4L17A

Glua2-l483y-a665c ligand-binding domain in complex with the antagonist dnqx
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKICVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A conformational intermediate in glutamate receptor activation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 77
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence C, E, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4l17A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4l17A02
2Y7KA 1CE2A 4XIGQ 3CSBA 4EF2A 3E4RA 2VHAA 1B9JA 5L9MA 1SBPA 1D9VA 1R1NA 2IA4A 2QS1A 3TTKA 1P1NA 4HCYA 3SEUA 3KGCA 5HM4B 3LBSA 3FGSA 3CVGA 2GHAA 4NF6A 3SEYA 2CZLA 3LSLA 4C1TA 1DTZA 3Q26A 3N94A 3PMWA 3TTRA 2O84X 4PE5B 3MVXA 3E3KA 4NWDA 2UYFA 2R9JA 4IO5A 1BP5A 3LR1A 4JSDA 1B51A 2B65A 1EH3A 3G3HA 1P1WA 4YB5A 1A8EA 1ATGA 3GZGA 1USYH 4PFUA 2VOZA 2ZNUA 3L6HA 1DTGA 4NEDA 1B58A 1Z7NE 4H0WA 5JEIA 3G3IA 4BDQA 5DVIA 2PVUA 3TFLA 2B3FA 3PD8A 1B3FA 3PUYE 4F3PA 5A5XA 3DELB 3CRBA 1LFGA 4U4XA 1B3EA 3ZS6A 3JYRA 4EQBA 4M1VA 4MFIA 1JETA 2F97A 3FV1A 1OQHA 4QF9A 3FJMA 1SDXA 5H8HB 3QXMA 1MY3A 4BDLA 1I6QA 3FVOA 3MPKA 1HSEA 4Q5TA 2ONSA 3CFZA 4OFJA 2VD3A 3UA8A 1SD3A 2AIXA 2V3UA 4MLVA 4DE8A 4DLDA 4IO6A 1DPEA 1YCJA 1XC1A 2W7YA 3SDFA 2XXPA 1SI1A 3QYTA 1XVYA 4RA1A 3KN3A 3IOUA 1VFDA 3V5AA 4PQJA 3S2VA 4DXCA 1S9TA 3RUMA 5H8FA 3PMVA 2HZLA 4ND9A 1GVCA 3EQ1A 2F6GA 1AH5A 2O6AA 4EF1A 4KD5A 2P0SA 3OENA 3SEVA 2NVUB 1XHYA 1Y1MA 1LBBA 1BIYA 3ODBA 4R9FA 1LGBC 5KZTA 4YICA 1M5DA 3C33A 3IOVA 5CM6A 4KCDA 1AL3A 4THIA 3IR1A 4IO3A 1SW5A 2DWAA 4F1YA 2OCUA 1B7ZA 3M3FA 3V89B 1O7TA 1NNFA 4GOTA 3O6GA 2ZNTA 1H76A 1IXCA 2RKMA 4QFOA 3W15C 1D4NA 1IUDA 3KFMA 4F39A 3N6UA 2DSFA 2X26A 1ZKBA 4IY5A 1UIUA 4GL0A 2THIA 2ONKE 2Y7RA 1A7LA 2ZYKA 1EZPA 2Z8FA 3IOTA 3THIA 4JWYA 1N3XA 1QKBA 1URGA 5AA1A 3MQ9A 5HPQA 5DT6A 2QS4A 4KI0E 5FTHA 4U21A 2AL4A 3CG1A 3Q29A 3TYHA 4YKPA 1MQDA 3R6UA 1N7WA 3IO4A 3KG2A 2RF1A 1VFEA 3IB1A 2DQVA 4IO7A 1BLFA 4X1BA 3DP8A 3ZKLA 2V25A 3U94A 3HHFA 3K1MA 1J1NA 3CG3A 3HN0A 3ZSFA 3FVGA 1B4ZA 2OWSA 5EHSA 1B05A 3RNNA 1N3WA 4QSEA 2V3QA 2PT1A 1FW0A 4E0XA 2RC7A 4XKPA 5CMKA 1NNPA 1YPNA 4IGTA 1SW1A 3OSRA 3FV2A 1NNKA 1DSNA 1H45A 4F29A 3IX1A 4OXVA 2XXQA 3B7DA 2F35A 1MS7A 3DLNA 5CC2A 4LONB 4WXJA 5H8HA 5H8QB 1FCKA 1B3GA 4U1OA 3N26A 3WAEA 3I6VA 1RYOA 4DXUA 2F78A 4ZZEA 3TQLA 3GLBA 1WVJA 5DTBA 3PU5A 1FTMA 4LQ5A 4JBZA 4LQ2A 4JXIA 4R2BA 1I69A 2GH9A 1LCTA 4H8IA 1Q1KA 1ELJA 4GF8A 4GRKA 2ALUA 4GXSB 1MY0A 5CRYA 4LZ5A 3MBPA 2GFEA 4FAJA 2I58A 4OHNA 5I84A 2DVZA 5DEXB 2P1SA 3RLFE 3FUZA 1FTOA 2QS3A 3N5LA 4H5FA 1B1HA 2OK2A 3DP4A 1KWHA 1LCFA 4R72A 2NUVA 1R9QA 1OQGA 4N13A 1ZJLA 1MXWA 4P0IA 4QFKA 3GXAA 4KFQA 4N6PA 4YKJA 2X7PA 3FXRA 4RYAA 5AA4B 2UXAA 3Q27A 4F3GA 2UVGA 5DVJA 1M5CA 5KCJB 5ICTA 4BDMA 2Y84A 4BDNA 3MWBA 4PFWA 2XX8A 1N76A 5HBCA 4TOZA 4IB2A 1QW0A 3VVEA 1XS5A 4OEUA 2DE4A 3C9HA 4GXAA 1MQJA 4G68B 4H8JA 3MVZA 3CFLA 4YB7A 1FTKA 2DE3A 5B7DA 3O6IA 1NL5A 2VGQA 1L5TA 3FVNA 3PV0E 4I1DA 3G3JA 3K0VA 5K2YA 1MH4A 1LAXA 1D9YA 1YTVA 2BJJX 4LVQA 1POY1 1R9LA 4JSOA 1B3LA 3VLWA 1TT1A 5IKBA 3O9PA 3MZBA 2HFBA 4R75A 4L17A 3KSJA 5I58B 1OIBA 2XXRA 5I2KB 1MDQA 4G8MA 1Q35A 4EQ9A 2ABHA 2NXOA 4I8CA 1PB9A 3TMGA 5CBSA 1Y20A 3T22A 2XX7A 3S9MC 1JW1A 3IJOB 2O68A 5IAIA 1ANFA 1TFDA 4P0GA 2H4IA 2REGA 1AIVA 1Y3PA 5B70A 2REJA 4YMBA 1F9BA 1ZIUA 1OLCA 3G3GA 1NFTA 4EDPA 5H8QA 1Y4TA 2ZYMA 1UQWA 3MZ1A 3HO7A 2Y7WA 2HAUA 4U22A 4FEBA 1M5BA 3I5OA 2PT2A 3K2DA 1II5A 1LAGE 1EZOA 3IK6B 2V3TA 1LFHA 1MM6A 4Z0IA 2H9BA 5DEXA 3UIFA 1QKAA 1QUIA 1POTA 3E13X 2QS2A 1FTLA 4NMYA 4F18A 1US4A 3MVYA 1QVSA 2I3VA 3QUFA 4RY1A 3S9EA 3IB2A 1Z7ME 3ILTB 3IB0A 2XXYA 4PFYA 4R6HA 3TDJA 3LSXA 5AA4A 5F1QA 4I62A 4JWOA 1B2HA 1IITA 3MC2A 2WKYA 1URSA 2QSXA 5KCJA 1IXHA 1DMBA 4YB6A 1Y3QA 2HCAA 4BDOA 2E1SA 3TUSA 1LB8A 4EXKA 4OEVA 3PPNA 3LC8A 1EZ9A 4XKNA 5FHOA 1LSTA 1QJMA 4G68A 4YKKA 3H06B 3QK6A 1WDNA 5K2XA 3OXNA 2RC8A 1B0HA 3H6TA 1VSOA 5BUUA 4YAHX 3VDFA 3BFTA 3USDA 3RN8A 4PP0A 4I9DA 2OWTA 3FATA 4F31B 2A5TB 3RPWA 4TLMB 3K4UA 3TPAA 2I0BA 2Z8DA 3G3KA 5I58A 1P1UA 1Y9UA 4DXBA 3K1PA 2O51A 1A8FA 4FECA 5I2KA 1MPCA 4YMAA 3O66A 4G8NA 4RXLA 2XHDA 1SYIA 3HCQA 4GL8A 1TXFA 4U1ZA 3IO6A 1UTBB 3JZJA 2QMXA 3K01A 2XXUA 3BFUA 3ECRA 1B5JA 1OVBA 4HS7A 3HPIA 3PGFA 3Q28A 3PUXE 5ITOA 3H6WA 2DXRA 2D5WA 3MUQA 4HW8A 1FQEA 4ZEDA 2RINA 4OENA 3LSWA 4AB5A 1USYE 1Y4CA 2H99A 1PDAA 3RY3A 3TCFA 5F7VA 3OSQA 4NF5B 4QRZA 1S50A 5AA3A 1GTKA 4IO4A 4LATA 3FJGA 4F2OA 4XKQA 4OESA 2VP1A 2I48A 4FATA 1SYHA 3MW0A 3O2AA 3M3KA 3OD7A 1B0LA 1MDP1 3UN6A 5TPAB 3RTFB 4OZ9A 3JV9A 1JEUA 3TELA 1FQFA 5DVFA 1FQAA 1JEVA 2Z22A 1TFAA 2XXTA 4OFOA 2O7UA 3ZKKA 5FTIA 2I49A 3ONMA 2ZMBA 3A3UA 4ELPA 3A3CA 2D21A 2G93A 3VE1B 3CSGA 3GBBA 4JWXA 3KN7A 1OLAA 1H3DA 4O3CA 4WEPA 2GHBA 4OYVA 5CMMA 4KYEA 1B32A 2Y7PA 4WKMA 2NWJA 2OBGA 3SKPA 2DP8A 3EF7A 1LAHE 3FVKA 4UA8A 2B3BA 1URDA 3MVWA 3OO6A 1IQ7A 3TAJA 1O64A 2I0CA 2P2AA 1B3HA 2ZNSA 2FYIA 1MY1A 4H5GA 3WAFA 2PYYA 2I3WA 4G77A 1XT8A 4O3AA 1OVTA 2V93A 4F1UA 2IEEA 4QHQA 4F22A 2HZKA 4KPTA 2Z8EA 2F6PA 1JNFA 5FHMA 3TKDA 3TCGA 5KDTB 4UACA 4C1UA 2LAOA 1B1XA 4WEDA 2RCBA 2ZXTA 4IO2A 1MXUA 4HCWA 3B6TA 4BLAA 1SW2A 4KR5A 1ZU0A 3C36A 3RTWB 4ESWA 1MG1A 2Y7IA 3S4UA 2KLFA 4G2ZA 2A5TA 4QFNA 4XKRA 3FD3A 1B7UA 1O63A 3EHUA 3RT8A 4PETA 1RYXA 2D3IA 5I2NB 2OLBA 1QUKA 4POXA 3IORA 1UTBA 4LP2B 3FZVA 4R73A 1PBPA 2OJTA 5AA2D 3SEXA 2PMSA 3TTNA 2E0SA 3B6WA 4Z7EA 3CIJA 1SVXB 4AQ4A 4E0WA 1R6ZA 2QJEA 4RNSA 3OEMA 3V8XB 4LUBA 3RGYA 1MM7A 4GLIA 2Q2AA 3H7MA 4EUOA 3VXCA 1IEJA 5AE4A 1A55A 4FEDA 3O6HA 2F34A 3SEWA 1QULA 2UVIA 4NF5A 4X48A 2Q89A 1JVXA 1B5HA 1DPPA 2DYXA 4FE8A 4U2RA 4NF8B 1VR5A 2RCAA 4FIMA 4EXLA 1A54A 5TP9B 2O69A 1CB6A 2GRVA 1NH8A 1GGGA 4HTGA 2HEUA 4POWA 3VXBA 2HAVA 2Q8JA 2I4BA 4XTCQ 4M4GA 4K3FA 5TPAA 2I4CA 3W9VA 1H44A 2A5SA 5LOMA 1MPDA 1IXGA 2CMOA 4ZEIA 1PEBA 3U72A 1A40A 1B7HA 4GWOA 3C31A 3C35A 1BKAA 4NE4A 1ZMGA 3G7WA 1NMUA 1US5A 3M8UA 2I6EA 5ICQA 4ELQA 4G8HA 1D3KA 1ZBMA 4YKIA 1S7YA 3KZGA 2XXWA 1N0TA 2PBWA 3K6UA 3P7IA 5M2VA 1P99A 2YLNA 4LZ7A 2QMWA 1PB8A 3O97A 4U4SA 3A09A 4MBPA 4ZDMA 1ZTYA 2X7QA 3D4CA 3VLVA 2UYEA 3GBAA 1TWYA 5CI5A 1B40A 4R6YA 1B4HA 4LZ8A 3T9UA 3QAXA 1XVXA 3HV1A 1N7XA 2DXYA 2RC9A 2DE2A 3LSFB 3MP6A 5KDTA 1UTHB 3MP8A 4Q30B 4F3SA 4QSDA 1A99A 4R2FA 2H5YA 2DVCA 2M8CA 4KQPA 3ILUB 3HSTA 2DWJA 1LLSA 1MY2A 1MQGA 3EPEA 3CFXA 3SETA 4ZZAA 4NF4B 1M5FA 5H8NB 2DWIA 3U92A 3KJTA 1B52A 4DCYA 4X1DA 2ONRA 2AYSA 4G68C 3EN3A 2O7IA 5I2NA 2ZYOA 3SERA 3TQWA 1MRPA 1P1OA 2UVJA 4OERA 3K6WA 1FTJA 3F11A 3OMBA 4U23A 1Y3NA 2HXWA 4H6DA 4N07A 1B5IA 4DCXA 3C4MA 4ZS9A 4MF3A 3TTMA 3HHGA 3OEKA 3KSXA 5AA2B 5CMCA 3K6XA 4YZZA 4R9GA 4ZEKA 5TU0A 3U1OA 5L8DA 1LB9A 1SQYA 3VVDA 3MJNA 3O28A 1M5EA 4OTEA 1LAFE 3KN8A 4NF8A 3T66A 4QSCA 1ZLQA 4ZEFA 2O1MA 5TP9A 4Q8RA 2YPNA 3VV5A 2Q88A 3R7XA 4GVOA 4GQOA 3T96B 3AXFA 3OELA 1HSLA 3C34A 3PD9A 3TTLA 5JTYB 4H65A 3S9LC 4ZEBA 2QRYA 4RJZA 1GR2A 4PFTA 1VE4A 4OVJA 1BTJA 2Q9TA 4BDRA 5I57B 3UGWA 3EHTA 4IY6A 3PPPA 3Q25A 3K6VA 2F5XA 4ISUA 2ZYNA 4KCCA 1IIWA 2R6GE 2HQ0A 4RPOA 3DP6A 4RK2A 5FHNA 4KYSA 1UIVA 3UK4A 1MPBA 4RK9A 3FIRA 2F7CA 4ZE9A 3RQTA 3M3LA 4F2QA 1PB7A 3DM0A 4QFLA 1MH3A 4NTLA 3PPRA 3EHSA 4FORA 2NOOA 4F19A 2H98A 3MP1A 3S9NC 3FXUA 4GIZA 3T9HB 3H03A 2XD2A 1IXIA 2DOJA 2XX9A 5I56B 5EHMA 5ISUA 3H6UA 4TLLB 4YU0A 2QL3A 2AL5A 4GD5A 3VVFA 4OMBA 5L9OA 4OFLA 3IAZA 3SESA 4MLQA 3N6TA 3OOAA 5DYHA 4ELOA 1N84A 3CI8A 5I59B 3TODA 1Y1ZA 1LFIA 3K02A 1GV8A 2O1LA 3FASA 4OWDA 3IL1B 1UTHA 3B6QA 4DDDA 3K00A 1P1QA 1IZ1A 2R71A 3OO8A 3BBRA 1I6BA 1JVYA 2QPQA 3FXQA 5CBRA 3PUWE 2DS9A 3PMXA 3PPQA 1LBCA 2XXVA 4NF4A 3R26A 5H8NA 4DIGA 2Z23A 1HSJA 4P11A 3CR9A 3L6GA 4GFRA 2OZZA 3KEIA 3BKIB 1PC3A 2VD2A 4JB7A 1XOCA 3MPLA 4NF6B 3T93B 2ANJA 5ELVA 1MQIA 1I6AA 5BWJA 1SI0A 3MAMA 3C32A 3O29A 4IGRA 3T9VA 3K1NA 4ZE8A 4XXUA 3UP9A 1JW4A 2XXIA 4X9TA 2H25A 3LUYA 4ECFA 4JDFA 1OMPA 1AMFA 4ONYA 1MXYA 1YAEA 4KHZE 3FJ7A 1WODA 2FA7A 5AA2A 3QSLA 1MQHA 1SW4A 2ESNA 1FQDA 4ESXA 3D4GA 4ZECA 3PPOA 3TCHA 1EU8A 4C0RA 4LA9A 3MZ9A 5CMBA 3TZAA 3OO9A 4KYDA 3IJXB 5A5XB 5JTYA 1FQCA 3VLUA 3PUZE 3H4ZA 2G29A 3U93A 5J1DA 5I57A 1FQBA 4OETA 2XXHA 4R6KA 1MXZA 2XXXA 4RPNA 3E9XA 3G3FA 3U8QA 2F8DA 1AOVA 3UORA 1NNTA 2V84A 5H8SA 1B6HA 1JW5A 3H3GA 4Q0CA 1NH7A 4O3BA 3KOTA 1QUJA 5L9SA 4H67A 3KOSA 3W9WA 4TQUQ 3KJ7A 1H43A 1PBQA 2F36A 2FNCA 3RT6B 1T0KA 3T9XB 5JK4A 4OQOA 2XD3A 4F1VA 2YJPA 4AB6A 1RKMA 5I56A 4ELRA 3IOWA 5H8FB 4H1XA 4R74A 3V83A 1JQFA 4EQ7A 1MXVA 1NKXA 1DOTA 2F7BA 3OO7A 3QUJA 2UVHA 3H6VA 3PUVE 1MXXA 1B46A 2PX1A 1N04A 5I59A 3KBRA 2Q2CA 4G4PA 3QIMA 4F3BA 4NWCA 3TEPA 3I3VA 5EYFA 4QFPA 1MY4A 3VFJA 4FJPA 4DZ1A 2F7AA 2DWHA 4MH5A 5ITPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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