4LZ5A

Crystal structures of glur2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery and Characterization of a Novel Dihydroisoxazole Class of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA) Receptor Potentiators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz5A02
1B2HA 1QJMA 1B05A 4POXA 4LUBA 3H6UA 5KDTB 4JXIA 4BDNA 3CG3A 1ZMGA 3RGYA 3JV9A 4YKJA 3EF7A 3TELA 4GXSB 4ELQA 3K00A 1LGBC 1HSJA 3PMWA 3IORA 3B6TA 1SD3A 4PFYA 1DMBA 2M8CA 3CG1A 2RCAA 4IO6A 5ELVA 2KLFA 4OENA 1Y1MA 2Y7PA 4F1YA 1Q1KA 4F18A 3B6WA 1FTMA 5H8NB 1XS5A 3RPWA 2ALUA 5CMCA 4G68B 5JTYA 4JSOA 4GF8A 4TQUQ 4DIGA 2PMSA 4LONB 1LB8A 3HO7A 4PFTA 1DTGA 3T22A 1BIYA 5A5XA 2I0CA 1A7LA 1II5A 4R9FA 4BDQA 2V84A 5I56B 3TUSA 2Z8EA 1MM7A 3M8UA 4MLQA 3VXBA 4NTLA 3BKIB 3MP1A 5H8QB 4NMYA 5I2NB 1MXZA 3QAXA 1CE2A 4XKNA 3ZKLA 2FNCA 1RYXA 1TFAA 3HN0A 2H98A 4QSCA 3G3KA 1L5TA 3PPOA 4RXLA 4KQPA 4ZE9A 4ZS9A 1MDQA 1KWHA 3S9LC 5F7VA 2XXHA 1URSA 3CRBA 1B58A 5TU0A 1B5HA 3IAZA 2GH9A 2I4CA 3O97A 4OFLA 3RQTA 5DYHA 1P1NA 4RA1A 2X7QA 4NE4A 4HS7A 3Q29A 5LOMA 2AL4A 3KZGA 1LAXA 1MY4A 2NWJA 4KR5A 1R1NA 3KBRA 4XKQA 1B4ZA 5B70A 3MVYA 2HFBA 1JEUA 2XD3A 3KSXA 3GXAA 5TPAA 1VR5A 3T66A 3K6WA 1MPDA 2DSFA 3PPRA 3LR1A 1H45A 4I62A 4YMBA 3G3JA 1IUDA 1UIUA 4NF5A 1VFEA 3TAJA 1H3DA 3K0VA 2OJTA 4UACA 4H8IA 5H8FA 4XIGQ 1LSTA 3R26A 5B7DA 1B7ZA 2UVIA 3W9WA 3FJGA 4U23A 3O6GA 1Y9UA 3FV1A 3HPIA 1NH7A 3FASA 4QRZA 2G93A 2GHBA 2QMWA 3PUXE 4F31B 3GZGA 3E13X 1VE4A 4G8HA 4O3BA 4EXKA 1AOVA 2DYXA 1NMUA 3A3CA 4DDDA 3MC2A 5CMBA 4P0GA 3I5OA 4R2FA 1N04A 3H03A 3KJ7A 2ONKE 4FEDA 3ILTB 1I69A 1PDAA 2CZLA 2O1LA 3PMXA 2B3BA 4GD5A 3RUMA 2DE2A 4I1DA 2D5WA 3MUQA 3IO4A 3OSRA 3ZS6A 4YKPA 5F1QA 1T0KA 1IZ1A 1FQFA 3HHGA 1SQYA 2XXIA 5L9SA 2O68A 2XXYA 4ELPA 2VHAA 2I49A 1Y4CA 1UTBB 4NF4A 1OQGA 1N3XA 2O7UA 3MZBA 4LZ5A 1B0HA 3LBSA 1LFGA 1MY1A 3PMVA 2QMXA 4ESXA 1US4A 4P11A 3OO6A 3W15C 1LB9A 3ODBA 3UP9A 3IB1A 1BTJA 4IGRA 1US5A 3T93B 3IOWA 1FTJA 3TCFA 1AH5A 4ZEDA 3DLNA 5KCJB 1MM6A 1URDA 3C9HA 3VVEA 5FHNA 3U1OA 4BDMA 4QFNA 1B3LA 1JW5A 4TOZA 2YJPA 3H06B 4GL0A 4N6PA 3G3FA 1XHYA 3I3VA 2H25A 3QSLA 3RT6B 3A3UA 4GOTA 5FHMA 3FXRA 4KI0E 4OTEA 2GRVA 4G8MA 2V25A 3VVDA 2F8DA 4M1VA 3FVGA 3FATA 4R72A 2HAUA 3MPLA 4H6DA 4OERA 3SEXA 4F2QA 4WEPA 3HV1A 2DQVA 4MLVA 2RF1A 1B51A 2Y84A 2Z23A 4GRKA 4ECFA 2V93A 3E9XA 3Q26A 3PU5A 3O28A 3IK6B 2OWSA 1ZLQA 1Z7ME 4PQJA 1MXUA 1SI1A 4OYVA 3N6UA 5H8NA 2HEUA 4XTCQ 5M2VA 3G7WA 4G68A 3FGSA 3ILUB 4I8CA 2HZLA 2Y7WA 3VLUA 3OD7A 4HCWA 1OVTA 3TEPA 4LZ7A 1SW2A 2DS9A 2DXYA 5AA3A 2AYSA 2HZKA 4F3BA 1SYIA 4OVJA 5EYFA 2QS2A 1UTHA 2QRYA 4N13A 5I57B 5H8QA 4H5GA 2VD3A 2VP1A 5I2NA 4EDPA 3OEKA 4E0XA 2DXRA 1EU8A 4DCYA 3FJ7A 3EHSA 2XXQA 1SW4A 3MBPA 3LSXA 3CSBA 5DT6A 3KG2A 1IXGA 1A40A 2ZYKA 1QULA 3IO6A 2PT2A 3USDA 4F39A 1MPBA 3UIFA 3FJMA 1LCTA 1B46A 3B7DA 1P1QA 3W9VA 4R75A 3K4UA 3PD9A 5AE4A 3LC8A 4FECA 2A5TB 3FIRA 4IO5A 3S9NC 1ZTYA 4OZ9A 5I58B 1WODA 2Q89A 2YLNA 4DLDA 3TQWA 2DE3A 4R9GA 4YKKA 5K2YA 4YICA 5DEXB 3QIMA 4O3CA 1I6QA 1NH8A 1M5EA 1A8FA 3U93A 1UQWA 3TKDA 2VD2A 4ZECA 1PB8A 3QK6A 2F7AA 2ESNA 2O1MA 3FZVA 4BDLA 2F35A 2ZNUA 4X1DA 1Y1ZA 3MAMA 1M5FA 1N3WA 4XKRA 3CR9A 4ZEFA 2QS1A 1MRPA 2REGA 5AA2B 4OMBA 2PVUA 3KN7A 4F3GA 2P2AA 3LSLA 3DELB 1NNKA 1J1NA 3TQLA 4EQBA 2OWTA 2HXWA 3OO7A 4EUOA 3FD3A 1XVYA 5FTIA 1POY1 2DWJA 3P7IA 1B1HA 1FCKA 1QW0A 1OIBA 4IO4A 2B65A 4G8NA 2H5YA 3K6XA 1ZKBA 4QHQA 3K2DA 5EHMA 4BLAA 2IEEA 4G2ZA 2I3VA 4UA8A 1IITA 4KPTA 1MG1A 4XKPA 1YPNA 4NF6B 1NL5A 5CMMA 1NNFA 3QYTA 4LQ2A 1GGGA 4EF2A 4YB6A 4RJZA 1B3EA 2ONSA 1FQAA 2REJA 4OFOA 4WEDA 4O3AA 3QXMA 2UVHA 1SYHA 1B7UA 4WXJA 3WAFA 2PT1A 4Q0CA 3DM0A 1H44A 3I6VA 1TXFA 3VLWA 1B32A 1I6AA 1CB6A 2QPQA 1R6ZA 1B3GA 3H7MA 4KD5A 2OCUA 3MJNA 2UYFA 3S9EA 3S4UA 5KCJA 4GXAA 2O84X 3PV0E 1TWYA 3D4GA 1JW1A 1LAFE 1MS7A 4EXLA 4C0RA 1N7WA 4OEUA 5TP9A 3SEUA 1Y3NA 4R6HA 1TFDA 2ZNTA 2OLBA 4ZE8A 2RC9A 4G77A 4LQ5A 1Y4TA 4YMAA 2P1SA 3N94A 5DTBA 3C33A 4EF1A 5I59B 4C1UA 2I58A 3HCQA 2F78A 5AA2D 2RKMA 3L6GA 3LUYA 1A55A 4JB7A 1XT8A 1YAEA 5H8SA 3LSFB 1NNPA 3IJXB 1B4HA 1GR2A 1MQJA 4TLLB 1B3HA 3FVNA 4R73A 3SEWA 1EZ9A 1MQDA 2P0SA 3C35A 2I48A 3H6WA 4IGTA 1XOCA 4JDFA 3TMGA 3BFUA 4NF8A 1DPEA 1B6HA 3HHFA 5ITOA 5H8HB 1IXCA 3MWBA 3K6VA 1BKAA 1FTLA 4HCYA 5I2KB 3GBBA 2LAOA 2Z22A 1JW4A 1SI0A 3BBRA 3PD8A 4QFOA 4PP0A 3PUWE 2XXWA 2DVCA 3OEMA 3D4CA 4EQ7A 5A5XB 4H65A 4YB5A 4DCXA 3RY3A 1XC1A 5BUUA 3N5LA 3Q28A 4QF9A 1M5CA 2ZYMA 4POWA 4YKIA 3Q25A 4RPNA 4OETA 3O2AA 3RNNA 3OOAA 4Q5TA 4ZZAA 2AIXA 4GVOA 3C36A 4K3FA 2ABHA 1PEBA 3OO9A 4RK2A 3O6IA 3MP6A 5I58A 5CBRA 1PBQA 2B3FA 3T9HB 4FATA 2ZYOA 2BJJX 1NFTA 1ZBMA 2NXOA 1B5JA 3MPKA 2XHDA 2V3UA 1MXVA 4PFUA 5DVFA 3MVZA 4AB5A 1Y20A 5DEXA 3F11A 1RKMA 2UVGA 4U2RA 1B9JA 1GV8A 2QJEA 5ITPA 3O29A 3EHUA 4H0WA 3VE1B 4QSDA 1H76A 1M5DA 5KDTA 5TPAB 1D9VA 1UIVA 1HSEA 4KYDA 1MH3A 3FVKA 3R7XA 4U1ZA 1LCFA 3V8XB 1SW5A 4H67A 2Z8FA 5ISUA 3H4ZA 4F1UA 1ELJA 1IEJA 4ELRA 4LZ8A 3U92A 4IO3A 5AA2A 1MY0A 3VLVA 2Q88A 4H1XA 2Y7IA 5HPQA 1B5IA 1LFHA 2R6GE 1QUJA 4DXBA 3DP8A 2AL5A 4X48A 2OK2A 1MQGA 1ATGA 2UXAA 3CFLA 4OXVA 4FJPA 4IY6A 1LLSA 3K1PA 1ZIUA 1JNFA 3KN8A 4RNSA 4BDOA 2E1SA 3CVGA 4ELOA 3M3LA 1QKBA 3THIA 3TTMA 5I56A 1H43A 3FVOA 1DTZA 1FQDA 1O63A 3ONMA 2O7IA 2XX9A 1FQBA 3K1MA 2RC8A 3IB0A 5L8DA 2RCBA 3CFZA 3TZAA 3K02A 4H8JA 1OVBA 3PPQA 3SDFA 2E0SA 2VOZA 2QS4A 5AA1A 4NF4B 2HAVA 3JZJA 1QUIA 1MXXA 4Q8RA 4JWXA 5ICQA 4G4PA 2PYYA 4U22A 2FYIA 3IJOB 4JBZA 4QSEA 3M3KA 1RYOA 4ZEBA 1ZU0A 2RINA 4ZZEA 4QFKA 5FTHA 4LATA 3TFLA 1S9TA 5HM4B 3V83A 2H4IA 5I84A 3S2VA 4HW8A 2ZNSA 2YPNA 1POTA 1R9QA 5CM6A 4M4GA 1A54A 3BFTA 2DVZA 1FTKA 1P99A 3CI8A 3IOTA 1B52A 4PETA 2Q2CA 4MBPA 2OBGA 4YU0A 4U4XA 3GLBA 1F9BA 1FTOA 3E3KA 1USYH 1EZPA 3TCGA 1O7TA 4R2BA 4PFWA 5I59A 3VV5A 2THIA 3O6HA 4ONYA 2F34A 5CBSA 3TTNA 2XD2A 3G3GA 1LFIA 3TDJA 2DP8A 3IL1B 2DWAA 2PBWA 4FIMA 4XXUA 3RTFB 3M3FA 5J1DA 1DPPA 3UORA 2F5XA 2XXRA 1Y3PA 3CIJA 2I0BA 3O9PA 4OHNA 2XX8A 2O51A 2XXUA 5H8HA 4F22A 1B3FA 4KYEA 3C32A 3E4RA 5I2KA 3PGFA 2GHAA 5DVIA 2Q2AA 1YCJA 1NNTA 2F6GA 2G29A 4ISUA 2NOOA 4P0IA 3T9UA 1B7HA 2H9BA 3IX1A 3V89B 1UTBA 1GVCA 3FV2A 1UTHB 1JEVA 4AB6A 1GTKA 2XX7A 3V5AA 1O64A 3KGCA 3EHTA 2NUVA 3UGWA 2NVUB 1WVJA 5CC2A 5HBCA 2I4BA 4FEBA 5AA4B 4X1BA 1MQHA 1BLFA 2QL3A 3O66A 4MFIA 4DXUA 4RPOA 2OZZA 4N07A 1YTVA 3OO8A 2ZMBA 2XXVA 2HQ0A 3LSWA 3U8QA 3SETA 2DWIA 3UA8A 3T9VA 1MPCA 1PB9A 2QSXA 3RT8A 2UVJA 1OQHA 1XVXA 3MVWA 4R6KA 3H6VA 4EQ9A 3TTRA 3PPPA 4NEDA 2F7BA 5DVJA 2I6EA 3N6TA 4H5FA 4NWCA 2QS3A 4F1VA 3QUJA 4YAHX 1I6BA 4OQOA 4KFQA 4PE5B 4DE8A 3EPEA 3RN8A 3TTLA 3C31A 3JYRA 4ZEIA 3KOSA 5FHOA 4KYSA 1BP5A 1A8EA 3K1NA 4KHZE 3QUFA 3DP6A 2A5SA 2Z8DA 4GFRA 1USYE 1PC3A 5IAIA 3FUZA 3SKPA 4IO7A 3R6UA 3VDFA 1OMPA 5EHSA 2R71A 4QFLA 1PBPA 3N26A 4R6YA 5JTYB 4YZZA 1IXIA 1DSNA 3MZ9A 1MY2A 3GBAA 2R9JA 1MH4A 4OEVA 1SBPA 4LP2B 4AQ4A 4FE8A 2XXPA 2GFEA 3C4MA 2FA7A 3CFXA 1URGA 3VFJA 3OELA 1ZJLA 2HCAA 2O69A 1B1XA 1SVXB 1EH3A 2H99A 3AXFA 4DZ1A 5KZTA 3L6HA 3C34A 5I57A 2F36A 4U21A 2DOJA 4FAJA 4Z0IA 2RC7A 2D21A 1OLCA 3SEVA 4OWDA 1SDXA 3RTWB 1QUKA 2V3TA 4R74A 2ZYNA 4OESA 4JSDA 1MXWA 5K2XA 3CSGA 1M5BA 4ESWA 1TT1A 3KJTA 1OLAA 1AMFA 3Q27A 4GLIA 2F97A 2XXXA 1Y3QA 2CMOA 1JVXA 3K01A 1N76A 5L9OA 2O6AA 5BWJA 3T96B 4GL8A 2A5TA 5L9MA 1P1UA 3HSTA 2Y7RA 4WKMA 2UYEA 2X26A 3U94A 3U72A 4JWOA 1AIVA 1ANFA 2Q8JA 3IOVA 4FORA 4LVQA 3OMBA 4MF3A 1HSLA 1JQFA 5ICTA 1N7XA 2ZXTA 4HTGA 3K6UA 3SEYA 4F29A 4KCDA 4I9DA 2DWHA 3PUVE 3KOTA 5TP9B 3IB2A 4MH5A 3OENA 1P1WA 2F6PA 3VXCA 4LA9A 4U4SA 3UN6A 4IO2A 4NF5B 3ECRA 3ZKKA 3DP4A 1AL3A 3VVFA 2IA4A 3UK4A 5H8FB 3H3GA 2VGQA 4F2OA 3MP8A 2W7YA 3WAEA 1D4NA 1NKXA 3TYHA 5CMKA 3EQ1A 5JK4A 3PUZE 4C1TA 2I3WA 1D9YA 3S9MC 3PPNA 4F19A 4THIA 1A99A 5JEIA 4JWYA 3MW0A 4GQOA 3A09A 3T9XB 1MXYA 3G3IA 4TLMB 2Y7KA 1QVSA 3TODA 3KN3A 1LAHE 4E0WA 4NF8B 1B0LA 3KSJA 4ND9A 1MQIA 5CRYA 1VFDA 3EN3A 3G3HA 1D3KA 4KCCA 1P1OA 1B40A 3KEIA 1FW0A 3MQ9A 3IOUA 4G68C 3PUYE 1N84A 4Q30B 1FQCA 4RK9A 1Q35A 1S7YA 4DXCA 2ANJA 1SW1A 4ZDMA 3MVXA 4NF6A 4X9TA 3RLFE 1EZOA 2D3IA 3B6QA 4IB2A 1VSOA 3IR1A 4OFJA 1IXHA 2X7PA 2ONRA 4NWDA 2F7CA 1MY3A 1R9LA 4IY5A 4L17A 3MZ1A 2Q9TA 3TTKA 1JVYA 3SERA 5AA4A 2V3QA 3KFMA 1Z7NE 3H6TA 4U1OA 4BDRA 3ZSFA 5CI5A 3TCHA 3FXUA 1PB7A 4F3SA 4GWOA 3FXQA 3TPAA 4Z7EA 1DOTA 1FQEA 4F3PA 1LAGE 1JETA 4GIZA 2WKYA 1LBCA 3OSQA 3SESA 4QFPA 1QKAA 4RY1A 1WDNA 2XXTA 3OXNA 4RYAA 1LBBA 4YB7A 1S50A 2DE4A 2PX1A 1N0TA 4ZEKA 5IKBA 1IIWA 1IQ7A 1MDP1
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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2DDKA 3KSXA 3GXAA 5TPAA 1VR5A 3T66A 1IMCA 3K6WA 1MPDA 2DSFA 3PPRA 3LR1A 1H45A 4I62A 4YMBA 3G3JA 1IUDA 4MNPA 1UIUA 2XWVA 4NF5A 1VFEA 3TAJA 1H3DA 3K0VA 2OJTA 4XEQA 4UACA 4H8IA 4MNCA 5H8FA 4XIGQ 1LSTA 3R26A 5B7DA 1B7ZA 2UVIA 3W9WA 3FJGA 2WEFA 4U23A 3O6GA 1Y9UA 3FV1A 3HPIA 1NH7A 3FASA 4QRZA 2G93A 2GHBA 2QMWA 3PUXE 4P9KA 5IZ3B 3GZGA 3E13X 4F31B 1VE4A 4G8HA 2Y5KA 4O3BA 4EXKA 1AOVA 2DYXA 1NMUA 1SPIA 3A3CA 4DDDA 3MC2A 5CMBA 3E79A 4P0GA 3I5OA 4R2FA 1N04A 5J16A 3H03A 3KJ7A 2ONKE 4FEDA 3ILTB 1I69A 1Q9DA 1PDAA 3PMXA 2CZLA 2O1LA 2B3BA 4PFBA 4GD5A 3RUMA 2DE2A 4I1DA 2D5WA 3MUQA 4O94A 3IO4A 3OSRA 3ZS6A 4YKPA 5F1QA 1T0KA 1IZ1A 1NV4A 1FQFA 3HHGA 1SQYA 2XXIA 4PAIA 5L9SA 2O68A 2XXYA 4ELPA 2VHAA 2I49A 1Y4CA 1UTBB 4NF4A 1OQGA 1N3XA 2O7UA 3MZBA 4LZ5A 1B0HA 3LBSA 1LFGA 1MY1A 3PMVA 2QMXA 4ESXA 1US4A 4KXPA 4P11A 3OO6A 3RPLB 1FRPA 3W15C 1LB9A 3ODBA 3UP9A 3IB1A 1BTJA 4IGRA 1US5A 3T93B 3IOWA 1FTJA 3TCFA 4NN3A 2WBDA 1AH5A 4ZEDA 3DLNA 5KCJB 1MM6A 1URDA 3C9HA 3VVEA 5FHNA 3U1OA 4BDMA 4QFNA 1B3LA 4PDHA 1JW5A 4TOZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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