4JXIA

Directed evolution and rational design of a de novo designed esterase toward improved catalysis. northeast structural genomics consortium (nesg) target or184
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
410
structure length
410
Chain Sequence
SHMEVNLRMSWWGGNGRHQVTLKALEEFHKQHPNINVKAEYTGWDGHLSRLTTQIAGGTEPDVMQTNWNWLPIFSKDGTGFYNLFSVKEQLDLAQFDPKELQQTTVNGKLNGIPISVTAMIFYFNDATWAKAGLEYPKTWDELLAAGKVFKEKLGDQYYPVVLCAGQTLVLIRSYMTQKYNIPTIDEANKKFAYSPEQWVEFFTMYKTMVDNHVMPSTKYYASIVKSSYYEMKPWINGEWAGTYMWNSTITKYSDNLTKPAKLVLGPYPMLPGAKDAGLFFLPAQMLSIGKSTKHPQESAMLINFLLNSKEGVEALGLERGVPLSATAVTQLRASGVIKDEDPSVAGLNMALELPHPMTTSPYFLDWQIWSLFLDAIQYIDYGQKTVQETAEYFNKQGDRILKRAMRGSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Synthetic construct
publication title Directed evolution and rational design of a de novo designed esterase toward improved catalysis. Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) Target OR184
rcsb
molecule keywords design cystein esterase
total genus 135
structure length 410
sequence length 410
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jxiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jxiA02
4FIMA 2DWAA 4LZ7A 1A7LA 1IXCA 1DPPA 2P2AA 1FW0A 3USDA 3JYRA 3K01A 3ZSFA 2XD2A 4ZE9A 1FCKA 2QS1A 1NH8A 3RTWB 3KJTA 4F2QA 4MH5A 4PFUA 4M1VA 4IO4A 5M2VA 4ONYA 1RKMA 4G68A 4YKIA 3N5LA 3O29A 1SW4A 1FQAA 1OVTA 3U8QA 2E0SA 1LFHA 2WKYA 5A5XA 4F1VA 5I58A 3VLWA 2G93A 2DYXA 5I56B 4FEBA 2YLNA 1PBPA 2RC9A 1A54A 3OEKA 3MQ9A 4JBZA 3IOTA 3E4RA 3U72A 3N94A 1LB8A 1B3LA 3JZJA 4WEPA 4G8HA 2HQ0A 4YICA 4F3GA 4ELPA 3G3FA 1XT8A 2HZLA 2V3TA 5FHOA 3FXRA 3UORA 3O6HA 1MM6A 1D3KA 3HCQA 2VHAA 1ZKBA 2VD2A 3IX1A 1IZ1A 2XX7A 2XXXA 2I3WA 1SVXB 3FV1A 1SYHA 5CM6A 3SEUA 3CIJA 3UP9A 4O3AA 3PUZE 4F39A 5TP9B 1OIBA 4ZS9A 1LCFA 1AOVA 3QAXA 4YB7A 5ITPA 3H06B 4QSEA 2QJEA 3C35A 2DS9A 1B5HA 1LBBA 2AL4A 1VR5A 4NF6B 2RC7A 1GR2A 3OSRA 2RCAA 4DE8A 3RNNA 1PB9A 2Z8EA 5CBRA 2A5SA 1N84A 2W7YA 3KOTA 3VLUA 2HZKA 4NWCA 2R6GE 4WXJA 4RNSA 2DXYA 5EHSA 4RYAA 5H8HA 4FORA 2Y7RA 4KHZE 1B40A 3TTMA 3M8UA 1MXXA 4U2RA 2HAVA 4TQUQ 4L17A 2Y7KA 1MDP1 2V3UA 1EU8A 1B1XA 3T9HB 4R75A 5KZTA 4OTEA 3SEVA 3KN7A 1LB9A 4NTLA 4HCWA 3O28A 3MVWA 4GD5A 3QSLA 1ANFA 1MQJA 1PB8A 4EQ9A 4QHQA 1QKAA 3IR1A 5ISUA 4GVOA 2UVIA 4RXLA 3EHTA 4X1DA 1B3HA 4OEVA 3U93A 1PEBA 2IEEA 3FVGA 1N76A 2DQVA 3CRBA 3TQLA 1B0HA 4RPOA 1MPBA 3T93B 4DZ1A 2THIA 2OCUA 5AA1A 2Z8DA 3VV5A 2ZYMA 2Y7IA 2DP8A 3MWBA 2VP1A 1ZTYA 3TKDA 3PU5A 2NOOA 2QMXA 4NWDA 2Y7PA 3OELA 3G3IA 2BJJX 3MW0A 1D4NA 4KFQA 4IY6A 3VLVA 1UTHA 4F1YA 4ZEFA 4QFLA 2DWIA 1FTKA 2GH9A 3VFJA 3U92A 3K6WA 3K6UA 2PT2A 3TUSA 3PD8A 2PBWA 3C33A 2UVGA 4N6PA 4O3BA 2AIXA 4N13A 1NNTA 2F6PA 4XKNA 3LBSA 4QRZA 4GIZA 1YCJA 3RPWA 5AA3A 1GV8A 3LR1A 2XXPA 4F2OA 5FTIA 3MPKA 3JV9A 4R74A 4DCXA 4EF2A 5CMBA 3TODA 3CI8A 1J1NA 3IB1A 1B1HA 3A09A 3ZKLA 4XKQA 1OLAA 3I3VA 3K1NA 4X9TA 1PDAA 1B7ZA 2G29A 2GHAA 4LONB 2Y84A 1AL3A 2QRYA 3A3UA 5L9MA 2F7CA 4Z0IA 4F22A 1B58A 3ZKKA 3SESA 1DMBA 5EHMA 1LCTA 4RPNA 5ICQA 1USYH 3OOAA 4QFOA 4X48A 4GOTA 3MVYA 3O6GA 2OWSA 5KCJB 3KFMA 2XXUA 4G2ZA 3ECRA 2PMSA 4OMBA 5L9SA 2A5TA 1N7WA 4ZEKA 1IUDA 4H1XA 4EQBA 1UTBA 1XS5A 4C1TA 1P1OA 1ELJA 1HSJA 3OXNA 2F97A 3RT6B 3U1OA 1H45A 4OFOA 3HHFA 4LQ5A 4GL8A 3H4ZA 3W15C 3CSGA 1N3XA 3H03A 3V89B 1Y20A 2RINA 3MBPA 3FIRA 4EXKA 3S9NC 4LATA 3T66A 3O66A 4KPTA 3UGWA 4LP2B 4GFRA 2DWJA 2I49A 4KD5A 3TTLA 2OJTA 2I58A 5CC2A 1LFIA 3DM0A 1R1NA 2XXQA 4R2FA 1XVXA 1I6BA 4XIGQ 5AE4A 1POY1 3LUYA 1B0LA 3T9UA 4F19A 3OO7A 1MQGA 1NFTA 3GLBA 5DT6A 1EZOA 3VE1B 4MLVA 4ESXA 2H9BA 3FV2A 1O7TA 4G77A 5I2NA 5JEIA 3TFLA 5HBCA 1NNPA 2R71A 1US5A 2XHDA 1DTGA 4WEDA 5DEXA 2O69A 1ZMGA 4G4PA 3M3FA 2Y7WA 3T9VA 2ZYKA 1MQDA 3B6QA 2X7PA 1URDA 3KGCA 5JTYB 1N04A 3IO6A 3O2AA 1MY0A 4G8MA 4KQPA 3KJ7A 1UIVA 3TEPA 5KDTB 3N6TA 2GHBA 2DVZA 4QFNA 4ECFA 3Q28A 1S50A 5F7VA 5B7DA 5IKBA 1TFDA 1FQFA 5L8DA 4AB5A 1OLCA 5JTYA 2O51A 1A55A 4P11A 3GZGA 4RK9A 2UYFA 3HO7A 1B51A 4KYSA 4YMAA 1B3GA 1BIYA 3TPAA 3IK6B 4QFKA 4YKJA 2V3QA 1SDXA 3MP8A 1MPDA 3FZVA 1P1NA 4NF8B 3KOSA 2XXIA 4DDDA 3MP6A 2XXYA 5CMMA 4DIGA 4GWOA 2I4BA 4JWXA 3C36A 3SDFA 2VD3A 3VXCA 3FVKA 4U21A 3BFUA 1O64A 3KSJA 3VVEA 1RYXA 5I56A 3SETA 4PFTA 1UIUA 1VFEA 4RY1A 4LZ5A 3FASA 2E1SA 2OWTA 5CI5A 3LC8A 1DSNA 5AA2D 1BLFA 2UXAA 3OMBA 3FJ7A 5TU0A 3IOVA 2F78A 3OO8A 1URGA 1AMFA 4XKRA 4YKKA 1MXVA 5AA2B 1N7XA 1SBPA 1FQCA 3VXBA 2HXWA 3BBRA 3DELB 3QIMA 1B3FA 3BFTA 1JNFA 3FD3A 3R7XA 2Q8JA 1JEVA 2RKMA 3PPRA 3FJMA 3CR9A 4X1BA 4BDNA 2H98A 2PYYA 1NKXA 1M5FA 2ZXTA 5L9OA 4R6YA 4BDOA 5TP9A 4U4XA 2CMOA 1MRPA 4Q30B 1IXHA 3S9EA 2HCAA 2O1MA 1MG1A 1IXGA 1MXYA 3MVZA 3EPEA 2I0CA 3IB0A 2F7AA 1TXFA 4XXUA 4GRKA 3RT8A 2R9JA 2V25A 4RK2A 4H0WA 2I6EA 1B7UA 2QS4A 4NF6A 2ZYOA 4QFPA 2HAUA 4KCDA 4YB6A 4OQOA 3C31A 4POWA 3RUMA 4DXBA 3B6TA 1DTZA 1BKAA 1QJMA 1CB6A 3V5AA 4ELRA 2O84X 4JDFA 2AYSA 5LOMA 5H8FB 3KN8A 4MBPA 5EYFA 4THIA 3RLFE 4K3FA 5DYHA 1M5EA 2D21A 3PPPA 3TMGA 4WKMA 4FEDA 4OWDA 3DP4A 1P1WA 3FVOA 3PPOA 4OHNA 1MDQA 4H6DA 4YAHX 3ILTB 2V84A 2O68A 4ZZEA 3IO4A 4BDQA 1IQ7A 4DCYA 1RYOA 1MY4A 4QSCA 3PUWE 2YJPA 3G3KA 3M3KA 1H44A 3A3CA 1FQEA 3KBRA 3C9HA 3CSBA 2ZNTA 1I6AA 3MAMA 4U1ZA 1L5TA 2I0BA 3H6TA 1P1UA 1FQDA 3E3KA 1MY2A 4IO3A 3HSTA 4LZ8A 3UK4A 1B52A 4KCCA 2F35A 5I2KB 4OEUA 1PBQA 3UN6A 2ZYNA 3TYHA 4O3CA 4G8NA 1B32A 1UQWA 3PUXE 3G3GA 1I69A 3E9XA 3PMWA 1EH3A 4I1DA 1FTLA 3IAZA 4IO2A 1IIWA 2GFEA 4MLQA 4Q0CA 3H6UA 2RC8A 4F29A 3D4CA 4IGTA 3BKIB 3GBAA 1YPNA 5I59B 4LQ2A 1II5A 1AH5A 2O1LA 3FATA 5I2KA 1Y3NA 2P0SA 1XC1A 3G7WA 1A40A 5DVIA 1CE2A 2NVUB 3MZBA 1P99A 3F11A 4YZZA 3C32A 4F3BA 3K4UA 5ELVA 3O6IA 2VGQA 2ABHA 2UVJA 1HSEA 1FQBA 1LGBC 4NF5B 4OENA 2HEUA 3R26A 3IJXB 3V83A 4HTGA 5H8NB 4JSDA 1P1QA 2DE2A 5BUUA 1LAGE 3DP6A 4R6KA 3GBBA 1B4HA 2XX9A 1FTMA 2QMWA 4U4SA 1YAEA 2FNCA 4HS7A 4ZEIA 5KCJA 3OO9A 2DE3A 5K2YA 3IB2A 2H5YA 1F9BA 3C4MA 3H6VA 3FXQA 4U1OA 5H8SA 1LAXA 4KYEA 3RQTA 3QXMA 5CBSA 3HN0A 2ZMBA 5J1DA 5IAIA 1QW0A 2V93A 2XXWA 4H5GA 4KYDA 1JW1A 1NNFA 1SW5A 1OVBA 1NH7A 3TZAA 4EDPA 4MFIA 3L6HA 3N6UA 3ONMA 4NEDA 2Q2CA 1ZU0A 5TPAB 3TAJA 2XXRA 3FJGA 1GVCA 1MQHA 1R6ZA 4OFLA 1VSOA 4I9DA 4OZ9A 4NF4B 4ZEDA 3PPNA 1S7YA 1GTKA 4EQ7A 3SEWA 2D5WA 2XX8A 3SERA 2P1SA 4GF8A 3H6WA 1WDNA 2XD3A 1IXIA 5H8QB 1I6QA 1NNKA 1B46A 3K0VA 2GRVA 1TWYA 3PD9A 2HFBA 1DOTA 4ISUA 4ELQA 1JETA 3K1MA 2H25A 3TQWA 3CG1A 4IO5A 2CZLA 4P0GA 5FHNA 4GXSB 4NF4A 1T0KA 3IORA 4AQ4A 4EF1A 4XTCQ 1DPEA 5K2XA 1B6HA 3CFZA 2UVHA 3N26A 4ZEBA 1POTA 2Z23A 2XXHA 4IB2A 3WAEA 2NXOA 3I5OA 3I6VA 2DVCA 3IOWA 4G68B 1H43A 4OETA 2O7UA 3TELA 4HCYA 2RCBA 2DE4A 3PUVE 3SEXA 5A5XB 5I58B 1ZJLA 1JVYA 3G3HA 3SKPA 1JEUA 3LSFB 3FVNA 5KDTA 3FXUA 1BTJA 2D3IA 3W9WA 4H5FA 2ONKE 4F31B 2I48A 4EXLA 4GLIA 3PUYE 4Q8RA 4YKPA 1PB7A 4JB7A 2FA7A 4PP0A 1ZIUA 3HV1A 1VE4A 1B5IA 4YB5A 4ZDMA 2B3FA 1SW1A 2ESNA 1M5BA 4NF8A 3ZS6A 4R72A 1H76A 4POXA 3VVFA 1SW2A 1QUJA 5CRYA 1LBCA 5ICTA 2OBGA 4PFWA 3U94A 4R73A 3DP8A 1LSTA 3MZ1A 4F18A 4PE5B 4PETA 5JK4A 2XXVA 3PGFA 4I8CA 3LSWA 4YMBA 2H4IA 1XVYA 2VOZA 4R6HA 4BLAA 5AA4B 1MY1A 2H99A 2ONSA 4DXUA 2Z22A 1SI1A 3KSXA 3H3GA 4R9GA 1S9TA 4MF3A 3L6GA 2F7BA 3G3JA 3PMVA 2QPQA 2KLFA 2B3BA 3VDFA 1LAFE 5AA4A 1H3DA 5AA2A 2UYEA 4ZE8A 2AL5A 3VVDA 4ZZAA 2PX1A 3OD7A 5H8HB 4E0WA 5HM4B 1XOCA 3Q25A 1B4ZA 3FUZA 2Q2AA 4TLLB 5FTHA 4JXIA 5BWJA 4IGRA 1AIVA 5I84A 2F5XA 1B7HA 2NUVA 3GXAA 1TFAA 4AB6A 1TT1A 3UA8A 4G68C 2NWJA 4GL0A 1QULA 3D4GA 1B9JA 4LVQA 3KN3A 4NE4A 4PQJA 4IO6A 1O63A 2ANJA 1KWHA 3AXFA 4ND9A 3M3LA 1NL5A 1Z7ME 3QYTA 4FATA 1MXZA 3Q27A 4Q5TA 5DVFA 3T96B 4GQOA 2DOJA 2DSFA 2PVUA 3UIFA 4EUOA 1SI0A 4P0IA 2QL3A 1WODA 4U23A 3SEYA 1IITA 4OXVA 4XKPA 1M5CA 1JW4A 4H65A 3TCGA 4F1UA 1R9LA 3K6VA 1SYIA 2RF1A 2IA4A 2PT1A 3K6XA 1D9VA 1LAHE 2DWHA 1MM7A 5H8FA 3THIA 3MVXA 5FHMA 3KZGA 3TDJA 4ELOA 3OSQA 5CMCA 3CFLA 1Y9UA 4GXAA 1US4A 3MPLA 1MH4A 1Y3QA 3T9XB 3EN3A 1B5JA 1UTHB 3QUFA 4OVJA 5DVJA 2B65A 2X26A 3KG2A 1R9QA 3OENA 3FGSA 1B2HA 1ZLQA 3CG3A 1Y4CA 2LAOA 4LUBA 4FE8A 4JSOA 4BDMA 5HPQA 1FTJA 1MQIA 3H7MA 4RA1A 4BDLA 4OFJA 1XHYA 2FYIA 1EZPA 4Z7EA 4E0XA 4H8JA 3B6WA 3EHSA 4BDRA 1B05A 2DXRA 2I3VA 4DXCA 3O9PA 4F3PA 2ONRA 3B7DA 3CVGA 2F6GA 3K2DA 4N07A 5B70A 3OEMA 4PFYA 1OMPA 2OZZA 2ZNUA 2REGA 1N0TA 4IO7A 3TTKA 1MY3A 2OLBA 3TTNA 3DLNA 3PPQA 3IOUA 4C1UA 3EHUA 4ESWA 1EZ9A 3S2VA 3RY3A 1QVSA 1A8FA 1SQYA 4TOZA 4JWOA 4KI0E 2A5TB 4QF9A 4I62A 3RTFB 5I59A 1SD3A 3WAFA 4F3SA 1Y4TA 3E13X 1D9YA 4H67A 2OK2A 1UTBB 1OQGA 1VFDA 3MC2A 4TLMB 3PV0E 1USYE 3IJOB 3HHGA 1QKBA 1OQHA 4OYVA 3LSLA 1GGGA 1NMUA 5I57B 1QUKA 3OO6A 1ATGA 1Z7NE 2Q9TA 3MUQA 3S9MC 3HPIA 1Q1KA 1Y1MA 2Q89A 4DLDA 2M8CA 5CMKA 2Q88A 4NF5A 1Y3PA 3T22A 5H8NA 3TTRA 1N3WA 3S4UA 2F34A 1IEJA 5I57A 4R2BA 3V8XB 4NMYA 1MH3A 1JW5A 3EF7A 2XXTA 3C34A 2ZNSA 3K1PA 3EQ1A 3Q29A 1Y1ZA 1HSLA 4KR5A 1M5DA 3K02A 3R6UA 4IY5A 3IL1B 5F1QA 1B3EA 2REJA 3LSXA 3ODBA 4M4GA 1ZBMA 1PC3A 3RN8A 3ILUB 3QK6A 4FJPA 4FAJA 1A8EA 5I2NB 2QS2A 2Z8FA 1JVXA 5DTBA 2QS3A 2YPNA 5DEXB 1MXUA 1A99A 1JQFA 2X7QA 3W9VA 4U22A 4HW8A 3S9LC 1MXWA 3TCFA 1URSA 1MS7A 3O97A 4JWYA 4OERA 5TPAA 2F36A 1MPCA 2O6AA 4ZECA 3CFXA 4H8IA 2QSXA 5ITOA 4C0RA 2F8DA 3MJNA 3RGYA 2I4CA 1WVJA 3MP1A 3MZ9A 1LFGA 1YTVA 4FECA 1FTOA 2ALUA 2O7IA 3Q26A 1Q35A 3QUJA 4R9FA 5H8QA 1LLSA 1BP5A 4UACA 3K00A 3KEIA 4QSDA 3TCHA 4YU0A 4LA9A 4OESA 4UA8A 3PMXA 3P7IA 4RJZA 1QUIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FIMA 2DWAA 4LZ7A 1A7LA 1IXCA 1DPPA 2P2AA 1FW0A 3USDA 3JYRA 1DCUA 3K01A 3ZSFA 2XD2A 4ZE9A 1FCKA 2QS1A 1NH8A 3RTWB 4PC9A 3KJTA 4F2QA 4MH5A 4PFUA 4M1VA 4IO4A 5M2VA 4ONYA 1RKMA 4PE3A 4G68A 4YKIA 4PDHA 3N5LA 3O29A 1SW4A 1FQAA 1OVTA 3U8QA 2E0SA 1LFHA 2WKYA 5A5XA 4F1VA 5I58A 3VLWA 2G93A 2DYXA 5I56B 4FEBA 2YLNA 1PBPA 4NX1A 2RC9A 1A54A 3OEKA 3MQ9A 4JBZA 1IMDA 3IOTA 3E4RA 3U72A 3N94A 1LB8A 1B3LA 3JZJA 4WEPA 4G8HA 2HQ0A 4YICA 4HE2A 2JJKA 4F3GA 4ELPA 3G3FA 1XT8A 2HZLA 2V3TA 5FHOA 3FXRA 4GWXA 3UORA 3O6HA 4I3YA 1MM6A 1D3KA 3HCQA 2VHAA 1ZKBA 1NUXA 2VD2A 3IX1A 1IZ1A 2XX7A 2XXXA 2I3WA 1SVXB 3FV1A 1XI6A 1SYHA 5CM6A 1FPLA 3GYYA 3SEUA 3CIJA 3UP9A 4O3AA 3PUZE 4F39A 5A5LA 5TP9B 4MJOA 1OIBA 4ZS9A 1LCFA 1AOVA 3QAXA 4YB7A 3MSTA 5ITPA 3H06B 1FJ6A 4QSEA 5J16A 4O7MA 2QJEA 3C35A 2DS9A 1B5HA 1LBBA 2ZZWA 2AL4A 1VR5A 1G0IA 1NV6A 4NF6B 4GWUA 2RC7A 1GR2A 3OSRA 2RCAA 1YYZA 4DE8A 3RNNA 1PB9A 4GX6A 2Z8EA 5CBRA 2A5SA 1N84A 2W7YA 3KOTA 3VLUA 2HZKA 4NWCA 2R6GE 4WXJA 4RNSA 2DXYA 5EHSA 4RYAA 5H8HA 4FORA 2Y7RA 4KHZE 1B40A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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