4LZ8A

Crystal structures of glur2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery and Characterization of a Novel Dihydroisoxazole Class of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA) Receptor Potentiators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz8A02
3H7MA 1QVSA 3DP6A 5ICQA 1B51A 1A7LA 1UTBA 3VVEA 3KOSA 1JW5A 1NMUA 1II5A 1PC3A 1B1HA 2DWHA 1Y1MA 2V84A 2DXRA 3IX1A 2M8CA 1FTLA 3FASA 3HHGA 2H5YA 1IEJA 2HEUA 1N0TA 3HCQA 1NNKA 4KCDA 1CB6A 4OERA 4EDPA 1MXUA 1VFDA 4BLAA 5H8QB 3TQWA 2UVIA 5CMCA 3N6TA 4YMAA 3KN8A 3N26A 3FV1A 3MVYA 5M2VA 1AOVA 3TZAA 2I0BA 4ZZEA 1B58A 4Q30B 4THIA 4LUBA 2P0SA 2RF1A 5I57A 3F11A 3RPWA 4GFRA 3MZBA 2XX7A 3JZJA 4U23A 4X1BA 3UK4A 4GL0A 5CBRA 3KGCA 4O3BA 4FIMA 1UTHA 4KYDA 3UN6A 1XHYA 3PD9A 1BIYA 4RK9A 1OQGA 5AA2A 1Z7NE 1QUKA 2Q8JA 5HM4B 1GR2A 3EHTA 2ONKE 2F35A 1B3HA 3LSFB 4ZEFA 5KDTA 2XD3A 2ZYMA 1N76A 1RYXA 2XXHA 2Z23A 1Y3PA 3L6GA 5TPAB 3TMGA 3PUVE 1GV8A 2DWIA 5DTBA 3OMBA 3MVWA 5AA4B 3GBAA 1A99A 3E3KA 1QJMA 3ECRA 4U4SA 4ZDMA 5I58B 1KWHA 2GFEA 2OK2A 3PPPA 1IIWA 4O3AA 4M1VA 5DYHA 3LSXA 1B6HA 4WEDA 1MQGA 3OO6A 3ODBA 1PEBA 4OFLA 3TCGA 3KOTA 1MXVA 3MBPA 4P11A 2Y7IA 4BDRA 4F1YA 3RTFB 1NL5A 3ONMA 2HZLA 3KFMA 1FTKA 2XXUA 1N7WA 1QKBA 4H5GA 1JW4A 1M5DA 4JDFA 4YZZA 2OZZA 4R9GA 5TP9A 1MM7A 4H65A 2P2AA 3N5LA 1B9JA 4OENA 2B3BA 4NE4A 4ELQA 4H1XA 3N94A 4F1UA 3DELB 4DE8A 1MQHA 3TTRA 1HSEA 2XX8A 3TKDA 4ZEBA 3B6WA 2XXXA 2O51A 1TFDA 4FORA 4R74A 5L9MA 4GLIA 2PVUA 4JWOA 4QFPA 3O97A 2UVHA 3RY3A 5FTIA 2DOJA 3CG1A 5AE4A 5L9SA 3S9LC 4WKMA 2V93A 1PB8A 5DEXB 3SEXA 3OO7A 1IZ1A 4R72A 1A55A 4KYEA 2YLNA 3IB1A 4JWXA 4XKQA 3VVFA 1URGA 4YB5A 2Q88A 5CMMA 1SYIA 4PFYA 2ABHA 2V3UA 3O2AA 3CFZA 2NOOA 3FV2A 2R71A 2KLFA 4XKPA 4EXKA 4JXIA 1JNFA 5F7VA 2OCUA 4MF3A 4EQ7A 1USYH 4ESXA 4GWOA 5L9OA 2DE4A 2A5TA 4QFKA 3RNNA 4OEUA 1TT1A 1LBBA 1LB9A 3U94A 3QIMA 1ELJA 3HPIA 2OWTA 1IXGA 4IGRA 1JVXA 3FGSA 1A8FA 4DCYA 3T96B 4YICA 3D4CA 2ZYNA 4RJZA 1Y4CA 3V89B 3RLFE 4R75A 5H8FB 1LAXA 3O6GA 1LAGE 4LQ2A 3TUSA 4BDQA 2OLBA 1IXCA 4IO5A 1B5HA 2E1SA 1NFTA 4H5FA 1B3EA 1MXWA 4OZ9A 3IOWA 2DS9A 3KSXA 2NVUB 2FYIA 3H06B 1XVYA 2O69A 2Q89A 2FA7A 3KJ7A 3B6QA 3MP1A 4NF5B 4OXVA 2I49A 1J1NA 1PBQA 1JEVA 1IQ7A 4RY1A 4R6YA 1B7HA 3FVKA 2O6AA 1FQEA 3IB2A 3PMXA 1S9TA 2DWJA 4F2OA 1IXHA 1EU8A 4QFNA 3G3IA 1MXXA 3K6WA 2O68A 3LSLA 2V3TA 2O7UA 3BFUA 1LCFA 4F31B 3R6UA 2UVJA 2YJPA 4U21A 3KG2A 4H0WA 4ISUA 3JYRA 1LLSA 3DP4A 3H3GA 1Y20A 4EQBA 4MFIA 5JTYB 1F9BA 3HHFA 2ANJA 1ATGA 1D4NA 5DVIA 1MPBA 4DXBA 1B0HA 4N13A 4N07A 1O63A 1D9VA 2F6PA 4E0WA 1GGGA 4JWYA 3RUMA 3C33A 2VOZA 3PMVA 4H8IA 1O7TA 2H25A 3LUYA 4MLQA 3FIRA 3PUXE 2NXOA 3DLNA 4TOZA 1FW0A 3G3JA 4FECA 2I58A 3CIJA 2Y7KA 4DXUA 4KCCA 2WKYA 2VHAA 4G2ZA 4NWCA 2ESNA 4DLDA 1LAHE 2Y7RA 3U92A 3MQ9A 4YAHX 4XXUA 1MH4A 1SBPA 2AIXA 3H6VA 1DTGA 1P1UA 2F34A 4XTCQ 4LATA 3G3KA 1D3KA 4ELOA 4MBPA 2HQ0A 3RT8A 5CC2A 3UP9A 5H8SA 1B40A 3Q28A 4ZE8A 1POY1 3IB0A 4IO6A 1MDQA 1SI0A 2V25A 2HAVA 4KYSA 3UA8A 3K01A 5LOMA 4FAJA 2UYEA 4LZ7A 4LP2B 2HXWA 1LSTA 2QPQA 4OTEA 3FVNA 2XXYA 2F5XA 1B46A 2GRVA 3KBRA 2F7CA 1TXFA 2O84X 1SYHA 4PFUA 3T9VA 3WAEA 1H43A 2GH9A 3BFTA 2QL3A 1MY3A 1VR5A 3G7WA 4EF2A 4QSDA 1OQHA 1R1NA 1B05A 4HS7A 4U4XA 5I56B 5FHNA 5CM6A 4TLLB 2HAUA 4Z0IA 3R7XA 3EPEA 2VD2A 2XXVA 2PT1A 4NWDA 5TPAA 3TQLA 3MP6A 5EHMA 1YAEA 2LAOA 4ELRA 1ZIUA 4PFTA 5I2NB 1MQJA 5BUUA 1MY4A 3ZKLA 3OSRA 3QK6A 4GOTA 4ELPA 5AA4A 4FEDA 1US4A 5EYFA 5HBCA 4GF8A 4NF6B 3MUQA 4UACA 2DSFA 4F18A 4FJPA 1A8EA 2Q2CA 3GBBA 3FXQA 4E0XA 4ECFA 3PPNA 2Z22A 2D5WA 2B65A 5L8DA 1IUDA 3MPKA 1LAFE 1RKMA 4H8JA 2H99A 3CSGA 1B5JA 3KJTA 3W15C 5BWJA 4F22A 4OEVA 1FQDA 2REGA 4YKPA 3VXCA 3QYTA 1HSLA 1MRPA 3VFJA 1B1XA 1LB8A 3IOUA 1NNPA 1QW0A 1MQDA 4NTLA 2DE2A 3K6UA 5I57B 1BKAA 3FVGA 2X7PA 2G93A 4RK2A 3QAXA 1EH3A 1JW1A 4P0GA 1NH8A 1MXZA 1GVCA 1B52A 1B7ZA 4G68B 3V8XB 3IORA 5DEXA 5I2KB 3SEYA 3H6WA 4IO3A 3D4GA 1SW1A 3HSTA 3TYHA 3UIFA 1Y9UA 2I48A 4QSEA 2RC8A 4LZ5A 3KZGA 3MWBA 5IKBA 3B7DA 3CI8A 3O66A 1DOTA 1XOCA 4I9DA 5ELVA 3CFXA 3M3LA 5KDTB 3H6TA 4F39A 5CMKA 2F36A 4HTGA 2E0SA 2REJA 1BTJA 4RPOA 3CFLA 4ZS9A 1SDXA 2D3IA 1N84A 4JSDA 5K2XA 5AA3A 3BKIB 4H67A 1WODA 2D21A 3T9HB 4UA8A 5H8NA 3M3KA 1FQAA 1MY1A 1M5BA 1XT8A 1OIBA 2RCAA 1FQCA 1EZ9A 4Q5TA 3SKPA 1MPDA 2DQVA 1B7UA 5H8FA 3TODA 3T66A 3CVGA 4DDDA 3OO8A 3K02A 5KCJB 1RYOA 2F6GA 4KPTA 3T22A 1QULA 3O28A 4X1DA 2B3FA 4ONYA 4BDOA 4IY6A 2ZXTA 2Y7PA 1WVJA 5H8HB 2I4CA 3WAFA 3PU5A 3SEWA 2HZKA 5ITPA 1ZKBA 4RXLA 3EHSA 2NUVA 3K0VA 3Q25A 2G29A 2Q2AA 1R6ZA 3VLUA 4HCYA 4QRZA 3T9UA 4GL8A 3IR1A 2I6EA 5FHOA 1DTZA 3A3UA 5JTYA 1XVXA 1P1WA 1LFHA 1T0KA 3MZ9A 3TCHA 1ANFA 4C1UA 1B3FA 1Q1KA 3MZ1A 1FTOA 2QMXA 3C36A 4EUOA 2XXWA 4NF8B 2GHBA 4R73A 3MP8A 4OHNA 4KD5A 1JETA 5KZTA 3L6HA 1FTMA 1IXIA 3TTMA 4RPNA 2UYFA 2AL5A 1PB7A 4NEDA 4IGTA 1USYE 3K1PA 4ZZAA 3A3CA 5CBSA 4OESA 1TFAA 4YB7A 2RC7A 1XS5A 1OMPA 1YPNA 1P99A 3LR1A 3OELA 3HN0A 3LSWA 4PFWA 1OVTA 3LBSA 1PDAA 3K00A 2BJJX 2I3VA 3K6VA 2I4BA 1A54A 4NF4B 5JK4A 3C35A 4F19A 1NH7A 4GXAA 4POWA 2QS4A 3PMWA 1FTJA 4IB2A 2F8DA 3M8UA 2Q9TA 5FHMA 1VE4A 2XXIA 2UXAA 4ZEIA 1H76A 2VP1A 3VDFA 2QSXA 1MQIA 4XIGQ 1Y3NA 4BDNA 3PUYE 1YCJA 1NNTA 3GZGA 3IK6B 5HPQA 3K4UA 3DM0A 3PD8A 2R9JA 2F78A 2ZYOA 4MLVA 1VFEA 2I3WA 3IL1B 3E4RA 4ZE9A 2Z8FA 1M5CA 1MM6A 2PT2A 5H8QA 3RQTA 4U1ZA 2Z8DA 1MH3A 4POXA 1QUJA 4R6KA 5B70A 2O1LA 4QHQA 4I62A 4PE5B 1YTVA 3C4MA 3USDA 3GXAA 1B2HA 3S9MC 1US5A 1VSOA 5I56A 5I59B 3FATA 1MY0A 1LBCA 3ILUB 3E13X 1ZLQA 1LGBC 2AYSA 1H44A 5I2NA 2CMOA 4GRKA 4F3GA 3V83A 3C34A 4K3FA 2IA4A 3TELA 4I1DA 3U1OA 1O64A 2O7IA 4RA1A 1SQYA 1R9QA 3U72A 3M3FA 3EHUA 3H4ZA 4NF6A 4AQ4A 4FE8A 4ESWA 5DVFA 3O6IA 2R6GE 1LFIA 3PUZE 1OLCA 3VV5A 2PBWA 3SEVA 5A5XB 4OWDA 5JEIA 1B4HA 2F7AA 3PGFA 4LZ8A 1URSA 1NKXA 4U2RA 3RT6B 3OD7A 3S2VA 4DZ1A 1TWYA 5AA1A 1B3GA 3QUFA 2ZNSA 1I6BA 2HCAA 4G4PA 2DP8A 1S7YA 3MAMA 4YKJA 2ONSA 1ZU0A 3E9XA 2XXQA 4Q0CA 1S50A 3C9HA 2HFBA 3SDFA 3IOVA 3OEMA 3PPOA 4R6HA 4OQOA 4FEBA 1UIVA 2DVCA 3FJGA 1P1QA 3OO9A 3W9WA 4IO7A 1SW4A 4JBZA 5I58A 3TTLA 1SVXB 2QRYA 1BP5A 3UORA 1UTBB 1XC1A 3EF7A 4FATA 3KSJA 3FUZA 3MVZA 2XXRA 3KN3A 1B4ZA 2ZNTA 1L5TA 3ZKKA 3EN3A 1DMBA 1MXYA 1N7XA 4H6DA 1Z7ME 1I6QA 4OFJA 4G68A 4OYVA 2CZLA 3FJMA 2QMWA 3I6VA 5I2KA 2QS2A 2FNCA 3DP8A 4EXLA 3U8QA 3V5AA 1SW5A 3BBRA 1SW2A 1B32A 4HW8A 4G8MA 4IO2A 2UVGA 4G8HA 2H9BA 3MVXA 1CE2A 3TPAA 5DT6A 4F3BA 3U93A 4TLMB 3N6UA 4JB7A 3K1NA 3P7IA 4YKIA 3R26A 4EF1A 3JV9A 2F7BA 2RINA 4I8CA 3TFLA 4F3PA 2XXTA 3H03A 1SD3A 3QXMA 4F3SA 3FD3A 5ISUA 3RGYA 4GIZA 3THIA 4YU0A 3ZS6A 1JEUA 3S4UA 1UTHB 1LFGA 5CI5A 2VD3A 3C32A 1N3XA 3A09A 4G8NA 5KCJA 1H3DA 1AIVA 4AB6A 1MY2A 5AA2B 4C1TA 2ALUA 3I3VA 4OVJA 2IEEA 3IJXB 1AL3A 3VE1B 1PBPA 2YPNA 3FZVA 1M5EA 1MS7A 5H8HA 4PP0A 3O29A 3S9EA 4MH5A 3OENA 3FXRA 4O3CA 3OOAA 5B7DA 1DPEA 3SEUA 1JVYA 3I5OA 1UIUA 3T9XB 3G3GA 4WEPA 1EZPA 2H98A 3TEPA 3QUJA 4OMBA 4R9FA 4GVOA 4G68C 1FQBA 2W7YA 3K2DA 3K6XA 2ZYKA 1PB9A 3S9NC 4BDMA 4GD5A 4IY5A 4X48A 1HSJA 5TU0A 3MC2A 3GLBA 2X7QA 2ONRA 4QFOA 3IO6A 4RNSA 3AXFA 4OETA 1LCTA 1SI1A 3IO4A 3VLWA 2Z8EA 4KFQA 3Q29A 5ICTA 3KEIA 1N3WA 2DWAA 3MPLA 1MPCA 4P0IA 2ZMBA 2QJEA 2Y84A 3QSLA 4QF9A 4ZECA 2RC9A 1Y1ZA 4NF5A 3CR9A 1MDP1 4NF8A 3PPRA 3PV0E 5IAIA 4KI0E 3W9VA 1OVBA 1WDNA 3T93B 5TP9B 5CRYA 4YKKA 2F97A 2PX1A 3CRBA 1QUIA 2DYXA 2XX9A 1DPPA 3O9PA 1M5FA 2Y7WA 3C31A 4OFOA 2RCBA 4YB6A 4KQPA 3RTWB 5F1QA 4DXCA 3SETA 3MJNA 4ZEDA 2ZNUA 5H8NB 2THIA 1P1OA 1Q35A 1B5IA 4NMYA 3SERA 4U22A 3KN7A 2XD2A 1NNFA 1B0LA 4R2FA 2O1MA 2RKMA 3OEKA 3B6TA 1ZJLA 1EZOA 4NF4A 5FTHA 5J1DA 4LONB 4R2BA 3G3HA 1BLFA 3ZSFA 3FXUA 2XXPA 1I6AA 3VXBA 3HV1A 3FVOA 5AA2D 2OBGA 2OJTA 4HCWA 3OXNA 2DE3A 4L17A 2VGQA 4M4GA 1Y3QA 3CG3A 4F1VA 2XHDA 2PYYA 1UQWA 1FQFA 1B3LA 2A5TB 4QSCA 3TTKA 2X26A 1AH5A 3TDJA 4N6PA 1JQFA 1MG1A 3O6HA 4GXSB 3PPQA 3TTNA 4X9TA 4C0RA 2PMSA 4RYAA 4G77A 3TAJA 1IITA 4DIGA 3VLVA 3Q26A 5EHSA 3HO7A 1GTKA 5DVJA 1POTA 4ZEKA 2I0CA 4QFLA 1A40A 3LC8A 1ZBMA 1N04A 3TCFA 4PQJA 1QKAA 3FJ7A 5I59A 4IO4A 4KHZE 1ZMGA 4DCXA 2QS3A 5ITOA 4TQUQ 3OSQA 3SESA 2NWJA 1DSNA 2DVZA 3IJOB 4JSOA 4EQ9A 1FCKA 1H45A 1URDA 3MW0A 3VVDA 1ZTYA 4ND9A 4LA9A 2H4IA 4F2QA 1AMFA 4GQOA 4U1OA 1D9YA 2QS1A 3PUWE 4XKNA 5A5XA 2OWSA 3EQ1A 4LQ5A 3IOTA 1R9LA 3CSBA 3K1MA 2GHAA 2V3QA 4Q8RA 3G3FA 5I84A 4XKRA 3UGWA 4PETA 5K2YA 2AL4A 3IAZA 3ILTB 1I69A 4BDLA 4WXJA 1Y4TA 5CMBA 4LVQA 4YMBA 2A5SA 4AB5A 3RN8A 4F29A 2DXYA 4KR5A 3H6UA 2P1SA 4Z7EA 1OLAA 3Q27A 1P1NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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