4KI0E

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an outward-facing conformation bound to maltohexaose
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for substrate specificity in the Escherichia coli maltose transport system.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ABC transporter related protein
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli
total genus 121
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ki0E02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ki0E01
2GFEA 1IIWA 3IX1A 1NNTA 2RCAA 3A3CA 4QFKA 5H8QB 3H6TA 1Y1MA 3G7WA 1BKAA 2O1LA 2Z8EA 2ZXTA 2ZYKA 3VDFA 4EXLA 3VVDA 3TYHA 3FXQA 1PB7A 3PPNA 1N7XA 1D9VA 3CSGA 2UYFA 4KHZE 1MXUA 4X1BA 4ZE8A 2ZYMA 1FQEA 2AIXA 4OVJA 3L6HA 2A5TB 4XKQA 4C1TA 2Q9TA 2DWHA 2O6AA 3R6UA 5K2XA 4Q5TA 1A7LA 4GIZA 1UTHA 4ESXA 4N07A 5DT6A 4IGTA 2H25A 3G3JA 4G68C 3MPLA 1F9BA 3TTRA 4OXVA 2THIA 3K6XA 2D5WA 5DVJA 1N7WA 1S50A 3CFLA 4DCYA 1XVYA 4R6HA 3FATA 5TPAA 1EZPA 5L9OA 1M5DA 4PQJA 1R9LA 4GD5A 1SYIA 1TXFA 3IOWA 4M1VA 1XS5A 3Q29A 1TFDA 1I6BA 4MLVA 1TFAA 2HXWA 4G4PA 4OYVA 3TEPA 1LCTA 3SDFA 1FCKA 2OZZA 1Z7ME 3PPOA 3BFTA 3TFLA 3MWBA 2DS9A 4EDPA 1VR5A 2E0SA 5ELVA 3UA8A 3K6VA 3EHSA 3FV2A 2UVIA 5H8HA 4ISUA 2DWAA 5HPQA 1D3KA 4P11A 4G68A 3SETA 2XX9A 4FIMA 5IKBA 3G3FA 3KZGA 5TPAB 3R26A 3PMVA 4NF8B 1QW0A 3U1OA 3Q28A 3PUYE 4BDOA 1SVXB 1MRPA 3HHGA 4ECFA 2OWTA 4TOZA 1JW4A 3FGSA 2PBWA 5H8SA 4HTGA 4BDMA 4YB6A 1SDXA 4R9FA 3MP6A 4G77A 3MC2A 3LSLA 2I0CA 3UGWA 1B7UA 2RC9A 3N94A 3N26A 3UP9A 2V25A 1XVXA 4GWOA 1QJMA 5H8HB 4GFRA 1URGA 2QJEA 3MZ1A 4IO5A 4OZ9A 4F3PA 2O1MA 1SI1A 2ZYOA 3L6GA 3DP8A 3SEVA 1IXIA 1OMPA 4U23A 4DXUA 3TAJA 1OQHA 2XXIA 1IUDA 1GR2A 1B05A 2XHDA 3WAEA 4MFIA 1MS7A 4ZEFA 4FECA 2UXAA 1I6AA 4LZ5A 3EN3A 3SESA 4R2FA 5CM6A 4OETA 2V84A 3T96B 4KD5A 5B7DA 4OFJA 1P99A 3CG1A 3RTFB 1MPCA 2VOZA 5I58A 3CIJA 4H67A 3ZKKA 4PE5B 4WXJA 3PUXE 5FHMA 3PPPA 1MXZA 3OSRA 4KPTA 4HCYA 3TZAA 4EQBA 3N6UA 2ZNSA 3T9XB 1SYHA 5DVFA 4RNSA 4NTLA 3ZS6A 4GL8A 4Q0CA 5DTBA 3MZBA 3FD3A 1MPDA 1M5EA 2F7AA 5AA3A 5H8FA 3M3LA 3K0VA 3DLNA 3RQTA 4QFOA 2F35A 2ZNTA 1H43A 4EQ9A 4U2RA 4LVQA 3QUJA 4ESWA 3KOTA 2QS3A 2DVZA 2I6EA 3ILUB 4F2OA 4GXAA 4QSEA 2Q88A 1H45A 5HBCA 5AA2A 3VVFA 3ZSFA 1PEBA 3K6UA 1MXWA 1JQFA 1NNFA 1O63A 5EHSA 2I48A 2V3QA 2O69A 4YKIA 1VSOA 5H8FB 4BDLA 2DXYA 2R9JA 1NFTA 3OO6A 1MH3A 4GQOA 3SEUA 1B3EA 4F22A 2I0BA 3LR1A 4C0RA 1MG1A 2W7YA 1P1NA 4KCDA 3EHTA 1PB9A 4NF6A 3G3HA 3TQLA 1PC3A 4HW8A 4LA9A 4Q30B 1LFHA 1HSLA 4H8JA 1PBPA 1UIVA 4ZDMA 3LSXA 4AB6A 1FTOA 3MW0A 1LSTA 4NWDA 4R74A 1IITA 4OEUA 3KG2A 3KJTA 1WDNA 2ZNUA 1TT1A 1OLAA 2G93A 4DE8A 5AA1A 1LFGA 1SD3A 5M2VA 2DE2A 3K4UA 5KZTA 3S9LC 1USYE 3V5AA 3U94A 3PUVE 3W15C 3K01A 4ONYA 4JB7A 1DTGA 4GF8A 3TDJA 4F3GA 5I2NA 1ZBMA 1A8EA 3U93A 4YKJA 1B4ZA 5CC2A 3FVOA 1SW2A 4IY5A 5HM4B 4OHNA 3G3IA 5FHOA 4RPOA 1A55A 3GBBA 4UACA 4I62A 1LAXA 4IB2A 4F3SA 1R6ZA 1B4HA 4DCXA 3T66A 4YU0A 4FJPA 3OSQA 3T22A 2RKMA 1POTA 3K1MA 3FXUA 4LQ2A 4YAHX 4F1VA 1QULA 2D3IA 5TP9A 2GHAA 2GHBA 4XXUA 4X48A 2GH9A 3DELB 4PFTA 4JWOA 5LOMA 2ZYNA 2I4CA 4O3CA 1MM7A 1US5A 2M8CA 1LGBC 4R6YA 4ZZEA 2XXUA 4ZECA 2DE4A 4H5GA 2DYXA 4K3FA 1LBBA 1MXXA 1UTBA 4HS7A 2UVGA 2F7CA 2OJTA 1NH8A 1ZLQA 4OWDA 2F6PA 4KQPA 4DZ1A 3BFUA 4Q8RA 3SEWA 3CG3A 5TP9B 1B5IA 2XXYA 4NWCA 3QSLA 1JW5A 3FJGA 4QFNA 4QSDA 1SW4A 4G2ZA 3ILTB 3TUSA 1QVSA 3DM0A 3KN8A 2XD3A 4HCWA 1IZ1A 4H8IA 2VHAA 2XXTA 3SEXA 1USYH 1KWHA 3A3UA 2NUVA 3PPQA 4OQOA 2HAUA 4H5FA 3I6VA 1S7YA 3GLBA 2R71A 1A8FA 3LSFB 3K2DA 1IQ7A 3LUYA 3S9NC 4ELRA 5DEXA 4U21A 2Q2CA 4WKMA 3CRBA 4LONB 1B0LA 4OMBA 3F11A 3TQWA 3H06B 3UN6A 4F3BA 1UTBB 1JETA 2XXQA 4LATA 3N6TA 3VXCA 1OVTA 3MJNA 2VD3A 3IJXB 2QS1A 5JTYA 5AA2D 1B40A 3MUQA 1UTHB 5I2KA 3W9WA 2QS4A 4R75A 3IB2A 4RY1A 3RN8A 3S4UA 5EYFA 5L8DA 2Z8FA 4FATA 1QKAA 3HSTA 4OERA 4WEDA 3TODA 3KSXA 4X9TA 3RT6B 4RK9A 1II5A 4R2BA 4KI0E 2NWJA 3GBAA 2IA4A 5KDTA 5DEXB 2ESNA 1FTMA 1AMFA 1YAEA 1O64A 4QSCA 1D4NA 3THIA 2DOJA 4DDDA 1URSA 4KYEA 1Q35A 3A09A 1MY3A 4JWYA 3T9VA 1MQHA 4I1DA 3HV1A 1AH5A 3C9HA 5JTYB 4MH5A 1WODA 2VD2A 2HEUA 2Z23A 3TPAA 5I2KB 1ZIUA 2H4IA 1UQWA 3C36A 3SKPA 3S9MC 4EUOA 2H9BA 1J1NA 4I9DA 3U8QA 3IO6A 1NNKA 3D4CA 2V3UA 1Y1ZA 3KGCA 1IXGA 3FVNA 5CMCA 4G68B 4F19A 1LAHE 2V3TA 3PUZE 3TELA 1NKXA 4ELQA 5CMMA 4ZZAA 3IORA 5CBSA 4YZZA 2I58A 5F7VA 3PMWA 1MDP1 4XIGQ 3OO7A 1A40A 4GVOA 1B5HA 4E0XA 4P0IA 5JK4A 3UIFA 3CSBA 3C31A 4JBZA 3MVYA 2WKYA 1B3LA 1UIUA 3TCHA 1H44A 1M5FA 5CI5A 4GL0A 3H4ZA 2ONRA 4PFUA 5I84A 4YB7A 1SBPA 4U4SA 1MY1A 2BJJX 4H65A 2UYEA 1B2HA 1EZ9A 1VFDA 3FVGA 1LAFE 4E0WA 5H8NA 4L17A 4F2QA 4NF4A 3QK6A 4YB5A 1Y3PA 2YLNA 4KCCA 1MY4A 1S9TA 4ZE9A 1MQIA 4MBPA 1RYXA 3SEYA 3OOAA 3CFXA 4FE8A 4Z0IA 3IAZA 5CRYA 3KOSA 3ECRA 3QUFA 2B3FA 5I58B 2R6GE 1PB8A 3H6UA 3C35A 3PGFA 3IO4A 4ELPA 1MDQA 3IB1A 4BDRA 3O6IA 4JXIA 4ZS9A 3UORA 1XT8A 3I5OA 1I69A 3T9UA 4KFQA 1N84A 5H8NB 2AYSA 1WVJA 1N04A 1MM6A 3S2VA 2UVJA 3QYTA 4YMBA 5B70A 3CFZA 1N3WA 2X7QA 3M3KA 2KLFA 4GXSB 4LZ7A 1JVYA 2HZLA 1ELJA 2O84X 4U22A 1JVXA 4IO6A 4F18A 1BLFA 2P0SA 4FORA 4G8HA 4RK2A 5CMKA 2LAOA 1NH7A 4F39A 2HZKA 1SI0A 1FQAA 4DXBA 2ABHA 3O2AA 5A5XA 1B3FA 4UA8A 2NXOA 4O3BA 1CE2A 3R7XA 1MXYA 4P0GA 4R6KA 1EZOA 1NNPA 3IOVA 5I56A 4ZEBA 4NF5A 1JEUA 3B7DA 3PD8A 4X1DA 1OQGA 3EQ1A 1POY1 2DXRA 4AB5A 5AA4A 1MQJA 5AA2B 2DSFA 3DP6A 2DWJA 1DTZA 1HSEA 3PPRA 1FTJA 1MXVA 4PFWA 3LC8A 4NE4A 1R1NA 1JW1A 2O51A 3FJMA 2IEEA 4N13A 3RPWA 3PV0E 4DLDA 2H99A 4EF2A 1LLSA 5EHMA 3H6VA 1ATGA 2H5YA 4OENA 5BWJA 5CMBA 4DXCA 3B6QA 3IJOB 5I56B 4NF6B 1B6HA 2Z8DA 2F36A 3TMGA 2RINA 3RGYA 5ISUA 4F31B 1FQDA 5AA4B 2QL3A 3K02A 3MPKA 3TTMA 1YCJA 3O6GA 4FEDA 1QUKA 2F78A 2OK2A 3SERA 3QAXA 4LP2B 3O66A 3FJ7A 4AQ4A 1XOCA 4IO2A 5I57A 1CB6A 2DWIA 2QPQA 3FASA 5I59A 1Z7NE 1US4A 2P2AA 3IL1B 2FA7A 4LZ8A 2XXWA 3FV1A 4XKPA 1BP5A 1B32A 1ZMGA 3K1PA 3N5LA 4THIA 1URDA 1JNFA 4IO7A 5CBRA 2YJPA 1FTKA 1B1HA 2I4BA 3K1NA 1NMUA 4R9GA 5I2NB 1BTJA 2HCAA 3KSJA 2Y7PA 3KFMA 5FHNA 3O29A 1EH3A 4U1ZA 3PD9A 2X7PA 2ONSA 3MP8A 4OEVA 3PMXA 4KYDA 5I57B 4POXA 1B7ZA 2RF1A 4G8MA 3CVGA 3AXFA 5AE4A 3OENA 4F1UA 1ZKBA 3MZ9A 2Y7WA 4JSDA 1P1OA 3GXAA 4OFOA 1L5TA 1VE4A 4ELOA 2F8DA 1GV8A 2CMOA 2PT2A 5DYHA 3USDA 2RC7A 3RT8A 3B6WA 4LUBA 5ITOA 1O7TA 1DPEA 3RNNA 2VGQA 2F5XA 4BDQA 3WAFA 3KBRA 1H3DA 3Q26A 1QUIA 3DP4A 4KYSA 2P1SA 4FEBA 3MBPA 4LQ5A 3KN3A 3E9XA 4POWA 1A99A 3U92A 4H1XA 4FAJA 1B0HA 1B52A 1SW5A 5FTIA 2Z22A 2Q89A 2B65A 3E13X 4EF1A 2O7IA 3Q25A 1Q1KA 4QRZA 2I3WA 3M8UA 3KN7A 1Y4CA 2PMSA 4R73A 4NEDA 4F29A 5F1QA 2ALUA 4U4XA 3MVXA 1P1WA 1P1UA 1A54A 5IAIA 1Y3NA 4KR5A 2HQ0A 2OCUA 3PU5A 2O7UA 1B3GA 4NF8A 4O3AA 3OXNA 2OLBA 1FTLA 3GZGA 3VVEA 2VP1A 4PETA 2Q2AA 4OESA 1YPNA 2Y7RA 5J1DA 3FZVA 4WEPA 4QFLA 2DVCA 1LBCA 3TTNA 1BIYA 4ND9A 1M5CA 1LFIA 3FIRA 2DQVA 1AL3A 3O9PA 1Y3QA 4QHQA 2REJA 3HPIA 3OMBA 5FTHA 4GRKA 3VXBA 1R9QA 4RYAA 4XKNA 2QMWA 3KJ7A 3S9EA 3H03A 2F97A 3ONMA 3V8XB 2RC8A 4QFPA 1B9JA 1OLCA 5K2YA 1ZTYA 3K6WA 2V93A 4RA1A 4GLIA 4U1OA 2OBGA 2HFBA 4JSOA 3VLUA 5ITPA 3JZJA 3O97A 4ZEIA 3I3VA 3M3FA 2I3VA 3E4RA 2Y7KA 2XXPA 3RUMA 3K00A 4PP0A 1TWYA 3U72A 5KDTB 3UK4A 3QXMA 3O28A 4EQ7A 2QS2A 2ANJA 3JYRA 3IK6B 2XXXA 3W9VA 1B3HA 1GTKA 4TLMB 4N6PA 2YPNA 5KCJA 5JEIA 2QSXA 3VE1B 4Z7EA 4RXLA 1PBQA 3VV5A 3B6TA 3CR9A 2DP8A 4I8CA 1Y9UA 2NOOA 4YKPA 1VFEA 1T0KA 3OD7A 2ZMBA 1SW1A 2XXRA 1MQGA 2I49A 3FVKA 3TKDA 1H76A 1GVCA 1ZJLA 4M4GA 1B1XA 3V83A 4RPNA 1RKMA 4OFLA 3OELA 1LCFA 2Y7IA 4JWXA 1OIBA 1DSNA 3IOTA 2Y84A 4IY6A 3HCQA 1N0TA 5KCJB 4BLAA 4IGRA 3D4GA 2XXVA 2F34A 3E3KA 4PFYA 5L9MA 2DE3A 2F6GA 3HO7A 4IO4A 2H98A 2A5SA 4C1UA 1FQFA 3MQ9A 1N76A 3PUWE 1Y20A 1MH4A 4QF9A 2AL5A 1ANFA 5DVIA 4YMAA 1B51A 2D21A 3LSWA 3C4MA 4XTCQ 3O6HA 4JDFA 1D9YA 4NF4B 1XC1A 1DMBA 2Q8JA 3JV9A 1IXCA 2PYYA 3C34A 1I6QA 2PVUA 4GOTA 2B3BA 4DIGA 3QIMA 4ZEKA 1LB9A 4OTEA 4TQUQ 3EPEA 3BKIB 2RCBA 2XXHA 3Q27A 1LAGE 2REGA 1MPBA 3V89B 2NVUB 2ONKE 3TTLA 1JEVA 1EU8A 3OO8A 2G29A 1ZU0A 3VLWA 4YICA 1FQBA 1B46A 3P7IA 2GRVA 2QMXA 3OEKA 4MF3A 1HSJA 3HN0A 1IEJA 5TU0A 1AIVA 5L9SA 3H3GA 4G8NA 3TTKA 3LBSA 1MY0A 1Y4TA 2XX8A 3T93B 2XX7A 3MVWA 3OEMA 3FXRA 1RYOA 4TLLB 3TCGA 2E1SA 3TCFA 2O68A 3RLFE 5ICTA 5A5XB 5BUUA 2F7BA 3VFJA 3CI8A 1DPPA 2OWSA 3OO9A 4NF5B 3MVZA 1MY2A 1N3XA 2UVHA 3RTWB 1IXHA 1FW0A 4NMYA 3KEIA 4IO3A 2QRYA 1AOVA 1B58A 2CZLA 1PDAA 3T9HB 1B5JA 4H6DA 2XD2A 1XHYA 2PT1A 3IB0A 4YKKA 3C33A 4MLQA 3EHUA 1P1QA 2HAVA 3MP1A 3HHFA 1DOTA 1M5BA 4ZEDA 3EF7A 5H8QA 3ZKLA 3H7MA 4XKRA 4BDNA 1OVBA 3G3GA 1QUJA 4EXKA 4R72A 1FQCA 1NL5A 4RJZA 4H0WA 3VLVA 1SQYA 5ICQA 1B7HA 1LB8A 3H6WA 3IR1A 3FUZA 1GGGA 1YTVA 3RY3A 3IOUA 2A5TA 2X26A 4F1YA 2FYIA 2AL4A 3G3KA 1MQDA 3ODBA 3BBRA 1QKBA 3MAMA 2FNCA 5I59B 3C32A 2PX1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GFEA 1IIWA 3IX1A 1NNTA 2RCAA 3A3CA 4GBVA 4QFKA 5H8QB 3H6TA 1Y1MA 3G7WA 5EYGA 1BKAA 4P9KA 4JVCA 2O1LA 4PAKA 2Z8EA 2ZXTA 2ZYKA 3MYUA 3VDFA 4EXLA 3VVDA 3TYHA 3FXQA 1PB7A 3PPNA 1N7XA 1D9VA 3CSGA 2UYFA 4KHZE 5EQ7A 1MXUA 1FPEA 4X1BA 1FBPA 1YZ0A 2XWVA 4ZE8A 2ZYMA 1FQEA 2AIXA 4OVJA 4PTKA 3L6HA 2A5TB 4NHBA 4XKQA 4C1TA 2Q9TA 2DWHA 4O8MA 2O6AA 4GX4A 3R6UA 5K2XA 4Q5TA 1A7LA 4GIZA 1UTHA 4ESXA 4N07A 5DT6A 4IGTA 2H25A 3G3JA 4G68C 4UABA 4P3LA 3MPLA 1F9BA 3TTRA 2Q74A 4OXVA 4DI4B 2XWKA 2XWOA 2THIA 3K6XA 2D5WA 5DVJA 1N7WA 1S50A 3CFLA 4DCYA 1XVYA 4R6HA 3FATA 5TPAA 1EZPA 5L9OA 4X04A 1M5DA 4PQJA 1R9LA 4GD5A 1SYIA 1TXFA 4PDDA 3IOWA 4M1VA 1XS5A 3Q29A 1TFDA 1I6BA 4MLVA 4PCDA 1TFAA 2HXWA 4G4PA 4OYVA 4N6KA 1FBHA 4LN5A 2R8TA 3TEPA 1LCTA 3T1BA 3SDFA 1FCKA 2WBDA 2OZZA 1Z7ME 3PPOA 3BFTA 3TFLA 3MWBA 2DS9A 4EDPA 1VR5A 2E0SA 5ELVA 3UA8A 3K6VA 2KR0A 2B4LA 3EHSA 3FV2A 2UVIA 5H8HA 4ISUA 2DWAA 5HPQA 1D3KA 4P11A 4G68A 3SETA 2XX9A 3QMFA 4FIMA 5IKBA 3G3FA 3KZGA 5TPAB 4N8YA 3R26A 4MCOA 3PMVA 4NF8B 1QW0A 3U1OA 2FVZA 3Q28A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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