4IGTA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the agonist za302 at 1.24a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Chemoenzymatic synthesis of new 2,4-syn-functionalized (S)-glutamate analogues and structure-activity relationship studies at ionotropic glutamate receptors and excitatory amino acid transporters.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 85
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igtA02
4G77A 3C4MA 5I2KA 4DCXA 4EQBA 3PUWE 3LSWA 5I56B 4JWXA 3HHFA 1ZIUA 2ZYKA 4H0WA 1FTJA 2YLNA 5DVFA 1D9VA 2FNCA 2DE4A 2QPQA 5JTYB 3MAMA 4IY5A 2ABHA 2D21A 2P2AA 3TELA 3U8QA 4O3BA 4I62A 4R6YA 4OEUA 2HEUA 1MQIA 4F29A 1FQEA 4DXUA 1OLAA 2DWHA 3MP1A 3IOWA 4R2BA 4PQJA 2Q2AA 5I57B 3UA8A 2UXAA 4YB6A 4JWOA 1ATGA 3TFLA 2XX9A 5I58A 2I48A 5TP9B 4QF9A 3MVWA 3OEMA 4ZE9A 5H8FA 4M1VA 1XT8A 3IO6A 4OMBA 2HQ0A 1UTBB 1D3KA 5A5XA 1J1NA 3E4RA 4YMAA 1LSTA 1P1UA 2D5WA 5H8SA 5I84A 1VFEA 2UYFA 1D9YA 5DT6A 1BLFA 2Y7PA 2F78A 3OSRA 3SERA 1P1QA 3ZSFA 3VXBA 4P11A 4KPTA 1IQ7A 5AA1A 1II5A 1B52A 3S4UA 1AL3A 3G3JA 5FHNA 4YU0A 4BDRA 4GRKA 1M5BA 4MF3A 3S9MC 4YKJA 3RT8A 2V93A 3O6HA 3IJOB 1PEBA 3FZVA 4XKQA 3IORA 3DLNA 2GRVA 2F36A 5DVIA 5CMBA 3IOVA 4U22A 3VLWA 3N6TA 1NKXA 3KZGA 3E3KA 3PMXA 1SBPA 1MY0A 1FQDA 1QW0A 4GLIA 3TZAA 3SEVA 5FHMA 3Q25A 3D4CA 5AA4A 2RC8A 4EF2A 1AH5A 3B6TA 3A3CA 1IUDA 4G68A 3Q28A 3FV2A 1IITA 1B58A 3H4ZA 1VR5A 3FVOA 2QJEA 3FATA 3Q26A 3RLFE 3RNNA 3TEPA 3ZKLA 1USYH 2F97A 2BJJX 5AA2B 1B7UA 3M3FA 2VHAA 4XTCQ 2F8DA 1B3GA 2XXVA 3VVEA 2I6EA 1MH3A 2DWAA 5ISUA 1EU8A 2XXXA 4K3FA 1TXFA 4E0WA 4GXSB 2F5XA 1EZPA 2V3TA 3QAXA 1ZLQA 5TPAA 3V8XB 1IIWA 4F1VA 1A8EA 1M5DA 4RPNA 3EQ1A 1LFGA 4OTEA 5EYFA 1H43A 4ELPA 4EQ7A 2D3IA 3OMBA 1SYIA 1SI1A 4NF5A 2P0SA 3FIRA 4RNSA 2ZNUA 2O51A 1DPPA 3DM0A 3LSXA 2PMSA 1SYHA 4LZ5A 3UK4A 5H8QA 1US4A 1FQFA 1DTZA 3OXNA 2ONKE 3RT6B 2O1MA 2CZLA 4HCYA 1FTOA 1S9TA 1TT1A 4NTLA 4F18A 1LAGE 1FCKA 4FIMA 3OSQA 1FQCA 4KQPA 4IO7A 1N3XA 1YPNA 1DSNA 2O7IA 4R73A 3ONMA 3VVFA 3PPOA 3OO7A 4EXLA 1N0TA 5CC2A 4NF4A 1YTVA 3K6XA 4R74A 2X7QA 3MZ1A 5JEIA 3MC2A 3T9VA 1LFIA 4ESWA 2Q88A 2AL4A 2Z8FA 1WODA 3H06B 3MVZA 5CM6A 4IY6A 3CR9A 2QS4A 1MY1A 1Y20A 2XXRA 1A55A 3EHSA 3FVGA 2H98A 2E0SA 4KYSA 1N04A 1XHYA 1MQGA 2XX7A 3OOAA 3TQWA 4N6PA 5AA3A 1QJMA 1NL5A 5I2KB 4H65A 1WVJA 1B05A 1BIYA 4F2QA 1IXCA 4IGRA 4QRZA 3T9UA 1B2HA 4GD5A 3DELB 4HTGA 3PD9A 4NMYA 3UP9A 4X1DA 1XC1A 5KCJA 2CMOA 3IX1A 3OELA 4U23A 1O63A 2HAUA 5IKBA 1A40A 3MP6A 2H99A 1POY1 3O9PA 2ALUA 2DWIA 3O97A 1M5CA 2I49A 2XXIA 1UTHA 3PUXE 4NWDA 4LQ2A 4ELOA 1MDP1 4X48A 3SETA 1QUJA 3PUZE 4DXBA 1XOCA 3UORA 4I1DA 3Q29A 5FHOA 4H67A 1XS5A 3UN6A 4YB7A 1SDXA 3U94A 1SW2A 2ZYOA 1EH3A 3ECRA 1FTMA 2P1SA 2AYSA 3L6HA 3EHUA 1BKAA 2V84A 3HPIA 3FV1A 5A5XB 1PBPA 5TU0A 3P7IA 4NF6A 1SVXB 2HAVA 3O29A 1B40A 3LSLA 4P0IA 1QVSA 1MQJA 4G68C 2DQVA 2A5TA 1QKAA 1MQHA 3PPNA 1LBBA 4JB7A 3C33A 1XVXA 3PPQA 5JK4A 1JNFA 1L5TA 2Z22A 4IO2A 4OXVA 2UVHA 3KBRA 5H8NA 1GGGA 4MLQA 4U4XA 1ZBMA 4ZE8A 2W7YA 4OENA 4THIA 1LB8A 2F7AA 4IO5A 2F6GA 1KWHA 3GBAA 3HN0A 5I2NB 2UYEA 4PP0A 4BDLA 4G8MA 3CVGA 1MXUA 3PPRA 3MJNA 4R9FA 1LLSA 3MUQA 1RKMA 1JW1A 1S50A 2GHBA 3MPLA 5AA4B 1PC3A 1NNTA 1B5HA 1LAXA 2DSFA 2DXYA 1TFDA 4KYDA 2RCAA 1LBCA 3RY3A 1CE2A 3IOTA 4C0RA 2PX1A 3KEIA 1NNFA 2ZYNA 3KOTA 3M3LA 1S7YA 4F1YA 2ZXTA 3TTRA 3W9WA 3SEYA 3CFXA 5L9MA 1N7WA 2RC7A 3MVXA 1Y4CA 4X1BA 2VD3A 5B70A 2ZNSA 1Y3QA 5CMMA 4NE4A 4YMBA 2H5YA 3PMVA 1FTKA 1Y3PA 3MZBA 1ZJLA 4AQ4A 4I8CA 1B6HA 3K6WA 2RF1A 1PBQA 2OLBA 2ZYMA 3H6VA 4JBZA 5B7DA 1AMFA 3TTNA 4QFKA 3TTKA 1PB7A 4MBPA 1JW5A 3O6IA 4IO3A 1N7XA 2DWJA 1D4NA 3ZKKA 1ZTYA 5FTIA 3TMGA 2UVJA 1Y9UA 3V5AA 3KSXA 1SW4A 5L8DA 3N26A 2OWTA 4HS7A 4PFTA 2Y7RA 2NUVA 3G3HA 4H8IA 3S2VA 3MQ9A 1YAEA 1DMBA 2HZKA 4QFNA 3ILTB 4U1OA 4ZEFA 1VE4A 4R2FA 1B3EA 2DE3A 5EHSA 2ZNTA 4OHNA 4TOZA 2OZZA 1VFDA 4KD5A 4R6HA 2Y7KA 3C35A 3I6VA 3N6UA 2R9JA 3VVDA 1JVYA 2H9BA 5ICTA 3D4GA 4EXKA 1URSA 1LAFE 1NMUA 2A5SA 1YCJA 4U21A 3A09A 2M8CA 3FASA 5KDTA 3LUYA 3V83A 4TLLB 1I6QA 3IOUA 5H8HB 1MDQA 3BKIB 3KN3A 2X26A 3VE1B 3CIJA 3IB1A 3HV1A 3TUSA 1P99A 2XXQA 3W9VA 4ISUA 3CFZA 1M5EA 5KCJB 3E13X 3DP6A 3SEWA 2F7CA 4NF8B 3CFLA 4R9GA 4NEDA 3S9NC 3K2DA 1Y3NA 5IAIA 2I0BA 4LQ5A 3KSJA 3U92A 1HSLA 4F2OA 1JEUA 1UIUA 2XXUA 5BUUA 3H6TA 4F3PA 1EZOA 2Q89A 4OFOA 3KGCA 1UTBA 1ANFA 4HCWA 3TODA 1USYE 4LP2B 1URGA 2NOOA 1CB6A 4Z7EA 4E0XA 3QUFA 4GVOA 3C9HA 2F6PA 1MQDA 3H03A 4LATA 4F3BA 4YKKA 3THIA 2Y84A 4EUOA 3IL1B 4G8HA 3K0VA 2ONSA 2UVGA 3CI8A 1HSJA 2O69A 5M2VA 4YKIA 4L17A 5F1QA 4PFWA 3IR1A 3VDFA 4QSCA 4YAHX 4LUBA 1H3DA 1NNPA 5I57A 5AE4A 5H8NB 3QK6A 4KYEA 2XHDA 4N13A 5DEXA 5I59A 2QRYA 4QSEA 2PBWA 5CMKA 4IO6A 4H5GA 4R75A 3CRBA 1SW5A 4OQOA 4YZZA 3FJMA 1BTJA 2IA4A 3MBPA 3G3IA 2O68A 3MW0A 4PFYA 3SKPA 3K6UA 4YICA 2VP1A 2PYYA 1MPDA 5ICQA 2PT1A 3TAJA 2I3WA 4QFLA 3M3KA 1MM7A 3GZGA 2I58A 1TWYA 3RTFB 4R72A 2RCBA 1O7TA 3R26A 3PV0E 3FGSA 3I5OA 1SW1A 4WEDA 3QYTA 3BBRA 1FQAA 3WAEA 2Z23A 2LAOA 4QHQA 2OJTA 3T93B 5DYHA 4XXUA 4LA9A 3HSTA 2QL3A 5K2XA 3FJ7A 4Q8RA 1OIBA 2FA7A 4POXA 3G7WA 4KCDA 3LBSA 2PVUA 2OK2A 4GQOA 3W15C 1AIVA 1T0KA 3K1PA 2V3QA 5ELVA 3IK6B 4U4SA 1FW0A 3H6WA 4FATA 2V25A 1I6BA 4H1XA 4UA8A 3UGWA 3E9XA 4ND9A 3PUVE 3M8UA 1EZ9A 4ZEBA 2Q8JA 3QIMA 1MY3A 2I4CA 1B46A 3KJTA 3LC8A 4U1ZA 5HM4B 4KHZE 2R71A 3V89B 2VGQA 2E1SA 5I58B 4HW8A 2XD2A 4GXAA 1LB9A 4LZ7A 2XXYA 3TPAA 5H8FB 2UVIA 3U1OA 4GIZA 2F7BA 3QXMA 3K02A 4DZ1A 4QFPA 1MPCA 4RYAA 4XKPA 2DVZA 4IB2A 1FTLA 5CBRA 1MXZA 1PB9A 3IJXB 2B3FA 2XX8A 1R1NA 1OMPA 3FJGA 4MFIA 3JYRA 4ZEDA 1R6ZA 4M4GA 2HZLA 3SEUA 1H44A 4F22A 3Q27A 2Q9TA 3JV9A 3BFUA 4POWA 4OZ9A 4F31B 1MS7A 4QFOA 2Z8EA 5K2YA 2DS9A 2G29A 3L6GA 5L9SA 4RJZA 5L9OA 2NVUB 4ZEKA 2THIA 4BDOA 4BDQA 1DPEA 2GH9A 1N84A 3TKDA 4DDDA 1H45A 1MH4A 4G2ZA 2DVCA 2ANJA 1B1HA 4G68B 4JSOA 1B3LA 3O2AA 3WAFA 1JETA 3B6WA 1B0LA 4OERA 3PGFA 3KJ7A 1SQYA 4ZEIA 3MPKA 1VSOA 3G3GA 3O6GA 3RGYA 4OETA 3F11A 2I3VA 4O3CA 2IEEA 4GF8A 4WEPA 4Z0IA 4PETA 4DLDA 1OQGA 1OLCA 1R9LA 3OO8A 1UIVA 2I4BA 4ONYA 1MXXA 2GHAA 2O1LA 4WXJA 5FTHA 1H76A 4OFJA 1MPBA 4RK2A 2O7UA 3OO9A 4P0GA 1JEVA 3VV5A 4DXCA 4Q5TA 5TPAB 1QULA 1JQFA 4AB5A 1RYOA 1QKBA 1MG1A 3DP8A 3H7MA 5ITOA 1LCTA 4FAJA 4N07A 3AXFA 3GBBA 4RPOA 4RY1A 4NF5B 1MXVA 3HO7A 1Z7ME 3T22A 1SD3A 4MLVA 3BFTA 2ZMBA 3DP4A 1B5JA 3RQTA 2YJPA 3CSGA 4JSDA 5H8QB 4F19A 1B4ZA 4Q0CA 1Y1ZA 4OWDA 4ECFA 4BDNA 1P1OA 3LSFB 4KR5A 1JVXA 3B6QA 2R6GE 3MZ9A 3TCFA 5DEXB 5I59B 4OESA 4ZZAA 2YPNA 5CBSA 4TLMB 4BDMA 4IGTA 3N94A 4NF4B 4ZECA 1B1XA 3FVKA 2OCUA 3QUJA 3PD8A 1QUKA 1B5IA 4C1UA 3OENA 4JWYA 3LR1A 1ZMGA 1POTA 3K1MA 1I6AA 2WKYA 4G4PA 3G3FA 5DVJA 3PPPA 1LAHE 4H6DA 1N3WA 1MY4A 2QS3A 3GXAA 3USDA 1MM6A 4X9TA 2H4IA 3KG2A 1LGBC 5HPQA 1O64A 1I69A 3O28A 4OYVA 4ELRA 3RPWA 2HXWA 1P1WA 3H3GA 2ESNA 3MP8A 5HBCA 1JW4A 1B4HA 5DTBA 5I2NA 4GOTA 1B7HA 2OWSA 1GV8A 4XKRA 1ZU0A 1B3HA 2DE2A 5CRYA 4PFUA 1LFHA 3T9XB 4EQ9A 3IO4A 3K1NA 3GLBA 3MVYA 3IB2A 1A7LA 4FECA 3N5LA 2RC9A 4FORA 1UTHB 3RUMA 3ODBA 1WDNA 2HFBA 1B9JA 4ZZEA 4FEBA 3UIFA 3FXRA 4F3SA 4OEVA 5I56A 3K6VA 5CI5A 4G8NA 4H5FA 5J1DA 3U93A 1R9QA 1XVYA 5BWJA 2DYXA 3VLUA 3O66A 4C1TA 3R7XA 4RXLA 3K4UA 5JTYA 4LZ8A 3IAZA 3OEKA 3FD3A 4NF6B 5EHMA 1ZKBA 2VD2A 3FXQA 3C34A 4IO4A 3EHTA 2QS2A 3KN7A 2A5TB 2RINA 1B3FA 2B65A 2DP8A 2B3BA 2F34A 4BLAA 2QMWA 4ZS9A 3CSBA 2V3UA 1IEJA 4DE8A 1IXGA 3CG3A 1DOTA 4YKPA 2F35A 1NFTA 3G3KA 4I9DA 2QSXA 4OFLA 4QSDA 1B0HA 2X7PA 1MXWA 1NH7A 3S9EA 5TP9A 2QS1A 4OVJA 2Q2CA 5CMCA 1IXHA 1IXIA 1AOVA 2REGA 4GL0A 3TYHA 3EPEA 2KLFA 1BP5A 3U72A 5AA2D 2DXRA 1A99A 3MWBA 1P1NA 1GTKA 2Y7WA 2AL5A 1F9BA 1GVCA 1TFAA 2REJA 3T96B 4FE8A 4PE5B 1N76A 4KCCA 4WKMA 3C32A 3RN8A 1HSEA 1RYXA 4FJPA 3KFMA 1B32A 2NWJA 3EF7A 3QSLA 3B7DA 3H6UA 3FVNA 4KI0E 2AIXA 5F7VA 1Y4TA 2HCAA 4GL8A 3OO6A 1Q35A 2I0CA 1IZ1A 3JZJA 4R6KA 5H8HA 3TCGA 3S9LC 3ZS6A 2XD3A 4GFRA 3SEXA 4DIGA 2XXTA 4DCYA 2XXPA 1M5FA 3T9HB 3VLVA 2RKMA 4JDFA 4NF8A 2ONRA 2PT2A 1Z7NE 5AA2A 4LVQA 3PU5A 2O6AA 1Y1MA 1QUIA 2VOZA 3T66A 3VFJA 1NNKA 3OD7A 1US5A 3K01A 5KZTA 4MH5A 3TTMA 2XXWA 1FQBA 4XKNA 1UQWA 3HCQA 2O84X 3A3UA 3R6UA 4EF1A 4U2RA 3KN8A 1GR2A 3PMWA 4F39A 4F1UA 1B7ZA 3PUYE 1A8FA 3SDFA 3VXCA 1MY2A 2NXOA 3I3VA 1Q1KA 3C36A 2Z8DA 3ILUB 4TQUQ 1OVTA 3IB0A 5ITPA 4JXIA 1OVBA 1B51A 1LCFA 4LONB 4ESXA 1NH8A 2DOJA 4O3AA 4GWOA 5LOMA 3EN3A 1MRPA 3TCHA 1ELJA 4Q30B 2XXHA 3K00A 4F3GA 4XIGQ 5KDTB 2FYIA 4H8JA 1URDA 3TQLA 2QMXA 3FXUA 1SI0A 3TTLA 3TDJA 4FEDA 2OBGA 3FUZA 4ZDMA 2H25A 1A54A 1MXYA 2GFEA 1DTGA 3CG1A 2G93A 4KFQA 1PDAA 3SESA 1OQHA 4EDPA 4RK9A 4AB6A 4YB5A 3HHGA 3KOSA 4RA1A 4ELQA 2Y7IA 4NWCA 3RTWB 3C31A 1PB8A 4UACA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4G77A 3C4MA 5I2KA 4AS4A 4DCXA 4EQBA 3PUWE 3LSWA 2XWKA 5I56B 4JWXA 3HHFA 4PGPA 1ZIUA 2ZYKA 4H0WA 1FTJA 2HHMA 2YLNA 5DVFA 1D9VA 2FNCA 2DE4A 2QPQA 5JTYB 3MAMA 4GBWA 4IY5A 2ABHA 2D21A 2P2AA 3TELA 3U8QA 4O3BA 2OWZA 4I62A 3KC1A 4R6YA 1NUYA 4NF0A 4OEUA 2HEUA 1MQIA 4F29A 1FPJA 1FQEA 4DXUA 1OLAA 2DWHA 3MP1A 3IOWA 4NG7A 2XWVA 4LN5A 4R2BA 1JP4A 4PQJA 2Q2AA 5I57B 4P3LA 3UA8A 2UXAA 1LBZA 4YB6A 2FHYA 4JWOA 3RPLA 1ATGA 3TFLA 2XX9A 5I58A 2I48A 5TP9B 3MSTA 4QF9A 3MVWA 3OEMA 1FJ6A 4ZE9A 5H8FA 3GYYA 4M1VA 2WX9A 1XT8A 3IO6A 4OMBA 2HQ0A 1UTBB 1D3KA 5A5XA 1J1NA 3E4RA 4YMAA 1LSTA 1P1UA 2D5WA 5H8SA 5I84A 1VFEA 5ET5A 2UYFA 1LBVA 1D9YA 5DT6A 1BLFA 2Y7PA 2F78A 3OSRA 3SERA 1P1QA 3VXBA 3ZSFA 4P11A 4KPTA 1IQ7A 3D1RA 5AA1A 1II5A 1B52A 3S4UA 4GX6A 4PCDA 1AL3A 3G3JA 5FHNA 4YU0A 4BDRA 4GRKA 1M5BA 4MF3A 4X8RA 3S9MC 4YKJA 3RT8A 2V93A 3O6HA 3IJOB 1PEBA 3FZVA 2ZZVA 4XKQA 3IORA 3DLNA 2GRVA 2F36A 5DVIA 5CMBA 3IOVA 4U22A 2VT5A 3VLWA 3N6TA 1NKXA 3KZGA 3E3KA 3PMXA 1SBPA 1MY0A 1FQDA 1QW0A 4GLIA 3TZAA 3SEVA 5FHMA 1FTAA 4GBVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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