4ISUA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the antagonist (2r)-ikm-159 at 2.3a resolution.
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Studies on an (S)-2-amino-3-(3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolyl)propionic acid (AMPA) receptor antagonist IKM-159: asymmetric synthesis, neuroactivity, and structural characterization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein/antagonist
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4isuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4isuA02
1QUKA 1LGBC 3S2VA 3TCFA 4UA8A 4AB5A 1QKBA 1VR5A 5CC2A 1XVYA 2I4CA 2Y7KA 5DTBA 3TTNA 3MAMA 1ZTYA 3MC2A 3ILTB 4OFOA 4NF8B 1N76A 1US5A 3SESA 1T0KA 4IO7A 5I58A 1GR2A 4JWXA 1RYXA 4JWYA 4GL0A 4RPNA 1JW1A 5JTYA 5AA2D 4G8HA 2V3TA 4POXA 4RYAA 3DP4A 4NF5A 3WAEA 3KN8A 4QFKA 3CI8A 1LB8A 4G68A 3Q27A 3FATA 3QAXA 2YLNA 5FTHA 1A55A 3FUZA 3B7DA 1BIYA 4U23A 3VFJA 1B7HA 3RNNA 3RGYA 3L6HA 5HBCA 4GXSB 1LCTA 4LONB 5CM6A 4I9DA 3PUWE 4DCXA 2Z23A 4O3AA 3K1MA 2B65A 3CFLA 3OXNA 5DEXB 4GXAA 1ATGA 4ZEIA 3GBBA 4X9TA 3FJ7A 4Q8RA 4N07A 2NUVA 4P0GA 3KN3A 5KCJB 1B2HA 4BDMA 2DSFA 4XIGQ 4F31B 2VD3A 3K0VA 3TODA 3SEWA 4RPOA 1UQWA 5A5XA 2I4BA 2OZZA 3K1NA 5KDTA 3ILUB 3SKPA 4U22A 4WEDA 1B51A 3DELB 3O6IA 4F3GA 4FORA 2Y7IA 3KG2A 1SYHA 3IL1B 4R6YA 1NH8A 3KEIA 5AA1A 4OWDA 4F19A 1FQBA 3RY3A 1HSEA 2DP8A 3K6WA 2Y7PA 1SW5A 3DLNA 1XT8A 3H7MA 4R72A 4TLMB 1FTJA 4FJPA 4P0IA 3VXBA 4HTGA 3DM0A 4FECA 3UA8A 3LSWA 3VVFA 4E0WA 3Q28A 3UK4A 3QK6A 4QSCA 1Y4CA 1H45A 2F6GA 4LUBA 3FV2A 2VGQA 4JB7A 1ZMGA 4IGRA 3S9MC 4HW8A 3HV1A 4HCYA 3IOVA 4LATA 1MG1A 2QPQA 1LBBA 4AB6A 3GLBA 3ZSFA 1SD3A 1UTHA 4I62A 4NF5B 3KJ7A 4DIGA 3K02A 1B40A 1XHYA 3QIMA 1LFHA 1GTKA 4IO3A 5H8QA 5CMBA 4IB2A 1URDA 5I2NB 3C31A 1XVXA 1S7YA 4XKPA 3N6TA 1MY1A 1MPBA 2RINA 5CBSA 1H44A 2UVGA 4FEBA 1M5CA 3VE1B 3TTMA 1AOVA 1FTKA 1O64A 1BTJA 3R7XA 4ESWA 2I0CA 3RT6B 5F7VA 3KN7A 1Y9UA 1H43A 3H6TA 3OELA 5M2VA 1NNFA 5H8FA 1POY1 1TFAA 1UTBA 1IQ7A 1AMFA 4IO6A 1N84A 3N94A 4IO5A 3UGWA 1LFGA 4RK2A 4GVOA 1B0LA 1D4NA 3C32A 2GH9A 2ZYMA 1Y3NA 1A7LA 3FIRA 2F78A 4PP0A 3O6GA 4X1BA 2P1SA 4ZZAA 1FCKA 1MY2A 5CMCA 2PBWA 2DE2A 4ELPA 3HSTA 4DXUA 4OEVA 4ZEBA 5ITPA 4PFYA 3T93B 1ANFA 2PT1A 2RC9A 1SI0A 3M3LA 4EUOA 3TKDA 1TWYA 4I1DA 2DOJA 2NWJA 3MPKA 3FVKA 3K2DA 2DVCA 4NTLA 4KCDA 2UYFA 5JEIA 1QW0A 1R9LA 3O2AA 4NWCA 3K01A 4DXCA 4UACA 3H06B 4I8CA 1B3FA 1EZ9A 3TMGA 1MQGA 1PDAA 5FHMA 4EF1A 1B5IA 3HPIA 2F8DA 4DZ1A 1LAGE 3MP8A 3O6HA 4OXVA 2QS1A 3CVGA 1USYH 4K3FA 3T66A 1URGA 1MXZA 2VP1A 4M1VA 3A3UA 1AL3A 1LB9A 2PMSA 1I6AA 3IOTA 3OSRA 4YICA 3MVZA 2F7AA 1B5HA 5B7DA 2DYXA 3SEVA 4OMBA 2QMWA 1JW4A 5I56A 4THIA 4YAHX 4YKKA 4PETA 3IB1A 3MZBA 3VVDA 2B3FA 1LCFA 1SYIA 2BJJX 1EZPA 1Y20A 1M5BA 3G3IA 1URSA 4IY6A 3O28A 1IIWA 2HZLA 3T96B 1KWHA 5H8FB 2F6PA 3HCQA 3SDFA 2ZXTA 1Y4TA 2G93A 3CSBA 3KOSA 3O97A 5KCJA 1R9QA 4HS7A 2GHAA 2DWAA 2GRVA 2XXRA 1DTGA 1BKAA 3LSFB 3EQ1A 4BDOA 1MQDA 1L5TA 4MH5A 3IO4A 3Q26A 2WKYA 3N26A 1B7UA 2H25A 2QS4A 4BDNA 2D21A 2V3QA 3K4UA 3MP6A 3K6UA 1H3DA 1OLCA 4FATA 3G3GA 1B4ZA 3V89B 3O66A 3PPPA 4LA9A 3N6UA 5FHOA 4KFQA 1B46A 1N3XA 1B4HA 1VFEA 3EN3A 1I6QA 4ZEFA 3TEPA 4RK9A 4YU0A 4AQ4A 4O3BA 2HFBA 4YB6A 3LC8A 4F1UA 1JETA 3FV1A 2FNCA 1B3LA 2O1LA 4JDFA 3TQWA 2O51A 3H6VA 1OLAA 4ZE8A 1ZLQA 1P1QA 3W9VA 1EH3A 4KHZE 5ITOA 2X7PA 1MM6A 2F7CA 3TAJA 1N7XA 3UP9A 1PB9A 4Z7EA 2Y7WA 4WXJA 3EHSA 5I56B 1N3WA 3OMBA 5I2NA 1LBCA 4E0XA 3V8XB 3FGSA 5ICQA 3FASA 1NNKA 2P0SA 4OTEA 2ZNUA 3TELA 4U1ZA 4TQUQ 2UVJA 2RCBA 3RPWA 1AH5A 3ODBA 4LQ5A 2I48A 5I57B 2E0SA 3CG3A 3RLFE 4YMAA 1QUJA 4C0RA 3M3KA 1IXIA 1IXCA 4QFOA 3MQ9A 2ANJA 1MY4A 3LSXA 5I59A 2OJTA 5KZTA 3THIA 2V84A 3PMVA 2O7IA 3C34A 1A8FA 3IB2A 4Q0CA 4R75A 2XD2A 5L8DA 4EQ9A 1OIBA 2NVUB 1Y1MA 2HAUA 2I3WA 4KYDA 1WDNA 2DE4A 2OK2A 2A5SA 4FIMA 1RKMA 2XD3A 1B58A 3C9HA 1MPDA 4LZ7A 4ZE9A 4Z0IA 3T9UA 1FQFA 3E9XA 3A3CA 2PVUA 4TLLB 4N6PA 4HCWA 2ONRA 1ELJA 3C33A 4DDDA 5TP9A 2A5TB 1DSNA 3MVWA 1DTZA 4ESXA 4GQOA 4H8JA 3CR9A 3EPEA 5K2YA 5H8SA 3PGFA 3UN6A 3FJMA 5LOMA 1MM7A 4OFJA 3KZGA 2Z22A 4EQ7A 1BP5A 4NEDA 1TXFA 5DVIA 2ZNTA 1Y1ZA 4NE4A 5DVJA 1MDQA 5FHNA 3S9LC 3EHTA 3HN0A 4MBPA 4OQOA 2XXIA 2QJEA 3OSQA 5B70A 5AA4B 3MUQA 1QVSA 3PPOA 1MRPA 1B05A 1Z7ME 4RXLA 4F3SA 1QKAA 4GL8A 1MH3A 2DWIA 4F3BA 3RTFB 3SEUA 1LAHE 3LBSA 3FVGA 3MZ9A 3KGCA 2QL3A 2UYEA 3KSJA 3RTWB 3BFUA 5AE4A 5AA3A 1RYOA 5BUUA 2E1SA 4OESA 3MVXA 3G3KA 1JNFA 3IB0A 2RC7A 3G3HA 3TUSA 3T9XB 3TZAA 3TTLA 3WAFA 2I58A 3TCGA 1NMUA 4ZEKA 3IJXB 4JBZA 4IY5A 5CMMA 3QUFA 4X1DA 4U4SA 4OERA 3RN8A 3TDJA 2B3BA 3MJNA 2OCUA 2R6GE 4YZZA 3RT8A 1AIVA 4ECFA 1M5FA 2HEUA 3H6UA 4KD5A 3A09A 3W9WA 5I59B 3GBAA 3VXCA 2GHBA 1IZ1A 2Y84A 1H76A 1DOTA 2FA7A 4L17A 1B3EA 2DS9A 4Q30B 1N7WA 1SDXA 4IO4A 3LR1A 4POWA 3PPNA 1A40A 1PEBA 1Y3PA 4ELRA 1SW1A 5I84A 2XXHA 2HAVA 3E4RA 4ND9A 2XXWA 3MP1A 5I2KB 2I0BA 2HCAA 3QXMA 2ZMBA 2AL4A 2F97A 5TP9B 4GFRA 2Y7RA 2Q8JA 3B6WA 4ONYA 1B3HA 3U1OA 4ZS9A 2XX9A 3IO6A 3TTKA 4F29A 3QYTA 4DXBA 2V25A 2UXAA 4PFUA 2V3UA 4JSOA 3CFXA 1P99A 2LAOA 1N04A 3MVYA 4U4XA 4DLDA 3ZKKA 3PMXA 2XHDA 3D4CA 4H6DA 3M8UA 4R6KA 3VV5A 4R9FA 4MFIA 1M5DA 1B32A 5IKBA 3ECRA 3IK6B 3CRBA 4F18A 3Q25A 1MY0A 4H67A 1XS5A 1M5EA 4N13A 3FVNA 2ABHA 4GWOA 2QS3A 1YPNA 3DP6A 1FTOA 1OQGA 1IITA 4NF4B 4EF2A 2OWSA 1MQIA 3IAZA 4G68C 1MQHA 1HSLA 4G8MA 3H4ZA 3QSLA 3LSLA 1ZU0A 2KLFA 3I5OA 4H0WA 2XXUA 2XX7A 2IEEA 3SEYA 4FE8A 3V83A 4RY1A 4KYEA 2F35A 3AXFA 3D4GA 3F11A 1GV8A 1D9VA 1WVJA 4H8IA 1S50A 5DYHA 1IUDA 1XC1A 3TFLA 1FQDA 2PYYA 4LZ5A 2OBGA 1OVBA 1SI1A 5I57A 2F5XA 3Q29A 4YB5A 2Q9TA 3T9HB 1MXWA 3I3VA 4XKRA 4OZ9A 4NF6B 1TT1A 4QFPA 3VLVA 1Y3QA 4P11A 3CIJA 2H5YA 3OO7A 4MF3A 1UIVA 4R6HA 3TQLA 4GD5A 3MPLA 1OQHA 4NWDA 2VOZA 3R6UA 1A54A 1QJMA 3IJOB 3KSXA 1VE4A 3PMWA 4OVJA 3G7WA 1J1NA 4ZECA 1VSOA 4YKPA 4ELQA 5K2XA 1NNPA 1QUIA 5JK4A 4RA1A 1CB6A 2VD2A 3V5AA 2XXTA 4GOTA 3ONMA 4WKMA 2A5TA 1PBQA 3OO8A 4R74A 2QRYA 1P1NA 1OVTA 1P1WA 3IORA 2XXVA 1II5A 3IOUA 1SBPA 2D5WA 3EF7A 1EU8A 5CMKA 4FEDA 1LSTA 1B52A 2NOOA 2Z8EA 1NH7A 2I6EA 3BKIB 4DE8A 1IXGA 2O69A 1FTLA 1MXXA 3N5LA 2REGA 4YMBA 1LAFE 4NMYA 4H5GA 1SW2A 3CSGA 1MDP1 4EQBA 3FXUA 2RF1A 4LQ2A 4EXKA 4F1VA 2Q2AA 3PUZE 5AA4A 1YAEA 4QHQA 3CFZA 2DXYA 1O7TA 1I69A 4F1YA 4XXUA 2UVHA 3K1PA 3LUYA 5TU0A 4YB7A 2ALUA 3TPAA 4QSDA 4IO2A 3VLWA 3JYRA 4KCCA 2HZKA 1ZKBA 1B3GA 1O63A 3QUJA 3S9NC 5CBRA 1Z7NE 5TPAB 2O1MA 3MZ1A 1VFDA 4JWOA 2IA4A 4LVQA 4WEPA 2ZYOA 4OFLA 2AL5A 2F36A 3JV9A 2O7UA 3FJGA 4JXIA 1GVCA 1B1XA 4F22A 4OEUA 5H8HA 1F9BA 3OO9A 4KR5A 3IR1A 3FXQA 2DVZA 3SEXA 2YJPA 3PUYE 1FQCA 3PUVE 4QF9A 3H6WA 1PBPA 2Q88A 5H8NB 3K00A 4IGTA 3CG1A 3UIFA 5F1QA 1NNTA 4F2OA 1MXUA 1MQJA 3TCHA 4OYVA 4PQJA 1LLSA 2DWHA 3FVOA 3KOTA 4ISUA 2XXQA 4TOZA 2XXPA 5I2KA 2OLBA 4QRZA 3PPQA 4QFNA 2R71A 3E3KA 1MPCA 1US4A 4PFWA 1XOCA 2DQVA 1B7ZA 4LP2B 4BDQA 4U2RA 4QFLA 1LAXA 5FTIA 3UORA 3PUXE 1UIUA 3KFMA 4H65A 1HSJA 3FZVA 3PD8A 1SVXB 3ZS6A 3KBRA 4BDRA 3OD7A 3HHGA 2F7BA 4GF8A 5L9MA 3PPRA 1DPPA 1A8EA 4R2FA 1YTVA 3L6GA 1PC3A 1JEUA 4R73A 5CRYA 1WODA 4DCYA 5L9SA 4H5FA 3TYHA 1B6HA 2ONSA 1I6BA 5HM4B 1R1NA 2QS2A 3TTRA 3W15C 5I58B 5HPQA 4O3CA 1MXYA 3JZJA 1B5JA 2H99A 4MLVA 3OO6A 5JTYB 3OENA 3G3FA 3HHFA 3R26A 4NF4A 2AYSA 2UVIA 4G68B 5ELVA 2HXWA 2O84X 2Z8DA 5L9OA 3MWBA 3T22A 1DMBA 3IOWA 4PFTA 4XKNA 2AIXA 4F2QA 4ZEDA 2X7QA 4F39A 3G3JA 2X26A 4GRKA 3GZGA 1Q1KA 2RC8A 3S9EA 1EZOA 5H8HB 4M4GA 3OEMA 2I3VA 2H4IA 3SERA 3U72A 3PV0E 3O29A 2G29A 3BBRA 3PD9A 4H1XA 1JEVA 4EXLA 2GFEA 4LZ8A 2ESNA 4NF6A 4R2BA 3O9PA 2H9BA 5AA2A 1JVYA 4OENA 4OETA 5BWJA 3C4MA 1P1OA 5A5XB 1N0TA 2XXYA 5KDTB 2REJA 3U94A 5J1DA 3P7IA 2THIA 1SQYA 1LFIA 1BLFA 3RQTA 4C1TA 1FTMA 5EHMA 1B9JA 4G8NA 5EYFA 4F3PA 2M8CA 1ZBMA 3USDA 3H03A 4X48A 3T9VA 2Z8FA 1IEJA 1ZJLA 3RUMA 1JVXA 4Q5TA 5ISUA 5EHSA 2RKMA 4G4PA 1R6ZA 4RNSA 2O68A 3K6XA 1FQEA 4G77A 1MXVA 2DE3A 4FAJA 4XKQA 3B6QA 2ZYKA 1CE2A 2ONKE 1POTA 4QSEA 3MW0A 1JQFA 1D3KA 3VVEA 1B1HA 1B0HA 2CZLA 3SETA 3C35A 2QMXA 2DXRA 2CMOA 3HO7A 3VDFA 1UTHB 4C1UA 3M3FA 4NF8A 4GIZA 1FW0A 1MY3A 3U93A 3MBPA 5DVFA 2QSXA 1DPEA 1NFTA 3EHUA 4KQPA 3IX1A 2D3IA 2F34A 4JSDA 3C36A 3PU5A 5H8QB 3U8QA 4KYSA 2RCAA 4U21A 3H3GA 3K6VA 4PE5B 2FYIA 5CI5A 1TFDA 1JW5A 1S9TA 4RJZA 2YPNA 3FXRA 1YCJA 2DWJA 3E13X 4BLAA 5TPAA 1A99A 1NKXA 3KJTA 4U1OA 1GGGA 1QULA 2ZYNA 2Q89A 1PB8A 2OWTA 2NXOA 2V93A 2PT2A 4G2ZA 1OMPA 2W7YA 3OEKA 2H98A 1MH4A 4KPTA 1P1UA 4BDLA 5AA2B 4OHNA 2ZNSA 2R9JA 1NL5A 1FQAA 3I6VA 3ZKLA 1UTBB 5DEXA 4KI0E 4XTCQ 4YKJA 3DP8A 4ZDMA 3BFTA 4ELOA 5H8NA 5ICTA 1PB7A 2XXXA 4GLIA 5IAIA 2PX1A 1SW4A 2P2AA 2VHAA 4EDPA 2Q2CA 1USYE 1Q35A 2HQ0A 1D9YA 4YKIA 2I49A 4ZZEA 1ZIUA 3GXAA 4R9GA 3OOAA 2O6AA 2XX8A 4MLQA 3FD3A 1IXHA 5DT6A 1MS7A 3B6TA 3U92A 3S4UA 3VLUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QUKA 1LGBC 3S2VA 3TCFA 4UA8A 4PGPA 2WEFA 4AB5A 3B50A 3E79A 4NAPA 3RPLA 1QKBA 5A5LA 1FPFA 1VR5A 5CC2A 4N81A 1XVYA 2I4CA 2Y7KA 5DTBA 3TTNA 3MAMA 1ZTYA 3MC2A 3ILTB 4OFOA 4NF8B 1N76A 4JVIA 1US5A 3SESA 1T0KA 4IO7A 5I58A 1GR2A 4JWXA 1RYXA 4JWYA 4P3LA 4GL0A 4RPNA 1D9QA 1JW1A 5JTYA 5AA2D 4G8HA 2V3TA 4POXA 4RYAA 3DP4A 4NF5A 3WAEA 3KN8A 4QFKA 3CI8A 1LB8A 3LUZA 4PE3A 4G68A 3Q27A 3FATA 5EQ7A 3QAXA 4GWYA 2YLNA 3CHGA 5FTHA 1A55A 5LDZA 3FUZA 3B7DA 4O8MA 1BIYA 5EYGA 4MNIA 4U23A 4HE0A 3VFJA 1B7HA 3RNNA 3RGYA 3L6HA 5HBCA 4GXSB 1LCTA 4LONB 5CM6A 1YXIA 4I9DA 3PUWE 4DCXA 2Z23A 4N17A 1FBGA 4O3AA 3K1MA 2B65A 3CFLA 3OXNA 5DEXB 4GXAA 1ATGA 4ZEIA 3GBBA 4OVSA 4X9TA 3FJ7A 4N91A 4Q8RA 4N07A 2NUVA 4P0GA 3KN3A 4HE1A 5KCJB 1B2HA 4BDMA 2DSFA 4XIGQ 4F31B 1NV1A 2VD3A 3K0VA 3TODA 4GX6A 3SEWA 4RPOA 1UQWA 5A5XA 2I4BA 2OZZA 2WYKA 3K1NA 5KDTA 1RDYA 3ILUB 4PBHA 3SKPA 2HPGA 4GWSA 4U22A 4NN3A 4WEDA 1DCUA 1B51A 4PBQA 3DELB 3O6IA 4F3GA 4FORA 2Y7IA 3KG2A 1SYHA 3IL1B 3SZPA 4R6YA 5IZ3A 1NH8A 3KEIA 5AA1A 4OWDA 3PTYA 2VPNA 4F19A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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