4KHZE

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an pre-translocation conformation bound to maltoheptaose
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for substrate specificity in the Escherichia coli maltose transport system.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli
total genus 119
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4khzE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4khzE01
3K02A 3PUXE 2O7UA 1BP5A 2DXYA 5DYHA 1B5JA 4WKMA 4GQOA 2DVZA 3H6UA 3IORA 5AA3A 4N13A 1SI1A 5ITPA 3FATA 2UXAA 2XXTA 5CBRA 4ELOA 4KYSA 3V83A 3K6VA 4OTEA 3IL1B 1NFTA 1XVYA 2NVUB 3HPIA 2PYYA 4GOTA 1M5BA 3T9VA 3VLUA 2I0BA 4U1OA 2XXYA 1UTHA 4JWYA 5TP9B 2DWIA 5H8HA 4G68B 4RY1A 1OVTA 1PB9A 4FEBA 2PMSA 3PUZE 3OO6A 1N04A 1B3HA 4NF5B 4JSDA 3H6TA 1DPPA 3KZGA 1B51A 4PQJA 3SEWA 5KCJA 4F22A 1VFDA 3FVGA 3N26A 4MLQA 2VGQA 5A5XB 1US4A 2F35A 1PB7A 2Q2AA 3TQLA 4NF6B 2OWTA 1N0TA 4DDDA 4R6HA 3B6WA 4H5GA 3MP1A 4WEPA 4F1YA 4GFRA 1EZPA 1DTZA 3L6GA 2I4BA 3EF7A 2O68A 1JETA 3PMXA 3TTNA 2O51A 1SYHA 1PBPA 2RC7A 1ANFA 3KOSA 3UK4A 4U22A 3FD3A 3V8XB 3EN3A 2CMOA 1D9YA 4KI0E 4XKPA 4FIMA 3IB1A 1IIWA 3PD8A 4R9GA 2F97A 4XIGQ 4DIGA 3VLWA 3MZBA 4TQUQ 1I6AA 2BJJX 2KLFA 3KSXA 5ITOA 2PVUA 4RA1A 4TOZA 4U1ZA 2HAUA 3E3KA 4ZDMA 2VD2A 3PMWA 4LP2B 4DXCA 1MXZA 1ZTYA 3DELB 4YMAA 3ZS6A 1AMFA 3D4GA 4BDNA 1SD3A 3A09A 4F1VA 1JEUA 2Y7WA 4FORA 3N94A 1ATGA 4ZE8A 4N07A 1MY0A 1ZKBA 2RC9A 2OK2A 5I84A 2QRYA 4LZ7A 3MW0A 4OENA 1MDQA 4XKQA 4XKNA 2I58A 1YPNA 3BBRA 3U8QA 5I58B 4NF4B 1B1XA 5H8FB 1A54A 1P1OA 5DVFA 4ZS9A 3MC2A 5JEIA 4R75A 3G3FA 3O6GA 4NMYA 3K2DA 4FAJA 4F39A 4OFOA 3RNNA 2M8CA 1MXYA 3TKDA 2Q2CA 4LVQA 1LCTA 3S9MC 1NNTA 3CSBA 4X1BA 4GF8A 1QKAA 2O6AA 4KPTA 1LAHE 4ZE9A 3V5AA 4DLDA 3KN7A 2R6GE 1Z7NE 1GV8A 4IO2A 4YAHX 3BFTA 1NNPA 4QSEA 3THIA 2PX1A 1POTA 5DEXB 3VDFA 5I57B 5AA2D 5CMMA 2ZYOA 3T66A 1OVBA 3EHSA 3PUWE 5BUUA 4AB6A 4NTLA 3RUMA 1OLCA 1S9TA 1USYH 3TZAA 2QS3A 3TFLA 3UA8A 2QMXA 3RT6B 3T9XB 4YKPA 3VVDA 1GGGA 4LATA 4X48A 2HXWA 2F36A 1HSJA 1B5IA 5CMKA 2F5XA 4JWOA 2Z8EA 1TT1A 2QMWA 1YAEA 1JNFA 1AOVA 3BFUA 2Q88A 4G8MA 4H0WA 3H6VA 3IOWA 4MLVA 4OYVA 2H9BA 1MQGA 3IX1A 2RKMA 2ABHA 1P1UA 5AA4A 5JTYB 4DXUA 1B3EA 1B7HA 4Q8RA 2D21A 1N3XA 3FV2A 2A5TB 3PUYE 3PPOA 3EQ1A 4YB5A 2O84X 4P0GA 1CB6A 4RNSA 3CIJA 3U94A 4EQ9A 3SEUA 4GL8A 3S9NC 1Q1KA 1A8EA 4ONYA 2F7BA 3E4RA 4YICA 2ZNTA 5EHSA 4LZ8A 1IXHA 2ONKE 5EYFA 4KCDA 1TWYA 1URSA 3R26A 4F1UA 4BDOA 2VP1A 1BIYA 3K1MA 3K0VA 4RPOA 3PUVE 4Q0CA 1GTKA 4ZZAA 2I0CA 1H45A 1SQYA 4EQBA 3WAEA 5HPQA 2VOZA 2NXOA 1HSLA 1MY1A 4WXJA 3MVZA 2B65A 3G3JA 3ONMA 1M5FA 3OXNA 3IB2A 4YKJA 4OFJA 4HCYA 4MBPA 3KOTA 4OMBA 1VFEA 1M5DA 3G3IA 3FVNA 2R71A 4R6KA 4R2BA 5TP9A 2Q8JA 3GZGA 3S9EA 4PP0A 5H8QB 4G68A 2F7CA 4XKRA 4H67A 3ZKKA 2XX7A 3FVKA 1FTMA 4NF5A 3UP9A 2OBGA 5I2NB 2DVCA 5AA2B 2XXXA 4F3BA 5A5XA 2QS4A 2DYXA 4NF6A 2HZKA 2P0SA 4OXVA 4C1TA 3RLFE 4POWA 3FXUA 1CE2A 2W7YA 3FXQA 4KD5A 2E0SA 3S2VA 4DCXA 4F29A 3MVWA 3CRBA 4ZEBA 1RYOA 2Z23A 4JB7A 4G77A 3C31A 4H5FA 1FQBA 1GR2A 1QULA 2XXQA 3USDA 4H8IA 1LFGA 5CI5A 1TFDA 3EPEA 4KQPA 3RPWA 3C36A 5H8NB 4F3GA 3TMGA 3W15C 1FTKA 1N7WA 4NF8B 2QJEA 1KWHA 2I4CA 3MBPA 3G3KA 3SDFA 1D9VA 4QFLA 3RY3A 3SEYA 2ZXTA 1A55A 3C32A 1SW4A 1BLFA 2QSXA 3M3FA 1ZBMA 1AH5A 3IJXB 2IA4A 3TEPA 2H98A 2OJTA 3LBSA 5DTBA 3R6UA 1FQEA 2UVJA 3PV0E 4R74A 3R7XA 2GH9A 3Q28A 4NWDA 2QPQA 3HSTA 1PEBA 3TCHA 2O7IA 2XXWA 2AIXA 3DP6A 1B7ZA 3LSXA 1JVXA 3S9LC 3SERA 2B3BA 4KHZE 3N5LA 1Y1ZA 2F6GA 1JW4A 5DVJA 4DE8A 4YZZA 4H6DA 4U4SA 5I58A 4I1DA 3GBBA 3MZ1A 4NF4A 2XX9A 3TELA 3O28A 1MXXA 5H8FA 2YJPA 3RN8A 2V93A 1URGA 2QS1A 3U72A 2NWJA 2DOJA 3K6XA 3TCFA 5BWJA 1H3DA 5M2VA 4F2QA 4H8JA 2H5YA 3IR1A 4KCCA 3T93B 4O3BA 1JW1A 1R1NA 1D4NA 2V25A 3K1NA 3IAZA 1PDAA 1EZ9A 4GVOA 4JBZA 1SVXB 3UGWA 4ELRA 3G7WA 4ECFA 4FECA 4QFKA 5DEXA 4HCWA 5I57A 3MWBA 1I6QA 2RC8A 2Y7PA 3FV1A 4NWCA 4M1VA 2OWSA 1B52A 5L9OA 1UIUA 1I6BA 4GXSB 1I69A 3QK6A 3HV1A 4UA8A 3TPAA 2REGA 4BDLA 1P99A 3W9VA 4ZEKA 1MPBA 3D4CA 2F8DA 1QKBA 1QUJA 2I3WA 4OEUA 4P0IA 4YMBA 1MQHA 3O9PA 4PFYA 2DWAA 3FJMA 4Q30B 3UIFA 4HTGA 3TDJA 2XXIA 3VE1B 4R6YA 3KJTA 2UVHA 1LBCA 3TQWA 1Y3QA 3FJ7A 3SESA 5AE4A 4THIA 2XX8A 2P2AA 5I59B 5TU0A 3PMVA 1B3LA 4ZZEA 2X26A 1LFIA 4F2OA 1IZ1A 4ZEIA 1ZJLA 1MXWA 1XT8A 2HCAA 2GRVA 1NKXA 1Y4CA 2H4IA 3EHUA 1B32A 4AQ4A 3KN3A 4GXAA 3UORA 2D3IA 5JTYA 2Q89A 3RTWB 3K4UA 1B4HA 2RF1A 3FIRA 4GLIA 3I6VA 1NMUA 1LB9A 1PC3A 3CG1A 2A5TA 1MDP1 1T0KA 3OENA 1MS7A 4IB2A 1P1QA 2I48A 1L5TA 4R73A 3RGYA 2Q9TA 4TLMB 1ZLQA 2GHBA 4JSOA 2UVIA 1O64A 1NNFA 3B6TA 1MY3A 4KR5A 5ISUA 4RJZA 1Z7ME 4IO6A 3O66A 4K3FA 3EHTA 1MG1A 1R9LA 1BKAA 1MQIA 2ZYNA 4QRZA 5F1QA 5AA1A 3RQTA 2IEEA 2HZLA 4YB7A 1Y3NA 3MVYA 2E1SA 1J1NA 1B6HA 3L6HA 1M5CA 2X7QA 3DM0A 4DXBA 3CR9A 1URDA 1SI0A 3O29A 2ANJA 3OO9A 1SW2A 4POXA 1DSNA 1Y3PA 1IITA 4QFOA 4IY5A 5I56B 3T96B 3CFXA 4LQ2A 1UTBB 2Y7KA 1FTOA 2V3TA 3SETA 3G3GA 5H8QA 3V89B 4G2ZA 3T9HB 1MM7A 5CBSA 1IXIA 5K2XA 3OOAA 1UIVA 1FQAA 3C4MA 3PPRA 3QAXA 5I2NA 1LAFE 2ZYMA 3S4UA 1XOCA 5AA2A 5I2KA 4TLLB 3VFJA 4NEDA 1MY4A 2XD3A 3DP8A 1O63A 2VHAA 1SYIA 3TYHA 1US5A 1B3GA 1GVCA 2ZNSA 1ZU0A 3P7IA 5TPAB 1MXVA 3K01A 3FJGA 3KSJA 2DQVA 1N3WA 4Z7EA 3G3HA 4P11A 1FW0A 2ZYKA 1OQGA 5FHNA 1A99A 1JEVA 1N76A 3PPPA 2ZMBA 1M5EA 4ISUA 2DS9A 3K00A 5CRYA 4JDFA 2Z8DA 1HSEA 3DLNA 5KDTB 1A8FA 2FNCA 4PFUA 1VR5A 3IOTA 5H8NA 2DE3A 4NF8A 3LR1A 3Q27A 3MVXA 4G68C 5FTHA 4OFLA 1OIBA 2D5WA 5FHMA 4RK2A 1DMBA 4DZ1A 4PE5B 4F19A 1S50A 4GD5A 1DOTA 3E13X 1JQFA 1R9QA 1B5HA 4OVJA 1B9JA 3AXFA 4LONB 1QVSA 3O2AA 2AYSA 2RCAA 3WAFA 1B3FA 1II5A 4EXLA 1VE4A 4ELQA 1RKMA 2V3QA 1LLSA 2GFEA 3MJNA 3TUSA 2HEUA 3ECRA 3SEXA 3QSLA 3U92A 4DCYA 4IO7A 2VD3A 3O97A 5I2KB 2XXPA 1Q35A 3W9WA 1B05A 4XXUA 3IO6A 4GRKA 1OMPA 3PD9A 5DVIA 5CMCA 1WVJA 3TAJA 5L9SA 3UN6A 4LQ5A 3O6IA 1XVXA 1MY2A 3MUQA 3K6UA 3H03A 4R2FA 1BTJA 2G93A 2NUVA 4G8HA 2G29A 2XXVA 4AB5A 2Z22A 2QL3A 3KEIA 1A40A 3LUYA 4KFQA 3ILUB 5L9MA 5L8DA 3Q29A 1MH3A 3FUZA 4X1DA 4QFNA 2DE2A 2X7PA 5JK4A 1JW5A 4U23A 5EHMA 4O3AA 1Y4TA 4PFWA 4FEDA 3LSFB 2Y7RA 1B4ZA 3OSQA 1EU8A 2UYEA 3HCQA 3HO7A 2P1SA 3PPQA 2THIA 4HW8A 3SEVA 1SBPA 2XXRA 3KFMA 1PB8A 1LAXA 3OEMA 4UACA 5H8SA 4QFPA 3OEKA 3SKPA 3OD7A 4OESA 4OEVA 3C9HA 3RT8A 1NH7A 2DXRA 3H4ZA 3QUFA 5I59A 2NOOA 1H43A 4G8NA 4IGTA 4E0WA 4XTCQ 2Z8FA 2DWHA 3LC8A 3M3KA 5IAIA 4OETA 4Z0IA 4I62A 3LSLA 3HHGA 5CMBA 4EXKA 1N84A 4YU0A 3GXAA 3JV9A 4I9DA 4GIZA 4F3PA 1XS5A 3ZKLA 5J1DA 3HHFA 5CM6A 4PETA 3N6UA 3B7DA 3H6WA 3M3LA 5HM4B 3C34A 1NNKA 3C35A 3OMBA 4NE4A 1MM6A 3A3CA 3O6HA 1A7LA 3CFLA 3CI8A 3OO7A 4R72A 4QF9A 3GBAA 2O69A 4KYEA 4ESXA 2ZNUA 1B2HA 2LAOA 1F9BA 2WKYA 5DT6A 1TFAA 3MPLA 3T9UA 4OHNA 3DP4A 2I6EA 2XXHA 4H1XA 1O7TA 1EH3A 3OO8A 5ICQA 4WEDA 4ZECA 3BKIB 1B46A 1LAGE 1IEJA 1LB8A 3IOVA 4EDPA 4IY6A 1DTGA 4F18A 5HBCA 2O1MA 4KYDA 2RCBA 4ELPA 1MRPA 3U1OA 1UTHB 2I49A 5H8HB 1SDXA 2QS2A 4MF3A 5CC2A 1OQHA 1IQ7A 2F78A 4IO4A 1USYE 4LZ5A 4BLAA 2R9JA 5I56A 3OELA 3VVEA 4RK9A 5KCJB 3JYRA 3VV5A 4EF2A 1UTBA 2XHDA 1IUDA 3MZ9A 1QJMA 1B7UA 2REJA 1P1WA 4GL0A 2B3FA 3QIMA 1Y9UA 1MPCA 1IXCA 2PT2A 1EZOA 2GHAA 2V3UA 5ELVA 2AL4A 3ZSFA 1XC1A 1FTJA 2H99A 4ND9A 5FHOA 2F34A 1QUIA 3MAMA 3N6TA 4EF1A 3VLVA 4C1UA 4YKKA 3K1PA 1B1HA 4F3SA 3K6WA 4MFIA 3RTFB 5IKBA 1R6ZA 1YTVA 5ICTA 3VXBA 4EUOA 3IO4A 4QSDA 4I8CA 1FQCA 3C33A 4RXLA 4E0XA 4FJPA 4L17A 5TPAA 2Y84A 4HS7A 1MQDA 2UVGA 3KJ7A 4ZEDA 4R9FA 5FTIA 1XHYA 4X9TA 1QW0A 2F7AA 4GWOA 4JXIA 3M8UA 3GLBA 3TTRA 3H06B 1LFHA 4ESWA 5LOMA 2XXUA 1FTLA 5KDTA 4Q5TA 1ZIUA 3QYTA 2ESNA 4N6PA 1P1NA 5KZTA 1SW1A 4OERA 2YPNA 3F11A 3CSGA 3MPKA 3TCGA 4FE8A 1TXFA 3KGCA 3FGSA 1YCJA 1B58A 1UQWA 2XD2A 4BDRA 3KG2A 4IGRA 1ZMGA 1DPEA 1ELJA 3TODA 1WODA 2YLNA 3TTLA 3VXCA 4BDQA 4BDMA 1RYXA 1LBBA 1QUKA 2DSFA 2OCUA 2A5SA 1MQJA 3CG3A 1H44A 1H76A 3QXMA 1S7YA 3H3GA 2HFBA 1SW5A 1IXGA 1N7XA 4YKIA 3ILTB 5B70A 3I5OA 3B6QA 2OZZA 1B0HA 2Y7IA 4OQOA 2V84A 2ONSA 1PBQA 4YB6A 1FQFA 1MPDA 4EQ7A 2DE4A 3Q25A 3TTMA 3CVGA 1OLAA 4OWDA 4IO5A 1POY1 4FATA 1MXUA 3FXRA 3MQ9A 1B40A 2CZLA 2ALUA 3JZJA 4G4PA 4U2RA 4QHQA 3PU5A 2HAVA 2PT1A 5B7DA 3QUJA 4RYAA 3VVFA 5F7VA 4QSCA 3PPNA 1NH8A 4PFTA 3I3VA 4O3CA 4ZEFA 3OSRA 2H25A 3TTKA 1FQDA 3T22A 2F6PA 2OLBA 3Q26A 2DWJA 3MP6A 3U93A 3IJOB 3IOUA 4M4GA 2I3VA 3HN0A 4IO3A 3PGFA 5K2YA 4U4XA 1MH4A 3E9XA 2DP8A 2UYFA 3H7MA 4F31B 1FCKA 3A3UA 2PBWA 3FASA 1Y1MA 2RINA 2HQ0A 4LA9A 3IK6B 1LSTA 3IB0A 4MH5A 2FA7A 1NL5A 5AA4B 3LSWA 3KBRA 4LUBA 3MP8A 4H65A 1LGBC 4U21A 1D3KA 1Y20A 3FZVA 1AL3A 4OZ9A 1B0LA 1WDNA 1JVYA 3FVOA 2O1LA 2AL5A 1AIVA 4RPNA 2FYIA 2ONRA 3CFZA 1LCFA 4C0RA 4JWXA 3ODBA 1VSOA 3KN8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IGAA 3K02A 3PUXE 2Q74A 2O7UA 1BP5A 2DXYA 5DYHA 1B5JA 4WKMA 4GQOA 2DVZA 4P8BA 3H6UA 3IORA 5AA3A 4N13A 1SI1A 3KC1A 1RDXA 5ITPA 3FATA 5IM2A 2UXAA 2XXTA 5CBRA 4ELOA 4JVDA 1DCUA 3IFCA 4KYSA 3V83A 3U65A 3K6VA 4OTEA 3IL1B 1NFTA 1XVYA 2NVUB 3HPIA 2PYYA 4GOTA 1M5BA 3T9VA 3VLUA 2I0BA 4U1OA 2XXYA 1UTHA 4JWYA 4N6KA 5TP9B 2DWIA 5H8HA 4G68B 4RY1A 1OVTA 1PB9A 1INPA 1RDZA 4FEBA 2PMSA 3PUZE 3OO6A 1N04A 2ZZXA 1B3HA 4NF5B 4JSDA 3H6TA 1DPPA 3KZGA 1B51A 4PQJA 3SEWA 5KCJA 4F22A 1VFDA 3FVGA 2VT5A 3N26A 4MLQA 2VGQA 5A5XB 1LBZA 1US4A 2F35A 1PB7A 2Q2AA 3TQLA 4NF6B 2OWTA 1N0TA 4DDDA 4R6HA 3B6WA 4H5GA 3MP1A 1FBFA 1IMEA 4WEPA 4F1YA 4GFRA 1EZPA 1DTZA 3L6GA 2I4BA 3EF7A 1FPLA 2O68A 1JETA 3PMXA 3TTNA 2O51A 1SYHA 2KR0A 1PBPA 2RC7A 4IR8A 1ANFA 3KOSA 4N15A 3UK4A 4U22A 3FD3A 3V8XB 3EN3A 1KA0A 4KXPA 2CMOA 5I3SA 1D9YA 4KI0E 4XKPA 4FIMA 3IB1A 1IIWA 3PD8A 4R9GA 2F97A 4XIGQ 4DIGA 3VLWA 3MZBA 4TQUQ 5I5PA 1I6AA 2BJJX 2KLFA 3KSXA 5ITOA 2PVUA 4RA1A 4MIJA 4TOZA 4U1ZA 2HAUA 3E3KA 4ZDMA 2VD2A 3PMWA 4LP2B 4HE2A 4DXCA 1MXZA 1ZTYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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