4IGRA

Crystal structure of the kainate receptor gluk3 ligand-binding domain in complex with the agonist za302
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
253
structure length
253
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Chemoenzymatic synthesis of new 2,4-syn-functionalized (S)-glutamate analogues and structure-activity relationship studies at ionotropic glutamate receptors and excitatory amino acid transporters.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 253
sequence length 253
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igrA02
5HM4B 4EQ7A 2UVHA 4PFTA 1US5A 1FQBA 3O6IA 1B3EA 4ZEIA 3O6HA 3B6TA 3VLVA 3DP4A 3D4CA 2DYXA 2F34A 4X1DA 2ESNA 2ZYMA 3PU5A 2F97A 2XX7A 4F1VA 1URGA 5H8NB 5L8DA 1SD3A 3MJNA 3RQTA 3OO7A 1LGBC 1NFTA 2V93A 4L17A 3H6VA 3K6XA 2Z8FA 4JWYA 3C9HA 1FTOA 3OEMA 3I3VA 4X9TA 4H5FA 1OIBA 4KD5A 3IB0A 4R6HA 4O3BA 1SYHA 3TAJA 1URSA 3K6VA 3OO6A 2THIA 2HAUA 3VFJA 2QRYA 2HCAA 1B5HA 4RK9A 3TKDA 4RPOA 1A7LA 2PYYA 3TELA 2LAOA 3IB2A 3FV1A 4OESA 3OSQA 1S50A 2UYEA 1AOVA 4IO4A 3PPRA 2Z8EA 1YCJA 4GL8A 5JK4A 3QXMA 4I9DA 2AL5A 2I3VA 1DMBA 1WODA 3LUYA 4TLMB 2F6PA 4OWDA 1JVYA 1JNFA 1IITA 3C35A 3RT8A 2I58A 1IQ7A 3SESA 2I6EA 3V8XB 3CSGA 1HSLA 1LFGA 1LAFE 4N6PA 3OENA 1H45A 4OEVA 4JDFA 3TTRA 4FORA 2DP8A 1F9BA 4H1XA 1Y9UA 4H5GA 1N3XA 4POWA 1OQHA 4GWOA 1MPDA 3W15C 4F18A 4RK2A 1Y3NA 1R9QA 5AA1A 3CG3A 3MPLA 5KCJB 1QUJA 4BDOA 1QUIA 2I48A 4G68A 5DVFA 3T9VA 5I59A 1ZTYA 3TTNA 1I69A 3T66A 5FHNA 2XXXA 1MXXA 3IR1A 3W9WA 4KYDA 4DE8A 2Q2AA 4DXBA 1IXIA 3IOTA 1TWYA 3TPAA 3TZAA 2QMWA 3PMVA 4KCDA 4OETA 1IEJA 3K01A 4GXSB 5EYFA 3PMWA 5I2KA 1SW5A 5L9SA 3T9UA 3HSTA 2FNCA 3SEYA 2FA7A 2XXVA 4KI0E 3S2VA 3FXUA 1I6QA 3MVXA 3KBRA 2DE4A 5KDTA 3MBPA 2V84A 4GL0A 4U4SA 5AA4B 3VVEA 2PMSA 3FJMA 3IX1A 4YMAA 3UP9A 4RNSA 4R9FA 3RT6B 3G3KA 2XD3A 4OMBA 3IO4A 2G29A 4U4XA 5HBCA 1A54A 3K1PA 1NH7A 3KOTA 4G8NA 2ALUA 4NF5B 4DXUA 3SDFA 4G8HA 3K1NA 5J1DA 2GFEA 2QPQA 4E0WA 3A3UA 2PX1A 4RA1A 3KN8A 1B46A 5TP9A 1R1NA 2DQVA 3K02A 4NE4A 4YKIA 4AQ4A 3N5LA 3ZKKA 1MDQA 1M5FA 3A09A 3KSJA 3Q29A 3HV1A 5CC2A 1NMUA 3RUMA 3V89B 1TFAA 3K6UA 3JV9A 5H8HB 1UIVA 4GOTA 1GGGA 5AA2B 1M5EA 4ZZEA 3OEKA 2ZNUA 4IO7A 4DIGA 2GH9A 1NNPA 4NF6B 2YJPA 2F7CA 1GR2A 1B52A 1Z7ME 4F3GA 3HCQA 2UXAA 5CM6A 4R73A 3K6WA 1B4ZA 1J1NA 4AB6A 5DEXB 2QSXA 2O7UA 4FATA 1B0LA 3UA8A 1USYE 2V3TA 3EHUA 1Y4CA 1YAEA 3L6GA 2Q9TA 4G68C 4YU0A 4RPNA 4YB6A 1FTMA 3RLFE 4K3FA 4YKKA 3R6UA 3IORA 3PUVE 3M3KA 5HPQA 4BDQA 3VVDA 5L9MA 5H8QA 4AB5A 1USYH 1N0TA 4EF1A 1QW0A 3VV5A 3HN0A 5CRYA 2I0CA 4G8MA 3C31A 2CZLA 4H6DA 1LFIA 4GIZA 4EQBA 1N3WA 2AYSA 2QL3A 3CFXA 2ZYNA 4EQ9A 5I56B 2VP1A 2B3FA 3PUXE 2O84X 4OZ9A 2Q88A 3PD8A 5I57A 1MS7A 3LR1A 2I49A 4ELPA 3CG1A 2F8DA 3ECRA 2CMOA 4XKNA 4BLAA 2H99A 4QRZA 4ZEFA 1D9YA 1XVXA 5DVJA 3MZ1A 3OO9A 3TUSA 1JW4A 1NNTA 4LZ8A 1OVBA 4KYEA 1FQFA 2XXPA 1OMPA 3LSFB 3TTKA 2D21A 4YB5A 2OCUA 1POTA 3ZSFA 4FE8A 1LAGE 5TPAA 3QK6A 4M1VA 1LBBA 2GHBA 3PPNA 1FTLA 1UTHB 1A55A 3EHTA 3EF7A 2XXWA 1BKAA 3MAMA 1VE4A 2O51A 1MY4A 2F7AA 3LBSA 5BUUA 4JBZA 2Z23A 1HSJA 3I5OA 4YKJA 3ILTB 3IJOB 3E13X 3LSWA 1UTBB 1PB9A 1UQWA 2H98A 2G93A 3OSRA 2ONRA 2Y7KA 3SEUA 4IO5A 4FJPA 2ABHA 1ZMGA 3THIA 2Y84A 4RY1A 1MH4A 3CR9A 1I6BA 4LONB 3QIMA 2ONKE 3KZGA 4OFLA 3QUJA 2DWAA 4U21A 1MXUA 1SQYA 3Q27A 4ESXA 2ZYOA 1Y1MA 2XXIA 3TTLA 1FQCA 3S9NC 3S9MC 4Z0IA 4THIA 4ZZAA 1TFDA 1P1UA 2O69A 1QJMA 4MFIA 4YB7A 1NH8A 4C1UA 1MPBA 4H67A 4QSEA 3V83A 2XX9A 2HZLA 3O29A 5H8FB 1L5TA 1PEBA 3MVWA 4I8CA 3JZJA 3VDFA 3IOWA 3N94A 3GZGA 1QULA 3FXQA 1B3FA 1JW1A 4GLIA 5DTBA 1EZ9A 4JXIA 1M5DA 3EHSA 1M5BA 2R6GE 3IB1A 3KJ7A 3ONMA 3VXBA 3PV0E 1DOTA 1LAXA 4P0GA 1SYIA 4C0RA 4H65A 2H25A 3SEXA 4F2OA 4XIGQ 4ZEKA 3TCGA 4XTCQ 1QKBA 4DCYA 3H6WA 1P99A 5CMCA 2DE2A 1EU8A 2DVCA 5EHSA 1P1WA 3TODA 2RKMA 3M3FA 1MY2A 2XX8A 5AA4A 3DP6A 3O97A 3C34A 4NEDA 4F1YA 1LBCA 5I58A 4TQUQ 4PFWA 4QHQA 1JETA 4QSDA 2NVUB 2O7IA 2O6AA 4H8JA 1NL5A 4LQ2A 1Q35A 5L9OA 4RYAA 5AA2D 1SDXA 3D4GA 4FAJA 2M8CA 3O9PA 1N7XA 4QF9A 4R2FA 2RCBA 2DWHA 4DLDA 3ZS6A 3RN8A 3CI8A 3BFUA 4ZDMA 1ZBMA 3PD9A 3LC8A 2IEEA 1D3KA 2RC8A 2OLBA 3EN3A 4KCCA 2V3UA 3FASA 3FJGA 2AL4A 1HSEA 5H8HA 1H43A 1SI1A 3FUZA 4GD5A 1LSTA 4POXA 3OELA 5AA2A 1MM7A 3DLNA 5FTIA 3GLBA 3O2AA 3MPKA 1AMFA 3MVYA 4NF6A 1LAHE 2YLNA 2P2AA 2UVJA 3MZ9A 5DYHA 1SW2A 5JTYA 1MXYA 2OJTA 1POY1 4NF4B 1B32A 1MQGA 4R74A 3G3GA 4JSDA 1FQAA 5K2XA 4OENA 1H44A 2Z22A 3EPEA 1DPEA 4NTLA 2FYIA 3CIJA 1IIWA 1B1XA 2OK2A 3TMGA 4DZ1A 4ECFA 4G2ZA 3MP1A 4Q5TA 1EH3A 4MBPA 3QYTA 2Y7RA 2NOOA 3U1OA 4ZS9A 4YAHX 3FVOA 3TDJA 2NWJA 3MP8A 3FGSA 1MQHA 3QSLA 3H6TA 4EXKA 3O6GA 4WKMA 1H3DA 2OWTA 4ELRA 4LATA 2VD2A 1NNFA 1Y1ZA 5I2NA 3PPOA 4R72A 2ZNTA 1S7YA 5I56A 2QS3A 4IGRA 2OBGA 4ESWA 4M4GA 3OD7A 1A8FA 1T0KA 1BLFA 3U8QA 5CBRA 4BDLA 1MQIA 4IO3A 3MUQA 4YKPA 1Y20A 4G68B 4ZEBA 3RGYA 5B7DA 1NNKA 1FQDA 4FEBA 2DSFA 4OYVA 4NF8B 3KSXA 4X48A 3TCFA 1URDA 4PQJA 1MRPA 5CMBA 3T93B 1SW4A 3P7IA 1Q1KA 3H4ZA 3MVZA 5K2YA 3C32A 2KLFA 1O7TA 5I2KB 4O3AA 3Q28A 1ZIUA 1UTHA 1GTKA 1LCTA 3CFZA 3H03A 1JVXA 3G3FA 5KDTB 3G3IA 5H8SA 2VGQA 2NXOA 3H7MA 1B7UA 1NKXA 4IY6A 4YMBA 1IXCA 1JEUA 4LA9A 3W9VA 3CSBA 5CMMA 1UTBA 4YICA 3T96B 4ZEDA 4PP0A 1QVSA 2DXRA 3MC2A 3C4MA 1B3GA 1Y4TA 3E9XA 2A5TA 4IB2A 3Q26A 3PUWE 3VXCA 4ZE9A 3BBRA 1MXWA 1RKMA 5TU0A 1PBQA 4OHNA 5AE4A 5TP9B 4R9GA 4Q0CA 1SVXB 2D3IA 2F5XA 3IAZA 3GXAA 3E3KA 1M5CA 2PT2A 3OXNA 3WAEA 1A99A 1D9VA 4QFPA 3SEWA 3N6TA 1DSNA 5ICTA 5H8NA 1PB8A 2I3WA 3KG2A 4LZ7A 2O1LA 4DCXA 4DDDA 4GF8A 1XHYA 4GRKA 2Y7IA 1O64A 2PVUA 3B6WA 4FIMA 1B4HA 1IZ1A 2H9BA 2XXQA 4FECA 4Q30B 4DXCA 5IKBA 1LFHA 2DOJA 1DPPA 4IO6A 1P1OA 1B3HA 3VLUA 3UN6A 4NWCA 4EF2A 3T22A 2D5WA 1AH5A 2GRVA 5ITOA 4R75A 3DELB 1B58A 2UVIA 2ZXTA 4UACA 1OVTA 3M8UA 3HO7A 3PMXA 2RCAA 3FVGA 1MXZA 2QS4A 4JB7A 1Y3PA 4XKQA 3LSLA 3KGCA 3U92A 2H4IA 2REJA 4I1DA 1LB9A 3KJTA 3KEIA 4ONYA 5ICQA 3UK4A 3ZKLA 2XHDA 4F3SA 4MLVA 5DVIA 3RTFB 3GBBA 3MP6A 3B6QA 1VR5A 1XC1A 1YPNA 2QS1A 2IA4A 4F19A 3H3GA 3FD3A 1ZJLA 4OERA 5ISUA 3K0VA 5I57B 3IL1B 3QAXA 3FZVA 3F11A 4JWXA 4F22A 1EZOA 2A5SA 1B0HA 4KYSA 4F2QA 3LSXA 2HEUA 4QFLA 3CVGA 4U2RA 4NWDA 1IXHA 3IOUA 3EQ1A 1OLCA 4H0WA 3TYHA 5KCJA 3K00A 1XT8A 3FVNA 4U1ZA 2I0BA 3JYRA 4OVJA 5CMKA 2ONSA 2DE3A 1XOCA 4HS7A 4QFKA 4R6KA 4RXLA 3G7WA 2F6GA 4YZZA 2HZKA 4JSOA 1LLSA 3WAFA 3K1MA 4MLQA 1KWHA 3O66A 5TPAB 2E1SA 3RTWB 1ATGA 3KOSA 3PUZE 2F78A 4KR5A 1XVYA 3VVFA 1LB8A 4NF4A 3GBAA 3TFLA 2VD3A 3RY3A 4OXVA 2XXHA 3FIRA 4F31B 2O1MA 4QSCA 2HFBA 5A5XB 1FCKA 1DTGA 3UORA 3G3JA 3RPWA 2E0SA 1H76A 4PFYA 2WKYA 1FQEA 5KZTA 4ISUA 5BWJA 2P0SA 1FTKA 1B6HA 2UYFA 3TTMA 1ANFA 4KFQA 1EZPA 4RJZA 1D4NA 4KPTA 5I84A 2I4CA 4GVOA 1YTVA 2RC9A 1B7HA 4ELOA 3CFLA 2VOZA 3V5AA 4N07A 2V3QA 3L6HA 4NF5A 3UGWA 4OFOA 5ELVA 2R71A 1RYOA 3MQ9A 1WDNA 2ZMBA 1JQFA 3ILUB 1SI0A 2XXUA 2BJJX 3FATA 1ZKBA 2NUVA 3SETA 1MQDA 2XD2A 3IO6A 3S9LC 2DS9A 3PPQA 1N76A 4WEPA 5FHMA 1IXGA 1VFDA 3T9HB 1RYXA 2B65A 4XXUA 2ZYKA 1B7ZA 4F29A 4NF8A 3T9XB 3E4RA 1MDP1 1QUKA 1PDAA 4PETA 4P0IA 4H8IA 2QMXA 5DT6A 3TEPA 1MM6A 2W7YA 2F36A 2O68A 5DEXA 3I6VA 3RNNA 1XS5A 4PE5B 2R9JA 3KN3A 3UIFA 2Y7WA 3K4UA 4EDPA 3OMBA 3FVKA 3U94A 4E0XA 4LP2B 1B1HA 3CRBA 2V25A 4F3PA 3OOAA 1CB6A 1ELJA 4OEUA 3B7DA 2QS2A 4N13A 1BP5A 4Q8RA 4JWOA 2XXTA 5I58B 2X7PA 4QFNA 1MH3A 4LZ5A 4PFUA 5F7VA 1R6ZA 2AIXA 1JW5A 3FV2A 3PPPA 5EHMA 1ZU0A 1MG1A 3TQWA 3C33A 5ITPA 1CE2A 1S9TA 2Q8JA 1B9JA 4U22A 4G77A 1FW0A 5JEIA 1QKAA 2DWJA 2F7BA 4R6YA 3U93A 4ZECA 4ZE8A 1MXVA 4IY5A 2RC7A 3HPIA 2HQ0A 3K2DA 2ZNSA 1DTZA 3USDA 2DWIA 3PUYE 4XKPA 4IGTA 4OQOA 3VE1B 4BDMA 5I59B 4U23A 3R26A 4HCYA 2P1SA 3OO8A 4Z7EA 1N04A 2Z8DA 1LCFA 3O28A 2I4BA 4OTEA 3A3CA 2RINA 2UVGA 1O63A 1PBPA 2YPNA 2B3BA 4NMYA 5JTYB 1TXFA 4LQ5A 2F35A 4ELQA 4R2BA 4KHZE 1I6AA 1MY1A 3M3LA 4QFOA 4C1TA 4TOZA 2OWSA 5IAIA 4F3BA 3ODBA 4X1BA 2PBWA 5FTHA 3KN7A 3HHFA 2HAVA 5CBSA 4IO2A 4BDNA 1VFEA 1PC3A 5M2VA 4OFJA 4U1OA 4UA8A 1MPCA 2DVZA 2QJEA 4KQPA 2H5YA 1WVJA 4F1UA 2PT1A 3C36A 3N26A 4GXAA 1BTJA 1MY0A 3PGFA 1B3LA 1IUDA 3S9EA 5I2NB 5CI5A 1SW1A 5F1QA 1GV8A 3KFMA 1P1QA 3DM0A 4GFRA 4HCWA 4HW8A 2X7QA 3DP8A 3HHGA 3TQLA 2Q89A 1ZLQA 2ANJA 1II5A 4GQOA 4MF3A 3VLWA 2X26A 3TCHA 1JEVA 4WEDA 1B2HA 3FJ7A 5H8FA 3BFTA 1GVCA 1OQGA 1R9LA 4BDRA 1PB7A 5LOMA 3FXRA 4MH5A 4EUOA 4XKRA 3Q25A 3SEVA 2DXYA 3MWBA 1A40A 4FEDA 2VHAA 3BKIB 4F39A 1B5JA 1TT1A 3QUFA 4P11A 3IJXB 5B70A 3IOVA 4O3CA 3S4UA 4LUBA 4TLLB 3H6UA 3R7XA 1N84A 1A8EA 3N6UA 2HXWA 1Z7NE 1FTJA 2GHAA 1Y3QA 4ND9A 1N7WA 5A5XA 5H8QB 2RF1A 1B51A 3SERA 1MY3A 2Q2CA 2Y7PA 2REGA 1UIUA 1B5IA 3IK6B 4WXJA 1US4A 2OZZA 1AIVA 1B40A 3AXFA 3SKPA 4EXLA 1OLAA 1P1NA 3H06B 4LVQA 4I62A 2XXRA 5FHOA 1AL3A 5AA3A 3G3HA 1BIYA 4HTGA 3U72A 4G4PA 2A5TB 1MQJA 3MW0A 1B05A 2XXYA 3MZBA 1SBPA 1VSOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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