4LZ5A

Crystal structures of glur2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery and Characterization of a Novel Dihydroisoxazole Class of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA) Receptor Potentiators.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz5A02
3FUZA 2DVCA 3P7IA 4OZ9A 1MQJA 4IO7A 2NWJA 5EHMA 3IOWA 1NNFA 3RY3A 1Y1MA 4G77A 3I6VA 1O64A 1A7LA 1PBPA 2NXOA 3PUXE 3KZGA 3IOUA 3ZS6A 2RC9A 2F6PA 3O2AA 1B4ZA 5CBSA 4QRZA 1BIYA 4RXLA 3IK6B 4HCWA 1GV8A 3KN3A 3FATA 1PB7A 3SEVA 1B3EA 4ZZAA 3MZ9A 2XD2A 3Q29A 1R6ZA 4HCYA 2RF1A 1AL3A 3V83A 2D21A 4OERA 2ONKE 3MWBA 1SD3A 2XX8A 4O3AA 1RKMA 5K2YA 1LAGE 3KBRA 1O7TA 3H03A 3MJNA 1M5CA 3R7XA 4OFJA 1TFDA 5H8NA 1ZLQA 2QPQA 4F2QA 2ESNA 2QS4A 1SW4A 5ITOA 2Z8EA 3PV0E 3TTLA 1B3LA 3T9XB 3FASA 4YMAA 1LB9A 4KR5A 4F39A 5AA2A 3IJOB 4BDOA 1MXXA 4OESA 4LA9A 4G2ZA 5BUUA 3TPAA 5FTIA 4ZEFA 3N94A 3AXFA 4X9TA 4DE8A 5KCJB 1ANFA 1MXZA 2ZMBA 1ZJLA 1Y3PA 4YZZA 5IKBA 4NF5A 1MQHA 5A5XA 3KJTA 4BDRA 1I6QA 4IB2A 1ATGA 1OMPA 4ZEBA 4BDMA 3KFMA 2VOZA 4OQOA 4R2BA 3VVDA 4NF6A 4F3BA 5JTYB 1ELJA 1I69A 3A09A 3UORA 3PMVA 3MP8A 4MFIA 3PMXA 5HM4B 4GD5A 4I1DA 3L6HA 1DOTA 1AH5A 3FD3A 1POTA 3HHGA 2HAUA 4F18A 4QFLA 5L9MA 1BLFA 3K1MA 4IO6A 5TU0A 1DPEA 4GXSB 3C36A 1M5FA 3ZKKA 5I59B 2DWJA 2P1SA 3MVWA 4RPNA 3CG3A 3FV1A 3VVEA 3CIJA 4DCXA 5HBCA 4KYEA 2Z22A 3SEUA 4OWDA 1QVSA 3U8QA 1JEVA 1ZKBA 1N3XA 3BKIB 1B1XA 4NF4B 5L9OA 4HS7A 3FIRA 4BDQA 3VXBA 4P11A 3MZ1A 4QSEA 1DTZA 2W7YA 2UVGA 5I2KB 2G29A 3IX1A 4Q0CA 4ELPA 4H8JA 4LZ5A 2V84A 3B7DA 4RY1A 3S9EA 1IUDA 3G3GA 4KCCA 3PU5A 3B6TA 4DXCA 2O7IA 2F78A 3M8UA 4U21A 3N6UA 4H8IA 4U4XA 4F1VA 1AMFA 2HCAA 3VLWA 3T96B 3PMWA 5AE4A 1URGA 2DWHA 1SVXB 2V93A 5HPQA 5AA3A 3LC8A 2ZNSA 3MAMA 5DVJA 1IZ1A 1QJMA 4QFNA 1LCFA 2I4BA 3OELA 1EZ9A 4YKJA 4ONYA 2V3UA 4WXJA 2Q9TA 2XXIA 1S7YA 1DSNA 2OZZA 1ZIUA 1N7WA 1Y4TA 3V8XB 4DIGA 3QIMA 3N5LA 3C9HA 1P99A 5AA2D 2DE2A 2PYYA 3I5OA 3RGYA 4GVOA 3N6TA 2XXPA 3HO7A 3ILUB 1EH3A 2REJA 4H0WA 4YB6A 1LBBA 3S9LC 3HCQA 3PPNA 1URDA 2FA7A 4OHNA 4LONB 4GOTA 2YJPA 1NNPA 3O28A 2YLNA 4ESWA 3QUJA 4XKPA 1USYE 1I6AA 1VR5A 1MM6A 1DPPA 3VVFA 3H3GA 1Y3QA 4ND9A 4C1UA 4Q8RA 2G93A 2DWAA 4I62A 1FQCA 1P1QA 2NOOA 5KCJA 4GWOA 3OENA 1ZBMA 3RLFE 2ZYKA 3BBRA 2ZNTA 5DT6A 4F3GA 2Q2CA 5DVIA 2PX1A 3PPPA 3H6UA 4U22A 5ELVA 2XXWA 4NMYA 4QSCA 3CFLA 3KN8A 1M5DA 3KN7A 2DE4A 3H4ZA 1CB6A 1FTOA 2B3BA 5JTYA 1XHYA 1MXUA 4YB7A 2Z23A 2R71A 3A3CA 3KEIA 3HN0A 1B51A 3T9VA 4NWCA 2DS9A 4LP2B 1QULA 5TP9A 2UVJA 3K0VA 4FAJA 4FATA 1H76A 4F1UA 3DP6A 1B2HA 1LAXA 4L17A 1JW5A 3FXQA 4DZ1A 2E0SA 2YPNA 2B65A 4FJPA 3SERA 4IO3A 1MPCA 1QUKA 4NF8B 1A8FA 5CMMA 3TQWA 3G3FA 4RYAA 1H43A 3K6XA 2GH9A 3E3KA 3FVGA 3TDJA 1MH3A 4PFTA 4U1ZA 4X48A 2F5XA 1AIVA 4ELQA 4UACA 1S50A 1XC1A 1A8EA 2VHAA 4K3FA 1VFDA 3RN8A 4ZE9A 1MY3A 4FEBA 2REGA 5CMCA 1IITA 4Z7EA 3H6TA 2O68A 2QS3A 2OWTA 3EHSA 1N7XA 3MW0A 1RYOA 1LFHA 1SYIA 4GRKA 4PFYA 3MZBA 4LZ7A 2P0SA 1IXHA 4FIMA 3LSWA 4EQ9A 3K1PA 2I48A 4LATA 1MH4A 3FVOA 4LZ8A 3TCFA 4IY5A 3S4UA 2UYEA 2O1MA 4QHQA 4R73A 3ZSFA 2H4IA 1P1UA 1TFAA 1URSA 3KG2A 4Q5TA 2X7QA 3N26A 4DDDA 2F35A 4YU0A 4ZS9A 3GXAA 1GGGA 1Q1KA 1B7HA 1SI1A 4ZDMA 4JDFA 3RT8A 4QSDA 1US5A 4THIA 4U4SA 4GLIA 2HFBA 3E4RA 3IORA 1MDP1 1OIBA 4YMBA 1NMUA 1MXYA 1BKAA 3HV1A 1AOVA 4G4PA 3R26A 4KCDA 2PBWA 3SDFA 2OCUA 1B52A 4QFOA 2XX7A 5ITPA 1MDQA 3SEYA 1A54A 5H8FA 3PPQA 2XXRA 3CFXA 1LBCA 1EZPA 3PPRA 1N84A 3DM0A 2FYIA 2VD2A 3G7WA 3QK6A 4XKNA 1JNFA 3G3JA 5H8QA 4EF1A 1P1WA 1SW5A 4GFRA 1QUJA 3FXUA 3ECRA 4OXVA 3U92A 5AA1A 3A3UA 5DEXA 3KJ7A 4F19A 5CI5A 4E0WA 5ISUA 5DYHA 1UTBA 3FVKA 5K2XA 2Q8JA 4C1TA 4FECA 4KYSA 4PE5B 4AB5A 2XD3A 3O6HA 2I3WA 2VP1A 5TP9B 3WAFA 3VE1B 2RC8A 4PFUA 1IXIA 4P0IA 3B6QA 3PUVE 1Z7NE 2PVUA 3K00A 3MP1A 3JV9A 4POXA 5TPAB 4ELRA 5EYFA 1B7ZA 4R6HA 2D3IA 4NF8A 4TQUQ 3E13X 3EPEA 1I6BA 3DP4A 3K02A 5I57A 1YAEA 4XTCQ 3TTRA 3G3HA 4YKPA 3VFJA 2DSFA 3O6GA 1MPDA 2I4CA 2H98A 3BFTA 1ZTYA 3UGWA 4JB7A 4OENA 3C33A 1PC3A 3GZGA 1MY1A 3IAZA 5KDTB 3VDFA 1MY4A 1MM7A 4N6PA 5F7VA 3IB0A 2HQ0A 1PDAA 1P1NA 1NKXA 1XS5A 4QFKA 1WDNA 1SYHA 3MVYA 2OLBA 1ZU0A 3VLUA 2F6GA 2RCAA 4NEDA 4KHZE 1GTKA 2XXHA 2H99A 1LCTA 3OOAA 4U2RA 4OFOA 2Q2AA 3C35A 3HPIA 1NH8A 3TYHA 3U93A 4E0XA 4N13A 1LAFE 2UYFA 2Y84A 4R6KA 4XKRA 4EQ7A 3TQLA 1SDXA 3C4MA 3OO9A 3TODA 1USYH 3W15C 3W9WA 4WEDA 3PPOA 3GBBA 1FW0A 2Y7WA 5L8DA 1EU8A 4F2OA 3M3LA 4DCYA 3CSGA 3CI8A 3ILTB 2F34A 2I49A 3TFLA 3DELB 1N04A 3U1OA 1Y1ZA 2F97A 2OJTA 5I58B 3TTKA 3O29A 4OEVA 4IO2A 4KYDA 1MY2A 3HHFA 5ICTA 1VFEA 3SETA 4AB6A 4DXBA 1R9LA 3JZJA 3QAXA 2V3TA 3RPWA 3MPLA 5CMBA 4OETA 3TZAA 4EQBA 3QYTA 2DVZA 3KOTA 3SEXA 2THIA 2F8DA 3OXNA 3C32A 3W9VA 4RPOA 1QKBA 3K01A 2ZNUA 3LSFB 3CR9A 5I2NA 1MQIA 3D4CA 2OBGA 5FHNA 3IO6A 2DXYA 2DYXA 3QUFA 1UIVA 1MXVA 5LOMA 3G3KA 4JWXA 2BJJX 1B40A 1NL5A 5H8FB 3PUZE 4JSOA 4POWA 1GR2A 1LSTA 1D9YA 4EUOA 4NE4A 4G68B 5H8QB 3PUWE 3QXMA 3H6WA 3K1NA 3BFUA 4PP0A 1JW1A 4F3PA 3TKDA 2R6GE 4DLDA 3RTFB 4R72A 1Y4CA 5DEXB 3UN6A 1KWHA 1YCJA 1H3DA 1UTBB 3TCGA 1TWYA 3MQ9A 4YAHX 2ABHA 1FQEA 1UTHB 2I6EA 1PB8A 4QFPA 2A5SA 3KOSA 4G68C 3CRBA 1PBQA 1IIWA 1POY1 4H1XA 2AYSA 1JETA 2QMXA 3GLBA 2Y7PA 1B7UA 3PD9A 1B9JA 3OMBA 3LUYA 4GQOA 3T93B 4O3CA 3CFZA 2LAOA 4TLMB 3MUQA 1FTJA 2FNCA 3DP8A 5TPAA 1PB9A 1SW1A 2H9BA 1UQWA 4JBZA 1FTKA 1QUIA 5DTBA 2OWSA 5I57B 3M3KA 5DVFA 4EF2A 4KI0E 4EDPA 1N76A 4HW8A 1XT8A 3T9HB 2V3QA 3Q25A 4C0RA 1T0KA 4X1DA 1JEUA 2D5WA 1LFGA 3V89B 3DLNA 2IA4A 2VGQA 1MXWA 5H8HB 4GXAA 3FJGA 4KD5A 5KDTA 3CVGA 3S2VA 2ONSA 3O6IA 1IQ7A 3IR1A 1B5JA 3UIFA 2AL4A 3FV2A 2Q88A 2GRVA 3THIA 3MVZA 4G8HA 3IO4A 2UVIA 3TMGA 1SI0A 3IOVA 4GIZA 1IXCA 3MBPA 2HXWA 4ZEDA 3T66A 1NH7A 2F36A 3FGSA 1FQDA 1NFTA 1H45A 4RJZA 3LSXA 1D4NA 3EQ1A 3TTNA 5CC2A 1M5BA 4JWOA 3VLVA 3LR1A 4LVQA 1SQYA 1FQFA 3R6UA 2NUVA 3HSTA 2IEEA 3FJ7A 1IXGA 4OMBA 5I58A 1HSJA 3S9MC 3QSLA 4MF3A 4ELOA 3OO6A 2DXRA 2XHDA 4H6DA 4XXUA 4BLAA 3FZVA 2O1LA 4DXUA 4RNSA 2DQVA 4MLQA 5I2NB 4R9GA 2CMOA 2UXAA 4Q30B 3K6WA 3IB1A 4U1OA 4NTLA 2O7UA 4YICA 2QS1A 5AA4B 3K2DA 1MPBA 4GL0A 5J1DA 1DTGA 3H06B 3T9UA 2V25A 1BTJA 4LUBA 1A40A 4IGRA 2H5YA 1B6HA 4UA8A 1B46A 4ECFA 2HZKA 2XXQA 4G68A 2WKYA 2O6AA 5I56B 4IGTA 5FHOA 5I84A 2QJEA 3Q26A 2X26A 3S9NC 1H44A 3C34A 3U72A 2ONRA 1LAHE 1HSEA 3UK4A 5L9SA 2ANJA 2F7BA 1FTMA 3Q27A 1QW0A 4KFQA 4IO5A 1UTHA 3OO8A 4M1VA 5IAIA 2NVUB 1MG1A 5F1QA 3USDA 1SW2A 1J1NA 2RC7A 1IEJA 4AQ4A 1OQHA 3TELA 2Q89A 4ZZEA 2CZLA 1II5A 4KQPA 3TEPA 4YB5A 1XVYA 4ZEKA 1D3KA 3EHTA 2PMSA 1DMBA 4F3SA 3WAEA 5B7DA 4TLLB 4QF9A 3RUMA 1B5HA 2ZYNA 1WVJA 3EHUA 3K6UA 4XKQA 4ESXA 3RTWB 2ZYMA 4PETA 4IY6A 1L5TA 1JQFA 3MP6A 2F7CA 5JK4A 1F9BA 3CG1A 1Y3NA 4LQ2A 3TTMA 5CRYA 1ZMGA 3OSQA 1MS7A 3MPKA 3L6GA 4GL8A 2F7AA 1B3HA 4R2FA 5H8HA 1B3FA 5H8SA 5JEIA 3C31A 3D4GA 1B4HA 2HZLA 5CBRA 2HAVA 3SESA 2A5TB 1B0LA 4OYVA 2GFEA 4X1BA 3I3VA 2HEUA 4FEDA 1N0TA 4LQ5A 4R9FA 2X7PA 1WODA 4G8NA 1SBPA 3PUYE 3OEMA 3IL1B 1CE2A 3RQTA 5BWJA 1LGBC 4JSDA 4RK9A 3M3FA 2Z8FA 2E1SA 3JYRA 4H67A 1FQBA 4YKIA 2PT2A 3OO7A 4BDLA 3MC2A 5FTHA 3V5AA 2O69A 2ZXTA 1P1OA 1S9TA 3IJXB 1FCKA 3TCHA 2Y7KA 4MLVA 1FTLA 5CMKA 3UA8A 3O66A 2Y7IA 4G8MA 4ISUA 3Q28A 2XXVA 3ODBA 1LB8A 1OLCA 3OEKA 1LFIA 1US4A 1OVTA 4H5GA 1JVYA 4Z0IA 3GBAA 3FXRA 1JVXA 2KLFA 4JWYA 4FE8A 1LLSA 4ZECA 2P2AA 4R6YA 4XIGQ 1GVCA 1Y9UA 2GHBA 4I8CA 1FQAA 3VV5A 2RCBA 3LSLA 1MY0A 4MBPA 3U94A 2I0CA 2O51A 2XX9A 3UP9A 2XXTA 4MH5A 1D9VA 4U23A 5ICQA 1XOCA 4F29A 5FHMA 4RA1A 1N3WA 3TUSA 1A55A 5AA4A 3ONMA 5H8NB 3O9PA 4ZEIA 2DE3A 4HTGA 1PEBA 4R75A 3G3IA 1B32A 4NWDA 5AA2B 3K6VA 3KSJA 1JW4A 5EHSA 4YKKA 2Z8DA 2RKMA 1A99A 4TOZA 2ZYOA 1EZOA 1R1NA 2Y7RA 3PD8A 5I56A 3RNNA 2O84X 4N07A 2QSXA 4R74A 1OLAA 4NF5B 2QMWA 5A5XB 4BDNA 1B05A 1YTVA 5CM6A 4RK2A 4KPTA 2RINA 2XXUA 3OD7A 2B3FA 3OSRA 1UIUA 2DWIA 1NNKA 4H65A 4EXKA 5B70A 1B3GA 4H5FA 1RYXA 1B0HA 4NF6B 1MQGA 5KZTA 1R9QA 2OK2A 4IO4A 4OFLA 4OVJA 3FVNA 2UVHA 3SKPA 1O63A 1Q35A 1M5EA 3FJMA 4OEUA 2VD3A 1B58A 3SEWA 3MVXA 3PGFA 2DOJA 4FORA 3B6WA 3KGCA 1VSOA 2H25A 1MQDA 1HSLA 4EXLA 3H7MA 4I9DA 5I59A 3F11A 4WKMA 1OQGA 4P0GA 1OVBA 2AIXA 3T22A 1XVXA 4F22A 3LBSA 1MRPA 2DP8A 2I3VA 2XXXA 3K4UA 4NF4A 3EF7A 2QS2A 2R9JA 1B1HA 3O97A 3KSXA 5M2VA 2A5TA 2I0BA 2QRYA 3ZKLA 4F31B 1BP5A 1TT1A 1Y20A 5I2KA 4GF8A 4JXIA 4OTEA 1VE4A 3IB2A 4ZE8A 2M8CA 2AL5A 3TAJA 1Z7ME 3VXCA 1YPNA 3RT6B 1NNTA 2GHAA 2XXYA 3H6VA 4PFWA 3E9XA 4WEPA 4PQJA 4F1YA 4M4GA 2ALUA 3EN3A 4O3BA 1QKAA 3CSBA 1B5IA 2QL3A 3IOTA 2I58A 1TXFA 2PT1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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