HB 2F7CA 3C9HA 4I1DA 4Q5TA 4JBZA 1MQDA 1PDAA 5I56A 4QSDA 4Q8RA 3LSFB 1FTLA 4NTLA 3G3KA 4R6YA 3I6VA 5DVJA 1VSOA 4OESA 5FTIA 2I4CA 2O7IA 2HZLA 3PV0E 4OMBA 4GL8A 4NF5B 4H5GA 2RC8A 1BKAA 3KFMA 4JXIA 1PC3A 3BFTA 1LAFE 3Q28A 3LC8A 3PPQA 4NWCA 4OETA 5TPAB 4K3FA 4O3CA 1B3GA 3TTMA 4LATA 4G77A 4F1VA 4EF1A 4MLQA 2D5WA 3LUYA 3M3FA 3OEKA 1B7ZA 4H65A 4IO6A 4R74A 1SW4A 1SW1A 1NFTA 3TTRA 3KSJA 3S9MC 1R9QA 3BFUA 2RKMA 1FQEA 3GXAA 5A5XA 4QF9A 3M3LA 5JTYB 3O97A 2I3VA 3B6QA 1MS7A 1YAEA 1L5TA 3RQTA 3IO6A 5L9OA 5AA2D 2ZMBA 1O64A 1TFDA 3FVOA 3BBRA 3THIA 1A55A 3VXBA 5I2KA 3LBSA 3UK4A 2XXHA 3F11A 3MJNA 3C34A 4IO2A 4F2OA 3TPAA 1JQFA 2OJTA 1GVCA 1QW0A 4GQOA 5EHSA 3TODA 1J1NA 4KR5A 1EZ9A 4R75A 1FQAA 4EDPA 2UYFA 1H3DA 1NMUA 3IK6B 5I57B 4BDLA 1YTVA 5L9SA 1N0TA 4F29A 1B0HA 3H4ZA 3P7IA 1MRPA 2Z23A 3OO6A 1IZ1A 3SEYA 1HSLA 1RYOA 4G8MA 5DVFA 4BDOA 1XHYA 1UQWA 1JVYA 4EQBA 3ONMA 4GF8A 4I9DA 5KCJA 1FTJA 2DE3A 2D3IA 2AL5A 4HS7A 3KN8A 1QKAA 2QS1A 2ZNTA 5DEXB 3GBAA 3KOTA 4RY1A 4Q30B 1ATGA 3U1OA 1MM6A 2V3TA 1FQBA 2HAVA 3FASA 2V84A 2REGA 1VFEA 3N6TA 2F7AA 3VXCA 1LB8A 1UTBB 5L9MA 4QSCA 3PMXA 3WAFA 4XKPA 1CE2A 3R26A 4ZDMA 3FXRA 3EN3A 3Q29A 1QUKA 1Y9UA 3PU5A 1FQDA 1LAXA 1URDA 2M8CA 1MY1A 4F22A 3QXMA 3KJTA 3TZAA 1PB9A 1OLAA 2F6PA 1TFAA 4YZZA 3VV5A 2XXWA 1H43A 3OELA 4ND9A 2O68A 1DTGA 1B40A 2H98A 4OXVA 3CI8A 1SYHA 1B0LA 1OQHA 1SYIA 3CSBA 4IO5A 5I56B 4PQJA 4FIMA 3KSXA 1NNTA 3O6HA 2KLFA 1N76A 1JVXA 2Q2CA 4RNSA 4ZEIA 4G2ZA 5F1QA 3MW0A 2QS3A 1Y1MA 3TKDA 3DELB 5H8FB 3K6XA 5M2VA 5CMBA 4ESWA 1AIVA 1FTMA 2QS4A 2Z8EA 1JW1A 2XXUA 2W7YA 2AIXA 1DSNA 4F3BA 3SERA 4JB7A 1NH8A 2QRYA 3C33A 3MBPA 1IEJA 2HCAA 3MVXA 4U1ZA 3E13X 2Z8DA 3CFZA 3K6WA 1GGGA 1NNPA 2GRVA 3FVNA 2Q88A 1D9VA 3H03A 4KYSA 4F19A 4GFRA 5F7VA 3UP9A 3ZKKA 4BDNA 3PUZE 3TQLA 2DE4A 4RYAA 3R7XA 3IJXB 3K2DA 1B3HA 4R6KA 5L8DA 1FQCA 4UA8A 3DP8A 4JSDA 3JZJA 4KCCA 1QULA 3K4UA 3H6TA 2GHAA 3C4MA 3T93B 1ZTYA 4WXJA 3PGFA 2OLBA 3K6VA 3UGWA 2PMSA 3FD3A 1FCKA 4KPTA 3CG1A 4QSEA 2I4BA 5LOMA 3TYHA 3G3FA 2ZXTA 3RTFB 1N84A 2Y7WA 3MVZA 4X1BA 3K1NA 3L6GA 2NOOA 4PFWA 1NNFA 2IEEA 1B7HA 2UXAA 3HN0A 1OMPA 3MP1A 4GIZA 1MH3A 2Q8JA 4ELRA 2QMWA 1O63A 5H8NB 1QUIA 3MZBA 3RPWA 4EXKA 4XTCQ 5CMKA 4R2BA 3C36A 5KCJB 2XD2A 2VHAA 3TTLA 4PFTA 2OWTA 1MDQA 1SW5A 4LQ5A 5DEXA 4ONYA 4H8IA 3A3UA 2I6EA 2XXQA 1B3EA 2QS2A 4DCXA 4DXUA 4F31B 1UTBA 3IOUA 3C32A 2HZKA 4ZEFA 4KQPA 1DTZA 3IL1B 4Z0IA 5AA1A 2HXWA 2CMOA 3FZVA 5B70A 4WKMA 4LQ2A 1WDNA 2GFEA 3D4GA 4P11A 1LAHE 4BDQA 1B9JA 4RJZA 2NXOA 3KJ7A 3PUWE 1I69A 3KEIA 5FTHA 4KI0E 5I58B 4FJPA 3UORA 4BLAA 4F1YA 4E0XA 4ELOA 1FTOA 3K1MA 1UTHA 1Q35A 3PPPA 3LSLA 1B3LA 4GOTA 3AXFA 2UVJA 3OEMA 1ZU0A 3VVEA 3MPKA 3I3VA 3KZGA 3EF7A 1ANFA 3KG2A 1Z7NE 3MAMA 1IUDA 3PPRA 4F3GA 4MH5A 3H6UA 5I59A 1MH4A 1XOCA 1A99A 1OVBA 1SI0A 3IOVA 1IXHA 4QFLA 5H8FA 3FUZA 1FW0A 5DYHA 1LB9A 3MQ9A 3OO8A 1JEVA 3VLUA 1LCTA 4U4SA 3TAJA 5ISUA 5ITOA 4HW8A 3A3CA 4POWA 2XXXA 3UN6A 3IO4A 4AQ4A 1MXXA 1R6ZA 3G3HA 3QUFA 2PT1A 3ODBA 1MY0A 3K1PA 4IB2A 2PVUA 2O84X 4JWXA 1MQJA 2O1MA 3SDFA 2V3QA 4G68B 1USYE 3LSWA 4YU0A 1XVXA 5CBRA 4KHZE 3K00A 2I3WA 3VVFA 1B5IA 2Q89A 1P1WA 4C1TA 3TTNA 3FV1A 3S4UA 4G4PA 2QJEA 5CM6A 1I6QA 4IGRA 1LCFA 1M5EA 2VP1A 3IAZA 3V5AA 1XT8A 3FJ7A 5I2NB 3RUMA 1B1HA 1GR2A 3R6UA 1R9LA 5ICTA 1D3KA 1JNFA 1QUJA 5KDTA 4JWYA 4F3SA 3O66A 5TU0A 1URGA 2I58A 2ZYOA 1BTJA 3ILUB 3KOSA 1A40A 2AL4A 3O6IA 4QRZA 2P1SA 5HM4B 2XXPA 4LUBA 4YAHX 4YB6A 4OYVA 2VD3A 1MXWA 4U23A 3O2AA 5H8NA 4ZEDA 4ZECA 3HSTA 3RT8A 3K02A 1B1XA 2XXRA 4XKQA 1B52A 2QSXA 1IQ7A 1A8FA 2ONSA 4YICA 1IIWA 4LA9A 4KYEA 3HHGA 3K0VA 3OENA 4YKKA 1ZKBA 1HSJA 2F34A 1F9BA 3UA8A 4ZZAA 3Q27A 1DPEA 1PBQA 4UACA 2XX8A 5TP9B 4X1DA 3U94A 4YB5A 4ISUA 4NF4B 4R6HA 3VLVA 2H5YA 3OSRA 3CFLA 2XX7A 3PD8A 4LONB 5FHMA 2I48A 4C1UA 4OZ9A 1LBBA 3DP4A 3IX1A 1SI1A 1MPDA 2VOZA 1N3XA 1URSA 4OENA 3LSXA 3IOWA 4DXCA 5HBCA 2I49A 4GXAA 3T96B 5J1DA 5AA2A 2DWJA 3L6HA 5I58A 1JW5A 4FEDA 1SQYA 3N26A 2ALUA 1AMFA 5AA3A 3EQ1A 4HCYA 1H76A 1XC1A 2HQ0A 4H6DA 2XXTA 2ONKE 1A54A 2F8DA 1UTHB 1Y4TA 4YKPA 4U2RA 5K2YA 1UIVA 2ZNSA 1M5CA 3PPNA 1UIUA 4IO7A 1IITA 2YJPA 4XIGQ 4N07A 1WODA 4GRKA 5I59B 1SW2A 2H9BA 3OMBA 4YKIA 1H44A 1QVSA 4DCYA 2V93A 4U1OA 1JETA 4EUOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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