4KHZE

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an pre-translocation conformation bound to maltoheptaose
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli
publication title Structural basis for substrate specificity in the Escherichia coli maltose transport system.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 119
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4khzE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4khzE01
1DPEA 4ND9A 2NXOA 3DP8A 4X9TA 4Z7EA 2Y7PA 3UGWA 1R6ZA 3VLVA 4PFTA 3T9XB 5L9MA 4GFRA 5CMCA 1M5EA 2G29A 1BLFA 4NF8A 1MPCA 4XKNA 2F8DA 3TCGA 4F3BA 4FEBA 1WODA 1JNFA 3IO4A 2O6AA 4FECA 4F19A 2ONRA 2LAOA 1IIWA 3KZGA 4XKRA 4G4PA 2H25A 4YAHX 1R1NA 4KR5A 5AA2B 5K2YA 4YZZA 1Z7ME 3QSLA 4Q8RA 1SBPA 1MY2A 4HS7A 3O6HA 4DLDA 3VVDA 4UA8A 4F29A 4RYAA 1RYOA 3TCHA 4JXIA 1B1XA 5I2NA 5H8HB 1B3EA 3TTRA 2RINA 4KCCA 3MZ9A 1MM6A 2Q88A 3C32A 1LLSA 1B5JA 4F22A 1B0HA 2DYXA 3PMWA 5BWJA 2F6PA 4NF6B 2DE4A 1SW2A 2IEEA 4LATA 1FCKA 5H8NB 4POWA 4YKJA 4OMBA 3OSRA 3P7IA 3PPRA 1ZJLA 3K01A 4DZ1A 2A5TA 2Z8FA 4ISUA 4X1DA 3TKDA 4RXLA 3RY3A 3MZ1A 3Q26A 3DELB 5TPAA 1NH8A 3K6VA 3QAXA 5J1DA 4OFLA 4F2OA 1PBPA 4R72A 1PEBA 1B3LA 1B3GA 1BP5A 4Q5TA 3H6VA 1Y3PA 4QRZA 1JW4A 4WEDA 4F2QA 2E0SA 4BDRA 1MPDA 3FGSA 1Q35A 4QFLA 4EF2A 3CI8A 2OK2A 2X26A 3CR9A 3KN3A 1UQWA 4E0XA 4YKPA 1JVXA 4IY6A 2ABHA 1N0TA 4BDMA 3EN3A 3V89B 3KGCA 1P1WA 4GOTA 1NMUA 5IAIA 1FQFA 3AXFA 2PMSA 4QFKA 2I3VA 4FORA 1OVBA 3IJOB 1B7UA 4ZECA 1B51A 2F97A 2VGQA 1AL3A 1R9QA 4X1BA 2DWJA 2Y7WA 1MQGA 1A55A 3KOTA 1FTOA 5ITOA 1H76A 4FIMA 3ZKKA 3GBAA 4YB7A 4XKQA 3MVXA 5B7DA 3SESA 1YAEA 2XXHA 5I2KA 3O29A 2AYSA 2WKYA 4F1VA 5I2NB 2ZXTA 3K6UA 4F1UA 2I58A 3VXCA 4MBPA 4R6YA 1H45A 1DPPA 5A5XA 2A5SA 4MFIA 4PFYA 4G68C 3MP8A 1JETA 3TTMA 4OEVA 2PBWA 3KFMA 2ZYMA 4FEDA 3RQTA 1MQDA 3MUQA 2F78A 4GRKA 4FAJA 2ONSA 2FA7A 1SYHA 3KJTA 4LZ7A 4H5GA 3PUXE 5TP9B 3Q25A 1TFAA 3IAZA 1VR5A 5DEXA 1GV8A 4IO7A 2XX9A 2ALUA 2ZMBA 1D9VA 2ANJA 3OEKA 3OELA 3MC2A 4NTLA 5I58A 3VE1B 4PFWA 4O3AA 3C9HA 3S9LC 1UTHB 1N3WA 1Y3QA 1XS5A 4TQUQ 4G8MA 3H6UA 1M5CA 1XC1A 4TLLB 3IOWA 4RA1A 4GL8A 5AA3A 4OFOA 2V3UA 2HAUA 1N7XA 2I6EA 4HTGA 3IOVA 3S9MC 2X7PA 1I6BA 2AL5A 2DWIA 3RPWA 1OMPA 4O3BA 3TQLA 2CMOA 4DXCA 5AE4A 3TODA 2YLNA 3O6GA 3MVWA 3MP6A 1TT1A 4N07A 3RTWB 4PETA 1MXZA 2Y7IA 5FHOA 4OYVA 2XXQA 2XXUA 3TELA 5ISUA 3PD8A 2G93A 2UVJA 3MP1A 3LBSA 3VVEA 3CFLA 1ZBMA 1Y20A 1B1HA 1H3DA 2DE3A 1CE2A 1B40A 5L9OA 5I2KB 1B0LA 3CG3A 3HPIA 2RC9A 4RNSA 2OCUA 4IY5A 3RGYA 3OO9A 5A5XB 3QK6A 3RTFB 3CIJA 1S50A 5I84A 3MQ9A 5AA2A 2F5XA 1I69A 5I59A 1LGBC 2I3WA 1USYE 4IO6A 3VXBA 5FTHA 1MXXA 3FZVA 1QJMA 2O7IA 3HO7A 5H8HA 3N26A 1POTA 4C1TA 1N3XA 3PD9A 1XOCA 1Q1KA 2VD2A 5DEXB 3HHFA 2PYYA 2B3FA 1OLCA 2DSFA 3U92A 1AOVA 3CRBA 2UVGA 4NF6A 1Y4CA 1P1OA 4DDDA 3H7MA 2DP8A 1LAGE 2XX7A 1ZMGA 3RT6B 1QULA 2RKMA 3SEYA 1MDP1 5ICTA 3RLFE 4ZDMA 5CRYA 5DT6A 2GHBA 3FVGA 1NH7A 4JDFA 3KG2A 3G7WA 2VOZA 4LA9A 2I0BA 4BDNA 4JSDA 5DVFA 1MQJA 1TXFA 3UP9A 5BUUA 2DE2A 5FHMA 3BFUA 2FNCA 4H67A 3MBPA 4ZEIA 1BTJA 2DWAA 1PC3A 3FJGA 3FVNA 1IEJA 2QSXA 3PUWE 4Z0IA 4NF5A 2QRYA 1O7TA 2O7UA 3LC8A 3M3LA 1LCFA 3JYRA 4ZE8A 3U8QA 1OQGA 1WDNA 3LR1A 4OESA 4G2ZA 4EUOA 5H8FA 4DXBA 2H4IA 3T96B 5FHNA 3IL1B 4F31B 2Y7RA 4QF9A 2HCAA 3G3HA 3EHUA 1TWYA 4LVQA 4RK9A 4GQOA 3USDA 2DXRA 3E13X 1OQHA 3UN6A 3FJ7A 1I6QA 1P1UA 3G3KA 4AB6A 4YMAA 4JBZA 3OO7A 3TCFA 3SEWA 3HV1A 3SEXA 3JV9A 1EZ9A 5DVJA 3IB1A 4ZE9A 5I59B 1ATGA 3QYTA 4PFUA 2R6GE 5L8DA 4OTEA 3K1PA 3PGFA 4RY1A 4IO2A 2DQVA 1S7YA 4KYDA 5TU0A 3VDFA 3K4UA 2H9BA 2REJA 1JEUA 4LZ8A 4THIA 4R2FA 3OENA 3ILTB 3BBRA 1IXGA 1PDAA 3LUYA 1JVYA 4U22A 2XXYA 2HEUA 1XHYA 2GHAA 1DOTA 1LFHA 3MJNA 4R9GA 3JZJA 1UIUA 4R2BA 3VVFA 4U1ZA 3PPPA 3PUVE 4KCDA 4F3SA 5EYFA 3KJ7A 3KSXA 3M8UA 3C33A 3OO6A 3U1OA 5TP9A 4RPNA 4H0WA 1QUKA 1QKAA 2YJPA 4RK2A 1LFGA 1MQIA 3UORA 1P1QA 1F9BA 3TEPA 5CC2A 3SEUA 4OENA 4OWDA 3RUMA 1NNKA 4X48A 1XT8A 4JSOA 2QPQA 1UTHA 3PU5A 1D9YA 2GH9A 2PVUA 4LP2B 2X7QA 2F36A 4F39A 4NF5B 4NMYA 3TFLA 1AIVA 3DP4A 1A8FA 3Q29A 2ZYNA 4JB7A 1IZ1A 3V5AA 2P0SA 5LOMA 5H8FB 1SDXA 4YMBA 4H8JA 1B4ZA 4GF8A 3RNNA 3S4UA 1IXIA 1M5FA 4FE8A 1N04A 1N76A 3K00A 1PB7A 3R26A 2HFBA 3KN8A 2O51A 4DCYA 5CMBA 1A7LA 4DCXA 4HW8A 1RKMA 2M8CA 3GZGA 3FD3A 2XXRA 4NF4B 1A40A 4DE8A 3W15C 1DSNA 2XXIA 1NNPA 3O97A 1A8EA 4XKPA 1Y1ZA 1MDQA 1QKBA 2F7BA 2Z22A 4H1XA 3PPQA 3MPLA 2DVCA 2H98A 1S9TA 1US4A 4IO5A 4FATA 1MY0A 4KFQA 1NKXA 3T22A 1XVXA 1B52A 1Y1MA 3FVKA 2Q8JA 5IKBA 4GXSB 1ANFA 2AIXA 2PT2A 2XD3A 3O66A 4H5FA 4ZS9A 1LAHE 5HM4B 1LFIA 3OD7A 3A3CA 3A09A 3K6XA 3IX1A 2XXXA 4C0RA 1IXCA 4OVJA 1Y4TA 3E3KA 3N6UA 2R71A 5ICQA 1CB6A 5I57A 1IXHA 4AQ4A 1O63A 2QS1A 1SQYA 4IO4A 4OERA 3VV5A 3SETA 4KYSA 4KQPA 1N84A 3V8XB 3HSTA 3MAMA 5CBSA 1LB9A 3HN0A 3PUZE 1SVXB 1MG1A 3IO6A 2I4BA 1HSLA 1SW1A 2ZYKA 4RJZA 3U72A 1FQAA 1DMBA 2RC8A 3IK6B 1B7ZA 2XXVA 3FV2A 1NFTA 3OO8A 2FYIA 1URSA 1Z7NE 3I5OA 2Y7KA 2UVIA 5CM6A 1BIYA 2H5YA 2VP1A 3TUSA 3U94A 1XVYA 3R6UA 5KDTA 3O2AA 1GGGA 4YB6A 1ZIUA 3KOSA 3VLWA 4R6HA 3C36A 3WAEA 2NOOA 3RN8A 2QS2A 3FXRA 4U1OA 4NWDA 3K02A 3TQWA 1URDA 1AH5A 1JEVA 3K0VA 1GR2A 3H3GA 2F7AA 3H6WA 2F34A 3CFZA 3TZAA 4P0GA 3ONMA 4EQ9A 1VFEA 4U21A 4K3FA 3E9XA 1LAFE 4R9FA 5B70A 2P1SA 4GVOA 3O9PA 2QS4A 4R75A 2OZZA 4LZ5A 2NVUB 1QUIA 1ZKBA 2D5WA 3TMGA 2ZNSA 3G3FA 2XX8A 2Y84A 4R6KA 3DP6A 4XIGQ 4BDOA 1LSTA 1AMFA 1LB8A 1IITA 2DXYA 4ELQA 1Y3NA 3D4GA 5I57B 2I0CA 5I56B 1JW1A 4E0WA 4YU0A 2XXTA 1EZOA 3IOUA 4QFNA 1B5HA 2VHAA 1FTLA 2HZKA 4IB2A 2O1MA 3K6WA 1B7HA 4F3PA 5H8SA 3CFXA 1PBQA 2I49A 1B32A 3T9VA 5DVIA 3TDJA 4OEUA 1USYH 1FW0A 4QFOA 4L17A 1VSOA 1US5A 4TLMB 3DLNA 3H4ZA 4P11A 3O6IA 1T0KA 1I6AA 4G8HA 4WEPA 1FTJA 1B58A 2V25A 2H99A 3G3JA 5HPQA 4JWYA 2Z8DA 2I4CA 1GVCA 1L5TA 3PMVA 4OFJA 5KDTB 4HCWA 1YCJA 2Q9TA 4QHQA 3UA8A 2RF1A 3T9HB 3FASA 3K1NA 2B3BA 4EQ7A 3PMXA 2DOJA 4JWXA 4I1DA 1SW5A 3SEVA 3TAJA 4XXUA 4U23A 3CSBA 4GIZA 4MF3A 5JTYA 1NL5A 3H6TA 4OXVA 3S2VA 3V83A 4M4GA 4TOZA 3TTKA 3MZBA 3QUJA 3SERA 4N6PA 5CI5A 1MXUA 3PPOA 2ZNTA 4ECFA 4NF4A 4U4XA 4G68A 2E1SA 1A54A 3TPAA 3CVGA 1JQFA 1LCTA 2OBGA 2YPNA 3IR1A 1H44A 1NNTA 1B5IA 3LSWA 2RC7A 4ZEKA 2DWHA 4ZEBA 2F7CA 4AB5A 1PB8A 3VFJA 3S9NC 3HCQA 3F11A 2ESNA 1TFDA 3CSGA 2PX1A 2THIA 3N5LA 2O84X 2QJEA 3E4RA 5AA2D 3FUZA 3Q28A 3U93A 4PQJA 3DM0A 1MRPA 2NUVA 5EHMA 4F18A 4BDLA 4R74A 2V93A 1MS7A 4ESWA 3OSQA 1B3HA 3OEMA 1QW0A 3N94A 1D3KA 4EF1A 4IO3A 4HCYA 4WXJA 1M5BA 2GFEA 3RT8A 3TTLA 4Q0CA 5DTBA 3I6VA 2BJJX 4I8CA 1MXYA 2I48A 1FQEA 4MLVA 3KN7A 3M3KA 4I9DA 4KHZE 1II5A 5EHSA 3K1MA 5JEIA 1VE4A 5AA4A 3ILUB 3BFTA 3LSLA 2O1LA 1UIVA 4KYEA 1A99A 2OJTA 3ZSFA 1FQCA 3FVOA 3LSFB 4QSCA 5JTYB 1KWHA 3FXUA 4MLQA 3GXAA 3OMBA 4ONYA 4U4SA 3ZS6A 5DYHA 1MY1A 1SW4A 2CZLA 2W7YA 3C34A 4H6DA 4QSDA 2HZLA 2O69A 1B05A 2ZYOA 4G68B 3L6GA 4NE4A 3L6HA 3KSJA 3MW0A 2GRVA 2XHDA 4JWOA 4NF8B 4U2RA 4DXUA 4EQBA 4P0IA 2HAVA 1EZPA 4OETA 3O28A 1SI0A 3FXQA 5CMMA 5AA1A 1GTKA 3H03A 3PUYE 2KLFA 4Q30B 1HSEA 2HQ0A 2RCBA 1H43A 3B6WA 4C1UA 1MH3A 1M5DA 3THIA 3W9VA 3D4CA 4EDPA 3SDFA 2QL3A 2AL4A 5K2XA 3SKPA 3B6QA 1P99A 3ZKLA 1RYXA 3CG1A 1LBCA 1OIBA 3MVYA 1EU8A 4EXKA 1MPBA 1ELJA 3IORA 3IOTA 1DTZA 4BLAA 1MXVA 5F1QA 2UYEA 3ECRA 5I56A 5H8QA 1HSJA 3R7XA 1D4NA 2IA4A 2A5TB 2DS9A 1LBBA 1ZU0A 1JW5A 4PP0A 5JK4A 1URGA 3C4MA 5TPAB 4F3GA 4OHNA 2REGA 3OOAA 2Z8EA 1P1NA 5HBCA 1MXWA 4EXLA 4G77A 4QFPA 4NWCA 3T9UA 5AA4B 1B2HA 1FTKA 1FTMA 4KPTA 2D21A 5CMKA 1B6HA 4KI0E 3K2DA 2HXWA 5ITPA 3B7DA 5KCJA 3LSXA 4ELRA 3GLBA 2Z23A 1OLAA 1N7WA 4KD5A 3N6TA 4G8NA 4H65A 3FJMA 3IB0A 4GL0A 4QSEA 3Q27A 3QXMA 3T66A 4GWOA 5L9SA 4BDQA 1B46A 1OVTA 1FQBA 2NWJA 3EPEA 1UTBA 2ZNUA 2F6GA 3EHSA 3GBBA 4I62A 2XXPA 2V84A 3TTNA 2P2AA 4YB5A 1B9JA 2F35A 3HHGA 1Y9UA 4ZZEA 2QMWA 2XXWA 4O3CA 4ZEFA 5ELVA 1IQ7A 3KEIA 3QUFA 3MVZA 1MH4A 3G3IA 3A3UA 3PV0E 3MPKA 1MY4A 1YPNA 2Q89A 4ESXA 3B6TA 2PT1A 4GXAA 1WVJA 2Q2CA 2Q2AA 1ZLQA 4MH5A 1ZTYA 3VLUA 2O68A 2UVHA 2OWTA 1O64A 1MY3A 5F7VA 4DIGA 1NNFA 3FV1A 3G3GA 1IUDA 1SD3A 4M1VA 5KZTA 3WAFA 3OXNA 4R73A 4F1YA 3W9WA 4LUBA 3PPNA 2OWSA 4IGTA 2RCAA 1PB9A 5H8QB 2QMXA 3C35A 1SI1A 4LQ5A 2R9JA 1EH3A 5M2VA 1SYIA 4OZ9A 3QIMA 4YKIA 1QVSA 3EQ1A 4ZZAA 3S9EA 4FJPA 4WKMA 3T93B 5H8NA 1DTGA 5I58B 4ZEDA 3KBRA 4PE5B 4POXA 1J1NA 2QS3A 3I3VA 5KCJB 4OQOA 4ELPA 1LAXA 1MQHA 3TYHA 2VD3A 4YICA 5CBRA 2ONKE 5FTIA 3UK4A 4H8IA 4NEDA 4YKKA 4RPOA 1YTVA 4XTCQ 2DVZA 3M3FA 1VFDA 4GD5A 4ELOA 3IJXB 1BKAA 1UTBB 3ODBA 1B4HA 3EHTA 2OLBA 3H06B 4N13A 1QUJA 1FQDA 3BKIB 1R9LA 4LQ2A 2UXAA 2B65A 4UACA 2UYFA 3IB2A 3FIRA 3UIFA 2V3TA 4GLIA 4IGRA 3C31A 1POY1 3FATA 2D3IA 4LONB 1MM7A 3EF7A 2XD2A 1B3FA 2V3QA 3MWBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DPEA 4ND9A 2NXOA 3DP8A 4X9TA 4Z7EA 2Y7PA 3UGWA 1R6ZA 3VLVA 2DDKA 2KR0A 4PFTA 4HE2A 3T9XB 5L9MA 4GFRA 5CMCA 1M5EA 2G29A 1BLFA 4NF8A 1MPCA 4XKNA 2F8DA 3TCGA 2B4MA 4H46A 4O8MA 4F3BA 4FEBA 1WODA 1JNFA 1RDZA 3IO4A 2Y5LA 2O6AA 4FECA 4F19A 2ONRA 2LAOA 1IIWA 3KZGA 4XKRA 4G4PA 2H25A 1K9ZA 4YAHX 1R1NA 4KR5A 5AA2B 5K2YA 4YZZA 1Z7ME 3QSLA 2QVVA 4Q8RA 1SBPA 1MY2A 4HS7A 3O6HA 5IM2A 4DLDA 3VVDA 4UA8A 4F29A 4RYAA 3EKIA 2Q74A 1RYOA 3TCHA 4JXIA 1B1XA 5I2NA 5IZ1A 5H8HB 1B3EA 4MNIA 3TTRA 2RINA 4KCCA 3MZ9A 1MM6A 2Q88A 3C32A 1LLSA 1B5JA 4F22A 1B0HA 2DYXA 3PMWA 5BWJA 2F6PA 4NF6B 2DE4A 1SW2A 2IEEA 4LATA 1FCKA 5H8NB 4POWA 4YKJA 4NX1A 4OMBA 5IZ3A 3OSRA 3P7IA 3PPRA 1ZJLA 3K01A 4DZ1A 2A5TA 2Z8FA 4ISUA 4PDHA 4X1DA 3TKDA 4RXLA 4X04A 3RY3A 3MZ1A 2XWIA 3Q26A 3DELB 5TPAA 1NH8A 2L5VA 3K6VA 4P56A 3QAXA 5J1DA 4OFLA 4F2OA 1LBXA 1PBPA 4R72A 2XA5A 1PEBA 5DW8A 1B3LA 1B3GA 1BP5A 4Q5TA 3H6VA 1Y3PA 4QRZA 1JW4A 4WEDA 4F2QA 3MYUA 2E0SA 4BDRA 1MPDA 3FGSA 2P3VA 1Q35A 1IMFA 4QFLA 1NV2A 4EF2A 3CI8A 2OK2A 2X26A 3CR9A 3KN3A 1UQWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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