4LATA

Crystal structure of phosphate abc transporter, periplasmic phosphate-binding protein psts 1 (pbp1) from streptococcus pneumoniae canada mdr_19a in complex with phosphate
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
ESITAVGSTALQPLVEVAADEFGTIHVGKTVNVQGGGSGTGLSQVQSGAVDIGNSDVFAEEKDGIDASALVDHKVAVAGLALIVNKEVDVDNLTTEQLRQIFIGEVTNWKEVGGKDLPISVINRAAGSGSRATFDTVIMEGQSAMQSQEQDSNGAVKSIVSKSPGAISYLSLTYIDDSVKSMKLNGYDLSPENISSNNWPLWSYEHMYTLGQPNELAAEFLNFVLSDETQEGIVKGLKYIPIKEMKVEKDAAGTVTVLEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS 1 (PBP1) from Streptococcus pneumoniae Canada MDR_19A in complex with phosphate
rcsb
molecule keywords Phosphate-binding protein PstS 1
molecule tags Transport protein
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 87
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4latA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4latA02
3K1MA 4LZ7A 3HPIA 2F78A 3O28A 2P2AA 1H3DA 1M5CA 2O1MA 2F36A 4GXAA 3OO8A 3H3GA 2ABHA 1IXGA 4Q30B 3MZ9A 4NF8B 2YJPA 1M5FA 4R2FA 4GLIA 3O97A 3BFUA 4O3CA 2I3VA 2AYSA 3S9NC 1H44A 4U4SA 1MQGA 1XT8A 2GH9A 2HXWA 3FJMA 3K2DA 3TKDA 3KN3A 5I59A 1LFGA 2DWAA 3TYHA 4QFKA 3Q29A 4YKJA 2UYEA 3RNNA 3EHSA 2DVZA 4RPNA 2REJA 3DP6A 3G3HA 3VLUA 2QS2A 5CM6A 2YPNA 2XX7A 3C36A 3TTRA 3GLBA 2Q88A 4GRKA 4OVJA 4RPOA 1FQEA 4ESWA 4O3AA 1O7TA 1N84A 4NEDA 3KJ7A 2Z8EA 4F3PA 4ZEIA 4G2ZA 1MPCA 3MWBA 5ISUA 1VSOA 4GIZA 3RT6B 4PP0A 2KLFA 2THIA 1FTLA 1I6BA 2HZLA 2YLNA 2D5WA 1MPBA 3IK6B 2I0CA 3TEPA 3K1PA 4GFRA 5HPQA 3MC2A 1HSLA 2DQVA 1UIVA 4LATA 3H4ZA 1Y4CA 1BKAA 1T0KA 1OVBA 5I57A 3B7DA 1R9LA 1LCFA 4C0RA 1NMUA 1QJMA 4I9DA 3OO7A 1XVXA 1FTMA 4ELRA 1H76A 2HEUA 2H4IA 2V25A 3CSGA 1B3EA 3MPKA 3KG2A 3FASA 3E13X 4QFLA 1OLAA 3H6VA 3KEIA 1LLSA 2XXWA 2FYIA 3T9XB 3VVDA 3G3JA 3MQ9A 3TTMA 3R26A 3C31A 4PFYA 2Y7PA 4JSOA 3GZGA 5JK4A 4PETA 3VLWA 2A5TB 3AXFA 4NF4A 1XOCA 2Z8FA 2UVHA 2ZNSA 2DE3A 1WDNA 3KBRA 2XXQA 1N76A 1RYXA 3T9HB 1WVJA 3HHGA 3IOVA 1UTBB 1B3HA 2HAUA 3CVGA 1B2HA 2RCAA 3G3GA 2HQ0A 4ZEFA 4ZE9A 4RK9A 3O29A 2PBWA 2W7YA 1ZU0A 1OIBA 4ESXA 2ESNA 3S4UA 3H03A 1JQFA 2D3IA 3PPPA 4OESA 4FEBA 4POXA 4GL0A 2REGA 4PFTA 4WKMA 1ZTYA 4TLLB 2X26A 4H5FA 4O3BA 3IO6A 1LFIA 1A8EA 5FTIA 1YPNA 1QUJA 5AA1A 5J1DA 2RC8A 2H9BA 2LAOA 3MP8A 2ZNUA 3FUZA 3C33A 1US5A 1NH7A 1NFTA 1SI0A 3U94A 1IUDA 3OMBA 2I49A 4YKIA 3KSXA 1MS7A 4BDNA 3OENA 4ONYA 2O84X 1D9VA 4I8CA 1B7UA 1JVXA 3O6HA 3BKIB 4FATA 4NF6A 3B6TA 3OOAA 3KOTA 5TU0A 1XVYA 2G93A 4FECA 3O9PA 1LAGE 1EZPA 1N7WA 1B9JA 1UIUA 3GXAA 1TXFA 4U2RA 4JWYA 3VVEA 5H8HA 4BLAA 1P1NA 3CSBA 4K3FA 4RK2A 2OK2A 2XXHA 4H0WA 1SD3A 1FQAA 2ZXTA 4I1DA 3TCFA 3PMWA 1NNPA 4Q0CA 3U72A 1HSEA 4IY6A 3SESA 4X1DA 5DVIA 3M3LA 4KCCA 3RPWA 1IQ7A 2DP8A 1Y9UA 1GV8A 5B7DA 5H8FB 3IOWA 3E4RA 2Q8JA 1B4ZA 3H06B 2PT2A 1SYHA 2FA7A 4EF1A 4IY5A 1XS5A 4IGTA 2NOOA 1OQGA 5K2YA 5EHMA 3PUVE 1JVYA 4AB6A 4ZECA 1N04A 5I56A 3U1OA 4G77A 1NKXA 3P7IA 5CMCA 2F35A 3RTFB 4EXKA 1UTHA 2UVJA 3O66A 4R6YA 4EDPA 4DE8A 1A55A 2XD3A 3C35A 1QVSA 5CBSA 1Y1ZA 2QRYA 1FQBA 1JEVA 3EN3A 4FJPA 4ZZEA 2ZNTA 2DYXA 1ZLQA 4R72A 4Z0IA 3B6QA 4LVQA 3U8QA 3ZKLA 3Q27A 3MVZA 1MQJA 3MVYA 3LBSA 1NL5A 1MM6A 1PB7A 4YB7A 5KDTA 2OBGA 4OEUA 4H6DA 3PD9A 3PUWE 2O1LA 5ICQA 3E9XA 3TTLA 5JEIA 3OO6A 5CI5A 3ILUB 2E1SA 2V3UA 3TCHA 4QFPA 3I6VA 4N13A 3FGSA 4OFJA 4NTLA 3KJTA 4DXCA 1D4NA 3RQTA 1MXWA 1R9QA 5CBRA 4OYVA 3FATA 1IZ1A 4RJZA 5AA3A 2WKYA 3DP4A 1II5A 2ONRA 3DP8A 3VDFA 1ANFA 2Z22A 5CC2A 5TP9A 5EYFA 2QMWA 2DS9A 3KSJA 1GVCA 4AQ4A 1FQFA 3JZJA 1P1UA 4PQJA 3S2VA 1Z7ME 2XXTA 2QMXA 1D3KA 3E3KA 5FTHA 3VXBA 1JW5A 4RNSA 1S7YA 1MY2A 4C1TA 4F19A 1N7XA 1R6ZA 4F1VA 4GXSB 1Q1KA 1QUIA 3KGCA 3TFLA 4LQ2A 1ZKBA 4Q8RA 1AOVA 1A8FA 5I58A 3EQ1A 4ZE8A 4DIGA 2QS1A 1A99A 1PBQA 2Z23A 2ALUA 1DPPA 1N0TA 2I0BA 3EHUA 1QKBA 5I84A 5DTBA 3C32A 4F18A 1I6QA 3TTKA 5I2NA 4TOZA 1Q35A 1SI1A 3LC8A 3PV0E 4BDOA 4G68B 5JTYB 5EHSA 1HSJA 5DEXB 2M8CA 3KZGA 3FIRA 5IAIA 5H8NA 1TWYA 1I6AA 1YTVA 2XD2A 3WAEA 3MPLA 4XKNA 3IOUA 5KCJA 4KCDA 4QSEA 3A09A 4EF2A 3K02A 3IJOB 1YAEA 4U1OA 2P0SA 4YMBA 4NF4B 5L9OA 3H6WA 5CMBA 1PC3A 4FE8A 5CRYA 3TZAA 3M3FA 5I2KA 3D4CA 3N6UA 2VHAA 2ZYNA 5F1QA 3CRBA 1FCKA 4TQUQ 1KWHA 5ICTA 5AE4A 3N94A 5BUUA 5L9SA 1SW2A 1MH3A 1LB8A 3PPOA 3USDA 2ANJA 3RLFE 5FHOA 4KD5A 4POWA 3Q28A 1MRPA 3MP6A 1B3GA 3M3KA 4MH5A 5IKBA 2H98A 1S50A 4LA9A 1JEUA 2RKMA 2Y7IA 3HO7A 3TQLA 4GOTA 1SBPA 5A5XB 4XXUA 1BTJA 1P99A 1OLCA 1FTKA 2B3BA 3S9LC 3TPAA 2PT1A 2DWHA 5CMKA 2B65A 1IXIA 4ZZAA 4G8NA 3CFLA 4BDQA 4KI0E 2X7QA 1TT1A 2GHBA 1DPEA 4M4GA 2NUVA 5AA4B 3K6VA 1M5BA 3OXNA 3UK4A 4F3SA 2Z8DA 3BBRA 4QFOA 2A5SA 3B6WA 4C1UA 3IO4A 4HTGA 4GWOA 2I3WA 3FV2A 3QIMA 2OWTA 4RA1A 3TELA 2O69A 3ZKKA 1EU8A 4MLVA 1F9BA 1AH5A 1LAFE 3IOTA 2I4CA 4NF6B 5F7VA 1LFHA 3TQWA 2HFBA 4DZ1A 1B40A 4F22A 4QRZA 1B5HA 3BFTA 4ZEDA 4LP2B 3T22A 3TUSA 5H8QB 1IXHA 1DTZA 2XXRA 2QS3A 1BIYA 1B0HA 1Y3PA 1A40A 2O6AA 2IEEA 3MBPA 3SEWA 1UQWA 3IX1A 2DXRA 4F1YA 3V83A 4IB2A 2XXXA 1N3XA 1SYIA 3SKPA 4OFLA 2NVUB 1B32A 2OJTA 1CB6A 1DSNA 2OCUA 1PB8A 2QSXA 4NF5B 4AB5A 4ELPA 4WEPA 3O2AA 1PDAA 1IIWA 1B58A 2B3FA 4KFQA 3C9HA 2D21A 3ZS6A 3OELA 1JNFA 3N26A 4OXVA 3HCQA 2O7IA 1P1OA 1FW0A 3V5AA 2UVGA 3QSLA 4EQ7A 1MXUA 3L6HA 1MXYA 1QKAA 4DLDA 4L17A 1US4A 1QUKA 2H99A 3TMGA 3M8UA 3HV1A 1PEBA 2RINA 4EQBA 3L6GA 3QUJA 5DVFA 1J1NA 4ZEBA 4KQPA 1Z7NE 2OLBA 3T93B 3SEXA 4MFIA 4NWCA 1PBPA 4HCWA 1IXCA 2OWSA 3C4MA 1SW1A 1XHYA 4THIA 2CMOA 3Q25A 1B05A 2AIXA 3T66A 3FJ7A 2DXYA 4JSDA 3H6UA 4HW8A 1RYOA 4WXJA 3CG1A 5TPAB 4PE5B 1QW0A 2RF1A 3VLVA 5KDTB 4F3GA 2ONSA 4G68C 4XKPA 3OO9A 3JYRA 4HS7A 3C34A 1LAHE 1OQHA 2F7BA 4R9GA 3RT8A 3ONMA 3FVOA 4ND9A 3IB2A 3PUZE 4IO2A 2VGQA 1AMFA 3CG3A 4QSDA 1YCJA 1MY4A 1MH4A 4XTCQ 3QYTA 1TFAA 1NNKA 2ONKE 2HZKA 3K1NA 1O63A 2DOJA 1ELJA 4OHNA 4I62A 4DXBA 5ITPA 3PPNA 3I5OA 2XXUA 4E0XA 4F1UA 4R9FA 4KYSA 3IORA 2PX1A 3V89B 4QFNA 3A3CA 1MXVA 3R6UA 2IA4A 2AL5A 3H7MA 2Y84A 1ZJLA 3QK6A 4U1ZA 2VOZA 2DSFA 3EHTA 4YKPA 4GD5A 1I69A 3CFZA 3KN8A 3EF7A 3UA8A 1Y3NA 4JWXA 3VXCA 1B46A 4OQOA 1DMBA 4N6PA 4YB5A 1B5JA 1B5IA 4NE4A 2V84A 1USYE 5I59B 1P1WA 3FXRA 5KZTA 2XXYA 3H6TA 3VFJA 5I2NB 1ZBMA 1GTKA 2QPQA 2DWJA 1VE4A 4MLQA 1FQCA 4F29A 2R6GE 1MXZA 5ELVA 4IO7A 3FXQA 1A54A 1LB9A 1B7ZA 3KOSA 3RUMA 1L5TA 3VV5A 2G29A 2O68A 2DVCA 1B4HA 2AL4A 4RY1A 5H8FA 3MVXA 2VD2A 5AA2A 1VFDA 4GVOA 4X1BA 5H8SA 4JBZA 3G7WA 2Q2CA 1LSTA 3WAFA 1XC1A 3RY3A 4DDDA 4ZDMA 4QHQA 3D4GA 2F97A 3FVGA 1Y4TA 1MQIA 4JXIA 3SDFA 1B1HA 3GBBA 3FV1A 3SETA 3QUFA 4YKKA 1VFEA 4OETA 3MP1A 1RKMA 3KFMA 4QSCA 3THIA 4FAJA 2XXIA 4PFUA 5I57B 1LBCA 4R2BA 4JB7A 2GRVA 1WODA 3S9EA 2HCAA 2I4BA 3V8XB 1POTA 3UIFA 3T9UA 1NNFA 3PU5A 1B3LA 3TAJA 4NMYA 4JDFA 2F7AA 4KHZE 1GR2A 3RN8A 1R1NA 2XX8A 4OZ9A 1CE2A 3EPEA 4OFOA 3GBAA 1SW5A 2X7PA 4H8JA 3UN6A 2R9JA 4DXUA 1MM7A 3OSRA 4XIGQ 3ZSFA 4HCYA 1LAXA 3ILTB 3PUYE 3PMXA 4F2QA 3CIJA 4LONB 2V3TA 2DWIA 4OTEA 3VE1B 5B70A 1LCTA 3K6UA 4LQ5A 3TDJA 3LSXA 4NWDA 3FJGA 5BWJA 2HAVA 3LSWA 4LZ5A 1MG1A 3TTNA 4WEDA 5LOMA 1Y3QA 3T96B 1LBBA 4YZZA 4N07A 1D9YA 2Y7KA 3OEKA 4XKRA 4NF8A 2V3QA 1BP5A 4IO4A 4IGRA 1DOTA 4EUOA 3Q26A 1MDP1 3HHFA 4U21A 1A7LA 1MDQA 2NXOA 2XXVA 4OMBA 3W15C 3K00A 4YICA 1B6HA 3FD3A 1M5DA 2CZLA 2PVUA 3I3VA 2FNCA 3A3UA 4G68A 4M1VA 5JTYA 3O6GA 4FORA 4ELQA 5DEXA 3HSTA 2I48A 2F7CA 4H67A 3G3FA 3MAMA 3UGWA 1URDA 2QL3A 4ECFA 3SEYA 3DLNA 1B7HA 3PGFA 1JETA 5L8DA 4PFWA 3PPQA 4UA8A 4IO5A 3UP9A 1H45A 3OEMA 3CR9A 3SERA 4H65A 3TODA 3HN0A 2F6PA 3K6XA 2UVIA 3FZVA 3MJNA 2RC7A 3LSFB 4ISUA 1JW4A 4BDRA 4DCYA 1USYH 5DT6A 2NWJA 3DELB 2F34A 5H8HB 1EH3A 3DM0A 1S9TA 5FHMA 3SEUA 1TFDA 3OSQA 3IB0A 3CFXA 2I58A 4XKQA 3R7XA 1FQDA 3IJXB 1MXXA 4MBPA 4KPTA 3OD7A 4YMAA 1JW1A 3F11A 1BLFA 3KN7A 5A5XA 1URSA 3LR1A 5FHNA 1OVTA 4EQ9A 3N5LA 1B3FA 3K4UA 4P0IA 3LSLA 1PB9A 1POY1 2ZYOA 3IB1A 1URGA 1B52A 3VVFA 5AA4A 5I56B 4Q5TA 1SQYA 1Y1MA 4GF8A 5DYHA 1MY3A 5CMMA 4E0WA 2DE4A 3K0VA 5AA2D 4BDLA 1UTHB 4X9TA 1MPDA 4KYEA 3W9WA 3CI8A 4FIMA 4G8MA 3PPRA 4LUBA 5K2XA 2A5TA 2H25A 2XX9A 5ITOA 4EXLA 4YB6A 1SVXB 2RC9A 3SEVA 4R75A 2Q89A 1QULA 3JV9A 1UTBA 3ODBA 2ZMBA 5HM4B 4R73A 1SDXA 2ZYKA 1MY1A 4R74A 4KYDA 1IITA 1H43A 3IR1A 4BDMA 4OENA 2O51A 2H5YA 4H5GA 2E0SA 5H8QA 4P11A 5DVJA 4OWDA 4DCXA 2I6EA 1AL3A 1P1QA 3G3IA 1Y20A 3MUQA 3MZBA 2OZZA 2GFEA 4F39A 2P1SA 4U22A 3U92A 3W9VA 3O6IA 4RXLA 2VP1A 4Z7EA 4R6KA 1FTJA 4GQOA 3RTWB 3K6WA 3G3KA 1MY0A 1MQDA 3LUYA 4IO3A 3MVWA 2DE2A 4NF5A 4IO6A 4U4XA 1ZMGA 2XXPA 3FXUA 5AA2B 3PMVA 1NH8A 1NNTA 1B51A 4MF3A 5TP9B 4QF9A 1O64A 4ELOA 2QJEA 2Q9TA 2UYFA 3QAXA 4FEDA 3PUXE 1VR5A 2BJJX 4U23A 3U93A 4R6HA 2Y7WA 2ZYMA 1N3WA 4P0GA 4LZ8A 3QXMA 1M5EA 2F8DA 1ATGA 4G8HA 4GL8A 4OERA 5I58B 4ZS9A 1B1XA 3ECRA 3MW0A 4RYAA 2Y7RA 1DTGA 2GHAA 3K01A 4YU0A 2QS4A 2F5XA 1MQHA 3FVKA 3T9VA 1B0LA 2RCBA 3N6TA 3S9MC 2F6GA 1FTOA 2V93A 2PMSA 3IAZA 4YAHX 1ZIUA 3FVNA 4H8IA 2PYYA 4X48A 5TPAA 3PD8A 3IL1B 1GGGA 4F31B 3TCGA 5H8NB 2Q2AA 2R71A 4TLMB 1EZOA 4ZEKA 4KR5A 2O7UA 4F3BA 5KCJB 2XHDA 1EZ9A 4H1XA 4OEVA 1OMPA 4G4PA 5HBCA 4UACA 5L9MA 3MZ1A 5M2VA 2VD3A 5I2KB 3UORA 1IEJA 1AIVA 4F2OA 1LGBC 3RGYA 2UXAA 1SW4A 4JWOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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