4JXIA

Directed evolution and rational design of a de novo designed esterase toward improved catalysis. northeast structural genomics consortium (nesg) target or184
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
410
structure length
410
Chain Sequence
SHMEVNLRMSWWGGNGRHQVTLKALEEFHKQHPNINVKAEYTGWDGHLSRLTTQIAGGTEPDVMQTNWNWLPIFSKDGTGFYNLFSVKEQLDLAQFDPKELQQTTVNGKLNGIPISVTAMIFYFNDATWAKAGLEYPKTWDELLAAGKVFKEKLGDQYYPVVLCAGQTLVLIRSYMTQKYNIPTIDEANKKFAYSPEQWVEFFTMYKTMVDNHVMPSTKYYASIVKSSYYEMKPWINGEWAGTYMWNSTITKYSDNLTKPAKLVLGPYPMLPGAKDAGLFFLPAQMLSIGKSTKHPQESAMLINFLLNSKEGVEALGLERGVPLSATAVTQLRASGVIKDEDPSVAGLNMALELPHPMTTSPYFLDWQIWSLFLDAIQYIDYGQKTVQETAEYFNKQGDRILKRAMRGSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Directed evolution and rational design of a de novo designed esterase toward improved catalysis. Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) Target OR184
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Synthetic construct
molecule keywords design cystein esterase
total genus 135
structure length 410
sequence length 410
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jxiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jxiA02
2F34A 2NUVA 1LGBC 4EF2A 1QUJA 4KCCA 1FQFA 4ISUA 3TQWA 1JW5A 3FJ7A 1B7ZA 4OVJA 1P1QA 5AA2A 4IO4A 3RLFE 4I8CA 3OO7A 4H67A 3H6WA 3HV1A 2ZNTA 2VD3A 1B9JA 3G3FA 3ONMA 1H76A 3PUZE 3ZSFA 1UIVA 1B3GA 3TTLA 5AA2D 4H65A 3K6WA 1N3XA 1IXGA 1MQGA 1R1NA 3TCGA 2ZMBA 3IOTA 4R73A 3K6VA 4F22A 4IY5A 1R6ZA 1KWHA 1IXCA 4X48A 2XXXA 5L8DA 3QUFA 3RTFB 4BDNA 2OBGA 3JYRA 3QIMA 4LUBA 3K1MA 1A99A 1H44A 3KOTA 4F3BA 4ZEKA 3VXCA 2YJPA 3K6XA 3UGWA 1USYE 1ELJA 4P11A 5I58A 4AB5A 4O3CA 4F39A 1XVXA 1MXZA 3OSQA 3CFLA 3EQ1A 4KQPA 4RK2A 1PC3A 4G77A 4NEDA 2OZZA 3G7WA 5ICTA 1QUKA 4ESXA 5DEXA 4YU0A 2DXRA 1GVCA 4FATA 2VP1A 2Q2CA 2OLBA 1GV8A 1LFIA 1EH3A 2PVUA 3GZGA 5A5XB 2OWSA 4TOZA 3C9HA 3ILTB 1FQEA 4Q0CA 3G3IA 1EZ9A 5ELVA 1PDAA 4F3PA 1JEVA 3K01A 3EF7A 2FA7A 1SD3A 3FV1A 1MXWA 1XS5A 3OO8A 4FAJA 1FW0A 3O28A 3TFLA 2O7UA 3VLVA 1GR2A 4FJPA 5I56B 2QMWA 3IO4A 3VVFA 1I6QA 3O2AA 1QVSA 3UK4A 3IJXB 2M8CA 3Q28A 4RYAA 2D21A 2V84A 4EQ7A 1MH4A 3SETA 3TELA 3UP9A 2I58A 3L6GA 5ITPA 4F2OA 1VE4A 2QL3A 1MDP1 3FJGA 5H8NA 2ESNA 3EHSA 5I59B 1LSTA 4GFRA 2O1LA 1R9LA 3PGFA 4RJZA 3T9XB 3H6TA 2H5YA 2HQ0A 2O51A 4HTGA 4MLVA 5AA4B 4IGTA 2ZXTA 1MRPA 4OFJA 4LZ5A 2F6GA 1OLCA 2DWIA 3CG1A 4XKPA 4LP2B 2DSFA 3RY3A 3HPIA 3OEMA 2I49A 2ZYMA 3FVGA 4F2QA 4THIA 1MQHA 3F11A 3G3KA 3FV2A 2I6EA 3IL1B 3O66A 3H6VA 1M5EA 2AYSA 3R7XA 4EF1A 2V25A 3G3HA 4Z0IA 1SW1A 2THIA 3PMVA 4N07A 2E0SA 4NF8A 4WEPA 3ECRA 1SI0A 5JEIA 4GOTA 5H8QB 3N26A 2Q9TA 4NF6A 4DDDA 3FVKA 4XKNA 2O84X 4RXLA 2DVCA 4OENA 3T93B 3A09A 4TLLB 1YAEA 1URDA 3LSLA 3MAMA 3O6HA 1H45A 3E4RA 1SW2A 3I5OA 2W7YA 3HN0A 2QS4A 4ZEFA 4IB2A 2Q88A 3D4CA 2DVZA 5JK4A 3KN3A 4LONB 1D3KA 3S9NC 5I84A 3A3UA 1D9YA 2F7BA 2F8DA 3MVYA 1AL3A 4MBPA 1IQ7A 3Q26A 1CB6A 4PFYA 1B3FA 3V89B 4YKIA 4POXA 1N7XA 5TP9A 3TUSA 4KHZE 1BTJA 2RCBA 3IOUA 2OK2A 1JETA 4H6DA 4MH5A 1GTKA 4JB7A 2O6AA 3K2DA 3PUVE 4IY6A 2XX7A 4ELOA 4OQOA 1B5HA 3MZBA 4YB6A 5AA3A 3S4UA 4XTCQ 1FTLA 5CC2A 4FECA 3USDA 1HSLA 4NE4A 1VFDA 4IGRA 2HEUA 4F29A 1A40A 2I4CA 5DVJA 3KEIA 4RA1A 1N3WA 1B3HA 3T9VA 1M5CA 1SYIA 2F7CA 3PPNA 4POWA 2X7QA 4PFUA 1Y3NA 1B46A 2D5WA 5IKBA 3H3GA 2DXYA 3TTNA 3A3CA 1B40A 3PUYE 1PBQA 2QPQA 2P0SA 1VR5A 4GL8A 4DIGA 3MBPA 1QKAA 2ZNSA 2WKYA 5I58B 3EHUA 5I2NA 2NXOA 4RPOA 1Q35A 3FASA 2XXPA 3SDFA 4C1TA 4QFOA 3HHGA 4OXVA 1MQJA 3FVNA 5J1DA 4LZ7A 2XXWA 2XX9A 2VD2A 1O7TA 1LCFA 1MPCA 3RUMA 3L6HA 2RC8A 1N0TA 1FQAA 5HBCA 4BDOA 5CRYA 4C1UA 1F9BA 3TZAA 3H06B 4GIZA 3LSXA 1ZIUA 3N6TA 2Y7WA 5KCJB 1OVBA 3FUZA 1IEJA 1NH7A 4EUOA 3O6IA 1FTJA 4DXUA 2V3QA 1USYH 1LBBA 1S50A 1UTBB 1IIWA 1TT1A 2Y7RA 2AIXA 4FORA 2IEEA 4OTEA 4WXJA 2XHDA 1MPDA 4C0RA 1HSJA 2A5TB 1Y20A 1DSNA 3SERA 3DM0A 4FIMA 3KZGA 3G3JA 5FHOA 2AL4A 1MXVA 4F3GA 4FEBA 4R9GA 3CI8A 1SBPA 4U4SA 3FD3A 1IITA 3LR1A 1NNPA 2P2AA 4ZEDA 3FXUA 4EQBA 1ATGA 2F36A 5TPAB 2QJEA 4OESA 3ZKLA 4IO6A 5CMKA 5I2KB 1NNTA 4YAHX 4NF4A 3TCFA 2RCAA 4G8HA 3TQLA 1JW1A 1N84A 3PU5A 3U8QA 1LB9A 1VFEA 3EPEA 4G8NA 3EHTA 1P1WA 2XXHA 4UA8A 5HM4B 3E13X 4OFOA 2R71A 2GFEA 1MXXA 3DP4A 3V5AA 1H3DA 1II5A 1LAFE 3ODBA 3RT8A 4OHNA 3GXAA 3SEVA 3QSLA 3FVOA 2I0CA 3H7MA 4QF9A 1UTHA 1Q1KA 1IZ1A 3IB0A 3PMXA 2Q89A 3CIJA 2I3VA 5CMBA 5KDTB 3G3GA 3IB2A 4GQOA 2HCAA 3E9XA 2Y84A 1XHYA 5I57B 1DPPA 1LFGA 3SEXA 4KFQA 4ZE9A 1MQIA 1O64A 4GL0A 3S2VA 1MM6A 4OFLA 2XXIA 2R6GE 1MPBA 4XKQA 2DE2A 4NF5A 4WEDA 1FTMA 1OQGA 5B70A 2VOZA 3BFUA 1QJMA 2ALUA 4ELPA 3VLWA 3GBBA 1O63A 1T0KA 3SESA 4UACA 3MWBA 3HSTA 3TTRA 5EHMA 2CMOA 1ZBMA 3FXQA 1OVTA 4KYEA 1MQDA 1H43A 2DS9A 3OMBA 4OZ9A 2DP8A 2X7PA 4IO7A 2H9BA 5JTYB 2HZKA 1Y1MA 1B4ZA 4EDPA 1A8EA 4K3FA 1JEUA 5H8FB 1YPNA 4R75A 4U21A 1TFDA 1B6HA 3M3LA 1DOTA 1POTA 2B3BA 2KLFA 3R26A 1LLSA 3T66A 5H8HB 4BDMA 3WAEA 1FQBA 4YB5A 1B52A 2XD2A 1FQCA 4NTLA 4XKRA 3RNNA 2Z8EA 4Q5TA 3B6TA 1DTGA 3OD7A 1ZTYA 1DPEA 4I1DA 4HS7A 4G68B 3LSWA 1MY0A 5AE4A 3RTWB 1LB8A 5DYHA 1A55A 1XOCA 3QYTA 1M5DA 5HPQA 2PT1A 1XVYA 1XT8A 4RK9A 5CMCA 2XXUA 3GBAA 2H25A 5FHMA 2NWJA 1A54A 2OWTA 3CSBA 1B3EA 3TODA 1WDNA 4QSCA 1UIUA 2QS3A 3LSFB 2YPNA 2I0BA 4OWDA 3TEPA 3PPOA 3UORA 4FE8A 2Y7KA 3S9EA 3FGSA 3V83A 3FZVA 2ANJA 4LZ8A 1Y9UA 3IAZA 3K4UA 4NWDA 1NH8A 4KPTA 3K1PA 4U1OA 3MC2A 4O3AA 2F5XA 4KYSA 3LUYA 3U93A 3BFTA 3K00A 3KN8A 4BDQA 3IB1A 3T9UA 2HAVA 3U92A 3MVZA 1M5BA 4X1DA 4DE8A 4GVOA 4JSDA 2PT2A 1ZU0A 1RKMA 3VV5A 3IK6B 4GD5A 1P1OA 5AA2B 3VLUA 1URSA 5FTHA 1FQDA 4HCYA 3UN6A 4NMYA 4N13A 5A5XA 3IOWA 1MDQA 3MUQA 1UQWA 3UIFA 1R9QA 4ELRA 1JW4A 1MH3A 3VFJA 2DOJA 3K6UA 4ESWA 5ICQA 1PB7A 4JXIA 4YKPA 1SDXA 4QRZA 1MXUA 2UYFA 5BWJA 3S9MC 1AOVA 4EXLA 1B32A 1DMBA 5F1QA 3BKIB 4YMAA 4KYDA 1AIVA 4JWYA 5I56A 1LAGE 4BLAA 4Q30B 1MY1A 5CBSA 1B58A 2UVGA 1IXIA 3PMWA 1YCJA 2H4IA 1B5IA 4DCYA 3VDFA 3N94A 1MXYA 4P0GA 1B51A 1OLAA 3KSXA 2QS2A 2REJA 4HCWA 5DEXB 5EHSA 1P99A 3CSGA 3LC8A 4LA9A 2ONSA 3SEUA 1PBPA 3MZ1A 3MP8A 2PMSA 2I4BA 5AA4A 3DELB 4TQUQ 3T22A 1FTKA 3C32A 2V93A 1TWYA 2DWHA 4OETA 2PBWA 5CI5A 4F1YA 3TMGA 3PUXE 4L17A 4BDRA 2B65A 1B7HA 1WODA 1ZMGA 4GXAA 1Z7ME 3FJMA 2Z22A 3T96B 5L9SA 1PB8A 4F18A 4KR5A 2QRYA 2DE3A 5L9MA 4H8IA 3RT6B 4ZDMA 1B2HA 3DLNA 1NMUA 2H99A 4H0WA 5CBRA 2D3IA 3IO6A 2VHAA 4N6PA 2XXYA 4R72A 1JVXA 4QFKA 2O68A 1RYXA 3C31A 1SI1A 1JQFA 4OEUA 3QUJA 2PX1A 2DWAA 3MZ9A 4X9TA 5H8NB 4QSEA 5CM6A 5H8QA 3M8UA 2UYEA 2Q8JA 4G8MA 1B7UA 1N04A 4DXCA 3IOVA 3TAJA 2BJJX 3OO9A 2Z8FA 1Y3PA 3OENA 3CR9A 1MS7A 5H8SA 3OSRA 2B3FA 3B6WA 3BBRA 2RC9A 3I3VA 4FEDA 4ONYA 2H98A 3QK6A 3I6VA 3VE1B 2Z8DA 2GH9A 1B05A 5AA1A 3SKPA 3PPRA 3FIRA 3HHFA 3C35A 1LCTA 4H1XA 4I9DA 1QUIA 3UA8A 3C33A 4KD5A 2Z23A 1SQYA 3KBRA 4PE5B 1POY1 1Y1ZA 4R9FA 1EZPA 1I6AA 4U23A 4H5GA 3OXNA 1Y4TA 3EN3A 4R6HA 3PUWE 4NF8B 1MG1A 4YZZA 5CMMA 4YICA 3E3KA 3W9VA 3N5LA 4NF6B 1SVXB 2O1MA 2E1SA 2FNCA 5K2XA 1MM7A 1PB9A 4EXKA 4ZEIA 4U2RA 1ANFA 3IORA 1B5JA 2XXTA 4JSOA 4EQ9A 2ONKE 3PV0E 3MPLA 3OEKA 4GRKA 3DP6A 4AB6A 1NNKA 4LATA 2UVIA 3C34A 4HW8A 3MP6A 2IA4A 1AH5A 3CFXA 1US5A 4QFNA 4LVQA 1DTZA 4QSDA 3VVDA 4U22A 3RPWA 4LQ2A 5K2YA 2UXAA 5TP9B 2A5SA 3TYHA 3IR1A 4Z7EA 4R2FA 5TU0A 3K0VA 3MW0A 1P1NA 2RKMA 3DP8A 1S7YA 1A7LA 2REGA 3U72A 2YLNA 4G2ZA 1IXHA 2HXWA 3GLBA 2OJTA 3QAXA 5FHNA 3W15C 5B7DA 1B4HA 3TDJA 3ZS6A 2O7IA 3O9PA 1FTOA 2F78A 4OMBA 1S9TA 5DT6A 2I48A 3KOSA 4I62A 2CZLA 4G4PA 2QMXA 4F3SA 2AL5A 3K02A 3RGYA 4YKJA 4YMBA 2I3WA 4OERA 2X26A 4R2BA 5KCJA 4ZS9A 4WKMA 4PFTA 5DVFA 4ZZEA 2QS1A 4R6KA 2OCUA 4GLIA 3MP1A 2GHAA 4GXSB 1P1UA 2F97A 3PPPA 3JZJA 3Q27A 2GHBA 1UTBA 4H5FA 5I2NB 3HCQA 1N7WA 3S9LC 3AXFA 2ZNUA 2VGQA 2ZYOA 4RNSA 4JWOA 4IO2A 4M1VA 2A5TA 3N6UA 1B0HA 1PEBA 3CVGA 2ZYNA 4U4XA 3M3KA 2O69A 1MY2A 2RC7A 4DCXA 4Q8RA 3H6UA 2XX8A 3B6QA 1A8FA 3QXMA 2F6PA 4F31B 2Q2AA 3IJOB 3KG2A 3PD8A 1AMFA 2XXVA 3THIA 1HSEA 5L9OA 5F7VA 1J1NA 5TPAA 3SEWA 4ELQA 3PPQA 4ECFA 4PETA 3Q29A 5BUUA 5I2KA 2V3UA 1Y4CA 3TPAA 3KJ7A 1URGA 4G68C 3TKDA 3KJTA 2DWJA 1SW5A 2ZYKA 3LBSA 4PQJA 4TLMB 3OELA 4YB7A 4MFIA 3OOAA 1LAHE 1BLFA 1QKBA 4XIGQ 4ZEBA 3JV9A 2RF1A 5IAIA 4P0IA 3K1NA 1YTVA 2XXRA 2DYXA 4F1UA 3KSJA 4ZECA 4DZ1A 4F1VA 4ZE8A 2PYYA 1GGGA 3TTMA 4NWCA 4JDFA 3KFMA 3RN8A 5KDTA 4M4GA 1TFAA 4ZZAA 1I6BA 2R9JA 3W9WA 3C36A 2DQVA 2FYIA 3U94A 5I57A 1ZKBA 4NF4B 3FATA 1B1XA 2ABHA 2GRVA 4IO5A 1JNFA 4KCDA 4OEVA 2UVJA 4GF8A 1IUDA 3KN7A 3IX1A 1MY4A 3RQTA 3CRBA 2NOOA 2LAOA 2Y7IA 4PFWA 1OQHA 1WVJA 5ISUA 4GWOA 1BP5A 5DTBA 1LBCA 3TTKA 2ONRA 1B1HA 1MY3A 4KI0E 3T9HB 4OYVA 3H4ZA 1BIYA 3KGCA 3H03A 4PP0A 3U1OA 1NKXA 4E0WA 4X1BA 3VXBA 1UTHB 1EU8A 5JTYA 4BDLA 3B7DA 1OIBA 3MVXA 1LAXA 3OO6A 3TCHA 4DXBA 1ZLQA 5H8FA 3VVEA 3C4MA 4IO3A 1CE2A 4XXUA 1ZJLA 4O3BA 1NFTA 5I59A 3FXRA 1LFHA 2RINA 1QW0A 3O29A 5H8HA 4E0XA 1I69A 2HAUA 4H8JA 4JWXA 3ILUB 4NF5B 3M3FA 3CG3A 3Q25A 1SW4A 3CFZA 5EYFA 2HFBA 1TXFA 2HZLA 2DE4A 1B0LA 4ND9A 1Z7NE 1L5TA 1SYHA 1N76A 3HO7A 4RPNA 1FCKA 4G68A 1VSOA 5LOMA 1OMPA 3MPKA 1Y3QA 4RY1A 5ITOA 3PD9A 2V3TA 3MJNA 5DVIA 1NNFA 1RYOA 4U1ZA 3P7IA 1D4NA 4JBZA 4AQ4A 2XXQA 3WAFA 1US4A 4QFLA 5M2VA 4DLDA 3V8XB 1JVYA 2F35A 2P1SA 3O97A 4QHQA 4R6YA 3R6UA 4R74A 4YKKA 3MQ9A 2UVHA 3O6GA 3MVWA 1QULA 1BKAA 4LQ5A 1B3LA 2XD3A 4MLQA 5KZTA 2F7AA 4QFPA 3ZKKA 2G93A 2G29A 2Y7PA 3SEYA 2QSXA 1D9VA 3D4GA 1M5FA 1XC1A 1EZOA 4MF3A 1NL5A 2NVUB 4F19A 5FTIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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