4JWYA

Glun2d ligand-binding core in complex with propyl-nhp5g
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
281
structure length
269
Chain Sequence
QHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARGTTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural determinants of agonist efficacy at the glutamate binding site of N-methyl-d-aspartate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 269
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwyA02
4OEUA 4IO5A 1Q35A 5DVIA 4HCWA 3V5AA 3T93B 3N5LA 3FIRA 3H6WA 3HV1A 2F7BA 2F6PA 4IY6A 3HSTA 2DSFA 3CG3A 5ISUA 4R75A 2NWJA 4KYDA 4ESXA 1JW4A 3D4GA 1QKBA 3PMWA 2GH9A 3O9PA 4GXAA 3MP1A 1LAXA 2DWJA 1H45A 3ZS6A 1Y3NA 3VXBA 3W9VA 1DPPA 2NXOA 3H3GA 3M3FA 3VV5A 4OTEA 4GXSB 1HSJA 1B1XA 2I49A 4KYEA 1FQFA 2H98A 1LFIA 3CSBA 1MPCA 3S9EA 1M5DA 1MXZA 4OZ9A 3CSGA 1QUKA 2O6AA 4F2QA 5KZTA 1WODA 3CVGA 3FVOA 3PD9A 2O68A 4Q30B 1I6BA 4YB7A 3T9XB 3SETA 3PV0E 1MQJA 5AA2A 3TUSA 1MY0A 5AA2D 2XXRA 4IGRA 1B0LA 4NTLA 2X26A 3C4MA 3UIFA 1B32A 4JB7A 1B4HA 2OWSA 3MZBA 2UVJA 3ODBA 2IEEA 1MQDA 4N07A 3PPRA 3LUYA 1MY3A 5JEIA 2GHAA 1I69A 3TODA 4Q0CA 1P1WA 3O6GA 1IIWA 1NH8A 1FQCA 2QS1A 1DPEA 3SESA 5H8HA 4QHQA 5CMMA 4M4GA 3HN0A 2UVHA 1A40A 3R6UA 2V93A 3MZ1A 3FXUA 2XHDA 3Q25A 3IR1A 3TTRA 1B1HA 1NFTA 1QW0A 1ZLQA 2HEUA 1LAGE 3G3KA 3KJ7A 4BDLA 4KI0E 3FVKA 1AIVA 4IO4A 2ALUA 4ND9A 3T9VA 2Q88A 3U8QA 2VGQA 1XS5A 3K2DA 3K02A 3H4ZA 3VLUA 4OETA 1B58A 4IO3A 5H8QA 5L8DA 3V8XB 3C34A 4BDQA 5F1QA 1B51A 2CMOA 1JEVA 3A3CA 3PUXE 3KOTA 4O3AA 4G8NA 1GV8A 3KOSA 5CRYA 2H9BA 3CR9A 4Z0IA 1A8EA 2XXYA 3VDFA 2DYXA 2HCAA 1ZTYA 1QJMA 2F7CA 1OIBA 3C32A 3DELB 3THIA 3UORA 3PGFA 4ECFA 1GVCA 4G68A 4MBPA 3LSWA 5TPAA 5L9OA 2R6GE 4KHZE 3FUZA 5K2XA 4AB6A 2F36A 4KYSA 4DCYA 2IA4A 4X1DA 3T9UA 3T9HB 5DVFA 4LZ5A 3K1MA 2Y7KA 3G3FA 3FGSA 2ZXTA 1N84A 3UN6A 5JTYB 3FVNA 3K1NA 4KQPA 5AA4B 1SYIA 2DE3A 1YTVA 5BUUA 3K1PA 2OBGA 2ZYOA 3ILUB 1OMPA 3TELA 4ZEFA 3OO9A 4R6KA 3LSFB 1QUIA 4H5FA 2PT2A 5FHNA 3FJ7A 3OSQA 3OMBA 4R2FA 1MQGA 2DWAA 4LONB 3Q27A 4EF2A 2ONRA 1ANFA 4UA8A 4NWDA 4F1YA 2FYIA 3OENA 2V3TA 4FORA 2I6EA 2Z23A 2OLBA 3TEPA 2V3QA 4RK2A 4F39A 4EDPA 1B05A 4F2OA 4ZECA 2Q9TA 5KDTA 2X7QA 4H67A 2RC7A 3H7MA 1SD3A 1XVYA 3MVZA 1LAHE 3EF7A 3I5OA 4XKPA 4EF1A 4U22A 2H4IA 5DT6A 5CMKA 3B6QA 4M1VA 2E0SA 5M2VA 2BJJX 2QS2A 4ELRA 3VVFA 1B7HA 1FQEA 1LCFA 3UP9A 4YZZA 2OK2A 4BDMA 1JW1A 5CI5A 2DOJA 1EZ9A 3ECRA 4F18A 4GQOA 1GR2A 1ATGA 3K4UA 2DXYA 4GLIA 2I3WA 4PE5B 3TCHA 3CIJA 1FQBA 1BIYA 1AMFA 2GFEA 3VFJA 2DVZA 4KPTA 3ZKLA 3FATA 1FTKA 2H99A 1P1QA 2I0CA 3HHGA 2XD2A 2DWHA 2DVCA 3F11A 1N3XA 2ONKE 3OOAA 1URDA 2NOOA 3KN8A 3TAJA 3OEMA 1H44A 4QF9A 3QYTA 2ZNTA 5JK4A 4F3GA 1HSEA 3G3JA 3E9XA 1FCKA 4DXBA 3WAFA 4OHNA 2R71A 2XX8A 1M5FA 1SW4A 1M5EA 1DSNA 3OXNA 3U1OA 3PPOA 5I56A 1OVTA 3LSLA 3LC8A 2FNCA 1S9TA 2THIA 1FW0A 3PMVA 4NF8A 2QPQA 2UVIA 5ITPA 2NVUB 4XXUA 1USYH 4ZEIA 1MDP1 1RYOA 2DE2A 2P2AA 3JYRA 1IEJA 3QAXA 1JQFA 1N04A 5B7DA 3C36A 1B3HA 3TYHA 2B3FA 3EN3A 4OVJA 3CFXA 2OWTA 3CFLA 2ZNUA 1XOCA 4I9DA 4DXUA 4PETA 3MP6A 1BLFA 2HXWA 1MDQA 1XC1A 1ZMGA 2D3IA 3TMGA 1GGGA 1POTA 4HW8A 1UTHA 2Y7IA 1IITA 1LFGA 4G68C 2O7IA 3G7WA 5H8FB 1Z7ME 3FJMA 5FHOA 3KSXA 4YMBA 4YICA 1LB9A 3DM0A 2O1LA 4LATA 1HSLA 1JW5A 2XXQA 2A5TA 1VFDA 1DOTA 4NF4B 3C9HA 4U4XA 1Y1ZA 1BTJA 2O51A 3LR1A 2DQVA 3C31A 5HPQA 4DDDA 3E3KA 4H8JA 3M3KA 3O2AA 3Q28A 3S4UA 4K3FA 2REJA 4QFKA 4P0IA 5I2NB 5HM4B 3TFLA 3DLNA 3KGCA 3DP8A 2V3UA 1Q1KA 2ABHA 4TOZA 4EQ7A 3IX1A 1PB7A 1VFEA 1S7YA 3IOUA 4DE8A 1ZKBA 3R26A 4R6YA 1P1UA 3U93A 5I2KA 1N0TA 3W15C 4I62A 1JEUA 3N94A 2O7UA 3FXRA 4WKMA 1M5BA 1MY2A 1MM7A 4IY5A 5CM6A 3H06B 1MG1A 1DTGA 1Z7NE 2F8DA 4R2BA 2X7PA 4RNSA 2OZZA 1ZU0A 1IXGA 1PB8A 3SDFA 1QUJA 4LQ5A 4MLVA 2OJTA 1BKAA 2XXIA 1SBPA 2I4BA 2F6GA 1IQ7A 4G2ZA 1SDXA 4P11A 4TQUQ 4RXLA 3Q26A 2R9JA 2F5XA 5I57B 2HZKA 1B5JA 1NNTA 4KR5A 3PPQA 5I58A 5A5XB 5KDTB 1SI1A 1Y1MA 2O84X 3MAMA 5DTBA 1A8FA 1TFAA 3B6TA 1OQGA 4OFJA 3KBRA 4GF8A 3RT6B 3RTWB 2I48A 1WVJA 1YAEA 3O97A 4HTGA 3MJNA 4PQJA 4LQ2A 1MXYA 2Q2CA 3WAEA 5K2YA 4NEDA 3P7IA 1EH3A 3H6UA 2UYEA 1USYE 4WEPA 2D21A 5CMBA 3TPAA 3K6UA 3KFMA 1UIVA 1T0KA 2FA7A 1H43A 1XVXA 3BKIB 2RINA 1JVYA 2B65A 4BDNA 1B52A 4MLQA 2ZNSA 4H0WA 3EHUA 5AE4A 3JV9A 1B7ZA 5TU0A 5DVJA 2XXVA 4ESWA 3USDA 3Q29A 4XKRA 3IOWA 1URSA 4X48A 3U72A 2RCAA 1MH4A 4U2RA 3IORA 1R9QA 3QIMA 4AQ4A 5AA3A 3S9MC 4RY1A 1P1OA 4FE8A 4X9TA 4NF5A 4Z7EA 2Z8DA 3MUQA 3EHTA 4GOTA 5DEXB 4U4SA 2H25A 4HS7A 4EXKA 1B0HA 1B5IA 4F1UA 5L9SA 3RT8A 3VLVA 3OO8A 3S9NC 1MPBA 2W7YA 5I59B 4XKQA 4RYAA 4E0XA 3TTMA 1I6QA 4I1DA 1POY1 1UTBB 3O29A 4H6DA 3R7XA 1YCJA 3MVWA 4ZE9A 1ZBMA 1KWHA 2QMWA 3N6UA 4R73A 4XKNA 1MY1A 1IXIA 4GL0A 1D4NA 3FASA 5EYFA 1UTHB 4FECA 1LB8A 4N13A 2F34A 1LLSA 4FJPA 5TP9A 4FAJA 1QKAA 4F1VA 1NNKA 3RLFE 1IZ1A 4QSDA 2XXUA 4U1ZA 1OLCA 1SW2A 3GLBA 2XD3A 3KJTA 3TQWA 4POWA 4ZZAA 2XXPA 3C33A 3TKDA 4PFYA 2YJPA 5J1DA 3I3VA 4YU0A 1LGBC 1GTKA 2ZYMA 2AL4A 4IO6A 4NMYA 1B3LA 2Y7PA 2I58A 2Z8EA 4GIZA 3OEKA 4DCXA 3PPPA 3BBRA 3AXFA 1EU8A 3OSRA 2VOZA 4ZEDA 4R72A 2GHBA 4Q5TA 4F3SA 3IOTA 5EHSA 4U23A 2QMXA 2DP8A 4F3PA 4WXJA 4H65A 1B3EA 1PBPA 1I6AA 1AL3A 3H6VA 4KCCA 4FEDA 3IK6B 3CG1A 2VD2A 3QK6A 3GBAA 3ZSFA 2Q2AA 2QS4A 3PD8A 5CBSA 4TLLB 1AH5A 2Y7WA 3OD7A 2RC8A 1IUDA 4YKKA 4OYVA 3K6WA 1NMUA 4F29A 5AA2B 1Y3PA 3DP6A 4NE4A 3FV1A 2HAUA 2PMSA 4ZS9A 4MFIA 1P1NA 4OWDA 4HCYA 1RYXA 1R1NA 3I6VA 2CZLA 3O6HA 2ZYKA 1N7WA 3RN8A 3CI8A 1TFDA 2P1SA 4ZE8A 3O28A 3MPLA 2AIXA 1SW1A 2Q8JA 1ELJA 1FTOA 2QSXA 1WDNA 1B9JA 3UA8A 4JSOA 5H8HB 2QJEA 3SEYA 3K00A 4MF3A 1H76A 1QVSA 4EQBA 4ELOA 1Y9UA 3EPEA 5BWJA 1F9BA 1MPDA 4KCDA 3IB2A 3IB0A 5DYHA 1PBQA 2G29A 3K6XA 1MXUA 1EZOA 1J1NA 2ONSA 4BDOA 5LOMA 2QRYA 3TTNA 3TTKA 3OELA 3W9WA 4NWCA 5H8QB 5JTYA 2NUVA 2I4CA 4G8MA 4YMAA 3LSXA 4H1XA 1SQYA 4POXA 1QULA 4EUOA 3MZ9A 2OCUA 3IO6A 3MWBA 3UK4A 2O69A 4QFPA 1Y4TA 3RPWA 1A55A 4GL8A 2RF1A 4YB6A 4MH5A 3G3IA 4C1TA 4OFOA 3IO4A 1EZPA 3KEIA 1NL5A 4GVOA 4QFNA 3MBPA 4NF5B 4JWYA 4G68B 4OFLA 4G8HA 1S50A 5TPAB 3CFZA 4DLDA 1D3KA 2F7AA 4DZ1A 1NNFA 3FZVA 3SEWA 3VXCA 5EHMA 4AB5A 2O1MA 3S9LC 3C35A 4DIGA 3PUZE 3ZKKA 3KN7A 4L17A 2KLFA 4OENA 4ZDMA 3JZJA 3FV2A 3EQ1A 1DMBA 3L6HA 4FEBA 4U21A 3QXMA 1D9YA 1MRPA 3D4CA 2I3VA 1SI0A 5H8NA 3FVGA 5TP9B 3GBBA 4BDRA 1ZJLA 2G93A 3U94A 2XX7A 3IB1A 3N26A 2H5YA 2HFBA 4ELQA 5CC2A 1N76A 5HBCA 1TWYA 4JDFA 4F22A 3GZGA 5FTHA 5KCJA 2REGA 4ONYA 4GFRA 4JBZA 2RKMA 3M3LA 1PC3A 2VD3A 4RPNA 1B4ZA 4YAHX 2DWIA 1FTJA 1Y20A 1URGA 1AOVA 4F19A 3OO7A 3HHFA 3K01A 3U92A 3PPNA 1UQWA 3UGWA 2XXTA 2HQ0A 4IO2A 2RCBA 3B7DA 4JXIA 1VSOA 1A54A 2VP1A 2UXAA 4YKJA 1LFHA 3T66A 2M8CA 4YKPA 5ITOA 4YKIA 3QUJA 3TCFA 3IL1B 3SEVA 4Q8RA 4G4PA 3TCGA 3IOVA 4JSDA 1MY4A 4ZEBA 1CB6A 3MVXA 3FXQA 2XX9A 1B46A 3MP8A 5ICQA 1L5TA 4LUBA 3KN3A 3T22A 3KG2A 1IXCA 3DP4A 1FTLA 4RPOA 4GWOA 4JWOA 1MQHA 1NKXA 3G3HA 3GXAA 4NF6A 4OESA 4R9GA 3RUMA 3SERA 1DTZA 3H03A 3PUYE 1JETA 3CRBA 1FQDA 3OO6A 4QFLA 2LAOA 1JVXA 2DS9A 4R74A 5AA1A 3E13X 2PX1A 5H8FA 1US5A 2DE4A 3MQ9A 2HZLA 2AYSA 2Z8FA 1US4A 2UYFA 1O63A 4RA1A 3KZGA 4THIA 4IB2A 4DXCA 2F35A 4N6PA 5CMCA 3IJOB 3RTFB 4R6HA 4PP0A 3A09A 3RY3A 1MH3A 2F97A 3QUFA 2XXXA 2XXWA 4P0GA 4FIMA 5F7VA 4NF4A 3K0VA 4TLMB 5I56B 3PUVE 1SYHA 4JWXA 1OQHA 4C0RA 3BFUA 1FQAA 4XIGQ 4NF8B 3M8UA 5FHMA 3RQTA 2F78A 3PMXA 2ESNA 1RKMA 2QS3A 5ICTA 1O64A 4O3CA 5I2NA 4LP2B 3A3UA 4YB5A 3FD3A 1LCTA 3VLWA 3VVDA 4RJZA 5IAIA 5I84A 1MS7A 4H5GA 3T96B 3G3GA 1MQIA 1N7XA 3TTLA 3HPIA 1R9LA 1M5CA 2Q89A 2ZMBA 5H8SA 1H3DA 4C1UA 1XT8A 4GRKA 1NNPA 4X1BA 4LA9A 1B2HA 4IGTA 1FTMA 1LBBA 3ILTB 1SVXB 3IAZA 3LBSA 2A5TB 3ONMA 3IJXB 3RGYA 3HO7A 2B3BA 2VHAA 3MPKA 1D9VA 3VVEA 1B40A 4U1OA 1MXVA 2Y7RA 3PUWE 2XXHA 5CBRA 1IXHA 1OVBA 3QSLA 3VE1B 1II5A 4RK9A 2Y84A 3B6WA 5I57A 4OERA 1NH7A 4ELPA 4G77A 4UACA 1UIUA 1SW5A 5A5XA 2DXRA 4OQOA 1Y4CA 3TQLA 1P99A 3TZAA 4EXLA 2E1SA 5I2KB 1O7TA 3BFTA 1CE2A 4O3BA 4QRZA 2UVGA 3HCQA 4E0WA 3TDJA 3N6TA 3L6GA 4OXVA 1MXXA 2YLNA 2ANJA 3MW0A 3KSJA 4XTCQ 4OEVA 1LSTA 2QL3A 1LAFE 4IO7A 4FATA 1JNFA 3SKPA 1BP5A 5H8NB 3EHSA 4PFWA 1VE4A 4ZEKA 4KFQA 1B6HA 1TT1A 1A99A 5KCJB 3O66A 3MC2A 3PU5A 4LZ8A 4KD5A 2PVUA 4QSEA 5I58B 5B70A 2Z22A 3RNNA 1R6ZA 3MVYA 1B7UA 1A7LA 2P0SA 4ZZEA 4H8IA 4QFOA 4BLAA 4LVQA 2YPNA 2PYYA 3FJGA 2PT1A 2D5WA 4QSCA 2AL5A 1LBCA 1VR5A 2RC9A 3V83A 4R9FA 2I0BA 5DEXA 4WEDA 1MM6A 4OMBA 1OLAA 3E4RA 4F3BA 1B5HA 1PB9A 5FTIA 1TXFA 1B3FA 4I8CA 3SEUA 3O6IA 3K6VA 5L9MA 1N3WA 1PEBA 1XHYA 2A5SA 5I59A 4F31B 1MXWA 4ISUA 2V25A 1UTBA 1Y3QA 2WKYA 3V89B 5AA4A 1ZIUA 3H6TA 3SEXA 4NF6B 4PFUA 4GD5A 2V84A 5IKBA 4PFTA 4EQ9A 1PDAA 4LZ7A 2ZYNA 1YPNA 1B3GA 2PBWA 2GRVA 5ELVA 3S2VA 2HAVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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