4LATA

Crystal structure of phosphate abc transporter, periplasmic phosphate-binding protein psts 1 (pbp1) from streptococcus pneumoniae canada mdr_19a in complex with phosphate
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
ESITAVGSTALQPLVEVAADEFGTIHVGKTVNVQGGGSGTGLSQVQSGAVDIGNSDVFAEEKDGIDASALVDHKVAVAGLALIVNKEVDVDNLTTEQLRQIFIGEVTNWKEVGGKDLPISVINRAAGSGSRATFDTVIMEGQSAMQSQEQDSNGAVKSIVSKSPGAISYLSLTYIDDSVKSMKLNGYDLSPENISSNNWPLWSYEHMYTLGQPNELAAEFLNFVLSDETQEGIVKGLKYIPIKEMKVEKDAAGTVTVLEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS 1 (PBP1) from Streptococcus pneumoniae Canada MDR_19A in complex with phosphate
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule keywords Phosphate-binding protein PstS 1
total genus 87
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4latA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4latA02
2QJEA 5AA2D 1B9JA 3IB0A 1SI1A 1PBPA 3K6UA 1MPCA 3FV2A 2ZYMA 3FGSA 1SYHA 3PUYE 4GXAA 3TTRA 3BBRA 3PPNA 2UXAA 4PFWA 3O6IA 4F19A 4JWXA 4FORA 1FTOA 4TLMB 1SVXB 3U93A 3JV9A 2H4IA 3UP9A 4IGRA 4JSOA 2DE3A 4KHZE 4KFQA 3IOVA 1BTJA 1FQFA 2QPQA 3VFJA 3TPAA 2QS2A 1MQIA 3K6XA 1FTMA 4XKNA 1ZBMA 4N6PA 4ESWA 1Y3NA 2XXIA 2P2AA 3B6WA 2HCAA 2XXPA 2DYXA 2KLFA 1N04A 1UQWA 4MF3A 5K2YA 1TFAA 1ZIUA 4H5FA 4THIA 3CG3A 1FCKA 1OQHA 4ZZEA 4OHNA 2IA4A 1NNKA 4DLDA 2ZYKA 2NWJA 1LFIA 3PMVA 4PFYA 3VLUA 2DQVA 1R9QA 4F1VA 4OENA 5I2KB 2UVIA 4P11A 5L8DA 1N3XA 3RTFB 3IOUA 5KZTA 1MQJA 4ND9A 2RF1A 3QUFA 4OFJA 3E3KA 4IO7A 2QMWA 2F8DA 4OEVA 4FAJA 2THIA 5KCJB 2XX9A 3O9PA 2ALUA 1MPDA 4HW8A 3MW0A 1IXHA 1GVCA 4AB6A 3K6WA 4RPOA 1LAXA 3OO8A 1AH5A 4YMBA 5H8NA 3MWBA 4YKJA 1SW5A 1VE4A 3R7XA 1EZ9A 2I4CA 3FIRA 4OTEA 3G3HA 4QFLA 3OO7A 1N3WA 1AMFA 2NXOA 5I59A 4QSEA 1QJMA 4K3FA 1YCJA 3K1MA 1Y20A 1I69A 2PX1A 4R72A 2Q8JA 3RQTA 3CSBA 3KSJA 1XC1A 4OMBA 4WXJA 4ZEKA 3TCGA 1MXWA 1II5A 4WEPA 4LUBA 1WODA 1UTHA 4R74A 3C36A 5H8HA 1MH3A 3G3KA 2AYSA 1R1NA 4H8JA 5AA2B 4I9DA 4MBPA 3RGYA 4NF8B 4O3CA 1YTVA 5ITPA 5I56B 2FA7A 4Q5TA 2DSFA 4BDQA 2HZLA 2UVGA 3RT6B 4JBZA 4YB7A 3B7DA 2DXRA 3ZSFA 2UVHA 3MVZA 4OVJA 5H8FA 3TODA 2Q2CA 2O7UA 4MFIA 2XD2A 4I8CA 1SW4A 2DOJA 2XXVA 4FATA 4IO6A 1D9VA 2H98A 3DP6A 4DIGA 2ZMBA 3HHGA 3TCFA 3FXQA 4F3PA 5KDTB 2VD3A 3FXRA 2I3WA 3Q27A 3I6VA 1LCTA 5FTIA 4DCXA 2FYIA 1YAEA 3O66A 4RK9A 4YKKA 3SESA 2HZKA 4QSDA 3LC8A 3PPRA 1OMPA 4OYVA 1EH3A 3TQLA 1B3EA 4YKPA 4EQ9A 5JTYB 2I0BA 1MDP1 3V8XB 3KOSA 1Q35A 2R9JA 4JB7A 2XXXA 4O3AA 4H5GA 4IB2A 4X1BA 3PUVE 1NNFA 5EHSA 4TOZA 1BKAA 2QS1A 4ELQA 1MG1A 5HPQA 3V5AA 3QYTA 4U1OA 1FW0A 4OESA 3GBBA 3IO4A 2Q2AA 4XIGQ 1JVXA 3T22A 3T66A 2F6PA 2Y84A 4R75A 3S9LC 3CRBA 1MQDA 3PU5A 4QFPA 2OCUA 1DTZA 2VD2A 2Y7KA 5ITOA 1LAFE 2V25A 2G29A 3MBPA 1H44A 4KCDA 1D4NA 4GF8A 3FJMA 1POY1 3E9XA 3K4UA 3UIFA 1J1NA 3RY3A 1WVJA 3TTMA 4U1ZA 4BDLA 1MY4A 2V3UA 2X26A 2F97A 2I4BA 3KG2A 3A3UA 2HXWA 5I2KA 3EHTA 4FECA 4N13A 3EPEA 5I58A 5AA4B 1B5JA 4PP0A 3GZGA 4MLQA 1ELJA 3V83A 1VR5A 1KWHA 4G8MA 4AQ4A 5I57A 5KCJA 1Y4CA 1GV8A 1N76A 1BIYA 5CRYA 2Z8DA 3HO7A 3KZGA 1URSA 1Q1KA 1VSOA 1MDQA 4G4PA 3O6HA 5BWJA 2QS4A 2NVUB 1FQCA 1B3FA 1A55A 4OXVA 4F3BA 4G8HA 2O7IA 3OXNA 1B58A 4YAHX 4XKPA 2O1MA 2HQ0A 2HAVA 2XX8A 3FV1A 3K02A 1NKXA 5I59B 1QUIA 1B5IA 1ZJLA 2UVJA 4ZEBA 1LLSA 1B7ZA 4DXBA 2M8CA 3TTLA 1IXGA 1ZU0A 4KCCA 3CR9A 4U4XA 3MUQA 3FD3A 2PT1A 1IQ7A 4IO4A 1DPPA 5AA2A 3VVEA 4NF8A 4GWOA 1RYXA 1PBQA 1B51A 2B65A 1M5CA 4KYDA 5I56A 1BP5A 2Y7WA 1IITA 4Z7EA 3U92A 4C1UA 1N0TA 2DXYA 1QULA 2GHBA 4YKIA 2O6AA 4OFLA 3UORA 2ZYOA 1QUJA 1RYOA 3CI8A 1P99A 4GFRA 1D9YA 1NH7A 5KDTA 2CZLA 1MXYA 5CMKA 4OERA 1UTBA 1JQFA 3U94A 3Q25A 5B70A 1MY3A 4R2FA 4G77A 4TLLB 4RA1A 2Y7IA 4PQJA 4LP2B 4YU0A 3FVOA 5JTYA 3SEVA 3S9NC 1WDNA 1EZOA 3FZVA 1A8FA 4RK2A 2XD3A 4ZS9A 3L6HA 2F78A 3PV0E 4OWDA 4NWCA 1Z7NE 4LQ2A 2RC9A 4NE4A 2XHDA 2OJTA 4IO5A 3ECRA 3R26A 4ISUA 4GD5A 3TTNA 1URGA 4EF1A 1JW1A 4GL8A 5DVJA 3FVNA 4IY6A 4G8NA 1H45A 2O69A 2DS9A 4U2RA 4U21A 2ZNTA 3ODBA 4WKMA 4F29A 3VLWA 2ZNUA 2NUVA 4EUOA 3HN0A 3ILTB 2PT2A 4PETA 3H7MA 1XT8A 4G2ZA 4PFUA 1B5HA 3CSGA 4GXSB 3OD7A 3T9XB 3IX1A 1OLAA 4U22A 2GHAA 3H4ZA 1DPEA 3TMGA 5TP9B 3OENA 3D4GA 4QFOA 3Q29A 2V3TA 1B6HA 2XXUA 5AA4A 1HSLA 3K00A 4YB5A 1IUDA 3CFLA 3MP1A 4PE5B 3IOWA 3USDA 1P1QA 2O51A 1ZTYA 4KD5A 5I58B 4ZECA 1DSNA 2H5YA 3KFMA 3PD9A 4EQBA 2P0SA 2I58A 2V3QA 4BDNA 4OFOA 5I57B 3VVFA 2XXRA 1SD3A 3LSWA 2Z22A 3N6UA 3A09A 1MXXA 5A5XB 3H06B 2I48A 1AIVA 4F1YA 2WKYA 4ELOA 5CMMA 4FJPA 1UIUA 3C4MA 4LQ5A 1ZMGA 3KEIA 2ONSA 4POXA 4R6HA 1YPNA 1MXVA 1DTGA 1QW0A 3TFLA 1B1HA 3T96B 3VXBA 1LAGE 3VLVA 1P1NA 4ECFA 3RT8A 1LCFA 1EU8A 1PB7A 3FVKA 1MM7A 4LATA 1MY1A 2F35A 1B32A 4RPNA 4F3SA 2AL4A 1FQEA 3FJ7A 3QXMA 5DEXB 5HM4B 4R6YA 4QHQA 3RTWB 3CVGA 3OMBA 1M5BA 2Z8EA 1NMUA 3Q28A 4OZ9A 2XXYA 2PYYA 5F1QA 1PC3A 2E0SA 5DVIA 2QS3A 2RCAA 4IY5A 1XOCA 4KYEA 4QF9A 2Q88A 4NF5B 3VE1B 2CMOA 3DLNA 1GR2A 3ZKKA 2GH9A 3E13X 3K1NA 3BFTA 1A8EA 2XX7A 3A3CA 3GLBA 3HHFA 4Q0CA 1B40A 1UTBB 3MPLA 4UA8A 1NL5A 3TKDA 3H6TA 1TXFA 1Z7ME 4MH5A 2ZYNA 3QK6A 3KGCA 1MRPA 4GRKA 3KN3A 1GTKA 1LB8A 5ELVA 4FE8A 1I6BA 1JNFA 3RNNA 4H6DA 2VHAA 3IL1B 4XKQA 3TZAA 4N07A 4ZE8A 1I6AA 5BUUA 3TEPA 4QFKA 5FHNA 4IO3A 3M3LA 3PPOA 5TPAA 1B7HA 4FIMA 3SERA 4X1DA 4LONB 3SDFA 1B3LA 1TT1A 2HAUA 2OWTA 2DP8A 4Q30B 2DVZA 2H9BA 2VP1A 4YICA 2DWIA 2VGQA 3THIA 5L9MA 3IO6A 1LFHA 1MH4A 2DWHA 5IAIA 1TWYA 4O3BA 3H3GA 5I84A 4R9GA 1S9TA 2HFBA 1QUKA 3L6GA 1IEJA 1PB8A 1MQGA 1US4A 2O68A 3O28A 1B3GA 3UK4A 3U72A 2UYFA 1JETA 4ZEDA 2GRVA 4NF6B 2ONKE 5TP9A 4RXLA 5JEIA 1UIVA 1IIWA 4C0RA 2FNCA 1B7UA 2Z8FA 3C9HA 5HBCA 3JZJA 3IB2A 3U8QA 4DXUA 2I3VA 4EDPA 1RKMA 3UA8A 4E0WA 2V93A 3QIMA 4R73A 3WAEA 3MAMA 3H6UA 3GXAA 5H8QB 2Z23A 5H8SA 4DE8A 3MVXA 1NH8A 3G3FA 1XHYA 5CBSA 2RC7A 4BDMA 4ELRA 1LGBC 4ONYA 5A5XA 3PPPA 4DCYA 1ANFA 1R9LA 3E4RA 4JDFA 3T9HB 3LSLA 4P0IA 3OO6A 4BDOA 1AL3A 1SYIA 2O1LA 3DM0A 4AB5A 1MXUA 3C34A 3LUYA 2XXQA 4IGTA 4G68B 3CIJA 2X7QA 1I6QA 4XTCQ 3TYHA 3S2VA 3TELA 1N7XA 2P1SA 4KYSA 1XVYA 3DELB 3BKIB 3G3GA 2X7PA 3MP6A 1LAHE 1POTA 1NNPA 2DWJA 1LFGA 4Z0IA 3TUSA 2RINA 1AOVA 5CMBA 1Y3QA 2V84A 4F22A 2DWAA 5DEXA 1MY2A 3KSXA 4I1DA 1P1UA 5B7DA 1H76A 1OVTA 3LSFB 1B52A 3LBSA 3FVGA 4EXKA 1P1OA 2ANJA 4FEBA 5ISUA 1OIBA 1LB9A 4FEDA 4NF5A 4LZ7A 3EN3A 2QRYA 3IORA 3K1PA 1P1WA 3G3IA 1JW5A 3ILUB 4QSCA 3D4CA 4E0XA 1O63A 1MY0A 2REGA 3SEXA 2D3IA 3TAJA 1EZPA 5I2NB 3MP8A 4M4GA 2HEUA 4H8IA 4BLAA 1H43A 1QKBA 3PD8A 1Y9UA 4F2OA 1HSEA 4Q8RA 1M5FA 4LZ5A 1OVBA 2LAOA 3O29A 3G3JA 2QSXA 4OETA 2NOOA 1A99A 4H1XA 1FTLA 4GVOA 4YMAA 1A54A 3PMXA 3UN6A 2PMSA 4H67A 3VXCA 5LOMA 2R71A 3N6TA 5L9SA 2OK2A 3S4UA 5DTBA 1NNTA 1FQDA 3IK6B 4I62A 5TPAB 2OZZA 4JXIA 2OLBA 4GL0A 1S50A 4IO2A 3I5OA 2ABHA 5AA1A 2QL3A 3SKPA 3T9UA 4H0WA 3M3FA 3M8UA 4R9FA 4JWYA 2PBWA 3MPKA 1D3KA 4NF4B 5L9OA 1XS5A 3MVWA 3S9EA 4QFNA 2A5TB 4GIZA 4X9TA 5CBRA 5FHOA 4NF6A 4QRZA 3DP4A 5TU0A 1LSTA 2GFEA 1IXIA 2F36A 1Y1MA 3ONMA 4OQOA 4RYAA 4U23A 1SBPA 5FHMA 3P7IA 4F1UA 3W9WA 3K0VA 4EXLA 4DDDA 2G93A 3IJOB 1B0HA 3K2DA 1USYE 5H8QA 3IJXB 1M5DA 3C31A 1QVSA 3CFZA 1SDXA 1R6ZA 1US5A 3EHSA 3OO9A 1SW1A 1M5EA 1URDA 3RN8A 3WAFA 4XXUA 1OQGA 3SETA 3O2AA 2RKMA 3IB1A 4G68A 5ICTA 4C1TA 4H65A 1IZ1A 3JYRA 4ZDMA 2BJJX 1S7YA 3B6QA 2I6EA 1LBBA 2I0CA 3C32A 2F7CA 4F18A 3FUZA 3RLFE 3HCQA 4ZEFA 1DOTA 2Y7RA 3MVYA 1F9BA 2YJPA 2Y7PA 2ESNA 3C35A 3FJGA 3QAXA 2B3FA 2YLNA 3ZKLA 4F3GA 4POWA 4NTLA 1B05A 4ZZAA 1PDAA 3KN8A 2XXWA 1SI0A 3QUJA 1H3DA 4RY1A 1HSJA 1T0KA 4WEDA 3H03A 4HS7A 4TQUQ 4P0GA 1N7WA 2B3BA 2Q89A 3MZ9A 5I2NA 5K2XA 3RPWA 1PEBA 4LVQA 3C33A 1DMBA 2PVUA 3CG1A 2IEEA 3G7WA 2I49A 3HPIA 2R6GE 4KR5A 5DVFA 1Y1ZA 3W15C 1FQBA 3RUMA 4KQPA 4EF2A 1FTKA 4GLIA 4PFTA 2D5WA 3FATA 3FASA 3IAZA 4ESXA 4XKRA 1A40A 3TDJA 2D21A 1MQHA 3OELA 4BDRA 1MXZA 2F7AA 4YB6A 1OLCA 3M3KA 4UACA 1N84A 3TCHA 3V89B 3OOAA 3T93B 2A5SA 4YZZA 5F7VA 2O84X 4F31B 1MPBA 4HTGA 1SW2A 3I3VA 1B2HA 3HSTA 5DT6A 3KJTA 3W9VA 3N26A 2RCBA 4R6KA 2DE2A 4NF4A 2ZNSA 3F11A 2F6GA 4NWDA 1B1XA 2A5TA 1BLFA 2REJA 4RNSA 3ZS6A 1SQYA 3KJ7A 1MS7A 2XXTA 4GOTA 1B3HA 1O64A 3OEMA 3PUWE 1VFEA 5M2VA 4LA9A 4GQOA 3PMWA 3VDFA 1CE2A 1B4HA 1USYH 3K01A 4LZ8A 3HV1A 3IOTA 4DXCA 1ZKBA 4EQ7A 5CI5A 3N5LA 3EF7A 4HCYA 4KI0E 1PB9A 3MZ1A 2Q9TA 5FTHA 1GGGA 1CB6A 3AXFA 4ZE9A 3GBAA 1JVYA 3KN7A 2VOZA 1FTJA 1TFDA 3LR1A 4R2BA 5EYFA 1LBCA 2XXHA 1IXCA 5CM6A 3T9VA 3PGFA 4NMYA 1JEVA 1O7TA 4F2QA 2F5XA 3KOTA 4OEUA 3SEWA 3CFXA 3SEYA 3KBRA 3OSQA 4JSDA 1B4ZA 4DZ1A 3LSXA 1JW4A 3PPQA 2F34A 4L17A 4U4SA 3PUZE 1FQAA 3N94A 1L5TA 2ZXTA 4KPTA 1VFDA 1Y3PA 5CC2A 5H8NB 3QSLA 3U1OA 3OSRA 2AIXA 3H6WA 3B6TA 3MC2A 4G68C 3MZBA 4ELPA 1MM6A 3O6GA 2QMXA 2DVCA 5CMCA 5AA3A 3O97A 1Y4TA 2UYEA 5JK4A 4NEDA 2DE4A 2YPNA 1UTHB 5H8HB 3DP8A 1ATGA 2OWSA 1A7LA 3H6VA 4RJZA 3FXUA 2AL5A 3SEUA 5ICQA 4X48A 2H25A 3IR1A 2ONRA 1QKAA 4M1VA 3UGWA 2OBGA 5EHMA 3MQ9A 5H8FB 3MJNA 5AE4A 3VV5A 3PUXE 4F39A 2W7YA 2E1SA 3TQWA 4MLVA 3K6VA 1XVXA 4ZEIA 3BFUA 3S9MC 1ZLQA 3OEKA 3EQ1A 1B46A 1JEUA 4JWOA 3VVDA 3TTKA 5DYHA 1NFTA 2RC8A 5J1DA 2H99A 1B0LA 2F7BA 3Q26A 3R6UA 4HCWA 3EHUA 5IKBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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