4H8IA

Structure of gluk2-lbd in complex with gluazo
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A photoswitchable neurotransmitter analogue bound to its receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
molecule tags Signaling protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8iA02
1AMFA 3FGSA 4I9DA 3THIA 1MXUA 4Q30B 1R1NA 1MH3A 2XD2A 2Z8FA 2DWIA 5I58B 4JWOA 5FHOA 4X48A 4TLMB 4RK9A 5KDTB 3EHUA 3EQ1A 3MVYA 3PUVE 1Y3NA 4XXUA 4GXAA 3G7WA 4FIMA 4LP2B 2D5WA 3IO6A 5CMCA 1F9BA 2QRYA 1A8FA 1IZ1A 4YZZA 1DPPA 4OQOA 1JVXA 4IGRA 1IITA 4QFOA 3RGYA 2DE3A 1PB8A 1UIVA 4WEPA 3FVNA 4EXKA 2ZNTA 3SEWA 3FUZA 3RT8A 1TT1A 2Q9TA 3A3CA 3TDJA 1B0HA 2M8CA 2PMSA 4H67A 3C9HA 3UN6A 5HM4B 2ABHA 2DS9A 2YJPA 3VXCA 1LLSA 4ZEKA 1FQDA 3K6XA 1Y4CA 1R6ZA 3HV1A 1D4NA 3MP6A 2PVUA 3BFUA 4DXUA 3CVGA 2I49A 4OEVA 2DXYA 3OEMA 2HZLA 1SBPA 1KWHA 5B70A 3VXBA 2VP1A 2PT2A 3LSXA 3K1MA 1SW2A 3IJOB 1O64A 3O28A 3H4ZA 2I3VA 3PD8A 4H6DA 2VD2A 3P7IA 5I57A 1TFAA 3MZ1A 3C31A 4OVJA 1Z7NE 4QFLA 1XVXA 3T93B 4R6KA 4P0GA 4HCWA 3N6UA 2Y84A 5AA2A 1LAXA 2NVUB 3MC2A 4THIA 1YPNA 3MBPA 1CE2A 3MZ9A 1MM6A 1NMUA 3FJGA 2RC8A 1LAFE 3OSRA 4EQ9A 3KN8A 3DM0A 5AE4A 2OBGA 1ZBMA 3TCGA 2DVZA 1ATGA 2HZKA 3PU5A 3LBSA 5TP9A 3CSBA 1USYE 4ND9A 1B1XA 3I6VA 1MY1A 4RYAA 4EF1A 3K2DA 5K2XA 5B7DA 1LFGA 4R2FA 4H0WA 1ELJA 3OMBA 5H8SA 1DMBA 4ZEDA 4KHZE 4OEUA 2ESNA 2DE2A 3IOTA 1VE4A 4U22A 4JSOA 5H8HB 1ZIUA 2X26A 3KBRA 1OMPA 1YAEA 2ZYOA 2H4IA 2QPQA 3DP6A 2RCAA 4ZEBA 3UK4A 1NH7A 2VHAA 3PUXE 3C33A 4R75A 3B6WA 1N7WA 3MQ9A 4PQJA 1UIUA 1QJMA 3A3UA 3BFTA 1QKAA 2CZLA 3GBAA 1JQFA 2O7IA 4UA8A 3TKDA 1MDP1 1PBPA 2GHAA 2XXWA 2A5TA 1SYIA 1SI1A 2UYEA 1ZJLA 4FEDA 3USDA 3U92A 4DXCA 4C0RA 3QUJA 1OLCA 1DTZA 1H3DA 1B3EA 1FW0A 4F1VA 3TPAA 3FXUA 1B52A 1OQHA 3TODA 2XXUA 1US4A 3CSGA 2D21A 3FVGA 3IOWA 4JWYA 5I2NA 5CBRA 3I5OA 4JSDA 1SW4A 1FTOA 3BKIB 1SVXB 3FVOA 1QVSA 1D9YA 1Y1ZA 3MP8A 4ZE9A 3O2AA 4PE5B 1Y1MA 3MP1A 1Q35A 3IB1A 4BDRA 4ZZEA 1PC3A 3FXRA 2REGA 1B7UA 2RCBA 4DCYA 2Y7IA 2O1MA 4TOZA 4ZZAA 1D3KA 3K01A 4HS7A 4AQ4A 2H9BA 2Y7KA 3SEXA 1SYHA 3CFLA 3FJMA 3AXFA 4BDLA 2XX7A 1DOTA 2OJTA 1LGBC 2DP8A 1B3GA 5JTYB 5BWJA 1B51A 5EHMA 1IEJA 2ONSA 3LC8A 4O3BA 2I58A 2B65A 3U72A 4XKNA 4IO7A 5HPQA 4F39A 3RNNA 3H6TA 3MVZA 1MH4A 1Y9UA 2V25A 4G8NA 1MXVA 4OFJA 4YU0A 1NL5A 1BLFA 1TFDA 3PPOA 4ISUA 2PBWA 3LSLA 2Q8JA 1NH8A 3O6HA 2GH9A 1Q1KA 1LCFA 2CMOA 3B6TA 1MXXA 1B05A 2OWTA 3U8QA 5ITPA 1UTHA 4QFPA 1N3XA 3RPWA 4H5FA 1LCTA 2E1SA 5JEIA 4ELRA 5AA4A 4LQ5A 4OXVA 4F3GA 2Y7WA 3TTLA 4OYVA 2F7CA 4BDMA 2F97A 1LB8A 3FV1A 2HFBA 5EHSA 1MQGA 1DPEA 3UORA 3UGWA 5BUUA 3PUWE 3IB2A 3FD3A 4PETA 1B6HA 2OLBA 3LSWA 4Z0IA 3FVKA 3N26A 4F3PA 4ESWA 3ZS6A 1Y4TA 3IJXB 1EZ9A 4GFRA 4OTEA 3N6TA 4IY5A 4QF9A 4YMAA 3CG1A 4M1VA 4I1DA 4QFKA 1FCKA 4RK2A 1PBQA 3G3GA 3WAEA 3D4CA 1OVTA 2P0SA 3UA8A 3SETA 2V3UA 3V5AA 1P1QA 1LB9A 4U1ZA 3C4MA 4FE8A 4EQ7A 4XTCQ 4G68B 5L9OA 5CMKA 1L5TA 2OWSA 1AL3A 2IEEA 3ZKKA 4OETA 2UXAA 3TYHA 3VVFA 1XT8A 4WEDA 3T66A 1P1NA 2X7QA 5CM6A 4C1UA 3KSJA 3S2VA 3C35A 5DEXB 3MWBA 2O6AA 1JVYA 3H06B 1S7YA 4PFWA 5M2VA 4LZ8A 3IL1B 1R9QA 3OO7A 4MLQA 1LAHE 2XHDA 4NF8A 2F8DA 1VR5A 3SKPA 4F29A 4ECFA 4ZEFA 2DYXA 2HXWA 1XS5A 1AIVA 1NKXA 1GGGA 1IIWA 4K3FA 2ALUA 4N07A 4LA9A 2F7BA 4YB5A 5F1QA 1MDQA 4GWOA 3V83A 2FYIA 1N7XA 4GXSB 2PYYA 3O29A 2YLNA 1YCJA 4MH5A 2D3IA 3KJ7A 4ZECA 3CRBA 3MVXA 5I2KB 3H3GA 5I59A 1GV8A 3G3FA 4DIGA 3B6QA 3TEPA 3H7MA 2XXIA 4KCCA 1A99A 2RC9A 1Y20A 2Q2AA 2QS4A 3O66A 1MQDA 3PUZE 3TTKA 3G3HA 4NMYA 4IY6A 4FECA 1M5CA 2Q2CA 1LSTA 4R74A 1ZU0A 4NF4B 4X1DA 1DSNA 1PB9A 5CRYA 2GHBA 1MQJA 5TU0A 3DELB 2VD3A 1I69A 3OELA 1LBCA 1UTBB 1MPBA 3MVWA 3DLNA 4KYSA 1BIYA 3MZBA 1QUIA 4NWDA 1QUKA 1YTVA 3Q25A 5J1DA 3TCFA 5A5XA 3KJTA 4MLVA 4H1XA 4KFQA 5I56B 1B1HA 2AL5A 4MF3A 5H8QA 2AYSA 3KOSA 2HEUA 2H98A 3SEYA 5TPAB 2DWHA 2F5XA 4RPNA 3EN3A 3IOUA 2HAVA 1JETA 3C32A 2QS1A 2OCUA 3L6HA 1URSA 3QUFA 3RTFB 3TAJA 3RQTA 2DVCA 1MXWA 4YB7A 3TQLA 4DZ1A 1SQYA 3PPQA 3K6UA 5I58A 4KQPA 4F31B 4YKKA 1AOVA 3CI8A 1NFTA 1XC1A 5KDTA 5KCJB 4TLLB 5DTBA 1NNKA 4X1BA 4NTLA 2DWJA 2FNCA 3U1OA 5F7VA 4G68C 4GL8A 3RY3A 3K00A 1EU8A 4YKIA 4DLDA 2A5SA 4U23A 3EF7A 1BTJA 1QUJA 1MRPA 1URGA 4NF5B 3LSFB 4ESXA 3T22A 2VOZA 3VE1B 4KCDA 4KR5A 3O6IA 1MQHA 3GLBA 4EQBA 4IO5A 1O63A 3FATA 3R6UA 4U4SA 2X7PA 1MY4A 2PX1A 1SW5A 5ELVA 5AA2D 1A55A 3K1NA 2UVHA 5K2YA 4M4GA 1SI0A 4IO2A 3U94A 4NF6B 4UACA 4ZE8A 4LZ7A 5L9MA 1EZOA 4F3BA 4GLIA 4R72A 3T9HB 4RY1A 1QKBA 3RTWB 2DOJA 4N6PA 4GRKA 3K1PA 4F1UA 3KG2A 4JB7A 4FORA 4FAJA 2ZNUA 3FJ7A 4AB6A 1FQFA 4OFLA 1VFEA 3HN0A 5L8DA 1P1OA 1I6AA 3UIFA 2Y7RA 3TFLA 4R9FA 3OD7A 3QK6A 3OENA 4H8JA 3U93A 4PFYA 2PT1A 1DTGA 3IB0A 1AH5A 4Q0CA 4YAHX 4FATA 3W15C 5FTHA 1QW0A 3GXAA 2P2AA 3PUYE 2R6GE 1B58A 3PMXA 3H6VA 3CIJA 1RYOA 4R2BA 4I8CA 4E0XA 1MQIA 4F3SA 1B4HA 1FTMA 3M3LA 4GQOA 5CC2A 5H8FB 3T9UA 2H99A 5CMMA 5H8NB 5FHNA 4PFUA 4G4PA 4QRZA 3QXMA 2XXVA 1B4ZA 4OZ9A 3O9PA 4HTGA 1H76A 1WDNA 2ZYKA 1MXZA 1UQWA 4XKPA 4LZ5A 2XXRA 4ELPA 4ZDMA 2I6EA 2F6GA 1D9VA 2O84X 1R9LA 4GD5A 4BLAA 4ELQA 3ILUB 3MAMA 2E0SA 1GR2A 1EH3A 4Q8RA 4F22A 3B7DA 1O7TA 4G8MA 1NNPA 3PMWA 1MG1A 3RN8A 3S9LC 3OEKA 2BJJX 4TQUQ 3HHGA 1B7HA 3IK6B 2B3FA 1LFHA 3M3KA 4YB6A 4DXBA 1A8EA 2P1SA 1MXYA 3HSTA 2AIXA 4DCXA 2F7AA 2DSFA 3VLUA 4R73A 4ONYA 3KGCA 1B3LA 1Y3PA 4R6HA 4QSDA 4FJPA 3ZKLA 1US5A 2OZZA 1BP5A 4F19A 4WKMA 4LONB 1N84A 3VLVA 3ODBA 1M5DA 2G93A 3OOAA 3SESA 3W9WA 1B32A 3CFZA 1NNFA 4OWDA 3TELA 3C36A 1Y3QA 4GOTA 3HCQA 4WXJA 1B2HA 3IR1A 4BDOA 3CR9A 3JZJA 4F2QA 4OENA 4RXLA 1GVCA 4QSCA 5I57B 2ONKE 2UVGA 4P0IA 5KZTA 2QS2A 3HO7A 3MPLA 1HSJA 5ICQA 5AA2B 2I3WA 5JTYA 1ZMGA 2NXOA 2UVJA 3FV2A 4H5GA 4GF8A 3HPIA 5IKBA 4KYDA 4F2OA 1PB7A 1FQCA 4G8HA 1B3FA 3LUYA 4IO3A 4GIZA 5JK4A 1MM7A 2RINA 5TP9B 1VFDA 5IAIA 2QS3A 1ZLQA 3D4GA 3MPKA 4I62A 5DVJA 2I4CA 4H65A 4JBZA 1RKMA 3Q29A 3PV0E 2QSXA 4KI0E 5CMBA 4OESA 3TCHA 4E0WA 2XXQA 4YMBA 1CB6A 5ICTA 4F18A 1OLAA 5DYHA 1T0KA 3OO6A 4ELOA 3QIMA 3QAXA 4O3AA 1LFIA 4OERA 1B0LA 5EYFA 3KEIA 3OO8A 2ZXTA 1H44A 2H5YA 3ILTB 1MY0A 3KN7A 4OMBA 5DT6A 1IQ7A 2O7UA 1MPDA 2O51A 3K4UA 3KZGA 1M5EA 3S9MC 3K02A 3H03A 4BDQA 4OFOA 1N0TA 1LAGE 4RA1A 2A5TB 2F6PA 3G3KA 1B5HA 3FZVA 4C1TA 4Q5TA 4AB5A 1H45A 3MUQA 2QMWA 2IA4A 5ISUA 2O68A 4NEDA 2O1LA 4POWA 2V93A 3FXQA 1A7LA 2ONRA 4G68A 5I2NB 1B46A 5FHMA 2Z8DA 2B3BA 3RT6B 3K0VA 1JW5A 3KN3A 5DEXA 3H6WA 1XHYA 2XX8A 1WODA 4KYEA 1B5IA 1S9TA 2I0BA 5HBCA 1JEVA 3MW0A 2YPNA 5L9SA 1M5FA 4P11A 3RUMA 2UVIA 2F35A 2XX9A 1I6BA 3OXNA 2Z23A 1FQBA 3Q27A 4O3CA 4EXLA 2Z22A 3OO9A 3PPPA 1SDXA 1SD3A 1QULA 1FTLA 3GBBA 4G2ZA 3PPRA 3VLWA 3FASA 1II5A 3V8XB 4RJZA 1N04A 3SEVA 2QL3A 3CFXA 1SW1A 3IX1A 3BBRA 2I48A 3A09A 3SERA 1FTJA 3DP8A 3TMGA 5I84A 4EDPA 2F78A 1UTHB 1B5JA 5I2KA 4ZEIA 3RLFE 1MPCA 5DVFA 3KFMA 3OSQA 3VVDA 5DVIA 3IAZA 5AA4B 2GFEA 4U2RA 3QYTA 1TWYA 4LQ2A 2XXXA 4IGTA 1IXCA 2F36A 2NOOA 3EHTA 3TUSA 3S4UA 2NUVA 4DE8A 3VV5A 3G3IA 4FEBA 2XXHA 4NF4A 4IO4A 4LVQA 2V3TA 2R9JA 3Q26A 3WAFA 3K6VA 1A40A 2XXTA 4HW8A 3VFJA 1Z7ME 1NNTA 1MS7A 4PP0A 1UTBA 1OQGA 2R71A 4LUBA 3JV9A 4DDDA 3V89B 1LBBA 2Q88A 2WKYA 3PPNA 3LR1A 4QHQA 4RPOA 1GTKA 4GVOA 1BKAA 1B40A 4MFIA 2REJA 1P1WA 5I56A 1IXHA 3TTRA 4BDNA 1XVYA 2XXYA 2ZYNA 1PDAA 4NE4A 3K6WA 3Q28A 4H8IA 4LATA 1ZKBA 3ECRA 5TPAA 2ANJA 1B3HA 2ZMBA 4HCYA 4IO6A 2DE4A 4G77A 5CI5A 1M5BA 2VGQA 1H43A 3W9VA 2UYFA 3SDFA 4JXIA 3TTMA 1J1NA 1ANFA 2G29A 4IB2A 3C34A 3QSLA 2V84A 3HHFA 1OVBA 4PFTA 1FTKA 2I0CA 3I3VA 5KCJA 2HAUA 2ZYMA 2ZNSA 2LAOA 1URDA 3N94A 1JW1A 3ONMA 3F11A 3PD9A 3PMVA 1A54A 3T96B 1HSEA 5H8HA 4Z7EA 2H25A 3JYRA 4MBPA 4QFNA 2XD3A 1RYXA 2DWAA 4NWCA 1P99A 1ZTYA 3T9XB 1MY3A 4GL0A 1HSLA 4RNSA 4NF8B 3L6GA 1N3WA 4NF5A 1FQAA 1JW4A 4JDFA 2XXPA 2DXRA 2HCAA 2KLFA 2HQ0A 4EF2A 3IORA 1B9JA 2NWJA 2OK2A 4XKQA 3MJNA 3M8UA 3VVEA 3EHSA 1I6QA 3IO4A 2Q89A 3TZAA 1IUDA 1P1UA 3E3KA 4R6YA 3S9NC 4EUOA 4NF6A 3TTNA 4JWXA 4KPTA 5FTIA 3E13X 3GZGA 3M3FA 5I59B 5CBSA 3KOTA 3DP4A 2AL4A 3CG3A 3ZSFA 3N5LA 1EZPA 1WVJA 3O6GA 1PEBA 4YKJA 4U1OA 3SEUA 1USYH 3PGFA 3IOVA 3E9XA 3UP9A 2QMXA 4KD5A 3EPEA 3R26A 4OHNA 2RKMA 1N76A 2DQVA 3KSXA 3G3JA 2RF1A 5LOMA 2Y7PA 1POTA 1JEUA 1S50A 1TXFA 4QSEA 3O97A 4N13A 2THIA 4U4XA 4YICA 4ZS9A 2V3QA 2I4BA 2O69A 1JNFA 1VSOA 3H6UA 3E4RA 5ITOA 4XIGQ 2FA7A 4F1YA 5A5XB 3R7XA 1IXGA 1XOCA 2F34A 4XKRA 3S9EA 4X9TA 3TQWA 5H8FA 2W7YA 1FQEA 5H8QB 1MY2A 5H8NA 5AA3A 4YKPA 4R9GA 1POY1 2Z8EA 4POXA 4U21A 1OIBA 3FIRA 2QJEA 1IXIA 2GRVA 3T9VA 4L17A 5AA1A 3VDFA 2RC7A 1B7ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1MM6A 1NMUA 3FJGA 2RC8A 2WBDA 4O7IA 1LAFE 1NV2A 3OSRA 2L5VA 4EQ9A 3FBPA 3KN8A 3DM0A 5AE4A 5ET6A 2OBGA 2Q8MA 1ZBMA 3TCGA 2DVZA 1ATGA 3EKIA 2HZKA 3PU5A 3LBSA 1FRPA 5TP9A 3CSBA 1USYE 1INPA 4ND9A 1B1XA 3I6VA 1MY1A 4RYAA 4EF1A 3K2DA 5K2XA 5B7DA 1LFGA 1LBVA 4R2FA 4H0WA 1ELJA 2FHYA 3OMBA 5H8SA 1DMBA 4ZEDA 4NGUA 4KHZE 4OEUA 1IMDA 2ESNA 4XF5A 2DE2A 3IOTA 1VE4A 1FPGA 4U22A 4JSOA 5H8HB 1ZIUA 2X26A 3KBRA 5F24A 1K9YA 4PDHA 1OMPA 1YAEA 2ZYOA 2H4IA 2QPQA 3DP6A 2RCAA 4ZEBA 3UK4A 5EQAA 1NH7A 2VHAA 3PUXE 3C33A 4R75A 3B6WA 1N7WA 3MQ9A 1DCUA 4PQJA 1UIUA 1QJMA 3A3UA 3BFTA 1QKAA 2CZLA 3GBAA 1JQFA 2O7IA 4PDDA 4UA8A 3TKDA 1MDP1 1PBPA 5EYGA 2GHAA 2XXWA 2A5TA 1SYIA 1SI1A 2UYEA 1ZJLA 4PAKA 1DBZA 4FEDA 3USDA 3U92A 4DXCA 4C0RA 4PAIA 3QUJA 1OLCA 1DTZA 1H3DA 1B3EA 2CZHA 1FW0A 4F1VA 3TPAA 3FXUA 1B52A 1OQHA 1D9QA 3TODA 2XXUA 1G0HA 1US4A 3CSGA 2D21A 3FVGA 3IOWA 4JWYA 5I2NA 5CBRA 3I5OA 4JSDA 1SW4A 4PFIA 1FTOA 3BKIB 1SVXB 3FVOA 1QVSA 1D9YA 1Y1ZA 3MP8A 4ZE9A 3O2AA 4PE5B 1Y1MA 3MP1A 1Q35A 3GYYA 3IB1A 2PFZA 4BDRA 5IZ3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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